ChangeLog

   1 2003-07-28  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
   2         * src/gdcmHeader.cxx : misplaced return 0.; for ACR/NEMA
   3 2003-07-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
   4       * src/jpeg/libijg12/.cvsignore, jconfig.* : ommited files while last
   5         commit of JPR (before his hollidays to facilitate our work).
   6       * setup.py : bug fix in code. Modifications made while the last commit
   7         of JPR. The code hasn't been tested before the commit... it's so
   8         useless to make that (for best programmer that is JPR) !!!
   9 2003-07-08  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  10       * tagged the current version as Version0_3 (i.e. version 0.3)
  11 2003-07-08  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
  12       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx : remove a symbol that is unused
  13       * src/jpeg/libijg8/jmorecfg.h : adding export symbol for windows
  14       * *.dsp : modifications to use new libgdcmijpeg8 library
  15       * setup.py : bug fix on VTKPATH variable
  16       * PACKAGER : adding all concerning windows
  17 2003-07-07  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  18       * src/gdcmElValSet.cxx, gdcmFile.cxx: JPR bug fix, removal of
  19         garbage debug code.
  20       * TODO, vtk/vtkGdcmReader.cxx: upcoming fixes comments.
  21       * gdcmPython/testSuite.py: JPR bug fix, brutal erasement of
  22         test suite reported error.
  23       * PACKAGER file added (describes what a packager must do when
  24         packaging a new release).
  25       * MANIFEST.in, now declares jconfig.linux and jconfig.vc
  26       * configure.in: upgraded version number to 0.3.0
  27       * fixing build of rpm (through rpm -ta):
  28         - Doc/Makefile.am exports proper doxygen files
  29         - src/jpeg/libijg8/Makefile.am exports the include files.
  30 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
  31       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading only 1 file.
  32       * src/gdcmHeader.h : formatting code
  33 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
  34       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
  35         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
  36         is made in an internal list to prevent this problem.
  37         Bug fix when output is empty.
  38         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
  39         correction.
  40       * vtk/vtkGdcmReader.h : adding comments for InternalFileNaleList variable
  41 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
  42       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
  43       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
  44         files. Added method to remove all files on the input
  45         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
  46         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
  47 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  48       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
  49         when using make instal.
  50       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
  51         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
  52 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
  53       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
  54       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
  55 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
  56       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
  57         linux and WINDOWS !
  58       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
  59       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
  60 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  61       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
  62         addon of the jpeg library)
  63       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
  64       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
  65       * INSTALL now points to web documentation
  66 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  67       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
  68         gdcmUtil.h anymore.
  69       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
  70         clean target.
  71       * src/gdcm*.[cxx|h] :
  72         - to allow compilation with gcc 3.x
  73           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
  74           -- small fixes on exceptions.
  75           Note: linking not tested !
  76         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
  77           building stage.
  78       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
  79         dependent convertion).
  80 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  81       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
  82         Changelog):
  83         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
  84         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
  85           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
  86         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
  87 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
  88       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to
  89         compile
  90       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
  91         (FileName -> Filename)
  92 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
  93       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
  94         - UpdateProgress method should now be effective
  95         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
  96           to volumes),
  97         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
  98           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
  99           accelerating things).
 100         - when building a stack of images/volumes, files which are not
 101           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
 102           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
 103           in the stack (for the caller to notice the problem).
 104 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 105       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
 106 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 107       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts
 108         between standard library (std) and vtk library (problems are found
 109         under Windows... thanks Windows !)
 110 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 111       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
 112         debug stage).
 113       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
 114 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 115       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
 116 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 117       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
 118         called with different flags than the default ones (with automake).
 119         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
 120            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
 121         and went for warning fixes:
 122         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
 123           up from unused variables.
 124         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
 125       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
 126 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 127       * gdcmPython/gdcm.i:
 128         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
 129           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
 130           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
 131         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
 132           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
 133           exported to Python a as cvar.
 134       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
 135         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
 136         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
 137         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
 138         C++ static methods).
 139       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
 140         with the above changes.
 141 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 142       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
 143 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 144       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
 145         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
 146         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
 147          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
 148          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
 149            a wrapper
 150          - Wrapper interface which wrap sources
 151         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
 152         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
 153       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
 154         files for compilation
 155 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
 156       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
 157         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
 158         - vtk/Makefile.am now builds a library
 159         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
 160           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
 161           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
 162           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
 163           import library.
 164         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
 165           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
 166           + vtk/vtkGdcmReader.so and
 167           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
 168           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
 169         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
 170           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
 171         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
 172           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
 173       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
 174       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
 175         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
 176         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
 177         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
 178         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
 179         collision of various stl members (principally cout...).
 180       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
 181         file.
 182       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
 183          comply with above changes)
 184 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
 185       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
 186       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
 187         vtk data structure (an image Flip was required).
 188       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
 189       * cosmetic changes in documentation.
 190 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
 191       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
 192         unexisting file is given as argument.
 193       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
 194         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
 195         containing those images is now available at
 196           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
 197         with the name gdcmData.
 198         All the python scripts (including the package initialisation file
 199         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
 200         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
 201 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
 202       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
 203         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
 204         demo of the usage of this class.
 205         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
 206         at configure (or autogen.sh) stage.
 207 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
 208       * More memmory link related corrections and documentation fixes.
 209         Notes on valgrind:
 210           - maximum info is obtained with a command of the form:
 211             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
 212                    --show-reachable=yes PrintHeader
 213           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
 214             allocation scheme through the usage of map and list. It looks
 215             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
 216             (in fact further invocation to the STL would recollect the
 217              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
 218       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
 219         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
 220         Note: some images don't seem to work e.g.
 221             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
 222       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
 223         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
 224         make gdcm more thread friendly.
 225 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
 226       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
 227           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
 228         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
 229           gdcmHeader::_dicom_vr.
 230         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
 231         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
 232           VRHT*.
 233         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
 234 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
 235       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
 236         make install stage.
 237 2003-04-9 JPR
 238       * UpdateGroupLength replaced by new one
 239 2003-04-7 JPR
 240       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
 241         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
 242
 243 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
 244       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
 245       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
 246       * src:
 247         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
 248         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
 249           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
 250         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
 251           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
 252           carried the same semantics.
 253           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
 254         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
 255           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
 256         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
 257       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
 258       * gdcmGetXSize added
 259       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
 260       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
 261 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 262       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
 263         (to avoid double call by end user).
 264       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
 265         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
 266 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 267       * gdcm/Doc many doxygen changes:
 268         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
 269           the html.users end users oriented documentation and
 270           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
 271           oriented documentation.
 272         - README changed accordingly
 273         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
 274         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
 275           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
 276         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
 277           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying
 278           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
 279       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
 280         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
 281       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
 282         ill-formed documentation sections.
 283       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
 284 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 285       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
 286       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
 287         un*ces with sh-utils test utility.
 288       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
 289       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
 290       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
 291       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
 292       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
 293 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 294       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
 295       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
 296 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 297       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
 298       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
 299       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
 300       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
 301         compilation work.
 302       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
 303       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
 304 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 305       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
 306         hence the user doesn't need this explicit call.
 307         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
 308           i.e. LoadElements() call removed.
 309       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
 310         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
 311       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
 312         for adding user defined new tags.
 313         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
 314         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
 315           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
 316 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
 317       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
 318    Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am,
 319    src/Makefile.am : the project should properly compile and install
 320    with the autotools, included the python wrappers part.
 321       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
 322 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 323       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
 324 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 325       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
 326         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
 327         for usage).
 328       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
 329         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
 330         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
 331       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
 332         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
 333 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 334       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
 335         in InstallMode or PreInstallMode but with an environement given
 336         value of GDCM_DICT_PATH.
 337       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
 338 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 339       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
 340       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
 341       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
 342         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
 343         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
 344 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 345       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
 346         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
 347         gdcmHeader.h
 348       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
 349         (as opposed to gdcm.h)
 350       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
 351       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
 352         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
 353       * autogen.sh removed history related references to crea package.
 354 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 355       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
 356         bug.
 357 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 358       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
 359         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
 360         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
 361         of hidding away the python related distutils specific files
 362         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
 363         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
 364         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
 365         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
 366 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 367       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
 368       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
 369         among the list of sources.
 370
 371 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 372       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
 373       * modifications in MSVC projects
 374 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 375       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
 376         looks like we can move back to original usage of exception within
 377         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
 378         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
 379       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
 380         README file for usage added.
 381       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
 382         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
 383         testing the proper parsing of a Dicom related file.
 384         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
 385       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
 386       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
 387         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
 388           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
 389           Dicom public dictionnary were not accessible without an
 390           instance of class gdcmHeader.
 391         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
 392           require no instances at all to be invocated.
 393         - within gdcmDictSet this change required to change some method
 394           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
 395           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
 396       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
 397         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
 398       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
 399         the above to be effective.
 400       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
 401         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
 402       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
 403         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
 404         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
 405         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
 406         (for python dectection).
 407       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
 408         now avoids publishing the empty entries.
 409 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 410       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
 411         ExtraPath reused :-P
 412       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
 413 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
 414       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
 415       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
 416       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
 417         and links
 418 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 419       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
 420         method. Doxygenation.
 421       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
 422 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 423       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
 424         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
 425         when using "python setup.py install".
 426       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
 427         reexports the working classes.
 428       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
 429         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
 430         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
 431         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
 432         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
 433         subdir (see the README file). This problem probably due to
 434         an combination of g++ and dynamic loading.
 435       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
 436 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 437       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
 438         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
 439         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
 440         again in a python subdir, but the package itself is now in
 441         python/gdcmPython.
 442       * setup.py was cleaned up:
 443         - pythonIncludePath removed
 444         - python setup.py bdist target is now functional.
 445       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
 446         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
 447         accordingly.
 448 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 449       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
 450       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
 451         distutils installer is operational.
 452       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
 453           shadow classes (from gdcm.py).
 454         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
 455           instead of gdcmPython/demo/load.py.
 456         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
 457
 458 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 459       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
 460         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
 461         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
 462         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
 463         dictionary.
 464         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
 465           are now in the "???" group.
 466         - python/gdcm.i changed accordingly,
 467         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
 468           of the above new functionalities in Python.
 469 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 470       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
 471         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
 472           were definitively removed.
 473         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
 474       * src/gdcmElValSet.cxx:
 475         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
 476         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
 477         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
 478         - Added GetElementByName(string).
 479       * src/gdcmHeader.cxx: added
 480         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
 481         - GetPubElValRepByName(string)
 482         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
 483         - GetShaElValRepByName(string)
 484         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
 485         - GetShaElValRepByName(string)
 486         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
 487         - GetElValRepByName(string)
 488         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
 489         - GetElValRepByName(string)
 490       * Doc/requirements.txt added.
 491 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 492       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
 493       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
 494         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
 495         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
 496         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
 497       * python/testSuite.py changed accordingly.
 498 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
 499       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
 500         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
 501              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
 502               cannot be exported. [...]
 503               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
 504               be exported. [...]
 505               This is caused by a designed limitation that once a template
 506               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
 507               exported."
 508         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
 509         limitation" of VC++ is a pitfall.
 510         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
 511         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
 512         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
 513         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
 514         library.
 515         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
 516       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
 517          dll under windows !!!!)
 518       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
 519       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
 520         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
 521       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
 522         (one) of image(s).
 523       * removed glib references
 524       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
 525 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 526       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
 527         that only displays required tags and testAll.py that parses all
 528         the files of the testsuite without using unittest.
 529       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
 530       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
 531       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
 532         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
 533 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 534       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
 535         values, but limits itself to values which are below a user specified
 536         size (by default 1024 bytes).
 537       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
 538         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
 539         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
 540         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
 541       * python/testSuite.py
 542         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
 543         - two new examples added.
 544       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
 545 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 546       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
 547         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
 548       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
 549       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
 550       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
 551 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 552       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
 553         the vr was also RET.
 554       * python/testSuite.py more tests added.
 555 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 556       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
 557       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
 558       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
 559         7.18 Integer types (see stdint.h)
 560         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
 561       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
 562         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
 563         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
 564         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
 565         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
 566         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
 567         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
 568         The rest of the changes we the necessary adaptations.
 569 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 570       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
 571         VR files.
 572       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
 573 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 574       * Adaptation for porting to VC++:
 575         - src/gdcm.h
 576           o forced to use std namespace (for string to be known)
 577           o all class use __declspec export style on WIN32
 578         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
 579           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
 580       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
 581         variable GDCM_DICT_PATH.
 582       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
 583 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 584       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
 585         to native Python dictionary.
 586       * python/demo/test.py:
 587         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
 588         - takes an optional filename argument (the file to parse).
 589       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
 590         PubElVals hashing table.
 591       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
 592 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 593       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
 594         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
 595       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
 596       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
 597       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
 598         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
 599       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
 600 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 601       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
 602         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
 603         that we can import de shadow classes without errors].
 604 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 605       * hashtest.cxx removed (since allready in Test)
 606       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
 607       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
 608       * src/Makefile prepared for python wrapping
 609 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 610       * src/gdcmHeader.cxx :
 611         - Parsing of header is now separated from loading of element values
 612           (see gdcmHeader::LoadElements).
 613         - general clean up of hopefully all file access (creation of
 614           ReadInt16 and ReadInt32)
 615 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 616       * src/gdcmHeader.cxx :
 617         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
 618           method.
 619         - SetLgrElem renamed to SetLength
 620         - GetLgrElem renamed to GetLength
 621         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
 622       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
 623       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
 624         due to IdoDude was cleaned out.
 625 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 626       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
 627         concentrates on finding the value representation (when it exists).
 628         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
 629         returning the unecessary skL (skipped length).
 630         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
 631         it was redundant with the File position internals (by using
 632         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
 633         jajun.
 634       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
 635         on the libido specificities which are handled through class
 636         inheritance.
 637       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
 638         added.
 639 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 640       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
 641         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
 642 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 643       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
 644 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 645       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
 646         and _IdDcmSWAP_LONG.
 647 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
 648       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
 649         May 23 2002. Needless to say we are running late...
 650