Doc/Website/News.html

   1 <!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
   2 <HTML>
   3 <HEAD>
   4    <META http-equiv="Content-Type" content="text/html;charset=iso-8859-1">
   5    <TITLE>Gdcm News</TITLE>
   6 </HEAD>
   7
   8 <BODY>
   9
  10
  11 <!--#######################################################################-->
  12 <H1>Gdcm News</a></H1>
  13
  14 <!--#######################################################################-->
  15
  16 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
  17 <H2>
  18    <A CLASS="anchor" NAME="missing">
  19       <B>Missing features</B></A>
  20 </H2>
  21 We know the following are missing; don't loose time looking for them ...<br>
  22 We know they could be helpfull. We shall add them some day.<br>
  23 Any contribution is welcome.
  24 <UL>
  25 <LI> Decoders
  26    <UL>
  27       <LI> gdcm doesn't read yet JPEG-LS encoded files.
  28       <UL>
  29           We said 'JPEG-LS', not Lossless Jpeg ...<br>
  30           [JPEG-LS is the basis for new lossless/near-lossless compression
  31           standard for continuous-tone images intended for JPEG2000.
  32           The standard is based on the LOCO-I algorithm
  33           (LOw COmplexity LOssless COmpression for Images)
  34           developed at Hewlett-Packard Laboratories]
  35      </UL>
  36      <LI> gdcm doesn't read yet JPEG2000 encoded files.
  37      <UL>
  38          But we are working on it.
  39       </UL>
  40       <LI> gdcm doesn't read yet MPEG2 encoded files.
  41       <UL>
  42           But we are working on it.
  43       </UL>
  44    </UL>
  45 <LI>Reader
  46    <UL>
  47       <LI> Allow user to tell <TT>gdcm::Document</TT> constructor he just wants
  48            to load a given list of <TT>DocEntries</TT>
  49            (to save CPU time and RAM space)
  50       <LI> Allow 'frame by frame' reading (should be helpfull for huge
  51            multiframe images)
  52       <LI> Allow subvolume selection / frames selection before reading.
  53       <LI> Expose Read/Decompression mechanisms to allow user getting
  54          information from <tt>DICOMDIR</TT> <br> -or from his own Data Base-
  55          and reading his images without parsing
  56          the header, one more time.
  57    </UL>
  58    <LI>Writer
  59    <UL>
  60       <LI> Allow user to tell the Writer he doesn't want to write down
  61            <TT>SeqEntry</TT> (if any)
  62       <LI> Allow user to tell the Writer he doesn't want to write down
  63            <TT>Shadow groups</TT> (if any)
  64       <LI> Allow user to tell the Writer which compression mode he wants<br>
  65            (Right now, no one is available)
  66       <LI> Allow user to tell the Writer he wants to split a
  67            <TT>Multiframe</TT> image into a serie of
  68            <TT>Single frame</TT> images.
  69       <LI> Allow user to tell the Writer he wants to agregate a
  70            Serie of <TT>Single frame</TT> images into a
  71            <TT>Multiframe</TT> image.
  72    </UL>
  73 <LI>Reader / Writer
  74    <UL>
  75       <LI> Full <TT>Icon Image</TT> management (Read and Write)
  76       <LI> Full <TT>Overlays</TT> management (Read and Write) <br>
  77            both for '<TT>ACR-NEMA</TT> style' (using groups <TT>0x6000</TT>
  78             and nexts) and '<TT>DICOM V3</TT> style' (using Sequences)
  79    </UL>
  80 <LI> <TT>DICOMDIR</TT>
  81     <UL>
  82       <LI> <TT>DICOMDIR</TT> full management (not limited to
  83            <TT> PATIENT</TT>/<TT>STUDY</TT>/<TT>SERIE</TT>/<TT>IMAGE</TT>)
  84       <LI> Allow user to add an entry (belonging to the file header Dicom
  85            entries)to the default entry list, before
  86            making a <TT>DICOMDIR</TT> from a root directory
  87       <LI> Allow user to add an entry of his owns (for instance an <TT>Icon</TT>
  88            to each image, or to each Serie).
  89       </UL>
  90 <LI> SerieHelper
  91    <UL>
  92
  93       <LI> An accurate <TT>SerieHelper</TT> <br>
  94            Right now <TT>SerieHelper</TT> only works on 'bona fide Series', and
  95            breaks on wrongly forged Series.<br>
  96            We are still looking for any heuristics...
  97       <LI> A <TT>SerieHelper</TT> that would use the <TT>DICOMDIR</TT> (if any)
  98         instead of parsing all the files within the Root Directory
  99    </UL>
 100 <LI> Other
 101    <UL>
 102       <LI> 16-bits-LUT full Management
 103       <LI> User friendly management of <TT>Rescale Slope</TT> and
 104            <TT>Rescale Intercept</TT>
 105       <LI> Allow parsing the <TT>Shadow groups</TT> against a user supplied
 106            private <TT>Dicom Dictionary</TT> (pfff!...)
 107    </UL>
 108 </UL>
 109 <!#######################################################################>
 110 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
 111 <H2>
 112    <A CLASS="anchor" NAME="NewsCurrentVersion">
 113    <B>Current Version</B></A>
 114       <B></B></A>
 115 </H2>
 116
 117 <UL>
 118    <LI>State of the art
 119    <UL>
 120       <LI>
 121          <a href="uml-gdcm.pdf">gdcm UML Class Diagram</a> current version.
 122       <LI>
 123    </UL>
 124
 125    <LI> New Features
 126    <UL>
 127       <LI>Both <TT>vtkgdcmViewer</TT> and <TT>vtkgdcmViewer2</TT>
 128           are available to allow easy displaying of single/multiframe
 129           GreyLevel/RGB/PaletteColor images<br><br>
 130       <LI> <TT>DICOMDIR</TT> anonymiser (<TT>Load</TT> and <TT>Noload</TT> mode)
 131            <br><br>
 132       <LI> Because the <TT>gdcm::DicomDir::Load()</TT> method may be used
 133            either for loading an already made <TT>DICOMDIR</TT> file or for
 134            parsing all the dicom files with a given root directory we
 135            syntaxically separated the operations: <br>
 136            For loading an already made <TT>DICOMDIR</TT> file, use : <br>
 137            <pre>
 138            gdcm::DicomDir *d = new gdcm::DicomDir();
 139            d->SetFileName(fileName);
 140            d->Load( );
 141            </pre>
 142
 143            For parsing all the dicom files with a given root directory, use :<br>
 144            <pre>
 145            gdcm::DicomDir *d = new gdcm::DicomDir();
 146            d->SetDirectoryName(dirName);
 147            d->Load( )
 148            </pre>
 149
 150            <b>Don't</b> use any longer old deprecated style: <br>
 151            <TT>
 152            gdcm::DicomDir *d = new gdcm::DicomDir();<br>
 153            d->SetParseDir(true);   // </TT>or <TT>d->SetParseDir(false);<br>
 154            d->Load( fileName );<br>
 155            </TT>
 156            <br>
 157       <LI> User is now allowed to tell <TT>gdcm::Document</TT> constructor
 158             he doesn't want to deal with <TT>SeqEntry</TT>
 159             (every time it's possible) <br> and/or he doesn't
 160             want to deal with <TT>Shadow groups</TT> (every time it's
 161             possible) <br> or he doesn't
 162             want to deal with <TT>SeqEntry</TT> that belong to a <TT>Shadow group</TT>  (every time it's
 163             possible)<br>
 164             use : <br>
 165             <pre>
 166             gdcm::File *f = new gdcm::File();
 167                   f->SetLoadMode(NO_SEQ);            | depending on what
 168                   f->SetLoadMode(NO_SHADOW);         | you want *not*
 169                   f->SetLoadMode(NO_SEQ | NO_SHADOW);| to load from the
 170                   f->SetLoadMode(NO_SHADOWSEQ);      | target file
 171             f->SetFileName(fileName);
 172             f->Load( );
 173             </pre>
 174             <b>Don't</b> use any longer old deprecated style: <br>
 175             <TT>
 176             gdcm::File *f = new gdcm::File(fileName);</TT> <br>
 177             <br>
 178         <LI> User is now allowed to tell <TT>gdcm::DicomDir</TT> constructor
 179             he doesn't want to deal with <TT>SeqEntry</TT>
 180             he doesn't want to deal with <TT>SeqEntry</TT>
 181             (every time it's possible) <br> and/or he doesn't
 182             want to deal with <TT>Shadow groups</TT> (every time it's
 183             possible) <br> or he doesn't
 184             want to deal with <TT>SeqEntry</TT> that belong to a <TT>Shadow group</TT>  (every time it's
 185             possible)<br> when he parses all the Dicom files within a given
 186             directory
 187             use : <br>
 188             <pre>
 189             gdcm::DicomDir *f = new gdcm::DicomDir();
 190                   f->SetLoadMode(NO_SEQ);            | depending on what
 191                   f->SetLoadMode(NO_SHADOW);         | you want *not*
 192                   f->SetLoadMode(NO_SEQ | NO_SHADOW);| to load from the files
 193                   f->SetLoadMode(NO_SHADOWSEQ);      | within the root directory
 194             f->SetDirectoryName(rootDirectoryName);
 195             f->Load( );
 196             </pre>
 197             <b>Don't</b> use any longer old deprecated style: <br>
 198             <TT>
 199             gdcm::DicomDir *dcmdir = new gdcm::DicomDir(dirName, true);</TT><br>
 200             <br>
 201    </UL>
 202
 203    <LI> Bug fixes
 204    <UL>
 205       <LI> The difference between <TT>MONOCHROME1</TT> (low values = bright,
 206             high values = dark) and <TT>MONOCHROME2</TT> (low values = dark,
 207             high values = bright) is now taken into account.<br>
 208             It's no longer up to the user to change the pixels value
 209       <LI> Writing a 'True Dicom' image after reading an <TT>ACR-NEMA</TT> image
 210            does not request any longer from the user to build up
 211             'manually' the Meta Elements group (<TT>Ox0002</TT>)
 212       <LI> Old '24 Bits' <TT>ACR-NEMA</TT> are now correctly re-written
 213            in <TT>DICOM V3</TT> mode.
 214       <LI> Element <TT>0x0000</TT> of <TT>Shadow groups</TT> is always forced to be a
 215            <TT>ValEntry</TT> and its <TT>VR</TT> is forced to <TT>UL</TT>
 216       <LI>
 217    </UL>
 218
 219    <LI> A.P.I. breaking modifications (since previous version : <TT>1.0</TT>)
 220    <UL>
 221       <LI> NEVER more API breaking modifications !!!
 222
 223    </UL>
 224
 225    <LI> Known bugs
 226    <UL>
 227       <LI> Use of <TT>Implicit Value Representation</TT> writting mode may
 228            causes troubles, when there are some <TT>SQ</TT> belonging to a
 229            <TT>Shadow Group</TT>. <br>
 230            Better you use <TT>Explicit Value Representation</TT> writting mode ...
 231    </UL>
 232
 233 </UL>
 234
 235
 236
 237 <!#######################################################################>
 238 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
 239 <H2>
 240    <A CLASS="anchor" NAME="NewsVersion1_0">
 241       <B>Version 1.0 (Feb 14 2005)</B></A>
 242 </H2>
 243 <UL>
 244    <LI>State of the art
 245    <UL>
 246       <LI>
 247          <a href="Doc1.0/uml-gdcmV1.0.pdf">gdcm 1.0 UML Class Diagram</a> version.
 248       <LI> <a href= "Doc1.0/html.user/index.html">User Documentation"</a>
 249       <LI> <a href= "Doc1.0/html.developper/index.html">Developper
 250          Documentation"</a>
 251       <LI> Final check of the jpeg sub-library: all 'classical' jpeg
 252         compressed Dicom files can be read<br>
 253       <LI>All the previously gdcm-breaker images are now readable<br>
 254       <LI> A huge number of memory leaks removed
 255       <LI> Improvement of write process
 256    </UL>
 257
 258
 259    <LI> A.P.I. breaking modifications (since previous version : <TT>0.6</TT>)
 260    <UL>
 261       <LI> Use of <TT> namespace</TT> : all the methods formerly named
 262           <TT>className::gdcmXxx()</TT> are now named <TT>className::Xxx()</TT>
 263           <br> End user will have to call them as <TT>gdcm::className::Xxx() </TT>
 264       <LI> a <TT>gdcm::Document</TT> is now specialized in :
 265       <UL>
 266          <LI> <TT>gdcm::DicomDir</TT>
 267          <LI> <TT>gdcm::File</TT>
 268       </UL>
 269       <LI> a <TT>gdcm::DicomElementSet</TT> is composed of a set of
 270             <TT>gdcm::DicomDocEntry</TT>
 271       <LI> a <TT>gdcm::DicomDocEntry</TT> can be :
 272       <UL>
 273          <LI> a <TT>gdcm::ContentEntry</TT>, specialized in :
 274          <UL>
 275             <LI> <TT>gdcm::ValEntry</TT>
 276             <LI> <TT>gdcm::BinEntry</TT> (no longer a specialization of
 277                  <TT>gdcm::ValEntry</TT>)
 278         </UL>
 279       <LI> a <TT>gdcm::SeqEntry</TT>
 280       </UL>
 281       <LI> Removal of useless accessors <TT>GetXxxByname</TT>, <TT>SetXxxByname</TT>
 282       <LI> Renaming of accessors <TT>GetXxxByNumber</TT>, <TT>SetXxxByNumber</TT>
 283            as follow :
 284       <UL>
 285          <LI> <TT>GetEntryByNumber
 286                   &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
 287                                           --> GetEntryValue</TT>
 288          <LI> <TT>GetEntryLengthByNumber  --> GetEntryLength</TT>
 289          <LI> <TT>GetEntryOffsetByNumber  --> GetEntryOffset</TT>
 290          <LI> <TT>GetEntryVRByNumber
 291                   &nbsp;&nbsp;&nbsp;      --> GetEntryVR</TT>
 292          <LI>
 293          <LI> <TT>GetDocEntryByNumber
 294                   &nbsp;&nbsp;            --> GetDocEntry</TT>
 295          <LI> <TT>GetValEntryByNumber
 296                   &nbsp;&nbsp;            --> GetValEntry</TT>
 297          <LI> <TT>GetBinEntryByNumber
 298                   &nbsp;&nbsp;            --> GetBinEntry</TT>
 299          <LI> <TT>GetSeqEntryByNumber
 300                   &nbsp;&nbsp;            --> GetSeqEntry</TT>
 301        </UL>
 302    </UL>
 303 </UL>
 304
 305 <!#######################################################################>
 306 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
 307 <H2>
 308    <A CLASS="anchor" NAME="NewsVersion0_6">
 309       <B>Version 0.6 (June 8 2004)</B></A>
 310 </H2>
 311 <UL>
 312    This version will be used by Insight Tool Kit
 313    (<a href="http://www.itk.org">ITK</a> 2.0) at the beginning of 2005.<br>
 314     It's not yet packaged ...<br><br>
 315    <LI> <a href= "Doc0.6/html.user/index.html">User Documentation"</a>
 316    <LI> <a href= "Doc0.6/html.developper/index.html">Developper Documentation"</a>
 317    <LI> The new <TT>gdcmDocument</TT> class is a parent class of
 318        <TT>gdcmHeader</TT> class and <TT>gdcmDicomDir</TT> class.
 319    <LI> Massive modifications in the Class Diagram :
 320    <UL>
 321       <LI> any dicom related file is a <TT>gdcmDocument</TT>
 322       <LI> a <TT>gdcmDocument</TT> can be :
 323       <UL>
 324          <LI> a <TT>gdcmHeader</TT>, if it contains pixel data
 325          <LI> a <TT>gdcmDicomDir</TT>, if it contains only informations
 326               on the files in a given directory
 327       </UL>
 328
 329    <LI> a <TT>gdcmDocument</TT> is_a <TT>gdcmElementSet</TT>,
 330         composed of a set of <TT>gdcmEntry</TT> separated into :
 331       <UL>
 332       <LI> <TT>gdcmValEntry</TT><br>
 333            a specialization of <TT>gdcmValEntry</TT>, for 'non
 334            <TT>std::string</TT> representable' values is
 335            <TT>gdcmBinEntry</TT>
 336        <LI> <TT>gdcmSeqEntry</TT> (VR = <TT>SQ</TT>, i.e Dicom Sequences)<br>
 337              they are dealt as tree-like structures :<br>
 338              - a <TT>gdcmSeqEntry</TT> is considered as a set
 339              of <TT>gdcmSQItem</TT>,<br>
 340              - a <TT>gdcmSQItem</TT> is_a <TT>gdcmElementSet</TT>, composed
 341              of <TT>gdcmDocEntries</TT>, recursively <br>
 342       </UL>
 343    </UL>
 344    <LI> Improvement of the jpeg sub-library: jpeg
 345            compressed Dicom files (lossless and lossy)
 346            might be read (check-it out)
 347 </UL>
 348
 349 <!#######################################################################>
 350 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
 351 <H2>
 352    <A CLASS="anchor" NAME="NewsVersion0_4">
 353       <B>Version 0.4 (February 6 2004)</B></A>
 354 </H2>
 355 <UL>
 356
 357    <LI> <a href="Doc0.4/uml-gdcmV0.4.pdf">gdcm 0.4 UML Class Diagram</a>.
 358    <LI> <a href= "Doc0.4/html.user/index.html">User Documentation"</a>
 359    <LI> <a href= "Doc0.4/html.developper/index.html">Developper Documentation </a>
 360
 361    <LI> Introduction of a jpeg sub-library: some very simple jpeg-lossy
 362         compressed Dicom files might be working (check-it out).
 363    <LI> And also, fewer memory leaks, cleaned-up stl usage (should work
 364         with gcc-3.x), python disutil installer (see file setup.py)
 365         supporting both Swig and vtk wrapping.
 366    <LI> Introduction of a RLE (Run-Time Encoding) library
 367    <LI> Color images (RGB or Palette Color) are dealt with
 368    <LI> Confusing names <TT>gdcmPatient</TT>, <TT>gdcmStudy</TT>,
 369         <TT>gdcmSerie</TT>, <TT>gdcmPatient</TT> changed to
 370         <TT>gdcmDicomDirPatient</TT>, <TT>gdcmDicomDirStudy</TT>,
 371         <TT>gdcmDicomDirSerie</TT>, <TT>gdcmDicomDirPatient</TT>
 372
 373 </UL>
 374
 375 <!#######################################################################>
 376 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
 377 <H2>
 378    <A CLASS="anchor" NAME="NewsVersion0_3">
 379       <B>Version 0.3 (July 8 2003)</B></A>
 380 </H2>
 381 <UL>
 382    <LI> <TT>gdcmFile</TT> class now enables acces to the data
 383        i.e. the image[s] content. Previously only parsing of the
 384        Dicom header was available through usage of <TT>gdcmHeader</TT>
 385        class.
 386    <LI> a <A HREF="http://public.kitware.com/VTK/">VTK</A> plugin
 387        of gdcm is now available through the <TT>vtkGdcmReader</TT>
 388        vtk class (see it as a vtk wrapper of gdcm), which enables
 389        <UL>
 390          <LI> Loading of a single image,
 391          <LI> Loading of a stack of images from multiple Dicom files,
 392          <LI> this class is wrapped for vtkPython (by using native vtk
 393               wrappers).
 394        </UL>
 395    <LI> Introduction of a jpeg sub-library: lossless-jpeg
 396         compressed Dicom files work.
 397 <LI> <TT>vtkgdcmViewer</TT> allows easy displaying of single/multiframe
 398      GreyLevel/RGB/PaletteColor images
 399 </UL>
 400
 401 <!#######################################################################>
 402 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
 403 <H2>
 404    <A CLASS="anchor" NAME="NewsVersion0_1">
 405       <B>Version 0.1 (April 1 2003)</B></A>
 406
 407 <!#######################################################################>
 408 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
 409 <H2>
 410    <A CLASS="anchor" name="NewsVersion0_1">
 411       <B>Version 0.0 (March 14 2003)</B></A>
 412
 413 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADRESS>
 414
 415 </BODY>
 416 </HTML>