Dicts/CMakeLists.txt

   1 #-----------------------------------------------------------------------------
   2 # DICOM dictionary stuff
   3
   4 #-----------------------------------------------------------------------------
   5 # Generate our own 'DICOM' dictionary, based on the following dictionaries:
   6 SET(ALL_DICTS
   7   dicomV3.dic
   8   #Papyrus.dic
   9   #NIH.dic     #the forbidden one...
  10   #  SPI.dic
  11   #  PHILIPS-Intera.dic # uncomment me if you want
  12   #GEMS.dic #Commented out to avoid polluting 'non GEMS' images
  13   #GEMS-HiSpeed.dic
  14   #  GEMS-Advance.dic
  15   )
  16
  17 # Better solution
  18 SET(TEST_DICT_BODY)
  19 FOREACH(dict ${ALL_DICTS})
  20   # Properly set dependencies, therefore `touch Philips-Intera.dic` does not rebuild
  21   # but adding/removing a line in Philips-Intera.dic rebuild as expected
  22   CONFIGURE_FILE("${GDCM_SOURCE_DIR}/Dicts/${dict}"
  23        "${GDCM_BINARY_DIR}/Dicts/${dict}" COPYONLY IMMEDIATE)
  24   FILE(READ "${GDCM_SOURCE_DIR}/Dicts/${dict}" dict_append)
  25   SET(TEST_DICT_BODY "${TEST_DICT_BODY}\n${dict_append}")
  26 ENDFOREACH(dict)
  27 CONFIGURE_FILE("${GDCM_SOURCE_DIR}/Dicts/gdcm.dic.in"
  28   "${GDCM_BINARY_DIR}/Dicts/gdcm.dic" @ONLY IMMEDIATE)
  29
  30 #-----------------------------------------------------------------------------
  31 # Nice trick to avoid creating a .h file each time we compile gdcm
  32 # Since CONFIGURE_FILE do a 'copy if different'
  33 # We have to write the file here since is contains 'DICOM_DICTIONARY'
  34 # Which is a variable afterward...
  35
  36 # Following code contributing by Andy Cedilnik (Kitware)
  37 FILE(READ "${GDCM_BINARY_DIR}/Dicts/gdcm.dic" ENT)
  38 STRING(REGEX REPLACE "\r?\n" ";" ENT "${ENT}")
  39 SET(DICOM_DATA_DICTIONARY "")
  40
  41 FOREACH(line ${ENT})
  42   STRING(REGEX REPLACE
  43     "^([0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f]) ([0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f][0-9a-f]) ([A-Z]+) ([1-9n-]+) (.*)$"
  44     "   {0x\\1, 0x\\2, \"\\3\" , \"\\4\" , \"\\5\"}, " nline "${line}")
  45   SET(DICOM_DATA_DICTIONARY "${DICOM_DATA_DICTIONARY}\n${nline}")
  46 ENDFOREACH(line)
  47
  48 SET(DICOM_DATA_DICTIONARY "${DICOM_DATA_DICTIONARY} \n {0,0,0,0,0}")
  49
  50 #-----------------------------------------------------------------------------
  51 # ... for DicomTS file
  52 FILE(READ "dicomTS.dic" ENT_TS)
  53 STRING(REGEX REPLACE "\r?\n" ";" ENT_TS "${ENT_TS}")
  54 SET(DICOM_TS_DICTIONARY "")
  55
  56 FOREACH(line ${ENT_TS})
  57   STRING(REGEX REPLACE
  58     "^([0-9.]+) +(.*)$"
  59     "  ts[\"\\1\"] = \"\\2\"; " nline "${line}")
  60   SET(DICOM_TS_DICTIONARY "${DICOM_TS_DICTIONARY}\n${nline}")
  61 ENDFOREACH(line)
  62
  63 #-----------------------------------------------------------------------------
  64 # ... for DicomVR file
  65 FILE(READ "dicomVR.dic" ENT_VR)
  66 STRING(REGEX REPLACE ";" "/" ENT_VR "${ENT_VR}") # CMake doesn't like ';'
  67 STRING(REGEX REPLACE "\r?\n" ";" ENT_VR "${ENT_VR}")
  68 SET(DICOM_VR_DICTIONARY "")
  69
  70 FOREACH(line ${ENT_VR})
  71   STRING(REGEX REPLACE
  72     "^([A-Z][A-Z]) (.*)/ +//.*$"
  73     "  vr[\"\\1\"] = \"\\2\"; " nline "${line}")
  74   SET(DICOM_VR_DICTIONARY "${DICOM_VR_DICTIONARY}\n${nline}")
  75 ENDFOREACH(line)
  76
  77 #-----------------------------------------------------------------------------
  78 # ... for DictGroupName file
  79 FILE(READ "DictGroupName.dic" ENT_TS)
  80 STRING(REGEX REPLACE "\r?\n" ";" ENT_TS "${ENT_TS}")
  81 SET(DICT_GROUP_NAME_DICTIONARY "")
  82
  83 FOREACH(line ${ENT_TS})
  84   STRING(REGEX REPLACE
  85     "^([0-9a-f]+) +(.*)$"
  86     "  groupName[0x\\1] = \\2; " nline "${line}")
  87   SET(DICT_GROUP_NAME_DICTIONARY "${DICT_GROUP_NAME_DICTIONARY}\n${nline}")
  88 ENDFOREACH(line)
  89
  90 #-----------------------------------------------------------------------------
  91 # ... for DicomDir file
  92 FILE(READ "DicomDir.dic" ENT_DIR)
  93 STRING(REGEX REPLACE "\\\\" "\\\\\\\\" ENT_DIR "${ENT_DIR}")
  94 STRING(REGEX REPLACE ";" "/" ENT_DIR "${ENT_DIR}") # CMake doesn't like ';'
  95 STRING(REGEX REPLACE "\r?\n" ";" ENT_DIR "${ENT_DIR}")
  96 SET(DICOM_DIR_DICTIONARY "")
  97
  98 FOREACH(line ${ENT_DIR})
  99   STRING(REGEX REPLACE
 100     "^(metaElem|patientElem|studyElem|serieElem|imageElem) *([a-f0-9]+) ([a-f0-9]+) [\"](.*)[\"] [\"](.*)[\"] (.*)$"
 101     "  {\"\\1\" , 0x\\2 , 0x\\3 , \"\\4\", \"\\5\"}, \\6" nline "${line}")
 102   SET(DICOM_DIR_DICTIONARY "${DICOM_DIR_DICTIONARY}\n${nline}")
 103 ENDFOREACH(line)
 104
 105 #-----------------------------------------------------------------------------
 106 # ... Set the dictionnary
 107 SET(DICOM_DIR_DICTIONARY "${DICOM_DIR_DICTIONARY} \n {0,0,0,0,0}")
 108
 109 CONFIGURE_FILE("${GDCM_SOURCE_DIR}/src/gdcmDefaultDicts.cxx.in"
 110   "${GDCM_BINARY_DIR}/src/gdcmDefaultDicts.cxx" IMMEDIATE)
 111
 112 #-----------------------------------------------------------------------------
 113 # For now GDCM_INSTALL_NO_DICTIONARY is a hidden variables
 114 IF(NOT GDCM_INSTALL_NO_DICTIONARY)
 115   INSTALL_FILES(${GDCM_INSTALL_DATA_DIR} .dic
 116     dicomV3
 117     dicomVR
 118     dicomTS
 119     DicomDir
 120     DictGroupName
 121     gdcm
 122     )
 123 ENDIF(NOT GDCM_INSTALL_NO_DICTIONARY)
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