Dicts/CMakeLists.txt

   1 #-----------------------------------------------------------------------------
   2 # DICOM dictionary stuff
   3
   4
   5 INSTALL_FILES(${GDCM_DATA_DIR} .dic
   6   dicomV3
   7   dicomVR
   8   dicomTS
   9   DicomDir
  10   DictGroupName
  11 )
  12
  13 # Nice trick to avoid creating a .h file each time we compile gdcm
  14 # Since CONFIGURE_FILE do a 'copy if different'
  15 # We have to write the file here since is contains 'DICOM_DICTIONARY'
  16 # Which is a variable afterward...
  17
  18 # Following code contributing by Andy Cedilnik (Kitware)
  19 FILE(READ "dicomV3.dic" ENT)
  20 STRING(REGEX REPLACE "\r?\n" ";" ENT "${ENT}")
  21 SET(DICOM_DATA_DICTIONARY "")
  22
  23 FOREACH(line ${ENT})
  24   STRING(REGEX REPLACE
  25     "^([0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f]) ([0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f]) ([A-Z]+) ([1-9n-]+) (.*)$"
  26     "   {0x\\1, 0x\\2, \"\\3\" , \"\\4\" , \"\\5\"}, " nline "${line}")
  27   SET(DICOM_DATA_DICTIONARY "${DICOM_DATA_DICTIONARY}\n${nline}")
  28 ENDFOREACH(line)
  29
  30 SET(DICOM_DATA_DICTIONARY "${DICOM_DATA_DICTIONARY} \n {0,0,0,0,0}")
  31
  32 #-----------------------------------------------------------------------------
  33 # ... for DicomTS file
  34 FILE(READ "dicomTS.dic" ENT_TS)
  35 STRING(REGEX REPLACE "\r?\n" ";" ENT_TS "${ENT_TS}")
  36 SET(DICOM_TS_DICTIONARY "")
  37
  38 FOREACH(line ${ENT_TS})
  39   STRING(REGEX REPLACE
  40     "^([0-9.]+) +(.*)$"
  41     "  ts[\"\\1\"] = \"\\2\"; " nline "${line}")
  42   SET(DICOM_TS_DICTIONARY "${DICOM_TS_DICTIONARY}\n${nline}")
  43 ENDFOREACH(line)
  44
  45 #-----------------------------------------------------------------------------
  46 # ... for DicomVR file
  47 FILE(READ "dicomVR.dic" ENT_VR)
  48 STRING(REGEX REPLACE ";" "/" ENT_VR "${ENT_VR}") # CMake doesn't like ';'
  49 STRING(REGEX REPLACE "\r?\n" ";" ENT_VR "${ENT_VR}")
  50 SET(DICOM_VR_DICTIONARY "")
  51
  52 FOREACH(line ${ENT_VR})
  53   STRING(REGEX REPLACE
  54     "^([A-Z][A-Z]) (.*)/ +//.*$"
  55     "  vr[\"\\1\"] = \"\\2\"; " nline "${line}")
  56   SET(DICOM_VR_DICTIONARY "${DICOM_VR_DICTIONARY}\n${nline}")
  57 ENDFOREACH(line)
  58
  59 #-----------------------------------------------------------------------------
  60 # ... for DictGroupName file
  61 FILE(READ "DictGroupName.dic" ENT_TS)
  62 STRING(REGEX REPLACE "\r?\n" ";" ENT_TS "${ENT_TS}")
  63 SET(DICT_GROUP_NAME_DICTIONARY "")
  64
  65 FOREACH(line ${ENT_TS})
  66   STRING(REGEX REPLACE
  67     "^([0-9a-f]+) +(.*)$"
  68     "  groupName[0x\\1] = \\2; " nline "${line}")
  69   SET(DICT_GROUP_NAME_DICTIONARY "${DICT_GROUP_NAME_DICTIONARY}\n${nline}")
  70 ENDFOREACH(line)
  71
  72 #-----------------------------------------------------------------------------
  73 # ... for DicomDir file
  74 FILE(READ "DicomDir.dic" ENT_DIR)
  75 STRING(REGEX REPLACE "\\\\" "\\\\\\\\" ENT_DIR "${ENT_DIR}")
  76 STRING(REGEX REPLACE ";" "/" ENT_DIR "${ENT_DIR}") # CMake doesn't like ';'
  77 STRING(REGEX REPLACE "\r?\n" ";" ENT_DIR "${ENT_DIR}")
  78 SET(DICOM_DIR_DICTIONARY "")
  79
  80 FOREACH(line ${ENT_DIR})
  81   STRING(REGEX REPLACE
  82     "^(metaElem|patientElem|studyElem|serieElem|imageElem) *([a-f0-9]+) ([a-f0-9]+) [\"](.*)[\"](.*)$"
  83     "  {\"\\1\" , 0x\\2 , 0x\\3 , \"\\4\"}, \\5" nline "${line}")
  84   SET(DICOM_DIR_DICTIONARY "${DICOM_DIR_DICTIONARY}\n${nline}")
  85 ENDFOREACH(line)
  86
  87 #-----------------------------------------------------------------------------
  88 # ... Set the dictionnary
  89 SET(DICOM_DIR_DICTIONARY "${DICOM_DIR_DICTIONARY} \n {0,0,0,0}")
  90
  91 FOREACH(file dicomV3.dic  dicomTS.dic dicomVR.dic DicomDir.dic DictGroupName.dic)
  92   CONFIGURE_FILE("${GDCM_SOURCE_DIR}/Dicts/${file}"
  93     "${GDCM_BINARY_DIR}/Dicts/${file}.out")
  94 ENDFOREACH(file)
  95 CONFIGURE_FILE("${GDCM_SOURCE_DIR}/src/gdcmDefaultDicts.cxx.in" "${GDCM_BINARY_DIR}/src/gdcmDefaultDicts.cxx" IMMEDIATE)
  96
  97
  98 #FILE(READ "dicomV3VM2004.dic" ENT2)
  99 #STRING(REGEX REPLACE "\n" ";" ENT2 "${ENT2}")
 100 #SET(DICOM_DICTIONARY2 "")
 101 #
 102 #FOREACH(line ${ENT2})
 103 #  STRING(REGEX REPLACE
 104 ##    "^([0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f]) ([0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f]) ([A-Z]+) ([A-Z]+) (.*)([ \(RET\)]*)$"
 105 #    "^([0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f]) ([0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f]) ([A-Z]+) ([0-9]|[1]-[0-9n]|[2]-[2][n]|[3]-[3][n]) (.*)$"
 106 ##    "   { \\1, \\2, \"\\3\" , \"\\4\" , \"\\5\", \"\\6\"}," nline "${line}")
 107 #    "   { \\1, \\2, \"\\3\" , \"\\4\" , \"\\5\"}," nline "${line}")
 108 #  SET(DICOM_DICTIONARY2 "${DICOM_DICTIONARY2}\n${nline}")
 109 #ENDFOREACH(line)
 110 #
 111 #
 112 #
 113 ##FILE(READ "04_06PU.txt" ENT3)
 114 #FILE(READ "extract.txt" ENT3)
 115 #
 116 #STRING(REGEX REPLACE "\n" ";" ENT3 "${ENT3}")
 117 #SET(DICOM_DICTIONARY3 "")
 118 #
 119 #FOREACH(line ${ENT3})
 120 #  STRING(REGEX REPLACE
 121 ##    "^[(]([0-9a-fA-F]+),([0-9a-fA-F]+)[)] (.*) ([A-ZA-Z]*) ([[0-3][-][1-3n]*|[1-]*[0-9]+]*) ?([RET|Retired]*)$"
 122 #    "^[(]([0-9a-fA-F]+),([0-9a-fA-F]+)[)]  +(.*)  +([A-ZA-Z   [[0-3][-][1-3n]*|[1-]*[0-9]+]]*)([ RET]*)$"
 123 #    "   { \\1 , \\2, \\3, \\4, \\5  }," nline "${line}")
 124 #  STRING(COMPARE NOTEQUAL "${line}" "${nline}" add)
 125 #  IF(add)
 126 #    #SET(DICOM_DICTIONARY3 "${DICOM_DICTIONARY3}\n${nline}")
 127 #    MESSAGE("${nline}")
 128 #  ELSE(add)
 129 #    MESSAGE("WRONG:${nline}")
 130 #  ENDIF(add)
 131 #ENDFOREACH(line)
 132
 133
 134 # Txt generation:
 135 # ~/Software/xpdf-3.00-linux/pdftotext -f 9 -l 81 -raw -nopgbrk 04_06PU.PDF 04_06PU-3.txt