Dicts/README

   1 Sources for dicom public dictionaries:
   2  * the official source is the part 6 of the dicom standard (see
   3    http://www.dclunie.com/dicom-status/status.html#BaseStandard2001).
   4  * http://www.fpimage.com/Manuals/Imp/dicomdic.html
   5    an html group based presentation.
   6  * ftp://rsbweb.nih.gov/pub/nih-image/documents/dicom-dict.txt
   7    a C syntax oriented version provided by NIH (Jim Nash)
   8  * http://afni.nimh.nih.gov/afni/AFNI_Dist/afni_src.tgz
   9    extract mri_dicom_hdr.c (tar zxvf afni_src.tgz afni_src/mri_dicom_hdr.c)
  10    and look for the definitions of CMD_dictionary, META_dictionary,
  11    ID_dictionary, PAT_dictionary...
  12  * Actually, the *official* Dicom Data Dictionary
  13    is on http://medical.nema.org/dicom/2003/03_06PU.pdf
  14    (check it every year, some tags are added, some names change)
  15    All C syntax oriented stuff, or anything else -but gdcm one-
  16    you can find on the net is very partial.
  17    WARNING : The Dicom Tag is an identifier inside the Dicom Dictionary,
  18              The Tag Name *is not*
  19
  20
  21 Comment on the file NIH.dic, you can find the following discussion
  22 on comp.protocol.dicom(*). As clearly specify by David Clunie all
  23 thoses tags are extremely dangerous to use since they override some
  24 other, we are only adding them to gdcm to be able to read /apparently/
  25 some NIH images. SHOULD NOT EVER BE USED FOR WRITTING IMAGES !
  26
  27 (*)
  28 [Re: Retired element VR and VM, was Re: 0028,3006 LUT Data (nightmare)]
  29 ...
  30 > 'gdcm' Dicom dictionary uses a few tags, such as :
  31 >  0018 106b UI 1 Synchronization Frame of Reference
  32 This should be:
  33 (0020,0200) Synchronization Frame of Reference UID
  34 >  0028 0122 US 1 Waveform Padding Value
  35 (5400,100A)    Waveform Padding Value
  36 >   003a 0002 SQ 1 Waveform Sequence
  37 (5400,0100)    Waveform Sequence
  38 >   003a 0103 CS 1 Data Value Representation
  39 (50xx,0103)    Data Value Representation
  40 >   0040 0552 SQ 1 Specimen Description Sequence
  41 No such attribute
  42 >   0040 0553 ST 1 Specimen Description
  43 No such attribute
  44 >   0040 09f8 SQ 1 Vital Stain Code Sequence
  45 No such attribute
  46 >   0040 a16a ST 1 Bibliographics Citation
  47 No such attribute
  48 >   0040 a992 ST 1 Uniform Resource Locator
  49 No such attribute
  50
  51 I suspect these were taken for the draft for trial implementation
  52 of Sup 23 SR, which was problematic in many ways, not the least
  53 of which was that some of its attributes with the same number
  54 were re-used with different purpose and VR, etc.
  55
  56 Some may have been from early drafts of other supplements (e.g.,
  57 waveform from the looks of things).
  58
  59 None of these should ever be used.
  60 ...
  61
  62
  63
  64
  65
  66
  67 Remarks about dicomV3Intera.dic:
  68
  69 This document is produced /somehow/ using document at:
  70 [Intera 10.1]
  71 http://www.medical.philips.com/main/company/connectivity/assets/docs/dicomcs/Conformance_Statement_MR_101_v04.pdf
  72
  73 [DICOM Conformance Statement]
  74 http://www.medical.philips.com/main/company/connectivity/assets/docs/dicomcs/MR_InteraR104dcs.pdf
  75
  76
  77 Remarks about GEMS.dic
  78
  79 This document is produced using:
  80 GE Medical Systems HISPEED ADVANTAGE CT/i CONFORMANCE STATEMENT:
  81 http://www.gehealthcare.com/euen/interoperability/docs/2162114_100r5.pdf
  82
  83 the 0023 tags were also extracted from:
  84 [Technical Publications]
  85 http://www.gehealthcare.com/usen/interoperability/dicom/docs/22046092.pdf
  86
  87 Ok I finally understood the Private Creator thing:
  88 V 0025|0010 lg :       x(c) 12       Off.:     x(e4e) 3662    [LO]                                                      [gdcm::Unknown] [GEMS_SERS_01]
  89 V 0027|0010 lg :       x(c) 12       Off.:     x(eda) 3802    [LO]                                                      [gdcm::Unknown] [GEMS_IMAG_01]
  90 V 0029|0010 lg :       x(c) 12       Off.:    x(10b8) 4280    [LO]                                                      [gdcm::Unknown] [GEMS_IMPS_01]
  91 V 0043|0010 lg :       x(c) 12       Off.:    x(112a) 4394    [LO]                                                      [gdcm::Unknown] [GEMS_PARM_01]
  92
  93 And if you take document:
  94 http://www.gehealthcare.com/euen/interoperability/docs/2288567_100r3_0.pdf
  95 they are all described:
  96
  97 B.2.5 Private Creator Identification (GEMS_STDY_01)
  98 B.2.6 Private Creator Identification (GEMS_SERS_01)
  99 B.2.7 Private Creator Identification (GEMS_IMAG_01)
 100 ...
 101
 102 In fact the best document is:
 103 LightSpeed QX/i 1.2 Conformance Statement for DICOM v3.0 (ID/Net v3.0)
 104 http://www.gehealthcare.com/euen/interoperability/docs/2288567_100r3_0.pdf
 105
 106
 107 I was searching for 0043 1039, I could only find:
 108 http://www.gehealthcare.com/it_solutions/connectivity/pdf/hispeed_np.pdf
 109 ok -> http://www.gehealthcare.com/usen/interoperability/dicom/docs/hispeed_np.pdf
 110 but the link points nowhere, the document describes:
 111 HiSpeed LX/i, FX/i, DX/i, DX/iB 2.00/2.01/2.02 CONFORMANCE STATEMENT for DICOM v3.0
 112
 113 ..let's use google cache... not fun !
 114
 115
 116 0043 1060 was found at: http://www.gehealthcare.com/it_solutions/connectivity/pdf/2246181r25.pdf
 117 ok -> http://www.gehealthcare.com/usen/interoperability/dicom/docs/2246181r25.pdf
 118 0043 1060 IS 8 slop_int_10...slop_int_17
 119
 120 I would also need:
 121 Signa Horizon Lx DICOM CONFORMANCE STATEMENT for DICOM v3.0
 122 grrrr: Vas flags 0043 1032 SS 1 in http://www.vitalcom.com/it_solutions/connectivity/pdf/2317752r3.pdf
 123 ok: -> www.gehealthcare.com/usen/interoperability/dicom/docs/2317752r3.pdf
 124 but 0043 1032 SS 1 Raw data type http://www.vitalcom.com/it_solutions/connectivity/pdf/2171143r25.pdf
 125 ok -> www.gehealthcare.com/usen/interoperability/dicom/docs/2171143r25.pdf
 126
 127 Adding a page from : http://www.vitalcom.com/it_solutions/connectivity/pdf/2317752r3.pdf
 128
 129 A Coord of Top Right Corner (0027,1049) FL 1
 130 S Coord of Top Right Corner (0027,104A) FL 1
 131 R Coord of Bottom Right Corner (0027,104B) FL 1
 132 A Coord of Bottom Right Corner (0027,104C) FL 1
 133 S Coord of Bottom Right Corner (0027,104D) FL 1
 134 Image dimension - X (0027,1060) FL 1
 135 Image dimension - Y (0027,1061) FL 1
 136 Number of Excitations (0027,1062) FL 1
 137 B.1. 8 Private Creator Identification (GEMS_IMPS_01)
 138 Lower range of Pixels1 (0029,1015) SL 1
 139 Lower range of Pixels1 (0029,1016) SL 1
 140 Lower range of Pixels2 (0029,1017) SL 1
 141 Upper range of Pixels2 (0029,1018) SL 1
 142 Len of tot hdr in bytes (0029,101A) SL 1
 143 Version of the hdr struct (0029,1026) SS 1
 144 Advantage comp. Overflow (0029,1034) SL 1
 145 Advantage comp. Underflow (0029,1035) SL 1
 146 B.1. 9 Private Creator Identification (GEMS_PARM_01)
 147 Bitmap of prescan options (0043,1001) SS 1
 148 Gradient offset in X (0043,1002) SS 1
 149 Gradient offset in Y (0043,1003) SS 1
 150 Gradient offset in Z (0043,1004) SS 1
 151 Img is original or unoriginal (0043,1005) SS 1
 152 Number of EPI shots (0043,1006) SS 1
 153 Views per segment (0043,1007) SS 1
 154 Respiratory rate, bpm (0043,1008) SS 1
 155 Respiratory trigger point (0043,1009) SS 1
 156 Type of receiver used (0043,100A) SS 1
 157 Peak rate of change of gradient field (0043,100B) DS 1
 158 Limits in units of percent (0043,100C) DS 1
 159 PSD estimated limit (0043,100D) DS 1
 160 PSD estimated limit in tesla per second (0043,100E) DS 1
 161 Saravghead (0043,100F) DS 1
 162 Window value (0043,1010) US 1
 163 GE image integrity (0043,101C) SS 1
 164 Level value (0043,101D) SS 1
 165 Unique image iden (0043,1028) OB 1
 166 Histogram tables (0043,1029) OB 1
 167 User defined data (0043,102A) OB 1
 168 Private Scan Options (0043,102B) SS 4
 169 Effective echo spacing (0043,102C) SS 1
 170 String slop field 1 (0043,102D) SH 1
 171 String slop field 2 (0043,102E) SH 1
 172 Image Type (real, imaginary, phase, magnitude) (0043,102F) SS 1
 173 Vas collapse flag (0043,1030) SS 1
 174
 175 RA cord of target recon center (0043,1031) DS 2
 176 Vas flags (0043,1032) SS 1
 177 Neg_scanspacing (0043,1033) FL 1
 178 Offset Frequency (0043,1034) IS 1
 179 User_usage_tag (0043,1035) UL 1
 180 User_fill_map_MSW (0043,1036) UL 1
 181 User_fill_map_LSW (0043,1037) UL 1
 182 User data 25...User data 48 (0043,1038) FL 24
 183 Slop_int_6... slop_int_9 (0043,1039) IS 4
 184  6: b_value
 185  7: private imaging options 2
 186  8: ihtagging
 187  9: ihtagspc
 188 Slop_int_10...slop_int_17 (0043,1060) IS 8
 189  10: ihfcineim
 190  11: ihfcinent
 191  12: Reserved
 192  13: oprtarr
 193  14: averages
 194  15: Current Station #
 195  16: Total # of Stations
 196  17: Reserved
 197
 198 Scanner Study Entity UID (0043,1061) UI 1
 199 Scanner Study ID (0043,1062) SH 1
 200 Scanner Table Entry (single gradient coil systems only)
 201 Scanner Table Entry + Gradient Coil Selected (0043,106f) DS 3 or 4
 202
 203
 204 -------------------------------------------------
 205 Notes from:
 206 PathSpeedtm PACS Version 8.0 CONFORMANCE STATEMENT for DICOM V3.0
 207 http://www.gehealthcare.com/it_solutions/connectivity/pdf/iis_fp_10282r1.pdf
 208 ok -> www.gehealthcare.com/usen/interoperability/dicom/docs/iis_fp_10282r1.pdf
 209
 210 See GE_ImageThumbnails
 211 --------------------------------------------------
 212
 213
 214 About ACUSON.dic, generated from aspen3.pdf:
 215 [Acusion Aspen(tm) Ultrasound System Dicom Conformance Statement for aspen 3.0 3.5]
 216 http://mais.baikal.ru/library/pdf/aspen3.pdf
 217
 218
 219 --------------------------------------------------
 220 According to :
 221 http://www.gehealthcare.com/usen/interoperability/dicom/docs/ep250409r4.pdf
 222
 223 2.5 EXTENSIONS / SPECIALIZATIONS / PRIVATIZATIONS
 224 If so configured, the product will send ultrasound raw data information in private data elements designated by the Private
 225 Creator element:
 226
 227 Element Name Tag VR VM Description
 228 Private Creator 7FE1,00xx LO 1 GEMS_Ultrasound_MovieGroup_001
 229
 230 This means that all private tags starting with 7FE1,xx will belong to the GEMS_Ultrasound_MovieGroup_001.
 231 If so configured, the product will send preview image in private data elements designated by the Private Creator element:
 232
 233 Element Name Tag VR VM Description
 234 Private Creator 6003,00xx LO 1 GEMS_Ultrasound_ImageGroup_001
 235
 236 This means that all private tags starting with 6003,00xx will belong to the GEMS_Ultrasound_ImageGroup_001
 237
 238 --------------------------------------------------
 239 In preparation for the new Philips dictionaray with values taken from:
 240 http://www.medical.philips.com/main/company/connectivity/assets/docs/dicomcs/mr91.pdf
 241 rename the old dictionary to avoid confusion
 242
 243 Basically all the dictionary should have been:
 244
 245 2001 xx22 FL 1 Water Fat Shift
 246 instead of
 247 2001 1022 FL 1 Water Fat Shift
 248
 249
 250 About GEMS Genie:
 251 Doc was taken from:
 252 http://www.gehealthcare.com/usen/fun_img/nmedicine/nmdicom/docs/confstmt.pdf
 253
 254 433  echo "http://www.gehealthcare.com/usen/fun_img/nmedicine/nmdicom/docs/confstmt.pdf" > GEMS-Genie.dic
 255 To build GEMS-Genie I also used: http://www.gehealthcare.com/usen/fun_img/nmedicine/nmdicom/docs/2383442_100r1.pdf
 256
 257 434  echo "http://www.gehealthcare.com/usen/interoperability/dicom/docs/2270669_100r0_3.pdf" > GEMS-Advance.dic
 258
 259 According to 2270669_100r0_3.pdf, there is different interpretation for:
 260
 261 0009 10b3 SL 1 GE Advance ImageSet.ir_num_subsets
 262 0009 10b4 FL 1 GE Advance ImageSet.ir_recon_fov
 263
 264 or:
 265
 266 0009 10b4 FL 1 GE Advance ImageSet.ir_num_subsets
 267 ... grrrr
 268 ok nevermind I found also this document:
 269 http://www.gehealthcare.com/usen/fun_img/pet/docs/5101600GDOr0.pdf
 270 that defines:
 271 0009 10b3 SL 1 GE Advance ImageSet.ir_num_subsets
 272
 273
 274 --------------------------------------------------
 275 About 6002,1000 I only found one ref:
 276 [Advantage Workstation 4.0 CONFORMANCE STATEMENT for DICOM V3.0]
 277 http://www.gehealthcare.com/usen/interoperability/dicom/docs/2261302_100r1.pdf
 278
 279
 280 --------------------------------------------------
 281 For GEMS-Advantx.dic
 282 [EchoPAC PC version 4 CONFORMANCE STATEMENT for DICOM]
 283 http://www.gehealthcare.com/it_solutions/connectivity/pdf/EP250409r06.pdf
 284 ok -> www.gehealthcare.com/usen/interoperability/dicom/docs/EP250409r06.pdf
 285 http://www.gehealthcare.com/usen/xr/dicom/docs/2142506_100r01_ps.pdf
 286
 287
 288 --------------------------------------------------
 289 ELSCINT Dictionary was done by ripping stuff from:
 290 Value Multiplicity was deducted by looking at the values for this particular image...
 291 http://www.merge-efilm.com/phpbb2/viewtopic.php?t=171&sid=11cde708c1f4feac179467c117373732
 292
 293
 294 About PHILIPS-EasyVision.dic, BE VERY AFRAID:
 295 http://www.medical.philips.com/main/company/connectivity/assets/docs/dicomcs/ev44_final.pdf
 296 ... pure pleasure...
 297
 298
 299 --------------------------------------------------
 300 SPI.dic and SIEMENS.dic were generated based on D. Clunie work at:
 301 [3.3.2.2.2 Siemens Magnetom SP SPI Format]
 302 http://www.dclunie.com/medical-image-faq/html/part4.html
 303
 304 and spi.tpl siemens.tpl from dicom3tools (20050611 snapshot)
 305
 306
 307 ---------------------------------------------------
 308
 309 Alright SIEMENS is totally screwed up...
 310 Let's have a look at:
 311 [Aristos VB10]
 312 http://www.medical.siemens.com/siemens/en_INT/rg_marcom_FBAs/files/brochures/DICOM/ax/Aristos_DicomConformanceStatement.pdf
 313
 314 SOMATOM syngo VA50A DICOM Conformance Statement
 315 http://61.62.116.208/webhd/adams/LinkedDocuments/SENSATION_16.pdf
 316
 317 SOMATOM syngo VA45A DICOM Conformance Statement
 318 http://61.62.116.208/webhd/adams/LinkedDocuments/EMOTION%206%20DICOM.pdf
 319
 320 Somaris/5 VA70A CT DICOM Conformance Statement
 321 http://www.petscaninfo.com/zportal/portals/ctimi/prodandserv/dicom_statements/xvi.pdf