]> Creatis software - gdcm.git/blob - ChangeLog
2004-02-06 Jean-Pierre Roux
[gdcm.git] / ChangeLog
1 2004-02-06 Jean-Pierre Roux
2      * ENH : - now gdcmDicomDir::CreateDicomDir() returns also the meta elements
3              - GDCM_META added to gdcmDicomDirType
4              - class gdcmMeta created
5      * ENH : - A brief summary is now displayed at the beginning of 'testDicomDir'
6              to help disaster magnitude estimation
7      * REM  : Now useless Test/explDICOMDIR.cxx
8
9 2004-02-05 Benoit Regrain
10      * ENH : add methods in gdcmObject to get the hash table or the list of
11        header entries
12      * FIX : wrapping python for ListPatient, ListStudy, ListSerie, ListImage
13      * FIX : wrapping python for TagHeaderEntryHT
14
15 2004-02-04 Benoit Regrain
16      * FIX : even length for some strings when writting the dicom dir
17      * FIX : sort the images in the dicom dir
18      * FIX : Bug fix for python use of dicom dir
19      * ADD : a python demo
20
21 2004-02-04 Jean-Pierre Roux
22      * FIX : Final solution (?) for icone embedded images
23      * FIX : dicomVR.dic Overlay group is not *only* 6000, but 60xxx
24              (see http://medical.nema.org/dicom/2003/03_06PU.PDF)
25              add groups 6002, 6004, 6006, to allow 'clean' parsing of
26              gdcmData/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1
27      * ENH  add gdcmData/checkWriteExplicit.sh gdcmData/checkWriteImplicit.sh
28             to make full checking easier
29              
30 2004-02-04 Benoit Regrain
31      * FIX : WriteEntries : coding style & logic in parameters
32      * FIX : Set the elements to create the DicomDir in a dictionary file
33
34 2004-02-03 Benoit Regrain
35      * gdcmDirList : to parse a hard drive directory in recursive (or not)
36      * gdcmDicomDir : add the load of directory
37      * Bug fix and print add-on
38
39 2004-02-03 Jean-Pierre Roux
40      * ENH gdcmParser : allows "DICM" files, with NO group '0002'
41      * FIX handling 'non string elements' unsecure area (LUT, overlays, etc)
42      * FIX Dicts/dicomV3.dic : Add a few missing 'group length' Elements 
43      * FIX gdcmParser.cxx : 'group length' elements are now considered 
44            as integers, even for shadow groups, when file is Implicit VR
45         
46 2004-02-02 Jean-Pierre Roux
47      * FIX : gdcmWrite : equal_range() for multimap doesn't return a 'second' 
48                   iterator on last
49              of the last synonym :-(
50      * FIX : gdcmWrite::WriteBase : method stops if Pixels not yet Read (except 
51                   for DICOMDIR ;-)
52      * ENH gdcmData/checkWrite.sh :modif for full check of Explicit VR writting
53      * FIX taking into account the possible 7fe0,0010 multiplicity        
54      * FIX add GRPixel,NumPixel,countGrPixel (gdcmParser protected members)
55            to allow removal of references to 7fe0,0010, to deal with
56            ACR-NEMA images, when 0028,0200 is meaningfull
57
58 2004-01-31 Jean-Pierre Roux
59      * FIX gdcmParser::WriteEntries : when a VR is tagged as 'Unknown'
60                        no longer writes 'Un' on disk
61      * FIX  SQ elements with actual length are now dealt with corectly
62      * FIX gdcmFile::WriteBase make the difference, for color images, between
63                      the length (for Palette expanded omages) 
64                      and Raw Length (non expanded image + Palette)
65       * FIX  Dicts/dicomV3.dic : removal of 'CTX' (context dependant) VR
66                      (that broke Write). Replaced by UL.
67                      Aware user will reload the field if he 
68                      thinks it's necesssary
69                        
70 2004-01-30 Jean-Pierre Roux
71      * gdcmParser::CheckSwap() now defaults the filetype to ACR 
72        when 'dirty Acr' is found, to be compliant with the new 
73        IsReadable() methods.
74        
75      * gdcmHeaderHelper :add Pixel Type 'FD', for dealing with 'double' images.
76       (no DOUBLE images in kosher DICOM, 
77       but so usefull for people that miss them ;-)
78       
79      * add Test/testDicomDir.cxx, Test/makeDicomDir.cxx , Test/explDICOMDIR.cxx
80        DICOMDIR related utilities (not checked as Windoze compliant)
81
82 2004-01-28 Jean-Pierre Roux
83      * upgrade GdcmHeaderEntry Print Method for DICOMDIR
84
85 2004-01-27 Jean-Pierre Roux
86      * gdcmParser constructor has a new boolean param,'ignore_shadow', 
87              to allow skipping the shadow elements, to save memory space.
88              The TRUE value for this param has to be used 
89              with a FALSE value for the 'enable_sequence' param.
90              ('public elements' may be embedded in 'shadow Sequences')
91      * gdcmHeader methods now deal with 'embedded icones images' in the header
92              (even when an 'icone image sequence' is announced by the 
93              element (0x0088,0x0200), but there is NO icone at all ...
94              
95      * gdcmHeader sometimes Image Location value doesn't follow  
96              the supposed processor endianity (see gdcmData/cr172241.dcm).
97              Fixed
98                      
99      * gdcmHeader add the method
100              IterHT  GetHeaderEntrySameNumber(grPixel,numPixel);
101              to get *all* the Header Entries with the same tag.
102              GetHeaderEntrySameName is probabely *useless* 
103              (no meaning : Name is *not* an identifier within the Dictionnary)
104
105 2004-01-26 Benoit Regrain
106      * Bug fix in the print of hexadecimal representations. Remove long fields 
107        in the print and add a third level of print to print them
108
109 2004-01-23 Benoit Regrain
110      * Bug fix on field having a VR = 'UI'. Assume that is a string field
111      * Bug fix on test suite after remove the strip made on not string fields
112      * Split the IsReadable method between gdcmParser which test that the file
113        is dicom and gdcmHeader which test that it's an image file
114
115 2004-01-22 Benoit Regrain
116      * DicomDir : clean code, add methods, set variables in protected or private
117      * gdcmUtil : bug fix for the clean string method
118
119 2004-01-19 Benoit Regrain
120      * Add the use of shadow dictionaries
121      * bug fix and coding style
122
123 2004-01-19 Benoit Regrain
124      * src/gdcmFile.cxx : bug fix concerning the close of file
125      * src/gdcmParser.[h|cxx] : remove obvious Pub informations
126      * Add the update of header entries using the shadow library
127
128 2004-01-19 Benoit Regrain
129     * removal of file gdcmHeader2.cxx
130     * split class gdcmHeader into gdcmParser and gdcmHeader, with gdcmHeader
131       inheriting from gdcmParser. This split is to prepare the integration
132       of dicom dir parsing
133     * bug fix under python
134
135 2004-01-16 Jean-Pierre Roux
136     * removal of class gdcmHeaderEntrySet
137     * removal of files gdcmHeaderEntrySet.cxx, gdcmHeaderEntrySet.h
138     * add file gdcmHeader2.cxx 
139     * add method gdcmHeader::SetPrintLevel (for PrintHeader)
140
141 2004-01-15 Benoit Regrain
142      * src/gdcmDicSet.[h|cxx] : add virtual entries to have a reference of
143        entries created while parsing the header. Thus, they will be destroyed
144        when the gdcmDictSet will be destroyed
145      * src/gdcmHeader.cxx, gdcmHeaderEntrySet.cxx : uses virtual entries of
146        gdcmDictSet
147
148 2004-01-15 Benoit Regrain
149      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix : before, with python only, the program
150        made a fatal error because of the memory release at the end of program.
151        The problem was in vtkGdcmReader::ExecuteData where we were allocate
152        some memory and vtk seems to have some problems with that.
153      * src/gdcmHeaderEntrySet.cxx : bug fix for std lib and cout
154
155 2004-01-14 Benoit Regrain
156      * src/gdcmHeaderEntry.[h|cxx] : gdcmElValue -> gdcmHeaderEntry
157      * src/gdcmHeaderEntrySet.[h|cxx] : gdcmElValSet -> gdcmHeaderEntrySet
158      * src/*.[h|cxx] : make changes due to class name changes
159      * gdcmPython/demo/*.py : bug fix due to method names
160
161 2004-01-13 Benoit Regrain
162      * src/*.[h|cxx] : coding style
163      * vtk/*.[h|cxx] : coding style
164
165 2004-01-13 Benoit Regrain
166      * gdcmPython/testSuite.py : test the readable flag of file for tests
167      * src/gdcmDict.cxx, gdcmElValSet.cxx : bug fix under windows for prints.
168        It's lied to the stl compilation by MSVC (windows, always windows...)
169      * src/gdcmIdo.h, gdcmHeaderIdo.cxx : remove the Ido unused files
170
171 2004-01-12 Benoit Regrain
172      * src/*.h : add comments
173      * src/gdcmDictSet.h : set the method BuildDictPath in public
174      * src/gdcmTS.cxx, gdcmVR.cxx : use now a dictionnary file other than to be
175        directly setted in the source code
176      * Dicts/dicomTS.dic, dicomVR.dic : 2 new dictionnary files loaded by
177        gdcmTS and gdcmVR
178
179 2004-01-09 Benoit Regrain
180      * gdcmPython/gdcmVersion.py : add a gdcmVERSION variable information
181      * setup.py : use a reference to gdcmVERSION
182
183 2004-01-07 Benoit Regrain
184      * Modification to compile with the distutils.
185      * Bug fix in code
186
187 2003-12-10 Benoit Regrain
188      * gdcmHeader is now aggregating gdcmFile, and not derived into. Thus, we
189        can use a gdcmHeaderHelper to load datas
190      * gdcmPython/testSuite.py : make the testSuite compliant with modifications
191        made in the source code
192
193 2003-12-10 Benoit Regrain
194      * Update Windows projects and .cvsignore files
195
196 2003-11-12 Jean-Pierre Roux
197      *ENH  gdcmHeader constructor has one more parameter (default value : false)
198            that allows the user to 'go inside' the SeQuences only
199            if he wants to.
200            gdcmElValSet:Print takes it into account
201
202 2003-11-12  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
203      *ENH: Update gdcmPython/CMakeLists
204      *FIX: (gdcmHeaderHelper) GetRescale and GetSlope
205      *FIX: (gdcmElValSet) char 'tag' was overiding private members (VC++)
206
207 2003-11-10 Jean-Pierre Roux
208       *FIX : gdcmHeader::LoadElements is now based
209              on the ListTag listElem member,
210              not longer on the TagElValueHT tagHt member
211       *ENH : PrintPubElVal shows (temporarily) both results,
212              with the tagHt member and the listElem member.
213              (it's easier to 'see' the problems when using Printheader)
214
215       *FIX : old private member LgrElem is now splitted into
216              ReadLength   : Length actually found on disk (updated only
217                             if bug fixing is necessary), for internal
218                             use only
219              UsableLength : Updated by FixFoundLength, to fix a bug
220                             or to allow Parser going on.
221              Will allow to re-write a kosher header when a SeQuence
222              with a length (not 0000) is found
223       Warning : gdcmFile::Write still uses the TagHt (not ListElem)
224                 because gdcmElValSet::Add does not update ListElem
225                 (to be written)
226
227 2003-11-07 Jean-Pierre Roux
228      *FIX misstyping in Transfert Syntax name table
229      *ENH gdcmHeader::FixFoundLength now allow to 'go inside' tge SeQuences
230           when they have an actual length (not 0000 nor FFFFF)
231           (Nobody should care of it, but DICOMDIR explorers)
232
233 2003-11-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
234      *ENH: vtkgdcmViewer now works with LUT dicom (OT-PAL-face ...)
235
236 2003-11-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
237      *ENH: vtkGdcmReader now supports LUT !
238           (vtkgdcmViewer for now is not able to use them though)
239
240 2003-11-05 Jean-Pierre Roux
241      * in testSuite.py : new files names for checking the package
242      * Fix : Forgot to commit gdcmFile::GetImageDataSizeRaw();
243              that returns the pixel area size to the *aware* (vtk) user
244              that DOESN'T want to turn the PALETTE COLOR image into an RGB image
245
246 2003-11-05 Benoit Regrain
247      * in testSuite.py : Modify the rules for checking the paths
248                        : Explicit error messages
249      * in __init__.py  : Related modif
250
251 2003-11-03 Jean-Pierre Roux
252      * add gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponentsRaw()
253            to be used by aware (vtk) users that want to manage
254            LUT (and no to turn the PALETTE image into an RGB pixels one)
255      * GetPixelType now returns 8U for 24 Bits images
256                     (vtkGdcmReader compliant)              
257            
258 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
259      * Removal of *all* gdcmData images and add them again
260        in order to loose the 'history' of un-anonymised images
261        
262 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
263      *RMV : removal of useless jBitsInJsample.h 
264            for both 8 and 12 Bits JPEG Lossy Libraries
265            
266 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
267      * ENH : Add the functions gdcmFile::GetImageDataRaw 
268                                gdcmFile::GetImageDataIntoVectorRaw
269              that act as GetImageData and GetImageDataIntoVector
270              except the making of an RGB Plane from Gray Plane + LUT
271              Intended to aware (vtk) users who know how to manage 
272              such an image : 
273              After gdcmHeader :
274                 GetLUTRGBA return a R,G,B,A LUT if any
275                 lgrTotaleRaw gives the 'Raw' length
276                 GetImageDataRaw returns the gray Plane    
277      * FIX : no more dirty trick for 'Segmented xxx Palette Color Lookup' images
278              (They stay Grey, just like with other Dicom viewers :-(
279
280 2003-10-30 Jean-Pierre Roux
281      * FIX : a VC++ intended syntax modif broke the 12/12 Bytes expanding
282              
283 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
284      *ENH: Can be used like this '$vtkgdcmViewer *.dcm' with *.dcm 
285            being coherents dicom files.
286      
287 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
288      *FIX: DOH ! Forgot about windo$e users, they couldn't read lossless jpeg,
289            from medcon lib !
290      *ENH: Turn it into DOS file type to match libgdcmijpeg8.dsp file type 
291      *ENH: Two steps is necessary to please VC++ compiler...
292      *FIX: DOH ! libgdcmijpg8 -> libgdcmljpeg
293      *ENH: Add include dir to medcon lib
294      *FIX: only one function is being exported for now ! 
295            You should use GLOBAL(return type) see ljpg/jpeg.h for more info
296             
297 2003-10-29 Jean-Pierre Roux
298       * adding  gdcmHeader::GetLUTRGBA
299                returns a 4 * 256 Bytes Reg/Green/Blue/Alpha vtk compliant LUT
300                --> Mathieu, the modif u're waiting for is not yet committed
301       * removal of now useless GetLUTRed,GetLUTGreen,GetLUTBlue,GetLUTRGB
302       
303 2003-10-27 Jean-Pierre Roux
304       * adding some xmedcon breaker files (courtesy of Loïc Boussel) 
305  .              00191113.dcm DermaColorLossLess.dcm 
306                 MxTwinLossLess.dcm RadBWLossLess.dcm       
307        * ENH: For version prior to vtkImageViewer2 -r 1.19
308        * FIX: avoid pb with xmedcon-breaker CT McTwin Elscint images
309            
310 2003-10-27  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
311       * Removal of ido stuff in CMakeLists.txt
312                                                
313 2003-10-24  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
314       * ENH: vtkGdcmReader.cxx can now read multiframe dicom
315       * FIX: remove a call to ->Modified ... see comments
316       * FIX: vtkgdcmViewer.cxx was writting ASCII file...this is so slooooooow !
317       
318 2003-10-23  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
319       * FIX: Problem with path for libvtkgdcmPython
320       * ENH: Try adding a search script for python site-package
321       * RMV: Remove some file from medcon lib that are not necessary
322       * FIX: gdcm/Makefile.am fix for generating ljpg medcon
323       * ENH: CMakeLists.txt now generate 'pygdcm.so' instead of 'libpygdcm.so' 
324       * FIX: More pragma disable fro VC++, 
325              I don't think I break something as it is also disable in VTK/ITK. 
326              But it fasten debug compilation time.
327             
328 2003-10-23 Jean-Pierre Roux
329       * gdcm now deals with 16 Bits Run Length Encoded images
330         (they are compressed as 2 planes images, 
331          one for the high Bytes, the other for low Bytes)
332
333 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
334      * Now CheckRead takes into account :
335             the bugged 'Leonardo' Siemens images
336             the XA images, sent thru the burning VPRO station
337      * add I9000001.dcm, a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
338      (breaks DicomWorks)
339
340 2003-10-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
341       * FIX: When copying a Makefile.am to CMakeLists.txt 
342              one should remove the '\'
343              
344 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
345       * in gdcmData adding a bugged 'Leonardo' Siemens image 
346         (wrong lengths in header)
347         OK with gdcm, KO with the other viewers :-)
348       * add a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
349         (breaks DicomWorks)
350
351 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
352       * in gdcmData add the checkvtkgdcmViewer.sh shell script 
353         for a brutal checking of vtkgdcmViewer compliance
354
355 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
356       * add the files for 'xmedcon' Jpeg Lossless library
357       * call of 'xmedcom' Jpeg Lossles libray (instead of the old LibIDO one)
358
359 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
360       * 'Compacted Files' (12 Bits Allocate, 12 Bits Stored) are now dealt with
361      
362 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
363       * garbage Siemens 'Leonardo' images dealt with
364         (the patch is easy to remove)
365       * cosmetic changes to avoid warnings
366       
367 2003-10-20  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
368       * ENH: vtkgdcmViewer now autoscale color/window level on start-up, 
369         no need to press 'r' now.
370         
371 2003-10-20  Jean-Pierre Roux
372       * upgrade of checkRead.sh checkWrite.sh according 
373         to new Jpeg Lossless decompressor
374        * add US.3405.1.dcm, a genuine RGB medical file ...
375        * add gdcm-ACR-LibIDO.acr, unnormalized Rectangular LibIDO format image
376        * add CLIP0001-Sequoia-U11.dcm, US 'Clip', from SEQUOIA machine, 
377                                                   UNIT 11, Hop Cardio              
378 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
379       * general anonymisation in gdcmData
380       * adding the 'color files' from
381          http://www.leadtools.com/SDK/Medical/DICOM/ltdc19.htm
382       * adding some well knowed bugged-header images
383       * adding checkRead.sk, checkReadColor.sh, checkWrite.sh,
384          waiting for their inclusion in Python testsuite
385
386 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
387     * gdcmHeader::gdcmHeader(const char *InFilename, bool exception_on_error)
388       no longer seg faults when file is not found
389
390 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
391      * Emprovement of reading for Dicom encapsulated Jpeg LossLess MultiFrame images
392
393 2003-10-14  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
394      * TODO: *.in file to genereate a UseGDCM later
395
396 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
397      * Some supposed-to-be Dicom Images have no preamble.
398         OpenFile takes it into account
399      * Jpeg LossLess 24 Bits images doesn't break any longer gdcm
400      * Missing elements added in dicomV3.dic
401       (just to be affraid : have a look at
402        ftp://medical.nema.org/medical/dicom/2003/01v03dif/01v03_06.pdf
403        and do it again next year ;->
404
405 2003-10-13  Jean-Pierre Roux
406      * According to PS 3.3-2003 C.11.1.1.2 p 619, when each pixel of 
407        a PALETTE COLOR is stored on 2 Bytes, theese 2 Bytes must be equal.
408        But there are NOT. It's fixed !
409        
410 2003-10-13  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
411      * FIX: "jpeglib.h" was not found on VC++
412      * FIX: vtkgdcm was not being installed 
413          
414 2003-10-10  Jean-Pierre Roux
415      * ENH : OpenFile closes the file if it *really* doesn't look like
416              an ACR-NEMA / DICOM one.
417      * FIX : testWrite no longer writes an empty file if the source file     
418              is not gdcm Readable
419      * ENH : One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" 
420              is now decoded.
421              
422 2003-10-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
423      * FIX: CMake generate now documentation
424      * ENH: out of source doc build !
425      * ENH: Generate both user and dev documentation
426      * ENH: Should work on windows too
427      * ENH: Only one doxygen config.in file is needed 
428      * FIX: make install should be ok now on Ã¹nix plateform
429      * FIX: PATH to dictionary was wrong (missing /)
430      * ENH: OpenFile, return true if the file looks like an ACR or DICOM file 
431                      
432 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
433      * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
434      * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
435      * added a gdcmViewer to vtk test, use mouse to control 
436         window level & window width
437
438 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
439      * CMake-ification of gdcm, we have now two build system
440      * FIX: on cygwin Wsock32 doesn't exist
441      * FIX: force jpeg dir to the local one (gdcm/src/jpeg)
442      
443 2003-10-06  Emanuel Ollart
444      * FIX : compilation process wad broken.
445              Changed gdcmViewer_sources to vtkgdcmViewer_sources
446              
447 2003-10-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
448      * change gdcmViewer -> vtkgdcmViewer
449      * change GetXSpacing and GetYSpacing "%f\\%" is parsed backward
450      
451 2003-10-06  Jean-Pierre Roux
452      * FIX :A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
453            ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
454                  : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
455       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
456
457 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
458       * Odd length strings are padded with '\0' (not with spaces, 
459         to remain compliant with already defined strings, 
460         like Transfert Syntax UID and others)
461
462 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
463       * ENH :gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
464              to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
465              
466 2003-10-03  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
467       * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
468       * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
469
470 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
471       * A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
472         ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
473               : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
474       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
475
476 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
477       * One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" is now decoded.
478
479 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
480       * gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
481         to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
482
483 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
484       * gdcmFile::GetImageDataIntoVector now
485          - deals with MultiFrames MultiFragments Run Length Encoded files
486          - deals with YcBcR (YBR_FULL) files
487          - deals with YBR_YBR_FULL_422 files (they work as RBG files ?!?)
488           WARNING : nothing was checked for YBR_PARTIAL_422, YBR_ICT, YBR_RCT files.
489           (no sample found :-(
490
491 2003-10-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
492       * src/*.cxx removed pragma thingies to src/gdcmCommon.h
493         Two reasons: - clear things
494                      - third parties acces gdcm through header files, so won't
495                      suffer anymore VC++ complains
496 2003-09-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
497       * add argv[1] in testvtkGdcmReader.cxx
498       * removed leaks
499                      
500 2003-09-24 Jean-Pierre Roux
501       * The lines are now eigthy characters long.for 
502         gdcmHeader.cxx gdcmHeaderHelper.cxx gdcmParse.cxx 
503
504 2003-09-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
505       * src/gdcmUtil.[cxx|h] : change the _CreateCleanString return value from
506         char* to std::string. Thus, the use of strdup becomes useless. (see
507         previous commis of Malaterre)
508       * src/gdcmElValSet.cxx : reuse commented call to _CreateCleanString like
509         before the last Malaterre's commit.
510
511 2003-09-19  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
512       * This commit should fix the Debug building under VC++, the problem
513         was mainly a mixture of debug and release lib being loaded at startup.
514       * I also remove a depency to a specific C function: strdup. Because I had
515         to force the link to msvcrtd (whereas strdup is in libc).
516
517 2003-09-16  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
518       * "gdcm::Unfound" string changed to a constant variable (GDCM_UNFOUND)
519         located in the gdcmCommon.h file. All use of reference of tha has been
520         changed to now use the variable GDCM_UNFOUND.
521
522 2003-09-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
523       * Cosmetic changes:
524         - gdcmPython/testSuite.py adapted to the JPR updated Dicts/dicomV3.dic
525           Dicom dictionary. The test suite can now be run again. Note:
526           I'm note very happy with the " (RET)" changes. I believe this
527           RETAINED comment should be dropped when parsing the dictionary.
528         - PACKAGER corrected
529         - DEVELOPPER added.
530         - AUTHORS updated and now in alphabetical order
531       * Makefile.am now exports gdcm.dsw for Windoze users.
532
533 2003-09-11  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
534       * cygwin complains about missing std:: in subdir Test/
535
536 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
537       * remove some methods that are now in gdcmHeaderHelper
538
539 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
540       * vtkGdcmReader set spacing and origin correctly
541
542 2003-09-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
543       * Fix a few delete/delete[] mismatch
544
545 2003-09-08  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
546       * src/gdcmHeaderHelper.[h cxx]: added new class that provide an
547       interpretation to data given by gdcmHeader. For instance there are
548       heuristics to get informations (look at different places).
549       * it also include a specific class: gdcmSerieHeaderHelper devoted to
550       sorting DICOM images based on different strategies.
551       * modified Makefiles accordingly.
552
553 2003-09-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
554       * src/*.cxx : added pragma disable 4786/4251 to get rid of ~4300 warning
555         when building in debug mode
556       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : change /MT -> /MD and /MTd -> /MDd to match
557         src/win32/gdcmdll.dsp
558       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : added /nodefaultlib "mscvrt" for debug mode
559
560 2003-08-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
561       * Corrected a leak in vtkGdcmREader.cxx, the pSource was find thanks to valgrind.
562
563 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
564       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp was not dos format
565       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp : libgdcmijpeg12_EXPORTS -> LIBGDCMIJPEG12_EXPORTS
566       * src/win32/gdcmdll.dsp: + /I "..\jpeg\libijg12"
567
568 2003-07-29 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
569       * src/gdcmHeader.h : add std:: prefix for stl elements... like others in
570         the file
571       * src/gdcmFile.cxx : bug fix in affectation type
572       * src/jpeg/libijpeg12/jmorecfg12.h : export for windows modified... like
573         in src/jpeg/libijpeg8/jmorecfg8.h (JPR : copy/paste exists !!!)
574       * Modifs of MVSC projects to compile them. Not concerning 2 identic
575         symbols... future problem ?
576
577 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
578       * src/win32/libgdcmijpeg12.dsp was missing
579       * modified gdcm.dsw accordingly
580
581 2003-07-28  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
582       * src/gdcmHeader.cxx : misplaced return 0.; for ACR/NEMA
583
584 2003-07-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
585       * src/jpeg/libijg12/.cvsignore, jconfig.* : ommited files while last
586         commit of JPR (before his hollidays to facilitate our work).
587       * setup.py : bug fix in code. Modifications made while the last commit
588         of JPR. The code hasn't been tested before the commit... it's so
589         useless to make that (for best programmer that is JPR) !!!
590
591 2003-07-08  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
592       * tagged the current version as Version0_3 (i.e. version 0.3)
593
594 2003-07-08  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
595       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx : remove a symbol that is unused
596       * src/jpeg/libijg8/jmorecfg.h : adding export symbol for windows
597       * *.dsp : modifications to use new libgdcmijpeg8 library
598       * setup.py : bug fix on VTKPATH variable
599       * PACKAGER : adding all concerning windows
600
601 2003-07-07  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
602       * src/gdcmElValSet.cxx, gdcmFile.cxx: JPR bug fix, removal of
603         garbage debug code.
604       * TODO, vtk/vtkGdcmReader.cxx: upcoming fixes comments.
605       * gdcmPython/testSuite.py: JPR bug fix, brutal erasement of
606         test suite reported error.
607       * PACKAGER file added (describes what a packager must do when
608         packaging a new release).
609       * MANIFEST.in, now declares jconfig.linux and jconfig.vc
610       * configure.in: upgraded version number to 0.3.0
611       * fixing build of rpm (through rpm -ta):
612         - Doc/Makefile.am exports proper doxygen files
613         - src/jpeg/libijg8/Makefile.am exports the include files.
614
615 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
616       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading only 1 file.
617       * src/gdcmHeader.h : formatting code
618
619 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
620       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
621         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
622         is made in an internal list to prevent this problem.
623         Bug fix when output is empty.
624         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
625         correction.
626       * vtk/vtkGdcmReader.h : adding comments for InternalFileNaleList variable
627
628 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
629       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
630       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
631         files. Added method to remove all files on the input
632         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
633         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
634
635 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
636       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
637         when using make instal.
638       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
639         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
640
641 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
642       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
643       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
644
645 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
646       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
647         linux and WINDOWS !
648       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
649       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
650
651 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
652       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
653         addon of the jpeg library)
654       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
655       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
656       * INSTALL now points to web documentation
657
658 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
659       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
660         gdcmUtil.h anymore.
661       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
662         clean target.
663       * src/gdcm*.[cxx|h] :
664         - to allow compilation with gcc 3.x
665           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
666           -- small fixes on exceptions.
667           Note: linking not tested !
668         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
669           building stage.
670       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
671         dependent convertion).
672
673 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
674       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
675         Changelog):
676         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
677         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
678           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
679         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
680
681 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
682       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to
683         compile
684       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
685         (FileName -> Filename)
686
687 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
688       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
689         - UpdateProgress method should now be effective
690         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
691           to volumes),
692         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
693           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
694           accelerating things).
695         - when building a stack of images/volumes, files which are not
696           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
697           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
698           in the stack (for the caller to notice the problem).
699
700 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
701       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
702
703 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
704       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts
705         between standard library (std) and vtk library (problems are found
706         under Windows... thanks Windows !)
707
708 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
709       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
710         debug stage).
711       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
712
713 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
714       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
715
716 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
717       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
718         called with different flags than the default ones (with automake).
719         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
720            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
721         and went for warning fixes:
722         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
723           up from unused variables.
724         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
725       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
726
727 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
728       * gdcmPython/gdcm.i:
729         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
730           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
731           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
732         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
733           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
734           exported to Python a as cvar.
735       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
736         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
737         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
738         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
739         C++ static methods).
740       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
741         with the above changes.
742
743 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
744       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
745
746 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
747       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
748         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
749         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
750          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
751          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
752            a wrapper
753          - Wrapper interface which wrap sources
754         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
755         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
756       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
757         files for compilation
758
759 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
760       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
761         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
762         - vtk/Makefile.am now builds a library
763         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
764           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
765           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
766           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
767           import library.
768         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
769           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
770           + vtk/vtkGdcmReader.so and
771           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
772           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
773         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
774           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
775         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
776           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
777       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
778       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
779         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
780         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
781         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
782         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
783         collision of various stl members (principally cout...).
784       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
785         file.
786       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
787         comply with above changes)
788
789 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
790       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
791       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
792         vtk data structure (an image Flip was required).
793       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
794       * cosmetic changes in documentation.
795
796 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
797       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
798         unexisting file is given as argument.
799       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
800         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
801         containing those images is now available at
802           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
803         with the name gdcmData.
804         All the python scripts (including the package initialisation file
805         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
806         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
807
808 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
809       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
810         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
811         demo of the usage of this class.
812         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
813         at configure (or autogen.sh) stage.
814
815 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
816       * More memory link related corrections and documentation fixes.
817         Notes on valgrind:
818           - maximum info is obtained with a command of the form:
819             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
820                    --show-reachable=yes PrintHeader
821           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
822             allocation scheme through the usage of map and list. It looks
823             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
824             (in fact further invocation to the STL would recollect the
825              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
826       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
827         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
828         Note: some images don't seem to work e.g.
829             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
830       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
831         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
832         make gdcm more thread friendly.
833
834 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
835       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
836           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
837         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
838           gdcmHeader::_dicom_vr.
839         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
840         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
841           VRHT*.
842         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
843
844 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
845       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
846         make install stage.
847
848 2003-04-9 JPR
849       * UpdateGroupLength replaced by new one
850
851 2003-04-7 JPR
852       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
853         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
854
855 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
856       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
857       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
858       * src:
859         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
860         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
861           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
862         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
863           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
864           carried the same semantics.
865           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
866         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
867           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
868         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
869       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
870       * gdcmGetXSize added
871       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
872       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
873
874 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
875       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
876         (to avoid double call by end user).
877       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
878         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
879
880 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
881       * gdcm/Doc many doxygen changes:
882         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
883           the html.users end users oriented documentation and
884           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
885           oriented documentation.
886         - README changed accordingly
887         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
888         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
889           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
890         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
891           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying
892           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
893       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
894         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
895       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
896         ill-formed documentation sections.
897       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
898
899 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
900       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
901       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
902         un*ces with sh-utils test utility.
903       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
904       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
905       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
906       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
907       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
908
909 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
910       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
911       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
912
913 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
914       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
915       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
916       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
917       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
918         compilation work.
919       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
920       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
921
922 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
923       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
924         hence the user doesn't need this explicit call.
925         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
926           i.e. LoadElements() call removed.
927       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
928         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
929       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
930         for adding user defined new tags.
931         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
932         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
933           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
934
935 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
936       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
937         Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am,
938         src/Makefile.am : the project should properly compile and install
939         with the autotools, included the python wrappers part.
940       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
941
942 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
943       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
944
945 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
946       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
947         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
948         for usage).
949       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
950         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
951         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
952       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
953         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
954
955 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
956       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
957         in InstallMode or PreInstallMode but with an environement given
958         value of GDCM_DICT_PATH.
959       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
960
961 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
962       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
963       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
964       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
965         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
966         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
967
968 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
969       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
970         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
971         gdcmHeader.h
972       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
973         (as opposed to gdcm.h)
974       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
975       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
976         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
977       * autogen.sh removed history related references to crea package.
978
979 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
980       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
981         bug.
982
983 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
984       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
985         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
986         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
987         of hidding away the python related distutils specific files
988         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
989         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
990         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
991         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
992
993 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
994       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
995       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
996         among the list of sources.
997
998 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
999       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
1000       * modifications in MSVC projects
1001
1002 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1003       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
1004         looks like we can move back to original usage of exception within
1005         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
1006         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
1007       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
1008         README file for usage added.
1009       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
1010         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
1011         testing the proper parsing of a Dicom related file.
1012         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
1013       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
1014       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
1015         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
1016           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
1017           Dicom public dictionnary were not accessible without an
1018           instance of class gdcmHeader.
1019         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
1020           require no instances at all to be invocated.
1021         - within gdcmDictSet this change required to change some method
1022           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
1023           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
1024       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
1025         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
1026       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
1027         the above to be effective.
1028       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
1029         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
1030       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
1031         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
1032         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
1033         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
1034         (for python dectection).
1035       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
1036         now avoids publishing the empty entries.
1037
1038 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1039       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
1040         ExtraPath reused :-P
1041       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
1042
1043 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1044       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
1045       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
1046       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
1047         and links
1048
1049 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1050       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
1051         method. Doxygenation.
1052       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
1053
1054 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1055       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
1056         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
1057         when using "python setup.py install".
1058       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
1059         reexports the working classes.
1060       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
1061         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
1062         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
1063         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
1064         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
1065         subdir (see the README file). This problem probably due to
1066         an combination of g++ and dynamic loading.
1067       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
1068
1069 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1070       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
1071         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
1072         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
1073         again in a python subdir, but the package itself is now in
1074         python/gdcmPython.
1075       * setup.py was cleaned up:
1076         - pythonIncludePath removed
1077         - python setup.py bdist target is now functional.
1078       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
1079         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
1080         accordingly.
1081
1082 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1083       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
1084       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
1085         distutils installer is operational.
1086       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
1087           shadow classes (from gdcm.py).
1088         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
1089           instead of gdcmPython/demo/load.py.
1090         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
1091
1092 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1093       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
1094         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
1095         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
1096         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
1097         dictionary.
1098         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
1099           are now in the "???" group.
1100         - python/gdcm.i changed accordingly,
1101         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
1102           of the above new functionalities in Python.
1103
1104 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1105       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
1106         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
1107           were definitively removed.
1108         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
1109       * src/gdcmElValSet.cxx:
1110         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
1111         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
1112         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
1113         - Added GetElementByName(string).
1114       * src/gdcmHeader.cxx: added
1115         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
1116         - GetPubElValRepByName(string)
1117         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
1118         - GetShaElValRepByName(string)
1119         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
1120         - GetShaElValRepByName(string)
1121         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
1122         - GetElValRepByName(string)
1123         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
1124         - GetElValRepByName(string)
1125       * Doc/requirements.txt added.
1126
1127 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1128       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
1129       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
1130         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
1131         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
1132         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
1133       * python/testSuite.py changed accordingly.
1134
1135 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
1136       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
1137         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
1138              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
1139               cannot be exported. [...]
1140               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
1141               be exported. [...]
1142               This is caused by a designed limitation that once a template
1143               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
1144               exported."
1145         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
1146         limitation" of VC++ is a pitfall.
1147         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
1148         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
1149         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
1150         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
1151         library.
1152         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
1153       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
1154          dll under windows !!!!)
1155       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
1156       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
1157         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
1158       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
1159         (one) of image(s).
1160       * removed glib references
1161       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
1162
1163 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1164       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
1165         that only displays required tags and testAll.py that parses all
1166         the files of the testsuite without using unittest.
1167       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
1168       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
1169       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
1170         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
1171
1172 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1173       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
1174         values, but limits itself to values which are below a user specified
1175         size (by default 1024 bytes).
1176       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
1177         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
1178         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
1179         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
1180       * python/testSuite.py
1181         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
1182         - two new examples added.
1183       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
1184
1185 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1186       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
1187         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
1188       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
1189       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
1190       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
1191
1192 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1193       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
1194         the vr was also RET.
1195       * python/testSuite.py more tests added.
1196
1197 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1198       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
1199       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
1200       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
1201         7.18 Integer types (see stdint.h)
1202         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
1203       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
1204         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
1205         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
1206         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
1207         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
1208         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
1209         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
1210         The rest of the changes we the necessary adaptations.
1211
1212 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1213       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
1214         VR files.
1215       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
1216
1217 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1218       * Adaptation for porting to VC++:
1219         - src/gdcm.h
1220           o forced to use std namespace (for string to be known)
1221           o all class use __declspec export style on WIN32
1222         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
1223           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
1224       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
1225         variable GDCM_DICT_PATH.
1226       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
1227
1228 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1229       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
1230         to native Python dictionary.
1231       * python/demo/test.py:
1232         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
1233         - takes an optional filename argument (the file to parse).
1234       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
1235         PubElVals hashing table.
1236       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
1237
1238 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1239       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
1240         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
1241       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
1242       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
1243       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
1244         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
1245       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
1246
1247 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1248       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
1249         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
1250         that we can import de shadow classes without errors].
1251
1252 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1253       * hashtest.cxx removed (since allready in Test)
1254       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
1255       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
1256       * src/Makefile prepared for python wrapping
1257
1258 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1259       * src/gdcmHeader.cxx :
1260         - Parsing of header is now separated from loading of element values
1261           (see gdcmHeader::LoadElements).
1262         - general clean up of hopefully all file access (creation of
1263           ReadInt16 and ReadInt32)
1264
1265 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1266       * src/gdcmHeader.cxx :
1267         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
1268           method.
1269         - SetLgrElem renamed to SetLength
1270         - GetLgrElem renamed to GetLength
1271         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
1272       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
1273       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
1274         due to IdoDude was cleaned out.
1275
1276 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1277       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
1278         concentrates on finding the value representation (when it exists).
1279         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
1280         returning the unecessary skL (skipped length).
1281         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
1282         it was redundant with the File position internals (by using
1283         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
1284         jajun.
1285       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
1286         on the libido specificities which are handled through class
1287         inheritance.
1288       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
1289         added.
1290
1291 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1292       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
1293         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
1294
1295 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1296       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
1297
1298 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1299       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
1300         and _IdDcmSWAP_LONG.
1301
1302 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1303       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
1304         May 23 2002. Needless to say we are running late...
1305