]> Creatis software - gdcm.git/blob - ChangeLog
ENH: Improve string manipulation. I now inforce the notion of 'DicomString'
[gdcm.git] / ChangeLog
1 2004-11-05 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
2   * Improve string manipulation. I now inforce the notion of 'DicomString'
3     A DicomString can contain as many \0 as they want
4     and it is *always* of even length.
5     We only support odd length for very rare case. 
6     And in the near future this should be removed.
7
8 2004-11-03 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
9   * /binary_write/ gdcm source. Now even on big endian we are writting
10     little endian. This should -heopfully- fix some tests
11
12 2004-11-03 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
13   * Now the dictionary is compiled into gdcm lib. This is a default 
14     behavior, thus any dic file specified is picked before failback to 
15     the one comiled into lib
16
17 2004-10-27 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
18   * Change internals for gdcmDict. Don't use any 'new' any more.
19     This should definitely solve any leak problem, and we should be
20     as fast as before, as long as don't modify too much the dictionary.
21
22 2004-10-25 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
23   * STYLE: ivars should start with a capital letter. 
24   * Accessors should be const to avoid people starting modifying stuff (since this is a ref). 
25   * remove 'virtual' as Style specify subclasses shouldn't reuse the keyword
26   
27 2004-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
28   * Doc/Dicom2004_Part5.pdf added (thanks to JPR).
29   * Dicts/dicomTS2004.dic, dicomV3VM2004.dic, groupNameAbbreviations2004.dic
30     new 2004 dictionaries added (thanks to JPR).
31   * FIX dashboard warning RLEFrame::NumberFragments is now of type unsigned int
32   * CLEANUP_ROUND (15) for gdcmPixelConvert
33     - RLEFrame::NumberFragments is now of type unsigned int
34     - gdcmFile::GetImageData(), GetImageDataIntoVector(), GetImageDataRaw()
35       are now all based on PixelConverter. ::GetImageDataIntoVectorRaw()
36       no longer exists.
37
38 2004-10-21 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
39   * Initial work in gathering all transfer syntax accessors. clearly 
40    IsDecompressed/IsJPEG2000/IsJPEGLossless/IsRLELossless shouldn't be all 
41    ivars, but only one transfersyntax (class) ivar with equivalent method on 
42    the class.
43   
44 2004-10-21 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
45   * Removed all FILE* ref and replace by ifstream/ofstream. For now I use a temp 
46     solution with the two files jdatadst.cxx and jdatasrc.cxx, this need to be 
47     discussed (plus I didn't like having a 2000 lines patch not commited)
48
49 2004-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
50   * src/gdcmDocument.cxx: wrong type on return fixed (thanks dashboard)
51   * CLEANUP_ROUND (14) for gdcmPixelConvert
52     - PixelConvert::GetLutRGBA(FILE*) is now GetLutRGBA() (no fp needed)
53     - PixelConvert::BuildRGBImage()(FILE*) is now BuildRGBImage() (no fp needed)
54     - File::GetImageDataIntoVector() doesn't need unnecessary OpenFile() and
55       CloseFile() anymore.
56     - File::GetImageDataRaw() doesn't call GetImageDataIntoVectorRaw()
57       anymore and hence avoids storing a copy of PixelConvert::Decompressed
58       into File::Pixel_Data.
59
60 2004-10-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
61   * src/gdcmDocument.cxx ftell() return properly stored in a long (i.e.
62     no longer depends on's programmers PMS = Preposterous Mood Swings ;).
63   * CLEANUP_ROUND (13) for gdcmPixelConvert
64     Substituted File::ParsePixelData() with PixelConvert::Print() new
65     method:
66     - src/gdcmParsePixels.cxx removed (only contained File::ParsePixelData())
67     - src/gdcmRLEFrame.cxx, gdcmJPEGFragment.cxx added. Added a ::Print()
68       method to those classes.
69     - src/gdcmFile.[cxx|h]:
70       -- Added a ::Print() method.
71       -- PixelConverter is now a reference instead of a member.
72       -- gdcmPython/gdcm.i: added "using namespace gdcm" in order for
73          gdcm_wrap.cxx to "understand" File::GetPixelConverter()
74
75 2004-10-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
76   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: when dot is present the
77     collaboration diagram and inheritance diagram should be generated with
78     doxygen.
79   * Doc/Website/Sidebar.html: Dashboard is now also in the sidebar.
80   * gdcmPython/gdcm.i: gdcmRLEFramesInfo.h gdcmJPEGFragmentsInfo.h are
81     pointlessly wrapped (see
82     http://www.creatis.insa-lyon.fr/pipermail/dcmlib/2004-October/000692.html )
83   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (sugar is my friend stage)
84     - Header::GetLUTRGBA() moved to PixelConvert::GetLutRGBA()
85     - vtk/vtkGdcmReader.cxx: adapted to displacment of Header::GetLUTRGBA()
86     - Document::RLEInfo and JPEGInfo are now pointer members (Swig thing)
87     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
88       -- File::Initialise: PixelConverter setup moved away to
89            PixelConverter::GrabInformationsFromHeader()
90       -- File::GetImageDataIntoVector(): Lut R + Lut G + Lut B color table
91          interpretation moved away to PixelConverter::BuildRGBImage()
92
93 2004-10-16 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
94   * Remove GDCM_EXPORT keyword from gdcm::DirList due to :
95     http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP
96
97 2004-10-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
98   * src/gdcmDebug.cxx last ditch attempt to get warning/error messages
99     displayed on Win32 when a brutal abort() occurs (because of uncatched
100     exception). See TODO new entry of this commit for more on this.
101   * TODO added new entry.
102   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (nicotine is my friend stage)
103     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
104     - HandleColor is no longer called from gdcmFile.cxx
105     - gdcmPixelConvert.cxx clean up on method arguments and internal
106       variable names for semantical coherence.
107
108 2004-10-14 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
109   * Finished lossless transition, not only do we now read all lossless jpeg
110   images, without the need of the Cornwell lib, but we do read them properly now
111   * To reduce code (well to avoid code duplication), I defined a common place
112   for jpeg read/write: gdcmJpeg.cxx. Now gdcmJpeg[8,12 16] include this file and
113   redefine symbols. This is not prefect but this the best solution I found for a
114   compilation time jpeg option.
115
116 2004-10-13 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
117   * Update jpeg ijg lib to support lossless jpeg implementation
118     For more info look in jpeg/libijg/README.GDCM.txt for necessary steps to
119     reproduce at home.
120   * Also added a special copyright for dcmtk since we use their bugfixes.
121   Thanks dcmtk crew !
122
123 2004-10-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
124   * Doc/Website/MailingList.html added (Sidebar.html changed accordingly).
125   * gdcmPython/gdcm.i: fix for compilation of wrappers (Note: %include order
126     matters, as stated in warning note at begining of %include section).
127   * src/gdcmDicomDir*.[cxx|h]: coding style
128   * src/gdcmDocument.h: doxygen \ref seems uncompatible with \todo.
129   * src/gdcmJpeg8.cxx: doxygen fix.
130   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (seing the ligth stage)
131     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: color handling moved
132     from File:: to PixelConvert::.
133
134 2004-10-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
135   * CLEANUP_ROUND (11) for gdcmPixelConvert (cafeine is my friend stage)
136     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
137      - more code moved away from File:: to PixelConvert::
138      - fat setup of PixelConverter set in place in File::Initialise.
139
140 2004-10-12 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
141   * Apply patch for namespace in gdcm. Didn't rename files for keeping a sort of
142   namespace at the file system level. So now you should convert your examples
143   like this:
144     gdcmHeader  ->   gdcm::Header
145   It would be nice if people keep in mind to no open the namespace, since it
146   allows compilation on broken plateform which were defining common symbol in
147   the standart namespace (like LP, Unknown ...)
148
149 2004-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
150   * CLEANUP_ROUND (10) for gdcmPixelConvert (Xanax is my friend stage)
151     The JPEG fragments are now parsed at the same stage than the RLE
152     information. All code related to JPEG is now in gdcmPixelConvert:
153     - src/gdcmJPEGFragment.h and gdcmJPEGFragmentsInfo.[h|cxx] added 
154     - src/gdcmJpeg12.cxx, gdcmJpeg2000.cxx and gdcmJpeg8.cxx no longer
155       export a gdcmFile:: method. Those are simply global functions
156       (for the time being this is better than having them attach to
157        either gdcmFile:: or gdcmPixelConvert::).
158     - src/gdcmDocument.[cxx|h], gdcmDocument:: now parser the JPEG fragments
159       and stores the result in a gdcmJPEGFragmentsInfo.
160     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: all JPEG related
161       code (among other stuff) moved away from gdcmFile:; to 
162       gdcmPixelConvert::
163
164 2004-10-08 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
165   * src/gdcmCommon.h now declares int8_t for non stdint.h plateforms.
166   * CLEANUP_ROUND (7) for gdcmPixelConvert (lost at sea)
167     - src/gdcmFile.h gdcmPixelConvert.cxx gdcmPixelConvert.h gdcmRLE.cxx:
168       clean up of RLE related code. 
169   * CLEANUP_ROUND (8) for gdcmPixelConvert (end of RLE nigthmare)
170     - src/gdcmRLE.cxx removed
171     - src/gdcmPixelConvert.cxx all RLE code is now in PixelConvert::
172     - src/CMakeLists.txt gdcmFile.[cxx|h] changed accordingly
173     - src/gdcmRLEFrame*.h gdcmPixelConvert is now a friend class.
174   * CLEANUP_ROUND (9) for gdcmPixelConvert
175     - src/gdcmFile.[cxx|h} gdcmPixelConvert.[cxx|h], SwapZone(),
176       ConvertReorderEndianity(), ConvertDecmpres12BitsTo16Bits() moved
177       away from gdcmFile:: to gdcmPixelConvert::.
178
179 2004-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
180   * CLEANUP_ROUND (5) for gdcmPixelConvert (Upshit creek without a paddle)
181     - src/gdcmDocument.[cxx|h] Parse7Fe0 renamed to ComputeRLEInfo.
182       This is because Parse7Fe0 used to parse the pixels to compute the
183       length. This task was passed over to FindDocEntryLengthOB() a long
184       time ago, EXCEPT I had forgotten the OW case...
185       Hence Parse7Fe0 was no longer necessary. When renaming to ComputeRLEInfo
186       we just recylce the code for parsing RLE fragments and computing
187       offsets.
188   * CLEANUP_ROUND (6) for gdcmPixelConvert (man, I need a paddle bad)
189     - src/gdcmRLE.cxx: is now much simpler and avoids code replication
190         with the retired Parse7Fe0().
191     - src/gdcmRLEFrame.h: type fix for properly computing OffSet[]
192     - src/gdcmDocument.cxx: segments offset are now correct + clean up.
193
194 2004-10-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
195   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert (nightmare stage)
196     - src/gdcmRLEFramesInfo.[cxx|h], gdcmRLEFrame.h added
197     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::Parse7FE0 now sets up the RLEInfo.
198     - src/CMakeLists.txt: alphabetic order reodering + new entries.
199   * CLEANUP_ROUND (4) for gdcmPixelConvert
200     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::ParseDES and ::ParseSQ no longer bother
201       to return an unused length.
202
203 2004-10-09 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
204   * Remove all sprintf from the code to centralize in one spot in gdcmUtil
205     this should be cleanner from the plane view. The iostream are erally a pain
206     to use to do simple stuff.
207
208 2004-10-04 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
209   * Redo the compilation of the ijg jpeg library. Now only one source is
210     necesseray. No need to rename file by hand what so ever. CMake handle the
211     copying of the file within different directory, configure header file to
212     modify some symbol. The only addition made to ijg wasd a mangle table so
213     that symbol are different wether we are within 8bits or 12bits.
214
215 2004-10-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
216   * Added documentation of vtkgdcmReader on Website:
217      - testvtkGdcmReader.cxx renamed to vtkGdcmDemo.cxx (to be compatible
218        with it's binary name).
219      - vtk/vtkGdcmDemo.cxx and vtkgdcmViewer.cxx: added comments for
220        the Website to be more complete.
221      - Doc/doxygen.config.in: vtk/vtkGdcmReader.cxx now appears on 
222        doxygenated documentation.
223      - Doc/DoxyVtkGdcmReaderExamples.txt added
224        (see http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/html.developper/
225                   DoxyVtkGdmReaderExamples.html )
226   * src/win32, vtk/win32 manually maintained .dsp and .dsw removed.
227   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert
228    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
229
230 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
231   * CLEANUP_ROUND (2) for gdcmPixelConvert
232    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
233
234 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
235   * CLEANUP_ROUND for gdcmPixelConvert:
236     - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h, gdcmHeader.cxx, gdcmHeader.h clean up
237     - src/gdcmPixelStuff[h|cxx] removed
238     - src/gdcmPixelConvert[h|cxx] added. Preparatory work included.
239     - src/CMakeLists.txt changed accordingly
240   * GDCMHOME clean up:
241     - MANIFEST.in, WrapSwig.py, WrapVTK.py, distutilsWrapping.py and
242       gdcmVersion.py moved to newly created ATTIC related
243       gdcmPython/SetupOldies/ directory.
244   * Autotools clean up:
245     - */*/Makefile.am removed AT EXCEPTION of gdcmPython/Makefile.am
246     - autogen.sh configure.in acinclude.m4 python.m4 removed 
247
248 2004-09-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
249   * src/*.cxx *.h Reference to License.htm fixed to License.html.
250   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: fix.
251   * Doc/Website/ConformanceSummary.html, minimal conformance statement added.
252
253 2004-09-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
254   * TODO updated with Mathieu suggestions. I proposed a template for
255     describing TODO entries and used it for new entries.
256   * Added Doc/Website/CodingStyle.html, Developpers.html,
257     DeveloppersPython.html, GdcmDataCvs.html and
258     DownloadVersion0_1.html, DownloadVersion0_3.html.
259   * Some Doc/*.txt Doxygen files (which do not really concern the
260     documentation itself, but the website) moved to html and
261     placed in directory Doc/Website:
262     - Doc/DoxyDevelInstal.txt moved to Doc/Website/Developpers.html
263     - Doc/DoxyInstallation.txt moved to Doc/Website/Installation.html
264     - Doc/DoxyIntroduction.txt included in Doc/Website/Main.html
265   * Doc/DoxyfileDeveloppers, DoxyfileUsers, Makefile.am oldies removed.
266   * CMakeLists.txt changed accordingly.
267   * DEVELOPPER spread out in Doc/Website/Developpers.html, CodingStyle.html,
268     DeveloppersPython.html
269   * INSTALL nows refers to Doc/Website/Installation.html
270
271 2004-09-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
272   * Added Doc/Website directory, that contains a first raw version
273     of gdcm Web site.
274
275 2004-09-23 Jean-Pierre Roux
276   * FIX In order not to be poluted any longer by casting problems,
277     the member VoidArea of gdcmBinEntry is now uint8_t* (instead of void *)
278          we can now delete[] it safely  
279   * VoidArea is now called BinArea (less confusing name),
280     and all the methods called ...VoidArea... are now ... BinArea...
281   * class gdcmObject is now called gdcmDicomDirObject (less confusing name)
282
283 2004-09-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
284   * src/gdcmDocument.cxx: gdcmDocument::~gdcmDocument() doesn't clear (nor
285     clear) TagHT, which is an inherited member of gdcmElementSet. It is
286     up to the destructor of gdcmElementSet to clean up TagHt and it's
287     pointed content.
288
289 2004-09-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
290   * Test/CMakeLists.txt: update to follow gdcmData renamings.
291   * src/gdcmCommon.h, gdcmDocument.cxx: doxygen typos
292
293 2004-09-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
294   * ENH: added some utility method that builds a flat dictionnary
295     holding all the Dicom entries contained in the recursive structure
296     of a gdcmElementSet. Refer to add FlatHashTablePrint.cxx for 
297     an example of usage.
298     - src/gdcmDocument.[h|cxx] added BuildFlatHashTableRecurse() and
299       BuildFlatHashTable() that build a flat dictionary.
300     - src/gdcmElementSet.h: added a new private GetTag() accessor.
301       gdcmDocument is now a friend of gdcmElementSet.
302     - src/gdcmElementSet.cxx: clean up.
303     - Example/FlatHashTablePrint.cxx added.
304     - Example/CmakeLists.txt changed accordingly
305
306 2004-09-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
307   * gdcmDocEntrySet::SQDepthLevel and gdcmDocEntrySet::BaseTagKey attributes
308     moved away from gdcmDocEntrySet (since this class is an abstract class
309     acting like an interface). SQDepthLevel and BaseTagKey are now
310     in class 
311     - src/gdcmDocEntrySet.[h|cxx] removal of SQDepthLevel and BaseTagKey
312       and associated accessors. Doxygenation of the class.
313     - src/gdcmSQItem.[h|cxx] SQDepthLevel and BaseTagKey and associated
314       accessors added.
315     - src/gdcmSeqEntry.[h|cxx]: constructor doesn't handle depth anymore.
316       Use SQDepthLevel accessor instead. ::Print() adapted.
317     - src/gdcmElementSet.cxx changed according to changes in gdcmSeqEntry.
318     - src/gdcmDocument.cxx changed accordingly.
319
320 2004-09-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
321   * Preparation of writing a gdcmHeader iterator: generalisation of gdcmTagKey
322     - The following is the doxygen comment of the typedef declaration
323       of gdcmagKey in src/gdcmCommon.h:
324            gdcmTagKey is made to old an "universal" (as in URL, Universal
325            Ressource Locator)  key to a gdcmDocEntry i.e. a dicom tag.
326            A dicom tag allways has a group and an element, but a set of tags
327            embeded in various (optionally nested) sequences and sharing
328            the same group and element all share the same (group, element)
329            "identifier". Hence the (group, element) cannot be used as an
330            identifier (in gdcm we shall refer to a "TagKey") of a tag.
331            In order to construct a proper tag identifier (i.e. a key) we
332            consider the following definition of a TagKey:
333            - let Group, Element be the string representation of the
334              group and element dicom tag members,
335            - let ItemNumber be the string representation of the integer
336              index of the considered item number of a sequence,
337            Let the key of a tag embeded in a sequence, noted SeqTag, be
338            the form:
339               /ItemNumber#Group|Element
340            where "/", "#" and "|" are characters acting as separators.
341            Then the general form of a gdcmTagKey is given by:
342               Group|Element<SeqTag>
343            where <SeqTag> means NO or many instances of SeqTag.
344            Hence the gdcmTagKey of a tag not "leaving" in a sequence is the
345            string e.g.
346                0028|1201
347            but the gdcmTagKey of a tag "embeded" is the first item of
348            a sequence, itself nested in the third item of a sequence is the
349            string e.g.
350                0004|1220/2#0008|0082/0#0008|0090
351     - src/gdcmDocEntry.h: added a new Key (of type gdcmTagKey) member, in
352       order to hold the new sequence compatible key. Previously, the 
353       GetKey() method would look in the underlying gdcmDictEntry.
354     - src/gdcmDocEntry.cxx:
355       -- constructor now copies the underlying DictEntry key, in the local
356          Key member.
357       -- ::Print: displays the member Key, instead of the (group, element).
358     - src/gdcmCommon.h: added some comments on typedef gdcmTagKey.
359     - src/gdcmDocEntrySet.h:xi
360       -- ::ParseDES() now setups the gdcmTagKey of the sequence it is parsing.
361       -- now has a new BaseTagKey member.
362       -- STYLE.
363   * src/gdcmValEntry.[h|cxx], src/gdcmBinEntry.[h|cxx]: the member VoidArea,
364     previously a member of gdcmValEntry, moved to gdcmBinEntry were is
365     truly belongs.
366     This poses the problem with the semantics of the following lines
367        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1201);  // R    LUT
368        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1202);  // G    LUT
369        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1203);  // B    LUT
370     in gdcmDocument::gdcmDocument(std::string const & ). Please refer
371     to the long FIXME note for what the problem is. Nevertheless in
372     order to get things working the dicom dictionary was altered !
373     Please fix things urgently...
374   * Dicts/dicomV3.dic WRONGLY altered (this means we introduced a uncorrect
375     information), see above note on moving the member VoidArea. Nevertheless
376     the following entries previously correctly set as US are now inproperly
377     set to OW:
378       0028 1201 OW IMG Red Palette Color Lookup Table Data
379       0028 1202 OW IMG Green Palette Color Lookup Table Data
380       0028 1203 OW IMG Blue Palette Color Lookup Table Data
381   * src/gdcmDocEntry.[h|cxx], src/gdcmSeqEntry.h: SQDepthLevel member
382     of gdcmDocEntry moved to gdcmSeqEntry.
383   * src/gdcmSeqEntry.cxx: STYLE.
384
385 2004-08-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
386   * Test/TestAllEntryVerify.cxx minor fix and added comments.
387
388 2004-08-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
389   * gdcmPython/testSuite.py: all the test suite in python is now moved
390     to it's C++ version (see gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt)
391   * Test/CMakeLists.txt adapted to renaming of files in gdcmData
392   * gdcm/TODO and src/gdcmDictSet.h cleaned up frow the "TODO Swig" oldies
393
394 2004-08-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
395   * gdcmPython/CMakeLists.txt: SWIG_FLAGS doesn't declare includeall
396     to avoid inclusion recursion until STL is reached.
397   * src/gdcmDocument.[h|cxx]: exceptions substituted to errno C-style
398     mecanism. errno.h is not included in gdcm anymore.
399   * src/gdcmException.h: introduced new gdcmFormatUnexpected class
400     (gdcmFormatError now inherits from gdcmFormatUnexpected).
401   * TODO updated
402   * gdcmPython/testSuite.py checks on CR-MONO1-10-chest.dcm moved to
403     gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
404   * Test/TestAllEntryVerify.cxx is now effective (used allways return true)
405   * src/gdcmDocument.[cxx|h]: constructors no longer use the bool
406     exception_on_error parameter.
407     - src/gdcmFile.[cxx|h], src/gdcmHeader.[cxx|h] changed accordingly,
408     - vtk/vtkGdcmReader.cxx changed accordingly,
409     - Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
410
411 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
412   * src/gdcmDicomDir.cxx, gdcmDocEntrySet.cxx: removed inclusion of errno.h
413   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
414     enable_sequences removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
415   * Example/PrintHeader.cxx: fixed accordingly (enable_sequences removal).
416   * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: dummy fix.
417   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
418     skip_shadow removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
419   * Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
420
421 2004-07-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
422   * Test/CMakeLists.txt: newly re-introduced SIEMENS_Sonata-12-MONO2-SQ.dcm
423     in gdcmData (previously known as E00001S03I0015.dcm) is blacklisted.
424
425 2004-07-21 Jean-Pierre Roux
426   * FIX Now, Parsing and Printing a DICOMDIR do work!
427        ( troubles remain in makeDicomDir and BuildUpDicomDir :-(
428                  
429 2004-07-20 Jean-Pierre Roux
430   * FIX Some brain damaged headers have Zero-Lenght fields 
431         for 'Transfert Syntax UID', or 'Media Stored SOP Class UID'.
432
433 2004-07-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
434    * src/gdcmCommon.h, gdcmDict.cxx, gdcmTS.cxx : bug fix for msvc6 compilation
435    * src/gdcmDebug.[h|cxx] : bug fix for msvc6 compilation. Replace the dbg
436      variable (instance of gdcmDebug) by a definition macro, and the instance
437      is now in static in the gdcmDebug class
438    * src/gdcmSQItem.h : (FIXME) remove an undefined method
439    * Test/PrintAllDocument.cxx : bug fix in the result of the test
440
441 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
442    * WARNING: ctest now depends more tightly on gdcmData. You should
443      check out gdcmData properly for things to run smoothly...
444    * src/gdcmDocument.cxx MAX_SIZE_LOAD_ELEMENT_VALUE is set back to 0xfff
445      (4096) for "ctest -R TestAllEntryVerify" to be able to run (i.e.
446      we need the pixels not be loaded in order to use the ValEntry
447      that displays position and size).
448    * Test/TestAllEntryVerify.cxx a new low level test now seems fair.
449      This is a C++ based equivalent of gdcmPython/testSuite.py that should
450      be deprecated. If you have any doubts about the advantages of a
451      modern scripting language (read Python) versus grass root C++ (i.e.
452      without lex + yacc, because of gdcm commitement to MS-VC++, sighhh),
453      I suggest you compare TestAllEntryVerify.cxx (639 lines, without the
454      reference file gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt) and testSuite.py.
455         Anyhow, consider documenting the gdcmData images in 
456      gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt (and please run ctest before
457      commiting changes).
458    * Test/CMakeLists.txt:
459       - now uses TestAllEntryVerify.cxx
460       - specific comments on oldACR00001.ima (now renamed in gdcmData
461         to SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr) moved away to
462         gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
463    * TODO updated.
464
465 2004-07-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
466    * src/*.[h|cxx] : typedef clean up
467      - guint16 and guint32 removed. Use ISO C uint16_t, uint32_t instead.
468      - TagKey renamed to gdcmTagKey (for external usage)
469      - VRKey renamed to gdcmVRKey (for external usage)
470      - removal of typedef duplication.
471      - Removed all unecessary inline keyword from class inline definitions.
472      - Some method|function(void) declarations replaced with method|function().
473    * src/jpeg/libijg12/jdhuff12.c:
474       - printf polluting ctest removed.
475       - TAB removal for comminting
476    * Test:
477      - TestAllReadCompareDicom.cxx: added a test that compares all the
478        images in gdcmDataImages.h with corresponding images in 
479        gdcmData/BaselineDicom/. When baseline images are not present
480        this test creates them.
481        Note: we need to validate each reference image, but before that
482              I'd like to rename them with a more explicit name...
483      - CMakeLists.txt: changed accordingly.
484    * Example/*.cxx: examples now only include gdcm.h (as opposed to 
485      including each header needed).
486
487 2004-07-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
488    * Test/*.cxx and Example/*.cxx: moved some examples away from the
489      test suite to the Example directory. Are concerned:
490      - PrintHeader.cxx
491      - TestDcm2Acr.cxx
492      - TestFindTags.cxx
493      - TestWrite.cxx was
494      - TestWriteSimple.cxx
495    * Test/CMakeLists.txt: added some comments on reasons for black listing
496      image gdcmData/oldACR00001.ima
497
498 2004-06-30 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
499    * Test/CmakeList.txt: removed the following from black list (to be coherent
500      with removal from gdcmData):
501       - gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.fixed.dcm
502       - gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm
503       - US.3405.1.dcm
504      Added the following because after last cvs update, they cause
505        ctest -R TestReadWriteReadCompare 
506      to segfault:
507       - gdcm-MR-SIEMENS-16-1.acr
508       - oldACR00001.ima
509    * Test/TestReadWriteReadCompare.cxx was properly written (with a call
510      to gdcmFile::SetImageData()) BUT since gdcmFile is brain damaged (see
511      new comments in this file) we temporarily (sigh) move to a weaker
512      form of test...
513    * Test/CmakeList.txt: with the change to Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
514      we don't need to black list the following images anymore:
515       - 8BitsUncompressedColor.dcm
516       - OT-PAL-8-face.dcm
517       - US-PAL-8-10x-echo.dcm
518    * src/gdcmDocument.[h|cxx]: RE-Reverting to version 1.42 with the proper
519      fixes and the beautified code ;-)
520      This fixes the bug introduced in version 1.42 (when beautifying)
521      that made the parsing of 8BitsRunLengthColor.dcm unproper.
522      Note: ctest was blind to this bug (this means we need to still
523            improve the test suite). The bug could be detected by using
524            gdcmbin/bin/PrintDocument $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
525            or by using
526            gdcmbin/bin/ReadWrite $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
527            and by displaying the (garbage) produced file temp.XDCM...
528
529 2004-06-29 Jean-Pierre Roux
530    FIX : - remove Frog's beautified, but never checked 'Parse7FE0' code,
531          - replace by uggly but working old code :-(
532                 A lot of things should be OK again.
533         It's really urgent to have a test suite that *tests*, 
534         to prevent Frog's beautifying sessions to break all the stuff
535         (twice, withing a fortnigh ...)         
536
537 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
538    * Test/TestWriteRead.cxx and TestReadWrite.cxx merged (because of
539      redundancy) to added Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
540    * Test/CmakeList.txt: because the compare test of
541      Test/TestReadWriteReadCompare.cxx fails, the following images are
542      black listed: - 8BitsUncompressedColor.dcm
543                    - OT-PAL-8-face.dcm
544                    - US-PAL-8-10x-echo.dcm
545    * src/gdcmDocument.cxx: for broken (non DICOM V3 conformal) images
546      (e.g. gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm see comments in
547      gdcm/gdcmPython/testSuite.py for details) ::FindDocLengthOB() had
548      and ad-hoc kludge. This kludge is now removed, and on encountering
549      such an image (OB field brain damaged) we set errno. Then in 
550      ::FindDocLength() we "fix" the length as being ALL what remains
551      in the file (until EOF). We then proceed, hoping for the best...
552      This fixes a SegFault in ShowDicom when trying to write such an
553      image.
554    * Test/CmakeList.txt: 8BitsRunLengthColor.dcm is now blacklisted
555      (because TestWriteRead breaks on it, after a non conformal commit?).
556      ctest now runs properly, except for MakeDicomDir (which was allways
557      broken) and the Python related stuff (still not fixed).
558    
559 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
560   ADD : Examples/WriteRead, that acts like the former Test/TestWriteRead
561   FIX : Test/TestReadWrite now iterates on all the file names 
562                           (instead of infinite loop)
563   ENH : Test/TestWriteRead now iterates on all the file names 
564
565 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
566    * Test/TestReadWrite.cxx: now uses all the images of gdcmData.
567
568 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
569    FIX : - now Write drops LUT Descriptors and LUTs (if any)
570                     when SamplesPerPixel =3
571          - now Write is no longer confused by 
572                               'BitsAllocated = 12" and 'BitsStored=12"
573          - "UN" value representation Elements are now written correctly 
574                (their legth is stored on 4 bytes -just like OB, OW, and SQ-)                                                                    
575    ENH : - now gdcmHeader has its own Write methods 
576                     (in order to split the job that has not to be done 
577                                         for gdcmDicomDir)
578
579 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
580    * Test/PrintAllDocument.cxx: looping on files is now effective. It used to
581      loop on the same image until memory went out. 
582      Note: this means we still have gobs of memory loss in PrintDocument
583    * src/gdcmDocument.cxx: fixes problem on parsing on file
584      gdcmData/16BitsJpegLosslessGrayScale.dcm.
585
586 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
587    FIX : Write - All the Sequences and Sequence Item are now written 
588             as 'no length' stuff, and a Sequence Delimitor aor an Item Delimitor
589                                 is added a the end, when necessary.
590             - A lot of brain-damaged images, that were read correctly are 
591                       now written correctly
592                                 - length compatible BinEntry are now loaded correctly 
593                                 (even for odd groups) 
594         Note : only Explicit Value Representation was checked.
595                                 (question : is implicit VR really necessary for gdcm ?)
596
597 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
598    * DEVELOPPER: added a proposition of coding style.
599    * src/gdcmDocEntry.h: removed every inline declaration (for test of 
600      coding style).
601
602 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
603    * gdcmDocEntry::PrintCommonPart() and ::WriteCommonPart() removed.
604      Use the gdcmDocEntry::Print() and Write() instead.
605    * src/gdcmDocument.cxx: bug fix.
606
607 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
608    FIX : gdcmDocument.cxx
609       - Now we do recognize the JpegLossLess format (there was a misstyping in
610         code 'beautyfication' :-(
611       - Now we automaticaticaly load the Luts, if any
612
613 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
614    In order : to write Sequences, whatever their imbrication level, 
615                  : to allow user to create his own Sequences
616         a lot of modif where necessary (adding, moving, or virtualising methods)
617
618 WARNING : save your own sources *before* cvs up !
619         
620         - gdcmBinEntry
621           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
622           
623    - gdcmDocEntry
624           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
625           ADD void gdcmDocEntry::WriteCommonPart(FILE *fp, FileType filetype);
626           
627         - gdcmDocEntrySet
628           ADD virtual void Write (FILE *fp, FileType filetype)=0;
629           ADD   virtual gdcmDocEntry *GetDocEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
630      ADD gdcmDocEntry *GetDocEntryByName(std::string name);
631      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
632      ADD std::string GetEntryByName(TagName name);                       
633      ADD gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
634                                             guint16 element,
635                                             std::string vr     = "unkn",
636                                             std::string fourth = "unkn",
637                                             std::string name   = "unkn"); 
638           ADD gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);                                                                                                 
639      ADD gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);     
640      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
641      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);   
642      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByName   (std::string Name);
643      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
644           REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element)=0;
645      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name)=0;
646           
647         - gdcmDocument
648      ADD virtual bool WriteF(FileType type); // New stuff, with recursive exploration           
649      ADD virtual std::string GetEntryByName    (TagName tagName);
650      ADD virtual std::string GetEntryVRByName  (TagName tagName);
651      REM virtual bool Write(FILE *, FileType);
652      REM virtual void WriteEntryTagVRLength(gdcmDocEntry *tag,
653                                         FILE *_fp, FileType type);
654      REM virtual void WriteEntryValue(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
655      REM virtual bool WriteEntry(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
656      REM virtual bool WriteEntries(FILE *_fp,FileType type);
657      REM virtual std::string GetEntryByName    (std::string tagName);
658      REM virtual std::string GetEntryVRByName  (std::string tagName);
659      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByName  (std::string Name);
660      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
661      REM gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
662                                             guint16 element,
663                                             std::string vr     = "unkn",
664                                             std::string fourth = "unkn",
665                                             std::string name   = "unkn");
666      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
667      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);
668      REM gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
669      REM gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
670                                                                                                                  
671         - gdcmElementSet
672           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
673           
674    - gdcmSeqEntry
675           ADD virtual void Write(FILE *fp,FileType filetype);
676  
677    - gdcmSQItem
678      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
679      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);        
680      REM std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
681      REM std::string GetEntryByName(TagName name);
682
683    - gdcmValEntry
684          ADD virtual void gdcmValEntry::Write(FILE *fp, FileType filetype); 
685                                   
686 2004-06-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
687     * Test/TestWriteSimple.cxx: fix to gdcmHeader-gdcmHeaderHelper revamping.
688       The default constructor invoked by the line
689          gdcmHeader *f1 = new gdcmHeader( header );
690       was gdcmHeader::gdcmHeader(bool) instead of the expected
691       gdcmHeader::gdcmHeader(std::string const &, bool = false, bool, bool).
692       Hence the parsing wasn't executed... See also below.
693     * src/gdcmHeader.h: the declaration of gdcmHeader::gdcmHeader(bool)
694       as explicit constructor didn't do the trick to fix the above problem.
695       Could anyone explain why ?
696     * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmValEntry.cxx: gdcmBinEntry::Print() now
697       properly calls gdcmValEntry::Print() (that was weed out from 
698       code related to gdcmBinEntry).
699
700 2004-06-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
701     * In order to fix memory leaks:
702      - Test/TestWriteSimple.cxx: added cleaning of free store through
703        some delete calls.
704      - src/gdcmBinEntry.cxx: fix to avoid SegFault.
705      - src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: fixed initialisation in constructor
706        gdcmDicomDir::gdcmDicomDir(bool) [either the constructor itself
707        (through the call to ::AddDicomDirMeta()) or the destructor
708        would crash when deleting uninitialized ::metaElems].
709      - src/gdcmDictEntry.cxx: annotation of ununderstood memory leak.
710      - src/gdcmDocument.cxx:
711        -- ::~gdcmDocument() destructor now cleans up all dictionary entries
712           from dynamic stores.
713        -- ::ParseDES() misplaced deletion of temporary NewDocEntry
714           was causing memory leaks.
715      - src/gdcmSQItem.cxx:
716        -- ::~gdcmSQItem() dummy code cleaned (learned that deletion is
717           cleanly handled with polymophism: sorry but my milage is low).
718        -- ::SetEntryByNumber(string, guint16, guint16) now cleanly allocates
719           a gdcmValENtry, and makes no assumption on type (gdcmDocEntry,
720           gdcmSeqEntry vs gdcmValEntry) of existing entry (when present).
721           This avoids SegFaulting.
722      - src/gdcmSQItem.h: coding style.
723     * Conclusion:
724      - Test/TestWriteSimple still severely sucks. The output image content
725        (when $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm in input) is brain
726        damaged when displayed with vtkgdcmViewer.
727      - on memory leaks: TestWriteSimple leaks really less (see entry
728        of 2004-06-18 in Changelog file for the call to valgrind).
729      - on segfaults: ctest now passes all the tests but one (no more
730        segfaults).
731     * Erroneous leading white fix:
732      - src/gdcmDict.cxx: getline(from,xxx) doesn't remove the leading
733        white[s] (as opposed to from >> xxx, that removes it [them].
734      - src/gdcmTS.cxx: ditto.
735      - gdcmPython/testSuite.py: dirty related kludge removed.
736     * src/*: remaining references to gdcmParser removed.
737     * src/*[cxx|h]: added copy[way]left header.
738
739
740 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
741     * In order to fix writing of dicom files:
742      - Test/TestWriteSimple.cxx: a simpler example of writing.
743      - Test/CMakeLists.txt changed accordingly.
744      - src/gdcmDocument.cxx:
745        -- The destructor now recursilvely removes potential sequences.
746        -- Bug fix in ::IsJPEG2000()
747        -- ::ReplaceOrCreateByNumber(std::string, guint16, guint16)
748           now handles promotion of gdcmDocEntry to gdcmValEntry in a cleaner
749           manner.
750        -- ::GetValEntryByNumber(guint16, guint16) now defined (as opposed
751           to only declared) and build on top of
752           ::GetDocEntryByNumber(guint16, guint16).
753        -- ::SetEntryByNumber() now uses GetValEntryByNumber(group, element)
754      - src/gdcmElementSet.[h|cxx]: added ::RemoveEntry(gdcmDocEntry *)
755        for usage in destructor and treatement of promotion in
756        ::ReplaceOrCreateByNumber().
757      - src/gdcmSQItem.cxx: destructor should better handle his job.
758       Test/TestWriteSimple now runs (or at least it DOES something).
759     * We can now start hutting memory links. A good starting point is:
760       valgrind -q --skin=memcheck --leak-check=yes --leak-resolution=high
761       --num-callers=100 --show-reachable=yes gdcmTests TestWriteSimple
762       $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm foo.dcm
763
764 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
765     * Valgrind note: after Mathieu Malaterre teached me how to read
766       the valgrind FAQ ;-] (see http://valgrind.kde.org/faq.html), I
767       learned that:
768           Using gcc, you can force the STL to use malloc and to free memory as
769           soon as possible by globally disabling memory caching.
770           With 3.2.2 and later, you should export the environment variable
771           GLIBCPP_FORCE_NEW before running your program.
772       By setting GLIBCPP_FORCE_NEW, STL related memory leak messages of gdcm
773       simply vanish (it is still not clear to me, whether this means that
774       STL std::string leaks or if valgrind believes it leaks...).
775     * Fixing of SegFault of Test/makeDicomDir (as shown by ctest or by
776       running bin/gdcmTests makeDicomDir):
777       - src/gdcmDicomDir.cxx: dynamic casting used + clean up.
778       - Test/makeDicomDir.cxx now properly traps empty lists and returns
779         with 1.
780       NOW, makeDicomDir cleanly fails (in ctest terminology) instead of
781       SegFaulting (I drowned in DicomDir related code when trying to
782       understand why the list is empty...).
783     * src/gdcmDocument.h: first BSD license header try.
784     * Doc/License.txt added.
785
786 2004-06-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
787     * src/gdcmDocument.[h|cxx]:
788       - Clean up of the Transfer related predicates. They are now all based
789         on new method isGivenTransferSyntax, that (should) handle properly
790         the padding problem.
791       - general clean up, simplification, and coding style.
792       - Specific clean up of Parse7FE0() (umproperly named actually).
793     * gdcmPython/testSuite.py: an odd temporary kludge introduced.
794
795 2004-06-14 Jean-Pierre Roux             
796    *  gdcmSeqEntry.cxx
797            - fix the display of Sequence Delimitor (SQDepthLevel pb)
798                 - fix the display of SQItem ordinal number
799       - add the GetSQItemByOrdinalNumber method
800                 - remove some useless never written private methods     
801                 
802 2004-06-14 Jean-Pierre Roux
803    * gdcmBinEntry.cxx 
804       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param
805            - ReplaceOrCreateByNumber now returns :
806               a gdcmBinEntry * if a Binary (void *) value is passed as a param
807                    a gdcmValEntry * if a string value is passed as a param
808    * dcmDocument.cxx
809       - SetEntryByNumber now allows setting gdcmValEntry or gdcmBinEntry, 
810               according to the param type (no longer sets a gdcmDocEntry)
811            - GetValEntryByNumber, GetBinEntryByNumber added
812       - NewValEntryByNumber and NewBinEntryByNumber added
813    * gdcmFile.cxx
814       - Pixel Data are now linked to the (7fe0,0010) elements, after reading
815    * gdcmSQItem.h
816       - GetSQItemNumber and SetSQItemNumber added, to provide 
817             a (relative) Item identier inside a given Sequence
818             \warning : some pb remaining around this number
819                                 will be solved asap
820       - AddEntry now takes the Item Number as a param   
821    * gdcmValEntry.cxx 
822       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param    
823
824 2004-06-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
825     * Memory leak hunt with the following command:
826       valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
827                --show-reachable=yes gdcmTests PrintDocument
828       It looks like many (all?) leaks are due to the STL (or a bad usage
829       of the STL. The lines producing the leaks now have a comment with
830       a "MEMORY LEAK" tag: you can retrieve them with 
831           grep "MEMORY LEAK" src/*
832       Here are two typical examples which I can't help fixing:
833       -----
834           #include <string>
835           int main() {
836              std::string name;
837              char * test = "babo";
838              name = test;    //// <--- valgrind detects 960 bytes lost in
839                              ////   call to std::string::operator=(char const*)
840              name.clear();   //// Doesn't help !
841              return 0;
842           }
843       -----
844           #include <string>
845           #include <iostream>
846           int main() {
847              std::string line;
848              std::cout << "Type a bunch of characters followed by RETURN: ";
849              getline(std::cin, line);   //// <--- valgrind dectects a loss
850                                         //// of 1320 bytes in call to
851                                         /// std::basic_istream<>& std::getline<>
852             return 0;
853           }
854       -----
855
856
857 2004-06-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
858     * src/gdcmHeader.[cxx|h]:
859       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*)
860         and related, moved away to gdcmDocument.
861       - Accessors (on the form [Get|Set]Entry*) set up to expose publicly
862         the corresponding protected accessors of inherited class
863         gdcmDocument, removed ! As a consequence gdcmFile had to be 
864         declared friend of class gdcmDocument (see below).
865       - operator< moved to gdcmDocument (in fact it belongs to gdcmDicomDir).
866       - Clean up of undefined or unused methods.
867     * src/gdcmFile.[cxx|h]: added SetEntryByNumber (in order to take into
868       account the changes to gdcmHeader.h).
869     * src/gdcmDocument.h:
870       - gdcmFile is now a friend class (in order to take into account the
871         changes to gdcmHeader.h).
872       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*) added
873         (see changes to gdcmHeader.h).
874       - Accessors (reading on the form GetEntry*) are now public.
875       - Clean up of undefined or unused methods.
876     * src/gdcmDocument.cxx:
877       - adaptation to changes to gdcmDocument.h
878       - ::OpenFile now writes a verbose message when file cannot be opened.
879       - some std::string properly set to VRKey
880     * src/gdcmDicomDir.h: historical references to gdcmHeader changed to
881       references to gdcmDocument. 
882     * Test/TestFindTags.cxx: changed accordingly to above changes.
883     * gdcmPython/testSuite.py: adapted to renaming of acr files in 
884       cvs repository gdcmData.
885
886 2004-06-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
887     * src/gdcmValEntry.h: member voidArea type changed from char* to void*.
888     * src/gdcmBinEntry.h: member voidArea commented out, since it potentially
889       conflicts with gdcmValEntry::voidArea.
890     * src/gdcmValEntry.cxx: unmatching comment wiped out.
891     * src/gdcmVR.[h|cxx]: added two predicates that partition the possible
892       Value representation between StringRepresentable and BinaryRepresentable.
893     * src/gdcmDocument.cxx: 
894       - method ParseDES: proper indentation restored and usage of
895         gdcmVR::IsVROfGdcmStringRepresentable wired in.
896       - method LoadDocEntry: the fingerprint left in the SetValue() of
897         unloaded entries (length > MaxSizeLoadEntry) had curiously been
898         removed. Reverting to previous code segment with the proper
899         dynamic_cast< gdcmValEntry* >.
900         Note: this was (partially) breaking the python test suite
901               (gdcmPython/testSuite.py) that made usage of the above
902               fingerprint to check presence of "Pixel Data".
903     * src/gdcmDocEntry.h: coding style.
904     * gdcmPython/__init__.py: environement variable GDCM_DATA_PATH is
905       now taken into account.
906     * gdcmPython/gdcm.i: adaptation to the new internal representation
907       of gdcm (exit gdcmParser, hello gdcmDocument).
908     * gdcmPython/testSuite.py: quick and dirty fix for loading vtkgdcmPython
909       on posix.
910     * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: doesn't use the gdcmDocument::Print()
911       anymore, but instead prints the loaded Python dictionary.
912     * .... alas, the python testSuite is still broken.
913
914 2004-05-18 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
915     * gdcmPython/gdcm.i : remove useless lines concerning the gdcmGlobal
916       gdcmGlob
917     * gdcmPython/setup.py : replace the use of cvar.gdcmGlob to gdcmGlobal
918     * src/gdcmUtil.h : export methods
919
920 2004-05-16  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
921     * Some more cleanup/enhancement in gdcmPython/CMakeLists.txt getting close
922       to right behavior
923     * Initial addition of automatic python testing
924     * Initial addition of automatic image comparison
925
926 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
927     * src/gdcmCommon.h, gdcmDicomDir.cxx, gdcmFile.cxx, gdcmHeaderHelper.h,
928       gdcmParser.cxx, gdcmParser.h : bug fix for the Microsoft .Net compilation
929
930 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
931      * src/gdcmFile.cxx, gdcmHeader.cxx : bug fix for the msvc compilation
932      * Test/ShowDicom.cxx : bug fix for msvc compilation
933      * vtk/vtkgdcmViewer.cxx : bug fix for msvc compilation
934
935 2004-05-04 Jean-Pierre Roux
936      * ADD Taking into account the 'Dicom Sequences' leads up to introduce
937        new concepts (and new classes) :
938        a 'gdcmDocument' is composed of a set of Doc Entries, that are
939         - elementary gdcmDocEntries (former gdcmHeaderEntries)
940         - Sequence Doc Entries (gdcmSeqEntries)
941        a Sequence is composed of Items.
942        Each item is a set of Doc Entries (this is recursive)
943        The non uniqueness of the 'Dicom tag' is due to this recursivity
944        (never taken into account)
945        Our unability to add a new 'entry' in the header
946        at the proper location (neither in the H-Table (map or multimap),
947        nor in the Chained List is also due to this recursivity.
948        Don't try, right now, to use/modify/compile these new sources :
949        nothing is finished.
950        We just commit all the stuff, 'as is', in order not to loose it.
951
952 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
953      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix in the setting of file name
954      
955 2004-05-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
956      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading a list of files using the
957        file prefix (SetFilePrefix)
958
959 2004-05-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
960      * Add a new test: ShowDicom, for now this is just the c++ version of
961        checkRead.sh, later it will be able to compare the image read against a
962        baseline.
963      * Replace the DEBUG on the stack with a global entry in cmake interface:
964        GDCM_DEBUG, so you can turn verbosity ON/OFF for debug statement.
965
966 2004-04-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
967      * Add an example subdir, with a real example on how to read + write a 
968        dicom image
969
970 2004-04-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
971      * Doc/gdcmUML.xmi added raw UML class view (umbrello format)
972      * Doc/CMakeLists.txt: the main page is now properly differentiated
973        between the developper and user version.
974      * Doc/doxygen.config.in: dropped search related obsolete flags
975      * src/gdcmParser.h, gdcmHeader.h: doxygenation
976
977 2004-04-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
978      * DEVELOPPER: added some helpfull comments for compile/test/install
979        when using cmake.
980
981 2004-04-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
982      * ENH: 1. Remove remp solution of gdcmTests.cxx+ gdcmMain directly in 
983                src directory, now generated in the build dir.
984             2. Tests as mentionned smarter
985             3. Some clean up
986             4. Add a new method in gdcmDict that return the PubDict by name 
987           this is interesting for 3rd party lib like ITK, 
988           where we could set the institution name / patient name...
989
990        * ENH: 1. Now the test suite is working for real
991               2. All binaries are now output in the gdcm-bin directory 
992                  (this was not true before)
993
994 2004-04-28  Jean-Pierre Roux
995      * ENH add the provisional  gdcmHeader::SQDepthLevel to allow 
996            SeQuence indented printing of Dicom Header.
997      * ENH merge methods gdcmParser::Parse and gdcmParser::LoadHeaderEntries
998            into the single gdcmParser::LoadHeaderEntries for efficiency purpose.
999            Computation of SQDepthLevel is now part of gdcmHeader constructor
1000      * ENH add self defined param 'new' to PrintHeader to 'show' the SeQuence
1001            tree-like structure of a Dicom Header.
1002      * FIX Test code cleaning     
1003            
1004 2004-04-25  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1005      * ENH: Adding automatic testing
1006        1. Need a DartConfig.cmake to submit to public
1007        2. Add a test driver gdcmTest.cxx
1008        3. gdcmTestMain, an helper for the main test driver gdcmTest
1009        4. Files in Test don't have a main anymore, this becomes interesting 
1010           when we add more and more tests, thus dsw don't have to load 
1011           too many projects
1012      * ENH: Adding a GDCM_DATA_ROOT for testing
1013      * ENH: Remove redundancie about GDCM_DICT stuff, now we only need to modify
1014        one file instead of seven + some small cleanup
1015
1016 2004-04-22  Jean-Pierre Roux
1017      * ENH Minor changes to the Print() methods.
1018      * ADD gdcmParser::PrintEntryNiceSQ() to allow SQ-indented
1019            Header printing. Example given with :
1020            > PrintHeader fileName  2 new
1021           (SQ based tree-like structure still to be done for the Header ...)
1022            
1023 2004-04-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1024      * ENH: Some cosmetic clean up for compilation with -W -Wall -Werror
1025          1. I have added some unsigned where needed
1026          2. Some function parameter not used -> (void)
1027          3. In gdcmDicomDir.cxx, add GDCM_DICOMDIR_NONE case
1028          4. g++ don't like character '\' in comment
1029          5. #define jpeg_create_decompress  jCreaDecompress
1030                     this really need to be fixed
1031          6. virtualize destructor of gdcmObject ... leakage
1032          7. sscanf(g->first.c_str(),"%x",&gr_bid); 
1033                     this also really need to be fixed
1034          8. gdcm/src/jpeg/libijg8/CMakeLists.txt, 
1035                     remove compression file 
1036                     (as we only do decompression, right ?)     
1037      * ENH: Change malloc/calloc/free with c++ equivalent
1038
1039 2004-04-21  Jean-Pierre Roux
1040      * FIX gdcmHeaderHelper::GetXSpacing
1041            when a single value is found (bug ?), xpacing is now 
1042            defaulted to yspacing
1043            
1044 2004-04-19  Jean-Pierre Roux
1045      * ADD gdcmData/Wrist.pap (PAPYRUS 3.0 -single frame-) for checking purpose
1046      * ENH add parameters :
1047                bool  exception_on_error = false, 
1048                bool  enable_sequences   = false,
1049                bool  ignore_shadow      = false
1050            to the gdcmFile constructors to be full gdcmParser compliant
1051      * FIX vtk/vtkGdcmReader.cxx now uses  enable_sequences = true in gdcmFile
1052            to allow reading of PAPYRUS 3.0 files 
1053               
1054 2004-04-06  Jean-Pierre Roux
1055      * ADD gdcmData/E00001S03I0015.dcm for SQ checking purpose
1056      
1057 2004-04-02  Jean-Pierre Roux
1058      * ADD : Test/checksequence.sh, for a general recap on SQ pb
1059      * FIX : gdcmParser::WriteEntryTagVRLength emprovement of special treatement
1060              for Philips spurious Tag fffe|0000 while rewritting Dicom files
1061              
1062 2004-03-30  Jean-Pierre Roux
1063      * FIX gdcmParser::ReplaceOrCreateByNumber shouldn't seg fault any more 
1064          for ACR file, written out as DICOM files (hope so...)
1065
1066 2004-03-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1067      * src/gdcmParser.[cxx|h] and gdcmHeader.[cxx.h]: gdcmHeader::Write split
1068        in WriteEntryTagVRLength and WriteEntryValue. Those methods were
1069        moved to base class gdcmParser and only the specialisation is kept
1070        in gdcmHeader.
1071      * src/gdcmParser.[cxx|h]: ReplaceOrCreateByNumber(char*, guint16, guint16)
1072        trashed out (because ReplaceOrCreateByNumber(string, guint16, guint16)
1073        already does the job.
1074      * src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: WriteDicomDirEntries renamed to WriteEntries
1075        (to be consistent with gdcmParser::WriteEntries).
1076
1077 2004-03-30 Benoit Regrain
1078      * vtk/vtkGdcmReader.[h|cxx] : fix the read of 3 gdcmHeader when making an
1079        upate of the object's instance. It's passed to 2 in the unfavorable
1080        case : one in the ExecuteInformation, one in the ExecuteData
1081
1082 2004-03-29  Jean-Pierre Roux
1083      * ENH : Check on file type to be written moved
1084              from gdcmParser::WriteEntry to gdcmParser::WriteEntries
1085      * FIX : gdcmObject::ResetBoundaries now stops properly
1086              when end-of-list is reached
1087            : gdcmVersion modified (as Benoit Regrain asked)
1088
1089 2004-03-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1090      * src/gdcmParser.cxx: removal of all TAB character. Indentation fixed.
1091      * src/gdcmUtil.cxx: added forgotten iostream include.
1092      * src/gdcmCommon.h: FileType enum entry DICOMDIR removed (since
1093        equivalent to ExplicitVR in existing code).
1094
1095 2004-03-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1096      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmGlobal.[cxx|h]
1097        now contains all the gdcmGlobal related code.
1098      * minor coding style and doxygenation changes.
1099
1100 2004-03-26  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1101      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmDebug.[cxx|h]
1102        now contains all the Debug related code.
1103      * minor clean-up of includes in src/*.cxx
1104      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _cleanString C style function (replaced with
1105        CreateCleanString) removed.
1106      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _CreateCleanString renamed to CreateCleanString
1107      * Doc/DoxyMainPageUser.txt added.
1108      * Doc/Doc/DoxyfileUsers updated to version 1.3.4 of Doxygen.
1109      * src/gdcmCommon.h now defines getcwd for Win32 (moved away from
1110        src/gdcmDirList.cxx)
1111
1112 2004-03-24  Jean-Pierre Roux
1113      * FIX a lot of little surface modifications to be doxygen 1.3.6 compliant
1114
1115 2004-03-23  Jean-Pierre Roux
1116      * FIX Now gdcmFile::SwapZone doesn't seg faults any longer for
1117            big endian made volumes
1118      * ENH Now gdcmParser constructor and destructor are protected to forbid
1119            end user to instanciate class gdcmParser
1120           (only gdcmHeader and gdcmDicomDir are meaningfull)
1121
1122 2004-03-22 Benoit Regrain
1123      * FIX : src/gdcmDicomDir.cxx : make windows compilable
1124      * FIX : gdcmPython/gdcm.i : change gdcmStudy to gdcmDicomDirStudy and
1125              gdcmSerie to gdcmDicomDirSerie
1126
1127 2004-03-19  Jean-Pierre Roux
1128      * ENH Now the tree-like structure describing a DICOMDIR comming from
1129            an already existing DICOMDIR file is consistent with
1130            the home-made tree-like structure build ex-nihilo
1131            or build from the files held (recursively) in a Directory
1132            functions gdcmDicomDir::CheckBoundaries()
1133            gdcmObject::SetBoundaries() added
1134
1135 2004-03-17  Jean-Pierre Roux
1136      * REM (Eric Boix bug) : removal of meaningless
1137                              gdcmDicomDirImage::NewImage function.
1138      * FIX now file names and directory name are written properly in the
1139            DICOMDIR
1140      * FIX now gdcmDicomDir constructor may be call without any trick
1141            about the name
1142
1143 2004-03-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1144      * FIX (JPR bug) : src/gdcmDicomDirImage.cxx added missing definition
1145                        of gdcmDicomDirImage::NewImage as empty function.
1146
1147 2004-02-28  Jean-Pierre Roux
1148      * ENH add gdcmDicomDir:NewPatient
1149            add gdcmDicomDirPatient:NewStudy
1150            add gdcmDicomDirStudy:NewSerie
1151            add gdcmDicomDirSerie:NewImage
1152            to allow making gdcDicomDir object.
1153      * ADD PrintDicomDir executable that uses gdcmDicomDir tree-like structure
1154           (as opposite to the gdcmHeader chained list)
1155
1156 2004-02-11 Benoit Regrain
1157      * FIX : memory leaks and the set of ArgDelete methods in gdcmDicomDir
1158              when using from python
1159
1160 2004-02-10 Benoit Regrain
1161      * FIX : bug fix in the gdcmDirList for the recursivity in directories
1162      * FIX : in gdcmDicomDir when the directory is empty
1163      * ENH : add callback and methods to get the progression of dicomDir
1164              directory parsing
1165
1166 2004-02-06 Jean-Pierre Roux
1167      * ENH : - now gdcmDicomDir::CreateDicomDir() returns also the meta elements
1168              - GDCM_META added to gdcmDicomDirType
1169              - class gdcmMeta created
1170      * ENH : - A brief summary is now displayed at the beginning of
1171              'testDicomDir' to help disaster magnitude estimation
1172      * REM : Now useless Test/explDICOMDIR.cxx
1173
1174 2004-02-05 Benoit Regrain
1175      * ENH : add methods in gdcmObject to get the hash table or the list of
1176              header entries
1177      * FIX : wrapping python for ListPatient, ListStudy, ListSerie, ListImage
1178      * FIX : wrapping python for TagHeaderEntryHT
1179
1180 2004-02-04 Benoit Regrain
1181      * FIX : even length for some strings when writting the dicom dir
1182      * FIX : sort the images in the dicom dir
1183      * FIX : Bug fix for python use of dicom dir
1184      * ADD : a python demo
1185
1186 2004-02-04 Jean-Pierre Roux
1187      * FIX : Final solution (?) for icone embedded images
1188      * FIX : dicomVR.dic Overlay group is not *only* 6000, but 60xxx
1189              (see http://medical.nema.org/dicom/2003/03_06PU.PDF)
1190              add groups 6002, 6004, 6006, to allow 'clean' parsing of
1191              gdcmData/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1
1192      * ENH add gdcmData/checkWriteExplicit.sh gdcmData/checkWriteImplicit.sh
1193            to make full checking easier
1194         
1195 2004-02-04 Benoit Regrain
1196      * FIX : WriteEntries : coding style & logic in parameters
1197      * FIX : Set the elements to create the DicomDir in a dictionary file
1198
1199 2004-02-03 Benoit Regrain
1200      * gdcmDirList : to parse a hard drive directory in recursive (or not)
1201      * gdcmDicomDir : add the load of directory
1202      * Bug fix and print add-on
1203
1204 2004-02-03 Jean-Pierre Roux
1205      * ENH gdcmParser : allows "DICM" files, with NO group '0002'
1206      * FIX handling 'non string elements' unsecure area (LUT, overlays, etc)
1207      * FIX Dicts/dicomV3.dic : Add a few missing 'group length' Elements 
1208      * FIX gdcmParser.cxx : 'group length' elements are now considered 
1209            as integers, even for shadow groups, when file is Implicit VR
1210         
1211 2004-02-02 Jean-Pierre Roux
1212      * FIX : gdcmWrite : equal_range() for multimap doesn't return a 'second' 
1213              iterator on last
1214              of the last synonym :-(
1215      * FIX : gdcmWrite::WriteBase : method stops if Pixels not yet Read (except 
1216              for DICOMDIR ;-)
1217      * ENH gdcmData/checkWrite.sh :modif for full check of Explicit VR writting
1218      * FIX taking into account the possible 7fe0,0010 multiplicity        
1219      * FIX add GRPixel,NumPixel,countGrPixel (gdcmParser protected members)
1220            to allow removal of references to 7fe0,0010, to deal with
1221       ACR-NEMA images, when 0028,0200 is meaningfull
1222
1223 2004-01-31 Jean-Pierre Roux
1224      * FIX gdcmParser::WriteEntries : when a VR is tagged as 'Unknown'
1225            no longer writes 'Un' on disk
1226      * FIX SQ elements with actual length are now dealt with corectly
1227      * FIX gdcmFile::WriteBase make the difference, for color images, between
1228            the length (for Palette expanded images)
1229            and Raw Length (non expanded image + Palette)
1230      * FIX Dicts/dicomV3.dic : removal of 'CTX' (context dependant) VR
1231            (that broke Write). Replaced by UL.
1232            Aware user will reload the field if he 
1233            thinks it's necesssary
1234              
1235 2004-01-30 Jean-Pierre Roux
1236      * gdcmParser::CheckSwap() now defaults the filetype to ACR 
1237        when 'dirty Acr' is found, to be compliant with the new 
1238        IsReadable() methods.
1239        
1240      * gdcmHeaderHelper :add Pixel Type 'FD', for dealing with 'double' images.
1241       (no DOUBLE images in kosher DICOM, 
1242       but so usefull for people that miss them ;-)
1243       
1244      * add Test/testDicomDir.cxx, Test/makeDicomDir.cxx , Test/explDICOMDIR.cxx
1245        DICOMDIR related utilities (not checked as Windoze compliant)
1246
1247 2004-01-28 Jean-Pierre Roux
1248      * upgrade GdcmHeaderEntry Print Method for DICOMDIR
1249
1250 2004-01-27 Jean-Pierre Roux
1251      * gdcmParser constructor has a new boolean param,'ignore_shadow', 
1252              to allow skipping the shadow elements, to save memory space.
1253         The TRUE value for this param has to be used 
1254         with a FALSE value for the 'enable_sequence' param.
1255         ('public elements' may be embedded in 'shadow Sequences')
1256      * gdcmHeader methods now deal with 'embedded icones images' in the header
1257              (even when an 'icone image sequence' is announced by the 
1258         element (0x0088,0x0200), but there is NO icone at all ...
1259         
1260      * gdcmHeader sometimes Image Location value doesn't follow  
1261              the supposed processor endianity (see gdcmData/cr172241.dcm).
1262              Fixed
1263
1264      * gdcmHeader add the method
1265              IterHT  GetHeaderEntrySameNumber(grPixel,numPixel);
1266         to get *all* the Header Entries with the same tag.
1267         GetHeaderEntrySameName is probabely *useless* 
1268         (no meaning : Name is *not* an identifier within the Dictionnary)
1269
1270 2004-01-26 Benoit Regrain
1271      * Bug fix in the print of hexadecimal representations. Remove long fields 
1272        in the print and add a third level of print to print them
1273
1274 2004-01-23 Benoit Regrain
1275      * Bug fix on field having a VR = 'UI'. Assume that is a string field
1276      * Bug fix on test suite after remove the strip made on not string fields
1277      * Split the IsReadable method between gdcmParser which test that the file
1278        is dicom and gdcmHeader which test that it's an image file
1279
1280 2004-01-22 Benoit Regrain
1281      * DicomDir : clean code, add methods, set variables in protected or private
1282      * gdcmUtil : bug fix for the clean string method
1283
1284 2004-01-19 Benoit Regrain
1285      * Add the use of shadow dictionaries
1286      * bug fix and coding style
1287
1288 2004-01-19 Benoit Regrain
1289      * src/gdcmFile.cxx : bug fix concerning the close of file
1290      * src/gdcmParser.[h|cxx] : remove obvious Pub informations
1291      * Add the update of header entries using the shadow library
1292
1293 2004-01-19 Benoit Regrain
1294      * removal of file gdcmHeader2.cxx
1295      * split class gdcmHeader into gdcmParser and gdcmHeader, with gdcmHeader
1296        inheriting from gdcmParser. This split is to prepare the integration
1297        of dicom dir parsing
1298      * bug fix under python
1299
1300 2004-01-16 Jean-Pierre Roux
1301     * REM removal of class gdcmHeaderEntrySet
1302     * REM removal of files gdcmHeaderEntrySet.cxx, gdcmHeaderEntrySet.h
1303     * ADD add file gdcmHeader2.cxx 
1304     * ADD add method gdcmHeader::SetPrintLevel (for PrintHeader)
1305
1306 2004-01-15 Benoit Regrain
1307      * src/gdcmDicSet.[h|cxx] : add virtual entries to have a reference of
1308        entries created while parsing the header. Thus, they will be destroyed
1309        when the gdcmDictSet will be destroyed
1310      * src/gdcmHeader.cxx, gdcmHeaderEntrySet.cxx : uses virtual entries of
1311        gdcmDictSet
1312
1313 2004-01-15 Benoit Regrain
1314      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix : before, with python only, the program
1315        made a fatal error because of the memory release at the end of program.
1316        The problem was in vtkGdcmReader::ExecuteData where we were allocate
1317        some memory and vtk seems to have some problems with that.
1318      * src/gdcmHeaderEntrySet.cxx : bug fix for std lib and cout
1319
1320 2004-01-14 Benoit Regrain
1321      * src/gdcmHeaderEntry.[h|cxx] : gdcmElValue -> gdcmHeaderEntry
1322      * src/gdcmHeaderEntrySet.[h|cxx] : gdcmElValSet -> gdcmHeaderEntrySet
1323      * src/*.[h|cxx] : make changes due to class name changes
1324      * gdcmPython/demo/*.py : bug fix due to method names
1325
1326 2004-01-13 Benoit Regrain
1327      * src/*.[h|cxx] : coding style
1328      * vtk/*.[h|cxx] : coding style
1329
1330 2004-01-13 Benoit Regrain
1331      * gdcmPython/testSuite.py : test the readable flag of file for tests
1332      * src/gdcmDict.cxx, gdcmElValSet.cxx : bug fix under windows for prints.
1333        It's lied to the stl compilation by MSVC (windows, always windows...)
1334      * src/gdcmIdo.h, gdcmHeaderIdo.cxx : remove the Ido unused files
1335
1336 2004-01-12 Benoit Regrain
1337      * src/*.h : add comments
1338      * src/gdcmDictSet.h : set the method BuildDictPath in public
1339      * src/gdcmTS.cxx, gdcmVR.cxx : use now a dictionnary file other than to be
1340        directly setted in the source code
1341      * Dicts/dicomTS.dic, dicomVR.dic : 2 new dictionnary files loaded by
1342        gdcmTS and gdcmVR
1343
1344 2004-01-09 Benoit Regrain
1345      * gdcmPython/gdcmVersion.py : add a gdcmVERSION variable information
1346      * setup.py : use a reference to gdcmVERSION
1347
1348 2004-01-07 Benoit Regrain
1349      * Modification to compile with the distutils.
1350      * Bug fix in code
1351
1352 2003-12-10 Benoit Regrain
1353      * gdcmHeader is now aggregating gdcmFile, and not derived into. Thus, we
1354        can use a gdcmHeaderHelper to load datas
1355      * gdcmPython/testSuite.py : make the testSuite compliant with modifications
1356        made in the source code
1357
1358 2003-12-10 Benoit Regrain
1359      * Update Windows projects and .cvsignore files
1360
1361 2003-11-12 Jean-Pierre Roux
1362      * ENH gdcmHeader constructor has one more parameter (default value : false)
1363            that allows the user to 'go inside' the SeQuences only
1364            if he wants to.
1365            gdcmElValSet:Print takes it into account
1366
1367 2003-11-12  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1368      * ENH: Update gdcmPython/CMakeLists
1369      * FIX: (gdcmHeaderHelper) GetRescale and GetSlope
1370      * FIX: (gdcmElValSet) char 'tag' was overiding private members (VC++)
1371
1372 2003-11-10 Jean-Pierre Roux
1373       * FIX : gdcmHeader::LoadElements is now based
1374              on the ListTag listElem member,
1375              not longer on the TagElValueHT tagHt member
1376       * ENH : PrintPubElVal shows (temporarily) both results,
1377              with the tagHt member and the listElem member.
1378              (it's easier to 'see' the problems when using Printheader)
1379
1380       * FIX : old private member LgrElem is now splitted into
1381              ReadLength   : Length actually found on disk (updated only
1382                             if bug fixing is necessary), for internal
1383                             use only
1384              UsableLength : Updated by FixFoundLength, to fix a bug
1385                             or to allow Parser going on.
1386              Will allow to re-write a kosher header when a SeQuence
1387              with a length (not 0000) is found
1388       Warning : gdcmFile::Write still uses the TagHt (not ListElem)
1389                 because gdcmElValSet::Add does not update ListElem
1390                 (to be written)
1391
1392 2003-11-07 Jean-Pierre Roux
1393      * FIX misstyping in Transfert Syntax name table
1394      * ENH gdcmHeader::FixFoundLength now allow to 'go inside' tge SeQuences
1395           when they have an actual length (not 0000 nor FFFFF)
1396      (Nobody should care of it, but DICOMDIR explorers)
1397
1398 2003-11-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1399      * ENH: vtkgdcmViewer now works with LUT dicom (OT-PAL-face ...)
1400
1401 2003-11-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1402      * ENH: vtkGdcmReader now supports LUT !
1403           (vtkgdcmViewer for now is not able to use them though)
1404
1405 2003-11-05 Jean-Pierre Roux
1406      * in testSuite.py : new files names for checking the package
1407      * FIX : Forgot to commit gdcmFile::GetImageDataSizeRaw();
1408              that returns the pixel area size to the *aware* (vtk) user
1409              that DOESN'T want to turn the PALETTE COLOR image into an RGB image
1410
1411 2003-11-05 Benoit Regrain
1412      * in testSuite.py : Modify the rules for checking the paths
1413                        : Explicit error messages
1414      * in __init__.py  : Related modif
1415
1416 2003-11-03 Jean-Pierre Roux
1417      * add gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponentsRaw()
1418            to be used by aware (vtk) users that want to manage
1419            LUT (and no to turn the PALETTE image into an RGB pixels one)
1420      * GetPixelType now returns 8U for 24 Bits images
1421                     (vtkGdcmReader compliant)           
1422       
1423 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1424      * Removal of *all* gdcmData images and add them again
1425        in order to loose the 'history' of un-anonymised images
1426        
1427 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1428      * RMV : removal of useless jBitsInJsample.h 
1429            for both 8 and 12 Bits JPEG Lossy Libraries
1430
1431 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1432      * ENH : Add the functions gdcmFile::GetImageDataRaw 
1433                                gdcmFile::GetImageDataIntoVectorRaw
1434              that act as GetImageData and GetImageDataIntoVector
1435              except the making of an RGB Plane from Gray Plane + LUT
1436              Intended to aware (vtk) users who know how to manage
1437              such an image :
1438              After gdcmHeader :
1439               GetLUTRGBA return a R,G,B,A LUT if any
1440               lgrTotaleRaw gives the 'Raw' length
1441               GetImageDataRaw returns the gray Plane
1442      * FIX : no more dirty trick for 'Segmented xxx Palette Color Lookup' images
1443              (They stay Grey, just like with other Dicom viewers :-(
1444
1445 2003-10-30 Jean-Pierre Roux
1446      * FIX : a VC++ intended syntax modif broke the 12/12 Bytes expanding
1447              
1448 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1449      * ENH: Can be used like this '$vtkgdcmViewer *.dcm' with *.dcm 
1450            being coherents dicom files.
1451      
1452 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1453      * FIX: DOH ! Forgot about windo$e users, they couldn't read lossless jpeg,
1454            from medcon lib !
1455      * ENH: Turn it into DOS file type to match libgdcmijpeg8.dsp file type 
1456      * ENH: Two steps is necessary to please VC++ compiler...
1457      * FIX: DOH ! libgdcmijpg8 -> libgdcmljpeg
1458      * ENH: Add include dir to medcon lib
1459      * FIX: only one function is being exported for now ! 
1460            You should use GLOBAL(return type) see ljpg/jpeg.h for more info
1461             
1462 2003-10-29 Jean-Pierre Roux
1463       * adding  gdcmHeader::GetLUTRGBA
1464         returns a 4 * 256 Bytes Reg/Green/Blue/Alpha vtk compliant LUT
1465           --> Mathieu, the modif u're waiting for is not yet committed
1466       * removal of now useless GetLUTRed,GetLUTGreen,GetLUTBlue,GetLUTRGB
1467
1468 2003-10-27 Jean-Pierre Roux
1469       * adding some xmedcon breaker files (courtesy of Loïc Boussel)
1470         00191113.dcm DermaColorLossLess.dcm
1471         MxTwinLossLess.dcm RadBWLossLess.dcm
1472       * ENH: For version prior to vtkImageViewer2 -r 1.19
1473       * FIX: avoid pb with xmedcon-breaker CT McTwin Elscint images
1474
1475 2003-10-27  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1476       * Removal of ido stuff in CMakeLists.txt
1477                                                
1478 2003-10-24  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1479       * ENH: vtkGdcmReader.cxx can now read multiframe dicom
1480       * FIX: remove a call to ->Modified ... see comments
1481       * FIX: vtkgdcmViewer.cxx was writting ASCII file...this is so slooooow !
1482       
1483 2003-10-23  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1484       * FIX: Problem with path for libvtkgdcmPython
1485       * ENH: Try adding a search script for python site-package
1486       * RMV: Remove some file from medcon lib that are not necessary
1487       * FIX: gdcm/Makefile.am fix for generating ljpg medcon
1488       * ENH: CMakeLists.txt now generate 'pygdcm.so' instead of 'libpygdcm.so'
1489       * FIX: More pragma disable fro VC++, 
1490              I don't think I break something as it is also disable in VTK/ITK.
1491         But it fasten debug compilation time.
1492             
1493 2003-10-23 Jean-Pierre Roux
1494       * gdcm now deals with 16 Bits Run Length Encoded images
1495         (they are compressed as 2 planes images, 
1496          one for the high Bytes, the other for low Bytes)
1497
1498 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
1499       * Now CheckRead takes into account :
1500          - the bugged 'Leonardo' Siemens images
1501          - the XA images, sent thru the burning VPRO station
1502       * add I9000001.dcm, a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
1503        (breaks DicomWorks)
1504
1505 2003-10-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1506       * FIX: When copying a Makefile.am to CMakeLists.txt 
1507              one should remove the '\'
1508         
1509 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
1510       * in gdcmData adding a bugged 'Leonardo' Siemens image 
1511         (wrong lengths in header)
1512         OK with gdcm, KO with the other viewers :-)
1513       * add a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
1514         (breaks DicomWorks)
1515
1516 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1517       * in gdcmData add the checkvtkgdcmViewer.sh shell script 
1518         for a brutal checking of vtkgdcmViewer compliance
1519
1520 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1521       * add the files for 'xmedcon' Jpeg Lossless library
1522       * call of 'xmedcom' Jpeg Lossles libray (instead of the old LibIDO one)
1523
1524 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1525       * 'Compacted Files' (12 Bits Allocate, 12 Bits Stored) are now dealt with
1526      
1527 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1528       * garbage Siemens 'Leonardo' images dealt with
1529         (the patch is easy to remove)
1530       * cosmetic changes to avoid warnings
1531       
1532 2003-10-20  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1533       * ENH: vtkgdcmViewer now autoscale color/window level on start-up, 
1534         no need to press 'r' now.
1535    
1536 2003-10-20  Jean-Pierre Roux
1537       * upgrade of checkRead.sh checkWrite.sh according
1538         to new Jpeg Lossless decompressor
1539       * add US.3405.1.dcm, a genuine RGB medical file ...
1540       * add gdcm-ACR-LibIDO.acr, unnormalized Rectangular LibIDO format image
1541       * add CLIP0001-Sequoia-U11.dcm, US 'Clip', from SEQUOIA machine,
1542                                                   UNIT 11, Hop Cardio              
1543 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
1544       * general anonymisation in gdcmData
1545       * adding the 'color files' from
1546         http://www.leadtools.com/SDK/Medical/DICOM/ltdc19.htm
1547       * adding some well knowed bugged-header images
1548       * adding checkRead.sk, checkReadColor.sh, checkWrite.sh,
1549         waiting for their inclusion in Python testsuite
1550
1551 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
1552     * gdcmHeader::gdcmHeader(const char *InFilename, bool exception_on_error)
1553       no longer seg faults when file is not found
1554
1555 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
1556      * Emprovement of reading for Dicom encapsulated Jpeg LossLess 
1557        MultiFrame images
1558
1559 2003-10-14  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1560      * TODO: *.in file to genereate a UseGDCM later
1561
1562 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
1563      * Some supposed-to-be Dicom Images have no preamble.
1564         OpenFile takes it into account
1565      * Jpeg LossLess 24 Bits images doesn't break any longer gdcm
1566      * Missing elements added in dicomV3.dic
1567       (just to be affraid : have a look at
1568        ftp://medical.nema.org/medical/dicom/2003/01v03dif/01v03_06.pdf
1569        and do it again next year ;->
1570
1571 2003-10-13  Jean-Pierre Roux
1572      * According to PS 3.3-2003 C.11.1.1.2 p 619, when each pixel of 
1573        a PALETTE COLOR is stored on 2 Bytes, theese 2 Bytes must be equal.
1574        But there are NOT. It's fixed !
1575        
1576 2003-10-13  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1577      * FIX: "jpeglib.h" was not found on VC++
1578      * FIX: vtkgdcm was not being installed 
1579          
1580 2003-10-10  Jean-Pierre Roux
1581      * ENH : OpenFile closes the file if it *really* doesn't look like
1582              an ACR-NEMA / DICOM one.
1583      * FIX : testWrite no longer writes an empty file if the source file     
1584              is not gdcm Readable
1585      * ENH : One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" 
1586              is now decoded.
1587         
1588 2003-10-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1589      * FIX: CMake generate now documentation
1590      * ENH: out of source doc build !
1591      * ENH: Generate both user and dev documentation
1592      * ENH: Should work on windows too
1593      * ENH: Only one doxygen config.in file is needed 
1594      * FIX: make install should be ok now on Ã¹nix plateform
1595      * FIX: PATH to dictionary was wrong (missing /)
1596      * ENH: OpenFile, return true if the file looks like an ACR or DICOM file 
1597                      
1598 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1599      * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
1600      * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
1601      * added a gdcmViewer to vtk test, use mouse to control 
1602         window level & window width
1603
1604 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1605      * CMake-ification of gdcm, we have now two build system
1606      * FIX: on cygwin Wsock32 doesn't exist
1607      * FIX: force jpeg dir to the local one (gdcm/src/jpeg)
1608      
1609 2003-10-06  Emanuel Ollart
1610      * FIX : compilation process wad broken.
1611              Changed gdcmViewer_sources to vtkgdcmViewer_sources
1612         
1613 2003-10-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1614      * change gdcmViewer -> vtkgdcmViewer
1615      * change GetXSpacing and GetYSpacing "%f\\%" is parsed backward
1616      
1617 2003-10-06  Jean-Pierre Roux
1618      * FIX :A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
1619            ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
1620                  : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
1621       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
1622
1623 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1624       * Odd length strings are padded with '\0' (not with spaces, 
1625         to remain compliant with already defined strings, 
1626         like Transfert Syntax UID and others)
1627
1628 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1629       * ENH :gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
1630              to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
1631         
1632 2003-10-03  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1633       * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
1634       * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
1635
1636 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1637       * A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
1638         ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
1639               : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
1640       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
1641
1642 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1643       * One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" is now decoded.
1644
1645 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1646       * gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
1647         to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
1648
1649 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1650       * gdcmFile::GetImageDataIntoVector now
1651          - deals with MultiFrames MultiFragments Run Length Encoded files
1652          - deals with YcBcR (YBR_FULL) files
1653          - deals with YBR_YBR_FULL_422 files (they work as RBG files ?!?)
1654           WARNING : nothing was checked for YBR_PARTIAL_422, YBR_ICT, 
1655                                             YBR_RCT files.
1656           (no sample found :-(
1657
1658 2003-10-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1659       * src/*.cxx removed pragma thingies to src/gdcmCommon.h
1660         Two reasons: - clear things
1661                      - third parties acces gdcm through header files, so won't
1662                        suffer anymore VC++ complains
1663
1664 2003-09-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1665       * add argv[1] in testvtkGdcmReader.cxx
1666       * removed leaks
1667
1668 2003-09-24 Jean-Pierre Roux
1669       * The lines are now eigthy characters long.for 
1670         gdcmHeader.cxx gdcmHeaderHelper.cxx gdcmParse.cxx 
1671
1672 2003-09-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1673       * src/gdcmUtil.[cxx|h] : change the _CreateCleanString return value from
1674         char* to std::string. Thus, the use of strdup becomes useless. (see
1675         previous commis of Malaterre)
1676       * src/gdcmElValSet.cxx : reuse commented call to _CreateCleanString like
1677         before the last Malaterre's commit.
1678
1679 2003-09-19  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1680       * This commit should fix the Debug building under VC++, the problem
1681         was mainly a mixture of debug and release lib being loaded at startup.
1682       * I also remove a depency to a specific C function: strdup. Because I had
1683         to force the link to msvcrtd (whereas strdup is in libc).
1684
1685 2003-09-16  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1686       * "gdcm::Unfound" string changed to a constant variable (GDCM_UNFOUND)
1687         located in the gdcmCommon.h file. All use of reference of tha has been
1688         changed to now use the variable GDCM_UNFOUND.
1689
1690 2003-09-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1691       * Cosmetic changes:
1692         - gdcmPython/testSuite.py adapted to the JPR updated Dicts/dicomV3.dic
1693           Dicom dictionary. The test suite can now be run again. Note:
1694           I'm note very happy with the " (RET)" changes. I believe this
1695           RETAINED comment should be dropped when parsing the dictionary.
1696         - PACKAGER corrected
1697         - DEVELOPPER added.
1698         - AUTHORS updated and now in alphabetical order
1699       * Makefile.am now exports gdcm.dsw for Windoze users.
1700
1701 2003-09-11  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1702       * cygwin complains about missing std:: in subdir Test/
1703
1704 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1705       * remove some methods that are now in gdcmHeaderHelper
1706
1707 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1708       * vtkGdcmReader set spacing and origin correctly
1709
1710 2003-09-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1711       * Fix a few delete/delete[] mismatch
1712
1713 2003-09-08  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1714       * src/gdcmHeaderHelper.[h cxx]: added new class that provide an
1715         interpretation to data given by gdcmHeader. For instance there are
1716         heuristics to get informations (look at different places).
1717       * it also include a specific class: gdcmSerieHeaderHelper devoted to
1718         sorting DICOM images based on different strategies.
1719       * modified Makefiles accordingly.
1720
1721 2003-09-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1722       * src/*.cxx : added pragma disable 4786/4251 to get rid of ~4300 warning
1723         when building in debug mode
1724       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : change /MT -> /MD and /MTd -> /MDd to match
1725         src/win32/gdcmdll.dsp
1726       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : added /nodefaultlib "mscvrt" for debug mode
1727
1728 2003-08-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1729       * Corrected a leak in vtkGdcmREader.cxx, the pSource was find thanks
1730             to valgrind.
1731
1732 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1733       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp was not dos format
1734       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp : 
1735                   libgdcmijpeg12_EXPORTS -> LIBGDCMIJPEG12_EXPORTS
1736       * src/win32/gdcmdll.dsp: + /I "..\jpeg\libijg12"
1737
1738 2003-07-29 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1739       * src/gdcmHeader.h : add std:: prefix for stl elements... like others in
1740         the file
1741       * src/gdcmFile.cxx : bug fix in affectation type
1742       * src/jpeg/libijpeg12/jmorecfg12.h : export for windows modified... like
1743         in src/jpeg/libijpeg8/jmorecfg8.h (JPR : copy/paste exists !!!)
1744       * Modifs of MVSC projects to compile them. Not concerning 2 identic
1745         symbols... future problem ?
1746
1747 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1748       * src/win32/libgdcmijpeg12.dsp was missing
1749       * modified gdcm.dsw accordingly
1750
1751 2003-07-28  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1752       * src/gdcmHeader.cxx : misplaced return 0.; for ACR/NEMA
1753
1754 2003-07-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1755       * src/jpeg/libijg12/.cvsignore, jconfig.* : ommited files while last
1756         commit of JPR (before his hollidays to facilitate our work).
1757       * setup.py : bug fix in code. Modifications made while the last commit
1758         of JPR. The code hasn't been tested before the commit... it's so
1759         useless to make that (for best programmer that is JPR) !!!
1760
1761 2003-07-08  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1762       * tagged the current version as Version0_3 (i.e. version 0.3)
1763
1764 2003-07-08  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1765       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx : remove a symbol that is unused
1766       * src/jpeg/libijg8/jmorecfg.h : adding export symbol for windows
1767       * *.dsp : modifications to use new libgdcmijpeg8 library
1768       * setup.py : bug fix on VTKPATH variable
1769       * PACKAGER : adding all concerning windows
1770
1771 2003-07-07  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1772       * src/gdcmElValSet.cxx, gdcmFile.cxx: JPR bug fix, removal of
1773         garbage debug code.
1774       * TODO, vtk/vtkGdcmReader.cxx: upcoming fixes comments.
1775       * gdcmPython/testSuite.py: JPR bug fix, brutal erasement of
1776         test suite reported error.
1777       * PACKAGER file added (describes what a packager must do when
1778         packaging a new release).
1779       * MANIFEST.in, now declares jconfig.linux and jconfig.vc
1780       * configure.in: upgraded version number to 0.3.0
1781       * fixing build of rpm (through rpm -ta):
1782         - Doc/Makefile.am exports proper doxygen files
1783         - src/jpeg/libijg8/Makefile.am exports the include files.
1784
1785 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1786       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading only 1 file.
1787       * src/gdcmHeader.h : formatting code
1788
1789 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1790       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
1791         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
1792         is made in an internal list to prevent this problem.
1793         Bug fix when output is empty.
1794         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
1795         correction.
1796       * vtk/vtkGdcmReader.h : adding comments for InternalFileNaleList variable
1797
1798 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1799       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
1800       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
1801         files. Added method to remove all files on the input
1802         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
1803         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
1804
1805 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1806       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
1807         when using make instal.
1808       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
1809         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
1810
1811 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1812       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
1813       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
1814
1815 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1816       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
1817         linux and WINDOWS !
1818       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
1819       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
1820
1821 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1822       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
1823         addon of the jpeg library)
1824       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
1825       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
1826       * INSTALL now points to web documentation
1827
1828 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1829       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
1830         gdcmUtil.h anymore.
1831       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
1832         clean target.
1833       * src/gdcm*.[cxx|h] :
1834         - to allow compilation with gcc 3.x
1835           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
1836           -- small fixes on exceptions.
1837           Note: linking not tested !
1838         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
1839           building stage.
1840       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
1841         dependent convertion).
1842
1843 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1844       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
1845         Changelog):
1846         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
1847         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
1848           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
1849         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
1850
1851 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1852       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to
1853         compile
1854       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
1855         (FileName -> Filename)
1856
1857 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1858       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
1859         - UpdateProgress method should now be effective
1860         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
1861           to volumes),
1862         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
1863           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
1864           accelerating things).
1865         - when building a stack of images/volumes, files which are not
1866           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
1867           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
1868           in the stack (for the caller to notice the problem).
1869
1870 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1871       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
1872
1873 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1874       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts
1875         between standard library (std) and vtk library (problems are found
1876         under Windows... thanks Windows !)
1877
1878 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1879       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
1880         debug stage).
1881       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
1882
1883 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1884       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
1885
1886 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1887       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
1888         called with different flags than the default ones (with automake).
1889         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
1890            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
1891         and went for warning fixes:
1892         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
1893           up from unused variables.
1894         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
1895       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
1896
1897 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1898       * gdcmPython/gdcm.i:
1899         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
1900           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
1901           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
1902         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
1903           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
1904           exported to Python a as cvar.
1905       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
1906         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
1907         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
1908         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
1909         C++ static methods).
1910       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
1911         with the above changes.
1912
1913 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1914       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
1915
1916 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1917       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
1918         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
1919         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
1920          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
1921          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
1922            a wrapper
1923          - Wrapper interface which wrap sources
1924         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
1925         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
1926       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
1927         files for compilation
1928
1929 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
1930       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
1931         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
1932         - vtk/Makefile.am now builds a library
1933         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
1934           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
1935           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
1936           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
1937           import library.
1938         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
1939           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
1940           + vtk/vtkGdcmReader.so and
1941           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
1942           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
1943         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
1944           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
1945         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
1946           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
1947       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
1948       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
1949         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
1950         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
1951         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
1952         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
1953         collision of various stl members (principally cout...).
1954       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
1955         file.
1956       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
1957         comply with above changes)
1958
1959 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1960       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
1961       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
1962         vtk data structure (an image Flip was required).
1963       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
1964       * cosmetic changes in documentation.
1965
1966 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1967       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
1968         unexisting file is given as argument.
1969       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
1970         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
1971         containing those images is now available at
1972           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
1973         with the name gdcmData.
1974         All the python scripts (including the package initialisation file
1975         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
1976         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
1977
1978 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1979       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
1980         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
1981         demo of the usage of this class.
1982         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
1983         at configure (or autogen.sh) stage.
1984
1985 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1986       * More memory link related corrections and documentation fixes.
1987         Notes on valgrind:
1988           - maximum info is obtained with a command of the form:
1989             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
1990                      --show-reachable=yes PrintHeader
1991           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
1992             allocation scheme through the usage of map and list. It looks
1993             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
1994             (in fact further invocation to the STL would recollect the
1995              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
1996       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
1997         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
1998         Note: some images don't seem to work e.g.
1999             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
2000       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
2001         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
2002         make gdcm more thread friendly.
2003
2004 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2005       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
2006           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
2007         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
2008           gdcmHeader::_dicom_vr.
2009         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
2010         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
2011           VRHT*.
2012         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
2013
2014 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2015       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
2016         make install stage.
2017
2018 2003-04-9 JPR
2019       * UpdateGroupLength replaced by new one
2020
2021 2003-04-7 JPR
2022       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
2023         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
2024
2025 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
2026       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
2027       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
2028       * src:
2029         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
2030         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
2031           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
2032         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
2033           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
2034           carried the same semantics.
2035           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
2036         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
2037           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
2038         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
2039       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
2040       * gdcmGetXSize added
2041       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
2042       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
2043
2044 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2045       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
2046         (to avoid double call by end user).
2047       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
2048         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
2049
2050 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2051       * gdcm/Doc many doxygen changes:
2052         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
2053           the html.users end users oriented documentation and
2054           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
2055           oriented documentation.
2056         - README changed accordingly
2057         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
2058         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
2059           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
2060         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
2061           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying
2062           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
2063       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
2064         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
2065       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
2066         ill-formed documentation sections.
2067       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
2068
2069 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2070       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
2071       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
2072         un*ces with sh-utils test utility.
2073       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
2074       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
2075       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
2076       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
2077       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
2078
2079 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2080       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
2081       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
2082
2083 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2084       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
2085       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
2086       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
2087       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
2088         compilation work.
2089       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
2090       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
2091
2092 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2093       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
2094         hence the user doesn't need this explicit call.
2095         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
2096           i.e. LoadElements() call removed.
2097       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
2098         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
2099       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
2100         for adding user defined new tags.
2101         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
2102         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
2103           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
2104
2105 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
2106       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
2107         Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am,
2108         src/Makefile.am : the project should properly compile and install
2109         with the autotools, included the python wrappers part.
2110       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
2111
2112 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2113       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
2114
2115 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2116       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
2117         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
2118         for usage).
2119       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
2120         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
2121         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
2122       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
2123         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
2124
2125 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2126       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
2127         in InstallMode or PreInstallMode but with an environement given
2128         value of GDCM_DICT_PATH.
2129       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
2130
2131 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2132       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
2133       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
2134       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
2135         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
2136         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
2137
2138 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2139       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
2140         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
2141         gdcmHeader.h
2142       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
2143         (as opposed to gdcm.h)
2144       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
2145       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
2146         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
2147       * autogen.sh removed history related references to crea package.
2148
2149 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2150       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
2151         bug.
2152
2153 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2154       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
2155         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
2156         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
2157         of hidding away the python related distutils specific files
2158         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
2159         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
2160         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
2161         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
2162
2163 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2164       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
2165       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
2166         among the list of sources.
2167
2168 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2169       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
2170       * modifications in MSVC projects
2171
2172 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2173       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
2174         looks like we can move back to original usage of exception within
2175         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
2176         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
2177       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
2178         README file for usage added.
2179       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
2180         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
2181         testing the proper parsing of a Dicom related file.
2182         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
2183       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
2184       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
2185         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
2186           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
2187           Dicom public dictionnary were not accessible without an
2188           instance of class gdcmHeader.
2189         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
2190           require no instances at all to be invocated.
2191         - within gdcmDictSet this change required to change some method
2192           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
2193           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
2194       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
2195         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
2196       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
2197         the above to be effective.
2198       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
2199         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
2200       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
2201         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
2202         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
2203         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
2204         (for python dectection).
2205       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
2206         now avoids publishing the empty entries.
2207
2208 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2209       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
2210         ExtraPath reused :-P
2211       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
2212
2213 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2214       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
2215       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
2216       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
2217         and links
2218
2219 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2220       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
2221         method. Doxygenation.
2222       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
2223
2224 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2225       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
2226         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
2227         when using "python setup.py install".
2228       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
2229         reexports the working classes.
2230       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
2231         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
2232         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
2233         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
2234         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
2235         subdir (see the README file). This problem probably due to
2236         an combination of g++ and dynamic loading.
2237       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
2238
2239 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2240       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
2241         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
2242         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
2243         again in a python subdir, but the package itself is now in
2244         python/gdcmPython.
2245       * setup.py was cleaned up:
2246         - pythonIncludePath removed
2247         - python setup.py bdist target is now functional.
2248       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
2249         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
2250         accordingly.
2251
2252 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2253       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
2254       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
2255         distutils installer is operational.
2256       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
2257           shadow classes (from gdcm.py).
2258         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
2259           instead of gdcmPython/demo/load.py.
2260         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
2261
2262 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2263       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
2264         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
2265         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
2266         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
2267         dictionary.
2268         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
2269           are now in the "???" group.
2270         - python/gdcm.i changed accordingly,
2271         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
2272           of the above new functionalities in Python.
2273
2274 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2275       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
2276         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
2277           were definitively removed.
2278         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
2279       * src/gdcmElValSet.cxx:
2280         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
2281         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
2282         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
2283         - Added GetElementByName(string).
2284       * src/gdcmHeader.cxx: added
2285         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
2286         - GetPubElValRepByName(string)
2287         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
2288         - GetShaElValRepByName(string)
2289         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
2290         - GetShaElValRepByName(string)
2291         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
2292         - GetElValRepByName(string)
2293         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
2294         - GetElValRepByName(string)
2295       * Doc/requirements.txt added.
2296
2297 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2298       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
2299       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
2300         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
2301         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
2302         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
2303       * python/testSuite.py changed accordingly.
2304
2305 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
2306       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
2307         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
2308              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
2309               cannot be exported. [...]
2310               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
2311               be exported. [...]
2312               This is caused by a designed limitation that once a template
2313               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
2314               exported."
2315         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
2316         limitation" of VC++ is a pitfall.
2317         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
2318         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
2319         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
2320         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
2321         library.
2322         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
2323       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
2324          dll under windows !!!!)
2325       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
2326       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
2327         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
2328       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
2329         (one) of image(s).
2330       * removed glib references
2331       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
2332
2333 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2334       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
2335         that only displays required tags and testAll.py that parses all
2336         the files of the testsuite without using unittest.
2337       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
2338       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
2339       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
2340         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
2341
2342 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2343       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
2344         values, but limits itself to values which are below a user specified
2345         size (by default 1024 bytes).
2346       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
2347         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
2348         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
2349         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
2350       * python/testSuite.py
2351         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
2352         - two new examples added.
2353       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
2354
2355 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2356       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
2357         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
2358       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
2359       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
2360       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
2361
2362 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2363       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
2364         the vr was also RET.
2365       * python/testSuite.py more tests added.
2366
2367 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2368       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
2369       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
2370       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
2371         7.18 Integer types (see stdint.h)
2372         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
2373       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
2374         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
2375         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
2376         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
2377         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
2378         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
2379         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
2380         The rest of the changes we the necessary adaptations.
2381
2382 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2383       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
2384         VR files.
2385       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
2386
2387 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2388       * Adaptation for porting to VC++:
2389         - src/gdcm.h
2390           o forced to use std namespace (for string to be known)
2391           o all class use __declspec export style on WIN32
2392         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
2393           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
2394       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
2395         variable GDCM_DICT_PATH.
2396       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
2397
2398 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2399       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
2400         to native Python dictionary.
2401       * python/demo/test.py:
2402         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
2403         - takes an optional filename argument (the file to parse).
2404       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
2405         PubElVals hashing table.
2406       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
2407
2408 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2409       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
2410         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
2411       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
2412       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
2413       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
2414         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
2415       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
2416
2417 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2418       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
2419         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
2420         that we can import de shadow classes without errors].
2421
2422 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2423       * hashtest.cxx removed (since allready in Test)
2424       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
2425       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
2426       * src/Makefile prepared for python wrapping
2427
2428 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2429       * src/gdcmHeader.cxx :
2430         - Parsing of header is now separated from loading of element values
2431           (see gdcmHeader::LoadElements).
2432         - general clean up of hopefully all file access (creation of
2433           ReadInt16 and ReadInt32)
2434
2435 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2436       * src/gdcmHeader.cxx :
2437         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
2438           method.
2439         - SetLgrElem renamed to SetLength
2440         - GetLgrElem renamed to GetLength
2441         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
2442       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
2443       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
2444         due to IdoDude was cleaned out.
2445
2446 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2447       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
2448         concentrates on finding the value representation (when it exists).
2449         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
2450         returning the unecessary skL (skipped length).
2451         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
2452         it was redundant with the File position internals (by using
2453         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
2454         jajun.
2455       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
2456         on the libido specificities which are handled through class
2457         inheritance.
2458       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
2459         added.
2460
2461 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2462       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
2463         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
2464
2465 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2466       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
2467
2468 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2469       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
2470         and _IdDcmSWAP_LONG.
2471
2472 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2473       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
2474         May 23 2002. Needless to say we are running late...
2475