]> Creatis software - gdcm.git/blob - ChangeLog
* src/gdcmDocument.cxx : fix bug... test if the fp is opened to use it
[gdcm.git] / ChangeLog
1 2004-11-25 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2    * src/gdcmDocument.cxx : fix bug... test if the fp is opened to use it
3    * src/gdcmPixelConvert.cxx : calculate the image size when while the grab of
4      the header.
5    * src/gdcmFile.[h|cxx] : remove PixelRead and ImageDataSizeRaw variables and
6      some corresponding methods. Write correctly the file and check before
7      write
8    * Test/TestCopyDicom.cxx, TestReadWriteReadCompare.cxx,
9      TestAllReadCompareDicom.cxx : pass the write of images to RGB and test
10      is now on RGB datas (as before my last commit
11    * Example/PrintHeader.cxx, PrintFile.cxx : repad files.
12
13 2004-11-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
14    * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmSeqEntry.cxx, gdcmSQItem.cxx, gdcmValEntry.cxx :
15      Add a print information of the type of the entry
16    * src/gdcmDocument.cxx : add the write of the preambule of a Dicom file.
17      It was in the gdcmFile, and all write have been regrouped
18    * src/gdcmFile.[h|cxx] : add methods to get the Raw data elements and size.
19      Write correctly all dicom files (in decompressed mode only at this time)
20    * Test/ : test on files are now made using Raw datas and not color datas if
21      any.
22    * Example/PrintFile.cxx : add more printings
23
24 2004-11-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
25    * Amelioration of code, remove some code copy. For the loading of
26      BinEntry (in gdcmDocument), add the test to verify if the file is already
27      opened or not.
28
29 2004-11-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
30    * src/gdcmDocEntryArchive.[h|cxx] : bug fix and add a method to temporary
31      remove a DocEntry in the header (push an empty DocEntry)
32    * src/gdcmFile.[h|cxx] : remove some useless variables, methods and code
33      lines. Bug fix in the initialization of the PixelConvert and the 
34      DocEntryArchive
35    * src/gdcmElementSet.[h|cxx] : add methods Initialize and GetNext to
36      use in TestCopyDicom (now this test can run under windows... but fails)
37    * Test/TestCopyDicom.cxx : amelioration of the test :
38      - test the pixels written
39      - add test points to quickly find where is the error
40      - can set a file name input and output in arguments
41    * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx, TestReadWriteReadCompare.cxx : 
42      amelioration of the test output
43
44 2004-11-23 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
45    * src/gdcmDocEntryArchive.cxx : complete the print function, that prints
46      all replaced DocEntry's
47    * src/gdcmFile.[h|cxx] : remove all changes of the header when getting datas.
48      Now, each needed DocEntry to modify is duplicated, modified and inserted
49      to the header using DocEntryArchive. Thus, after save, we can restore the
50      header initial state.
51
52 2004-11-22 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
53    * src/gdcmFile.h : fix compilation errors on zorglub linuc computer
54
55 2004-11-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
56    * src/gdcmDocEntry.cxx : remove the copy of the DictEntry... there isn't
57      correct to copy it. The DictEntry is specified at the DocEntry creation,
58      then, it musn't change in the time.
59    * src/gdcmDocEntryArchive.[h|cxx] : new class. It's goal is to change the
60      header correctly. At this time, the change is only made for the first
61      level of the Document. In the future, it might consider sequences.
62      The change is made by replacing a DocEntry by an other that is created
63      outside the class. The old value is kept. When we restore the header
64      status, the added DocEntry is deleted and replaced by the old value.
65    * src/gdcmElementSet.h : Set the DocEntryArchive like friend.
66    * src/gdcmFile.[h|cxx] : Use the gdcmDocEntryArchive. Add methods to
67      set the write type to explicit VR, implicit VR or ACR. Add methods to set
68      the write mode to native, decompressed or RGB (but not used at this time)
69
70 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
71    * src/gdcmSeqEntry.cxx : add initialisation of variable SeqTerm
72    * src/gdcmDocument.cxx : add delete of DocEntry's to remove some memory leaks
73
74 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
75    * src/gdcmDocument.cxx : now, when using the ReplaceOrCreateByNumber to
76      set a BinEntry, the binArea is copied (like to set a ValEntry, the string
77      is copied).
78    * Test/TestCopyDicom.cxx, Example/TestCopyDicom.cxx : the image data isn't 
79      set because already copied when copying the BinEntry's of the header
80    * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx : remove warnings
81
82 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
83    * FIX : now, the DocEntries are all deleted in the gdcmElementSet.
84      Two problems appear when doing it :
85       - with the gdcmFile : when the GetImageData method is called, the pixels
86         are stored in the gdcmPixelConvert, but a gdcmBinEntry link to these
87         datas (pixels). And each structure destruct the datas when it's
88         destructed. So we have two destructions for the same datas. To solve it,
89         a flag is added in the gdcmBinEntry to indicate if the BinEntry owns the
90         datas or not. If it doesn't own datas, then they will not destroyed by
91         the gdcmBinEntry.
92       - with the gdcmDicomDir : the sequences (gdcmSQItem) contain DocEntry
93         elements. The DicomDir* (DicomDirPatient, etc.) inherit from SQItem.
94         Thus destruct the DicomDir* elements and the TagHT of the ElementSet 
95         create a double destruction of the same DocEntry's. So, to solve it, 
96         the TagHT is simply cleared and the DicomDir* elements are destroyed.
97    * TODO : add an entry concerning memory leaks in the DicomDir
98
99 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
100    * FIX : src/gdcmDocument.cxx Remove obvious code in the destructor
101    * FIX : src/gdcmPixelConvert : Set to NULL the deleted structures in the
102      squeeze method
103
104 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
105    * FIX: src/gdcmUtil.cxx : to compile with MSVC6
106    * src/gdcmDocument.cxx : fix memory leaks. Fix possible bugs : use an object
107      after it have been deleted
108
109 2004-11-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
110    * FIX: src/* fix the doxygen warnings.
111    * src/gdcmVR.cxx: removed some redundant tests (e.g. LO)
112    * src/gdcmDocument.cxx: FIX ::ComputeRLEInfo() rleSegmentOffsetTable[]
113      was erroneously defined with a size of 15 instead of 16. [many thanks
114      to Jean Michel Rouet for pointing out this bug].
115
116 2004-11-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
117     1. Finish merging JMR patch for writting DICOM from scratch
118     2. Fix -hopefully- bug with MONOCHROME and space vs null character
119     3. Use const ref when possible
120     4. Add a new function InitializeDefaultHeader, which create a template DICOM header (CT image for now)
121     5. A few more comments
122     6. CreateUniqueUID can now be called without parameter"
123
124 2004-11-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
125   * ENH: Slightly bigger patch:
126     1. Getting toward full integration of JMR patch for writting dicom from scratch
127     2. Update Test to test part of this patch: CreateUniqueUID
128     3. File was not close properly in gdcmDict
129     4. Use of typedef is to be prefered when possible (gdcmDict.cxx)
130     5. Use of const ref instead of copy (speed issue)
131     6. Remove temporary (duplicate) string in TranslateToKey
132     7. Mark extremely dangerous code as such (gdcmDocument.cxx and AddEntry fallback case)
133     8. Do not repeat virtual in subclasses
134     9. Implemented in gdcm::Util two new function: GetIPAddress, and CreateUniqueUID
135
136 2004-11-15 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
137   * Apply first patch toward better string comparison when dealing with broken 
138     DICOM files. Essentially the string could be padded with a space instead 
139     of a null character as defined by standard
140   
141 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
142   * src/gdcmDocument.[cxx|h] : fix memory leaks. The return is suppressed
143     because never used... and in the same time, that's remove some memory leaks
144
145 2004-11-15 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
146   * src/gdcmFile.cxx : now delete the PixelConvert instance.
147   * In examples and tests : change the type of image data variables from void*
148     to uint8_t*. Remmove all delete on image data variables
149
150 2004-11-10 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
151   * src/gdcmDocument.cxx : Set the file pointer TP to 0 in the constructors.
152     Verify the file pointer value before open the file, and if it's not null,
153     a verbose message is generated.
154     Close correctly the file when the file isn't considered dicom-like. The
155     correctly close is a call to CloseFile.
156     When closing the file pointer, test if its not null to close the file.
157   * src/gdcmPixelConvert.cxx : bug fix for the SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr
158     file. For an uncompressed image, the copied datas correspond in the least 
159     case to the image size (calculated) or the image size specified in the 
160     header. A verbose is generated if these two size mismatch
161
162 2004-11-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
163   * Test/TestAllReadCompareDicom.cxx : test the existence of the directory
164     using an 'ifstream' other than a 'FILE *'. The previous solution ('FILE *')
165     break under windows (with msvc6 compilation).
166
167 2004-11-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
168   * src/gdcmDicomDir.h : bug fix for the last Boix's commit (problem when
169     compiling with MSVC6)
170
171 2004-11-09 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
172   * Bugs fix for the Windows build with VC6
173   * CMakeLists.txt : bug fix - The include of the VTK lib is made only when it's
174     needed (only for projects required VTK). If the VTK is included in all
175     projects, there is conflicts with the jpeg lib of vtk when compiling the
176     gdcmjpeg[8,12,16] projects. The first conflict is on the jmorecfg.h file.
177   * src/gdcmUtil.h : export binary_write methods. Otherwise, there's problems
178     when compiling the gdcm_wrap.cxx file (created by the compilation of the
179     gdcm.i file)
180   * vtk/vtkGdcmDemo.cxx : remove the use of std namespace for the cerr use
181     (like it's already made for the cout use). Otherwise, conflict with the
182     std::cerr of vtk.
183
184 2004-11-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
185   * src/gdcmDicomDit.h the Method typedef is now local to DicomDir class.
186   * gdcmPython/gdcm.i:
187     - comments on the DicomDir::Method related usage added.
188     - now that we use the namespace gdcm, a lot of internal classes do
189       NOT need to be wrapped anymore.
190   * gdcmPython/demo/DicomDirProgressMethod.py (that uses the above
191     DicomDir::Method) new example added.
192
193 2004-11-05 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
194   * Improve string manipulation. I now inforce the notion of 'DicomString'
195     A DicomString can contain as many \0 as they want
196     and it is *always* of even length.
197     We only support odd length for very rare case. 
198     And in the near future this should be removed.
199
200 2004-11-03 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
201   * /binary_write/ gdcm source. Now even on big endian we are writting
202     little endian. This should -heopfully- fix some tests
203
204 2004-11-03 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
205   * Now the dictionary is compiled into gdcm lib. This is a default
206     behavior, thus any dic file specified is picked before failback to 
207     the one comiled into lib
208
209 2004-10-27 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
210   * Change internals for gdcmDict. Don't use any 'new' any more.
211     This should definitely solve any leak problem, and we should be
212     as fast as before, as long as don't modify too much the dictionary.
213
214 2004-10-25 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
215   * STYLE: ivars should start with a capital letter. 
216   * Accessors should be const to avoid people starting modifying stuff (since this is a ref). 
217   * remove 'virtual' as Style specify subclasses shouldn't reuse the keyword
218   
219 2004-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
220   * Doc/Dicom2004_Part5.pdf added (thanks to JPR).
221   * Dicts/dicomTS2004.dic, dicomV3VM2004.dic, groupNameAbbreviations2004.dic
222     new 2004 dictionaries added (thanks to JPR).
223   * FIX dashboard warning RLEFrame::NumberFragments is now of type unsigned int
224   * CLEANUP_ROUND (15) for gdcmPixelConvert
225     - RLEFrame::NumberFragments is now of type unsigned int
226     - gdcmFile::GetImageData(), GetImageDataIntoVector(), GetImageDataRaw()
227       are now all based on PixelConverter. ::GetImageDataIntoVectorRaw()
228       no longer exists.
229
230 2004-10-21 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
231   * Initial work in gathering all transfer syntax accessors. clearly 
232    IsDecompressed/IsJPEG2000/IsJPEGLossless/IsRLELossless shouldn't be all 
233    ivars, but only one transfersyntax (class) ivar with equivalent method on 
234    the class.
235   
236 2004-10-21 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
237   * Removed all FILE* ref and replace by ifstream/ofstream. For now I use a temp 
238     solution with the two files jdatadst.cxx and jdatasrc.cxx, this need to be 
239     discussed (plus I didn't like having a 2000 lines patch not commited)
240
241 2004-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
242   * src/gdcmDocument.cxx: wrong type on return fixed (thanks dashboard)
243   * CLEANUP_ROUND (14) for gdcmPixelConvert
244     - PixelConvert::GetLutRGBA(FILE*) is now GetLutRGBA() (no fp needed)
245     - PixelConvert::BuildRGBImage()(FILE*) is now BuildRGBImage() (no fp needed)
246     - File::GetImageDataIntoVector() doesn't need unnecessary OpenFile() and
247       CloseFile() anymore.
248     - File::GetImageDataRaw() doesn't call GetImageDataIntoVectorRaw()
249       anymore and hence avoids storing a copy of PixelConvert::Decompressed
250       into File::Pixel_Data.
251
252 2004-10-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
253   * src/gdcmDocument.cxx ftell() return properly stored in a long (i.e.
254     no longer depends on's programmers PMS = Preposterous Mood Swings ;).
255   * CLEANUP_ROUND (13) for gdcmPixelConvert
256     Substituted File::ParsePixelData() with PixelConvert::Print() new
257     method:
258     - src/gdcmParsePixels.cxx removed (only contained File::ParsePixelData())
259     - src/gdcmRLEFrame.cxx, gdcmJPEGFragment.cxx added. Added a ::Print()
260       method to those classes.
261     - src/gdcmFile.[cxx|h]:
262       -- Added a ::Print() method.
263       -- PixelConverter is now a reference instead of a member.
264       -- gdcmPython/gdcm.i: added "using namespace gdcm" in order for
265          gdcm_wrap.cxx to "understand" File::GetPixelConverter()
266
267 2004-10-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
268   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: when dot is present the
269     collaboration diagram and inheritance diagram should be generated with
270     doxygen.
271   * Doc/Website/Sidebar.html: Dashboard is now also in the sidebar.
272   * gdcmPython/gdcm.i: gdcmRLEFramesInfo.h gdcmJPEGFragmentsInfo.h are
273     pointlessly wrapped (see
274     http://www.creatis.insa-lyon.fr/pipermail/dcmlib/2004-October/000692.html )
275   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (sugar is my friend stage)
276     - Header::GetLUTRGBA() moved to PixelConvert::GetLutRGBA()
277     - vtk/vtkGdcmReader.cxx: adapted to displacment of Header::GetLUTRGBA()
278     - Document::RLEInfo and JPEGInfo are now pointer members (Swig thing)
279     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
280       -- File::Initialise: PixelConverter setup moved away to
281            PixelConverter::GrabInformationsFromHeader()
282       -- File::GetImageDataIntoVector(): Lut R + Lut G + Lut B color table
283          interpretation moved away to PixelConverter::BuildRGBImage()
284
285 2004-10-16 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
286   * Remove GDCM_EXPORT keyword from gdcm::DirList due to :
287     http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP
288
289 2004-10-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
290   * src/gdcmDebug.cxx last ditch attempt to get warning/error messages
291     displayed on Win32 when a brutal abort() occurs (because of uncatched
292     exception). See TODO new entry of this commit for more on this.
293   * TODO added new entry.
294   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (nicotine is my friend stage)
295     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
296     - HandleColor is no longer called from gdcmFile.cxx
297     - gdcmPixelConvert.cxx clean up on method arguments and internal
298       variable names for semantical coherence.
299
300 2004-10-14 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
301   * Finished lossless transition, not only do we now read all lossless jpeg
302   images, without the need of the Cornwell lib, but we do read them properly now
303   * To reduce code (well to avoid code duplication), I defined a common place
304   for jpeg read/write: gdcmJpeg.cxx. Now gdcmJpeg[8,12 16] include this file and
305   redefine symbols. This is not prefect but this the best solution I found for a
306   compilation time jpeg option.
307
308 2004-10-13 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
309   * Update jpeg ijg lib to support lossless jpeg implementation
310     For more info look in jpeg/libijg/README.GDCM.txt for necessary steps to
311     reproduce at home.
312   * Also added a special copyright for dcmtk since we use their bugfixes.
313   Thanks dcmtk crew !
314
315 2004-10-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
316   * Doc/Website/MailingList.html added (Sidebar.html changed accordingly).
317   * gdcmPython/gdcm.i: fix for compilation of wrappers (Note: %include order
318     matters, as stated in warning note at begining of %include section).
319   * src/gdcmDicomDir*.[cxx|h]: coding style
320   * src/gdcmDocument.h: doxygen \ref seems uncompatible with \todo.
321   * src/gdcmJpeg8.cxx: doxygen fix.
322   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (seing the ligth stage)
323     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: color handling moved
324     from File:: to PixelConvert::.
325
326 2004-10-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
327   * CLEANUP_ROUND (11) for gdcmPixelConvert (cafeine is my friend stage)
328     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
329      - more code moved away from File:: to PixelConvert::
330      - fat setup of PixelConverter set in place in File::Initialise.
331
332 2004-10-12 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
333   * Apply patch for namespace in gdcm. Didn't rename files for keeping a sort of
334   namespace at the file system level. So now you should convert your examples
335   like this:
336     gdcmHeader  ->   gdcm::Header
337   It would be nice if people keep in mind to no open the namespace, since it
338   allows compilation on broken plateform which were defining common symbol in
339   the standart namespace (like LP, Unknown ...)
340
341 2004-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
342   * CLEANUP_ROUND (10) for gdcmPixelConvert (Xanax is my friend stage)
343     The JPEG fragments are now parsed at the same stage than the RLE
344     information. All code related to JPEG is now in gdcmPixelConvert:
345     - src/gdcmJPEGFragment.h and gdcmJPEGFragmentsInfo.[h|cxx] added 
346     - src/gdcmJpeg12.cxx, gdcmJpeg2000.cxx and gdcmJpeg8.cxx no longer
347       export a gdcmFile:: method. Those are simply global functions
348       (for the time being this is better than having them attach to
349        either gdcmFile:: or gdcmPixelConvert::).
350     - src/gdcmDocument.[cxx|h], gdcmDocument:: now parser the JPEG fragments
351       and stores the result in a gdcmJPEGFragmentsInfo.
352     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: all JPEG related
353       code (among other stuff) moved away from gdcmFile:; to 
354       gdcmPixelConvert::
355
356 2004-10-08 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
357   * src/gdcmCommon.h now declares int8_t for non stdint.h plateforms.
358   * CLEANUP_ROUND (7) for gdcmPixelConvert (lost at sea)
359     - src/gdcmFile.h gdcmPixelConvert.cxx gdcmPixelConvert.h gdcmRLE.cxx:
360       clean up of RLE related code. 
361   * CLEANUP_ROUND (8) for gdcmPixelConvert (end of RLE nigthmare)
362     - src/gdcmRLE.cxx removed
363     - src/gdcmPixelConvert.cxx all RLE code is now in PixelConvert::
364     - src/CMakeLists.txt gdcmFile.[cxx|h] changed accordingly
365     - src/gdcmRLEFrame*.h gdcmPixelConvert is now a friend class.
366   * CLEANUP_ROUND (9) for gdcmPixelConvert
367     - src/gdcmFile.[cxx|h} gdcmPixelConvert.[cxx|h], SwapZone(),
368       ConvertReorderEndianity(), ConvertDecmpres12BitsTo16Bits() moved
369       away from gdcmFile:: to gdcmPixelConvert::.
370
371 2004-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
372   * CLEANUP_ROUND (5) for gdcmPixelConvert (Upshit creek without a paddle)
373     - src/gdcmDocument.[cxx|h] Parse7Fe0 renamed to ComputeRLEInfo.
374       This is because Parse7Fe0 used to parse the pixels to compute the
375       length. This task was passed over to FindDocEntryLengthOB() a long
376       time ago, EXCEPT I had forgotten the OW case...
377       Hence Parse7Fe0 was no longer necessary. When renaming to ComputeRLEInfo
378       we just recylce the code for parsing RLE fragments and computing
379       offsets.
380   * CLEANUP_ROUND (6) for gdcmPixelConvert (man, I need a paddle bad)
381     - src/gdcmRLE.cxx: is now much simpler and avoids code replication
382         with the retired Parse7Fe0().
383     - src/gdcmRLEFrame.h: type fix for properly computing OffSet[]
384     - src/gdcmDocument.cxx: segments offset are now correct + clean up.
385
386 2004-10-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
387   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert (nightmare stage)
388     - src/gdcmRLEFramesInfo.[cxx|h], gdcmRLEFrame.h added
389     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::Parse7FE0 now sets up the RLEInfo.
390     - src/CMakeLists.txt: alphabetic order reodering + new entries.
391   * CLEANUP_ROUND (4) for gdcmPixelConvert
392     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::ParseDES and ::ParseSQ no longer bother
393       to return an unused length.
394
395 2004-10-09 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
396   * Remove all sprintf from the code to centralize in one spot in gdcmUtil
397     this should be cleanner from the plane view. The iostream are erally a pain
398     to use to do simple stuff.
399
400 2004-10-04 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
401   * Redo the compilation of the ijg jpeg library. Now only one source is
402     necesseray. No need to rename file by hand what so ever. CMake handle the
403     copying of the file within different directory, configure header file to
404     modify some symbol. The only addition made to ijg wasd a mangle table so
405     that symbol are different wether we are within 8bits or 12bits.
406
407 2004-10-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
408   * Added documentation of vtkgdcmReader on Website:
409      - testvtkGdcmReader.cxx renamed to vtkGdcmDemo.cxx (to be compatible
410        with it's binary name).
411      - vtk/vtkGdcmDemo.cxx and vtkgdcmViewer.cxx: added comments for
412        the Website to be more complete.
413      - Doc/doxygen.config.in: vtk/vtkGdcmReader.cxx now appears on 
414        doxygenated documentation.
415      - Doc/DoxyVtkGdcmReaderExamples.txt added
416        (see http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/html.developper/
417                   DoxyVtkGdmReaderExamples.html )
418   * src/win32, vtk/win32 manually maintained .dsp and .dsw removed.
419   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert
420    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
421
422 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
423   * CLEANUP_ROUND (2) for gdcmPixelConvert
424    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
425
426 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
427   * CLEANUP_ROUND for gdcmPixelConvert:
428     - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h, gdcmHeader.cxx, gdcmHeader.h clean up
429     - src/gdcmPixelStuff[h|cxx] removed
430     - src/gdcmPixelConvert[h|cxx] added. Preparatory work included.
431     - src/CMakeLists.txt changed accordingly
432   * GDCMHOME clean up:
433     - MANIFEST.in, WrapSwig.py, WrapVTK.py, distutilsWrapping.py and
434       gdcmVersion.py moved to newly created ATTIC related
435       gdcmPython/SetupOldies/ directory.
436   * Autotools clean up:
437     - */*/Makefile.am removed AT EXCEPTION of gdcmPython/Makefile.am
438     - autogen.sh configure.in acinclude.m4 python.m4 removed 
439
440 2004-09-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
441   * src/*.cxx *.h Reference to License.htm fixed to License.html.
442   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: fix.
443   * Doc/Website/ConformanceSummary.html, minimal conformance statement added.
444
445 2004-09-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
446   * TODO updated with Mathieu suggestions. I proposed a template for
447     describing TODO entries and used it for new entries.
448   * Added Doc/Website/CodingStyle.html, Developpers.html,
449     DeveloppersPython.html, GdcmDataCvs.html and
450     DownloadVersion0_1.html, DownloadVersion0_3.html.
451   * Some Doc/*.txt Doxygen files (which do not really concern the
452     documentation itself, but the website) moved to html and
453     placed in directory Doc/Website:
454     - Doc/DoxyDevelInstal.txt moved to Doc/Website/Developpers.html
455     - Doc/DoxyInstallation.txt moved to Doc/Website/Installation.html
456     - Doc/DoxyIntroduction.txt included in Doc/Website/Main.html
457   * Doc/DoxyfileDeveloppers, DoxyfileUsers, Makefile.am oldies removed.
458   * CMakeLists.txt changed accordingly.
459   * DEVELOPPER spread out in Doc/Website/Developpers.html, CodingStyle.html,
460     DeveloppersPython.html
461   * INSTALL nows refers to Doc/Website/Installation.html
462
463 2004-09-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
464   * Added Doc/Website directory, that contains a first raw version
465     of gdcm Web site.
466
467 2004-09-23 Jean-Pierre Roux
468   * FIX In order not to be poluted any longer by casting problems,
469     the member VoidArea of gdcmBinEntry is now uint8_t* (instead of void *)
470     we can now delete[] it safely 
471   * VoidArea is now called BinArea (less confusing name),
472     and all the methods called ...VoidArea... are now ... BinArea...
473   * class gdcmObject is now called gdcmDicomDirObject (less confusing name)
474
475 2004-09-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
476   * src/gdcmDocument.cxx: gdcmDocument::~gdcmDocument() doesn't clear (nor
477     clear) TagHT, which is an inherited member of gdcmElementSet. It is
478     up to the destructor of gdcmElementSet to clean up TagHt and it's
479     pointed content.
480
481 2004-09-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
482   * Test/CMakeLists.txt: update to follow gdcmData renamings.
483   * src/gdcmCommon.h, gdcmDocument.cxx: doxygen typos
484
485 2004-09-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
486   * ENH: added some utility method that builds a flat dictionnary
487     holding all the Dicom entries contained in the recursive structure
488     of a gdcmElementSet. Refer to add FlatHashTablePrint.cxx for 
489     an example of usage.
490     - src/gdcmDocument.[h|cxx] added BuildFlatHashTableRecurse() and
491       BuildFlatHashTable() that build a flat dictionary.
492     - src/gdcmElementSet.h: added a new private GetTag() accessor.
493       gdcmDocument is now a friend of gdcmElementSet.
494     - src/gdcmElementSet.cxx: clean up.
495     - Example/FlatHashTablePrint.cxx added.
496     - Example/CmakeLists.txt changed accordingly
497
498 2004-09-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
499   * gdcmDocEntrySet::SQDepthLevel and gdcmDocEntrySet::BaseTagKey attributes
500     moved away from gdcmDocEntrySet (since this class is an abstract class
501     acting like an interface). SQDepthLevel and BaseTagKey are now
502     in class 
503     - src/gdcmDocEntrySet.[h|cxx] removal of SQDepthLevel and BaseTagKey
504       and associated accessors. Doxygenation of the class.
505     - src/gdcmSQItem.[h|cxx] SQDepthLevel and BaseTagKey and associated
506       accessors added.
507     - src/gdcmSeqEntry.[h|cxx]: constructor doesn't handle depth anymore.
508       Use SQDepthLevel accessor instead. ::Print() adapted.
509     - src/gdcmElementSet.cxx changed according to changes in gdcmSeqEntry.
510     - src/gdcmDocument.cxx changed accordingly.
511
512 2004-09-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
513   * Preparation of writing a gdcmHeader iterator: generalisation of gdcmTagKey
514     - The following is the doxygen comment of the typedef declaration
515       of gdcmagKey in src/gdcmCommon.h:
516            gdcmTagKey is made to old an "universal" (as in URL, Universal
517            Ressource Locator)  key to a gdcmDocEntry i.e. a dicom tag.
518            A dicom tag allways has a group and an element, but a set of tags
519            embeded in various (optionally nested) sequences and sharing
520            the same group and element all share the same (group, element)
521            "identifier". Hence the (group, element) cannot be used as an
522            identifier (in gdcm we shall refer to a "TagKey") of a tag.
523            In order to construct a proper tag identifier (i.e. a key) we
524            consider the following definition of a TagKey:
525            - let Group, Element be the string representation of the
526              group and element dicom tag members,
527            - let ItemNumber be the string representation of the integer
528              index of the considered item number of a sequence,
529            Let the key of a tag embeded in a sequence, noted SeqTag, be
530            the form:
531               /ItemNumber#Group|Element
532            where "/", "#" and "|" are characters acting as separators.
533            Then the general form of a gdcmTagKey is given by:
534               Group|Element<SeqTag>
535            where <SeqTag> means NO or many instances of SeqTag.
536            Hence the gdcmTagKey of a tag not "leaving" in a sequence is the
537            string e.g.
538                0028|1201
539            but the gdcmTagKey of a tag "embeded" is the first item of
540            a sequence, itself nested in the third item of a sequence is the
541            string e.g.
542                0004|1220/2#0008|0082/0#0008|0090
543     - src/gdcmDocEntry.h: added a new Key (of type gdcmTagKey) member, in
544       order to hold the new sequence compatible key. Previously, the 
545       GetKey() method would look in the underlying gdcmDictEntry.
546     - src/gdcmDocEntry.cxx:
547       -- constructor now copies the underlying DictEntry key, in the local
548          Key member.
549       -- ::Print: displays the member Key, instead of the (group, element).
550     - src/gdcmCommon.h: added some comments on typedef gdcmTagKey.
551     - src/gdcmDocEntrySet.h:xi
552       -- ::ParseDES() now setups the gdcmTagKey of the sequence it is parsing.
553       -- now has a new BaseTagKey member.
554       -- STYLE.
555   * src/gdcmValEntry.[h|cxx], src/gdcmBinEntry.[h|cxx]: the member VoidArea,
556     previously a member of gdcmValEntry, moved to gdcmBinEntry were is
557     truly belongs.
558     This poses the problem with the semantics of the following lines
559        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1201);  // R    LUT
560        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1202);  // G    LUT
561        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1203);  // B    LUT
562     in gdcmDocument::gdcmDocument(std::string const & ). Please refer
563     to the long FIXME note for what the problem is. Nevertheless in
564     order to get things working the dicom dictionary was altered !
565     Please fix things urgently...
566   * Dicts/dicomV3.dic WRONGLY altered (this means we introduced a uncorrect
567     information), see above note on moving the member VoidArea. Nevertheless
568     the following entries previously correctly set as US are now inproperly
569     set to OW:
570       0028 1201 OW IMG Red Palette Color Lookup Table Data
571       0028 1202 OW IMG Green Palette Color Lookup Table Data
572       0028 1203 OW IMG Blue Palette Color Lookup Table Data
573   * src/gdcmDocEntry.[h|cxx], src/gdcmSeqEntry.h: SQDepthLevel member
574     of gdcmDocEntry moved to gdcmSeqEntry.
575   * src/gdcmSeqEntry.cxx: STYLE.
576
577 2004-08-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
578   * Test/TestAllEntryVerify.cxx minor fix and added comments.
579
580 2004-08-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
581   * gdcmPython/testSuite.py: all the test suite in python is now moved
582     to it's C++ version (see gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt)
583   * Test/CMakeLists.txt adapted to renaming of files in gdcmData
584   * gdcm/TODO and src/gdcmDictSet.h cleaned up frow the "TODO Swig" oldies
585
586 2004-08-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
587   * gdcmPython/CMakeLists.txt: SWIG_FLAGS doesn't declare includeall
588     to avoid inclusion recursion until STL is reached.
589   * src/gdcmDocument.[h|cxx]: exceptions substituted to errno C-style
590     mecanism. errno.h is not included in gdcm anymore.
591   * src/gdcmException.h: introduced new gdcmFormatUnexpected class
592     (gdcmFormatError now inherits from gdcmFormatUnexpected).
593   * TODO updated
594   * gdcmPython/testSuite.py checks on CR-MONO1-10-chest.dcm moved to
595     gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
596   * Test/TestAllEntryVerify.cxx is now effective (used allways return true)
597   * src/gdcmDocument.[cxx|h]: constructors no longer use the bool
598     exception_on_error parameter.
599     - src/gdcmFile.[cxx|h], src/gdcmHeader.[cxx|h] changed accordingly,
600     - vtk/vtkGdcmReader.cxx changed accordingly,
601     - Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
602
603 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
604   * src/gdcmDicomDir.cxx, gdcmDocEntrySet.cxx: removed inclusion of errno.h
605   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
606     enable_sequences removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
607   * Example/PrintHeader.cxx: fixed accordingly (enable_sequences removal).
608   * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: dummy fix.
609   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
610     skip_shadow removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
611   * Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
612
613 2004-07-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
614   * Test/CMakeLists.txt: newly re-introduced SIEMENS_Sonata-12-MONO2-SQ.dcm
615     in gdcmData (previously known as E00001S03I0015.dcm) is blacklisted.
616
617 2004-07-21 Jean-Pierre Roux
618   * FIX Now, Parsing and Printing a DICOMDIR do work!
619        ( troubles remain in makeDicomDir and BuildUpDicomDir :-(
620  
621 2004-07-20 Jean-Pierre Roux
622   * FIX Some brain damaged headers have Zero-Lenght fields 
623         for 'Transfert Syntax UID', or 'Media Stored SOP Class UID'.
624
625 2004-07-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
626    * src/gdcmCommon.h, gdcmDict.cxx, gdcmTS.cxx : bug fix for msvc6 compilation
627    * src/gdcmDebug.[h|cxx] : bug fix for msvc6 compilation. Replace the dbg
628      variable (instance of gdcmDebug) by a definition macro, and the instance
629      is now in static in the gdcmDebug class
630    * src/gdcmSQItem.h : (FIXME) remove an undefined method
631    * Test/PrintAllDocument.cxx : bug fix in the result of the test
632
633 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
634    * WARNING: ctest now depends more tightly on gdcmData. You should
635      check out gdcmData properly for things to run smoothly...
636    * src/gdcmDocument.cxx MAX_SIZE_LOAD_ELEMENT_VALUE is set back to 0xfff
637      (4096) for "ctest -R TestAllEntryVerify" to be able to run (i.e.
638      we need the pixels not be loaded in order to use the ValEntry
639      that displays position and size).
640    * Test/TestAllEntryVerify.cxx a new low level test now seems fair.
641      This is a C++ based equivalent of gdcmPython/testSuite.py that should
642      be deprecated. If you have any doubts about the advantages of a
643      modern scripting language (read Python) versus grass root C++ (i.e.
644      without lex + yacc, because of gdcm commitement to MS-VC++, sighhh),
645      I suggest you compare TestAllEntryVerify.cxx (639 lines, without the
646      reference file gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt) and testSuite.py.
647         Anyhow, consider documenting the gdcmData images in 
648      gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt (and please run ctest before
649      commiting changes).
650    * Test/CMakeLists.txt:
651       - now uses TestAllEntryVerify.cxx
652       - specific comments on oldACR00001.ima (now renamed in gdcmData
653         to SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr) moved away to
654         gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
655    * TODO updated.
656
657 2004-07-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
658    * src/*.[h|cxx] : typedef clean up
659      - guint16 and guint32 removed. Use ISO C uint16_t, uint32_t instead.
660      - TagKey renamed to gdcmTagKey (for external usage)
661      - VRKey renamed to gdcmVRKey (for external usage)
662      - removal of typedef duplication.
663      - Removed all unecessary inline keyword from class inline definitions.
664      - Some method|function(void) declarations replaced with method|function().
665    * src/jpeg/libijg12/jdhuff12.c:
666       - printf polluting ctest removed.
667       - TAB removal for comminting
668    * Test:
669      - TestAllReadCompareDicom.cxx: added a test that compares all the
670        images in gdcmDataImages.h with corresponding images in 
671        gdcmData/BaselineDicom/. When baseline images are not present
672        this test creates them.
673        Note: we need to validate each reference image, but before that
674              I'd like to rename them with a more explicit name...
675      - CMakeLists.txt: changed accordingly.
676    * Example/*.cxx: examples now only include gdcm.h (as opposed to 
677      including each header needed).
678
679 2004-07-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
680    * Test/*.cxx and Example/*.cxx: moved some examples away from the
681      test suite to the Example directory. Are concerned:
682      - PrintHeader.cxx
683      - TestDcm2Acr.cxx
684      - TestFindTags.cxx
685      - TestWrite.cxx was
686      - TestWriteSimple.cxx
687    * Test/CMakeLists.txt: added some comments on reasons for black listing
688      image gdcmData/oldACR00001.ima
689
690 2004-06-30 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
691    * Test/CmakeList.txt: removed the following from black list (to be coherent
692      with removal from gdcmData):
693       - gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.fixed.dcm
694       - gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm
695       - US.3405.1.dcm
696      Added the following because after last cvs update, they cause
697        ctest -R TestReadWriteReadCompare 
698      to segfault:
699       - gdcm-MR-SIEMENS-16-1.acr
700       - oldACR00001.ima
701    * Test/TestReadWriteReadCompare.cxx was properly written (with a call
702      to gdcmFile::SetImageData()) BUT since gdcmFile is brain damaged (see
703      new comments in this file) we temporarily (sigh) move to a weaker
704      form of test...
705    * Test/CmakeList.txt: with the change to Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
706      we don't need to black list the following images anymore:
707       - 8BitsUncompressedColor.dcm
708       - OT-PAL-8-face.dcm
709       - US-PAL-8-10x-echo.dcm
710    * src/gdcmDocument.[h|cxx]: RE-Reverting to version 1.42 with the proper
711      fixes and the beautified code ;-)
712      This fixes the bug introduced in version 1.42 (when beautifying)
713      that made the parsing of 8BitsRunLengthColor.dcm unproper.
714      Note: ctest was blind to this bug (this means we need to still
715            improve the test suite). The bug could be detected by using
716            gdcmbin/bin/PrintDocument $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
717            or by using
718            gdcmbin/bin/ReadWrite $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
719            and by displaying the (garbage) produced file temp.XDCM...
720
721 2004-06-29 Jean-Pierre Roux
722    FIX : - remove Frog's beautified, but never checked 'Parse7FE0' code,
723          - replace by uggly but working old code :-(
724    A lot of things should be OK again.
725    It's really urgent to have a test suite that *tests*, 
726    to prevent Frog's beautifying sessions to break all the stuff
727    (twice, withing a fortnigh ...)      
728
729 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
730    * Test/TestWriteRead.cxx and TestReadWrite.cxx merged (because of
731      redundancy) to added Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
732    * Test/CmakeList.txt: because the compare test of
733      Test/TestReadWriteReadCompare.cxx fails, the following images are
734      black listed: - 8BitsUncompressedColor.dcm
735                    - OT-PAL-8-face.dcm
736                    - US-PAL-8-10x-echo.dcm
737    * src/gdcmDocument.cxx: for broken (non DICOM V3 conformal) images
738      (e.g. gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm see comments in
739      gdcm/gdcmPython/testSuite.py for details) ::FindDocLengthOB() had
740      and ad-hoc kludge. This kludge is now removed, and on encountering
741      such an image (OB field brain damaged) we set errno. Then in 
742      ::FindDocLength() we "fix" the length as being ALL what remains
743      in the file (until EOF). We then proceed, hoping for the best...
744      This fixes a SegFault in ShowDicom when trying to write such an
745      image.
746    * Test/CmakeList.txt: 8BitsRunLengthColor.dcm is now blacklisted
747      (because TestWriteRead breaks on it, after a non conformal commit?).
748      ctest now runs properly, except for MakeDicomDir (which was allways
749      broken) and the Python related stuff (still not fixed).
750    
751 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
752   ADD : Examples/WriteRead, that acts like the former Test/TestWriteRead
753   FIX : Test/TestReadWrite now iterates on all the file names 
754                           (instead of infinite loop)
755   ENH : Test/TestWriteRead now iterates on all the file names 
756
757 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
758    * Test/TestReadWrite.cxx: now uses all the images of gdcmData.
759
760 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
761    FIX : - now Write drops LUT Descriptors and LUTs (if any)
762            when SamplesPerPixel =3
763          - now Write is no longer confused by 
764           'BitsAllocated = 12" and 'BitsStored=12"
765          - "UN" value representation Elements are now written correctly 
766                (their legth is stored on 4 bytes -just like OB, OW, and SQ-)
767    ENH : - now gdcmHeader has its own Write methods 
768            (in order to split the job that has not to be done 
769            for gdcmDicomDir)
770
771 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
772    * Test/PrintAllDocument.cxx: looping on files is now effective. It used to
773      loop on the same image until memory went out. 
774      Note: this means we still have gobs of memory loss in PrintDocument
775    * src/gdcmDocument.cxx: fixes problem on parsing on file
776      gdcmData/16BitsJpegLosslessGrayScale.dcm.
777
778 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
779    FIX : Write - All the Sequences and Sequence Item are now written 
780             as 'no length' stuff, and a Sequence Delimitor aor an Item Delimitor
781             is added a the end, when necessary.
782             - A lot of brain-damaged images, that were read correctly are 
783               now written correctly
784             - length compatible BinEntry are now loaded correctly 
785               (even for odd groups) 
786         Note : only Explicit Value Representation was checked.
787                (question : is implicit VR really necessary for gdcm ?)
788
789 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
790    * DEVELOPPER: added a proposition of coding style.
791    * src/gdcmDocEntry.h: removed every inline declaration (for test of 
792      coding style).
793
794 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
795    * gdcmDocEntry::PrintCommonPart() and ::WriteCommonPart() removed.
796      Use the gdcmDocEntry::Print() and Write() instead.
797    * src/gdcmDocument.cxx: bug fix.
798
799 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
800    FIX : gdcmDocument.cxx
801       - Now we do recognize the JpegLossLess format (there was a misstyping in
802         code 'beautyfication' :-(
803       - Now we automaticaticaly load the Luts, if any
804
805 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
806    In order : to write Sequences, whatever their imbrication level, 
807             : to allow user to create his own Sequences
808    a lot of modif where necessary (adding, moving, or virtualising methods)
809
810    WARNING : save your own sources *before* cvs up !
811
812    - gdcmBinEntry
813      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
814   
815    - gdcmDocEntry
816      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
817      ADD void gdcmDocEntry::WriteCommonPart(FILE *fp, FileType filetype);
818   
819    - gdcmDocEntrySet
820      ADD virtual void Write (FILE *fp, FileType filetype)=0;
821      ADD virtual gdcmDocEntry *GetDocEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
822      ADD gdcmDocEntry *GetDocEntryByName(std::string name);
823      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
824      ADD std::string GetEntryByName(TagName name);               
825      ADD gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
826                                             guint16 element,
827                                             std::string vr     = "unkn",
828                                             std::string fourth = "unkn",
829                                             std::string name   = "unkn"); 
830      ADD gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);  
831      ADD gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
832      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
833      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);   
834      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByName   (std::string Name);
835      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
836      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element)=0;
837      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name)=0;
838   
839    - gdcmDocument
840      ADD virtual bool WriteF(FileType type); // New stuff, with recursive exploration
841      ADD virtual std::string GetEntryByName    (TagName tagName);
842      ADD virtual std::string GetEntryVRByName  (TagName tagName);
843      REM virtual bool Write(FILE *, FileType);
844      REM virtual void WriteEntryTagVRLength(gdcmDocEntry *tag,
845                                         FILE *_fp, FileType type);
846      REM virtual void WriteEntryValue(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
847      REM virtual bool WriteEntry(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
848      REM virtual bool WriteEntries(FILE *_fp,FileType type);
849      REM virtual std::string GetEntryByName    (std::string tagName);
850      REM virtual std::string GetEntryVRByName  (std::string tagName);
851      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByName  (std::string Name);
852      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
853      REM gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
854                                             guint16 element,
855                                             std::string vr     = "unkn",
856                                             std::string fourth = "unkn",
857                                             std::string name   = "unkn");
858      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
859      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);
860      REM gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
861      REM gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
862                                                                                                                  
863         - gdcmElementSet
864           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
865           
866    - gdcmSeqEntry
867           ADD virtual void Write(FILE *fp,FileType filetype);
868  
869    - gdcmSQItem
870      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
871      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);        
872      REM std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
873      REM std::string GetEntryByName(TagName name);
874
875    - gdcmValEntry
876          ADD virtual void gdcmValEntry::Write(FILE *fp, FileType filetype); 
877                                   
878 2004-06-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
879     * Test/TestWriteSimple.cxx: fix to gdcmHeader-gdcmHeaderHelper revamping.
880       The default constructor invoked by the line
881          gdcmHeader *f1 = new gdcmHeader( header );
882       was gdcmHeader::gdcmHeader(bool) instead of the expected
883       gdcmHeader::gdcmHeader(std::string const &, bool = false, bool, bool).
884       Hence the parsing wasn't executed... See also below.
885     * src/gdcmHeader.h: the declaration of gdcmHeader::gdcmHeader(bool)
886       as explicit constructor didn't do the trick to fix the above problem.
887       Could anyone explain why ?
888     * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmValEntry.cxx: gdcmBinEntry::Print() now
889       properly calls gdcmValEntry::Print() (that was weed out from 
890       code related to gdcmBinEntry).
891
892 2004-06-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
893     * In order to fix memory leaks:
894      - Test/TestWriteSimple.cxx: added cleaning of free store through
895        some delete calls.
896      - src/gdcmBinEntry.cxx: fix to avoid SegFault.
897      - src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: fixed initialisation in constructor
898        gdcmDicomDir::gdcmDicomDir(bool) [either the constructor itself
899        (through the call to ::AddDicomDirMeta()) or the destructor
900        would crash when deleting uninitialized ::metaElems].
901      - src/gdcmDictEntry.cxx: annotation of ununderstood memory leak.
902      - src/gdcmDocument.cxx:
903        -- ::~gdcmDocument() destructor now cleans up all dictionary entries
904           from dynamic stores.
905        -- ::ParseDES() misplaced deletion of temporary NewDocEntry
906           was causing memory leaks.
907      - src/gdcmSQItem.cxx:
908        -- ::~gdcmSQItem() dummy code cleaned (learned that deletion is
909           cleanly handled with polymophism: sorry but my milage is low).
910        -- ::SetEntryByNumber(string, guint16, guint16) now cleanly allocates
911           a gdcmValENtry, and makes no assumption on type (gdcmDocEntry,
912           gdcmSeqEntry vs gdcmValEntry) of existing entry (when present).
913           This avoids SegFaulting.
914      - src/gdcmSQItem.h: coding style.
915     * Conclusion:
916      - Test/TestWriteSimple still severely sucks. The output image content
917        (when $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm in input) is brain
918        damaged when displayed with vtkgdcmViewer.
919      - on memory leaks: TestWriteSimple leaks really less (see entry
920        of 2004-06-18 in Changelog file for the call to valgrind).
921      - on segfaults: ctest now passes all the tests but one (no more
922        segfaults).
923     * Erroneous leading white fix:
924      - src/gdcmDict.cxx: getline(from,xxx) doesn't remove the leading
925        white[s] (as opposed to from >> xxx, that removes it [them].
926      - src/gdcmTS.cxx: ditto.
927      - gdcmPython/testSuite.py: dirty related kludge removed.
928     * src/*: remaining references to gdcmParser removed.
929     * src/*[cxx|h]: added copy[way]left header.
930
931
932 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
933     * In order to fix writing of dicom files:
934      - Test/TestWriteSimple.cxx: a simpler example of writing.
935      - Test/CMakeLists.txt changed accordingly.
936      - src/gdcmDocument.cxx:
937        -- The destructor now recursilvely removes potential sequences.
938        -- Bug fix in ::IsJPEG2000()
939        -- ::ReplaceOrCreateByNumber(std::string, guint16, guint16)
940           now handles promotion of gdcmDocEntry to gdcmValEntry in a cleaner
941           manner.
942        -- ::GetValEntryByNumber(guint16, guint16) now defined (as opposed
943           to only declared) and build on top of
944           ::GetDocEntryByNumber(guint16, guint16).
945        -- ::SetEntryByNumber() now uses GetValEntryByNumber(group, element)
946      - src/gdcmElementSet.[h|cxx]: added ::RemoveEntry(gdcmDocEntry *)
947        for usage in destructor and treatement of promotion in
948        ::ReplaceOrCreateByNumber().
949      - src/gdcmSQItem.cxx: destructor should better handle his job.
950       Test/TestWriteSimple now runs (or at least it DOES something).
951     * We can now start hutting memory links. A good starting point is:
952       valgrind -q --skin=memcheck --leak-check=yes --leak-resolution=high
953       --num-callers=100 --show-reachable=yes gdcmTests TestWriteSimple
954       $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm foo.dcm
955
956 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
957     * Valgrind note: after Mathieu Malaterre teached me how to read
958       the valgrind FAQ ;-] (see http://valgrind.kde.org/faq.html), I
959       learned that:
960           Using gcc, you can force the STL to use malloc and to free memory as
961           soon as possible by globally disabling memory caching.
962           With 3.2.2 and later, you should export the environment variable
963           GLIBCPP_FORCE_NEW before running your program.
964       By setting GLIBCPP_FORCE_NEW, STL related memory leak messages of gdcm
965       simply vanish (it is still not clear to me, whether this means that
966       STL std::string leaks or if valgrind believes it leaks...).
967     * Fixing of SegFault of Test/makeDicomDir (as shown by ctest or by
968       running bin/gdcmTests makeDicomDir):
969       - src/gdcmDicomDir.cxx: dynamic casting used + clean up.
970       - Test/makeDicomDir.cxx now properly traps empty lists and returns
971         with 1.
972       NOW, makeDicomDir cleanly fails (in ctest terminology) instead of
973       SegFaulting (I drowned in DicomDir related code when trying to
974       understand why the list is empty...).
975     * src/gdcmDocument.h: first BSD license header try.
976     * Doc/License.txt added.
977
978 2004-06-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
979     * src/gdcmDocument.[h|cxx]:
980       - Clean up of the Transfer related predicates. They are now all based
981         on new method isGivenTransferSyntax, that (should) handle properly
982         the padding problem.
983       - general clean up, simplification, and coding style.
984       - Specific clean up of Parse7FE0() (umproperly named actually).
985     * gdcmPython/testSuite.py: an odd temporary kludge introduced.
986
987 2004-06-14 Jean-Pierre Roux             
988    *  gdcmSeqEntry.cxx
989            - fix the display of Sequence Delimitor (SQDepthLevel pb)
990                 - fix the display of SQItem ordinal number
991       - add the GetSQItemByOrdinalNumber method
992                 - remove some useless never written private methods     
993                 
994 2004-06-14 Jean-Pierre Roux
995    * gdcmBinEntry.cxx 
996       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param
997            - ReplaceOrCreateByNumber now returns :
998               a gdcmBinEntry * if a Binary (void *) value is passed as a param
999                    a gdcmValEntry * if a string value is passed as a param
1000    * dcmDocument.cxx
1001       - SetEntryByNumber now allows setting gdcmValEntry or gdcmBinEntry, 
1002               according to the param type (no longer sets a gdcmDocEntry)
1003            - GetValEntryByNumber, GetBinEntryByNumber added
1004       - NewValEntryByNumber and NewBinEntryByNumber added
1005    * gdcmFile.cxx
1006       - Pixel Data are now linked to the (7fe0,0010) elements, after reading
1007    * gdcmSQItem.h
1008       - GetSQItemNumber and SetSQItemNumber added, to provide 
1009             a (relative) Item identier inside a given Sequence
1010             \warning : some pb remaining around this number
1011                                 will be solved asap
1012       - AddEntry now takes the Item Number as a param   
1013    * gdcmValEntry.cxx 
1014       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param    
1015
1016 2004-06-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1017     * Memory leak hunt with the following command:
1018       valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
1019                --show-reachable=yes gdcmTests PrintDocument
1020       It looks like many (all?) leaks are due to the STL (or a bad usage
1021       of the STL. The lines producing the leaks now have a comment with
1022       a "MEMORY LEAK" tag: you can retrieve them with 
1023           grep "MEMORY LEAK" src/*
1024       Here are two typical examples which I can't help fixing:
1025       -----
1026           #include <string>
1027           int main() {
1028              std::string name;
1029              char * test = "babo";
1030              name = test;    //// <--- valgrind detects 960 bytes lost in
1031                              ////   call to std::string::operator=(char const*)
1032              name.clear();   //// Doesn't help !
1033              return 0;
1034           }
1035       -----
1036           #include <string>
1037           #include <iostream>
1038           int main() {
1039              std::string line;
1040              std::cout << "Type a bunch of characters followed by RETURN: ";
1041              getline(std::cin, line);   //// <--- valgrind dectects a loss
1042                                         //// of 1320 bytes in call to
1043                                         /// std::basic_istream<>& std::getline<>
1044             return 0;
1045           }
1046       -----
1047
1048
1049 2004-06-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1050     * src/gdcmHeader.[cxx|h]:
1051       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*)
1052         and related, moved away to gdcmDocument.
1053       - Accessors (on the form [Get|Set]Entry*) set up to expose publicly
1054         the corresponding protected accessors of inherited class
1055         gdcmDocument, removed ! As a consequence gdcmFile had to be 
1056         declared friend of class gdcmDocument (see below).
1057       - operator< moved to gdcmDocument (in fact it belongs to gdcmDicomDir).
1058       - Clean up of undefined or unused methods.
1059     * src/gdcmFile.[cxx|h]: added SetEntryByNumber (in order to take into
1060       account the changes to gdcmHeader.h).
1061     * src/gdcmDocument.h:
1062       - gdcmFile is now a friend class (in order to take into account the
1063         changes to gdcmHeader.h).
1064       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*) added
1065         (see changes to gdcmHeader.h).
1066       - Accessors (reading on the form GetEntry*) are now public.
1067       - Clean up of undefined or unused methods.
1068     * src/gdcmDocument.cxx:
1069       - adaptation to changes to gdcmDocument.h
1070       - ::OpenFile now writes a verbose message when file cannot be opened.
1071       - some std::string properly set to VRKey
1072     * src/gdcmDicomDir.h: historical references to gdcmHeader changed to
1073       references to gdcmDocument. 
1074     * Test/TestFindTags.cxx: changed accordingly to above changes.
1075     * gdcmPython/testSuite.py: adapted to renaming of acr files in 
1076       cvs repository gdcmData.
1077
1078 2004-06-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1079     * src/gdcmValEntry.h: member voidArea type changed from char* to void*.
1080     * src/gdcmBinEntry.h: member voidArea commented out, since it potentially
1081       conflicts with gdcmValEntry::voidArea.
1082     * src/gdcmValEntry.cxx: unmatching comment wiped out.
1083     * src/gdcmVR.[h|cxx]: added two predicates that partition the possible
1084       Value representation between StringRepresentable and BinaryRepresentable.
1085     * src/gdcmDocument.cxx: 
1086       - method ParseDES: proper indentation restored and usage of
1087         gdcmVR::IsVROfGdcmStringRepresentable wired in.
1088       - method LoadDocEntry: the fingerprint left in the SetValue() of
1089         unloaded entries (length > MaxSizeLoadEntry) had curiously been
1090         removed. Reverting to previous code segment with the proper
1091         dynamic_cast< gdcmValEntry* >.
1092         Note: this was (partially) breaking the python test suite
1093               (gdcmPython/testSuite.py) that made usage of the above
1094               fingerprint to check presence of "Pixel Data".
1095     * src/gdcmDocEntry.h: coding style.
1096     * gdcmPython/__init__.py: environement variable GDCM_DATA_PATH is
1097       now taken into account.
1098     * gdcmPython/gdcm.i: adaptation to the new internal representation
1099       of gdcm (exit gdcmParser, hello gdcmDocument).
1100     * gdcmPython/testSuite.py: quick and dirty fix for loading vtkgdcmPython
1101       on posix.
1102     * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: doesn't use the gdcmDocument::Print()
1103       anymore, but instead prints the loaded Python dictionary.
1104     * .... alas, the python testSuite is still broken.
1105
1106 2004-05-18 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1107     * gdcmPython/gdcm.i : remove useless lines concerning the gdcmGlobal
1108       gdcmGlob
1109     * gdcmPython/setup.py : replace the use of cvar.gdcmGlob to gdcmGlobal
1110     * src/gdcmUtil.h : export methods
1111
1112 2004-05-16  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1113     * Some more cleanup/enhancement in gdcmPython/CMakeLists.txt getting close
1114       to right behavior
1115     * Initial addition of automatic python testing
1116     * Initial addition of automatic image comparison
1117
1118 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1119     * src/gdcmCommon.h, gdcmDicomDir.cxx, gdcmFile.cxx, gdcmHeaderHelper.h,
1120       gdcmParser.cxx, gdcmParser.h : bug fix for the Microsoft .Net compilation
1121
1122 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1123      * src/gdcmFile.cxx, gdcmHeader.cxx : bug fix for the msvc compilation
1124      * Test/ShowDicom.cxx : bug fix for msvc compilation
1125      * vtk/vtkgdcmViewer.cxx : bug fix for msvc compilation
1126
1127 2004-05-04 Jean-Pierre Roux
1128      * ADD Taking into account the 'Dicom Sequences' leads up to introduce
1129        new concepts (and new classes) :
1130        a 'gdcmDocument' is composed of a set of Doc Entries, that are
1131         - elementary gdcmDocEntries (former gdcmHeaderEntries)
1132         - Sequence Doc Entries (gdcmSeqEntries)
1133        a Sequence is composed of Items.
1134        Each item is a set of Doc Entries (this is recursive)
1135        The non uniqueness of the 'Dicom tag' is due to this recursivity
1136        (never taken into account)
1137        Our unability to add a new 'entry' in the header
1138        at the proper location (neither in the H-Table (map or multimap),
1139        nor in the Chained List is also due to this recursivity.
1140        Don't try, right now, to use/modify/compile these new sources :
1141        nothing is finished.
1142        We just commit all the stuff, 'as is', in order not to loose it.
1143
1144 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1145      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix in the setting of file name
1146      
1147 2004-05-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1148      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading a list of files using the
1149        file prefix (SetFilePrefix)
1150
1151 2004-05-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1152      * Add a new test: ShowDicom, for now this is just the c++ version of
1153        checkRead.sh, later it will be able to compare the image read against a
1154        baseline.
1155      * Replace the DEBUG on the stack with a global entry in cmake interface:
1156        GDCM_DEBUG, so you can turn verbosity ON/OFF for debug statement.
1157
1158 2004-04-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1159      * Add an example subdir, with a real example on how to read + write a 
1160        dicom image
1161
1162 2004-04-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1163      * Doc/gdcmUML.xmi added raw UML class view (umbrello format)
1164      * Doc/CMakeLists.txt: the main page is now properly differentiated
1165        between the developper and user version.
1166      * Doc/doxygen.config.in: dropped search related obsolete flags
1167      * src/gdcmParser.h, gdcmHeader.h: doxygenation
1168
1169 2004-04-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1170      * DEVELOPPER: added some helpfull comments for compile/test/install
1171        when using cmake.
1172
1173 2004-04-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1174      * ENH: 1. Remove remp solution of gdcmTests.cxx+ gdcmMain directly in 
1175                src directory, now generated in the build dir.
1176             2. Tests as mentionned smarter
1177             3. Some clean up
1178             4. Add a new method in gdcmDict that return the PubDict by name 
1179           this is interesting for 3rd party lib like ITK, 
1180           where we could set the institution name / patient name...
1181
1182        * ENH: 1. Now the test suite is working for real
1183               2. All binaries are now output in the gdcm-bin directory 
1184                  (this was not true before)
1185
1186 2004-04-28  Jean-Pierre Roux
1187      * ENH add the provisional  gdcmHeader::SQDepthLevel to allow 
1188            SeQuence indented printing of Dicom Header.
1189      * ENH merge methods gdcmParser::Parse and gdcmParser::LoadHeaderEntries
1190            into the single gdcmParser::LoadHeaderEntries for efficiency purpose.
1191            Computation of SQDepthLevel is now part of gdcmHeader constructor
1192      * ENH add self defined param 'new' to PrintHeader to 'show' the SeQuence
1193            tree-like structure of a Dicom Header.
1194      * FIX Test code cleaning     
1195            
1196 2004-04-25  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1197      * ENH: Adding automatic testing
1198        1. Need a DartConfig.cmake to submit to public
1199        2. Add a test driver gdcmTest.cxx
1200        3. gdcmTestMain, an helper for the main test driver gdcmTest
1201        4. Files in Test don't have a main anymore, this becomes interesting 
1202           when we add more and more tests, thus dsw don't have to load 
1203           too many projects
1204      * ENH: Adding a GDCM_DATA_ROOT for testing
1205      * ENH: Remove redundancie about GDCM_DICT stuff, now we only need to modify
1206        one file instead of seven + some small cleanup
1207
1208 2004-04-22  Jean-Pierre Roux
1209      * ENH Minor changes to the Print() methods.
1210      * ADD gdcmParser::PrintEntryNiceSQ() to allow SQ-indented
1211            Header printing. Example given with :
1212            > PrintHeader fileName  2 new
1213           (SQ based tree-like structure still to be done for the Header ...)
1214            
1215 2004-04-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1216      * ENH: Some cosmetic clean up for compilation with -W -Wall -Werror
1217          1. I have added some unsigned where needed
1218          2. Some function parameter not used -> (void)
1219          3. In gdcmDicomDir.cxx, add GDCM_DICOMDIR_NONE case
1220          4. g++ don't like character '\' in comment
1221          5. #define jpeg_create_decompress  jCreaDecompress
1222                     this really need to be fixed
1223          6. virtualize destructor of gdcmObject ... leakage
1224          7. sscanf(g->first.c_str(),"%x",&gr_bid); 
1225                     this also really need to be fixed
1226          8. gdcm/src/jpeg/libijg8/CMakeLists.txt, 
1227                     remove compression file 
1228                     (as we only do decompression, right ?)     
1229      * ENH: Change malloc/calloc/free with c++ equivalent
1230
1231 2004-04-21  Jean-Pierre Roux
1232      * FIX gdcmHeaderHelper::GetXSpacing
1233            when a single value is found (bug ?), xpacing is now 
1234            defaulted to yspacing
1235            
1236 2004-04-19  Jean-Pierre Roux
1237      * ADD gdcmData/Wrist.pap (PAPYRUS 3.0 -single frame-) for checking purpose
1238      * ENH add parameters :
1239                bool  exception_on_error = false, 
1240                bool  enable_sequences   = false,
1241                bool  ignore_shadow      = false
1242            to the gdcmFile constructors to be full gdcmParser compliant
1243      * FIX vtk/vtkGdcmReader.cxx now uses  enable_sequences = true in gdcmFile
1244            to allow reading of PAPYRUS 3.0 files 
1245               
1246 2004-04-06  Jean-Pierre Roux
1247      * ADD gdcmData/E00001S03I0015.dcm for SQ checking purpose
1248      
1249 2004-04-02  Jean-Pierre Roux
1250      * ADD : Test/checksequence.sh, for a general recap on SQ pb
1251      * FIX : gdcmParser::WriteEntryTagVRLength emprovement of special treatement
1252              for Philips spurious Tag fffe|0000 while rewritting Dicom files
1253              
1254 2004-03-30  Jean-Pierre Roux
1255      * FIX gdcmParser::ReplaceOrCreateByNumber shouldn't seg fault any more 
1256          for ACR file, written out as DICOM files (hope so...)
1257
1258 2004-03-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1259      * src/gdcmParser.[cxx|h] and gdcmHeader.[cxx.h]: gdcmHeader::Write split
1260        in WriteEntryTagVRLength and WriteEntryValue. Those methods were
1261        moved to base class gdcmParser and only the specialisation is kept
1262        in gdcmHeader.
1263      * src/gdcmParser.[cxx|h]: ReplaceOrCreateByNumber(char*, guint16, guint16)
1264        trashed out (because ReplaceOrCreateByNumber(string, guint16, guint16)
1265        already does the job.
1266      * src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: WriteDicomDirEntries renamed to WriteEntries
1267        (to be consistent with gdcmParser::WriteEntries).
1268
1269 2004-03-30 Benoit Regrain
1270      * vtk/vtkGdcmReader.[h|cxx] : fix the read of 3 gdcmHeader when making an
1271        upate of the object's instance. It's passed to 2 in the unfavorable
1272        case : one in the ExecuteInformation, one in the ExecuteData
1273
1274 2004-03-29  Jean-Pierre Roux
1275      * ENH : Check on file type to be written moved
1276              from gdcmParser::WriteEntry to gdcmParser::WriteEntries
1277      * FIX : gdcmObject::ResetBoundaries now stops properly
1278              when end-of-list is reached
1279            : gdcmVersion modified (as Benoit Regrain asked)
1280
1281 2004-03-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1282      * src/gdcmParser.cxx: removal of all TAB character. Indentation fixed.
1283      * src/gdcmUtil.cxx: added forgotten iostream include.
1284      * src/gdcmCommon.h: FileType enum entry DICOMDIR removed (since
1285        equivalent to ExplicitVR in existing code).
1286
1287 2004-03-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1288      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmGlobal.[cxx|h]
1289        now contains all the gdcmGlobal related code.
1290      * minor coding style and doxygenation changes.
1291
1292 2004-03-26  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1293      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmDebug.[cxx|h]
1294        now contains all the Debug related code.
1295      * minor clean-up of includes in src/*.cxx
1296      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _cleanString C style function (replaced with
1297        CreateCleanString) removed.
1298      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _CreateCleanString renamed to CreateCleanString
1299      * Doc/DoxyMainPageUser.txt added.
1300      * Doc/Doc/DoxyfileUsers updated to version 1.3.4 of Doxygen.
1301      * src/gdcmCommon.h now defines getcwd for Win32 (moved away from
1302        src/gdcmDirList.cxx)
1303
1304 2004-03-24  Jean-Pierre Roux
1305      * FIX a lot of little surface modifications to be doxygen 1.3.6 compliant
1306
1307 2004-03-23  Jean-Pierre Roux
1308      * FIX Now gdcmFile::SwapZone doesn't seg faults any longer for
1309            big endian made volumes
1310      * ENH Now gdcmParser constructor and destructor are protected to forbid
1311            end user to instanciate class gdcmParser
1312           (only gdcmHeader and gdcmDicomDir are meaningfull)
1313
1314 2004-03-22 Benoit Regrain
1315      * FIX : src/gdcmDicomDir.cxx : make windows compilable
1316      * FIX : gdcmPython/gdcm.i : change gdcmStudy to gdcmDicomDirStudy and
1317              gdcmSerie to gdcmDicomDirSerie
1318
1319 2004-03-19  Jean-Pierre Roux
1320      * ENH Now the tree-like structure describing a DICOMDIR comming from
1321            an already existing DICOMDIR file is consistent with
1322            the home-made tree-like structure build ex-nihilo
1323            or build from the files held (recursively) in a Directory
1324            functions gdcmDicomDir::CheckBoundaries()
1325            gdcmObject::SetBoundaries() added
1326
1327 2004-03-17  Jean-Pierre Roux
1328      * REM (Eric Boix bug) : removal of meaningless
1329                              gdcmDicomDirImage::NewImage function.
1330      * FIX now file names and directory name are written properly in the
1331            DICOMDIR
1332      * FIX now gdcmDicomDir constructor may be call without any trick
1333            about the name
1334
1335 2004-03-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1336      * FIX (JPR bug) : src/gdcmDicomDirImage.cxx added missing definition
1337                        of gdcmDicomDirImage::NewImage as empty function.
1338
1339 2004-02-28  Jean-Pierre Roux
1340      * ENH add gdcmDicomDir:NewPatient
1341            add gdcmDicomDirPatient:NewStudy
1342            add gdcmDicomDirStudy:NewSerie
1343            add gdcmDicomDirSerie:NewImage
1344            to allow making gdcDicomDir object.
1345      * ADD PrintDicomDir executable that uses gdcmDicomDir tree-like structure
1346           (as opposite to the gdcmHeader chained list)
1347
1348 2004-02-11 Benoit Regrain
1349      * FIX : memory leaks and the set of ArgDelete methods in gdcmDicomDir
1350              when using from python
1351
1352 2004-02-10 Benoit Regrain
1353      * FIX : bug fix in the gdcmDirList for the recursivity in directories
1354      * FIX : in gdcmDicomDir when the directory is empty
1355      * ENH : add callback and methods to get the progression of dicomDir
1356              directory parsing
1357
1358 2004-02-06 Jean-Pierre Roux
1359      * ENH : - now gdcmDicomDir::CreateDicomDir() returns also the meta elements
1360              - GDCM_META added to gdcmDicomDirType
1361              - class gdcmMeta created
1362      * ENH : - A brief summary is now displayed at the beginning of
1363              'testDicomDir' to help disaster magnitude estimation
1364      * REM : Now useless Test/explDICOMDIR.cxx
1365
1366 2004-02-05 Benoit Regrain
1367      * ENH : add methods in gdcmObject to get the hash table or the list of
1368              header entries
1369      * FIX : wrapping python for ListPatient, ListStudy, ListSerie, ListImage
1370      * FIX : wrapping python for TagHeaderEntryHT
1371
1372 2004-02-04 Benoit Regrain
1373      * FIX : even length for some strings when writting the dicom dir
1374      * FIX : sort the images in the dicom dir
1375      * FIX : Bug fix for python use of dicom dir
1376      * ADD : a python demo
1377
1378 2004-02-04 Jean-Pierre Roux
1379      * FIX : Final solution (?) for icone embedded images
1380      * FIX : dicomVR.dic Overlay group is not *only* 6000, but 60xxx
1381              (see http://medical.nema.org/dicom/2003/03_06PU.PDF)
1382              add groups 6002, 6004, 6006, to allow 'clean' parsing of
1383              gdcmData/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1
1384      * ENH add gdcmData/checkWriteExplicit.sh gdcmData/checkWriteImplicit.sh
1385            to make full checking easier
1386         
1387 2004-02-04 Benoit Regrain
1388      * FIX : WriteEntries : coding style & logic in parameters
1389      * FIX : Set the elements to create the DicomDir in a dictionary file
1390
1391 2004-02-03 Benoit Regrain
1392      * gdcmDirList : to parse a hard drive directory in recursive (or not)
1393      * gdcmDicomDir : add the load of directory
1394      * Bug fix and print add-on
1395
1396 2004-02-03 Jean-Pierre Roux
1397      * ENH gdcmParser : allows "DICM" files, with NO group '0002'
1398      * FIX handling 'non string elements' unsecure area (LUT, overlays, etc)
1399      * FIX Dicts/dicomV3.dic : Add a few missing 'group length' Elements 
1400      * FIX gdcmParser.cxx : 'group length' elements are now considered 
1401            as integers, even for shadow groups, when file is Implicit VR
1402         
1403 2004-02-02 Jean-Pierre Roux
1404      * FIX : gdcmWrite : equal_range() for multimap doesn't return a 'second' 
1405              iterator on last
1406              of the last synonym :-(
1407      * FIX : gdcmWrite::WriteBase : method stops if Pixels not yet Read (except 
1408              for DICOMDIR ;-)
1409      * ENH gdcmData/checkWrite.sh :modif for full check of Explicit VR writting
1410      * FIX taking into account the possible 7fe0,0010 multiplicity        
1411      * FIX add GRPixel,NumPixel,countGrPixel (gdcmParser protected members)
1412            to allow removal of references to 7fe0,0010, to deal with
1413       ACR-NEMA images, when 0028,0200 is meaningfull
1414
1415 2004-01-31 Jean-Pierre Roux
1416      * FIX gdcmParser::WriteEntries : when a VR is tagged as 'Unknown'
1417            no longer writes 'Un' on disk
1418      * FIX SQ elements with actual length are now dealt with corectly
1419      * FIX gdcmFile::WriteBase make the difference, for color images, between
1420            the length (for Palette expanded images)
1421            and Raw Length (non expanded image + Palette)
1422      * FIX Dicts/dicomV3.dic : removal of 'CTX' (context dependant) VR
1423            (that broke Write). Replaced by UL.
1424            Aware user will reload the field if he 
1425            thinks it's necesssary
1426              
1427 2004-01-30 Jean-Pierre Roux
1428      * gdcmParser::CheckSwap() now defaults the filetype to ACR 
1429        when 'dirty Acr' is found, to be compliant with the new 
1430        IsReadable() methods.
1431        
1432      * gdcmHeaderHelper :add Pixel Type 'FD', for dealing with 'double' images.
1433       (no DOUBLE images in kosher DICOM, 
1434       but so usefull for people that miss them ;-)
1435       
1436      * add Test/testDicomDir.cxx, Test/makeDicomDir.cxx , Test/explDICOMDIR.cxx
1437        DICOMDIR related utilities (not checked as Windoze compliant)
1438
1439 2004-01-28 Jean-Pierre Roux
1440      * upgrade GdcmHeaderEntry Print Method for DICOMDIR
1441
1442 2004-01-27 Jean-Pierre Roux
1443      * gdcmParser constructor has a new boolean param,'ignore_shadow', 
1444              to allow skipping the shadow elements, to save memory space.
1445         The TRUE value for this param has to be used 
1446         with a FALSE value for the 'enable_sequence' param.
1447         ('public elements' may be embedded in 'shadow Sequences')
1448      * gdcmHeader methods now deal with 'embedded icones images' in the header
1449              (even when an 'icone image sequence' is announced by the 
1450         element (0x0088,0x0200), but there is NO icone at all ...
1451         
1452      * gdcmHeader sometimes Image Location value doesn't follow  
1453              the supposed processor endianity (see gdcmData/cr172241.dcm).
1454              Fixed
1455
1456      * gdcmHeader add the method
1457              IterHT  GetHeaderEntrySameNumber(grPixel,numPixel);
1458         to get *all* the Header Entries with the same tag.
1459         GetHeaderEntrySameName is probabely *useless* 
1460         (no meaning : Name is *not* an identifier within the Dictionnary)
1461
1462 2004-01-26 Benoit Regrain
1463      * Bug fix in the print of hexadecimal representations. Remove long fields 
1464        in the print and add a third level of print to print them
1465
1466 2004-01-23 Benoit Regrain
1467      * Bug fix on field having a VR = 'UI'. Assume that is a string field
1468      * Bug fix on test suite after remove the strip made on not string fields
1469      * Split the IsReadable method between gdcmParser which test that the file
1470        is dicom and gdcmHeader which test that it's an image file
1471
1472 2004-01-22 Benoit Regrain
1473      * DicomDir : clean code, add methods, set variables in protected or private
1474      * gdcmUtil : bug fix for the clean string method
1475
1476 2004-01-19 Benoit Regrain
1477      * Add the use of shadow dictionaries
1478      * bug fix and coding style
1479
1480 2004-01-19 Benoit Regrain
1481      * src/gdcmFile.cxx : bug fix concerning the close of file
1482      * src/gdcmParser.[h|cxx] : remove obvious Pub informations
1483      * Add the update of header entries using the shadow library
1484
1485 2004-01-19 Benoit Regrain
1486      * removal of file gdcmHeader2.cxx
1487      * split class gdcmHeader into gdcmParser and gdcmHeader, with gdcmHeader
1488        inheriting from gdcmParser. This split is to prepare the integration
1489        of dicom dir parsing
1490      * bug fix under python
1491
1492 2004-01-16 Jean-Pierre Roux
1493     * REM removal of class gdcmHeaderEntrySet
1494     * REM removal of files gdcmHeaderEntrySet.cxx, gdcmHeaderEntrySet.h
1495     * ADD add file gdcmHeader2.cxx 
1496     * ADD add method gdcmHeader::SetPrintLevel (for PrintHeader)
1497
1498 2004-01-15 Benoit Regrain
1499      * src/gdcmDicSet.[h|cxx] : add virtual entries to have a reference of
1500        entries created while parsing the header. Thus, they will be destroyed
1501        when the gdcmDictSet will be destroyed
1502      * src/gdcmHeader.cxx, gdcmHeaderEntrySet.cxx : uses virtual entries of
1503        gdcmDictSet
1504
1505 2004-01-15 Benoit Regrain
1506      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix : before, with python only, the program
1507        made a fatal error because of the memory release at the end of program.
1508        The problem was in vtkGdcmReader::ExecuteData where we were allocate
1509        some memory and vtk seems to have some problems with that.
1510      * src/gdcmHeaderEntrySet.cxx : bug fix for std lib and cout
1511
1512 2004-01-14 Benoit Regrain
1513      * src/gdcmHeaderEntry.[h|cxx] : gdcmElValue -> gdcmHeaderEntry
1514      * src/gdcmHeaderEntrySet.[h|cxx] : gdcmElValSet -> gdcmHeaderEntrySet
1515      * src/*.[h|cxx] : make changes due to class name changes
1516      * gdcmPython/demo/*.py : bug fix due to method names
1517
1518 2004-01-13 Benoit Regrain
1519      * src/*.[h|cxx] : coding style
1520      * vtk/*.[h|cxx] : coding style
1521
1522 2004-01-13 Benoit Regrain
1523      * gdcmPython/testSuite.py : test the readable flag of file for tests
1524      * src/gdcmDict.cxx, gdcmElValSet.cxx : bug fix under windows for prints.
1525        It's lied to the stl compilation by MSVC (windows, always windows...)
1526      * src/gdcmIdo.h, gdcmHeaderIdo.cxx : remove the Ido unused files
1527
1528 2004-01-12 Benoit Regrain
1529      * src/*.h : add comments
1530      * src/gdcmDictSet.h : set the method BuildDictPath in public
1531      * src/gdcmTS.cxx, gdcmVR.cxx : use now a dictionnary file other than to be
1532        directly setted in the source code
1533      * Dicts/dicomTS.dic, dicomVR.dic : 2 new dictionnary files loaded by
1534        gdcmTS and gdcmVR
1535
1536 2004-01-09 Benoit Regrain
1537      * gdcmPython/gdcmVersion.py : add a gdcmVERSION variable information
1538      * setup.py : use a reference to gdcmVERSION
1539
1540 2004-01-07 Benoit Regrain
1541      * Modification to compile with the distutils.
1542      * Bug fix in code
1543
1544 2003-12-10 Benoit Regrain
1545      * gdcmHeader is now aggregating gdcmFile, and not derived into. Thus, we
1546        can use a gdcmHeaderHelper to load datas
1547      * gdcmPython/testSuite.py : make the testSuite compliant with modifications
1548        made in the source code
1549
1550 2003-12-10 Benoit Regrain
1551      * Update Windows projects and .cvsignore files
1552
1553 2003-11-12 Jean-Pierre Roux
1554      * ENH gdcmHeader constructor has one more parameter (default value : false)
1555            that allows the user to 'go inside' the SeQuences only
1556            if he wants to.
1557            gdcmElValSet:Print takes it into account
1558
1559 2003-11-12  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1560      * ENH: Update gdcmPython/CMakeLists
1561      * FIX: (gdcmHeaderHelper) GetRescale and GetSlope
1562      * FIX: (gdcmElValSet) char 'tag' was overiding private members (VC++)
1563
1564 2003-11-10 Jean-Pierre Roux
1565       * FIX : gdcmHeader::LoadElements is now based
1566              on the ListTag listElem member,
1567              not longer on the TagElValueHT tagHt member
1568       * ENH : PrintPubElVal shows (temporarily) both results,
1569              with the tagHt member and the listElem member.
1570              (it's easier to 'see' the problems when using Printheader)
1571
1572       * FIX : old private member LgrElem is now splitted into
1573              ReadLength   : Length actually found on disk (updated only
1574                             if bug fixing is necessary), for internal
1575                             use only
1576              UsableLength : Updated by FixFoundLength, to fix a bug
1577                             or to allow Parser going on.
1578              Will allow to re-write a kosher header when a SeQuence
1579              with a length (not 0000) is found
1580       Warning : gdcmFile::Write still uses the TagHt (not ListElem)
1581                 because gdcmElValSet::Add does not update ListElem
1582                 (to be written)
1583
1584 2003-11-07 Jean-Pierre Roux
1585      * FIX misstyping in Transfert Syntax name table
1586      * ENH gdcmHeader::FixFoundLength now allow to 'go inside' tge SeQuences
1587           when they have an actual length (not 0000 nor FFFFF)
1588      (Nobody should care of it, but DICOMDIR explorers)
1589
1590 2003-11-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1591      * ENH: vtkgdcmViewer now works with LUT dicom (OT-PAL-face ...)
1592
1593 2003-11-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1594      * ENH: vtkGdcmReader now supports LUT !
1595           (vtkgdcmViewer for now is not able to use them though)
1596
1597 2003-11-05 Jean-Pierre Roux
1598      * in testSuite.py : new files names for checking the package
1599      * FIX : Forgot to commit gdcmFile::GetImageDataSizeRaw();
1600              that returns the pixel area size to the *aware* (vtk) user
1601              that DOESN'T want to turn the PALETTE COLOR image into an RGB image
1602
1603 2003-11-05 Benoit Regrain
1604      * in testSuite.py : Modify the rules for checking the paths
1605                        : Explicit error messages
1606      * in __init__.py  : Related modif
1607
1608 2003-11-03 Jean-Pierre Roux
1609      * add gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponentsRaw()
1610            to be used by aware (vtk) users that want to manage
1611            LUT (and no to turn the PALETTE image into an RGB pixels one)
1612      * GetPixelType now returns 8U for 24 Bits images
1613                     (vtkGdcmReader compliant)           
1614       
1615 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1616      * Removal of *all* gdcmData images and add them again
1617        in order to loose the 'history' of un-anonymised images
1618        
1619 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1620      * RMV : removal of useless jBitsInJsample.h 
1621            for both 8 and 12 Bits JPEG Lossy Libraries
1622
1623 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1624      * ENH : Add the functions gdcmFile::GetImageDataRaw 
1625                                gdcmFile::GetImageDataIntoVectorRaw
1626              that act as GetImageData and GetImageDataIntoVector
1627              except the making of an RGB Plane from Gray Plane + LUT
1628              Intended to aware (vtk) users who know how to manage
1629              such an image :
1630              After gdcmHeader :
1631               GetLUTRGBA return a R,G,B,A LUT if any
1632               lgrTotaleRaw gives the 'Raw' length
1633               GetImageDataRaw returns the gray Plane
1634      * FIX : no more dirty trick for 'Segmented xxx Palette Color Lookup' images
1635              (They stay Grey, just like with other Dicom viewers :-(
1636
1637 2003-10-30 Jean-Pierre Roux
1638      * FIX : a VC++ intended syntax modif broke the 12/12 Bytes expanding
1639              
1640 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1641      * ENH: Can be used like this '$vtkgdcmViewer *.dcm' with *.dcm 
1642            being coherents dicom files.
1643      
1644 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1645      * FIX: DOH ! Forgot about windo$e users, they couldn't read lossless jpeg,
1646            from medcon lib !
1647      * ENH: Turn it into DOS file type to match libgdcmijpeg8.dsp file type 
1648      * ENH: Two steps is necessary to please VC++ compiler...
1649      * FIX: DOH ! libgdcmijpg8 -> libgdcmljpeg
1650      * ENH: Add include dir to medcon lib
1651      * FIX: only one function is being exported for now ! 
1652            You should use GLOBAL(return type) see ljpg/jpeg.h for more info
1653             
1654 2003-10-29 Jean-Pierre Roux
1655       * adding  gdcmHeader::GetLUTRGBA
1656         returns a 4 * 256 Bytes Reg/Green/Blue/Alpha vtk compliant LUT
1657           --> Mathieu, the modif u're waiting for is not yet committed
1658       * removal of now useless GetLUTRed,GetLUTGreen,GetLUTBlue,GetLUTRGB
1659
1660 2003-10-27 Jean-Pierre Roux
1661       * adding some xmedcon breaker files (courtesy of Loïc Boussel)
1662         00191113.dcm DermaColorLossLess.dcm
1663         MxTwinLossLess.dcm RadBWLossLess.dcm
1664       * ENH: For version prior to vtkImageViewer2 -r 1.19
1665       * FIX: avoid pb with xmedcon-breaker CT McTwin Elscint images
1666
1667 2003-10-27  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1668       * Removal of ido stuff in CMakeLists.txt
1669                                                
1670 2003-10-24  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1671       * ENH: vtkGdcmReader.cxx can now read multiframe dicom
1672       * FIX: remove a call to ->Modified ... see comments
1673       * FIX: vtkgdcmViewer.cxx was writting ASCII file...this is so slooooow !
1674       
1675 2003-10-23  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1676       * FIX: Problem with path for libvtkgdcmPython
1677       * ENH: Try adding a search script for python site-package
1678       * RMV: Remove some file from medcon lib that are not necessary
1679       * FIX: gdcm/Makefile.am fix for generating ljpg medcon
1680       * ENH: CMakeLists.txt now generate 'pygdcm.so' instead of 'libpygdcm.so'
1681       * FIX: More pragma disable fro VC++, 
1682              I don't think I break something as it is also disable in VTK/ITK.
1683         But it fasten debug compilation time.
1684             
1685 2003-10-23 Jean-Pierre Roux
1686       * gdcm now deals with 16 Bits Run Length Encoded images
1687         (they are compressed as 2 planes images, 
1688          one for the high Bytes, the other for low Bytes)
1689
1690 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
1691       * Now CheckRead takes into account :
1692          - the bugged 'Leonardo' Siemens images
1693          - the XA images, sent thru the burning VPRO station
1694       * add I9000001.dcm, a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
1695        (breaks DicomWorks)
1696
1697 2003-10-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1698       * FIX: When copying a Makefile.am to CMakeLists.txt 
1699              one should remove the '\'
1700         
1701 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
1702       * in gdcmData adding a bugged 'Leonardo' Siemens image 
1703         (wrong lengths in header)
1704         OK with gdcm, KO with the other viewers :-)
1705       * add a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
1706         (breaks DicomWorks)
1707
1708 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1709       * in gdcmData add the checkvtkgdcmViewer.sh shell script 
1710         for a brutal checking of vtkgdcmViewer compliance
1711
1712 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1713       * add the files for 'xmedcon' Jpeg Lossless library
1714       * call of 'xmedcom' Jpeg Lossles libray (instead of the old LibIDO one)
1715
1716 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1717       * 'Compacted Files' (12 Bits Allocate, 12 Bits Stored) are now dealt with
1718      
1719 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1720       * garbage Siemens 'Leonardo' images dealt with
1721         (the patch is easy to remove)
1722       * cosmetic changes to avoid warnings
1723       
1724 2003-10-20  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1725       * ENH: vtkgdcmViewer now autoscale color/window level on start-up, 
1726         no need to press 'r' now.
1727    
1728 2003-10-20  Jean-Pierre Roux
1729       * upgrade of checkRead.sh checkWrite.sh according
1730         to new Jpeg Lossless decompressor
1731       * add US.3405.1.dcm, a genuine RGB medical file ...
1732       * add gdcm-ACR-LibIDO.acr, unnormalized Rectangular LibIDO format image
1733       * add CLIP0001-Sequoia-U11.dcm, US 'Clip', from SEQUOIA machine,
1734                                                   UNIT 11, Hop Cardio              
1735 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
1736       * general anonymisation in gdcmData
1737       * adding the 'color files' from
1738         http://www.leadtools.com/SDK/Medical/DICOM/ltdc19.htm
1739       * adding some well knowed bugged-header images
1740       * adding checkRead.sk, checkReadColor.sh, checkWrite.sh,
1741         waiting for their inclusion in Python testsuite
1742
1743 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
1744     * gdcmHeader::gdcmHeader(const char *InFilename, bool exception_on_error)
1745       no longer seg faults when file is not found
1746
1747 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
1748      * Emprovement of reading for Dicom encapsulated Jpeg LossLess 
1749        MultiFrame images
1750
1751 2003-10-14  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1752      * TODO: *.in file to genereate a UseGDCM later
1753
1754 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
1755      * Some supposed-to-be Dicom Images have no preamble.
1756         OpenFile takes it into account
1757      * Jpeg LossLess 24 Bits images doesn't break any longer gdcm
1758      * Missing elements added in dicomV3.dic
1759       (just to be affraid : have a look at
1760        ftp://medical.nema.org/medical/dicom/2003/01v03dif/01v03_06.pdf
1761        and do it again next year ;->
1762
1763 2003-10-13  Jean-Pierre Roux
1764      * According to PS 3.3-2003 C.11.1.1.2 p 619, when each pixel of 
1765        a PALETTE COLOR is stored on 2 Bytes, theese 2 Bytes must be equal.
1766        But there are NOT. It's fixed !
1767        
1768 2003-10-13  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1769      * FIX: "jpeglib.h" was not found on VC++
1770      * FIX: vtkgdcm was not being installed 
1771          
1772 2003-10-10  Jean-Pierre Roux
1773      * ENH : OpenFile closes the file if it *really* doesn't look like
1774              an ACR-NEMA / DICOM one.
1775      * FIX : testWrite no longer writes an empty file if the source file     
1776              is not gdcm Readable
1777      * ENH : One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" 
1778              is now decoded.
1779         
1780 2003-10-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1781      * FIX: CMake generate now documentation
1782      * ENH: out of source doc build !
1783      * ENH: Generate both user and dev documentation
1784      * ENH: Should work on windows too
1785      * ENH: Only one doxygen config.in file is needed 
1786      * FIX: make install should be ok now on Ã¹nix plateform
1787      * FIX: PATH to dictionary was wrong (missing /)
1788      * ENH: OpenFile, return true if the file looks like an ACR or DICOM file 
1789                      
1790 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1791      * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
1792      * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
1793      * added a gdcmViewer to vtk test, use mouse to control 
1794         window level & window width
1795
1796 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1797      * CMake-ification of gdcm, we have now two build system
1798      * FIX: on cygwin Wsock32 doesn't exist
1799      * FIX: force jpeg dir to the local one (gdcm/src/jpeg)
1800      
1801 2003-10-06  Emanuel Ollart
1802      * FIX : compilation process wad broken.
1803              Changed gdcmViewer_sources to vtkgdcmViewer_sources
1804         
1805 2003-10-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1806      * change gdcmViewer -> vtkgdcmViewer
1807      * change GetXSpacing and GetYSpacing "%f\\%" is parsed backward
1808      
1809 2003-10-06  Jean-Pierre Roux
1810      * FIX :A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
1811            ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
1812                  : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
1813       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
1814
1815 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1816       * Odd length strings are padded with '\0' (not with spaces, 
1817         to remain compliant with already defined strings, 
1818         like Transfert Syntax UID and others)
1819
1820 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1821       * ENH :gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
1822              to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
1823         
1824 2003-10-03  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1825       * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
1826       * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
1827
1828 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1829       * A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
1830         ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
1831               : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
1832       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
1833
1834 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1835       * One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" is now decoded.
1836
1837 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1838       * gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
1839         to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
1840
1841 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1842       * gdcmFile::GetImageDataIntoVector now
1843          - deals with MultiFrames MultiFragments Run Length Encoded files
1844          - deals with YcBcR (YBR_FULL) files
1845          - deals with YBR_YBR_FULL_422 files (they work as RBG files ?!?)
1846           WARNING : nothing was checked for YBR_PARTIAL_422, YBR_ICT, 
1847                                             YBR_RCT files.
1848           (no sample found :-(
1849
1850 2003-10-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1851       * src/*.cxx removed pragma thingies to src/gdcmCommon.h
1852         Two reasons: - clear things
1853                      - third parties acces gdcm through header files, so won't
1854                        suffer anymore VC++ complains
1855
1856 2003-09-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1857       * add argv[1] in testvtkGdcmReader.cxx
1858       * removed leaks
1859
1860 2003-09-24 Jean-Pierre Roux
1861       * The lines are now eigthy characters long.for 
1862         gdcmHeader.cxx gdcmHeaderHelper.cxx gdcmParse.cxx 
1863
1864 2003-09-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1865       * src/gdcmUtil.[cxx|h] : change the _CreateCleanString return value from
1866         char* to std::string. Thus, the use of strdup becomes useless. (see
1867         previous commis of Malaterre)
1868       * src/gdcmElValSet.cxx : reuse commented call to _CreateCleanString like
1869         before the last Malaterre's commit.
1870
1871 2003-09-19  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1872       * This commit should fix the Debug building under VC++, the problem
1873         was mainly a mixture of debug and release lib being loaded at startup.
1874       * I also remove a depency to a specific C function: strdup. Because I had
1875         to force the link to msvcrtd (whereas strdup is in libc).
1876
1877 2003-09-16  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1878       * "gdcm::Unfound" string changed to a constant variable (GDCM_UNFOUND)
1879         located in the gdcmCommon.h file. All use of reference of tha has been
1880         changed to now use the variable GDCM_UNFOUND.
1881
1882 2003-09-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1883       * Cosmetic changes:
1884         - gdcmPython/testSuite.py adapted to the JPR updated Dicts/dicomV3.dic
1885           Dicom dictionary. The test suite can now be run again. Note:
1886           I'm note very happy with the " (RET)" changes. I believe this
1887           RETAINED comment should be dropped when parsing the dictionary.
1888         - PACKAGER corrected
1889         - DEVELOPPER added.
1890         - AUTHORS updated and now in alphabetical order
1891       * Makefile.am now exports gdcm.dsw for Windoze users.
1892
1893 2003-09-11  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1894       * cygwin complains about missing std:: in subdir Test/
1895
1896 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1897       * remove some methods that are now in gdcmHeaderHelper
1898
1899 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1900       * vtkGdcmReader set spacing and origin correctly
1901
1902 2003-09-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1903       * Fix a few delete/delete[] mismatch
1904
1905 2003-09-08  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1906       * src/gdcmHeaderHelper.[h cxx]: added new class that provide an
1907         interpretation to data given by gdcmHeader. For instance there are
1908         heuristics to get informations (look at different places).
1909       * it also include a specific class: gdcmSerieHeaderHelper devoted to
1910         sorting DICOM images based on different strategies.
1911       * modified Makefiles accordingly.
1912
1913 2003-09-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1914       * src/*.cxx : added pragma disable 4786/4251 to get rid of ~4300 warning
1915         when building in debug mode
1916       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : change /MT -> /MD and /MTd -> /MDd to match
1917         src/win32/gdcmdll.dsp
1918       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : added /nodefaultlib "mscvrt" for debug mode
1919
1920 2003-08-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1921       * Corrected a leak in vtkGdcmREader.cxx, the pSource was find thanks
1922             to valgrind.
1923
1924 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1925       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp was not dos format
1926       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp : 
1927                   libgdcmijpeg12_EXPORTS -> LIBGDCMIJPEG12_EXPORTS
1928       * src/win32/gdcmdll.dsp: + /I "..\jpeg\libijg12"
1929
1930 2003-07-29 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1931       * src/gdcmHeader.h : add std:: prefix for stl elements... like others in
1932         the file
1933       * src/gdcmFile.cxx : bug fix in affectation type
1934       * src/jpeg/libijpeg12/jmorecfg12.h : export for windows modified... like
1935         in src/jpeg/libijpeg8/jmorecfg8.h (JPR : copy/paste exists !!!)
1936       * Modifs of MVSC projects to compile them. Not concerning 2 identic
1937         symbols... future problem ?
1938
1939 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1940       * src/win32/libgdcmijpeg12.dsp was missing
1941       * modified gdcm.dsw accordingly
1942
1943 2003-07-28  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1944       * src/gdcmHeader.cxx : misplaced return 0.; for ACR/NEMA
1945
1946 2003-07-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1947       * src/jpeg/libijg12/.cvsignore, jconfig.* : ommited files while last
1948         commit of JPR (before his hollidays to facilitate our work).
1949       * setup.py : bug fix in code. Modifications made while the last commit
1950         of JPR. The code hasn't been tested before the commit... it's so
1951         useless to make that (for best programmer that is JPR) !!!
1952
1953 2003-07-08  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1954       * tagged the current version as Version0_3 (i.e. version 0.3)
1955
1956 2003-07-08  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1957       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx : remove a symbol that is unused
1958       * src/jpeg/libijg8/jmorecfg.h : adding export symbol for windows
1959       * *.dsp : modifications to use new libgdcmijpeg8 library
1960       * setup.py : bug fix on VTKPATH variable
1961       * PACKAGER : adding all concerning windows
1962
1963 2003-07-07  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1964       * src/gdcmElValSet.cxx, gdcmFile.cxx: JPR bug fix, removal of
1965         garbage debug code.
1966       * TODO, vtk/vtkGdcmReader.cxx: upcoming fixes comments.
1967       * gdcmPython/testSuite.py: JPR bug fix, brutal erasement of
1968         test suite reported error.
1969       * PACKAGER file added (describes what a packager must do when
1970         packaging a new release).
1971       * MANIFEST.in, now declares jconfig.linux and jconfig.vc
1972       * configure.in: upgraded version number to 0.3.0
1973       * fixing build of rpm (through rpm -ta):
1974         - Doc/Makefile.am exports proper doxygen files
1975         - src/jpeg/libijg8/Makefile.am exports the include files.
1976
1977 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1978       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading only 1 file.
1979       * src/gdcmHeader.h : formatting code
1980
1981 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1982       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
1983         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
1984         is made in an internal list to prevent this problem.
1985         Bug fix when output is empty.
1986         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
1987         correction.
1988       * vtk/vtkGdcmReader.h : adding comments for InternalFileNaleList variable
1989
1990 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1991       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
1992       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
1993         files. Added method to remove all files on the input
1994         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
1995         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
1996
1997 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1998       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
1999         when using make instal.
2000       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
2001         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
2002
2003 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2004       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
2005       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
2006
2007 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2008       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
2009         linux and WINDOWS !
2010       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
2011       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
2012
2013 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2014       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
2015         addon of the jpeg library)
2016       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
2017       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
2018       * INSTALL now points to web documentation
2019
2020 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2021       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
2022         gdcmUtil.h anymore.
2023       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
2024         clean target.
2025       * src/gdcm*.[cxx|h] :
2026         - to allow compilation with gcc 3.x
2027           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
2028           -- small fixes on exceptions.
2029           Note: linking not tested !
2030         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
2031           building stage.
2032       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
2033         dependent convertion).
2034
2035 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2036       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
2037         Changelog):
2038         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
2039         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
2040           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
2041         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
2042
2043 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2044       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to
2045         compile
2046       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
2047         (FileName -> Filename)
2048
2049 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2050       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
2051         - UpdateProgress method should now be effective
2052         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
2053           to volumes),
2054         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
2055           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
2056           accelerating things).
2057         - when building a stack of images/volumes, files which are not
2058           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
2059           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
2060           in the stack (for the caller to notice the problem).
2061
2062 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2063       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
2064
2065 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2066       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts
2067         between standard library (std) and vtk library (problems are found
2068         under Windows... thanks Windows !)
2069
2070 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2071       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
2072         debug stage).
2073       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
2074
2075 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2076       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
2077
2078 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2079       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
2080         called with different flags than the default ones (with automake).
2081         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
2082            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
2083         and went for warning fixes:
2084         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
2085           up from unused variables.
2086         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
2087       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
2088
2089 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2090       * gdcmPython/gdcm.i:
2091         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
2092           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
2093           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
2094         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
2095           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
2096           exported to Python a as cvar.
2097       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
2098         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
2099         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
2100         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
2101         C++ static methods).
2102       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
2103         with the above changes.
2104
2105 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2106       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
2107
2108 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2109       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
2110         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
2111         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
2112          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
2113          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
2114            a wrapper
2115          - Wrapper interface which wrap sources
2116         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
2117         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
2118       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
2119         files for compilation
2120
2121 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
2122       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
2123         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
2124         - vtk/Makefile.am now builds a library
2125         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
2126           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
2127           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
2128           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
2129           import library.
2130         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
2131           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
2132           + vtk/vtkGdcmReader.so and
2133           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
2134           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
2135         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
2136           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
2137         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
2138           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
2139       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
2140       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
2141         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
2142         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
2143         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
2144         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
2145         collision of various stl members (principally cout...).
2146       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
2147         file.
2148       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
2149         comply with above changes)
2150
2151 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2152       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
2153       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
2154         vtk data structure (an image Flip was required).
2155       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
2156       * cosmetic changes in documentation.
2157
2158 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2159       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
2160         unexisting file is given as argument.
2161       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
2162         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
2163         containing those images is now available at
2164           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
2165         with the name gdcmData.
2166         All the python scripts (including the package initialisation file
2167         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
2168         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
2169
2170 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2171       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
2172         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
2173         demo of the usage of this class.
2174         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
2175         at configure (or autogen.sh) stage.
2176
2177 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2178       * More memory link related corrections and documentation fixes.
2179         Notes on valgrind:
2180           - maximum info is obtained with a command of the form:
2181             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
2182                      --show-reachable=yes PrintHeader
2183           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
2184             allocation scheme through the usage of map and list. It looks
2185             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
2186             (in fact further invocation to the STL would recollect the
2187              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
2188       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
2189         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
2190         Note: some images don't seem to work e.g.
2191             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
2192       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
2193         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
2194         make gdcm more thread friendly.
2195
2196 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2197       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
2198           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
2199         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
2200           gdcmHeader::_dicom_vr.
2201         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
2202         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
2203           VRHT*.
2204         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
2205
2206 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2207       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
2208         make install stage.
2209
2210 2003-04-9 JPR
2211       * UpdateGroupLength replaced by new one
2212
2213 2003-04-7 JPR
2214       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
2215         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
2216
2217 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2218       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
2219       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
2220       * src:
2221         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
2222         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
2223           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
2224         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
2225           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
2226           carried the same semantics.
2227           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
2228         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
2229           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
2230         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
2231       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
2232       * gdcmGetXSize added
2233       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
2234       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
2235
2236 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2237       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
2238         (to avoid double call by end user).
2239       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
2240         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
2241
2242 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2243       * gdcm/Doc many doxygen changes:
2244         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
2245           the html.users end users oriented documentation and
2246           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
2247           oriented documentation.
2248         - README changed accordingly
2249         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
2250         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
2251           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
2252         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
2253           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying
2254           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
2255       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
2256         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
2257       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
2258         ill-formed documentation sections.
2259       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
2260
2261 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2262       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
2263       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
2264         un*ces with sh-utils test utility.
2265       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
2266       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
2267       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
2268       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
2269       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
2270
2271 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2272       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
2273       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
2274
2275 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2276       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
2277       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
2278       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
2279       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
2280         compilation work.
2281       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
2282       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
2283
2284 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2285       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
2286         hence the user doesn't need this explicit call.
2287         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
2288           i.e. LoadElements() call removed.
2289       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
2290         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
2291       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
2292         for adding user defined new tags.
2293         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
2294         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
2295           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
2296
2297 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
2298       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
2299         Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am,
2300         src/Makefile.am : the project should properly compile and install
2301         with the autotools, included the python wrappers part.
2302       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
2303
2304 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2305       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
2306
2307 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2308       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
2309         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
2310         for usage).
2311       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
2312         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
2313         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
2314       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
2315         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
2316
2317 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2318       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
2319         in InstallMode or PreInstallMode but with an environement given
2320         value of GDCM_DICT_PATH.
2321       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
2322
2323 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2324       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
2325       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
2326       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
2327         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
2328         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
2329
2330 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2331       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
2332         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
2333         gdcmHeader.h
2334       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
2335         (as opposed to gdcm.h)
2336       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
2337       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
2338         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
2339       * autogen.sh removed history related references to crea package.
2340
2341 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2342       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
2343         bug.
2344
2345 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2346       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
2347         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
2348         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
2349         of hidding away the python related distutils specific files
2350         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
2351         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
2352         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
2353         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
2354
2355 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2356       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
2357       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
2358         among the list of sources.
2359
2360 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2361       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
2362       * modifications in MSVC projects
2363
2364 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2365       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
2366         looks like we can move back to original usage of exception within
2367         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
2368         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
2369       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
2370         README file for usage added.
2371       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
2372         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
2373         testing the proper parsing of a Dicom related file.
2374         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
2375       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
2376       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
2377         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
2378           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
2379           Dicom public dictionnary were not accessible without an
2380           instance of class gdcmHeader.
2381         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
2382           require no instances at all to be invocated.
2383         - within gdcmDictSet this change required to change some method
2384           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
2385           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
2386       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
2387         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
2388       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
2389         the above to be effective.
2390       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
2391         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
2392       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
2393         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
2394         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
2395         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
2396         (for python dectection).
2397       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
2398         now avoids publishing the empty entries.
2399
2400 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2401       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
2402         ExtraPath reused :-P
2403       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
2404
2405 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2406       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
2407       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
2408       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
2409         and links
2410
2411 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2412       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
2413         method. Doxygenation.
2414       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
2415
2416 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2417       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
2418         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
2419         when using "python setup.py install".
2420       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
2421         reexports the working classes.
2422       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
2423         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
2424         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
2425         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
2426         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
2427         subdir (see the README file). This problem probably due to
2428         an combination of g++ and dynamic loading.
2429       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
2430
2431 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2432       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
2433         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
2434         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
2435         again in a python subdir, but the package itself is now in
2436         python/gdcmPython.
2437       * setup.py was cleaned up:
2438         - pythonIncludePath removed
2439         - python setup.py bdist target is now functional.
2440       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
2441         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
2442         accordingly.
2443
2444 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2445       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
2446       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
2447         distutils installer is operational.
2448       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
2449           shadow classes (from gdcm.py).
2450         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
2451           instead of gdcmPython/demo/load.py.
2452         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
2453
2454 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2455       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
2456         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
2457         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
2458         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
2459         dictionary.
2460         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
2461           are now in the "???" group.
2462         - python/gdcm.i changed accordingly,
2463         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
2464           of the above new functionalities in Python.
2465
2466 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2467       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
2468         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
2469           were definitively removed.
2470         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
2471       * src/gdcmElValSet.cxx:
2472         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
2473         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
2474         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
2475         - Added GetElementByName(string).
2476       * src/gdcmHeader.cxx: added
2477         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
2478         - GetPubElValRepByName(string)
2479         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
2480         - GetShaElValRepByName(string)
2481         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
2482         - GetShaElValRepByName(string)
2483         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
2484         - GetElValRepByName(string)
2485         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
2486         - GetElValRepByName(string)
2487       * Doc/requirements.txt added.
2488
2489 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2490       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
2491       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
2492         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
2493         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
2494         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
2495       * python/testSuite.py changed accordingly.
2496
2497 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
2498       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
2499         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
2500              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
2501               cannot be exported. [...]
2502               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
2503               be exported. [...]
2504               This is caused by a designed limitation that once a template
2505               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
2506               exported."
2507         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
2508         limitation" of VC++ is a pitfall.
2509         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
2510         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
2511         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
2512         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
2513         library.
2514         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
2515       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
2516          dll under windows !!!!)
2517       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
2518       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
2519         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
2520       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
2521         (one) of image(s).
2522       * removed glib references
2523       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
2524
2525 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2526       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
2527         that only displays required tags and testAll.py that parses all
2528         the files of the testsuite without using unittest.
2529       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
2530       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
2531       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
2532         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
2533
2534 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2535       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
2536         values, but limits itself to values which are below a user specified
2537         size (by default 1024 bytes).
2538       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
2539         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
2540         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
2541         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
2542       * python/testSuite.py
2543         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
2544         - two new examples added.
2545       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
2546
2547 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2548       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
2549         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
2550       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
2551       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
2552       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
2553
2554 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2555       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
2556         the vr was also RET.
2557       * python/testSuite.py more tests added.
2558
2559 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2560       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
2561       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
2562       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
2563         7.18 Integer types (see stdint.h)
2564         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
2565       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
2566         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
2567         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
2568         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
2569         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
2570         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
2571         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
2572         The rest of the changes we the necessary adaptations.
2573
2574 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2575       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
2576         VR files.
2577       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
2578
2579 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2580       * Adaptation for porting to VC++:
2581         - src/gdcm.h
2582           o forced to use std namespace (for string to be known)
2583           o all class use __declspec export style on WIN32
2584         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
2585           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
2586       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
2587         variable GDCM_DICT_PATH.
2588       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
2589
2590 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2591       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
2592         to native Python dictionary.
2593       * python/demo/test.py:
2594         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
2595         - takes an optional filename argument (the file to parse).
2596       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
2597         PubElVals hashing table.
2598       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
2599
2600 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2601       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
2602         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
2603       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
2604       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
2605       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
2606         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
2607       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
2608
2609 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2610       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
2611         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
2612         that we can import de shadow classes without errors].
2613
2614 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2615       * hashtest.cxx removed (since allready in Test)
2616       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
2617       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
2618       * src/Makefile prepared for python wrapping
2619
2620 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2621       * src/gdcmHeader.cxx :
2622         - Parsing of header is now separated from loading of element values
2623           (see gdcmHeader::LoadElements).
2624         - general clean up of hopefully all file access (creation of
2625           ReadInt16 and ReadInt32)
2626
2627 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2628       * src/gdcmHeader.cxx :
2629         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
2630           method.
2631         - SetLgrElem renamed to SetLength
2632         - GetLgrElem renamed to GetLength
2633         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
2634       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
2635       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
2636         due to IdoDude was cleaned out.
2637
2638 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2639       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
2640         concentrates on finding the value representation (when it exists).
2641         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
2642         returning the unecessary skL (skipped length).
2643         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
2644         it was redundant with the File position internals (by using
2645         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
2646         jajun.
2647       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
2648         on the libido specificities which are handled through class
2649         inheritance.
2650       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
2651         added.
2652
2653 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2654       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
2655         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
2656
2657 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2658       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
2659
2660 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2661       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
2662         and _IdDcmSWAP_LONG.
2663
2664 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2665       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
2666         May 23 2002. Needless to say we are running late...
2667