Dicts/CMakeLists.txt

   1 #-----------------------------------------------------------------------------
   2 # DICOM dictionary stuff
   3
   4
   5 INSTALL_FILES(${GDCM_DATA_DIR} FILES
   6   dicomV3.dic
   7   dicomVR.dic
   8   dicomTS.dic
   9   DicomDir.dic
  10 )
  11
  12 # Nice trick to avoid creating a .h file each time we compile gdcm
  13 # Since CONFIGURE_FILE do a 'copy if different'
  14 # We have to write the file here since is contains 'DICOM_DICTIONARY'
  15 # Which is a variable afterward...
  16
  17 # Following code contributing by Andy Cedilnik (Kitware)
  18 FILE(READ "dicomV3.dic" ENT)
  19 STRING(REGEX REPLACE "\n" ";" ENT "${ENT}")
  20 SET(DICOM_DATA_DICTIONARY "")
  21
  22 FOREACH(line ${ENT})
  23   STRING(REGEX REPLACE
  24     "^([0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f]) ([0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f]) ([A-Z]+) ([A-Z?]+) (.*)$"
  25     "   0x\\1, 0x\\2, \"\\3\" , \"\\4\" , \"\\5\", " nline "${line}")
  26   SET(DICOM_DATA_DICTIONARY "${DICOM_DATA_DICTIONARY}\n${nline}")
  27 ENDFOREACH(line)
  28
  29 SET(DICOM_DATA_DICTIONARY "${DICOM_DATA_DICTIONARY} \n 0,0,0,0,0")
  30
  31 FILE(READ "dicomTS.dic" ENT_TS)
  32 STRING(REGEX REPLACE "\n" ";" ENT_TS "${ENT_TS}")
  33 SET(DICOM_TS_DICTIONARY "")
  34
  35 FOREACH(line ${ENT_TS})
  36   STRING(REGEX REPLACE
  37     "^([0-9.]+) +(.*)$"
  38     "  ts[\"\\1\"] = \"\\2\"; " nline "${line}")
  39   SET(DICOM_TS_DICTIONARY "${DICOM_TS_DICTIONARY}\n${nline}")
  40 ENDFOREACH(line)
  41
  42 FILE(READ "dicomVR.dic" ENT_VR)
  43 STRING(REGEX REPLACE ";" "/" ENT_VR "${ENT_VR}") # CMake doesn't like ';'
  44 STRING(REGEX REPLACE "\n" ";" ENT_VR "${ENT_VR}")
  45 SET(DICOM_VR_DICTIONARY "")
  46
  47 FOREACH(line ${ENT_VR})
  48   STRING(REGEX REPLACE
  49     "^([A-Z][A-Z]) (.*)/ +//.*$"
  50     "  vr[\"\\1\"] = \"\\2\"; " nline "${line}")
  51   SET(DICOM_VR_DICTIONARY "${DICOM_VR_DICTIONARY}\n${nline}")
  52 ENDFOREACH(line)
  53
  54 FILE(READ "DicomDir.dic" ENT_DIR)
  55 STRING(REGEX REPLACE "\\\\" "\\\\\\\\" ENT_DIR "${ENT_DIR}")
  56 STRING(REGEX REPLACE ";" "/" ENT_DIR "${ENT_DIR}") # CMake doesn't like ';'
  57 STRING(REGEX REPLACE "\n" ";" ENT_DIR "${ENT_DIR}")
  58 SET(DICOM_DIR_DICTIONARY "")
  59
  60 FOREACH(line ${ENT_DIR})
  61   STRING(REGEX REPLACE
  62     "^(metaElem|patientElem|studyElem|serieElem|imageElem) *([a-f0-9]+) ([a-f0-9]+) [\"](.*)[\"](.*)$"
  63     "  \"\\1\" , 0x\\2 , 0x\\3 , \"\\4\", \\5" nline "${line}")
  64   SET(DICOM_DIR_DICTIONARY "${DICOM_DIR_DICTIONARY}\n${nline}")
  65 ENDFOREACH(line)
  66
  67 SET(DICOM_DIR_DICTIONARY "${DICOM_DIR_DICTIONARY} \n 0,0,0,0")
  68
  69 # See above
  70 CONFIGURE_FILE("${GDCM_SOURCE_DIR}/src/gdcmDefaultDicts.cxx.in" "${GDCM_BINARY_DIR}/src/gdcmDefaultDicts.cxx" IMMEDIATE)
  71
  72
  73 FILE(READ "dicomV3VM2004.dic" ENT2)
  74 STRING(REGEX REPLACE "\n" ";" ENT2 "${ENT2}")
  75 SET(DICOM_DICTIONARY2 "")
  76
  77 FOREACH(line ${ENT2})
  78   STRING(REGEX REPLACE
  79 #    "^([0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f]) ([0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f]) ([A-Z]+) ([A-Z]+) (.*)([ \(RET\)]*)$"
  80     "^([0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f]) ([0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f]) ([A-Z]+) ([0-9]|[1]-[0-9n]|[2]-[2][n]|[3]-[3][n]) (.*)$"
  81 #    "   { \\1, \\2, \"\\3\" , \"\\4\" , \"\\5\", \"\\6\"}," nline "${line}")
  82     "   { \\1, \\2, \"\\3\" , \"\\4\" , \"\\5\"}," nline "${line}")
  83   SET(DICOM_DICTIONARY2 "${DICOM_DICTIONARY2}\n${nline}")
  84 ENDFOREACH(line)
  85
  86
  87
  88 #FILE(READ "04_06PU.txt" ENT3)
  89 FILE(READ "extract.txt" ENT3)
  90
  91 STRING(REGEX REPLACE "\n" ";" ENT3 "${ENT3}")
  92 SET(DICOM_DICTIONARY3 "")
  93
  94 FOREACH(line ${ENT3})
  95   STRING(REGEX REPLACE
  96 #    "^[(]([0-9a-fA-F]+),([0-9a-fA-F]+)[)] (.*) ([A-ZA-Z]*) ([[0-3][-][1-3n]*|[1-]*[0-9]+]*) ?([RET|Retired]*)$"
  97     "^[(]([0-9a-fA-F]+),([0-9a-fA-F]+)[)]  +(.*)  +([A-ZA-Z   [[0-3][-][1-3n]*|[1-]*[0-9]+]]*)([ RET]*)$"
  98     "   { \\1 , \\2, \\3, \\4, \\5  }," nline "${line}")
  99   STRING(COMPARE NOTEQUAL "${line}" "${nline}" add)
 100   IF(add)
 101     #SET(DICOM_DICTIONARY3 "${DICOM_DICTIONARY3}\n${nline}")
 102     MESSAGE("${nline}")
 103   ELSE(add)
 104     MESSAGE("WRONG:${nline}")
 105   ENDIF(add)
 106 ENDFOREACH(line)
 107
 108
 109 # Txt generation:
 110 # ~/Software/xpdf-3.00-linux/pdftotext -f 9 -l 81 -raw -nopgbrk 04_06PU.PDF 04_06PU-3.txt