]> Creatis software - gdcm.git/blob - ChangeLog
* Memory leak hunt with the following command:
[gdcm.git] / ChangeLog
1 2004-06-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2     * Memory leak hunt with the following command:
3       valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
4                --show-reachable=yes gdcmTests PrintDocument
5       It looks like many (all?) leaks are due to the STL (or a bad usage
6       of the STL. The lines producing the leaks now have a comment with
7       a "MEMORY LEAK" tag: you can retrieve them with 
8           grep "MEMORY LEAK" src/*
9       Here are two typical examples which I can't help fixing:
10       -----
11           #include <string>
12           int main() {
13              std::string name;
14              char * test = "babo";
15              name = test;    //// <--- valgrind detects 960 bytes lost in
16                              ////   call to std::string::operator=(char const*)
17              name.clear();   //// Doesn't help !
18              return 0;
19           }
20       -----
21           #include <string>
22           #include <iostream>
23           int main() {
24              std::string line;
25              std::cout << "Type a bunch of characters followed by RETURN: ";
26              getline(std::cin, line);   //// <--- valgrind dectects a loss
27                                         //// of 1320 bytes in call to
28                                         /// std::basic_istream<>& std::getline<>
29             return 0;
30           }
31       -----
32
33
34 2004-06-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
35     * src/gdcmHeader.[cxx|h]:
36       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEF|RLE]*)
37         and related, moved away to gdcmDocument.
38       - Accessors (on the form [Get|Set]Entry*) set up to expose publicly
39         the corresponding protected accessors of inherited class
40         gdcmDocument, removed ! As a consequence gdcmFile had to be 
41         declared friend of class gdcmDocument (see below).
42       - operator< moved to gdcmDocument (in fact it belongs to gdcmDicomDir).
43       - Clean up of undefined or unused methods.
44     * src/gdcmFile.[cxx|h]: added SetEntryByNumber (in order to take into
45       account the changes to gdcmHeader.h).
46     * src/gdcmDocument.h:
47       - gdcmFile is now a friend class (in order to take into account the
48         changes to gdcmHeader.h).
49       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEF|RLE]*) added
50         (see changes to gdcmHeader.h).
51       - Accessors (reading on the form GetEntry*) are now public.
52       - Clean up of undefined or unused methods.
53     * src/gdcmDocument.cxx:
54       - adaptation to changes to gdcmDocument.h
55       - ::OpenFile now writes a verbose message when file cannot be opened.
56       - some std::string properly set to VRKey
57     * src/gdcmDicomDir.h: historical references to gdcmHeader changed to
58       references to gdcmDocument. 
59     * Test/TestFindTags.cxx: changed accordingly to above changes.
60     * gdcmPython/testSuite.py: adapted to renaming of acr files in 
61       cvs repository gdcmData.
62
63 2004-06-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
64     * src/gdcmValEntry.h: member voidArea type changed from char* to void*.
65     * src/gdcmBinEntry.h: member voidArea commented out, since it potentially
66       conflicts with gdcmValEntry::voidArea.
67     * src/gdcmValEntry.cxx: unmatching comment wiped out.
68     * src/gdcmVR.[h|cxx]: added two predicates that partition the possible
69       Value representation between StringRepresentable and BinaryRepresentable.
70     * src/gdcmDocument.cxx: 
71       - method ParseDES: proper indentation restored and usage of
72         gdcmVR::IsVROfGdcmStringRepresentable wired in.
73       - method LoadDocEntry: the fingerprint left in the SetValue() of
74         unloaded entries (length > MaxSizeLoadEntry) had curiously been
75         removed. Reverting to previous code segment with the proper
76         dynamic_cast< gdcmValEntry* >.
77         Note: this was (partially) breaking the python test suite
78               (gdcmPython/testSuite.py) that made usage of the above
79               fingerprint to check presence of "Pixel Data".
80     * src/gdcmDocEntry.h: coding style.
81     * gdcmPython/__init__.py: environement variable GDCM_DATA_PATH is
82       now taken into account.
83     * gdcmPython/gdcm.i: adaptation to the new internal representation
84       of gdcm (exit gdcmParser, hello gdcmDocument).
85     * gdcmPython/testSuite.py: quick and dirty fix for loading vtkgdcmPython
86       on posix.
87     * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: doesn't use the gdcmDocument::Print()
88       anymore, but instead prints the loaded Python dictionary.
89     * .... alas, the python testSuite is still broken.
90
91 2004-05-18 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
92     * gdcmPython/gdcm.i : remove useless lines concerning the gdcmGlobal 
93       gdcmGlob
94     * gdcmPython/setup.py : replace the use of cvar.gdcmGlob to gdcmGlobal
95     * src/gdcmUtil.h : export methods
96
97 2004-05-16  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
98     * Some more cleanup/enhancement in gdcmPython/CMakeLists.txt getting close
99       to right behavior
100     * Initial addition of automatic python testing
101     * Initial addition of automatic image comparison
102
103 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
104     * src/gdcmCommon.h, gdcmDicomDir.cxx, gdcmFile.cxx, gdcmHeaderHelper.h,
105       gdcmParser.cxx, gdcmParser.h : bug fix for the Microsoft .Net compilation
106
107 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
108      * src/gdcmFile.cxx, gdcmHeader.cxx : bug fix for the msvc compilation
109      * Test/ShowDicom.cxx : bug fix for msvc compilation
110      * vtk/vtkgdcmViewer.cxx : bug fix for msvc compilation
111
112 2004-05-04 Jean-Pierre Roux
113      * ADD Taking into account the 'Dicom Sequences' leads up to introduce
114        new concepts (and new classes) :
115        a 'gdcmDocument' is composed of a set of Doc Entries, that are
116         - elementary gdcmDocEntries (former gdcmHeaderEntries)
117         - Sequence Doc Entries (gdcmSeqEntries)
118        a Sequence is composed of Items.
119        Each item is a set of Doc Entries (this is recursive)
120        The non uniqueness of the 'Dicom tag' is due to this recursivity
121        (never taken into account)
122        Our unability to add a new 'entry' in the header
123        at the proper location (neither in the H-Table (map or multimap),
124        nor in the Chained List is also due to this recursivity.
125        Don't try, right now, to use/modify/compile these new sources :
126        nothing is finished.
127        We just commit all the stuff, 'as is', in order not to loose it.
128
129 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
130      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix in the setting of file name
131      
132 2004-05-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
133      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading a list of files using the
134        file prefix (SetFilePrefix)
135
136 2004-05-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
137      * Add a new test: ShowDicom, for now this is just the c++ version of
138        checkRead.sh, later it will be able to compare the image read against a
139        baseline.
140      * Replace the DEBUG on the stack with a global entry in cmake interface:
141        GDCM_DEBUG, so you can turn verbosity ON/OFF for debug statement.
142
143 2004-04-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
144      * Add an example subdir, with a real example on how to read + write a 
145        dicom image
146
147 2004-04-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
148      * Doc/gdcmUML.xmi added raw UML class view (umbrello format)
149      * Doc/CMakeLists.txt: the main page is now properly differentiated
150        between the developper and user version.
151      * Doc/doxygen.config.in: dropped search related obsolete flags
152      * src/gdcmParser.h, gdcmHeader.h: doxygenation
153
154 2004-04-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
155      * DEVELOPPER: added some helpfull comments for compile/test/install
156        when using cmake.
157
158 2004-04-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
159      * ENH: 1. Remove remp solution of gdcmTests.cxx+ gdcmMain directly in 
160                src directory, now generated in the build dir.
161             2. Tests as mentionned smarter
162             3. Some clean up
163             4. Add a new method in gdcmDict that return the PubDict by name 
164                this is interesting for 3rd party lib like ITK, 
165                where we could set the institution name / patient name...
166
167        * ENH: 1. Now the test suite is working for real
168               2. All binaries are now output in the gdcm-bin directory 
169                  (this was not true before)              
170
171 2004-04-28  Jean-Pierre Roux
172      * ENH add the provisional  gdcmHeader::SQDepthLevel to allow 
173            SeQuence indented printing of Dicom Header.
174      * ENH merge methods gdcmParser::Parse and gdcmParser::LoadHeaderEntries
175            into the single gdcmParser::LoadHeaderEntries for efficiency purpose.
176            Computation of SQDepthLevel is now part of gdcmHeader constructor
177      * ENH add self defined param 'new' to PrintHeader to 'show' the SeQuence
178            tree-like structure of a Dicom Header.
179      * FIX Test code cleaning     
180            
181 2004-04-25  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
182      * ENH: Adding automatic testing
183        1. Need a DartConfig.cmake to submit to public
184        2. Add a test driver gdcmTest.cxx
185        3. gdcmTestMain, an helper for the main test driver gdcmTest
186        4. Files in Test don't have a main anymore, this becomes interesting 
187           when we add more and more tests, thus dsw don't have to load 
188           too many projects
189      * ENH: Adding a GDCM_DATA_ROOT for testing
190      * ENH: Remove redundancie about GDCM_DICT stuff, now we only need to modify
191        one file instead of seven + some small cleanup
192
193 2004-04-22  Jean-Pierre Roux
194      * ENH Minor changes to the Print() methods.
195      * ADD gdcmParser::PrintEntryNiceSQ() to allow SQ-indented
196            Header printing. Example given with :
197            > PrintHeader fileName  2 new
198           (SQ based tree-like structure still to be done for the Header ...)
199            
200 2004-04-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
201      * ENH: Some cosmetic clean up for compilation with -W -Wall -Werror
202          1. I have added some unsigned where needed
203          2. Some function parameter not used -> (void)
204          3. In gdcmDicomDir.cxx, add GDCM_DICOMDIR_NONE case
205          4. g++ don't like character '\' in comment
206          5. #define jpeg_create_decompress  jCreaDecompress
207                     this really need to be fixed
208          6. virtualize destructor of gdcmObject ... leakage
209          7. sscanf(g->first.c_str(),"%x",&gr_bid); 
210                     this also really need to be fixed
211          8. gdcm/src/jpeg/libijg8/CMakeLists.txt, 
212                     remove compression file 
213                     (as we only do decompression, right ?)     
214      * ENH: Change malloc/calloc/free with c++ equivalent
215
216 2004-04-21  Jean-Pierre Roux
217      * FIX gdcmHeaderHelper::GetXSpacing
218            when a single value is found (bug ?), xpacing is now 
219            defaulted to yspacing
220            
221 2004-04-19  Jean-Pierre Roux
222      * ADD gdcmData/Wrist.pap (PAPYRUS 3.0 -single frame-) for checking purpose
223      * ENH add parameters :
224                bool  exception_on_error = false, 
225                bool  enable_sequences   = false,
226                bool  ignore_shadow      = false
227            to the gdcmFile constructors to be full gdcmParser compliant
228      * FIX vtk/vtkGdcmReader.cxx now uses  enable_sequences = true in gdcmFile
229            to allow reading of PAPYRUS 3.0 files 
230               
231 2004-04-06  Jean-Pierre Roux
232      * ADD gdcmData/E00001S03I0015.dcm for SQ checking purpose
233      
234 2004-04-02  Jean-Pierre Roux
235      * ADD : Test/checksequence.sh, for a general recap on SQ pb
236      * FIX : gdcmParser::WriteEntryTagVRLength emprovement of special treatement
237              for Philips spurious Tag fffe|0000 while rewritting Dicom files
238              
239 2004-03-30  Jean-Pierre Roux
240      * FIX gdcmParser::ReplaceOrCreateByNumber shouldn't seg fault any more 
241          for ACR file, written out as DICOM files (hope so...)
242
243 2004-03-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
244      * src/gdcmParser.[cxx|h] and gdcmHeader.[cxx.h]: gdcmHeader::Write split
245        in WriteEntryTagVRLength and WriteEntryValue. Those methods were
246        moved to base class gdcmParser and only the specialisation is kept
247        in gdcmHeader.
248      * src/gdcmParser.[cxx|h]: ReplaceOrCreateByNumber(char*, guint16, guint16)
249        trashed out (because ReplaceOrCreateByNumber(string, guint16, guint16)
250        already does the job.
251      * src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: WriteDicomDirEntries renamed to WriteEntries
252        (to be consistent with gdcmParser::WriteEntries).
253
254 2004-03-30 Benoit Regrain
255      * vtk/vtkGdcmReader.[h|cxx] : fix the read of 3 gdcmHeader when making an
256        upate of the object's instance. It's passed to 2 in the unfavorable
257        case : one in the ExecuteInformation, one in the ExecuteData
258
259 2004-03-29  Jean-Pierre Roux
260      * ENH : Check on file type to be written moved
261              from gdcmParser::WriteEntry to gdcmParser::WriteEntries
262      * FIX : gdcmObject::ResetBoundaries now stops properly
263              when end-of-list is reached
264            : gdcmVersion modified (as Benoit Regrain asked)
265
266 2004-03-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
267      * src/gdcmParser.cxx: removal of all TAB character. Indentation fixed.
268      * src/gdcmUtil.cxx: added forgotten iostream include.
269      * src/gdcmCommon.h: FileType enum entry DICOMDIR removed (since
270        equivalent to ExplicitVR in existing code).
271
272 2004-03-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
273      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmGlobal.[cxx|h]
274        now contains all the gdcmGlobal related code.
275      * minor coding style and doxygenation changes.
276
277 2004-03-26  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
278      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmDebug.[cxx|h]
279        now contains all the Debug related code.
280      * minor clean-up of includes in src/*.cxx
281      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _cleanString C style function (replaced with
282        CreateCleanString) removed.
283      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _CreateCleanString renamed to CreateCleanString
284      * Doc/DoxyMainPageUser.txt added.
285      * Doc/Doc/DoxyfileUsers updated to version 1.3.4 of Doxygen.
286      * src/gdcmCommon.h now defines getcwd for Win32 (moved away from
287        src/gdcmDirList.cxx)
288
289 2004-03-24  Jean-Pierre Roux
290      * FIX a lot of little surface modifications to be doxygen 1.3.6 compliant
291
292 2004-03-23  Jean-Pierre Roux
293      * FIX Now gdcmFile::SwapZone doesn't seg faults any longer for
294            big endian made volumes
295      * ENH Now gdcmParser constructor and destructor are protected to forbid
296            end user to instanciate class gdcmParser
297           (only gdcmHeader and gdcmDicomDir are meaningfull)
298
299 2004-03-22 Benoit Regrain
300      * FIX : src/gdcmDicomDir.cxx : make windows compilable
301      * FIX : gdcmPython/gdcm.i : change gdcmStudy to gdcmDicomDirStudy and
302              gdcmSerie to gdcmDicomDirSerie
303
304 2004-03-19  Jean-Pierre Roux
305      * ENH Now the tree-like structure describing a DICOMDIR comming from
306            an already existing DICOMDIR file is consistent with
307            the home-made tree-like structure build ex-nihilo
308            or build from the files held (recursively) in a Directory
309            functions gdcmDicomDir::CheckBoundaries()
310            gdcmObject::SetBoundaries() added
311
312 2004-03-17  Jean-Pierre Roux
313      * REM (Eric Boix bug) : removal of meaningless
314                              gdcmDicomDirImage::NewImage function.
315      * FIX now file names and directory name are written properly in the
316            DICOMDIR
317      * FIX now gdcmDicomDir constructor may be call without any trick
318            about the name
319
320 2004-03-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
321      * FIX (JPR bug) : src/gdcmDicomDirImage.cxx added missing definition
322                        of gdcmDicomDirImage::NewImage as empty function.
323
324 2004-02-28  Jean-Pierre Roux
325      * ENH add gdcmDicomDir:NewPatient
326            add gdcmDicomDirPatient:NewStudy
327            add gdcmDicomDirStudy:NewSerie
328            add gdcmDicomDirSerie:NewImage
329            to allow making gdcDicomDir object.
330      * ADD PrintDicomDir executable that uses gdcmDicomDir tree-like structure
331           (as opposite to the gdcmHeader chained list)
332
333 2004-02-11 Benoit Regrain
334      * FIX : memory leaks and the set of ArgDelete methods in gdcmDicomDir
335              when using from python
336
337 2004-02-10 Benoit Regrain
338      * FIX : bug fix in the gdcmDirList for the recursivity in directories
339      * FIX : in gdcmDicomDir when the directory is empty
340      * ENH : add callback and methods to get the progression of dicomDir
341              directory parsing
342
343 2004-02-06 Jean-Pierre Roux
344      * ENH : - now gdcmDicomDir::CreateDicomDir() returns also the meta elements
345              - GDCM_META added to gdcmDicomDirType
346              - class gdcmMeta created
347      * ENH : - A brief summary is now displayed at the beginning of
348              'testDicomDir' to help disaster magnitude estimation
349      * REM : Now useless Test/explDICOMDIR.cxx
350
351 2004-02-05 Benoit Regrain
352      * ENH : add methods in gdcmObject to get the hash table or the list of
353              header entries
354      * FIX : wrapping python for ListPatient, ListStudy, ListSerie, ListImage
355      * FIX : wrapping python for TagHeaderEntryHT
356
357 2004-02-04 Benoit Regrain
358      * FIX : even length for some strings when writting the dicom dir
359      * FIX : sort the images in the dicom dir
360      * FIX : Bug fix for python use of dicom dir
361      * ADD : a python demo
362
363 2004-02-04 Jean-Pierre Roux
364      * FIX : Final solution (?) for icone embedded images
365      * FIX : dicomVR.dic Overlay group is not *only* 6000, but 60xxx
366              (see http://medical.nema.org/dicom/2003/03_06PU.PDF)
367              add groups 6002, 6004, 6006, to allow 'clean' parsing of
368              gdcmData/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1
369      * ENH add gdcmData/checkWriteExplicit.sh gdcmData/checkWriteImplicit.sh
370            to make full checking easier
371         
372 2004-02-04 Benoit Regrain
373      * FIX : WriteEntries : coding style & logic in parameters
374      * FIX : Set the elements to create the DicomDir in a dictionary file
375
376 2004-02-03 Benoit Regrain
377      * gdcmDirList : to parse a hard drive directory in recursive (or not)
378      * gdcmDicomDir : add the load of directory
379      * Bug fix and print add-on
380
381 2004-02-03 Jean-Pierre Roux
382      * ENH gdcmParser : allows "DICM" files, with NO group '0002'
383      * FIX handling 'non string elements' unsecure area (LUT, overlays, etc)
384      * FIX Dicts/dicomV3.dic : Add a few missing 'group length' Elements 
385      * FIX gdcmParser.cxx : 'group length' elements are now considered 
386            as integers, even for shadow groups, when file is Implicit VR
387         
388 2004-02-02 Jean-Pierre Roux
389      * FIX : gdcmWrite : equal_range() for multimap doesn't return a 'second' 
390              iterator on last
391              of the last synonym :-(
392      * FIX : gdcmWrite::WriteBase : method stops if Pixels not yet Read (except 
393              for DICOMDIR ;-)
394      * ENH gdcmData/checkWrite.sh :modif for full check of Explicit VR writting
395      * FIX taking into account the possible 7fe0,0010 multiplicity        
396      * FIX add GRPixel,NumPixel,countGrPixel (gdcmParser protected members)
397            to allow removal of references to 7fe0,0010, to deal with
398       ACR-NEMA images, when 0028,0200 is meaningfull
399
400 2004-01-31 Jean-Pierre Roux
401      * FIX gdcmParser::WriteEntries : when a VR is tagged as 'Unknown'
402            no longer writes 'Un' on disk
403      * FIX SQ elements with actual length are now dealt with corectly
404      * FIX gdcmFile::WriteBase make the difference, for color images, between
405            the length (for Palette expanded images)
406            and Raw Length (non expanded image + Palette)
407      * FIX Dicts/dicomV3.dic : removal of 'CTX' (context dependant) VR
408            (that broke Write). Replaced by UL.
409            Aware user will reload the field if he 
410            thinks it's necesssary
411              
412 2004-01-30 Jean-Pierre Roux
413      * gdcmParser::CheckSwap() now defaults the filetype to ACR 
414        when 'dirty Acr' is found, to be compliant with the new 
415        IsReadable() methods.
416        
417      * gdcmHeaderHelper :add Pixel Type 'FD', for dealing with 'double' images.
418       (no DOUBLE images in kosher DICOM, 
419       but so usefull for people that miss them ;-)
420       
421      * add Test/testDicomDir.cxx, Test/makeDicomDir.cxx , Test/explDICOMDIR.cxx
422        DICOMDIR related utilities (not checked as Windoze compliant)
423
424 2004-01-28 Jean-Pierre Roux
425      * upgrade GdcmHeaderEntry Print Method for DICOMDIR
426
427 2004-01-27 Jean-Pierre Roux
428      * gdcmParser constructor has a new boolean param,'ignore_shadow', 
429              to allow skipping the shadow elements, to save memory space.
430         The TRUE value for this param has to be used 
431         with a FALSE value for the 'enable_sequence' param.
432         ('public elements' may be embedded in 'shadow Sequences')
433      * gdcmHeader methods now deal with 'embedded icones images' in the header
434              (even when an 'icone image sequence' is announced by the 
435         element (0x0088,0x0200), but there is NO icone at all ...
436         
437      * gdcmHeader sometimes Image Location value doesn't follow  
438              the supposed processor endianity (see gdcmData/cr172241.dcm).
439              Fixed
440
441      * gdcmHeader add the method
442              IterHT  GetHeaderEntrySameNumber(grPixel,numPixel);
443         to get *all* the Header Entries with the same tag.
444         GetHeaderEntrySameName is probabely *useless* 
445         (no meaning : Name is *not* an identifier within the Dictionnary)
446
447 2004-01-26 Benoit Regrain
448      * Bug fix in the print of hexadecimal representations. Remove long fields 
449        in the print and add a third level of print to print them
450
451 2004-01-23 Benoit Regrain
452      * Bug fix on field having a VR = 'UI'. Assume that is a string field
453      * Bug fix on test suite after remove the strip made on not string fields
454      * Split the IsReadable method between gdcmParser which test that the file
455        is dicom and gdcmHeader which test that it's an image file
456
457 2004-01-22 Benoit Regrain
458      * DicomDir : clean code, add methods, set variables in protected or private
459      * gdcmUtil : bug fix for the clean string method
460
461 2004-01-19 Benoit Regrain
462      * Add the use of shadow dictionaries
463      * bug fix and coding style
464
465 2004-01-19 Benoit Regrain
466      * src/gdcmFile.cxx : bug fix concerning the close of file
467      * src/gdcmParser.[h|cxx] : remove obvious Pub informations
468      * Add the update of header entries using the shadow library
469
470 2004-01-19 Benoit Regrain
471      * removal of file gdcmHeader2.cxx
472      * split class gdcmHeader into gdcmParser and gdcmHeader, with gdcmHeader
473        inheriting from gdcmParser. This split is to prepare the integration
474        of dicom dir parsing
475      * bug fix under python
476
477 2004-01-16 Jean-Pierre Roux
478     * REM removal of class gdcmHeaderEntrySet
479     * REM removal of files gdcmHeaderEntrySet.cxx, gdcmHeaderEntrySet.h
480     * ADD add file gdcmHeader2.cxx 
481     * ADD add method gdcmHeader::SetPrintLevel (for PrintHeader)
482
483 2004-01-15 Benoit Regrain
484      * src/gdcmDicSet.[h|cxx] : add virtual entries to have a reference of
485        entries created while parsing the header. Thus, they will be destroyed
486        when the gdcmDictSet will be destroyed
487      * src/gdcmHeader.cxx, gdcmHeaderEntrySet.cxx : uses virtual entries of
488        gdcmDictSet
489
490 2004-01-15 Benoit Regrain
491      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix : before, with python only, the program
492        made a fatal error because of the memory release at the end of program.
493        The problem was in vtkGdcmReader::ExecuteData where we were allocate
494        some memory and vtk seems to have some problems with that.
495      * src/gdcmHeaderEntrySet.cxx : bug fix for std lib and cout
496
497 2004-01-14 Benoit Regrain
498      * src/gdcmHeaderEntry.[h|cxx] : gdcmElValue -> gdcmHeaderEntry
499      * src/gdcmHeaderEntrySet.[h|cxx] : gdcmElValSet -> gdcmHeaderEntrySet
500      * src/*.[h|cxx] : make changes due to class name changes
501      * gdcmPython/demo/*.py : bug fix due to method names
502
503 2004-01-13 Benoit Regrain
504      * src/*.[h|cxx] : coding style
505      * vtk/*.[h|cxx] : coding style
506
507 2004-01-13 Benoit Regrain
508      * gdcmPython/testSuite.py : test the readable flag of file for tests
509      * src/gdcmDict.cxx, gdcmElValSet.cxx : bug fix under windows for prints.
510        It's lied to the stl compilation by MSVC (windows, always windows...)
511      * src/gdcmIdo.h, gdcmHeaderIdo.cxx : remove the Ido unused files
512
513 2004-01-12 Benoit Regrain
514      * src/*.h : add comments
515      * src/gdcmDictSet.h : set the method BuildDictPath in public
516      * src/gdcmTS.cxx, gdcmVR.cxx : use now a dictionnary file other than to be
517        directly setted in the source code
518      * Dicts/dicomTS.dic, dicomVR.dic : 2 new dictionnary files loaded by
519        gdcmTS and gdcmVR
520
521 2004-01-09 Benoit Regrain
522      * gdcmPython/gdcmVersion.py : add a gdcmVERSION variable information
523      * setup.py : use a reference to gdcmVERSION
524
525 2004-01-07 Benoit Regrain
526      * Modification to compile with the distutils.
527      * Bug fix in code
528
529 2003-12-10 Benoit Regrain
530      * gdcmHeader is now aggregating gdcmFile, and not derived into. Thus, we
531        can use a gdcmHeaderHelper to load datas
532      * gdcmPython/testSuite.py : make the testSuite compliant with modifications
533        made in the source code
534
535 2003-12-10 Benoit Regrain
536      * Update Windows projects and .cvsignore files
537
538 2003-11-12 Jean-Pierre Roux
539      * ENH gdcmHeader constructor has one more parameter (default value : false)
540            that allows the user to 'go inside' the SeQuences only
541            if he wants to.
542            gdcmElValSet:Print takes it into account
543
544 2003-11-12  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
545      * ENH: Update gdcmPython/CMakeLists
546      * FIX: (gdcmHeaderHelper) GetRescale and GetSlope
547      * FIX: (gdcmElValSet) char 'tag' was overiding private members (VC++)
548
549 2003-11-10 Jean-Pierre Roux
550       * FIX : gdcmHeader::LoadElements is now based
551              on the ListTag listElem member,
552              not longer on the TagElValueHT tagHt member
553       * ENH : PrintPubElVal shows (temporarily) both results,
554              with the tagHt member and the listElem member.
555              (it's easier to 'see' the problems when using Printheader)
556
557       * FIX : old private member LgrElem is now splitted into
558              ReadLength   : Length actually found on disk (updated only
559                             if bug fixing is necessary), for internal
560                             use only
561              UsableLength : Updated by FixFoundLength, to fix a bug
562                             or to allow Parser going on.
563              Will allow to re-write a kosher header when a SeQuence
564              with a length (not 0000) is found
565       Warning : gdcmFile::Write still uses the TagHt (not ListElem)
566                 because gdcmElValSet::Add does not update ListElem
567                 (to be written)
568
569 2003-11-07 Jean-Pierre Roux
570      * FIX misstyping in Transfert Syntax name table
571      * ENH gdcmHeader::FixFoundLength now allow to 'go inside' tge SeQuences
572           when they have an actual length (not 0000 nor FFFFF)
573      (Nobody should care of it, but DICOMDIR explorers)
574
575 2003-11-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
576      * ENH: vtkgdcmViewer now works with LUT dicom (OT-PAL-face ...)
577
578 2003-11-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
579      * ENH: vtkGdcmReader now supports LUT !
580           (vtkgdcmViewer for now is not able to use them though)
581
582 2003-11-05 Jean-Pierre Roux
583      * in testSuite.py : new files names for checking the package
584      * FIX : Forgot to commit gdcmFile::GetImageDataSizeRaw();
585              that returns the pixel area size to the *aware* (vtk) user
586              that DOESN'T want to turn the PALETTE COLOR image into an RGB image
587
588 2003-11-05 Benoit Regrain
589      * in testSuite.py : Modify the rules for checking the paths
590                        : Explicit error messages
591      * in __init__.py  : Related modif
592
593 2003-11-03 Jean-Pierre Roux
594      * add gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponentsRaw()
595            to be used by aware (vtk) users that want to manage
596            LUT (and no to turn the PALETTE image into an RGB pixels one)
597      * GetPixelType now returns 8U for 24 Bits images
598                     (vtkGdcmReader compliant)           
599       
600 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
601      * Removal of *all* gdcmData images and add them again
602        in order to loose the 'history' of un-anonymised images
603        
604 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
605      * RMV : removal of useless jBitsInJsample.h 
606            for both 8 and 12 Bits JPEG Lossy Libraries
607
608 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
609      * ENH : Add the functions gdcmFile::GetImageDataRaw 
610                                gdcmFile::GetImageDataIntoVectorRaw
611              that act as GetImageData and GetImageDataIntoVector
612              except the making of an RGB Plane from Gray Plane + LUT
613              Intended to aware (vtk) users who know how to manage
614              such an image :
615              After gdcmHeader :
616               GetLUTRGBA return a R,G,B,A LUT if any
617               lgrTotaleRaw gives the 'Raw' length
618               GetImageDataRaw returns the gray Plane
619      * FIX : no more dirty trick for 'Segmented xxx Palette Color Lookup' images
620              (They stay Grey, just like with other Dicom viewers :-(
621
622 2003-10-30 Jean-Pierre Roux
623      * FIX : a VC++ intended syntax modif broke the 12/12 Bytes expanding
624              
625 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
626      * ENH: Can be used like this '$vtkgdcmViewer *.dcm' with *.dcm 
627            being coherents dicom files.
628      
629 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
630      * FIX: DOH ! Forgot about windo$e users, they couldn't read lossless jpeg,
631            from medcon lib !
632      * ENH: Turn it into DOS file type to match libgdcmijpeg8.dsp file type 
633      * ENH: Two steps is necessary to please VC++ compiler...
634      * FIX: DOH ! libgdcmijpg8 -> libgdcmljpeg
635      * ENH: Add include dir to medcon lib
636      * FIX: only one function is being exported for now ! 
637            You should use GLOBAL(return type) see ljpg/jpeg.h for more info
638             
639 2003-10-29 Jean-Pierre Roux
640       * adding  gdcmHeader::GetLUTRGBA
641         returns a 4 * 256 Bytes Reg/Green/Blue/Alpha vtk compliant LUT
642           --> Mathieu, the modif u're waiting for is not yet committed
643       * removal of now useless GetLUTRed,GetLUTGreen,GetLUTBlue,GetLUTRGB
644
645 2003-10-27 Jean-Pierre Roux
646       * adding some xmedcon breaker files (courtesy of Loïc Boussel)
647         00191113.dcm DermaColorLossLess.dcm
648         MxTwinLossLess.dcm RadBWLossLess.dcm
649       * ENH: For version prior to vtkImageViewer2 -r 1.19
650       * FIX: avoid pb with xmedcon-breaker CT McTwin Elscint images
651
652 2003-10-27  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
653       * Removal of ido stuff in CMakeLists.txt
654                                                
655 2003-10-24  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
656       * ENH: vtkGdcmReader.cxx can now read multiframe dicom
657       * FIX: remove a call to ->Modified ... see comments
658       * FIX: vtkgdcmViewer.cxx was writting ASCII file...this is so slooooow !
659       
660 2003-10-23  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
661       * FIX: Problem with path for libvtkgdcmPython
662       * ENH: Try adding a search script for python site-package
663       * RMV: Remove some file from medcon lib that are not necessary
664       * FIX: gdcm/Makefile.am fix for generating ljpg medcon
665       * ENH: CMakeLists.txt now generate 'pygdcm.so' instead of 'libpygdcm.so'
666       * FIX: More pragma disable fro VC++, 
667              I don't think I break something as it is also disable in VTK/ITK.
668         But it fasten debug compilation time.
669             
670 2003-10-23 Jean-Pierre Roux
671       * gdcm now deals with 16 Bits Run Length Encoded images
672         (they are compressed as 2 planes images, 
673          one for the high Bytes, the other for low Bytes)
674
675 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
676       * Now CheckRead takes into account :
677          - the bugged 'Leonardo' Siemens images
678          - the XA images, sent thru the burning VPRO station
679       * add I9000001.dcm, a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
680        (breaks DicomWorks)
681
682 2003-10-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
683       * FIX: When copying a Makefile.am to CMakeLists.txt 
684              one should remove the '\'
685         
686 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
687       * in gdcmData adding a bugged 'Leonardo' Siemens image 
688         (wrong lengths in header)
689         OK with gdcm, KO with the other viewers :-)
690       * add a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
691         (breaks DicomWorks)
692
693 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
694       * in gdcmData add the checkvtkgdcmViewer.sh shell script 
695         for a brutal checking of vtkgdcmViewer compliance
696
697 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
698       * add the files for 'xmedcon' Jpeg Lossless library
699       * call of 'xmedcom' Jpeg Lossles libray (instead of the old LibIDO one)
700
701 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
702       * 'Compacted Files' (12 Bits Allocate, 12 Bits Stored) are now dealt with
703      
704 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
705       * garbage Siemens 'Leonardo' images dealt with
706         (the patch is easy to remove)
707       * cosmetic changes to avoid warnings
708       
709 2003-10-20  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
710       * ENH: vtkgdcmViewer now autoscale color/window level on start-up, 
711         no need to press 'r' now.
712    
713 2003-10-20  Jean-Pierre Roux
714       * upgrade of checkRead.sh checkWrite.sh according
715         to new Jpeg Lossless decompressor
716       * add US.3405.1.dcm, a genuine RGB medical file ...
717       * add gdcm-ACR-LibIDO.acr, unnormalized Rectangular LibIDO format image
718       * add CLIP0001-Sequoia-U11.dcm, US 'Clip', from SEQUOIA machine,
719                                                   UNIT 11, Hop Cardio              
720 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
721       * general anonymisation in gdcmData
722       * adding the 'color files' from
723         http://www.leadtools.com/SDK/Medical/DICOM/ltdc19.htm
724       * adding some well knowed bugged-header images
725       * adding checkRead.sk, checkReadColor.sh, checkWrite.sh,
726         waiting for their inclusion in Python testsuite
727
728 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
729     * gdcmHeader::gdcmHeader(const char *InFilename, bool exception_on_error)
730       no longer seg faults when file is not found
731
732 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
733      * Emprovement of reading for Dicom encapsulated Jpeg LossLess 
734        MultiFrame images
735
736 2003-10-14  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
737      * TODO: *.in file to genereate a UseGDCM later
738
739 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
740      * Some supposed-to-be Dicom Images have no preamble.
741         OpenFile takes it into account
742      * Jpeg LossLess 24 Bits images doesn't break any longer gdcm
743      * Missing elements added in dicomV3.dic
744       (just to be affraid : have a look at
745        ftp://medical.nema.org/medical/dicom/2003/01v03dif/01v03_06.pdf
746        and do it again next year ;->
747
748 2003-10-13  Jean-Pierre Roux
749      * According to PS 3.3-2003 C.11.1.1.2 p 619, when each pixel of 
750        a PALETTE COLOR is stored on 2 Bytes, theese 2 Bytes must be equal.
751        But there are NOT. It's fixed !
752        
753 2003-10-13  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
754      * FIX: "jpeglib.h" was not found on VC++
755      * FIX: vtkgdcm was not being installed 
756          
757 2003-10-10  Jean-Pierre Roux
758      * ENH : OpenFile closes the file if it *really* doesn't look like
759              an ACR-NEMA / DICOM one.
760      * FIX : testWrite no longer writes an empty file if the source file     
761              is not gdcm Readable
762      * ENH : One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" 
763              is now decoded.
764         
765 2003-10-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
766      * FIX: CMake generate now documentation
767      * ENH: out of source doc build !
768      * ENH: Generate both user and dev documentation
769      * ENH: Should work on windows too
770      * ENH: Only one doxygen config.in file is needed 
771      * FIX: make install should be ok now on Ã¹nix plateform
772      * FIX: PATH to dictionary was wrong (missing /)
773      * ENH: OpenFile, return true if the file looks like an ACR or DICOM file 
774                      
775 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
776      * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
777      * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
778      * added a gdcmViewer to vtk test, use mouse to control 
779         window level & window width
780
781 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
782      * CMake-ification of gdcm, we have now two build system
783      * FIX: on cygwin Wsock32 doesn't exist
784      * FIX: force jpeg dir to the local one (gdcm/src/jpeg)
785      
786 2003-10-06  Emanuel Ollart
787      * FIX : compilation process wad broken.
788              Changed gdcmViewer_sources to vtkgdcmViewer_sources
789         
790 2003-10-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
791      * change gdcmViewer -> vtkgdcmViewer
792      * change GetXSpacing and GetYSpacing "%f\\%" is parsed backward
793      
794 2003-10-06  Jean-Pierre Roux
795      * FIX :A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
796            ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
797                  : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
798       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
799
800 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
801       * Odd length strings are padded with '\0' (not with spaces, 
802         to remain compliant with already defined strings, 
803         like Transfert Syntax UID and others)
804
805 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
806       * ENH :gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
807              to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
808         
809 2003-10-03  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
810       * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
811       * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
812
813 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
814       * A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
815         ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
816               : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
817       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
818
819 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
820       * One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" is now decoded.
821
822 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
823       * gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
824         to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
825
826 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
827       * gdcmFile::GetImageDataIntoVector now
828          - deals with MultiFrames MultiFragments Run Length Encoded files
829          - deals with YcBcR (YBR_FULL) files
830          - deals with YBR_YBR_FULL_422 files (they work as RBG files ?!?)
831           WARNING : nothing was checked for YBR_PARTIAL_422, YBR_ICT, 
832                                             YBR_RCT files.
833           (no sample found :-(
834
835 2003-10-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
836       * src/*.cxx removed pragma thingies to src/gdcmCommon.h
837         Two reasons: - clear things
838                      - third parties acces gdcm through header files, so won't
839                        suffer anymore VC++ complains
840
841 2003-09-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
842       * add argv[1] in testvtkGdcmReader.cxx
843       * removed leaks
844
845 2003-09-24 Jean-Pierre Roux
846       * The lines are now eigthy characters long.for 
847         gdcmHeader.cxx gdcmHeaderHelper.cxx gdcmParse.cxx 
848
849 2003-09-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
850       * src/gdcmUtil.[cxx|h] : change the _CreateCleanString return value from
851         char* to std::string. Thus, the use of strdup becomes useless. (see
852         previous commis of Malaterre)
853       * src/gdcmElValSet.cxx : reuse commented call to _CreateCleanString like
854         before the last Malaterre's commit.
855
856 2003-09-19  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
857       * This commit should fix the Debug building under VC++, the problem
858         was mainly a mixture of debug and release lib being loaded at startup.
859       * I also remove a depency to a specific C function: strdup. Because I had
860         to force the link to msvcrtd (whereas strdup is in libc).
861
862 2003-09-16  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
863       * "gdcm::Unfound" string changed to a constant variable (GDCM_UNFOUND)
864         located in the gdcmCommon.h file. All use of reference of tha has been
865         changed to now use the variable GDCM_UNFOUND.
866
867 2003-09-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
868       * Cosmetic changes:
869         - gdcmPython/testSuite.py adapted to the JPR updated Dicts/dicomV3.dic
870           Dicom dictionary. The test suite can now be run again. Note:
871           I'm note very happy with the " (RET)" changes. I believe this
872           RETAINED comment should be dropped when parsing the dictionary.
873         - PACKAGER corrected
874         - DEVELOPPER added.
875         - AUTHORS updated and now in alphabetical order
876       * Makefile.am now exports gdcm.dsw for Windoze users.
877
878 2003-09-11  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
879       * cygwin complains about missing std:: in subdir Test/
880
881 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
882       * remove some methods that are now in gdcmHeaderHelper
883
884 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
885       * vtkGdcmReader set spacing and origin correctly
886
887 2003-09-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
888       * Fix a few delete/delete[] mismatch
889
890 2003-09-08  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
891       * src/gdcmHeaderHelper.[h cxx]: added new class that provide an
892         interpretation to data given by gdcmHeader. For instance there are
893         heuristics to get informations (look at different places).
894       * it also include a specific class: gdcmSerieHeaderHelper devoted to
895         sorting DICOM images based on different strategies.
896       * modified Makefiles accordingly.
897
898 2003-09-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
899       * src/*.cxx : added pragma disable 4786/4251 to get rid of ~4300 warning
900         when building in debug mode
901       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : change /MT -> /MD and /MTd -> /MDd to match
902         src/win32/gdcmdll.dsp
903       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : added /nodefaultlib "mscvrt" for debug mode
904
905 2003-08-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
906       * Corrected a leak in vtkGdcmREader.cxx, the pSource was find thanks
907             to valgrind.
908
909 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
910       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp was not dos format
911       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp : 
912                   libgdcmijpeg12_EXPORTS -> LIBGDCMIJPEG12_EXPORTS
913       * src/win32/gdcmdll.dsp: + /I "..\jpeg\libijg12"
914
915 2003-07-29 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
916       * src/gdcmHeader.h : add std:: prefix for stl elements... like others in
917         the file
918       * src/gdcmFile.cxx : bug fix in affectation type
919       * src/jpeg/libijpeg12/jmorecfg12.h : export for windows modified... like
920         in src/jpeg/libijpeg8/jmorecfg8.h (JPR : copy/paste exists !!!)
921       * Modifs of MVSC projects to compile them. Not concerning 2 identic
922         symbols... future problem ?
923
924 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
925       * src/win32/libgdcmijpeg12.dsp was missing
926       * modified gdcm.dsw accordingly
927
928 2003-07-28  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
929       * src/gdcmHeader.cxx : misplaced return 0.; for ACR/NEMA
930
931 2003-07-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
932       * src/jpeg/libijg12/.cvsignore, jconfig.* : ommited files while last
933         commit of JPR (before his hollidays to facilitate our work).
934       * setup.py : bug fix in code. Modifications made while the last commit
935         of JPR. The code hasn't been tested before the commit... it's so
936         useless to make that (for best programmer that is JPR) !!!
937
938 2003-07-08  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
939       * tagged the current version as Version0_3 (i.e. version 0.3)
940
941 2003-07-08  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
942       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx : remove a symbol that is unused
943       * src/jpeg/libijg8/jmorecfg.h : adding export symbol for windows
944       * *.dsp : modifications to use new libgdcmijpeg8 library
945       * setup.py : bug fix on VTKPATH variable
946       * PACKAGER : adding all concerning windows
947
948 2003-07-07  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
949       * src/gdcmElValSet.cxx, gdcmFile.cxx: JPR bug fix, removal of
950         garbage debug code.
951       * TODO, vtk/vtkGdcmReader.cxx: upcoming fixes comments.
952       * gdcmPython/testSuite.py: JPR bug fix, brutal erasement of
953         test suite reported error.
954       * PACKAGER file added (describes what a packager must do when
955         packaging a new release).
956       * MANIFEST.in, now declares jconfig.linux and jconfig.vc
957       * configure.in: upgraded version number to 0.3.0
958       * fixing build of rpm (through rpm -ta):
959         - Doc/Makefile.am exports proper doxygen files
960         - src/jpeg/libijg8/Makefile.am exports the include files.
961
962 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
963       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading only 1 file.
964       * src/gdcmHeader.h : formatting code
965
966 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
967       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
968         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
969         is made in an internal list to prevent this problem.
970         Bug fix when output is empty.
971         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
972         correction.
973       * vtk/vtkGdcmReader.h : adding comments for InternalFileNaleList variable
974
975 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
976       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
977       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
978         files. Added method to remove all files on the input
979         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
980         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
981
982 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
983       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
984         when using make instal.
985       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
986         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
987
988 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
989       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
990       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
991
992 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
993       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
994         linux and WINDOWS !
995       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
996       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
997
998 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
999       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
1000         addon of the jpeg library)
1001       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
1002       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
1003       * INSTALL now points to web documentation
1004
1005 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1006       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
1007         gdcmUtil.h anymore.
1008       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
1009         clean target.
1010       * src/gdcm*.[cxx|h] :
1011         - to allow compilation with gcc 3.x
1012           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
1013           -- small fixes on exceptions.
1014           Note: linking not tested !
1015         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
1016           building stage.
1017       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
1018         dependent convertion).
1019
1020 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1021       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
1022         Changelog):
1023         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
1024         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
1025           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
1026         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
1027
1028 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1029       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to
1030         compile
1031       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
1032         (FileName -> Filename)
1033
1034 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1035       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
1036         - UpdateProgress method should now be effective
1037         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
1038           to volumes),
1039         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
1040           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
1041           accelerating things).
1042         - when building a stack of images/volumes, files which are not
1043           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
1044           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
1045           in the stack (for the caller to notice the problem).
1046
1047 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1048       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
1049
1050 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1051       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts
1052         between standard library (std) and vtk library (problems are found
1053         under Windows... thanks Windows !)
1054
1055 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1056       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
1057         debug stage).
1058       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
1059
1060 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1061       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
1062
1063 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1064       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
1065         called with different flags than the default ones (with automake).
1066         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
1067            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
1068         and went for warning fixes:
1069         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
1070           up from unused variables.
1071         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
1072       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
1073
1074 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1075       * gdcmPython/gdcm.i:
1076         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
1077           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
1078           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
1079         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
1080           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
1081           exported to Python a as cvar.
1082       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
1083         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
1084         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
1085         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
1086         C++ static methods).
1087       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
1088         with the above changes.
1089
1090 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1091       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
1092
1093 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1094       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
1095         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
1096         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
1097          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
1098          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
1099            a wrapper
1100          - Wrapper interface which wrap sources
1101         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
1102         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
1103       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
1104         files for compilation
1105
1106 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
1107       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
1108         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
1109         - vtk/Makefile.am now builds a library
1110         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
1111           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
1112           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
1113           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
1114           import library.
1115         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
1116           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
1117           + vtk/vtkGdcmReader.so and
1118           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
1119           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
1120         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
1121           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
1122         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
1123           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
1124       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
1125       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
1126         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
1127         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
1128         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
1129         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
1130         collision of various stl members (principally cout...).
1131       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
1132         file.
1133       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
1134         comply with above changes)
1135
1136 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1137       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
1138       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
1139         vtk data structure (an image Flip was required).
1140       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
1141       * cosmetic changes in documentation.
1142
1143 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1144       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
1145         unexisting file is given as argument.
1146       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
1147         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
1148         containing those images is now available at
1149           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
1150         with the name gdcmData.
1151         All the python scripts (including the package initialisation file
1152         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
1153         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
1154
1155 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1156       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
1157         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
1158         demo of the usage of this class.
1159         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
1160         at configure (or autogen.sh) stage.
1161
1162 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1163       * More memory link related corrections and documentation fixes.
1164         Notes on valgrind:
1165           - maximum info is obtained with a command of the form:
1166             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
1167                      --show-reachable=yes PrintHeader
1168           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
1169             allocation scheme through the usage of map and list. It looks
1170             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
1171             (in fact further invocation to the STL would recollect the
1172              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
1173       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
1174         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
1175         Note: some images don't seem to work e.g.
1176             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
1177       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
1178         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
1179         make gdcm more thread friendly.
1180
1181 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1182       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
1183           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
1184         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
1185           gdcmHeader::_dicom_vr.
1186         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
1187         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
1188           VRHT*.
1189         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
1190
1191 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1192       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
1193         make install stage.
1194
1195 2003-04-9 JPR
1196       * UpdateGroupLength replaced by new one
1197
1198 2003-04-7 JPR
1199       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
1200         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
1201
1202 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1203       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
1204       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
1205       * src:
1206         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
1207         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
1208           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
1209         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
1210           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
1211           carried the same semantics.
1212           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
1213         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
1214           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
1215         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
1216       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
1217       * gdcmGetXSize added
1218       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
1219       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
1220
1221 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1222       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
1223         (to avoid double call by end user).
1224       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
1225         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
1226
1227 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1228       * gdcm/Doc many doxygen changes:
1229         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
1230           the html.users end users oriented documentation and
1231           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
1232           oriented documentation.
1233         - README changed accordingly
1234         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
1235         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
1236           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
1237         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
1238           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying
1239           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
1240       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
1241         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
1242       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
1243         ill-formed documentation sections.
1244       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
1245
1246 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1247       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
1248       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
1249         un*ces with sh-utils test utility.
1250       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
1251       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
1252       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
1253       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
1254       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
1255
1256 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1257       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
1258       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
1259
1260 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1261       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
1262       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
1263       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
1264       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
1265         compilation work.
1266       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
1267       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
1268
1269 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1270       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
1271         hence the user doesn't need this explicit call.
1272         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
1273           i.e. LoadElements() call removed.
1274       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
1275         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
1276       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
1277         for adding user defined new tags.
1278         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
1279         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
1280           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
1281
1282 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
1283       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
1284         Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am,
1285         src/Makefile.am : the project should properly compile and install
1286         with the autotools, included the python wrappers part.
1287       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
1288
1289 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1290       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
1291
1292 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1293       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
1294         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
1295         for usage).
1296       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
1297         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
1298         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
1299       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
1300         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
1301
1302 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1303       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
1304         in InstallMode or PreInstallMode but with an environement given
1305         value of GDCM_DICT_PATH.
1306       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
1307
1308 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1309       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
1310       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
1311       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
1312         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
1313         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
1314
1315 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1316       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
1317         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
1318         gdcmHeader.h
1319       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
1320         (as opposed to gdcm.h)
1321       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
1322       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
1323         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
1324       * autogen.sh removed history related references to crea package.
1325
1326 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1327       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
1328         bug.
1329
1330 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1331       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
1332         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
1333         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
1334         of hidding away the python related distutils specific files
1335         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
1336         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
1337         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
1338         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
1339
1340 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1341       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
1342       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
1343         among the list of sources.
1344
1345 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1346       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
1347       * modifications in MSVC projects
1348
1349 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1350       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
1351         looks like we can move back to original usage of exception within
1352         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
1353         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
1354       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
1355         README file for usage added.
1356       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
1357         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
1358         testing the proper parsing of a Dicom related file.
1359         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
1360       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
1361       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
1362         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
1363           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
1364           Dicom public dictionnary were not accessible without an
1365           instance of class gdcmHeader.
1366         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
1367           require no instances at all to be invocated.
1368         - within gdcmDictSet this change required to change some method
1369           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
1370           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
1371       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
1372         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
1373       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
1374         the above to be effective.
1375       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
1376         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
1377       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
1378         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
1379         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
1380         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
1381         (for python dectection).
1382       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
1383         now avoids publishing the empty entries.
1384
1385 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1386       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
1387         ExtraPath reused :-P
1388       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
1389
1390 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1391       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
1392       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
1393       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
1394         and links
1395
1396 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1397       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
1398         method. Doxygenation.
1399       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
1400
1401 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1402       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
1403         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
1404         when using "python setup.py install".
1405       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
1406         reexports the working classes.
1407       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
1408         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
1409         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
1410         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
1411         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
1412         subdir (see the README file). This problem probably due to
1413         an combination of g++ and dynamic loading.
1414       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
1415
1416 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1417       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
1418         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
1419         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
1420         again in a python subdir, but the package itself is now in
1421         python/gdcmPython.
1422       * setup.py was cleaned up:
1423         - pythonIncludePath removed
1424         - python setup.py bdist target is now functional.
1425       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
1426         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
1427         accordingly.
1428
1429 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1430       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
1431       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
1432         distutils installer is operational.
1433       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
1434           shadow classes (from gdcm.py).
1435         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
1436           instead of gdcmPython/demo/load.py.
1437         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
1438
1439 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1440       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
1441         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
1442         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
1443         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
1444         dictionary.
1445         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
1446           are now in the "???" group.
1447         - python/gdcm.i changed accordingly,
1448         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
1449           of the above new functionalities in Python.
1450
1451 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1452       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
1453         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
1454           were definitively removed.
1455         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
1456       * src/gdcmElValSet.cxx:
1457         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
1458         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
1459         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
1460         - Added GetElementByName(string).
1461       * src/gdcmHeader.cxx: added
1462         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
1463         - GetPubElValRepByName(string)
1464         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
1465         - GetShaElValRepByName(string)
1466         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
1467         - GetShaElValRepByName(string)
1468         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
1469         - GetElValRepByName(string)
1470         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
1471         - GetElValRepByName(string)
1472       * Doc/requirements.txt added.
1473
1474 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1475       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
1476       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
1477         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
1478         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
1479         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
1480       * python/testSuite.py changed accordingly.
1481
1482 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
1483       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
1484         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
1485              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
1486               cannot be exported. [...]
1487               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
1488               be exported. [...]
1489               This is caused by a designed limitation that once a template
1490               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
1491               exported."
1492         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
1493         limitation" of VC++ is a pitfall.
1494         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
1495         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
1496         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
1497         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
1498         library.
1499         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
1500       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
1501          dll under windows !!!!)
1502       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
1503       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
1504         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
1505       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
1506         (one) of image(s).
1507       * removed glib references
1508       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
1509
1510 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1511       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
1512         that only displays required tags and testAll.py that parses all
1513         the files of the testsuite without using unittest.
1514       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
1515       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
1516       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
1517         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
1518
1519 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1520       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
1521         values, but limits itself to values which are below a user specified
1522         size (by default 1024 bytes).
1523       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
1524         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
1525         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
1526         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
1527       * python/testSuite.py
1528         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
1529         - two new examples added.
1530       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
1531
1532 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1533       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
1534         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
1535       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
1536       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
1537       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
1538
1539 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1540       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
1541         the vr was also RET.
1542       * python/testSuite.py more tests added.
1543
1544 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1545       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
1546       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
1547       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
1548         7.18 Integer types (see stdint.h)
1549         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
1550       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
1551         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
1552         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
1553         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
1554         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
1555         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
1556         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
1557         The rest of the changes we the necessary adaptations.
1558
1559 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1560       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
1561         VR files.
1562       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
1563
1564 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1565       * Adaptation for porting to VC++:
1566         - src/gdcm.h
1567           o forced to use std namespace (for string to be known)
1568           o all class use __declspec export style on WIN32
1569         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
1570           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
1571       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
1572         variable GDCM_DICT_PATH.
1573       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
1574
1575 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1576       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
1577         to native Python dictionary.
1578       * python/demo/test.py:
1579         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
1580         - takes an optional filename argument (the file to parse).
1581       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
1582         PubElVals hashing table.
1583       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
1584
1585 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1586       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
1587         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
1588       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
1589       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
1590       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
1591         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
1592       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
1593
1594 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1595       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
1596         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
1597         that we can import de shadow classes without errors].
1598
1599 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1600       * hashtest.cxx removed (since allready in Test)
1601       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
1602       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
1603       * src/Makefile prepared for python wrapping
1604
1605 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1606       * src/gdcmHeader.cxx :
1607         - Parsing of header is now separated from loading of element values
1608           (see gdcmHeader::LoadElements).
1609         - general clean up of hopefully all file access (creation of
1610           ReadInt16 and ReadInt32)
1611
1612 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1613       * src/gdcmHeader.cxx :
1614         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
1615           method.
1616         - SetLgrElem renamed to SetLength
1617         - GetLgrElem renamed to GetLength
1618         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
1619       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
1620       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
1621         due to IdoDude was cleaned out.
1622
1623 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1624       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
1625         concentrates on finding the value representation (when it exists).
1626         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
1627         returning the unecessary skL (skipped length).
1628         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
1629         it was redundant with the File position internals (by using
1630         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
1631         jajun.
1632       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
1633         on the libido specificities which are handled through class
1634         inheritance.
1635       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
1636         added.
1637
1638 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1639       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
1640         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
1641
1642 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1643       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
1644
1645 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1646       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
1647         and _IdDcmSWAP_LONG.
1648
1649 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1650       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
1651         May 23 2002. Needless to say we are running late...
1652