]> Creatis software - gdcm.git/blob - ChangeLog
* src/gdcmDict.cxx, gdcmElValSet.cxx : bug fix under windows for prints.
[gdcm.git] / ChangeLog
1 2004-01-13 Benoit Regrain
2      * gdcmPython/testSuite.py : test the readable flag of file for tests
3      * src/gdcmDict.cxx, gdcmElValSet.cxx : bug fix under windows for prints.
4        It's lied to the stl compilation by MSVC (windows, always windows...)
5
6 2004-01-12 Benoit Regrain
7      * src/*.h : add comments
8      * src/gdcmDictSet.h : set the method BuildDictPath in public
9      * src/gdcmTS.cxx, gdcmVR.cxx : use now a dictionnary file other than to be
10        directly setted in the source code
11      * Dicts/dicomTS.dic, dicomVR.dic : 2 new dictionnary files loaded by
12        gdcmTS and gdcmVR
13
14 2004-01-09 Benoit Regrain
15      * gdcmPython/gdcmVersion.py : add a gdcmVERSION variable information
16      * setup.py : use a reference to gdcmVERSION
17
18 2004-01-07 Benoit Regrain
19      * Modification to compile with the distutils.
20      * Bug fix in code
21
22 2003-12-10 Benoit Regrain
23      * gdcmHeader is now aggregating gdcmFile, and not derived into. Thus, we
24        can use a gdcmHeaderHelper to load datas
25      * gdcmPython/testSuite.py : make the testSuite compliant with modifications
26        made in the source code
27
28 2003-12-10 Benoit Regrain
29      * Update Windows projects and .cvsignore files
30
31 2003-11-12 Jean-Pierre Roux
32      *ENH  gdcmHeader constructor has one more parameter (default value : false)
33            that allows the user to 'go inside' the SeQuences only
34            if he wants to.
35            gdcmElValSet:Print takes it into account
36
37 2003-11-12  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
38      *ENH: Update gdcmPython/CMakeLists
39      *FIX: (gdcmHeaderHelper) GetRescale and GetSlope
40      *FIX: (gdcmElValSet) char 'tag' was overiding private members (VC++)
41
42 2003-11-10 Jean-Pierre Roux
43       *FIX : gdcmHeader::LoadElements is now based
44              on the ListTag listElem member,
45              not longer on the TagElValueHT tagHt member
46       *ENH : PrintPubElVal shows (temporarily) both results,
47              with the tagHt member and the listElem member.
48              (it's easier to 'see' the problems when using Printheader)
49
50       *FIX : old private member LgrElem is now splitted into
51              ReadLength   : Length actually found on disk (updated only
52                             if bug fixing is necessary), for internal
53                             use only
54              UsableLength : Updated by FixFoundLength, to fix a bug
55                             or to allow Parser going on.
56              Will allow to re-write a kosher header when a SeQuence
57              with a length (not 0000) is found
58       Warning : gdcmFile::Write still uses the TagHt (not ListElem)
59                 because gdcmElValSet::Add does not update ListElem
60                 (to be written)
61
62 2003-11-07 Jean-Pierre Roux
63      *FIX misstyping in Transfert Syntax name table
64      *ENH gdcmHeader::FixFoundLength now allow to 'go inside' tge SeQuences
65           when they have an actual length (not 0000 nor FFFFF)
66           (Nobody should care of it, but DICOMDIR explorers)
67
68 2003-11-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
69      *ENH: vtkgdcmViewer now works with LUT dicom (OT-PAL-face ...)
70
71 2003-11-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
72      *ENH: vtkGdcmReader now supports LUT !
73           (vtkgdcmViewer for now is not able to use them though)
74
75 2003-11-05 Jean-Pierre Roux
76      * in testSuite.py : new files names for checking the package
77      * Fix : Forgot to commit gdcmFile::GetImageDataSizeRaw();
78              that returns the pixel area size to the *aware* (vtk) user
79              that DOESN'T want to turn the PALETTE COLOR image into an RGB image
80
81 2003-11-05 Benoit Regrain
82      * in testSuite.py : Modify the rules for checking the paths
83                        : Explicit error messages
84      * in __init__.py  : Related modif
85
86 2003-11-03 Jean-Pierre Roux
87      * add gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponentsRaw()
88            to be used by aware (vtk) users that want to manage
89            LUT (and no to turn the PALETTE image into an RGB pixels one)
90      * GetPixelType now returns 8U for 24 Bits images
91                     (vtkGdcmReader compliant)              
92            
93 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
94      * Removal of *all* gdcmData images and add them again
95        in order to loose the 'history' of un-anonymised images
96        
97 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
98      *RMV : removal of useless jBitsInJsample.h 
99            for both 8 and 12 Bits JPEG Lossy Libraries
100            
101 2003-10-31 Jean-Pierre Roux
102      * ENH : Add the functions gdcmFile::GetImageDataRaw 
103                                gdcmFile::GetImageDataIntoVectorRaw
104              that act as GetImageData and GetImageDataIntoVector
105              except the making of an RGB Plane from Gray Plane + LUT
106              Intended to aware (vtk) users who know how to manage 
107              such an image : 
108              After gdcmHeader :
109                 GetLUTRGBA return a R,G,B,A LUT if any
110                 lgrTotaleRaw gives the 'Raw' length
111                 GetImageDataRaw returns the gray Plane    
112      * FIX : no more dirty trick for 'Segmented xxx Palette Color Lookup' images
113              (They stay Grey, just like with other Dicom viewers :-(
114
115 2003-10-30 Jean-Pierre Roux
116      * FIX : a VC++ intended syntax modif broke the 12/12 Bytes expanding
117              
118 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
119      *ENH: Can be used like this '$vtkgdcmViewer *.dcm' with *.dcm 
120            being coherents dicom files.
121      
122 2003-10-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
123      *FIX: DOH ! Forgot about windo$e users, they couldn't read lossless jpeg,
124            from medcon lib !
125      *ENH: Turn it into DOS file type to match libgdcmijpeg8.dsp file type 
126      *ENH: Two steps is necessary to please VC++ compiler...
127      *FIX: DOH ! libgdcmijpg8 -> libgdcmljpeg
128      *ENH: Add include dir to medcon lib
129      *FIX: only one function is being exported for now ! 
130            You should use GLOBAL(return type) see ljpg/jpeg.h for more info
131             
132 2003-10-29 Jean-Pierre Roux
133       * adding  gdcmHeader::GetLUTRGBA
134                returns a 4 * 256 Bytes Reg/Green/Blue/Alpha vtk compliant LUT
135                --> Mathieu, the modif u're waiting for is not yet committed
136       * removal of now useless GetLUTRed,GetLUTGreen,GetLUTBlue,GetLUTRGB
137       
138 2003-10-27 Jean-Pierre Roux
139       * adding some xmedcon breaker files (courtesy of Loïc Boussel) 
140  .              00191113.dcm DermaColorLossLess.dcm 
141                 MxTwinLossLess.dcm RadBWLossLess.dcm       
142        * ENH: For version prior to vtkImageViewer2 -r 1.19
143        * FIX: avoid pb with xmedcon-breaker CT McTwin Elscint images
144            
145 2003-10-27  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
146       * Removal of ido stuff in CMakeLists.txt
147                                                
148 2003-10-24  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
149       * ENH: vtkGdcmReader.cxx can now read multiframe dicom
150       * FIX: remove a call to ->Modified ... see comments
151       * FIX: vtkgdcmViewer.cxx was writting ASCII file...this is so slooooooow !
152       
153 2003-10-23  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
154       * FIX: Problem with path for libvtkgdcmPython
155       * ENH: Try adding a search script for python site-package
156       * RMV: Remove some file from medcon lib that are not necessary
157       * FIX: gdcm/Makefile.am fix for generating ljpg medcon
158       * ENH: CMakeLists.txt now generate 'pygdcm.so' instead of 'libpygdcm.so' 
159       * FIX: More pragma disable fro VC++, 
160              I don't think I break something as it is also disable in VTK/ITK. 
161              But it fasten debug compilation time.
162             
163 2003-10-23 Jean-Pierre Roux
164       * gdcm now deals with 16 Bits Run Length Encoded images
165         (they are compressed as 2 planes images, 
166          one for the high Bytes, the other for low Bytes)
167
168 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
169      * Now CheckRead takes into account :
170             the bugged 'Leonardo' Siemens images
171             the XA images, sent thru the burning VPRO station
172      * add I9000001.dcm, a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
173      (breaks DicomWorks)
174
175 2003-10-22  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
176       * FIX: When copying a Makefile.am to CMakeLists.txt 
177              one should remove the '\'
178              
179 2003-10-22 Jean-Pierre Roux
180       * in gdcmData adding a bugged 'Leonardo' Siemens image 
181         (wrong lengths in header)
182         OK with gdcm, KO with the other viewers :-)
183       * add a GE dlx XA image, thru the VEPRO burning station
184         (breaks DicomWorks)
185
186 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
187       * in gdcmData add the checkvtkgdcmViewer.sh shell script 
188         for a brutal checking of vtkgdcmViewer compliance
189
190 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
191       * add the files for 'xmedcon' Jpeg Lossless library
192       * call of 'xmedcom' Jpeg Lossles libray (instead of the old LibIDO one)
193
194 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
195       * 'Compacted Files' (12 Bits Allocate, 12 Bits Stored) are now dealt with
196      
197 2003-10-21 Jean-Pierre Roux
198       * garbage Siemens 'Leonardo' images dealt with
199         (the patch is easy to remove)
200       * cosmetic changes to avoid warnings
201       
202 2003-10-20  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
203       * ENH: vtkgdcmViewer now autoscale color/window level on start-up, 
204         no need to press 'r' now.
205         
206 2003-10-20  Jean-Pierre Roux
207       * upgrade of checkRead.sh checkWrite.sh according 
208         to new Jpeg Lossless decompressor
209        * add US.3405.1.dcm, a genuine RGB medical file ...
210        * add gdcm-ACR-LibIDO.acr, unnormalized Rectangular LibIDO format image
211        * add CLIP0001-Sequoia-U11.dcm, US 'Clip', from SEQUOIA machine, 
212                                                   UNIT 11, Hop Cardio              
213 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
214       * general anonymisation in gdcmData
215       * adding the 'color files' from
216          http://www.leadtools.com/SDK/Medical/DICOM/ltdc19.htm
217       * adding some well knowed bugged-header images
218       * adding checkRead.sk, checkReadColor.sh, checkWrite.sh,
219          waiting for their inclusion in Python testsuite
220
221 2003-10-15  Jean-Pierre Roux
222     * gdcmHeader::gdcmHeader(const char *InFilename, bool exception_on_error)
223       no longer seg faults when file is not found
224
225 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
226      * Emprovement of reading for Dicom encapsulated Jpeg LossLess MultiFrame images
227
228 2003-10-14  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
229      * TODO: *.in file to genereate a UseGDCM later
230
231 2003-10-14  Jean-Pierre Roux
232      * Some supposed-to-be Dicom Images have no preamble.
233         OpenFile takes it into account
234      * Jpeg LossLess 24 Bits images doesn't break any longer gdcm
235      * Missing elements added in dicomV3.dic
236       (just to be affraid : have a look at
237        ftp://medical.nema.org/medical/dicom/2003/01v03dif/01v03_06.pdf
238        and do it again next year ;->
239
240 2003-10-13  Jean-Pierre Roux
241      * According to PS 3.3-2003 C.11.1.1.2 p 619, when each pixel of 
242        a PALETTE COLOR is stored on 2 Bytes, theese 2 Bytes must be equal.
243        But there are NOT. It's fixed !
244        
245 2003-10-13  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
246      * FIX: "jpeglib.h" was not found on VC++
247      * FIX: vtkgdcm was not being installed 
248          
249 2003-10-10  Jean-Pierre Roux
250      * ENH : OpenFile closes the file if it *really* doesn't look like
251              an ACR-NEMA / DICOM one.
252      * FIX : testWrite no longer writes an empty file if the source file     
253              is not gdcm Readable
254      * ENH : One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" 
255              is now decoded.
256              
257 2003-10-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
258      * FIX: CMake generate now documentation
259      * ENH: out of source doc build !
260      * ENH: Generate both user and dev documentation
261      * ENH: Should work on windows too
262      * ENH: Only one doxygen config.in file is needed 
263      * FIX: make install should be ok now on ùnix plateform
264      * FIX: PATH to dictionary was wrong (missing /)
265      * ENH: OpenFile, return true if the file looks like an ACR or DICOM file 
266                      
267 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
268      * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
269      * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
270      * added a gdcmViewer to vtk test, use mouse to control 
271         window level & window width
272
273 2003-10-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
274      * CMake-ification of gdcm, we have now two build system
275      * FIX: on cygwin Wsock32 doesn't exist
276      * FIX: force jpeg dir to the local one (gdcm/src/jpeg)
277      
278 2003-10-06  Emanuel Ollart
279      * FIX : compilation process wad broken.
280              Changed gdcmViewer_sources to vtkgdcmViewer_sources
281              
282 2003-10-06  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
283      * change gdcmViewer -> vtkgdcmViewer
284      * change GetXSpacing and GetYSpacing "%f\\%" is parsed backward
285      
286 2003-10-06  Jean-Pierre Roux
287      * FIX :A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
288            ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
289                  : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
290       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
291
292 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
293       * Odd length strings are padded with '\0' (not with spaces, 
294         to remain compliant with already defined strings, 
295         like Transfert Syntax UID and others)
296
297 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
298       * ENH :gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
299              to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
300              
301 2003-10-03  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
302       * vtkGdcmReader is now able to read rgb dicom file.
303       * src/gdcmHeaderHelper : GetNumberOfScalarComponents()
304
305 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
306       * A few nasty patches to allow the reading of a lot of nasty images
307         ( e.g : well known GE images with a wrong elem length,
308               : Philips MRI Images with a wrong Huffman table)
309       * still to be done : allow the reading of bugged LEONARDO Siemens images
310
311 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
312       * One more JPEG LossLess type "JPEG Baseline (Process 14)" is now decoded.
313
314 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
315       * gdcmHeaderHelper::GetNumberOfScalarComponents() added, 
316         to allow displaying RGB images (not only by affim ;-)
317
318 2003-10-03 Jean-Pierre Roux
319       * gdcmFile::GetImageDataIntoVector now
320          - deals with MultiFrames MultiFragments Run Length Encoded files
321          - deals with YcBcR (YBR_FULL) files
322          - deals with YBR_YBR_FULL_422 files (they work as RBG files ?!?)
323           WARNING : nothing was checked for YBR_PARTIAL_422, YBR_ICT, YBR_RCT files.
324           (no sample found :-(
325
326 2003-10-02  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
327       * src/*.cxx removed pragma thingies to src/gdcmCommon.h
328         Two reasons: - clear things
329                      - third parties acces gdcm through header files, so won't
330                      suffer anymore VC++ complains
331 2003-09-30  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
332       * add argv[1] in testvtkGdcmReader.cxx
333       * removed leaks
334                      
335 2003-09-24 Jean-Pierre Roux
336       * The lines are now eigthy characters long.for 
337         gdcmHeader.cxx gdcmHeaderHelper.cxx gdcmParse.cxx 
338
339 2003-09-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
340       * src/gdcmUtil.[cxx|h] : change the _CreateCleanString return value from
341         char* to std::string. Thus, the use of strdup becomes useless. (see
342         previous commis of Malaterre)
343       * src/gdcmElValSet.cxx : reuse commented call to _CreateCleanString like
344         before the last Malaterre's commit.
345
346 2003-09-19  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
347       * This commit should fix the Debug building under VC++, the problem
348         was mainly a mixture of debug and release lib being loaded at startup.
349       * I also remove a depency to a specific C function: strdup. Because I had
350         to force the link to msvcrtd (whereas strdup is in libc).
351
352 2003-09-16  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
353       * "gdcm::Unfound" string changed to a constant variable (GDCM_UNFOUND)
354         located in the gdcmCommon.h file. All use of reference of tha has been
355         changed to now use the variable GDCM_UNFOUND.
356
357 2003-09-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
358       * Cosmetic changes:
359         - gdcmPython/testSuite.py adapted to the JPR updated Dicts/dicomV3.dic
360           Dicom dictionary. The test suite can now be run again. Note:
361           I'm note very happy with the " (RET)" changes. I believe this
362           RETAINED comment should be dropped when parsing the dictionary.
363         - PACKAGER corrected
364         - DEVELOPPER added.
365         - AUTHORS updated and now in alphabetical order
366       * Makefile.am now exports gdcm.dsw for Windoze users.
367
368 2003-09-11  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
369       * cygwin complains about missing std:: in subdir Test/
370
371 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
372       * remove some methods that are now in gdcmHeaderHelper
373
374 2003-09-10  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
375       * vtkGdcmReader set spacing and origin correctly
376
377 2003-09-09  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
378       * Fix a few delete/delete[] mismatch
379
380 2003-09-08  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
381       * src/gdcmHeaderHelper.[h cxx]: added new class that provide an
382       interpretation to data given by gdcmHeader. For instance there are
383       heuristics to get informations (look at different places).
384       * it also include a specific class: gdcmSerieHeaderHelper devoted to
385       sorting DICOM images based on different strategies.
386       * modified Makefiles accordingly.
387
388 2003-09-05  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
389       * src/*.cxx : added pragma disable 4786/4251 to get rid of ~4300 warning
390         when building in debug mode
391       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : change /MT -> /MD and /MTd -> /MDd to match
392         src/win32/gdcmdll.dsp
393       * vtk/win32/vtkgdcm.dsp : added /nodefaultlib "mscvrt" for debug mode
394
395 2003-08-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
396       * Corrected a leak in vtkGdcmREader.cxx, the pSource was find thanks to valgrind.
397
398 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
399       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp was not dos format
400       * src/win32/libgdcmjpeg12.dsp : libgdcmijpeg12_EXPORTS -> LIBGDCMIJPEG12_EXPORTS
401       * src/win32/gdcmdll.dsp: + /I "..\jpeg\libijg12"
402
403 2003-07-29 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
404       * src/gdcmHeader.h : add std:: prefix for stl elements... like others in
405         the file
406       * src/gdcmFile.cxx : bug fix in affectation type
407       * src/jpeg/libijpeg12/jmorecfg12.h : export for windows modified... like
408         in src/jpeg/libijpeg8/jmorecfg8.h (JPR : copy/paste exists !!!)
409       * Modifs of MVSC projects to compile them. Not concerning 2 identic
410         symbols... future problem ?
411
412 2003-07-29  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
413       * src/win32/libgdcmijpeg12.dsp was missing
414       * modified gdcm.dsw accordingly
415
416 2003-07-28  Mathieu Malaterre  <Mathieu.Malaterre@creatis.insa-lyon.fr>
417       * src/gdcmHeader.cxx : misplaced return 0.; for ACR/NEMA
418
419 2003-07-24 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
420       * src/jpeg/libijg12/.cvsignore, jconfig.* : ommited files while last
421         commit of JPR (before his hollidays to facilitate our work).
422       * setup.py : bug fix in code. Modifications made while the last commit
423         of JPR. The code hasn't been tested before the commit... it's so
424         useless to make that (for best programmer that is JPR) !!!
425
426 2003-07-08  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
427       * tagged the current version as Version0_3 (i.e. version 0.3)
428
429 2003-07-08  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
430       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx : remove a symbol that is unused
431       * src/jpeg/libijg8/jmorecfg.h : adding export symbol for windows
432       * *.dsp : modifications to use new libgdcmijpeg8 library
433       * setup.py : bug fix on VTKPATH variable
434       * PACKAGER : adding all concerning windows
435
436 2003-07-07  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
437       * src/gdcmElValSet.cxx, gdcmFile.cxx: JPR bug fix, removal of
438         garbage debug code.
439       * TODO, vtk/vtkGdcmReader.cxx: upcoming fixes comments.
440       * gdcmPython/testSuite.py: JPR bug fix, brutal erasement of
441         test suite reported error.
442       * PACKAGER file added (describes what a packager must do when
443         packaging a new release).
444       * MANIFEST.in, now declares jconfig.linux and jconfig.vc
445       * configure.in: upgraded version number to 0.3.0
446       * fixing build of rpm (through rpm -ta):
447         - Doc/Makefile.am exports proper doxygen files
448         - src/jpeg/libijg8/Makefile.am exports the include files.
449
450 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
451       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : bug fix when loading only 1 file.
452       * src/gdcmHeader.h : formatting code
453
454 2003-07-07  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
455       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix when loading only one file.
456         We were obtaining error message from vtk. Now, creation of file list
457         is made in an internal list to prevent this problem.
458         Bug fix when output is empty.
459         Bug fix in update of progress value. Previous commit for this was a bad
460         correction.
461       * vtk/vtkGdcmReader.h : adding comments for InternalFileNaleList variable
462
463 2003-07-04  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
464       * src/gdcmHeader.h : added method to get the file name
465       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx|h] : bug fix concerning loading of bad dicom
466         files. Added method to remove all files on the input
467         Added FIXME comment concerning the bad parsing of header made by
468         ExecuteInformation method (in ExecuteData method)
469
470 2003-07-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
471       * vtk/Makefile.am: vtkGdcmReader.h should now be cleany installed
472         when using make instal.
473       * src/gdcmFile.cxx : bug fix under Window after JPR commit
474         RQ : the JPR doesn't appear in the ChangeLog... normal for him
475
476 2003-07-03  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
477       * setup.py : adding include dir of jpeg lib to compile all sources
478       * */Win32/*.dsp : JPR fix for windows compilation
479
480 2003-07-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
481       * src/jpeg/libijg8/jconfig.* : JPR bug fix : now compile on both
482         linux and WINDOWS !
483       * src/gdcmJpeg.cxx : JPR bug fix : erroneous include
484       * src/win32/gdcmdll.dsp : JPR fix for windows compilation
485
486 2003-07-02  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
487       * setup.py is again effective on un*x (takes into account the
488         addon of the jpeg library)
489       * Doc/DoxyDevelInstal.txt added (developper's raw documentation)
490       * Doc/Doxy* updated (includes above enhancements)
491       * INSTALL now points to web documentation
492
493 2003-07-01  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
494       * src/gdcmHeader.h doesn't make unnecessary reference to
495         gdcmUtil.h anymore.
496       * gdcmPython/Makefile.am now avoids calling the wrappers for the
497         clean target.
498       * src/gdcm*.[cxx|h] :
499         - to allow compilation with gcc 3.x
500           -- clean up of STL usage (added explicit usage of std::)
501           -- small fixes on exceptions.
502           Note: linking not tested !
503         - clean of doxygen comments to avoid warnings at documentation
504           building stage.
505       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: g++ warning message clean up (platform
506         dependent convertion).
507
508 2003-06-20  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
509       * Clean up of previous JPR garbage commit (not even commented in the
510         Changelog):
511         - Test/Makefile.am removed the reference to unexisting testTS.cxx
512         - moved all jpeg related files from src to src/jpeg/libijg8, with
513           addition/modification of Makefile.am and configure.in.
514         - the testSuite is still brain damage (not guilty).
515
516 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
517       * WrapVTK.py : modifications to get correctly vtk source files to
518         compile
519       * vtk/vtkGdcmReader.cxx : modification for an already existing name
520         (FileName -> Filename)
521
522 2003-06-11  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
523       * vtk/vtkGdcmReader.[cxx/h]:
524         - UpdateProgress method should now be effective
525         - removed the limitation on having only images loaded (as opposed
526           to volumes),
527         - when building a stack of images/volume, a lesser number of
528           gdcmHeader and gdcmFile instances should be used (hopefully
529           accelerating things).
530         - when building a stack of images/volumes, files which are not
531           loadable (wrong path-filename, wrong permissions on existing file,
532           or file not parsable by gdcm) are replaced with a black image
533           in the stack (for the caller to notice the problem).
534
535 2003-06-03  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
536       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: hopefully corrected Z extent.
537
538 2003-06-02  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
539       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] : makes correct code to remove conflicts
540         between standard library (std) and vtk library (problems are found
541         under Windows... thanks Windows !)
542
543 2003-05-30  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
544       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] should now be volume aware (read ready for
545         debug stage).
546       * gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py: commented lines for volume test
547
548 2003-05-29  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
549       * vtk/vtkGdcmReader[cxx|h] preparation addons for loading volumes.
550
551 2003-05-28  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
552       * When compiling with distutils (see setup.py) the C++ compiler is
553         called with different flags than the default ones (with automake).
554         In order to fix all those warning, I compiled gdcm with the command
555            make 'CXXFLAGS=-Wall -Wstrict-prototypes -D__STDC_LIMIT_MACROS'
556         and went for warning fixes:
557         - src/gdcmHeader.cxx, Test/dcm2acr.cxx, pourFindTaggs.cxx cleaned
558           up from unused variables.
559         - vtk/vtkGdcmReader.cxx: potential bug fix.
560       * src/gdcmHeader.h: Doxygen warning cleanup
561
562 2003-05-27  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
563       * gdcmPython/gdcm.i:
564         - typemaps correction to take into account the systematic replacement
565           of "using namespace std" with std:: prefix e.g. std::list,
566           std::string... (cf changes of 2003-05-21).
567         - gdcmGlob global variable of type gdcmGlobal (defined in
568           src/gdcmUtil.cxx and declared in gdcmPython/gdcm.i) is now
569           exported to Python a as cvar.
570       * gdcmPython/__init__.py now defines two functions GetPubDictTagNames()
571         and GetPubDictTagNamesByCategory() as a replacement for deprecated
572         gdcmDictSet.GetPubDictTagNames() and
573         gdcmDictSet.GetPubDictTagNamesByCategory() class functions (i.e.
574         C++ static methods).
575       * gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py is operational again,
576         with the above changes.
577
578 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
579       * setup.py, manifest.in : bug fix under linux
580
581 2003-05-22  Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
582       * Modification of setup.py to compile vtk part too. Then, we have 2
583         wrappers which must work with same distutils. For that, we have a
584         generic distutils in distusiltsWrapping.py ; with :
585          - build_extWrap class to wrap generically all extensions,
586          - ExtensionWrap base class for all wrapping extension that contains
587            a wrapper
588          - Wrapper interface which wrap sources
589         + In WrapSwig.py  we have extension and wrapper for Swig
590         + In WrapVTK.py  we have extension and wrapper for VTK
591       * MANIFEST.in : modifications to consider vtk directory and new python
592         files for compilation
593
594 2003-05-21  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with Benoit Regrain
595       * Added python wrappers of vtkGdcmReader vtk class (see the
596         source in vtk/vtkGdcmReader.cxx) :
597         - vtk/Makefile.am now builds a library
598         - gdcmPython/Makefile.am now builds vtkgdcmPython a second import
599           python library (as opposed to _gdcm.so wich are the python
600           wrappers of gdcm). vtkgdcmPython.so uses the vtk python wrappers
601           (vtkWrapPython and vtkWrapPythonInit utility) to build vtkgdcmPython
602           import library.
603         - configure.in has an additional flag --enable-vtk that needs
604           to be set to enable compilation of vtk related code, that is:
605           + vtk/vtkGdcmReader.so and
606           + vtk/testvtkGdcmReader C++ demo of vtk wrappers of gdcm)
607           + gdcmPython/vtkgdcmPython.so (see above)
608         - gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py corrected (some images cannot
609           be read when compressed or when HighBit + 1 != BitsStored),
610         - gdcmPython/demo/vtkGdcmReader.py added. This demo illustrates
611           the usage of the python wrapper of vtkGdcmReader vtk class.
612       * vtk/vtkGdcmReader.cxx: bug fixed (thanks to Benoit Regrain).
613       * src/*.[h] all occurences of stl classes are now prefixed with
614         std::, and all occurences of "using namespace std;" where removed.
615         This is to avoid pollution of global namespace in included files.
616         Apparently vtk does not avoid this pitfall: when using both
617         gdcm and vtk (as in vtk/vtkGdcmReader.cxx) this ended up in a
618         collision of various stl members (principally cout...).
619       * gdcmPython/testSuite.py now cleanly removes temprory generated
620         file.
621       * gdcmPython/gdcm.i now declares a typemap for std::string (to
622         comply with above changes)
623
624 2003-05-12  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
625       * src/gdcmHeader>[h/cxx] added gdcmHeader::GetPixelSize()
626       * vtk/vtkGdcmReader.cxx now properly inports the image in the
627         vtk data structure (an image Flip was required).
628       * vtk/testvtkGdcmReader.cxx refers to gdcmData subdir instead of Data.
629       * cosmetic changes in documentation.
630
631 2003-05-7  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
632       * src/gdcmHeader.cxx: the constructor no longer exits when an
633         unexisting file is given as argument.
634       * The subdirectory Data (containing all the images used for the
635         test suite) is not part of this repository anymore. A new module
636         containing those images is now available at
637           :pserver:xxx@cvs.creatis.insa-lyon.fr:2402/cvs/public
638         with the name gdcmData.
639         All the python scripts (including the package initialisation file
640         gdcmPython/__init__.py) were adapated to take this change into
641         account (basically GDCM_DATA_PATH is now GDCM_TEST_DATA_PATH).
642
643 2003-05-5  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
644       * vtk subdir added. Contains vtkGdcmReader.[cxx|h] a vtk class
645         inherinting from vtkImageReader and testvtkGdcmReader.cxx a small
646         demo of the usage of this class.
647         Compilation of this vtk part is only done when using the --enable-vtk
648         at configure (or autogen.sh) stage.
649
650 2003-04-16  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
651       * More memory link related corrections and documentation fixes.
652         Notes on valgrind:
653           - maximum info is obtained with a command of the form:
654             valgrind --leak-check=yes --leak-resolution=high --num-callers=40
655                    --show-reachable=yes PrintHeader
656           - the remaining reachable blocks seem to come from the STL
657             allocation scheme through the usage of map and list. It looks
658             like this memory cannot be freed but it is not a memory leak
659             (in fact further invocation to the STL would recollect the
660              unused memory allthough it cannot explicitely be freed).
661       * gdcmPython/demo/vtkGdcmDemo.py added: this is a small demo
662         of displaying an image parsed with gdcm and displayed with VTK.
663         Note: some images don't seem to work e.g.
664             python vtkGdcmDemo.py  ../../Data/US-RGB-8-esopecho.dcm
665       * src/gdcmHeader.x: dicom_vr and Dicts are not class members anymore.
666         Allthough this weakens the semantics, it is a ditch attempt to
667         make gdcm more thread friendly.
668
669 2003-04-15  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
670       * Memory link hunt (by using valgrind through the command
671           valgrind --show-reachable=yes --leak-check=yes PrintHeader).
672         - added src/gdcmVR.cxx gdcmVR.h that objectify the previous
673           gdcmHeader::_dicom_vr.
674         - gdcmHeader::InitVRDict transfered as gdcmVR::gdcmVR().
675         - gdcmHeader::dicom_vr is now of type gdcmVR* as opposed to
676           VRHT*.
677         - gdcmGlobal global object contained class added (see src/gdcmUtil.x)
678
679 2003-04-9  Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
680       * src/Makefile.am now exports all the necessary include files at
681         make install stage.
682
683 2003-04-9 JPR
684       * UpdateGroupLength replaced by new one
685
686 2003-04-7 JPR
687       * UpdateGroupLength re-written using H-Table
688         (named UpdateGroupLengthNew untill checks are over)
689
690 2003-04-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr> with JPR
691       * Data/im_00001 renamed to gdcm-MR-PHILIPS-16-Multi-Seq.dcm
692       * gdcmPython/testSuite.py now include a test of gdcmFile::Write.
693       * src:
694         - gdcmHeader::GetPubElValSet removed.
695         - gdcmElValSet::WriteDcm, WriteAcr, WriteExplVR, revamped to
696           UpdateGroupLength, WriteElements, Write.
697         - gdcmHeader::FileType moved to gdcmCommon.h. The enum FileType
698           doesn't contain TrueDicom anymore since ExplicitVR and ImplicitVR
699           carried the same semantics.
700           - src/gdcmHeaderIdo.cxx changed accordingly.
701         - gdcmFile::WriteBase now regroups all the codes from previous
702           versions of WriteDcm, WriteDcmImplVR, and WriteACR.
703         - enum FileType moved to gdcmCommon.h
704       * src/gdcmHeader.cxx AddDefault trashed
705       * gdcmGetXSize added
706       * getimageDataSize now calls gdcmGetXSize
707       * Test/*.cxx changed to agree with above changes
708
709 2003-03-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
710       * src/gdcmHeader.h: LoadElements() is not a public method anymore
711         (to avoid double call by end user).
712       * Test/*.cxx LoadElements() doesn't need to be called explicitely
713         by end user, since gdcmHeader::gdcmHeader now handles it.
714
715 2003-03-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
716       * gdcm/Doc many doxygen changes:
717         - Doxyfile now has two different versions, DoxyfileUsers that generates
718           the html.users end users oriented documentation and
719           DoxyfileDeveloppers that generates the html.developper developper
720           oriented documentation.
721         - README changed accordingly
722         - requirement.txt removed (old design info moved to TODO).
723         - Additional files DoxyInstallation.txt, DoxyIntroduction.txt,
724           DoxyMainPage.txt, DoxyPython.txt provide more information.
725         - Note: the website http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/ can now
726           be updated by simply regenerating the docs with doxygen and copying
727           html.developper and html.users to tux:/home/httpd/html/Public/Gdcm
728       * src/gdcmElValSet.cxx: stl <map>.count() can only return 0 or 1. Hence
729         all the tests in the form "if (<map>.count() >1)" were removed.
730       * src/gdcmFile.cxx: cosmetic changes to avoid messages of doxygen about
731         ill-formed documentation sections.
732       * src/gdcmHeader.cxx: ditto
733
734 2003-03-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
735       * setup.py fixed for un*x (needed macro for stdint.h)
736       * Test/test.cxx renamed to PrintHeader.cxx to avoid collision on
737         un*ces with sh-utils test utility.
738       * gdcmPython/demo/test.py renamed to PrintHeader.py
739       * gdcmPython/demo/ReorganiseFiles.py new demo script added.
740       * gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp renamed to gdcmpyembedded.dsp.
741       * gdcmPython/win32/gdcmpy.dsp trashed away (brain damaged).
742       * src/gdcm*.cxx JPR's bad inclusion fixed.
743
744 2003-03-26 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
745       * src/gdcmHeader[h, cxx] gdcmHeader now has an IsReadable predicate.
746       * gdcmPython/demo/test.py changed accordingly.
747
748 2003-03-25 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
749       * gdcmPython/Makefile.am fixed linking against libstdc++
750       * gdcmPython/_gdcm.so symbolic link to gdcmPython/.libs/pygdcm.so added.
751       * Swig subdir (historical tests of swig version 1.3.17++) removed
752       * Test/testChangeEntete.cxx some lines commented out in order to make
753         compilation work.
754       * src/gdcmHeader.cxx cleaned up wild JPR's dirty kludge.
755       * src/gdcmElValSet.cxx cleaned up frog's forgotten debug message
756
757 2003-03-24 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
758       * src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::gdcmHeader now calls LoadElements(),
759         hence the user doesn't need this explicit call.
760         - gdcmPython/testSuite.py, gdcmPython/demo/*.py changed accordingly
761           i.e. LoadElements() call removed.
762       * src/gdcmCommon.h now defines UINT32_MAX (see stdint.h).
763         - src/Makefile.am declares the proper flag for g++.
764       * src/gdcmElValSet.h added gdcmElValSet::GenerateFreeTagKeyInGroup
765         for adding user defined new tags.
766         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::NewManualElValToPubDict added.
767         - src/gdcmHeader.cxx gdcmHeader::AddAndDefaultElements now
768           cleanly adds some gdcm added tags (like gdcmXSize, gdcmYSize...)
769
770 2003-03-17 Fabrice Bellet <Fabrice.Bellet@creatis.insa-lyon.fr>
771       * Makefile.am, acinclude.m4, configure.in, python.m4, Dicts/Makefile.am,
772         Doc/Makefile.am, Test/Makefile.am, gdcmPython/Makefile.am,
773         src/Makefile.am : the project should properly compile and install
774         with the autotools, included the python wrappers part.
775       * gdcm.spec.in : added a spec file for RPM packaging.
776
777 2003-03-14 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
778       * src/gdcmUtils.cxx : redifinition of defaults parameters in code
779
780 2003-03-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
781       * gdcmPython/__init__.py fix of GDCM_DICT_PATH which was not
782         to exported to the environement (see gdcmPython/testSuite.py
783         for usage).
784       * src/gdcmElValSet.[cxx/h], gdcmElValue.[cxx/h], gdcmFile.[cxx/h],
785         gdcmHeader.[cxx/h]: ElValSet class renamed to gdcmElValSet, and
786         ElValue class renamed to gdcmElValue for obvious consistency reasons.
787       * src/gdcmElValSet.cxx, src/gdcmUtil.[cxx-h] Tokenize utility function
788         moved away from gdcmElValSet.cxx to gdcmUtil.cxx.
789
790 2003-03-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
791       * gdcmPython/__init__.py doesn't crash anymore when running in
792         in InstallMode or PreInstallMode but with an environement given
793         value of GDCM_DICT_PATH.
794       * src/gdcmDictSet.[cxx/h] coding style.
795
796 2003-03-06 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
797       * src/gdcmHeader.h and gdcmHeader.cxx Coding style + doxigenation.
798       * src/gdcm.h general comments moved to TODO, and README
799       * src/gdcm.h should now be seen as a user commodity (including it
800         should suffice to fully use gdcm). It is nowhere including within
801         any of the kernel files src/*.cxx and src/*.h.
802
803 2003-03-05 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
804       * src/gdcm.h splitted in gdcmCommon.h, gdcmDict.h, gdcmDictEntry.h,
805         gdcmDictSet.h, gdcmElValSet.h, gdcmElValue.h, gdcmFile.h,
806         gdcmHeader.h
807       * src/gdcm*.cxx only include their corresponding include file
808         (as opposed to gdcm.h)
809       * gdcmPython/gdcm.i changed accordingly
810       * Test/Makefile.am corrected and added NEWS, AUTHORS in order for
811         the autogen.sh generated "make snapshot" command to work.
812       * autogen.sh removed history related references to crea package.
813
814 2003-03-04 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
815       * distutilsSwigCPlusPlus.py work around some swig portability
816         bug.
817
818 2003-03-03 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
819       * Eventually, python/gdcmPython was renamed to gdcmPython. This
820         was done in a last ditch attempt to get setup.py _really_
821         operationnal. The python/gdcmPython layaout add the advantage
822         of hidding away the python related distutils specific files
823         (MANIFEST.in, setup.py, distutils*.py...) from the main directory.
824         Alas, the src directory was out of scope (i.e. it's relative
825         position to setup.py was ../src) which made things impossible to
826         handle (see previous version of python/setup.py). Crossing fingers...
827
828 2003-02-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
829       * python/setup.py now works on Un*x. (harder than I thougth)
830       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py can now have include files
831         among the list of sources.
832
833 2003-02-20 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
834       * src/gdcmHeader.cxx : bug fix - opening dicom file in binary !!!
835       * modifications in MSVC projects
836
837 2003-02-19 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
838       * As stated by the first lines of Test/ExceptionAndPython/README, it
839         looks like we can move back to original usage of exception within
840         src/gdcm* and hence remove the errno stuff that was introduced
841         as a quick and dirty fixture of this problem (added to the TODO).
842       * Doc/Doxyfile configuration file for Doxygen and corresponding
843         README file for usage added.
844       * Test/testWrite.cxx added. This new test comes from a split of
845         test.cxx that is now reverted to its original purpous i.e.
846         testing the proper parsing of a Dicom related file.
847         testWrite.cxx concentrates on testing the IO part of gdcm.
848       * Test/bug1.cxx (containing a bug on WIn32) added.
849       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx, gdcmDictSet.cxx:
850         - gdcmHeader::GetPubTagNames and  gdcmHeader::GetPubTagNamesByCategory
851           whose purpose is to publish the content of the TagNames of the
852           Dicom public dictionnary were not accessible without an
853           instance of class gdcmHeader.
854         - those methods are now static methods of gdcmDictSet and hence
855           require no instances at all to be invocated.
856         - within gdcmDictSet this change required to change some method
857           to class methods (i.e. are now static) among which SetDictPath
858           (renamed to BuildDictPath) and LoadDefaultPubDict.
859       * python/gdcmPython/demo/printGroupedPublicDict.py changed to illustrate
860         the above changes by calling the new method classes of gdcmDictSet.
861       * python/gdcmPython/__init__.py now exposes gdcm.gdcmDictSet for
862         the above to be effective.
863       * python/gdcmPython: in order to wrap properly the above changes
864         for Python, swig version now needs to be > 1.3.17.
865       * python/gdcmPython/Makefile fixed to adapt itself to new
866         configure/make shema introduced by Johan Montagnat (thanks for the
867         contribution). Alas this Makefile cannot be turned into a proper
868         Makefile.am without some heavy changes in the configure.in
869         (for python dectection).
870       * python/gdcmPython/gdcm.i: the out typemap map<string, list<string>>*
871         now avoids publishing the empty entries.
872
873 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
874       * python/setup.py : bug fix concerning install under windows
875         ExtraPath reused :-P
876       * gdcm.dsw : bug fix concerning path for libraries for python !!!
877
878 2003-02-13 Benoit Regrain <Benoit.Regrain@creatis.insa-lyon.fr>
879       * Dicts/dicomV3.dic : remove double spaces !!!
880       * src/gdcmElValSet.cxx : bug fix concerning windows compiler
881       * python/gdcmPython/win32/gdcmpycomplet.dsp : bug fix concerning paths
882         and links
883
884 2003-01-28 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
885       * src/gdcmHeader.cxx added a post header parsing AddAndDefaultElements
886         method. Doxygenation.
887       * src/gdcm.h clean up of JPR spurious comments.
888
889 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
890       * python/distutilsSwigCPlusPlus.py now properly collects the
891         shadow classes generated by "swig -c++" (gdcm.py in our case)
892         when using "python setup.py install".
893       * python/gdcmPython/__init__.py imports gdcm.py and only manually
894         reexports the working classes.
895       * src/gdcmHeader.cxx all the try/catch/throw calls were replaced
896         by the classical C errno scheme. This is to prevent an obscure
897         behavior of the python wrappers when importing wxPython.wx prior
898         to gdcmPython (which ended up in an abort call). An illustration
899         of this oddity can be found in the Test/ExceptionAndPython
900         subdir (see the README file). This problem probably due to
901         an combination of g++ and dynamic loading.
902       * added Test/ExceptionAndPython (see above)
903
904 2003-01-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
905       * Changed the layout of the python part to avoid bloating main
906         directory with setup.py, distutilsSwigCPlusPlus.py, MANIFEST.in
907         i.e. the distutils arsenal. All the python related stuff is
908         again in a python subdir, but the package itself is now in
909         python/gdcmPython.
910       * setup.py was cleaned up:
911         - pythonIncludePath removed
912         - python setup.py bdist target is now functional.
913       * gdcmPython/__init__.py doesn't export FileName any more (to avoid
914         collision with other packages). gdcmPython/demo/*.py changed
915         accordingly.
916
917 2003-01-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
918       * python subdir moved to gdcmPython (preparation of distutils packaging).
919       * gdcmPython/setup.py and distutilsSwigCPlusPlus.py added. The
920         distutils installer is operational.
921       * - gdcmPython/__init__.py now properly loads the swig generated
922           shadow classes (from gdcm.py).
923         - gdcmPython/demo/*.py changed to import the package gdcmPython
924           instead of gdcmPython/demo/load.py.
925         - gdcmPython/testSuite.py changed to import the package gdcmPython.
926
927 2002-12-16 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
928       * src/gdcm.h, src/gdcmHeader.cxx: added GetPubTagNames() resp.
929         GetPubTagNamesByCategory() to gdcmHeader that return a list of the
930         entries within the associated public Dicom dictionary resp. the same
931         information but sorted by the fourth field (PAT, IMG, DIR) of the
932         dictionary.
933         - Dicts/dicomV3.dic Entries which had and unspecified fourth field
934           are now in the "???" group.
935         - python/gdcm.i changed accordingly,
936         - python/demo/printGroupedPublicDict.py added, that gives an example
937           of the above new functionalities in Python.
938
939 2002-12-11 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
940       * src/gdcm.h, gdcmHeader.cxx:
941         - historic references to glib's g_malloc and g_free (#defined)
942           were definitively removed.
943         - gdcm.h: cosmetic changes (part of comments moved to Doc/requirements)
944       * src/gdcmElValSet.cxx:
945         - GetElement(guint32, guint32) renamed to GetElementByNumber.
946         - GetElValue(guint32, guint32) renamed to GetElValueByNumber.
947         - GetElValue(string) renamed to GetElValueByName.
948         - Added GetElementByName(string).
949       * src/gdcmHeader.cxx: added
950         - GetPubElValRepByNumber(guint16, guint16)
951         - GetPubElValRepByName(string)
952         - GetShaElValRepByNumber(guint16, guint16)
953         - GetShaElValRepByName(string)
954         - GetShaElValByNumber(guint16, guint16)
955         - GetShaElValRepByName(string)
956         - GetElValRepByNumber(guint16, guint16)
957         - GetElValRepByName(string)
958         - GetElValByNumber(guint16, guint16)
959         - GetElValRepByName(string)
960       * Doc/requirements.txt added.
961
962 2002-12-9 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
963       * Test/Makefile building now depends on the one of libgdcm.so
964       * src/gdcmHeader.cxx and gdcm.h are now OB (undefined length encoded
965         pixel data) aware which enables finding the address (offset) of
966         the pixel data of JPEG encoded DICOM files. This leaves only a single
967         file in the testSuite whose pixel data address (offset) is unknown.
968       * python/testSuite.py changed accordingly.
969
970 2002-12-6 Christophe Odet + Hugues Benoit-Cattin + Eric.Boix
971       * VC++ has some strong limitations when working with the STL, as stated
972         in http://support.microsoft.com/support/kb/articles/Q168/9/58.ASP :
973              "Also note that some STL containers (map, set, queue, list, deque)
974               cannot be exported. [...]
975               Some STL classes contain nested classes. These classes can not
976               be exported. [...]
977               This is caused by a designed limitation that once a template
978               class is instantiated, it can not be re-instantiated and
979               exported."
980         Since our usage of map<> is ubiquitous in gdcm, this "designed
981         limitation" of VC++ is a pitfall.
982         Hence the Python wrappers of gdcm cannot be incrementally linked
983         against the c++ dynamic library. The dirty but only workaround is
984         to forget about incremental link of dynamic libraries and to generate
985         the Python wrappers library with the inclusions of the underlying C++
986         library.
987         The following modifications concern this matter on Win32/VC++:
988       - wrapping python correct with standalone wrapped dll (don't use separate
989          dll under windows !!!!)
990       - python21_d debug mode enabled (ask Frog how to use it :-)
991       - NO problem with having an STL member of class for example string in C++
992         WITH THE RESTRICTION OF FORGETING ABOUT INCREMENTAL LINK.
993       - Python test of dcmlib in Python is ok under windows on a large set
994         (one) of image(s).
995       * removed glib references
996       * typedef's inserted in gdcm.i for correct swig type management
997
998 2002-11-27 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
999       * python/demo/*.py load.py extracted from test.py. Added explore.py
1000         that only displays required tags and testAll.py that parses all
1001         the files of the testsuite without using unittest.
1002       * python/testSuite.py other additional test on new files added.
1003       * Data/* new test files added accordingly to the testSuite.
1004       * src/gdcmHeader.cxx avoid overwriting of the dictionary when
1005         the vr in the file differs from the one of the dictionary.
1006
1007 2002-11-20 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1008       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx gdcm no longer loads all the elements
1009         values, but limits itself to values which are below a user specified
1010         size (by default 1024 bytes).
1011       * python/gdcm.i : elements not loaded (because their size is above the
1012         user specified treshold) are exported with their TagKey as key of the
1013         python dictionary. This enables the testsuite to make some checks
1014         on the unloaded elements (since we have their offset and size).
1015       * python/testSuite.py
1016         - now tests for the existence and proper value of the pixel data
1017         - two new examples added.
1018       * Data/gdcm-MR-SIEMENS-16.acr[12] added.
1019
1020 2002-11-18 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1021       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx are now "Big Endian transfer syntax"
1022         aware. See the strategy comments in gdcmHeader::FindeLength().
1023       * Test/test.cxx now accepts a filename as first argument.
1024       * Data/US-PAL-8-10x-echo.dcm and US-RGB-8-epicard.dcm added.
1025       * python/testSuite.py changed to integrate test on above files.
1026
1027 2002-11-15 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1028       * Dicts/dicomV3.dic removed all the trailing (RET) when the
1029         the vr was also RET.
1030       * python/testSuite.py more tests added.
1031
1032 2002-11-14 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1033       * python/testSuite.py unittest test suite added (uses Data)
1034       * Data/* dcm and acr files for the test suite.
1035       * glib dependance removed from un*x version. We now use ISO C99
1036         7.18 Integer types (see stdint.h)
1037         - python/Makefile, src/Makefile src/gdcm.h
1038       * src/ when an explicit vr (like dicom files) suddenly poped an
1039         implicit element we use to mark the underlying DictEntry of the
1040         concerned ElValue with "Implicit". This strategy was damageable
1041         too the public or provite dictionaries, since some of their vr
1042         would be changed. Since Header::FindLength heavily relies on the
1043         detection by Header::FindVR of falsely explicit elements, I
1044         added an extra ImplicitVr member to ElValue (boolean).
1045         The rest of the changes we the necessary adaptations.
1046
1047 2002-11-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1048       * src/gdcmHeader::FindLength bug fix when trapping falsely explicit
1049         VR files.
1050       * src/gdcmHeader::FindVR: hard way fix of falsely explicit vr files.
1051
1052 2002-11-8 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1053       * Adaptation for porting to VC++:
1054         - src/gdcm.h
1055           o forced to use std namespace (for string to be known)
1056           o all class use __declspec export style on WIN32
1057         - src/gdcmUtil.cxx new Exit method that wraps the exit call
1058           (in stdlib.h on Win32 but in std:: for gcc)
1059       * src/gdcmDictSet::SetDictPath adds a trailing / to environement
1060         variable GDCM_DICT_PATH.
1061       * src/gdcmHeader.cxx verbose comments made discrete.
1062
1063 2002-11-7 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1064       * python/gdcm.i: added a typemap that converts a C++ hashing table
1065         to native Python dictionary.
1066       * python/demo/test.py:
1067         - now uses the native dictionary for exploration of gdcmHeader.
1068         - takes an optional filename argument (the file to parse).
1069       * src/gdcm.h and gdcmHeader.cxx: gdcmHeader now has an accessor on
1070         PubElVals hashing table.
1071       * Dicts/dicomV3.dic removed error prone trailing spaces.
1072
1073 2002-11-6 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1074       * Python wrapping process moved away from src/Makefile to
1075         newly created python/Makefile (as well as gdcm.i)
1076       * python/demo/test.py (that mirrors Test/test.cxx) is effective.
1077       * src/gdcmHeader::FindLength only looks for current vr when necessary.
1078       * src/gdcmDictSet.cxx: the dictionnaries directory path is now imported
1079         from the environement variable GDCM_DICT_PATH (when existing).
1080       * src/gdcmDict::GetTag bug fix.
1081
1082 2002-10-31 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1083       * Straightforward temporary fixes for swig to build the python wrappers.
1084         src/Makefile now has a python working entry [by working we mean
1085         that we can import de shadow classes without errors].
1086
1087 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1088       * hashtest.cxx removed (since allready in Test)
1089       * src/gdcmlib.h renamed to src/gdcm.h
1090       * src/dcm.i renamed to src/gdcm.i
1091       * src/Makefile prepared for python wrapping
1092
1093 2002-10-29 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1094       * src/gdcmHeader.cxx :
1095         - Parsing of header is now separated from loading of element values
1096           (see gdcmHeader::LoadElements).
1097         - general clean up of hopefully all file access (creation of
1098           ReadInt16 and ReadInt32)
1099
1100 2002-10-22 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1101       * src/gdcmHeader.cxx :
1102         - RecupLgr renamed to FindLength and cut off with new IsAnInteger
1103           method.
1104         - SetLgrElem renamed to SetLength
1105         - GetLgrElem renamed to GetLength
1106         - ~gdcmHeader() made virtual to pesky warning messages at compile.
1107       * src/gdcmElValSet.cxx fixed both GetElValue methods
1108       * Dicts/dicomV3.dic falacious entry [7fe0 0010 OT PXL Pixel Data]
1109         due to IdoDude was cleaned out.
1110
1111 2002-10-21 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1112       * src/gdcmHeader.cxx RecupLgr split in FindVR and RecupLgr. FindVR
1113         concentrates on finding the value representation (when it exists).
1114         RecupLgr now only finds the element value length, and it avoids
1115         returning the unecessary skL (skipped length).
1116         Also, offsetCourant was simply removed (with taille_fich) since
1117         it was redundant with the File position internals (by using
1118         ftell and fseek). This also made skL (see above in RecupLgr) usage
1119         jajun.
1120       * src/gdcmHeaderIdo.cxx src/gdcmIdo.h added. Those files concentrate
1121         on the libido specificities which are handled through class
1122         inheritance.
1123       * Test/implicit_vr.dcm dicom v3 in implicit value representation
1124         added.
1125
1126 2002-10-17 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1127       * Truckload of changes. Parsing of header is barely functional
1128         (see Test/test) with the standard dictionary (see Dicts/dicomV3.dic).
1129
1130 2002-10-10 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1131       * src/gdcmHeader.cxx many addons of low level methods
1132
1133 2002-10-07 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1134       * src/gdcmHeader now contains_IdDcmCheckSwap, _IdDcmRecupLgr,
1135         and _IdDcmSWAP_LONG.
1136
1137 2002-09-12 Eric Boix <Eric.Boix@creatis.insa-lyon.fr>
1138       * This corresponds to all the changes decided at the meeting of
1139         May 23 2002. Needless to say we are running late...
1140