]> Creatis software - gdcm.git/blob - ChangeLog
* Corrected a leak in vtkGdcmREader.cxx, the pSource was find thanks to valgrind.
[gdcm.git] / ChangeLog
1 2003-08-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2       * Corrected a leak in vtkGdcmREader.cxx, the pSource was find thanks to valgrind.
3 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
4       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp was not dos format
5       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp : libgdcmijpeg12_EXPORTS -> LIBGDCMIJPEG12_EXPORTS
6       * src/win32/gdcmdll.dsp: + /I "..\jpeg\libijg12"
7 2003-07-29 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
8       * src/gdcmHeader.h : add std:: prefix for stl elements... like others in
9         the file
10       * src/gdcmFile.cxx : bug fix in affectation type
11       * src/jpeg/libijpeg12/jmorecfg12.h : export for windows modified... like
12         in src/jpeg/libijpeg8/jmorecfg8.h (JPR : copy/paste exists !!!)
13       * Modifs of MVSC projects to compile them. Not concerning 2 identic
14         symbols... futur problem ?
15 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
16       * src/win32/libgdcmijpeg12.dsp was missing
17       * modified gdcm.dsw accordingly
18 2003-07-28  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
19       * src/gdcmHeader.cxx : misplaced return 0.; for ACR/NEMA
20 2003-07-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
21       * src/jpeg/libijg12/.cvsignore, jconfig.* : ommited files while last
22         commit of JPR (before his hollidays to facilitate our work).
23       * setup.py : bug fix in code. Modifications made while the last commit
24         of JPR. The code hasn't been tested before the commit... it's so
25         useless to make that (for best programmer that is JPR) !!!
26 2003-07-08  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
27       * tagged the current version as Version0_3 (i.e. version 0.3)
28 2003-07-08  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
29       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx : remove a symbol that is unused
30       * src/jpeg/libijg8/jmorecfg.h : adding export symbol for windows
31       * *.dsp : modifications to use new libgdcmijpeg8 library
32       * setup.py : bug fix on VTKPATH variable
33       * PACKAGER : adding all concerning windows
34 2003-07-07  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
35       * src/gdcmElValSet.cxx, gdcmFile.cxx: JPR bug fix, removal of
36         garbage debug code.
37       * TODO, vtk/vtkGdcmReader.cxx: upcoming fixes comments.
38       * gdcmPython/testSuite.py: JPR bug fix, brutal erasement of
39         test suite reported error.
40       * PACKAGER file added (describes what a packager must do when
41         packaging a new release).
42       * MANIFEST.in, now declares jconfig.linux and jconfig.vc
43       * configure.in: upgraded version number to 0.3.0
44       * fixing build of rpm (through rpm -ta):
45         - Doc/Makefile.am exports proper doxygen files
46         - src/jpeg/libijg8/Makefile.am exports the include files.
47 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
48       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading only 1 file.
49       * src/gdcmHeader.h : formatting code
50 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
51       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
52         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
53         is made in an internal list to prevent this problem.
54         Bug fix when output is empty.
55         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
56         correction.
57       * vtk/vtkGdcmReader.h : adding comments for InternalFileNaleList variable
58 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
59       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
60       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
61         files. Added method to remove all files on the input
62         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
63         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
64 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
65       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
66         when using make instal.
67       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
68         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
69 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
70       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
71       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
72 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
73       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
74         linux and WINDOWS !
75       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
76       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
77 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
78       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
79         addon of the jpeg library)
80       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
81       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
82       * INSTALL now points to web documentation
83 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
84       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
85         gdcmUtil.h anymore.
86       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
87         clean target.
88       * src/gdcm*.[cxx|h] :
89         - to allow compilation with gcc 3.x
90           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
91           -- small fixes on exceptions.
92           Note: linking not tested !
93         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
94           building stage.
95       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
96         dependent convertion).
97 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
98       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
99         Changelog):
100         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
101         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
102           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
103         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
104 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
105       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to 
106         compile
107       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
108         (FileName -> Filename)
109 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
110       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
111         - UpdateProgress method should now be effective
112         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
113           to volumes),
114         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
115           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
116           accelerating things).
117         - when building a stack of images/volumes, files which are not
118           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
119           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
120           in the stack (for the caller to notice the problem).
121 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
122       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
123 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
124       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts 
125         between standard library (std) and vtk library (problems are found
126         under Windows... thanks Windows !)
127 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
128       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
129         debug stage).
130       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
131 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
132       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
133 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
134       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
135         called with different flags than the default ones (with automake).
136         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
137            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
138         and went for warning fixes:
139         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
140           up from unused variables.
141         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
142       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
143 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
144       * gdcmPython/gdcm.i:
145         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
146           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
147           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
148         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
149           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
150           exported to Python a as cvar.
151       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
152         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
153         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
154         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
155         C++ static methods).
156       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
157         with the above changes.
158 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
159       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
160 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
161       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
162         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
163         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
164          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
165          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
166            a wrapper
167          - Wrapper interface which wrap sources
168         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
169         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
170       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
171         files for compilation
172 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
173       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
174         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
175         - vtk/Makefile.am now builds a library
176         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
177           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
178           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
179           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
180           import library.
181         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
182           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
183           + vtk/vtkGdcmReader.so and
184           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
185           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
186         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
187           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
188         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
189           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
190       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
191       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
192         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
193         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
194         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
195         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
196         collision of various stl members (principally cout...).
197       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
198         file.
199       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
200          comply with above changes)
201 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
202       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
203       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
204         vtk data structure (an image Flip was required).
205       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
206       * cosmetic changes in documentation.
207 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
208       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
209         unexisting file is given as argument.
210       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
211         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
212         containing those images is now available at 
213           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
214         with the name gdcmData.
215         All the python scripts (including the package initialisation file
216         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
217         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
218 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
219       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
220         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
221         demo of the usage of this class.
222         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
223         at configure (or autogen.sh) stage.
224 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
225       * More memmory link related corrections and documentation fixes.
226         Notes on valgrind:
227           - maximum info is obtained with a command of the form:
228             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
229                    --show-reachable=yes PrintHeader
230           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
231             allocation scheme through the usage of map and list. It looks 
232             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
233             (in fact further invocation to the STL would recollect the
234              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
235       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
236         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
237         Note: some images don't seem to work e.g.
238             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
239       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
240         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
241         make gdcm more thread friendly.
242 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
243       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
244           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
245         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
246           gdcmHeader::_dicom_vr.
247         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
248         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
249           VRHT*.
250         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
251 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
252       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
253         make install stage.
254 2003-04-9 JPR
255       * UpdateGroupLength replaced by new one
256 2003-04-7 JPR
257       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
258         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
259       
260 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
261       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
262       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
263       * src:
264         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
265         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
266           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
267         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
268           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
269           carried the same semantics.
270           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
271         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
272           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
273         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
274       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
275       * gdcmGetXSize added
276       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
277       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
278 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
279       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
280         (to avoid double call by end user).
281       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
282         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
283 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
284       * gdcm/Doc many doxygen changes:
285         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
286           the html.users end users oriented documentation and
287           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
288           oriented documentation.
289         - README changed accordingly
290         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
291         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
292           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
293         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
294           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying 
295           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
296       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
297         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
298       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
299         ill-formed documentation sections.
300       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
301 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
302       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
303       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
304         un*ces with sh-utils test utility.
305       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
306       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
307       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
308       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
309       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
310 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
311       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
312       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
313 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
314       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
315       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
316       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
317       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
318         compilation work.
319       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
320       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
321 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
322       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
323         hence the user doesn't need this explicit call.
324         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
325           i.e. LoadElements() call removed.
326       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
327         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
328       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
329         for adding user defined new tags.
330         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
331         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
332           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
333 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
334       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
335    Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am, 
336    src/Makefile.am : the project should properly compile and install
337    with the autotools, included the python wrappers part. 
338       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
339 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
340       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
341 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
342       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
343         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
344         for usage).
345       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
346         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
347         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
348       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
349         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
350 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
351       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
352         in InstallMode or PreInstallMode but with an environement given
353         value of GDCM_DICT_PATH.
354       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
355 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
356       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
357       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
358       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
359         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
360         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
361 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
362       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
363         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
364         gdcmHeader.h
365       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
366         (as opposed to gdcm.h)
367       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
368       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
369         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
370       * autogen.sh removed history related references to crea package.
371 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
372       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
373         bug.
374 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
375       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
376         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
377         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
378         of hidding away the python related distutils specific files
379         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
380         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
381         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
382         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
383 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
384       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
385       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
386         among the list of sources.
387       
388 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
389       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
390       * modifications in MSVC projects
391 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
392       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
393         looks like we can move back to original usage of exception within
394         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
395         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
396       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
397         README file for usage added.
398       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
399         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e. 
400         testing the proper parsing of a Dicom related file.
401         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
402       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
403       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx: 
404         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
405           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
406           Dicom public dictionnary were not accessible without an
407           instance of class gdcmHeader.
408         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
409           require no instances at all to be invocated.
410         - within gdcmDictSet this change required to change some method
411           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
412           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
413       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
414         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
415       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
416         the above to be effective.
417       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
418         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
419       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new 
420         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
421         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
422         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
423         (for python dectection).
424       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
425         now avoids publishing the empty entries.
426 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
427       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
428         ExtraPath reused :-P
429       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
430 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
431       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
432       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
433       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
434         and links
435 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
436       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
437         method. Doxygenation.
438       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
439 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
440       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
441         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
442         when using "python setup.py install".
443       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
444         reexports the working classes.
445       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
446         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
447         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
448         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
449         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
450         subdir (see the README file). This problem probably due to
451         an combination of g++ and dynamic loading.
452       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
453 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
454       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
455         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
456         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
457         again in a python subdir, but the package itself is now in
458         python/gdcmPython.
459       * setup.py was cleaned up:
460         - pythonIncludePath removed
461         - python setup.py bdist target is now functional.
462       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
463         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
464         accordingly.
465 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
466       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
467       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
468         distutils installer is operational.
469       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
470           shadow classes (from gdcm.py).
471         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
472           instead of gdcmPython/demo/load.py.
473         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
474         
475 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
476       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
477         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
478         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
479         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
480         dictionary.
481         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
482           are now in the "???" group.
483         - python/gdcm.i changed accordingly,
484         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
485           of the above new functionalities in Python.
486 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
487       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
488         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
489           were definitively removed.
490         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
491       * src/gdcmElValSet.cxx:
492         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
493         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
494         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
495         - Added GetElementByName(string).
496       * src/gdcmHeader.cxx: added
497         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
498         - GetPubElValRepByName(string)
499         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
500         - GetShaElValRepByName(string)
501         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
502         - GetShaElValRepByName(string)
503         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
504         - GetElValRepByName(string)
505         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
506         - GetElValRepByName(string)
507       * Doc/requirements.txt added.
508 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
509       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
510       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
511         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of 
512         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
513         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
514       * python/testSuite.py changed accordingly.
515 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
516       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
517         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
518              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
519               cannot be exported. [...]
520               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
521               be exported. [...]
522               This is caused by a designed limitation that once a template
523               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
524               exported."
525         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
526         limitation" of VC++ is a pitfall.
527         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked 
528         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
529         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
530         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
531         library. 
532         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
533       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
534          dll under windows !!!!)
535       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
536       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
537         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
538       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set 
539         (one) of image(s).
540       * removed glib references
541       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
542 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
543       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
544         that only displays required tags and testAll.py that parses all
545         the files of the testsuite without using unittest.
546       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
547       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
548       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
549         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
550 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
551       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
552         values, but limits itself to values which are below a user specified
553         size (by default 1024 bytes).
554       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
555         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
556         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
557         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
558       * python/testSuite.py
559         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
560         - two new examples added.
561       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
562 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
563       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
564         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
565       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
566       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
567       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
568 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
569       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
570         the vr was also RET.
571       * python/testSuite.py more tests added.
572 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
573       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
574       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
575       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
576         7.18 Integer types (see stdint.h)
577         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
578       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
579         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
580         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
581         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
582         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
583         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
584         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
585         The rest of the changes we the necessary adaptations.
586 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
587       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
588         VR files.
589       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
590 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
591       * Adaptation for porting to VC++:
592         - src/gdcm.h
593           o forced to use std namespace (for string to be known)
594           o all class use __declspec export style on WIN32
595         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
596           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
597       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
598         variable GDCM_DICT_PATH.
599       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
600 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
601       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
602         to native Python dictionary.
603       * python/demo/test.py:
604         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
605         - takes an optional filename argument (the file to parse).
606       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
607         PubElVals hashing table. 
608       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
609 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
610       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
611         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
612       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
613       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
614       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
615         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
616       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
617 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
618       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
619         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
620         that we can import de shadow classes without errors].
621 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
622       * hashtest.cxx removed (since allready in Test)
623       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
624       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
625       * src/Makefile prepared for python wrapping
626 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
627       * src/gdcmHeader.cxx :
628         - Parsing of header is now separated from loading of element values
629           (see gdcmHeader::LoadElements).
630         - general clean up of hopefully all file access (creation of
631           ReadInt16 and ReadInt32)
632 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
633       * src/gdcmHeader.cxx :
634         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
635           method.
636         - SetLgrElem renamed to SetLength
637         - GetLgrElem renamed to GetLength
638         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
639       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
640       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
641         due to IdoDude was cleaned out.
642 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
643       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
644         concentrates on finding the value representation (when it exists).
645         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
646         returning the unecessary skL (skipped length).
647         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
648         it was redundant with the File position internals (by using
649         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
650         jajun.
651       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
652         on the libido specificities which are handled through class 
653         inheritance.
654       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
655         added. 
656 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
657       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
658         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
659 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
660       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
661 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
662       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
663         and _IdDcmSWAP_LONG.
664 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
665       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
666         May 23 2002. Needless to say we are running late...
667