Doc/Website/ConformanceSummary.html

   1 <!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
   2 <HTML>
   3 <HEAD>
   4    <META http-equiv="Content-Type" content="text/html;charset=iso-8859-1">
   5    <TITLE>Gdcm supported formats</TITLE>
   6 </HEAD>
   7
   8 <BODY>
   9
  10 <!#######################################################################>
  11 <H1>Gdcm DICOM v3.0 conformance summary</H1>
  12 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
  13
  14 <!#######################>
  15 <H2>Introduction</H2>
  16
  17 This section is an abbreviated DICOM conformance statement for gdcm.
  18 <BR>
  19 It specifies the compliance of gdcm to file reading/writing
  20 support to the
  21 <A HREF="http://www.dclunie.com/dicom-status/status.html">
  22           dicom base standard <B>part 5</B></A>.
  23 <BR>
  24 Gdcm <B>does not contain or support any of the DICOM services</B>
  25 such as Storage, Query/Retrieve, Print, Verification...
  26
  27 <!##############################################>
  28 <H2>Supported transfer syntaxes (Reading)</H2>
  29 The Transfer Syntax UID is in the file DICOM Tag field (0002,0010).
  30
  31 <TABLE WIDTH="800" BORDER="0" CELLSPACING="1" CELLPADDING="10"
  32        BGCOLOR="#ffffff">
  33 <!####### Uncompressed #########>
  34 <TR BGCOLOR="#99ccff">
  35    <TH> Uncompressed Transfer Syntax </TH>
  36    <TH> Description </TH>
  37 </TR>
  38 <TR>
  39    <TD> 1.2.840.10008.1.2 </TD>
  40    <TD> Implicit VR - Little Endian</TD>
  41 </TR>
  42 <TR>
  43    <TD> 1.2.840.10008.1.2.1 </TD>
  44    <TD> Explicit VR - Little Endian</TD>
  45 </TR>
  46 <TR>
  47    <TD> 1.2.840.10008.1.2.1.99</TD>
  48    <TD> Deflated Explicit VR - Little Endian</TD>
  49 </TR>
  50 <TR>
  51    <TD> 1.2.840.10008.1.2.2 </TD>
  52    <TD> Explicit VR - Big Endian </TD>
  53 </TR>
  54 <TR>
  55    <TD> 1.2.840.113619.5.2 </TD>
  56    <TD> Implicit VR - Big Endian (G.E Private) </TD>
  57 </TR>
  58
  59
  60 <!####### RLE #########>
  61 <TR BGCOLOR="#99ccff">
  62    <TD> RLE Transfer Syntax </TD>
  63    <TD></TD>
  64 </TR>
  65 <TR>
  66    <TD> 1.2.840.10008.1.2.5 </TD>
  67    <TD> Run Length Encoding, Lossless</TD>
  68 </TR>
  69
  70 <!####### JPEG #########>
  71 <TR BGCOLOR="#99ccff">
  72    <TD> JPEG Transfer Syntax </TD>
  73    <TD></TD>
  74 </TR>
  75 <TR>
  76    <TD> 1.2.840.10008.1.2.4.50 </TD>
  77    <TD> JPEG Baseline (Process 1)</TD>
  78 </TR>
  79 <TR>
  80    <TD> 1.2.840.10008.1.2.4.51 </TD>
  81    <TD> JPEG Extended (Process 2 & 4) </TD>
  82 </TR>
  83 <TR>
  84    <TD> 1.2.840.10008.1.2.4.57 </TD>
  85    <TD> JPEG Lossless, Non-Hierarchical (Process 14) </TD>
  86 </TR>
  87 <TR>
  88    <TD> 1.2.840.10008.1.2.4.70 </TD>
  89    <TD> JPEG Lossless, Hierarchical, First-Order
  90         Prediction (Process 14, [Selection Value 1]) </TD>
  91 </TR>
  92 <TR>
  93    <TD> 1.2.840.10008.1.2.4.90 </TD>
  94    <TD> JPEG 2000 Image Compression (Lossless Only) </TD>
  95 </TR>
  96 <TR>
  97    <TD> 1.2.840.10008.1.2.4.91 </TD>
  98    <TD> JPEG 2000 Image Compression </TD>
  99 </TR>
 100 </TABLE>
 101
 102 <!##############################################>
 103 <H2>Supported transfer syntaxes (Writing)</H2>
 104 The Transfer Syntax UID is in the file DICOM Tag field (0002,0010).
 105
 106 <TABLE WIDTH="800" BORDER="0" CELLSPACING="1" CELLPADDING="10"
 107        BGCOLOR="#ffffff">
 108 <!####### Uncompressed #########>
 109 <TR BGCOLOR="#99ccff">
 110    <TH> Uncompressed Transfer Syntax </TH>
 111    <TH> Description </TH>
 112 </TR>
 113 <TR>
 114    <TD> 1.2.840.10008.1.2 </TD>
 115    <TD> Implicit VR - Little Endian</TD>
 116 </TR>
 117 <TR>
 118    <TD> 1.2.840.10008.1.2.1 </TD>
 119    <TD> Explicit VR - Little Endian</TD>
 120 </TR>
 121 <!####### JPEG #########>
 122 <TR BGCOLOR="#99ccff">
 123    <TD> JPEG Transfer Syntax </TD>
 124    <TD></TD>
 125 </TR>
 126 <TR>
 127    <TD> 1.2.840.10008.1.2.4.50 </TD>
 128    <TD> JPEG Baseline (Process 1)</TD>
 129 </TR>
 130 <TR>
 131    <TD> 1.2.840.10008.1.2.4.51 </TD>
 132    <TD> JPEG Extended (Process 2 & 4) </TD>
 133 </TR>
 134 <TR>
 135    <TD> 1.2.840.10008.1.2.4.57 </TD>
 136    <TD> JPEG Lossless, Non-Hierarchical (Process 14) </TD>
 137 </TR>
 138 <TR>
 139    <TD> 1.2.840.10008.1.2.4.70 </TD>
 140    <TD> JPEG Lossless, Hierarchical, First-Order
 141         Prediction (Process 14, [Selection Value 1]) </TD>
 142 </TR>
 143 <TR>
 144    <TD> 1.2.840.10008.1.2.4.90 </TD>
 145    <TD> JPEG 2000 Image Compression (Lossless Only) </TD>
 146 </TR>
 147 <TR>
 148    <TD> 1.2.840.10008.1.2.4.91 </TD>
 149    <TD> JPEG 2000 Image Compression </TD>
 150 </TR>
 151 </TABLE>
 152 <!##############################################>
 153 <H2>Supported "Photometric Interpretation" pixel format (Reading)</H2>
 154 The Photometric Interpretation UID is in the file DICOM Tag field (0028,0004).
 155
 156 <TABLE WIDTH="800" BORDER="0" CELLSPACING="1" CELLPADDING="10"
 157        BGCOLOR="#ffffff">
 158 <TR BGCOLOR="#99ccff">
 159    <TH> Photometric Interpretation" pixel format </TH>
 160    <TH> Description </TH>
 161 </TR>
 162 <TR>
 163    <TD> MONOCHROME1 </TD>
 164    <TD> grey level image description (high values=dark, low values=bright)</TD>
 165 </TR>
 166 <TR>
 167    <TD> MONOCHROME2 </TD>
 168    <TD> grey level image description (high values=bright, low values=dark)</TD>
 169 </TR>
 170 <TR>
 171    <TD> PALETTE COLOR </TD>
 172    <TD> pseudo color image description</TD>
 173 </TR>
 174 <TR>
 175    <TD> RGB </TD>
 176    <TD> true color image description</TD>
 177 </TR>
 178 <TR>
 179    <TD> YBR_FULL </TD>
 180    <TD> true color image description</TD>
 181 </TR>
 182 <TR>
 183    <TD> YBR_FULL_422 </TD>
 184    <TD> true color image description</TD>
 185 </TR>
 186 </TABLE>
 187
 188 </TABLE>
 189 <!##############################################>
 190 <H2>Supported "Photometric Interpretation" pixel format (Writing)</H2>
 191 The Photometric Interpretation UID is in the file DICOM Tag field (0028,0004).
 192
 193 <TABLE WIDTH="800" BORDER="0" CELLSPACING="1" CELLPADDING="10"
 194        BGCOLOR="#ffffff">
 195 <TR BGCOLOR="#99ccff">
 196    <TH> Photometric Interpretation" pixel format </TH>
 197    <TH> Description </TH>
 198 </TR>
 199 <TR>
 200    <TD> MONOCHROME2 </TD>
 201    <TD> grey level image description (high values=bright, low values=dark)</TD>
 202 </TR>
 203 <TR>
 204    <TD> PALETTE COLOR </TD>
 205    <TD> pseudo color image description</TD>
 206 </TR>
 207 <TR>
 208    <TD> RGB </TD>
 209    <TD> true color image description</TD>
 210 </TR>
 211
 212 </TABLE>
 213
 214
 215 <!##############################################>
 216 <H2>Supported 'Bits Allocated' values (Reading)</H2>
 217 The Bits Allocated value is in the file DICOM Tag field (0020,0100).
 218
 219 <TABLE WIDTH="800" BORDER="0" CELLSPACING="1" CELLPADDING="10"
 220        BGCOLOR="#ffffff">
 221 <!####### Uncompressed #########>
 222 <TR BGCOLOR="#99ccff">
 223    <TH> Classical values </TH>
 224    <TH> Description </TH>
 225 </TR>
 226 <TR>
 227    <TD> 8, 12, 16 </TD>
 228    <TD> 12 means that 4 pixels are stored in 3 'short int'</TD>
 229 </TR>
 230 <TR BGCOLOR="#99ccff">
 231    <TH> Unusual values </TH>
 232    <TH> Description </TH></TR>
 233 <TR>
 234    <TD> 24 </TD>
 235    <TD> Some ACR-NEMA RGB files came with 'Bits Allocated' = 24
 236      and 'Samples Per Pixel' = 1, or with no 'Samples Per Pixel'
 237      at all  </TD>
 238 </TR>
 239 <TR>
 240    <TD> 32 </TD>
 241    <TD> Some ACR-NEMA files, from CT,  came with 'Bits Allocated' = 32
 242       (probabely 65535 grey levels was not enough for them ...)
 243    </TD>
 244 </TR>
 245 </TABLE>
 246
 247 <!##############################################>
 248 <H2> Note on odd length data elements</H2>
 249
 250 The Dicom Standard PS 3.5 (Data Structures and Encoding) specifies that
 251 the data element values which make up a DICOM data stream must be padded
 252 to an even length.
 253 <BR>
 254 Gdcm will <B>tolerate</B> an incorrectly formed odd length data field while
 255 <B>reading</B> (thus not enforcing the standard).
 256 <BR>
 257 But gdcm will always <B>enforce</B> the standard while <B>writing</B>.
 258
 259 <!##############################################>
 260 <H2> Note on undefined Value Representations</H2>
 261
 262 If gdcm encounters an undefined VR (either because in a private group,
 263 or because it corresponds to an undocumented public dictionary entry
 264 when in implicit VR) while reading a file, it will set that data
 265 element's VR to be UN (unknown).
 266
 267 <!##############################################>
 268 <H2> Note on missing 'Mandatory' Tags</H2>
 269
 270 Each time it's possible to assume a 'reasonable' default value for missing
 271 'mandatory' tag, gdcm does it. <br>
 272 For instance if the Tag 'Samples Per Pixels' is missing, we assume its value is
 273 '1' (Grey pixels, as opposite to RGB); <br>
 274 if the tag 'High Bit' is missing, we
 275 assume its value is 'Bits stored -1' (i.e. : no bad trick inside the pixels)<br>
 276 As gdcm wants to read *as well* old ACR-NEMA files, it has to be widely
 277 tolerant.
 278
 279
 280 <!##############################################>
 281 <H2> Note 'Value Multiplicity'</H2>
 282
 283 gdcm believes what's written on disc, better than the 'Dicom Dictionary'.<br>
 284 For instance if the field 'Pixels Spacing' contains a single value -instead of
 285 the mandatory two, gdcm will suppose both values are equal.
 286
 287
 288 <!##############################################>
 289 <H2>Note on retired data elements</H2>
 290
 291 Certain data elements are no longer supported under the v3.0 of the DICOM
 292 standard but persist as retired element. Gdcm maintain them in its Dicom
 293 Dictionary, postfix their names with the "(RET)" string, and goes on dealing
 294 with them as standard data elements.
 295
 296
 297 <!#######################################################################>
 298 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
 299 <H2><B>UN</B>Supported transfer syntaxes</H2>
 300 The Transfer Syntax UID is in the file DICOM Tag field (0002,0010).
 301
 302 <TABLE WIDTH="800" BORDER="0" CELLSPACING="1" CELLPADDING="10"
 303        BGCOLOR="#ffffff">
 304 <!####### Uncompressed #########>
 305 <TR BGCOLOR="#99ccff">
 306    <TH> Jpeg UNSUPPORTED Transfer Syntax </TH>
 307    <TH> Description </TH>
 308 </TR>
 309 <TR>
 310    <TD> 1.2.840.10008.1.2.4.52 </TD>
 311    <TD> JPEG Extended (Process 3 & 5) </TD>
 312 </TR>
 313 <TR>
 314    <TD> 1.2.840.10008.1.2.4.53</TD>
 315    <TD> JPEG Spectral Selection, Non-Hierarchical (Process 6 & 8)</TD>
 316 </TR>
 317 <TR>
 318    <TD> 1.2.840.10008.1.2.4.54 </TD>
 319    <TD> JPEG Spectral Selection, Non-Hierarchical (Process 7 & 9)</TD>
 320 </TR>
 321 <TR>
 322    <TD> 1.2.840.10008.1.2.4.55 </TD>
 323    <TD> JPEG Full Progression, Non-Hierarchical (Process 10 & 12)</TD>
 324 </TR>
 325 <TR>
 326    <TD> 1.2.840.10008.1.2.4.56 </TD>
 327    <TD> JPEG Full Progression, Non-Hierarchical (Process 11 & 13) </TD>
 328 </TR>
 329 <TR>
 330    <TD> 1.2.840.10008.1.2.4.59 </TD>
 331    <TD> JPEG Extended, Hierarchical (Process 16 & 18) </TD>
 332 </TR>
 333 <TR>
 334    <TD> 1.2.840.10008.1.2.4.60 </TD>
 335    <TD> JPEG Extended, Hierarchical (Process 17 & 19)</TD>
 336 </TR>
 337 <TR>
 338    <TD> 1.2.840.10008.1.2.4.61 </TD>
 339    <TD> JPEG Spectral Selection, Hierarchical (Process 20 & 22) </TD>
 340 </TR>
 341 <TR>
 342    <TD> 1.2.840.10008.1.2.4.62 </TD>
 343    <TD> JPEG Spectral Selection, Hierarchical (Process 21 & 23) </TD>
 344 </TR>
 345 <TR>
 346    <TD> 1.2.840.10008.1.2.4.63 </TD>
 347    <TD> JPEG Full Progression, Hierarchical (Process 24 & 26)</TD>
 348 </TR>
 349 <TR>
 350    <TD> 1.2.840.10008.1.2.4.64 </TD>
 351    <TD> JPEG Full Progression, Hierarchical (Process 25 & 27) </TD>
 352 </TR>
 353 <TR>
 354    <TD> 1.2.840.10008.1.2.4.80 (partial)</TD>
 355    <TD> JPEG-LS Lossless Image Compression </TD>
 356 </TR>
 357 <TR>
 358    <TD> 1.2.840.10008.1.2.4.81 (partial)</TD>
 359    <TD> JPEG-LS Lossy (Near-Lossless) Image Compression </TD>
 360 </TR>
 361 <TR>
 362    <TD> 1.2.840.10008.1.2.4.100 (partial)</TD>
 363    <TD> MPEG2 Main Profile @ Main Level </TD>
 364 </TR>
 365
 366 </TABLE>
 367
 368
 369 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
 370
 371 </BODY>
 372 </HTML>