]> Creatis software - gdcm.git/blob - ChangeLog
* src/gdcmDocument.cxx: wrong type on return fixed (thanks dashboard)
[gdcm.git] / ChangeLog
1 2004-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2   * src/gdcmDocument.cxx: wrong type on return fixed (thanks dashboard)
3   * CLEANUP_ROUND (14) for gdcmPixelConvert
4     - PixelConvert::GetLutRGBA(FILE*) is now GetLutRGBA() (no fp needed)
5     - PixelConvert::BuildRGBImage()(FILE*) is now BuildRGBImage() (no fp needed)
6     - File::GetImageDataIntoVector() doesn't need unnecessary OpenFile() and
7       CloseFile() anymore.
8     - File::GetImageDataRaw() doesn't call GetImageDataIntoVectorRaw()
9       anymore and hence avoids storing a copy of PixelConvert::Decompressed
10       into File::Pixel_Data.
11
12 2004-10-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
13   * src/gdcmDocument.cxx ftell() return properly stored in a long (i.e.
14     no longer depends on's programmers PMS = Preposterous Mood Swings ;).
15   * CLEANUP_ROUND (13) for gdcmPixelConvert
16     Substituted File::ParsePixelData() with PixelConvert::Print() new
17     method:
18     - src/gdcmParsePixels.cxx removed (only contained File::ParsePixelData())
19     - src/gdcmRLEFrame.cxx, gdcmJPEGFragment.cxx added. Added a ::Print()
20       method to those classes.
21     - src/gdcmFile.[cxx|h]:
22       -- Added a ::Print() method.
23       -- PixelConverter is now a reference instead of a member.
24       -- gdcmPython/gdcm.i: added "using namespace gdcm" in order for
25          gdcm_wrap.cxx to "understand" File::GetPixelConverter()
26
27 2004-10-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
28   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: when dot is present the
29     collaboration diagram and inheritance diagram should be generated with
30     doxygen.
31   * Doc/Website/Sidebar.html: Dashboard is now also in the sidebar.
32   * gdcmPython/gdcm.i: gdcmRLEFramesInfo.h gdcmJPEGFragmentsInfo.h are
33     pointlessly wrapped (see
34     http://www.creatis.insa-lyon.fr/pipermail/dcmlib/2004-October/000692.html )
35   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (sugar is my friend stage)
36     - Header::GetLUTRGBA() moved to PixelConvert::GetLutRGBA()
37     - vtk/vtkGdcmReader.cxx: adapted to displacment of Header::GetLUTRGBA()
38     - Document::RLEInfo and JPEGInfo are now pointer members (Swig thing)
39     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
40       -- File::Initialise: PixelConverter setup moved away to
41            PixelConverter::GrabInformationsFromHeader()
42       -- File::GetImageDataIntoVector(): Lut R + Lut G + Lut B color table
43          interpretation moved away to PixelConverter::BuildRGBImage()
44
45 2004-10-16 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
46   * Remove GDCM_EXPORT keyword from gdcm::DirList due to :
47     http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP
48
49 2004-10-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
50   * src/gdcmDebug.cxx last ditch attempt to get warning/error messages
51     displayed on Win32 when a brutal abort() occurs (because of uncatched
52     exception). See TODO new entry of this commit for more on this.
53   * TODO added new entry.
54   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (nicotine is my friend stage)
55     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
56     - HandleColor is no longer called from gdcmFile.cxx
57     - gdcmPixelConvert.cxx clean up on method arguments and internal
58       variable names for semantical coherence.
59
60 2004-10-14 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
61   * Finished lossless transition, not only do we now read all lossless jpeg
62   images, without the need of the Cornwell lib, but we do read them properly now
63   * To reduce code (well to avoid code duplication), I defined a common place
64   for jpeg read/write: gdcmJpeg.cxx. Now gdcmJpeg[8,12 16] include this file and
65   redefine symbols. This is not prefect but this the best solution I found for a
66   compilation time jpeg option.
67
68 2004-10-13 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
69   * Update jpeg ijg lib to support lossless jpeg implementation
70     For more info look in jpeg/libijg/README.GDCM.txt for necessary steps to
71     reproduce at home.
72   * Also added a special copyright for dcmtk since we use their bugfixes.
73   Thanks dcmtk crew !
74
75 2004-10-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
76   * Doc/Website/MailingList.html added (Sidebar.html changed accordingly).
77   * gdcmPython/gdcm.i: fix for compilation of wrappers (Note: %include order
78     matters, as stated in warning note at begining of %include section).
79   * src/gdcmDicomDir*.[cxx|h]: coding style
80   * src/gdcmDocument.h: doxygen \ref seems uncompatible with \todo.
81   * src/gdcmJpeg8.cxx: doxygen fix.
82   * CLEANUP_ROUND (12) for gdcmPixelConvert (seing the ligth stage)
83     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: color handling moved
84     from File:: to PixelConvert::.
85
86 2004-10-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
87   * CLEANUP_ROUND (11) for gdcmPixelConvert (cafeine is my friend stage)
88     src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]:
89      - more code moved away from File:: to PixelConvert::
90      - fat setup of PixelConverter set in place in File::Initialise.
91
92 2004-10-12 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
93   * Apply patch for namespace in gdcm. Didn't rename files for keeping a sort of
94   namespace at the file system level. So now you should convert your examples
95   like this:
96     gdcmHeader  ->   gdcm::Header
97   It would be nice if people keep in mind to no open the namespace, since it
98   allows compilation on broken plateform which were defining common symbol in
99   the standart namespace (like LP, Unknown ...)
100
101 2004-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
102   * CLEANUP_ROUND (10) for gdcmPixelConvert (Xanax is my friend stage)
103     The JPEG fragments are now parsed at the same stage than the RLE
104     information. All code related to JPEG is now in gdcmPixelConvert:
105     - src/gdcmJPEGFragment.h and gdcmJPEGFragmentsInfo.[h|cxx] added 
106     - src/gdcmJpeg12.cxx, gdcmJpeg2000.cxx and gdcmJpeg8.cxx no longer
107       export a gdcmFile:: method. Those are simply global functions
108       (for the time being this is better than having them attach to
109        either gdcmFile:: or gdcmPixelConvert::).
110     - src/gdcmDocument.[cxx|h], gdcmDocument:: now parser the JPEG fragments
111       and stores the result in a gdcmJPEGFragmentsInfo.
112     - src/gdcmFile.[cxx|h] and gdcmPixelConvert.[cxx|h]: all JPEG related
113       code (among other stuff) moved away from gdcmFile:; to 
114       gdcmPixelConvert::
115
116 2004-10-08 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
117   * src/gdcmCommon.h now declares int8_t for non stdint.h plateforms.
118   * CLEANUP_ROUND (7) for gdcmPixelConvert (lost at sea)
119     - src/gdcmFile.h gdcmPixelConvert.cxx gdcmPixelConvert.h gdcmRLE.cxx:
120       clean up of RLE related code. 
121   * CLEANUP_ROUND (8) for gdcmPixelConvert (end of RLE nigthmare)
122     - src/gdcmRLE.cxx removed
123     - src/gdcmPixelConvert.cxx all RLE code is now in PixelConvert::
124     - src/CMakeLists.txt gdcmFile.[cxx|h] changed accordingly
125     - src/gdcmRLEFrame*.h gdcmPixelConvert is now a friend class.
126   * CLEANUP_ROUND (9) for gdcmPixelConvert
127     - src/gdcmFile.[cxx|h} gdcmPixelConvert.[cxx|h], SwapZone(),
128       ConvertReorderEndianity(), ConvertDecmpres12BitsTo16Bits() moved
129       away from gdcmFile:: to gdcmPixelConvert::.
130
131 2004-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
132   * CLEANUP_ROUND (5) for gdcmPixelConvert (Upshit creek without a paddle)
133     - src/gdcmDocument.[cxx|h] Parse7Fe0 renamed to ComputeRLEInfo.
134       This is because Parse7Fe0 used to parse the pixels to compute the
135       length. This task was passed over to FindDocEntryLengthOB() a long
136       time ago, EXCEPT I had forgotten the OW case...
137       Hence Parse7Fe0 was no longer necessary. When renaming to ComputeRLEInfo
138       we just recylce the code for parsing RLE fragments and computing
139       offsets.
140   * CLEANUP_ROUND (6) for gdcmPixelConvert (man, I need a paddle bad)
141     - src/gdcmRLE.cxx: is now much simpler and avoids code replication
142         with the retired Parse7Fe0().
143     - src/gdcmRLEFrame.h: type fix for properly computing OffSet[]
144     - src/gdcmDocument.cxx: segments offset are now correct + clean up.
145
146 2004-10-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
147   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert (nightmare stage)
148     - src/gdcmRLEFramesInfo.[cxx|h], gdcmRLEFrame.h added
149     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::Parse7FE0 now sets up the RLEInfo.
150     - src/CMakeLists.txt: alphabetic order reodering + new entries.
151   * CLEANUP_ROUND (4) for gdcmPixelConvert
152     - src/gdcmDocument.[cxx|h] ::ParseDES and ::ParseSQ no longer bother
153       to return an unused length.
154
155 2004-10-09 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
156   * Remove all sprintf from the code to centralize in one spot in gdcmUtil
157     this should be cleanner from the plane view. The iostream are erally a pain
158     to use to do simple stuff.
159
160 2004-10-04 Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
161   * Redo the compilation of the ijg jpeg library. Now only one source is
162     necesseray. No need to rename file by hand what so ever. CMake handle the
163     copying of the file within different directory, configure header file to
164     modify some symbol. The only addition made to ijg wasd a mangle table so
165     that symbol are different wether we are within 8bits or 12bits.
166
167 2004-10-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
168   * Added documentation of vtkgdcmReader on Website:
169      - testvtkGdcmReader.cxx renamed to vtkGdcmDemo.cxx (to be compatible
170        with it's binary name).
171      - vtk/vtkGdcmDemo.cxx and vtkgdcmViewer.cxx: added comments for
172        the Website to be more complete.
173      - Doc/doxygen.config.in: vtk/vtkGdcmReader.cxx now appears on 
174        doxygenated documentation.
175      - Doc/DoxyVtkGdcmReaderExamples.txt added
176        (see http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/html.developper/
177                   DoxyVtkGdmReaderExamples.html )
178   * src/win32, vtk/win32 manually maintained .dsp and .dsw removed.
179   * CLEANUP_ROUND (3) for gdcmPixelConvert
180    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
181
182 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
183   * CLEANUP_ROUND (2) for gdcmPixelConvert
184    - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h splitting GetImageDataIntoVectorRaw
185
186 2004-09-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
187   * CLEANUP_ROUND for gdcmPixelConvert:
188     - src/gdcmFile.cxx, gdcmFile.h, gdcmHeader.cxx, gdcmHeader.h clean up
189     - src/gdcmPixelStuff[h|cxx] removed
190     - src/gdcmPixelConvert[h|cxx] added. Preparatory work included.
191     - src/CMakeLists.txt changed accordingly
192   * GDCMHOME clean up:
193     - MANIFEST.in, WrapSwig.py, WrapVTK.py, distutilsWrapping.py and
194       gdcmVersion.py moved to newly created ATTIC related
195       gdcmPython/SetupOldies/ directory.
196   * Autotools clean up:
197     - */*/Makefile.am removed AT EXCEPTION of gdcmPython/Makefile.am
198     - autogen.sh configure.in acinclude.m4 python.m4 removed 
199
200 2004-09-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
201   * src/*.cxx *.h Reference to License.htm fixed to License.html.
202   * Doc/CMakeLists.txt, doxygen.config.in: fix.
203   * Doc/Website/ConformanceSummary.html, minimal conformance statement added.
204
205 2004-09-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
206   * TODO updated with Mathieu suggestions. I proposed a template for
207     describing TODO entries and used it for new entries.
208   * Added Doc/Website/CodingStyle.html, Developpers.html,
209     DeveloppersPython.html, GdcmDataCvs.html and
210     DownloadVersion0_1.html, DownloadVersion0_3.html.
211   * Some Doc/*.txt Doxygen files (which do not really concern the
212     documentation itself, but the website) moved to html and
213     placed in directory Doc/Website:
214     - Doc/DoxyDevelInstal.txt moved to Doc/Website/Developpers.html
215     - Doc/DoxyInstallation.txt moved to Doc/Website/Installation.html
216     - Doc/DoxyIntroduction.txt included in Doc/Website/Main.html
217   * Doc/DoxyfileDeveloppers, DoxyfileUsers, Makefile.am oldies removed.
218   * CMakeLists.txt changed accordingly.
219   * DEVELOPPER spread out in Doc/Website/Developpers.html, CodingStyle.html,
220     DeveloppersPython.html
221   * INSTALL nows refers to Doc/Website/Installation.html
222
223 2004-09-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
224   * Added Doc/Website directory, that contains a first raw version
225     of gdcm Web site.
226
227 2004-09-23 Jean-Pierre Roux
228   * FIX In order not to be poluted any longer by casting problems,
229     the member VoidArea of gdcmBinEntry is now uint8_t* (instead of void *)
230          we can now delete[] it safely  
231   * VoidArea is now called BinArea (less confusing name),
232     and all the methods called ...VoidArea... are now ... BinArea...
233   * class gdcmObject is now called gdcmDicomDirObject (less confusing name)
234
235 2004-09-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
236   * src/gdcmDocument.cxx: gdcmDocument::~gdcmDocument() doesn't clear (nor
237     clear) TagHT, which is an inherited member of gdcmElementSet. It is
238     up to the destructor of gdcmElementSet to clean up TagHt and it's
239     pointed content.
240
241 2004-09-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
242   * Test/CMakeLists.txt: update to follow gdcmData renamings.
243   * src/gdcmCommon.h, gdcmDocument.cxx: doxygen typos
244
245 2004-09-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
246   * ENH: added some utility method that builds a flat dictionnary
247     holding all the Dicom entries contained in the recursive structure
248     of a gdcmElementSet. Refer to add FlatHashTablePrint.cxx for 
249     an example of usage.
250     - src/gdcmDocument.[h|cxx] added BuildFlatHashTableRecurse() and
251       BuildFlatHashTable() that build a flat dictionary.
252     - src/gdcmElementSet.h: added a new private GetTag() accessor.
253       gdcmDocument is now a friend of gdcmElementSet.
254     - src/gdcmElementSet.cxx: clean up.
255     - Example/FlatHashTablePrint.cxx added.
256     - Example/CmakeLists.txt changed accordingly
257
258 2004-09-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
259   * gdcmDocEntrySet::SQDepthLevel and gdcmDocEntrySet::BaseTagKey attributes
260     moved away from gdcmDocEntrySet (since this class is an abstract class
261     acting like an interface). SQDepthLevel and BaseTagKey are now
262     in class 
263     - src/gdcmDocEntrySet.[h|cxx] removal of SQDepthLevel and BaseTagKey
264       and associated accessors. Doxygenation of the class.
265     - src/gdcmSQItem.[h|cxx] SQDepthLevel and BaseTagKey and associated
266       accessors added.
267     - src/gdcmSeqEntry.[h|cxx]: constructor doesn't handle depth anymore.
268       Use SQDepthLevel accessor instead. ::Print() adapted.
269     - src/gdcmElementSet.cxx changed according to changes in gdcmSeqEntry.
270     - src/gdcmDocument.cxx changed accordingly.
271
272 2004-09-13 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
273   * Preparation of writing a gdcmHeader iterator: generalisation of gdcmTagKey
274     - The following is the doxygen comment of the typedef declaration
275       of gdcmagKey in src/gdcmCommon.h:
276            gdcmTagKey is made to old an "universal" (as in URL, Universal
277            Ressource Locator)  key to a gdcmDocEntry i.e. a dicom tag.
278            A dicom tag allways has a group and an element, but a set of tags
279            embeded in various (optionally nested) sequences and sharing
280            the same group and element all share the same (group, element)
281            "identifier". Hence the (group, element) cannot be used as an
282            identifier (in gdcm we shall refer to a "TagKey") of a tag.
283            In order to construct a proper tag identifier (i.e. a key) we
284            consider the following definition of a TagKey:
285            - let Group, Element be the string representation of the
286              group and element dicom tag members,
287            - let ItemNumber be the string representation of the integer
288              index of the considered item number of a sequence,
289            Let the key of a tag embeded in a sequence, noted SeqTag, be
290            the form:
291               /ItemNumber#Group|Element
292            where "/", "#" and "|" are characters acting as separators.
293            Then the general form of a gdcmTagKey is given by:
294               Group|Element<SeqTag>
295            where <SeqTag> means NO or many instances of SeqTag.
296            Hence the gdcmTagKey of a tag not "leaving" in a sequence is the
297            string e.g.
298                0028|1201
299            but the gdcmTagKey of a tag "embeded" is the first item of
300            a sequence, itself nested in the third item of a sequence is the
301            string e.g.
302                0004|1220/2#0008|0082/0#0008|0090
303     - src/gdcmDocEntry.h: added a new Key (of type gdcmTagKey) member, in
304       order to hold the new sequence compatible key. Previously, the 
305       GetKey() method would look in the underlying gdcmDictEntry.
306     - src/gdcmDocEntry.cxx:
307       -- constructor now copies the underlying DictEntry key, in the local
308          Key member.
309       -- ::Print: displays the member Key, instead of the (group, element).
310     - src/gdcmCommon.h: added some comments on typedef gdcmTagKey.
311     - src/gdcmDocEntrySet.h:xi
312       -- ::ParseDES() now setups the gdcmTagKey of the sequence it is parsing.
313       -- now has a new BaseTagKey member.
314       -- STYLE.
315   * src/gdcmValEntry.[h|cxx], src/gdcmBinEntry.[h|cxx]: the member VoidArea,
316     previously a member of gdcmValEntry, moved to gdcmBinEntry were is
317     truly belongs.
318     This poses the problem with the semantics of the following lines
319        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1201);  // R    LUT
320        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1202);  // G    LUT
321        LoadEntryVoidArea(0x0028,0x1203);  // B    LUT
322     in gdcmDocument::gdcmDocument(std::string const & ). Please refer
323     to the long FIXME note for what the problem is. Nevertheless in
324     order to get things working the dicom dictionary was altered !
325     Please fix things urgently...
326   * Dicts/dicomV3.dic WRONGLY altered (this means we introduced a uncorrect
327     information), see above note on moving the member VoidArea. Nevertheless
328     the following entries previously correctly set as US are now inproperly
329     set to OW:
330       0028 1201 OW IMG Red Palette Color Lookup Table Data
331       0028 1202 OW IMG Green Palette Color Lookup Table Data
332       0028 1203 OW IMG Blue Palette Color Lookup Table Data
333   * src/gdcmDocEntry.[h|cxx], src/gdcmSeqEntry.h: SQDepthLevel member
334     of gdcmDocEntry moved to gdcmSeqEntry.
335   * src/gdcmSeqEntry.cxx: STYLE.
336
337 2004-08-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
338   * Test/TestAllEntryVerify.cxx minor fix and added comments.
339
340 2004-08-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
341   * gdcmPython/testSuite.py: all the test suite in python is now moved
342     to it's C++ version (see gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt)
343   * Test/CMakeLists.txt adapted to renaming of files in gdcmData
344   * gdcm/TODO and src/gdcmDictSet.h cleaned up frow the "TODO Swig" oldies
345
346 2004-08-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
347   * gdcmPython/CMakeLists.txt: SWIG_FLAGS doesn't declare includeall
348     to avoid inclusion recursion until STL is reached.
349   * src/gdcmDocument.[h|cxx]: exceptions substituted to errno C-style
350     mecanism. errno.h is not included in gdcm anymore.
351   * src/gdcmException.h: introduced new gdcmFormatUnexpected class
352     (gdcmFormatError now inherits from gdcmFormatUnexpected).
353   * TODO updated
354   * gdcmPython/testSuite.py checks on CR-MONO1-10-chest.dcm moved to
355     gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
356   * Test/TestAllEntryVerify.cxx is now effective (used allways return true)
357   * src/gdcmDocument.[cxx|h]: constructors no longer use the bool
358     exception_on_error parameter.
359     - src/gdcmFile.[cxx|h], src/gdcmHeader.[cxx|h] changed accordingly,
360     - vtk/vtkGdcmReader.cxx changed accordingly,
361     - Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
362
363 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
364   * src/gdcmDicomDir.cxx, gdcmDocEntrySet.cxx: removed inclusion of errno.h
365   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
366     enable_sequences removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
367   * Example/PrintHeader.cxx: fixed accordingly (enable_sequences removal).
368   * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: dummy fix.
369   * src/gdcmDocument.[h|cxx], gdcmFile.[h|cxx], gdcmHeader.[h|cxx]:
370     skip_shadow removed from gdcmHeader constructor and dependencies.
371   * Example/*.cxx and Test/*.cxx changed accordingly.
372
373 2004-07-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
374   * Test/CMakeLists.txt: newly re-introduced SIEMENS_Sonata-12-MONO2-SQ.dcm
375     in gdcmData (previously known as E00001S03I0015.dcm) is blacklisted.
376
377 2004-07-21 Jean-Pierre Roux
378   * FIX Now, Parsing and Printing a DICOMDIR do work!
379        ( troubles remain in makeDicomDir and BuildUpDicomDir :-(
380                  
381 2004-07-20 Jean-Pierre Roux
382   * FIX Some brain damaged headers have Zero-Lenght fields 
383         for 'Transfert Syntax UID', or 'Media Stored SOP Class UID'.
384
385 2004-07-19 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
386    * src/gdcmCommon.h, gdcmDict.cxx, gdcmTS.cxx : bug fix for msvc6 compilation
387    * src/gdcmDebug.[h|cxx] : bug fix for msvc6 compilation. Replace the dbg
388      variable (instance of gdcmDebug) by a definition macro, and the instance
389      is now in static in the gdcmDebug class
390    * src/gdcmSQItem.h : (FIXME) remove an undefined method
391    * Test/PrintAllDocument.cxx : bug fix in the result of the test
392
393 2004-07-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
394    * WARNING: ctest now depends more tightly on gdcmData. You should
395      check out gdcmData properly for things to run smoothly...
396    * src/gdcmDocument.cxx MAX_SIZE_LOAD_ELEMENT_VALUE is set back to 0xfff
397      (4096) for "ctest -R TestAllEntryVerify" to be able to run (i.e.
398      we need the pixels not be loaded in order to use the ValEntry
399      that displays position and size).
400    * Test/TestAllEntryVerify.cxx a new low level test now seems fair.
401      This is a C++ based equivalent of gdcmPython/testSuite.py that should
402      be deprecated. If you have any doubts about the advantages of a
403      modern scripting language (read Python) versus grass root C++ (i.e.
404      without lex + yacc, because of gdcm commitement to MS-VC++, sighhh),
405      I suggest you compare TestAllEntryVerify.cxx (639 lines, without the
406      reference file gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt) and testSuite.py.
407         Anyhow, consider documenting the gdcmData images in 
408      gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt (and please run ctest before
409      commiting changes).
410    * Test/CMakeLists.txt:
411       - now uses TestAllEntryVerify.cxx
412       - specific comments on oldACR00001.ima (now renamed in gdcmData
413         to SIEMENS_GBS_III-16-ACR_NEMA_1.acr) moved away to
414         gdcmData/TestAllEntryVerifyReference.txt
415    * TODO updated.
416
417 2004-07-02 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
418    * src/*.[h|cxx] : typedef clean up
419      - guint16 and guint32 removed. Use ISO C uint16_t, uint32_t instead.
420      - TagKey renamed to gdcmTagKey (for external usage)
421      - VRKey renamed to gdcmVRKey (for external usage)
422      - removal of typedef duplication.
423      - Removed all unecessary inline keyword from class inline definitions.
424      - Some method|function(void) declarations replaced with method|function().
425    * src/jpeg/libijg12/jdhuff12.c:
426       - printf polluting ctest removed.
427       - TAB removal for comminting
428    * Test:
429      - TestAllReadCompareDicom.cxx: added a test that compares all the
430        images in gdcmDataImages.h with corresponding images in 
431        gdcmData/BaselineDicom/. When baseline images are not present
432        this test creates them.
433        Note: we need to validate each reference image, but before that
434              I'd like to rename them with a more explicit name...
435      - CMakeLists.txt: changed accordingly.
436    * Example/*.cxx: examples now only include gdcm.h (as opposed to 
437      including each header needed).
438
439 2004-07-01 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
440    * Test/*.cxx and Example/*.cxx: moved some examples away from the
441      test suite to the Example directory. Are concerned:
442      - PrintHeader.cxx
443      - TestDcm2Acr.cxx
444      - TestFindTags.cxx
445      - TestWrite.cxx was
446      - TestWriteSimple.cxx
447    * Test/CMakeLists.txt: added some comments on reasons for black listing
448      image gdcmData/oldACR00001.ima
449
450 2004-06-30 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
451    * Test/CmakeList.txt: removed the following from black list (to be coherent
452      with removal from gdcmData):
453       - gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.fixed.dcm
454       - gdcm-MR-PHILIPS-16.dcm
455       - US.3405.1.dcm
456      Added the following because after last cvs update, they cause
457        ctest -R TestReadWriteReadCompare 
458      to segfault:
459       - gdcm-MR-SIEMENS-16-1.acr
460       - oldACR00001.ima
461    * Test/TestReadWriteReadCompare.cxx was properly written (with a call
462      to gdcmFile::SetImageData()) BUT since gdcmFile is brain damaged (see
463      new comments in this file) we temporarily (sigh) move to a weaker
464      form of test...
465    * Test/CmakeList.txt: with the change to Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
466      we don't need to black list the following images anymore:
467       - 8BitsUncompressedColor.dcm
468       - OT-PAL-8-face.dcm
469       - US-PAL-8-10x-echo.dcm
470    * src/gdcmDocument.[h|cxx]: RE-Reverting to version 1.42 with the proper
471      fixes and the beautified code ;-)
472      This fixes the bug introduced in version 1.42 (when beautifying)
473      that made the parsing of 8BitsRunLengthColor.dcm unproper.
474      Note: ctest was blind to this bug (this means we need to still
475            improve the test suite). The bug could be detected by using
476            gdcmbin/bin/PrintDocument $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
477            or by using
478            gdcmbin/bin/ReadWrite $GDCM_DATA/8BitsRunLengthColor.dcm
479            and by displaying the (garbage) produced file temp.XDCM...
480
481 2004-06-29 Jean-Pierre Roux
482    FIX : - remove Frog's beautified, but never checked 'Parse7FE0' code,
483          - replace by uggly but working old code :-(
484                 A lot of things should be OK again.
485         It's really urgent to have a test suite that *tests*, 
486         to prevent Frog's beautifying sessions to break all the stuff
487         (twice, withing a fortnigh ...)         
488
489 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
490    * Test/TestWriteRead.cxx and TestReadWrite.cxx merged (because of
491      redundancy) to added Test/TestReadWriteReadCompare.cxx
492    * Test/CmakeList.txt: because the compare test of
493      Test/TestReadWriteReadCompare.cxx fails, the following images are
494      black listed: - 8BitsUncompressedColor.dcm
495                    - OT-PAL-8-face.dcm
496                    - US-PAL-8-10x-echo.dcm
497    * src/gdcmDocument.cxx: for broken (non DICOM V3 conformal) images
498      (e.g. gdcm-JPEG-LossLess3a.dcm see comments in
499      gdcm/gdcmPython/testSuite.py for details) ::FindDocLengthOB() had
500      and ad-hoc kludge. This kludge is now removed, and on encountering
501      such an image (OB field brain damaged) we set errno. Then in 
502      ::FindDocLength() we "fix" the length as being ALL what remains
503      in the file (until EOF). We then proceed, hoping for the best...
504      This fixes a SegFault in ShowDicom when trying to write such an
505      image.
506    * Test/CmakeList.txt: 8BitsRunLengthColor.dcm is now blacklisted
507      (because TestWriteRead breaks on it, after a non conformal commit?).
508      ctest now runs properly, except for MakeDicomDir (which was allways
509      broken) and the Python related stuff (still not fixed).
510    
511 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
512   ADD : Examples/WriteRead, that acts like the former Test/TestWriteRead
513   FIX : Test/TestReadWrite now iterates on all the file names 
514                           (instead of infinite loop)
515   ENH : Test/TestWriteRead now iterates on all the file names 
516
517 2004-06-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
518    * Test/TestReadWrite.cxx: now uses all the images of gdcmData.
519
520 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
521    FIX : - now Write drops LUT Descriptors and LUTs (if any)
522                     when SamplesPerPixel =3
523          - now Write is no longer confused by 
524                               'BitsAllocated = 12" and 'BitsStored=12"
525          - "UN" value representation Elements are now written correctly 
526                (their legth is stored on 4 bytes -just like OB, OW, and SQ-)                                                                    
527    ENH : - now gdcmHeader has its own Write methods 
528                     (in order to split the job that has not to be done 
529                                         for gdcmDicomDir)
530
531 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
532    * Test/PrintAllDocument.cxx: looping on files is now effective. It used to
533      loop on the same image until memory went out. 
534      Note: this means we still have gobs of memory loss in PrintDocument
535    * src/gdcmDocument.cxx: fixes problem on parsing on file
536      gdcmData/16BitsJpegLosslessGrayScale.dcm.
537
538 2004-06-24 Jean-Pierre Roux
539    FIX : Write - All the Sequences and Sequence Item are now written 
540             as 'no length' stuff, and a Sequence Delimitor aor an Item Delimitor
541                                 is added a the end, when necessary.
542             - A lot of brain-damaged images, that were read correctly are 
543                       now written correctly
544                                 - length compatible BinEntry are now loaded correctly 
545                                 (even for odd groups) 
546         Note : only Explicit Value Representation was checked.
547                                 (question : is implicit VR really necessary for gdcm ?)
548
549 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
550    * DEVELOPPER: added a proposition of coding style.
551    * src/gdcmDocEntry.h: removed every inline declaration (for test of 
552      coding style).
553
554 2004-06-23 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
555    * gdcmDocEntry::PrintCommonPart() and ::WriteCommonPart() removed.
556      Use the gdcmDocEntry::Print() and Write() instead.
557    * src/gdcmDocument.cxx: bug fix.
558
559 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
560    FIX : gdcmDocument.cxx
561       - Now we do recognize the JpegLossLess format (there was a misstyping in
562         code 'beautyfication' :-(
563       - Now we automaticaticaly load the Luts, if any
564
565 2004-06-22 Jean-Pierre Roux
566    In order : to write Sequences, whatever their imbrication level, 
567                  : to allow user to create his own Sequences
568         a lot of modif where necessary (adding, moving, or virtualising methods)
569
570 WARNING : save your own sources *before* cvs up !
571         
572         - gdcmBinEntry
573           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
574           
575    - gdcmDocEntry
576           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
577           ADD void gdcmDocEntry::WriteCommonPart(FILE *fp, FileType filetype);
578           
579         - gdcmDocEntrySet
580           ADD virtual void Write (FILE *fp, FileType filetype)=0;
581           ADD   virtual gdcmDocEntry *GetDocEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
582      ADD gdcmDocEntry *GetDocEntryByName(std::string name);
583      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group,guint16 element) = 0;
584      ADD std::string GetEntryByName(TagName name);                       
585      ADD gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
586                                             guint16 element,
587                                             std::string vr     = "unkn",
588                                             std::string fourth = "unkn",
589                                             std::string name   = "unkn"); 
590           ADD gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);                                                                                                 
591      ADD gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);     
592      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
593      ADD gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);   
594      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByName   (std::string Name);
595      ADD gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
596           REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element)=0;
597      REM virtual gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name)=0;
598           
599         - gdcmDocument
600      ADD virtual bool WriteF(FileType type); // New stuff, with recursive exploration           
601      ADD virtual std::string GetEntryByName    (TagName tagName);
602      ADD virtual std::string GetEntryVRByName  (TagName tagName);
603      REM virtual bool Write(FILE *, FileType);
604      REM virtual void WriteEntryTagVRLength(gdcmDocEntry *tag,
605                                         FILE *_fp, FileType type);
606      REM virtual void WriteEntryValue(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
607      REM virtual bool WriteEntry(gdcmDocEntry *tag,FILE *_fp,FileType type);
608      REM virtual bool WriteEntries(FILE *_fp,FileType type);
609      REM virtual std::string GetEntryByName    (std::string tagName);
610      REM virtual std::string GetEntryVRByName  (std::string tagName);
611      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByName  (std::string Name);
612      REM gdcmDictEntry *GetDictEntryByNumber(guint16, guint16);
613      REM gdcmDictEntry *NewVirtualDictEntry(guint16 group, 
614                                             guint16 element,
615                                             std::string vr     = "unkn",
616                                             std::string fourth = "unkn",
617                                             std::string name   = "unkn");
618      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
619      REM gdcmDocEntry *NewDocEntryByName  (std::string Name);
620      REM gdcmValEntry *NewValEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
621      REM gdcmBinEntry *NewBinEntryByNumber(guint16 group, guint16 element); 
622                                                                                                                  
623         - gdcmElementSet
624           ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
625           
626    - gdcmSeqEntry
627           ADD virtual void Write(FILE *fp,FileType filetype);
628  
629    - gdcmSQItem
630      ADD virtual void Write(FILE *fp, FileType filetype);
631      ADD virtual std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);        
632      REM std::string GetEntryByNumber(guint16 group, guint16 element);
633      REM std::string GetEntryByName(TagName name);
634
635    - gdcmValEntry
636          ADD virtual void gdcmValEntry::Write(FILE *fp, FileType filetype); 
637                                   
638 2004-06-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
639     * Test/TestWriteSimple.cxx: fix to gdcmHeader-gdcmHeaderHelper revamping.
640       The default constructor invoked by the line
641          gdcmHeader *f1 = new gdcmHeader( header );
642       was gdcmHeader::gdcmHeader(bool) instead of the expected
643       gdcmHeader::gdcmHeader(std::string const &, bool = false, bool, bool).
644       Hence the parsing wasn't executed... See also below.
645     * src/gdcmHeader.h: the declaration of gdcmHeader::gdcmHeader(bool)
646       as explicit constructor didn't do the trick to fix the above problem.
647       Could anyone explain why ?
648     * src/gdcmBinEntry.cxx, gdcmValEntry.cxx: gdcmBinEntry::Print() now
649       properly calls gdcmValEntry::Print() (that was weed out from 
650       code related to gdcmBinEntry).
651
652 2004-06-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
653     * In order to fix memory leaks:
654      - Test/TestWriteSimple.cxx: added cleaning of free store through
655        some delete calls.
656      - src/gdcmBinEntry.cxx: fix to avoid SegFault.
657      - src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: fixed initialisation in constructor
658        gdcmDicomDir::gdcmDicomDir(bool) [either the constructor itself
659        (through the call to ::AddDicomDirMeta()) or the destructor
660        would crash when deleting uninitialized ::metaElems].
661      - src/gdcmDictEntry.cxx: annotation of ununderstood memory leak.
662      - src/gdcmDocument.cxx:
663        -- ::~gdcmDocument() destructor now cleans up all dictionary entries
664           from dynamic stores.
665        -- ::ParseDES() misplaced deletion of temporary NewDocEntry
666           was causing memory leaks.
667      - src/gdcmSQItem.cxx:
668        -- ::~gdcmSQItem() dummy code cleaned (learned that deletion is
669           cleanly handled with polymophism: sorry but my milage is low).
670        -- ::SetEntryByNumber(string, guint16, guint16) now cleanly allocates
671           a gdcmValENtry, and makes no assumption on type (gdcmDocEntry,
672           gdcmSeqEntry vs gdcmValEntry) of existing entry (when present).
673           This avoids SegFaulting.
674      - src/gdcmSQItem.h: coding style.
675     * Conclusion:
676      - Test/TestWriteSimple still severely sucks. The output image content
677        (when $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm in input) is brain
678        damaged when displayed with vtkgdcmViewer.
679      - on memory leaks: TestWriteSimple leaks really less (see entry
680        of 2004-06-18 in Changelog file for the call to valgrind).
681      - on segfaults: ctest now passes all the tests but one (no more
682        segfaults).
683     * Erroneous leading white fix:
684      - src/gdcmDict.cxx: getline(from,xxx) doesn't remove the leading
685        white[s] (as opposed to from >> xxx, that removes it [them].
686      - src/gdcmTS.cxx: ditto.
687      - gdcmPython/testSuite.py: dirty related kludge removed.
688     * src/*: remaining references to gdcmParser removed.
689     * src/*[cxx|h]: added copy[way]left header.
690
691
692 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
693     * In order to fix writing of dicom files:
694      - Test/TestWriteSimple.cxx: a simpler example of writing.
695      - Test/CMakeLists.txt changed accordingly.
696      - src/gdcmDocument.cxx:
697        -- The destructor now recursilvely removes potential sequences.
698        -- Bug fix in ::IsJPEG2000()
699        -- ::ReplaceOrCreateByNumber(std::string, guint16, guint16)
700           now handles promotion of gdcmDocEntry to gdcmValEntry in a cleaner
701           manner.
702        -- ::GetValEntryByNumber(guint16, guint16) now defined (as opposed
703           to only declared) and build on top of
704           ::GetDocEntryByNumber(guint16, guint16).
705        -- ::SetEntryByNumber() now uses GetValEntryByNumber(group, element)
706      - src/gdcmElementSet.[h|cxx]: added ::RemoveEntry(gdcmDocEntry *)
707        for usage in destructor and treatement of promotion in
708        ::ReplaceOrCreateByNumber().
709      - src/gdcmSQItem.cxx: destructor should better handle his job.
710       Test/TestWriteSimple now runs (or at least it DOES something).
711     * We can now start hutting memory links. A good starting point is:
712       valgrind -q --skin=memcheck --leak-check=yes --leak-resolution=high
713       --num-callers=100 --show-reachable=yes gdcmTests TestWriteSimple
714       $(GDCMDATA_HOME)/012345.002.050.dcm foo.dcm
715
716 2004-06-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
717     * Valgrind note: after Mathieu Malaterre teached me how to read
718       the valgrind FAQ ;-] (see http://valgrind.kde.org/faq.html), I
719       learned that:
720           Using gcc, you can force the STL to use malloc and to free memory as
721           soon as possible by globally disabling memory caching.
722           With 3.2.2 and later, you should export the environment variable
723           GLIBCPP_FORCE_NEW before running your program.
724       By setting GLIBCPP_FORCE_NEW, STL related memory leak messages of gdcm
725       simply vanish (it is still not clear to me, whether this means that
726       STL std::string leaks or if valgrind believes it leaks...).
727     * Fixing of SegFault of Test/makeDicomDir (as shown by ctest or by
728       running bin/gdcmTests makeDicomDir):
729       - src/gdcmDicomDir.cxx: dynamic casting used + clean up.
730       - Test/makeDicomDir.cxx now properly traps empty lists and returns
731         with 1.
732       NOW, makeDicomDir cleanly fails (in ctest terminology) instead of
733       SegFaulting (I drowned in DicomDir related code when trying to
734       understand why the list is empty...).
735     * src/gdcmDocument.h: first BSD license header try.
736     * Doc/License.txt added.
737
738 2004-06-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
739     * src/gdcmDocument.[h|cxx]:
740       - Clean up of the Transfer related predicates. They are now all based
741         on new method isGivenTransferSyntax, that (should) handle properly
742         the padding problem.
743       - general clean up, simplification, and coding style.
744       - Specific clean up of Parse7FE0() (umproperly named actually).
745     * gdcmPython/testSuite.py: an odd temporary kludge introduced.
746
747 2004-06-14 Jean-Pierre Roux             
748    *  gdcmSeqEntry.cxx
749            - fix the display of Sequence Delimitor (SQDepthLevel pb)
750                 - fix the display of SQItem ordinal number
751       - add the GetSQItemByOrdinalNumber method
752                 - remove some useless never written private methods     
753                 
754 2004-06-14 Jean-Pierre Roux
755    * gdcmBinEntry.cxx 
756       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param
757            - ReplaceOrCreateByNumber now returns :
758               a gdcmBinEntry * if a Binary (void *) value is passed as a param
759                    a gdcmValEntry * if a string value is passed as a param
760    * dcmDocument.cxx
761       - SetEntryByNumber now allows setting gdcmValEntry or gdcmBinEntry, 
762               according to the param type (no longer sets a gdcmDocEntry)
763            - GetValEntryByNumber, GetBinEntryByNumber added
764       - NewValEntryByNumber and NewBinEntryByNumber added
765    * gdcmFile.cxx
766       - Pixel Data are now linked to the (7fe0,0010) elements, after reading
767    * gdcmSQItem.h
768       - GetSQItemNumber and SetSQItemNumber added, to provide 
769             a (relative) Item identier inside a given Sequence
770             \warning : some pb remaining around this number
771                                 will be solved asap
772       - AddEntry now takes the Item Number as a param   
773    * gdcmValEntry.cxx 
774       - adding a constructor taking a gdcmDocEntry as an input param    
775
776 2004-06-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
777     * Memory leak hunt with the following command:
778       valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
779                --show-reachable=yes gdcmTests PrintDocument
780       It looks like many (all?) leaks are due to the STL (or a bad usage
781       of the STL. The lines producing the leaks now have a comment with
782       a "MEMORY LEAK" tag: you can retrieve them with 
783           grep "MEMORY LEAK" src/*
784       Here are two typical examples which I can't help fixing:
785       -----
786           #include <string>
787           int main() {
788              std::string name;
789              char * test = "babo";
790              name = test;    //// <--- valgrind detects 960 bytes lost in
791                              ////   call to std::string::operator=(char const*)
792              name.clear();   //// Doesn't help !
793              return 0;
794           }
795       -----
796           #include <string>
797           #include <iostream>
798           int main() {
799              std::string line;
800              std::cout << "Type a bunch of characters followed by RETURN: ";
801              getline(std::cin, line);   //// <--- valgrind dectects a loss
802                                         //// of 1320 bytes in call to
803                                         /// std::basic_istream<>& std::getline<>
804             return 0;
805           }
806       -----
807
808
809 2004-06-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
810     * src/gdcmHeader.[cxx|h]:
811       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*)
812         and related, moved away to gdcmDocument.
813       - Accessors (on the form [Get|Set]Entry*) set up to expose publicly
814         the corresponding protected accessors of inherited class
815         gdcmDocument, removed ! As a consequence gdcmFile had to be 
816         declared friend of class gdcmDocument (see below).
817       - operator< moved to gdcmDocument (in fact it belongs to gdcmDicomDir).
818       - Clean up of undefined or unused methods.
819     * src/gdcmFile.[cxx|h]: added SetEntryByNumber (in order to take into
820       account the changes to gdcmHeader.h).
821     * src/gdcmDocument.h:
822       - gdcmFile is now a friend class (in order to take into account the
823         changes to gdcmHeader.h).
824       - Predicates on the Transfer syntax (of the form Is[JPEG|RLE]*) added
825         (see changes to gdcmHeader.h).
826       - Accessors (reading on the form GetEntry*) are now public.
827       - Clean up of undefined or unused methods.
828     * src/gdcmDocument.cxx:
829       - adaptation to changes to gdcmDocument.h
830       - ::OpenFile now writes a verbose message when file cannot be opened.
831       - some std::string properly set to VRKey
832     * src/gdcmDicomDir.h: historical references to gdcmHeader changed to
833       references to gdcmDocument. 
834     * Test/TestFindTags.cxx: changed accordingly to above changes.
835     * gdcmPython/testSuite.py: adapted to renaming of acr files in 
836       cvs repository gdcmData.
837
838 2004-06-09 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
839     * src/gdcmValEntry.h: member voidArea type changed from char* to void*.
840     * src/gdcmBinEntry.h: member voidArea commented out, since it potentially
841       conflicts with gdcmValEntry::voidArea.
842     * src/gdcmValEntry.cxx: unmatching comment wiped out.
843     * src/gdcmVR.[h|cxx]: added two predicates that partition the possible
844       Value representation between StringRepresentable and BinaryRepresentable.
845     * src/gdcmDocument.cxx: 
846       - method ParseDES: proper indentation restored and usage of
847         gdcmVR::IsVROfGdcmStringRepresentable wired in.
848       - method LoadDocEntry: the fingerprint left in the SetValue() of
849         unloaded entries (length > MaxSizeLoadEntry) had curiously been
850         removed. Reverting to previous code segment with the proper
851         dynamic_cast< gdcmValEntry* >.
852         Note: this was (partially) breaking the python test suite
853               (gdcmPython/testSuite.py) that made usage of the above
854               fingerprint to check presence of "Pixel Data".
855     * src/gdcmDocEntry.h: coding style.
856     * gdcmPython/__init__.py: environement variable GDCM_DATA_PATH is
857       now taken into account.
858     * gdcmPython/gdcm.i: adaptation to the new internal representation
859       of gdcm (exit gdcmParser, hello gdcmDocument).
860     * gdcmPython/testSuite.py: quick and dirty fix for loading vtkgdcmPython
861       on posix.
862     * gdcmPython/demo/PrintHeader.py: doesn't use the gdcmDocument::Print()
863       anymore, but instead prints the loaded Python dictionary.
864     * .... alas, the python testSuite is still broken.
865
866 2004-05-18 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
867     * gdcmPython/gdcm.i : remove useless lines concerning the gdcmGlobal
868       gdcmGlob
869     * gdcmPython/setup.py : replace the use of cvar.gdcmGlob to gdcmGlobal
870     * src/gdcmUtil.h : export methods
871
872 2004-05-16  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
873     * Some more cleanup/enhancement in gdcmPython/CMakeLists.txt getting close
874       to right behavior
875     * Initial addition of automatic python testing
876     * Initial addition of automatic image comparison
877
878 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
879     * src/gdcmCommon.h, gdcmDicomDir.cxx, gdcmFile.cxx, gdcmHeaderHelper.h,
880       gdcmParser.cxx, gdcmParser.h : bug fix for the Microsoft .Net compilation
881
882 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
883      * src/gdcmFile.cxx, gdcmHeader.cxx : bug fix for the msvc compilation
884      * Test/ShowDicom.cxx : bug fix for msvc compilation
885      * vtk/vtkgdcmViewer.cxx : bug fix for msvc compilation
886
887 2004-05-04 Jean-Pierre Roux
888      * ADD Taking into account the 'Dicom Sequences' leads up to introduce
889        new concepts (and new classes) :
890        a 'gdcmDocument' is composed of a set of Doc Entries, that are
891         - elementary gdcmDocEntries (former gdcmHeaderEntries)
892         - Sequence Doc Entries (gdcmSeqEntries)
893        a Sequence is composed of Items.
894        Each item is a set of Doc Entries (this is recursive)
895        The non uniqueness of the 'Dicom tag' is due to this recursivity
896        (never taken into account)
897        Our unability to add a new 'entry' in the header
898        at the proper location (neither in the H-Table (map or multimap),
899        nor in the Chained List is also due to this recursivity.
900        Don't try, right now, to use/modify/compile these new sources :
901        nothing is finished.
902        We just commit all the stuff, 'as is', in order not to loose it.
903
904 2004-05-04 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
905      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix in the setting of file name
906      
907 2004-05-03 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
908      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading a list of files using the
909        file prefix (SetFilePrefix)
910
911 2004-05-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
912      * Add a new test: ShowDicom, for now this is just the c++ version of
913        checkRead.sh, later it will be able to compare the image read against a
914        baseline.
915      * Replace the DEBUG on the stack with a global entry in cmake interface:
916        GDCM_DEBUG, so you can turn verbosity ON/OFF for debug statement.
917
918 2004-04-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
919      * Add an example subdir, with a real example on how to read + write a 
920        dicom image
921
922 2004-04-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
923      * Doc/gdcmUML.xmi added raw UML class view (umbrello format)
924      * Doc/CMakeLists.txt: the main page is now properly differentiated
925        between the developper and user version.
926      * Doc/doxygen.config.in: dropped search related obsolete flags
927      * src/gdcmParser.h, gdcmHeader.h: doxygenation
928
929 2004-04-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
930      * DEVELOPPER: added some helpfull comments for compile/test/install
931        when using cmake.
932
933 2004-04-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
934      * ENH: 1. Remove remp solution of gdcmTests.cxx+ gdcmMain directly in 
935                src directory, now generated in the build dir.
936             2. Tests as mentionned smarter
937             3. Some clean up
938             4. Add a new method in gdcmDict that return the PubDict by name 
939           this is interesting for 3rd party lib like ITK, 
940           where we could set the institution name / patient name...
941
942        * ENH: 1. Now the test suite is working for real
943               2. All binaries are now output in the gdcm-bin directory 
944                  (this was not true before)
945
946 2004-04-28  Jean-Pierre Roux
947      * ENH add the provisional  gdcmHeader::SQDepthLevel to allow 
948            SeQuence indented printing of Dicom Header.
949      * ENH merge methods gdcmParser::Parse and gdcmParser::LoadHeaderEntries
950            into the single gdcmParser::LoadHeaderEntries for efficiency purpose.
951            Computation of SQDepthLevel is now part of gdcmHeader constructor
952      * ENH add self defined param 'new' to PrintHeader to 'show' the SeQuence
953            tree-like structure of a Dicom Header.
954      * FIX Test code cleaning     
955            
956 2004-04-25  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
957      * ENH: Adding automatic testing
958        1. Need a DartConfig.cmake to submit to public
959        2. Add a test driver gdcmTest.cxx
960        3. gdcmTestMain, an helper for the main test driver gdcmTest
961        4. Files in Test don't have a main anymore, this becomes interesting 
962           when we add more and more tests, thus dsw don't have to load 
963           too many projects
964      * ENH: Adding a GDCM_DATA_ROOT for testing
965      * ENH: Remove redundancie about GDCM_DICT stuff, now we only need to modify
966        one file instead of seven + some small cleanup
967
968 2004-04-22  Jean-Pierre Roux
969      * ENH Minor changes to the Print() methods.
970      * ADD gdcmParser::PrintEntryNiceSQ() to allow SQ-indented
971            Header printing. Example given with :
972            > PrintHeader fileName  2 new
973           (SQ based tree-like structure still to be done for the Header ...)
974            
975 2004-04-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
976      * ENH: Some cosmetic clean up for compilation with -W -Wall -Werror
977          1. I have added some unsigned where needed
978          2. Some function parameter not used -> (void)
979          3. In gdcmDicomDir.cxx, add GDCM_DICOMDIR_NONE case
980          4. g++ don't like character '\' in comment
981          5. #define jpeg_create_decompress  jCreaDecompress
982                     this really need to be fixed
983          6. virtualize destructor of gdcmObject ... leakage
984          7. sscanf(g->first.c_str(),"%x",&gr_bid); 
985                     this also really need to be fixed
986          8. gdcm/src/jpeg/libijg8/CMakeLists.txt, 
987                     remove compression file 
988                     (as we only do decompression, right ?)     
989      * ENH: Change malloc/calloc/free with c++ equivalent
990
991 2004-04-21  Jean-Pierre Roux
992      * FIX gdcmHeaderHelper::GetXSpacing
993            when a single value is found (bug ?), xpacing is now 
994            defaulted to yspacing
995            
996 2004-04-19  Jean-Pierre Roux
997      * ADD gdcmData/Wrist.pap (PAPYRUS 3.0 -single frame-) for checking purpose
998      * ENH add parameters :
999                bool  exception_on_error = false, 
1000                bool  enable_sequences   = false,
1001                bool  ignore_shadow      = false
1002            to the gdcmFile constructors to be full gdcmParser compliant
1003      * FIX vtk/vtkGdcmReader.cxx now uses  enable_sequences = true in gdcmFile
1004            to allow reading of PAPYRUS 3.0 files 
1005               
1006 2004-04-06  Jean-Pierre Roux
1007      * ADD gdcmData/E00001S03I0015.dcm for SQ checking purpose
1008      
1009 2004-04-02  Jean-Pierre Roux
1010      * ADD : Test/checksequence.sh, for a general recap on SQ pb
1011      * FIX : gdcmParser::WriteEntryTagVRLength emprovement of special treatement
1012              for Philips spurious Tag fffe|0000 while rewritting Dicom files
1013              
1014 2004-03-30  Jean-Pierre Roux
1015      * FIX gdcmParser::ReplaceOrCreateByNumber shouldn't seg fault any more 
1016          for ACR file, written out as DICOM files (hope so...)
1017
1018 2004-03-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1019      * src/gdcmParser.[cxx|h] and gdcmHeader.[cxx.h]: gdcmHeader::Write split
1020        in WriteEntryTagVRLength and WriteEntryValue. Those methods were
1021        moved to base class gdcmParser and only the specialisation is kept
1022        in gdcmHeader.
1023      * src/gdcmParser.[cxx|h]: ReplaceOrCreateByNumber(char*, guint16, guint16)
1024        trashed out (because ReplaceOrCreateByNumber(string, guint16, guint16)
1025        already does the job.
1026      * src/gdcmDicomDir.[cxx|h]: WriteDicomDirEntries renamed to WriteEntries
1027        (to be consistent with gdcmParser::WriteEntries).
1028
1029 2004-03-30 Benoit Regrain
1030      * vtk/vtkGdcmReader.[h|cxx] : fix the read of 3 gdcmHeader when making an
1031        upate of the object's instance. It's passed to 2 in the unfavorable
1032        case : one in the ExecuteInformation, one in the ExecuteData
1033
1034 2004-03-29  Jean-Pierre Roux
1035      * ENH : Check on file type to be written moved
1036              from gdcmParser::WriteEntry to gdcmParser::WriteEntries
1037      * FIX : gdcmObject::ResetBoundaries now stops properly
1038              when end-of-list is reached
1039            : gdcmVersion modified (as Benoit Regrain asked)
1040
1041 2004-03-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1042      * src/gdcmParser.cxx: removal of all TAB character. Indentation fixed.
1043      * src/gdcmUtil.cxx: added forgotten iostream include.
1044      * src/gdcmCommon.h: FileType enum entry DICOMDIR removed (since
1045        equivalent to ExplicitVR in existing code).
1046
1047 2004-03-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1048      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmGlobal.[cxx|h]
1049        now contains all the gdcmGlobal related code.
1050      * minor coding style and doxygenation changes.
1051
1052 2004-03-26  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1053      * src/gdcmUtil.[cxx|h] split in two. Additional file gdcmDebug.[cxx|h]
1054        now contains all the Debug related code.
1055      * minor clean-up of includes in src/*.cxx
1056      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _cleanString C style function (replaced with
1057        CreateCleanString) removed.
1058      * src/gdcmUtil.[cxx|h] _CreateCleanString renamed to CreateCleanString
1059      * Doc/DoxyMainPageUser.txt added.
1060      * Doc/Doc/DoxyfileUsers updated to version 1.3.4 of Doxygen.
1061      * src/gdcmCommon.h now defines getcwd for Win32 (moved away from
1062        src/gdcmDirList.cxx)
1063
1064 2004-03-24  Jean-Pierre Roux
1065      * FIX a lot of little surface modifications to be doxygen 1.3.6 compliant
1066
1067 2004-03-23  Jean-Pierre Roux
1068      * FIX Now gdcmFile::SwapZone doesn't seg faults any longer for
1069            big endian made volumes
1070      * ENH Now gdcmParser constructor and destructor are protected to forbid
1071            end user to instanciate class gdcmParser
1072           (only gdcmHeader and gdcmDicomDir are meaningfull)
1073
1074 2004-03-22 Benoit Regrain
1075      * FIX : src/gdcmDicomDir.cxx : make windows compilable
1076      * FIX : gdcmPython/gdcm.i : change gdcmStudy to gdcmDicomDirStudy and
1077              gdcmSerie to gdcmDicomDirSerie
1078
1079 2004-03-19  Jean-Pierre Roux
1080      * ENH Now the tree-like structure describing a DICOMDIR comming from
1081            an already existing DICOMDIR file is consistent with
1082            the home-made tree-like structure build ex-nihilo
1083            or build from the files held (recursively) in a Directory
1084            functions gdcmDicomDir::CheckBoundaries()
1085            gdcmObject::SetBoundaries() added
1086
1087 2004-03-17  Jean-Pierre Roux
1088      * REM (Eric Boix bug) : removal of meaningless
1089                              gdcmDicomDirImage::NewImage function.
1090      * FIX now file names and directory name are written properly in the
1091            DICOMDIR
1092      * FIX now gdcmDicomDir constructor may be call without any trick
1093            about the name
1094
1095 2004-03-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1096      * FIX (JPR bug) : src/gdcmDicomDirImage.cxx added missing definition
1097                        of gdcmDicomDirImage::NewImage as empty function.
1098
1099 2004-02-28  Jean-Pierre Roux
1100      * ENH add gdcmDicomDir:NewPatient
1101            add gdcmDicomDirPatient:NewStudy
1102            add gdcmDicomDirStudy:NewSerie
1103            add gdcmDicomDirSerie:NewImage
1104            to allow making gdcDicomDir object.
1105      * ADD PrintDicomDir executable that uses gdcmDicomDir tree-like structure
1106           (as opposite to the gdcmHeader chained list)
1107
1108 2004-02-11 Benoit Regrain
1109      * FIX : memory leaks and the set of ArgDelete methods in gdcmDicomDir
1110              when using from python
1111
1112 2004-02-10 Benoit Regrain
1113      * FIX : bug fix in the gdcmDirList for the recursivity in directories
1114      * FIX : in gdcmDicomDir when the directory is empty
1115      * ENH : add callback and methods to get the progression of dicomDir
1116              directory parsing
1117
1118 2004-02-06 Jean-Pierre Roux
1119      * ENH : - now gdcmDicomDir::CreateDicomDir() returns also the meta elements
1120              - GDCM_META added to gdcmDicomDirType
1121              - class gdcmMeta created
1122      * ENH : - A brief summary is now displayed at the beginning of
1123              'testDicomDir' to help disaster magnitude estimation
1124      * REM : Now useless Test/explDICOMDIR.cxx
1125
1126 2004-02-05 Benoit Regrain
1127      * ENH : add methods in gdcmObject to get the hash table or the list of
1128              header entries
1129      * FIX : wrapping python for ListPatient, ListStudy, ListSerie, ListImage
1130      * FIX : wrapping python for TagHeaderEntryHT
1131
1132 2004-02-04 Benoit Regrain
1133      * FIX : even length for some strings when writting the dicom dir
1134      * FIX : sort the images in the dicom dir
1135      * FIX : Bug fix for python use of dicom dir
1136      * ADD : a python demo
1137
1138 2004-02-04 Jean-Pierre Roux
1139      * FIX : Final solution (?) for icone embedded images
1140      * FIX : dicomVR.dic Overlay group is not *only* 6000, but 60xxx
1141              (see http://medical.nema.org/dicom/2003/03_06PU.PDF)
1142              add groups 6002, 6004, 6006, to allow 'clean' parsing of
1143              gdcmData/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr1
1144      * ENH add gdcmData/checkWriteExplicit.sh gdcmData/checkWriteImplicit.sh
1145            to make full checking easier
1146         
1147 2004-02-04 Benoit Regrain
1148      * FIX : WriteEntries : coding style & logic in parameters
1149      * FIX : Set the elements to create the DicomDir in a dictionary file
1150
1151 2004-02-03 Benoit Regrain
1152      * gdcmDirList : to parse a hard drive directory in recursive (or not)
1153      * gdcmDicomDir : add the load of directory
1154      * Bug fix and print add-on
1155
1156 2004-02-03 Jean-Pierre Roux
1157      * ENH gdcmParser : allows "DICM" files, with NO group '0002'
1158      * FIX handling 'non string elements' unsecure area (LUT, overlays, etc)
1159      * FIX Dicts/dicomV3.dic : Add a few missing 'group length' Elements 
1160      * FIX gdcmParser.cxx : 'group length' elements are now considered 
1161            as integers, even for shadow groups, when file is Implicit VR
1162         
1163 2004-02-02 Jean-Pierre Roux
1164      * FIX : gdcmWrite : equal_range() for multimap doesn't return a 'second' 
1165              iterator on last
1166              of the last synonym :-(
1167      * FIX : gdcmWrite::WriteBase : method stops if Pixels not yet Read (except 
1168              for DICOMDIR ;-)
1169      * ENH gdcmData/checkWrite.sh :modif for full check of Explicit VR writting
1170      * FIX taking into account the possible 7fe0,0010 multiplicity        
1171      * FIX add GRPixel,NumPixel,countGrPixel (gdcmParser protected members)
1172            to allow removal of references to 7fe0,0010, to deal with
1173       ACR-NEMA images, when 0028,0200 is meaningfull
1174
1175 2004-01-31 Jean-Pierre Roux
1176      * FIX gdcmParser::WriteEntries : when a VR is tagged as 'Unknown'
1177            no longer writes 'Un' on disk
1178      * FIX SQ elements with actual length are now dealt with corectly
1179      * FIX gdcmFile::WriteBase make the difference, for color images, between
1180            the length (for Palette expanded images)
1181            and Raw Length (non expanded image + Palette)
1182      * FIX Dicts/dicomV3.dic : removal of 'CTX' (context dependant) VR
1183            (that broke Write). Replaced by UL.
1184            Aware user will reload the field if he 
1185            thinks it's necesssary
1186              
1187 2004-01-30 Jean-Pierre Roux
1188      * gdcmParser::CheckSwap() now defaults the filetype to ACR 
1189        when 'dirty Acr' is found, to be compliant with the new 
1190        IsReadable() methods.
1191        
1192      * gdcmHeaderHelper :add Pixel Type 'FD', for dealing with 'double' images.
1193       (no DOUBLE images in kosher DICOM, 
1194       but so usefull for people that miss them ;-)
1195       
1196      * add Test/testDicomDir.cxx, Test/makeDicomDir.cxx , Test/explDICOMDIR.cxx
1197        DICOMDIR related utilities (not checked as Windoze compliant)
1198
1199 2004-01-28 Jean-Pierre Roux
1200      * upgrade GdcmHeaderEntry Print Method for DICOMDIR
1201
1202 2004-01-27 Jean-Pierre Roux
1203      * gdcmParser constructor has a new boolean param,'ignore_shadow', 
1204              to allow skipping the shadow elements, to save memory space.
1205         The TRUE value for this param has to be used 
1206         with a FALSE value for the 'enable_sequence' param.
1207         ('public elements' may be embedded in 'shadow Sequences')
1208      * gdcmHeader methods now deal with 'embedded icones images' in the header
1209              (even when an 'icone image sequence' is announced by the 
1210         element (0x0088,0x0200), but there is NO icone at all ...
1211         
1212      * gdcmHeader sometimes Image Location value doesn't follow  
1213              the supposed processor endianity (see gdcmData/cr172241.dcm).
1214              Fixed
1215
1216      * gdcmHeader add the method
1217              IterHT  GetHeaderEntrySameNumber(grPixel,numPixel);
1218         to get *all* the Header Entries with the same tag.
1219         GetHeaderEntrySameName is probabely *useless* 
1220         (no meaning : Name is *not* an identifier within the Dictionnary)
1221
1222 2004-01-26 Benoit Regrain
1223      * Bug fix in the print of hexadecimal representations. Remove long fields 
1224        in the print and add a third level of print to print them
1225
1226 2004-01-23 Benoit Regrain
1227      * Bug fix on field having a VR = 'UI'. Assume that is a string field
1228      * Bug fix on test suite after remove the strip made on not string fields
1229      * Split the IsReadable method between gdcmParser which test that the file
1230        is dicom and gdcmHeader which test that it's an image file
1231
1232 2004-01-22 Benoit Regrain
1233      * DicomDir : clean code, add methods, set variables in protected or private
1234      * gdcmUtil : bug fix for the clean string method
1235
1236 2004-01-19 Benoit Regrain
1237      * Add the use of shadow dictionaries
1238      * bug fix and coding style
1239
1240 2004-01-19 Benoit Regrain
1241      * src/gdcmFile.cxx : bug fix concerning the close of file
1242      * src/gdcmParser.[h|cxx] : remove obvious Pub informations
1243      * Add the update of header entries using the shadow library
1244
1245 2004-01-19 Benoit Regrain
1246      * removal of file gdcmHeader2.cxx
1247      * split class gdcmHeader into gdcmParser and gdcmHeader, with gdcmHeader
1248        inheriting from gdcmParser. This split is to prepare the integration
1249        of dicom dir parsing
1250      * bug fix under python
1251
1252 2004-01-16 Jean-Pierre Roux
1253     * REM removal of class gdcmHeaderEntrySet
1254     * REM removal of files gdcmHeaderEntrySet.cxx, gdcmHeaderEntrySet.h
1255     * ADD add file gdcmHeader2.cxx 
1256     * ADD add method gdcmHeader::SetPrintLevel (for PrintHeader)
1257
1258 2004-01-15 Benoit Regrain
1259      * src/gdcmDicSet.[h|cxx] : add virtual entries to have a reference of
1260        entries created while parsing the header. Thus, they will be destroyed
1261        when the gdcmDictSet will be destroyed
1262      * src/gdcmHeader.cxx, gdcmHeaderEntrySet.cxx : uses virtual entries of
1263        gdcmDictSet
1264
1265 2004-01-15 Benoit Regrain
1266      * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix : before, with python only, the program
1267        made a fatal error because of the memory release at the end of program.
1268        The problem was in vtkGdcmReader::ExecuteData where we were allocate
1269        some memory and vtk seems to have some problems with that.
1270      * src/gdcmHeaderEntrySet.cxx : bug fix for std lib and cout
1271
1272 2004-01-14 Benoit Regrain
1273      * src/gdcmHeaderEntry.[h|cxx] : gdcmElValue -> gdcmHeaderEntry
1274      * src/gdcmHeaderEntrySet.[h|cxx] : gdcmElValSet -> gdcmHeaderEntrySet
1275      * src/*.[h|cxx] : make changes due to class name changes
1276      * gdcmPython/demo/*.py : bug fix due to method names
1277
1278 2004-01-13 Benoit Regrain
1279      * src/*.[h|cxx] : coding style
1280      * vtk/*.[h|cxx] : coding style
1281
1282 2004-01-13 Benoit Regrain
1283      * gdcmPython/testSuite.py : test the readable flag of file for tests
1284      * src/gdcmDict.cxx, gdcmElValSet.cxx : bug fix under windows for prints.
1285        It's lied to the stl compilation by MSVC (windows, always windows...)
1286      * src/gdcmIdo.h, gdcmHeaderIdo.cxx : remove the Ido unused files
1287
1288 2004-01-12 Benoit Regrain
1289      * src/*.h : add comments
1290      * src/gdcmDictSet.h : set the method BuildDictPath in public
1291      * src/gdcmTS.cxx, gdcmVR.cxx : use now a dictionnary file other than to be
1292        directly setted in the source code
1293      * Dicts/dicomTS.dic, dicomVR.dic : 2 new dictionnary files loaded by
1294        gdcmTS and gdcmVR
1295
1296 2004-01-09 Benoit Regrain
1297      * gdcmPython/gdcmVersion.py : add a gdcmVERSION variable information
1298      * setup.py : use a reference to gdcmVERSION
1299
1300 2004-01-07 Benoit Regrain
1301      * Modification to compile with the distutils.
1302      * Bug fix in code
1303
1304 2003-12-10 Benoit Regrain
1305      * gdcmHeader is now aggregating gdcmFile, and not derived into. Thus, we
1306        can use a gdcmHeaderHelper to load datas
1307      * gdcmPython/testSuite.py : make the testSuite compliant with modifications
1308        made in the source code
1309
1310 2003-12-10 Benoit Regrain
1311      * Update Windows projects and .cvsignore files
1312
1313 2003-11-12 Jean-Pierre Roux
1314      * ENH gdcmHeader constructor has one more parameter (default value : false)
1315            that allows the user to 'go inside' the SeQuences only
1316            if he wants to.
1317            gdcmElValSet:Print takes it into account
1318
1319 2003-11-12  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1320      * ENH: Update gdcmPython/CMakeLists
1321      * FIX: (gdcmHeaderHelper) GetRescale and GetSlope
1322      * FIX: (gdcmElValSet) char 'tag' was overiding private members (VC++)
1323
1324 2003-11-10 Jean-Pierre Roux
1325       * FIX : gdcmHeader::LoadElements is now based
1326              on the ListTag listElem member,
1327              not longer on the TagElValueHT tagHt member
1328       * ENH : PrintPubElVal shows (temporarily) both results,
1329              with the tagHt member and the listElem member.
1330              (it's easier to 'see' the problems when using Printheader)
1331
1332       * FIX : old private member LgrElem is now splitted into
1333              ReadLength   : Length actually found on disk (updated only
1334                             if bug fixing is necessary), for internal
1335                             use only
1336              UsableLength : Updated by FixFoundLength, to fix a bug
1337                             or to allow Parser going on.
1338              Will allow to re-write a kosher header when a SeQuence
1339              with a length (not 0000) is found
1340       Warning : gdcmFile::Write still uses the TagHt (not ListElem)
1341                 because gdcmElValSet::Add does not update ListElem
1342                 (to be written)
1343
1344 2003-11-07 Jean-Pierre Roux
1345      * FIX misstyping in Transfert Syntax name table
1346      * ENH gdcmHeader::FixFoundLength now allow to 'go inside' tge SeQuences
1347           when they have an actual length (not 0000 nor FFFFF)
1348      (Nobody should care of it, but DICOMDIR explorers)
1349
1350 2003-11-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1351      * ENH: vtkgdcmViewer now works with LUT dicom (OT-PAL-face ...)
1352
1353 2003-11-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1354      * ENH: vtkGdcmReader now supports LUT !
1355           (vtkgdcmViewer for now is not able to use them though)
1356
1357 2003-11-05 Jean-Pierre Roux
1358      * in testSuite.py : new files names for checking the package
1359      * FIX : Forgot to commit gdcmFile::GetImageDataSizeRaw();
1360              that returns the pixel area size to the *aware* (vtk) user
1361              that DOESN'T want to turn the PALETTE COLOR image into an RGB image
1362
1363 2003-11-05 Benoit Regrain
1364      * in testSuite.py : Modify the rules for checking the paths
1365                        : Explicit error messages
1366      * in __init__.py  : Related modif
1367
1368 2003-11-03 Jean-Pierre Roux
1369      * add gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponentsRaw()
1370            to be used by aware (vtk) users that want to manage
1371            LUT (and no to turn the PALETTE image into an RGB pixels one)
1372      * GetPixelType now returns 8U for 24 Bits images
1373                     (vtkGdcmReader compliant)           
1374       
1375 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1376      * Removal of *all* gdcmData images and add them again
1377        in order to loose the 'history' of un-anonymised images
1378        
1379 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1380      * RMV : removal of useless jBitsInJsample.h 
1381            for both 8 and 12 Bits JPEG Lossy Libraries
1382
1383 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
1384      * ENH : Add the functions gdcmFile::GetImageDataRaw 
1385                                gdcmFile::GetImageDataIntoVectorRaw
1386              that act as GetImageData and GetImageDataIntoVector
1387              except the making of an RGB Plane from Gray Plane + LUT
1388              Intended to aware (vtk) users who know how to manage
1389              such an image :
1390              After gdcmHeader :
1391               GetLUTRGBA return a R,G,B,A LUT if any
1392               lgrTotaleRaw gives the 'Raw' length
1393               GetImageDataRaw returns the gray Plane
1394      * FIX : no more dirty trick for 'Segmented xxx Palette Color Lookup' images
1395              (They stay Grey, just like with other Dicom viewers :-(
1396
1397 2003-10-30 Jean-Pierre Roux
1398      * FIX : a VC++ intended syntax modif broke the 12/12 Bytes expanding
1399              
1400 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1401      * ENH: Can be used like this '$vtkgdcmViewer *.dcm' with *.dcm 
1402            being coherents dicom files.
1403      
1404 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1405      * FIX: DOH ! Forgot about windo$e users, they couldn't read lossless jpeg,
1406            from medcon lib !
1407      * ENH: Turn it into DOS file type to match libgdcmijpeg8.dsp file type 
1408      * ENH: Two steps is necessary to please VC++ compiler...
1409      * FIX: DOH ! libgdcmijpg8 -> libgdcmljpeg
1410      * ENH: Add include dir to medcon lib
1411      * FIX: only one function is being exported for now ! 
1412            You should use GLOBAL(return type) see ljpg/jpeg.h for more info
1413             
1414 2003-10-29 Jean-Pierre Roux
1415       * adding  gdcmHeader::GetLUTRGBA
1416         returns a 4 * 256 Bytes Reg/Green/Blue/Alpha vtk compliant LUT
1417           --> Mathieu, the modif u're waiting for is not yet committed
1418       * removal of now useless GetLUTRed,GetLUTGreen,GetLUTBlue,GetLUTRGB
1419
1420 2003-10-27 Jean-Pierre Roux
1421       * adding some xmedcon breaker files (courtesy of Loïc Boussel)
1422         00191113.dcm DermaColorLossLess.dcm
1423         MxTwinLossLess.dcm RadBWLossLess.dcm
1424       * ENH: For version prior to vtkImageViewer2 -r 1.19
1425       * FIX: avoid pb with xmedcon-breaker CT McTwin Elscint images
1426
1427 2003-10-27  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1428       * Removal of ido stuff in CMakeLists.txt
1429                                                
1430 2003-10-24  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1431       * ENH: vtkGdcmReader.cxx can now read multiframe dicom
1432       * FIX: remove a call to ->Modified ... see comments
1433       * FIX: vtkgdcmViewer.cxx was writting ASCII file...this is so slooooow !
1434       
1435 2003-10-23  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1436       * FIX: Problem with path for libvtkgdcmPython
1437       * ENH: Try adding a search script for python site-package
1438       * RMV: Remove some file from medcon lib that are not necessary
1439       * FIX: gdcm/Makefile.am fix for generating ljpg medcon
1440       * ENH: CMakeLists.txt now generate 'pygdcm.so' instead of 'libpygdcm.so'
1441       * FIX: More pragma disable fro VC++, 
1442              I don't think I break something as it is also disable in VTK/ITK.
1443         But it fasten debug compilation time.
1444             
1445 2003-10-23 Jean-Pierre Roux
1446       * gdcm now deals with 16 Bits Run Length Encoded images
1447         (they are compressed as 2 planes images, 
1448          one for the high Bytes, the other for low Bytes)
1449
1450 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
1451       * Now CheckRead takes into account :
1452          - the bugged 'Leonardo' Siemens images
1453          - the XA images, sent thru the burning VPRO station
1454       * add I9000001.dcm, a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
1455        (breaks DicomWorks)
1456
1457 2003-10-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1458       * FIX: When copying a Makefile.am to CMakeLists.txt 
1459              one should remove the '\'
1460         
1461 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
1462       * in gdcmData adding a bugged 'Leonardo' Siemens image 
1463         (wrong lengths in header)
1464         OK with gdcm, KO with the other viewers :-)
1465       * add a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
1466         (breaks DicomWorks)
1467
1468 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1469       * in gdcmData add the checkvtkgdcmViewer.sh shell script 
1470         for a brutal checking of vtkgdcmViewer compliance
1471
1472 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1473       * add the files for 'xmedcon' Jpeg Lossless library
1474       * call of 'xmedcom' Jpeg Lossles libray (instead of the old LibIDO one)
1475
1476 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1477       * 'Compacted Files' (12 Bits Allocate, 12 Bits Stored) are now dealt with
1478      
1479 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
1480       * garbage Siemens 'Leonardo' images dealt with
1481         (the patch is easy to remove)
1482       * cosmetic changes to avoid warnings
1483       
1484 2003-10-20  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1485       * ENH: vtkgdcmViewer now autoscale color/window level on start-up, 
1486         no need to press 'r' now.
1487    
1488 2003-10-20  Jean-Pierre Roux
1489       * upgrade of checkRead.sh checkWrite.sh according
1490         to new Jpeg Lossless decompressor
1491       * add US.3405.1.dcm, a genuine RGB medical file ...
1492       * add gdcm-ACR-LibIDO.acr, unnormalized Rectangular LibIDO format image
1493       * add CLIP0001-Sequoia-U11.dcm, US 'Clip', from SEQUOIA machine,
1494                                                   UNIT 11, Hop Cardio              
1495 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
1496       * general anonymisation in gdcmData
1497       * adding the 'color files' from
1498         http://www.leadtools.com/SDK/Medical/DICOM/ltdc19.htm
1499       * adding some well knowed bugged-header images
1500       * adding checkRead.sk, checkReadColor.sh, checkWrite.sh,
1501         waiting for their inclusion in Python testsuite
1502
1503 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
1504     * gdcmHeader::gdcmHeader(const char *InFilename, bool exception_on_error)
1505       no longer seg faults when file is not found
1506
1507 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
1508      * Emprovement of reading for Dicom encapsulated Jpeg LossLess 
1509        MultiFrame images
1510
1511 2003-10-14  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1512      * TODO: *.in file to genereate a UseGDCM later
1513
1514 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
1515      * Some supposed-to-be Dicom Images have no preamble.
1516         OpenFile takes it into account
1517      * Jpeg LossLess 24 Bits images doesn't break any longer gdcm
1518      * Missing elements added in dicomV3.dic
1519       (just to be affraid : have a look at
1520        ftp://medical.nema.org/medical/dicom/2003/01v03dif/01v03_06.pdf
1521        and do it again next year ;->
1522
1523 2003-10-13  Jean-Pierre Roux
1524      * According to PS 3.3-2003 C.11.1.1.2 p 619, when each pixel of 
1525        a PALETTE COLOR is stored on 2 Bytes, theese 2 Bytes must be equal.
1526        But there are NOT. It's fixed !
1527        
1528 2003-10-13  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1529      * FIX: "jpeglib.h" was not found on VC++
1530      * FIX: vtkgdcm was not being installed 
1531          
1532 2003-10-10  Jean-Pierre Roux
1533      * ENH : OpenFile closes the file if it *really* doesn't look like
1534              an ACR-NEMA / DICOM one.
1535      * FIX : testWrite no longer writes an empty file if the source file     
1536              is not gdcm Readable
1537      * ENH : One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" 
1538              is now decoded.
1539         
1540 2003-10-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1541      * FIX: CMake generate now documentation
1542      * ENH: out of source doc build !
1543      * ENH: Generate both user and dev documentation
1544      * ENH: Should work on windows too
1545      * ENH: Only one doxygen config.in file is needed 
1546      * FIX: make install should be ok now on Ã¹nix plateform
1547      * FIX: PATH to dictionary was wrong (missing /)
1548      * ENH: OpenFile, return true if the file looks like an ACR or DICOM file 
1549                      
1550 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1551      * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
1552      * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
1553      * added a gdcmViewer to vtk test, use mouse to control 
1554         window level & window width
1555
1556 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1557      * CMake-ification of gdcm, we have now two build system
1558      * FIX: on cygwin Wsock32 doesn't exist
1559      * FIX: force jpeg dir to the local one (gdcm/src/jpeg)
1560      
1561 2003-10-06  Emanuel Ollart
1562      * FIX : compilation process wad broken.
1563              Changed gdcmViewer_sources to vtkgdcmViewer_sources
1564         
1565 2003-10-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1566      * change gdcmViewer -> vtkgdcmViewer
1567      * change GetXSpacing and GetYSpacing "%f\\%" is parsed backward
1568      
1569 2003-10-06  Jean-Pierre Roux
1570      * FIX :A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
1571            ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
1572                  : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
1573       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
1574
1575 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1576       * Odd length strings are padded with '\0' (not with spaces, 
1577         to remain compliant with already defined strings, 
1578         like Transfert Syntax UID and others)
1579
1580 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1581       * ENH :gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
1582              to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
1583         
1584 2003-10-03  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1585       * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
1586       * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
1587
1588 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1589       * A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
1590         ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
1591               : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
1592       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
1593
1594 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1595       * One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" is now decoded.
1596
1597 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1598       * gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
1599         to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
1600
1601 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
1602       * gdcmFile::GetImageDataIntoVector now
1603          - deals with MultiFrames MultiFragments Run Length Encoded files
1604          - deals with YcBcR (YBR_FULL) files
1605          - deals with YBR_YBR_FULL_422 files (they work as RBG files ?!?)
1606           WARNING : nothing was checked for YBR_PARTIAL_422, YBR_ICT, 
1607                                             YBR_RCT files.
1608           (no sample found :-(
1609
1610 2003-10-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1611       * src/*.cxx removed pragma thingies to src/gdcmCommon.h
1612         Two reasons: - clear things
1613                      - third parties acces gdcm through header files, so won't
1614                        suffer anymore VC++ complains
1615
1616 2003-09-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1617       * add argv[1] in testvtkGdcmReader.cxx
1618       * removed leaks
1619
1620 2003-09-24 Jean-Pierre Roux
1621       * The lines are now eigthy characters long.for 
1622         gdcmHeader.cxx gdcmHeaderHelper.cxx gdcmParse.cxx 
1623
1624 2003-09-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1625       * src/gdcmUtil.[cxx|h] : change the _CreateCleanString return value from
1626         char* to std::string. Thus, the use of strdup becomes useless. (see
1627         previous commis of Malaterre)
1628       * src/gdcmElValSet.cxx : reuse commented call to _CreateCleanString like
1629         before the last Malaterre's commit.
1630
1631 2003-09-19  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1632       * This commit should fix the Debug building under VC++, the problem
1633         was mainly a mixture of debug and release lib being loaded at startup.
1634       * I also remove a depency to a specific C function: strdup. Because I had
1635         to force the link to msvcrtd (whereas strdup is in libc).
1636
1637 2003-09-16  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1638       * "gdcm::Unfound" string changed to a constant variable (GDCM_UNFOUND)
1639         located in the gdcmCommon.h file. All use of reference of tha has been
1640         changed to now use the variable GDCM_UNFOUND.
1641
1642 2003-09-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1643       * Cosmetic changes:
1644         - gdcmPython/testSuite.py adapted to the JPR updated Dicts/dicomV3.dic
1645           Dicom dictionary. The test suite can now be run again. Note:
1646           I'm note very happy with the " (RET)" changes. I believe this
1647           RETAINED comment should be dropped when parsing the dictionary.
1648         - PACKAGER corrected
1649         - DEVELOPPER added.
1650         - AUTHORS updated and now in alphabetical order
1651       * Makefile.am now exports gdcm.dsw for Windoze users.
1652
1653 2003-09-11  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1654       * cygwin complains about missing std:: in subdir Test/
1655
1656 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1657       * remove some methods that are now in gdcmHeaderHelper
1658
1659 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1660       * vtkGdcmReader set spacing and origin correctly
1661
1662 2003-09-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1663       * Fix a few delete/delete[] mismatch
1664
1665 2003-09-08  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1666       * src/gdcmHeaderHelper.[h cxx]: added new class that provide an
1667         interpretation to data given by gdcmHeader. For instance there are
1668         heuristics to get informations (look at different places).
1669       * it also include a specific class: gdcmSerieHeaderHelper devoted to
1670         sorting DICOM images based on different strategies.
1671       * modified Makefiles accordingly.
1672
1673 2003-09-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1674       * src/*.cxx : added pragma disable 4786/4251 to get rid of ~4300 warning
1675         when building in debug mode
1676       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : change /MT -> /MD and /MTd -> /MDd to match
1677         src/win32/gdcmdll.dsp
1678       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : added /nodefaultlib "mscvrt" for debug mode
1679
1680 2003-08-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1681       * Corrected a leak in vtkGdcmREader.cxx, the pSource was find thanks
1682             to valgrind.
1683
1684 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1685       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp was not dos format
1686       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp : 
1687                   libgdcmijpeg12_EXPORTS -> LIBGDCMIJPEG12_EXPORTS
1688       * src/win32/gdcmdll.dsp: + /I "..\jpeg\libijg12"
1689
1690 2003-07-29 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1691       * src/gdcmHeader.h : add std:: prefix for stl elements... like others in
1692         the file
1693       * src/gdcmFile.cxx : bug fix in affectation type
1694       * src/jpeg/libijpeg12/jmorecfg12.h : export for windows modified... like
1695         in src/jpeg/libijpeg8/jmorecfg8.h (JPR : copy/paste exists !!!)
1696       * Modifs of MVSC projects to compile them. Not concerning 2 identic
1697         symbols... future problem ?
1698
1699 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1700       * src/win32/libgdcmijpeg12.dsp was missing
1701       * modified gdcm.dsw accordingly
1702
1703 2003-07-28  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
1704       * src/gdcmHeader.cxx : misplaced return 0.; for ACR/NEMA
1705
1706 2003-07-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1707       * src/jpeg/libijg12/.cvsignore, jconfig.* : ommited files while last
1708         commit of JPR (before his hollidays to facilitate our work).
1709       * setup.py : bug fix in code. Modifications made while the last commit
1710         of JPR. The code hasn't been tested before the commit... it's so
1711         useless to make that (for best programmer that is JPR) !!!
1712
1713 2003-07-08  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1714       * tagged the current version as Version0_3 (i.e. version 0.3)
1715
1716 2003-07-08  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1717       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx : remove a symbol that is unused
1718       * src/jpeg/libijg8/jmorecfg.h : adding export symbol for windows
1719       * *.dsp : modifications to use new libgdcmijpeg8 library
1720       * setup.py : bug fix on VTKPATH variable
1721       * PACKAGER : adding all concerning windows
1722
1723 2003-07-07  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1724       * src/gdcmElValSet.cxx, gdcmFile.cxx: JPR bug fix, removal of
1725         garbage debug code.
1726       * TODO, vtk/vtkGdcmReader.cxx: upcoming fixes comments.
1727       * gdcmPython/testSuite.py: JPR bug fix, brutal erasement of
1728         test suite reported error.
1729       * PACKAGER file added (describes what a packager must do when
1730         packaging a new release).
1731       * MANIFEST.in, now declares jconfig.linux and jconfig.vc
1732       * configure.in: upgraded version number to 0.3.0
1733       * fixing build of rpm (through rpm -ta):
1734         - Doc/Makefile.am exports proper doxygen files
1735         - src/jpeg/libijg8/Makefile.am exports the include files.
1736
1737 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1738       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading only 1 file.
1739       * src/gdcmHeader.h : formatting code
1740
1741 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1742       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
1743         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
1744         is made in an internal list to prevent this problem.
1745         Bug fix when output is empty.
1746         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
1747         correction.
1748       * vtk/vtkGdcmReader.h : adding comments for InternalFileNaleList variable
1749
1750 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1751       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
1752       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
1753         files. Added method to remove all files on the input
1754         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
1755         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
1756
1757 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1758       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
1759         when using make instal.
1760       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
1761         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
1762
1763 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1764       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
1765       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
1766
1767 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1768       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
1769         linux and WINDOWS !
1770       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
1771       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
1772
1773 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1774       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
1775         addon of the jpeg library)
1776       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
1777       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
1778       * INSTALL now points to web documentation
1779
1780 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1781       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
1782         gdcmUtil.h anymore.
1783       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
1784         clean target.
1785       * src/gdcm*.[cxx|h] :
1786         - to allow compilation with gcc 3.x
1787           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
1788           -- small fixes on exceptions.
1789           Note: linking not tested !
1790         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
1791           building stage.
1792       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
1793         dependent convertion).
1794
1795 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1796       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
1797         Changelog):
1798         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
1799         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
1800           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
1801         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
1802
1803 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1804       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to
1805         compile
1806       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
1807         (FileName -> Filename)
1808
1809 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1810       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
1811         - UpdateProgress method should now be effective
1812         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
1813           to volumes),
1814         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
1815           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
1816           accelerating things).
1817         - when building a stack of images/volumes, files which are not
1818           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
1819           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
1820           in the stack (for the caller to notice the problem).
1821
1822 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1823       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
1824
1825 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1826       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts
1827         between standard library (std) and vtk library (problems are found
1828         under Windows... thanks Windows !)
1829
1830 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1831       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
1832         debug stage).
1833       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
1834
1835 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1836       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
1837
1838 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1839       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
1840         called with different flags than the default ones (with automake).
1841         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
1842            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
1843         and went for warning fixes:
1844         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
1845           up from unused variables.
1846         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
1847       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
1848
1849 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1850       * gdcmPython/gdcm.i:
1851         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
1852           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
1853           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
1854         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
1855           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
1856           exported to Python a as cvar.
1857       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
1858         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
1859         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
1860         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
1861         C++ static methods).
1862       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
1863         with the above changes.
1864
1865 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1866       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
1867
1868 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
1869       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
1870         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
1871         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
1872          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
1873          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
1874            a wrapper
1875          - Wrapper interface which wrap sources
1876         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
1877         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
1878       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
1879         files for compilation
1880
1881 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
1882       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
1883         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
1884         - vtk/Makefile.am now builds a library
1885         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
1886           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
1887           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
1888           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
1889           import library.
1890         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
1891           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
1892           + vtk/vtkGdcmReader.so and
1893           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
1894           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
1895         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
1896           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
1897         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
1898           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
1899       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
1900       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
1901         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
1902         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
1903         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
1904         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
1905         collision of various stl members (principally cout...).
1906       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
1907         file.
1908       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
1909         comply with above changes)
1910
1911 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1912       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
1913       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
1914         vtk data structure (an image Flip was required).
1915       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
1916       * cosmetic changes in documentation.
1917
1918 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1919       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
1920         unexisting file is given as argument.
1921       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
1922         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
1923         containing those images is now available at
1924           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
1925         with the name gdcmData.
1926         All the python scripts (including the package initialisation file
1927         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
1928         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
1929
1930 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1931       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
1932         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
1933         demo of the usage of this class.
1934         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
1935         at configure (or autogen.sh) stage.
1936
1937 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1938       * More memory link related corrections and documentation fixes.
1939         Notes on valgrind:
1940           - maximum info is obtained with a command of the form:
1941             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
1942                      --show-reachable=yes PrintHeader
1943           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
1944             allocation scheme through the usage of map and list. It looks
1945             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
1946             (in fact further invocation to the STL would recollect the
1947              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
1948       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
1949         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
1950         Note: some images don't seem to work e.g.
1951             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
1952       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
1953         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
1954         make gdcm more thread friendly.
1955
1956 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1957       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
1958           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
1959         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
1960           gdcmHeader::_dicom_vr.
1961         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
1962         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
1963           VRHT*.
1964         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
1965
1966 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1967       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
1968         make install stage.
1969
1970 2003-04-9 JPR
1971       * UpdateGroupLength replaced by new one
1972
1973 2003-04-7 JPR
1974       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
1975         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
1976
1977 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
1978       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
1979       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
1980       * src:
1981         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
1982         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
1983           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
1984         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
1985           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
1986           carried the same semantics.
1987           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
1988         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
1989           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
1990         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
1991       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
1992       * gdcmGetXSize added
1993       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
1994       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
1995
1996 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1997       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
1998         (to avoid double call by end user).
1999       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
2000         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
2001
2002 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2003       * gdcm/Doc many doxygen changes:
2004         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
2005           the html.users end users oriented documentation and
2006           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
2007           oriented documentation.
2008         - README changed accordingly
2009         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
2010         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
2011           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
2012         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
2013           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying
2014           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
2015       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
2016         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
2017       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
2018         ill-formed documentation sections.
2019       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
2020
2021 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2022       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
2023       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
2024         un*ces with sh-utils test utility.
2025       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
2026       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
2027       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
2028       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
2029       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
2030
2031 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2032       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
2033       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
2034
2035 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2036       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
2037       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
2038       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
2039       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
2040         compilation work.
2041       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
2042       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
2043
2044 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2045       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
2046         hence the user doesn't need this explicit call.
2047         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
2048           i.e. LoadElements() call removed.
2049       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
2050         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
2051       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
2052         for adding user defined new tags.
2053         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
2054         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
2055           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
2056
2057 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
2058       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
2059         Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am,
2060         src/Makefile.am : the project should properly compile and install
2061         with the autotools, included the python wrappers part.
2062       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
2063
2064 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2065       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
2066
2067 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2068       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
2069         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
2070         for usage).
2071       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
2072         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
2073         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
2074       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
2075         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
2076
2077 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2078       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
2079         in InstallMode or PreInstallMode but with an environement given
2080         value of GDCM_DICT_PATH.
2081       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
2082
2083 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2084       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
2085       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
2086       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
2087         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
2088         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
2089
2090 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2091       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
2092         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
2093         gdcmHeader.h
2094       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
2095         (as opposed to gdcm.h)
2096       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
2097       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
2098         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
2099       * autogen.sh removed history related references to crea package.
2100
2101 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2102       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
2103         bug.
2104
2105 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2106       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
2107         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
2108         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
2109         of hidding away the python related distutils specific files
2110         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
2111         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
2112         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
2113         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
2114
2115 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2116       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
2117       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
2118         among the list of sources.
2119
2120 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2121       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
2122       * modifications in MSVC projects
2123
2124 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2125       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
2126         looks like we can move back to original usage of exception within
2127         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
2128         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
2129       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
2130         README file for usage added.
2131       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
2132         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
2133         testing the proper parsing of a Dicom related file.
2134         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
2135       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
2136       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
2137         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
2138           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
2139           Dicom public dictionnary were not accessible without an
2140           instance of class gdcmHeader.
2141         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
2142           require no instances at all to be invocated.
2143         - within gdcmDictSet this change required to change some method
2144           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
2145           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
2146       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
2147         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
2148       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
2149         the above to be effective.
2150       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
2151         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
2152       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
2153         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
2154         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
2155         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
2156         (for python dectection).
2157       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
2158         now avoids publishing the empty entries.
2159
2160 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2161       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
2162         ExtraPath reused :-P
2163       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
2164
2165 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
2166       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
2167       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
2168       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
2169         and links
2170
2171 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2172       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
2173         method. Doxygenation.
2174       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
2175
2176 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2177       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
2178         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
2179         when using "python setup.py install".
2180       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
2181         reexports the working classes.
2182       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
2183         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
2184         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
2185         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
2186         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
2187         subdir (see the README file). This problem probably due to
2188         an combination of g++ and dynamic loading.
2189       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
2190
2191 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2192       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
2193         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
2194         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
2195         again in a python subdir, but the package itself is now in
2196         python/gdcmPython.
2197       * setup.py was cleaned up:
2198         - pythonIncludePath removed
2199         - python setup.py bdist target is now functional.
2200       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
2201         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
2202         accordingly.
2203
2204 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2205       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
2206       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
2207         distutils installer is operational.
2208       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
2209           shadow classes (from gdcm.py).
2210         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
2211           instead of gdcmPython/demo/load.py.
2212         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
2213
2214 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2215       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
2216         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
2217         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
2218         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
2219         dictionary.
2220         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
2221           are now in the "???" group.
2222         - python/gdcm.i changed accordingly,
2223         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
2224           of the above new functionalities in Python.
2225
2226 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2227       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
2228         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
2229           were definitively removed.
2230         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
2231       * src/gdcmElValSet.cxx:
2232         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
2233         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
2234         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
2235         - Added GetElementByName(string).
2236       * src/gdcmHeader.cxx: added
2237         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
2238         - GetPubElValRepByName(string)
2239         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
2240         - GetShaElValRepByName(string)
2241         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
2242         - GetShaElValRepByName(string)
2243         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
2244         - GetElValRepByName(string)
2245         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
2246         - GetElValRepByName(string)
2247       * Doc/requirements.txt added.
2248
2249 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2250       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
2251       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
2252         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
2253         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
2254         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
2255       * python/testSuite.py changed accordingly.
2256
2257 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
2258       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
2259         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
2260              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
2261               cannot be exported. [...]
2262               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
2263               be exported. [...]
2264               This is caused by a designed limitation that once a template
2265               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
2266               exported."
2267         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
2268         limitation" of VC++ is a pitfall.
2269         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
2270         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
2271         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
2272         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
2273         library.
2274         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
2275       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
2276          dll under windows !!!!)
2277       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
2278       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
2279         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
2280       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
2281         (one) of image(s).
2282       * removed glib references
2283       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
2284
2285 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2286       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
2287         that only displays required tags and testAll.py that parses all
2288         the files of the testsuite without using unittest.
2289       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
2290       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
2291       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
2292         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
2293
2294 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2295       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
2296         values, but limits itself to values which are below a user specified
2297         size (by default 1024 bytes).
2298       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
2299         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
2300         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
2301         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
2302       * python/testSuite.py
2303         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
2304         - two new examples added.
2305       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
2306
2307 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2308       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
2309         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
2310       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
2311       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
2312       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
2313
2314 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2315       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
2316         the vr was also RET.
2317       * python/testSuite.py more tests added.
2318
2319 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2320       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
2321       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
2322       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
2323         7.18 Integer types (see stdint.h)
2324         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
2325       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
2326         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
2327         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
2328         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
2329         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
2330         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
2331         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
2332         The rest of the changes we the necessary adaptations.
2333
2334 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2335       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
2336         VR files.
2337       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
2338
2339 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2340       * Adaptation for porting to VC++:
2341         - src/gdcm.h
2342           o forced to use std namespace (for string to be known)
2343           o all class use __declspec export style on WIN32
2344         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
2345           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
2346       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
2347         variable GDCM_DICT_PATH.
2348       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
2349
2350 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2351       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
2352         to native Python dictionary.
2353       * python/demo/test.py:
2354         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
2355         - takes an optional filename argument (the file to parse).
2356       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
2357         PubElVals hashing table.
2358       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
2359
2360 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2361       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
2362         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
2363       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
2364       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
2365       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
2366         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
2367       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
2368
2369 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2370       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
2371         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
2372         that we can import de shadow classes without errors].
2373
2374 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2375       * hashtest.cxx removed (since allready in Test)
2376       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
2377       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
2378       * src/Makefile prepared for python wrapping
2379
2380 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2381       * src/gdcmHeader.cxx :
2382         - Parsing of header is now separated from loading of element values
2383           (see gdcmHeader::LoadElements).
2384         - general clean up of hopefully all file access (creation of
2385           ReadInt16 and ReadInt32)
2386
2387 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2388       * src/gdcmHeader.cxx :
2389         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
2390           method.
2391         - SetLgrElem renamed to SetLength
2392         - GetLgrElem renamed to GetLength
2393         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
2394       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
2395       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
2396         due to IdoDude was cleaned out.
2397
2398 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2399       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
2400         concentrates on finding the value representation (when it exists).
2401         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
2402         returning the unecessary skL (skipped length).
2403         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
2404         it was redundant with the File position internals (by using
2405         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
2406         jajun.
2407       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
2408         on the libido specificities which are handled through class
2409         inheritance.
2410       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
2411         added.
2412
2413 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2414       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
2415         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
2416
2417 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2418       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
2419
2420 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2421       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
2422         and _IdDcmSWAP_LONG.
2423
2424 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
2425       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
2426         May 23 2002. Needless to say we are running late...
2427