ChangeLog

   1 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
   2       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
   3         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
   4         for usage).
   5       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
   6         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
   7         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
   8       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
   9         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
  10
  11 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  12       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
  13         in InstallMode or PreInstallMode but with an environement given
  14         value of GDCM_DICT_PATH.
  15       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
  16
  17 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  18       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
  19       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
  20       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
  21         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
  22         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
  23
  24 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  25       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
  26         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
  27         gdcmHeader.h
  28       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
  29         (as opposed to gdcm.h)
  30       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
  31       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
  32         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
  33       * autogen.sh removed history related references to crea package.
  34
  35 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  36       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
  37         bug.
  38
  39 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  40       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
  41         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
  42         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
  43         of hidding away the python related distutils specific files
  44         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
  45         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
  46         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
  47         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
  48
  49 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  50       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
  51       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
  52         among the list of sources.
  53
  54 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
  55       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
  56       * modifications in MSVC projects
  57
  58 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  59       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
  60         looks like we can move back to original usage of exception within
  61         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
  62         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
  63       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
  64         README file for usage added.
  65       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
  66         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
  67         testing the proper parsing of a Dicom related file.
  68         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
  69       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
  70       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
  71         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
  72           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
  73           Dicom public dictionnary were not accessible without an
  74           instance of class gdcmHeader.
  75         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
  76           require no instances at all to be invocated.
  77         - within gdcmDictSet this change required to change some method
  78           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
  79           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
  80       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
  81         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
  82       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
  83         the above to be effective.
  84       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
  85         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
  86       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
  87         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
  88         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
  89         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
  90         (for python dectection).
  91       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
  92         now avoids publishing the empty entries.
  93
  94 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
  95       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
  96         ExtraPath reused :-P
  97       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
  98
  99 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 100       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
 101       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
 102       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
 103         and links
 104
 105 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 106       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
 107         method. Doxygenation.
 108       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
 109
 110 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 111       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
 112         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
 113         when using "python setup.py install".
 114       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
 115         reexports the working classes.
 116       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
 117         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
 118         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
 119         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
 120         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
 121         subdir (see the README file). This problem probably due to
 122         an combination of g++ and dynamic loading.
 123       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
 124
 125 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 126       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
 127         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
 128         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
 129         again in a python subdir, but the package itself is now in
 130         python/gdcmPython.
 131       * setup.py was cleaned up:
 132         - pythonIncludePath removed
 133         - python setup.py bdist target is now functional.
 134       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
 135         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
 136         accordingly.
 137 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 138       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
 139       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
 140         distutils installer is operational.
 141       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
 142           shadow classes (from gdcm.py).
 143         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
 144           instead of gdcmPython/demo/load.py.
 145         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
 146
 147
 148 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 149       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
 150         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
 151         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
 152         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
 153         dictionary.
 154         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
 155           are now in the "???" group.
 156         - python/gdcm.i changed accordingly,
 157         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
 158           of the above new functionalities in Python.
 159
 160 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 161       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
 162         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
 163           were definitively removed.
 164         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
 165       * src/gdcmElValSet.cxx:
 166         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
 167         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
 168         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
 169         - Added GetElementByName(string).
 170       * src/gdcmHeader.cxx: added
 171         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
 172         - GetPubElValRepByName(string)
 173         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
 174         - GetShaElValRepByName(string)
 175         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
 176         - GetShaElValRepByName(string)
 177         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
 178         - GetElValRepByName(string)
 179         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
 180         - GetElValRepByName(string)
 181       * Doc/requirements.txt added.
 182
 183 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 184       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
 185       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
 186         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
 187         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
 188         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
 189       * python/testSuite.py changed accordingly.
 190
 191 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
 192       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
 193         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
 194              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
 195               cannot be exported. [...]
 196               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
 197               be exported. [...]
 198               This is caused by a designed limitation that once a template
 199               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
 200               exported."
 201         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
 202         limitation" of VC++ is a pitfall.
 203         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
 204         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
 205         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
 206         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
 207         library.
 208         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
 209       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
 210          dll under windows !!!!)
 211       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
 212       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
 213         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
 214       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
 215         (one) of image(s).
 216       * removed glib references
 217       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
 218
 219 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 220       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
 221         that only displays required tags and testAll.py that parses all
 222         the files of the testsuite without using unittest.
 223       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
 224       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
 225       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
 226         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
 227
 228 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 229       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
 230         values, but limits itself to values which are below a user specified
 231         size (by default 1024 bytes).
 232       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
 233         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
 234         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
 235         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
 236       * python/testSuite.py
 237         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
 238         - two new examples added.
 239       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
 240
 241 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 242       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
 243         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
 244       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
 245       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
 246       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
 247
 248 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 249       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
 250         the vr was also RET.
 251       * python/testSuite.py more tests added.
 252
 253 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 254       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
 255       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
 256       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
 257         7.18 Integer types (see stdint.h)
 258         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
 259       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
 260         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
 261         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
 262         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
 263         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
 264         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
 265         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
 266         The rest of the changes we the necessary adaptations.
 267
 268 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 269       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
 270         VR files.
 271       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
 272
 273 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 274       * Adaptation for porting to VC++:
 275         - src/gdcm.h
 276           o forced to use std namespace (for string to be known)
 277           o all class use __declspec export style on WIN32
 278         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
 279           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
 280       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
 281         variable GDCM_DICT_PATH.
 282       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
 283
 284 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 285       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
 286         to native Python dictionary.
 287       * python/demo/test.py:
 288         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
 289         - takes an optional filename argument (the file to parse).
 290       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
 291         PubElVals hashing table.
 292       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
 293
 294 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 295       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
 296         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
 297       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
 298       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
 299       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
 300         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
 301       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
 302
 303 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 304       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
 305         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
 306         that we can import de shadow classes without errors].
 307
 308 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 309       * hashtest.cxx removed (since allready in Test)
 310       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
 311       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
 312       * src/Makefile prepared for python wrapping
 313
 314 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 315       * src/gdcmHeader.cxx :
 316         - Parsing of header is now separated from loading of element values
 317           (see gdcmHeader::LoadElements).
 318         - general clean up of hopefully all file access (creation of
 319           ReadInt16 and ReadInt32)
 320
 321 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 322       * src/gdcmHeader.cxx :
 323         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
 324           method.
 325         - SetLgrElem renamed to SetLength
 326         - GetLgrElem renamed to GetLength
 327         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
 328       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
 329       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
 330         due to IdoDude was cleaned out.
 331
 332 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 333       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
 334         concentrates on finding the value representation (when it exists).
 335         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
 336         returning the unecessary skL (skipped length).
 337         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
 338         it was redundant with the File position internals (by using
 339         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
 340         jajun.
 341       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
 342         on the libido specificities which are handled through class
 343         inheritance.
 344       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
 345         added.
 346
 347 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 348       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
 349         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
 350
 351 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 352       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
 353
 354 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 355       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
 356         and _IdDcmSWAP_LONG.
 357
 358 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 359       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
 360         May 23 2002. Needless to say we are running late...
 361