Doc/Website/News.html

   1 <!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
   2 <HTML>
   3 <HEAD>
   4    <META http-equiv="Content-Type" content="text/html;charset=iso-8859-1">
   5    <TITLE>Gdcm News</TITLE>
   6 </HEAD>
   7
   8 <BODY>
   9
  10
  11 <!#######################################################################>
  12 <H1>Gdcm News</a></H1>
  13
  14 <!#######################################################################>
  15
  16 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
  17 <H2>
  18    <A CLASS="anchor" NAME="missing">
  19       <B>Missing features</B></A>
  20 </H2>
  21 We know the following are missing; don't loose time looking for them ...<br>
  22 We know they could be helpfull. We shall add them some day.<br>
  23 Any contribution is welcome.
  24 <UL>
  25 <LI> Decoders
  26    <UL>
  27       <LI> gdcm doesn't read yet JPEG-LS and JPEG2000 encoded files.
  28       <LI> gdcm doesn't read yet MPEG encoded files.
  29    </UL>
  30 <LI>Reader
  31    <UL>
  32       <LI> Allow user to tell <TT>gdcm::Document</TT> constructor he just wants
  33            to load a given list of <TT>DocEntries</TT>
  34            (to save CPU time and RAM space)
  35       <LI> Allow 'frame by frame' reading (should be helpfull for huge multiframe
  36 images)
  37       <LI> Expose Read/Decompression mechanisms to allow user getting
  38          information from <tt>DICOMDIR</TT> <br> -or from his own Data Base-
  39          and reading his images without parsing
  40          the header, one more time.
  41    </UL>
  42    <LI>Writer
  43    <UL>
  44       <LI> Allow user to tell the Writer he doesn't want to write down
  45            <TT>SeqEntry</TT> (if any)
  46       <LI> Allow user to tell the Writer he doesn't want to write down
  47            <TT>Shadow groups</TT> (if any)
  48       <LI> Allow user to tell the Writer which compression mode he wants<br>
  49            (Right now, no one is available)
  50    </UL>
  51 <LI>Reader / Writer
  52    <UL>
  53       <LI> Full <TT>Icon Image</TT> management (Read and Write)
  54       <LI> Full <TT>Overlays</TT> management (Read and Write) <br>
  55            both for '<TT>ACR-NEMA</TT> style' (using groups <TT>0x6000</TT>
  56             and nexts) and '<TT>DICOM V3</TT> style' (using Sequences)
  57    </UL>
  58 <LI> <TT>DICOMDIR</TT>
  59     <UL>
  60       <LI> <TT>DICOMDIR</TT> full management (not limited to
  61            <TT> PATIENT</TT>/<TT>STUDY</TT>/<TT>SERIE</TT>/<TT>IMAGE</TT>)
  62       <LI> Allow user to add an entry (belonging to the file header Dicom
  63            entries)to the default entry list, before
  64            making a <TT>DICOMDIR</TT> from a root directory
  65       <LI> Allow user to add an entry of his owns (for instance an <TT>Icon</TT>
  66            to each image, or to each Serie.
  67       </UL>
  68 <LI> SerieHelper
  69    <UL>
  70
  71       <LI> An accurate <TT>SerieHelper</TT> <br>
  72            Right now <TT>SerieHelper</TT> only works on 'bona fide Series', and
  73            breaks on wrongly forged Series.<br>
  74            We are still looking for any heuristics...
  75       <LI> A <TT>SerieHelper</TT> that would use the <TT>DICOMDIR</TT> (if any)
  76         instead of parsing all the files within the Root Directory
  77    </UL>
  78 <LI> Other
  79    <UL>
  80       <LI> 16-bits-LUT full Management
  81       <LI> User friendly management of <TT>Rescale Slope</TT> and
  82            <TT>Rescale Intercept</TT>
  83       <LI> Allow parsing the <TT>Shadow groups</TT> against a user supplied
  84            private <TT>Dicom Dictionary</TT> (pfff!...)
  85    </UL>
  86 </UL>
  87 <!#######################################################################>
  88 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
  89 <H2>
  90    <A CLASS="anchor" NAME="NewsCurrentVersion">
  91    <B>Current Version</B></A>
  92       <B></B></A>
  93 </H2>
  94
  95 <UL>
  96    <LI>State of the art
  97    <UL>
  98       <LI>
  99          <a href="uml-gdcm.pdf">gdcm UML Class Diagram</a> current version.
 100       <LI>
 101    </UL>
 102
 103    <LI> New Features
 104    <UL>
 105       <LI>Both <TT>vtkgdcmViewer</TT> and <TT>vtkgdcmViewer2</TT>
 106           are available to allow easy displaying of single/multiframe
 107           GreyLevel/RGB/PaletteColor images
 108       <LI> <TT>DICOMDIR</TT> anonymiser (<TT>Load</TT> and <TT>Noload</TT> mode)
 109       <LI> User is now allowed to tell <TT>gdcm::Document</TT> constructor
 110             he doesn't want to deal with <TT>SeqEntry</TT>
 111             (every time it's possible) <br> and/or he doesn't
 112             want to deal with <TT>Shadow groups</TT> (every time it's
 113             possible)<br>
 114             use : <br><TT>
 115             gdcm::File *f = new gdcm::File();<br>
 116             f->SetLoadMode(NO_SEQ | NO_SHADOW);<br>
 117             f->Load(fileName);<br>
 118             </TT>
 119             instead of : <br>
 120             <TT>
 121             gdcm::File *f = new gdcm::File(fileName);</TT> <br>
 122             (old style still available)
 123
 124         <LI> User is now allowed to tell <TT>gdcm::DicomDir</TT> constructor
 125             he doesn't want to deal with <TT>SeqEntry</TT>
 126             (every time it's possible) <br> and/or he doesn't
 127             want to deal with <TT>Shadow groups</TT> (every time it's
 128             possible)<br>
 129             use : <br><TT>
 130             gdcm::DicomDir *dcmdir = new gdcm::DicomDir( );<br>
 131             dcmdir->SetParseDir(true);<br>
 132             dcmdir->SetLoadMode(NO_SEQ | NO_SHADOW);<br>
 133             dcmdir->Load(dirName);<br>
 134             </TT>
 135             instead of : <br>
 136             <TT>
 137             gdcm::DicomDir *dcmdir = new gdcm::DicomDir(dirName, true);</TT><br>
 138             (old style still available)
 139        <LI>
 140    </UL>
 141
 142    <LI> Bug fixes
 143    <UL>
 144       <LI> The difference between <TT>MONOCHROME1</TT> (low values = bright,
 145             high values = dark) and <TT>MONOCHROME2</TT> (low values = dark,
 146             high values = bright) is now taken into account.<br>
 147             It's no longer up to the user to change the pixels value
 148       <LI> Writing a 'True Dicom' image after reading an <TT>ACR-NEMA</TT> image
 149            does not request any longer from the user to build up
 150             'manually' the Meta Elements group (<TT>Ox0002</TT>)
 151       <LI> Old '24 Bits' <TT>ACR-NEMA</TT> are now correctly re-written
 152            in <TT>DICOM V3</TT> mode.
 153       <LI> Element <TT>0x0000</TT> of <TT>Shadow groups</TT> is always forced to be a
 154            <TT>ValEntry</TT> and its <TT>VR</TT> is forced to <TT>UL</TT>
 155       <LI>
 156    </UL>
 157
 158    <LI> A.P.I. breaking modifications (since previous version : <TT>1.0</TT>)
 159    <UL>
 160       <LI> NEVER more API breaking modifications !!!
 161
 162    </UL>
 163
 164    <LI> Known bugs
 165    <UL>
 166       <LI>
 167    </UL>
 168
 169    <LI> Sample Data
 170    <UL>
 171       Get a <a href="gdcmData.tar.gz">gzipped tarball</a> of sample data
 172        (warning : 185 Megabytes ...)
 173    </UL>
 174 </UL>
 175
 176
 177
 178 <!#######################################################################>
 179 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
 180 <H2>
 181    <A CLASS="anchor" NAME="NewsVersion1_0">
 182       <B>Version 1.0 (Feb 14 2005)</B></A>
 183 </H2>
 184 <UL>
 185    <LI>State of the art
 186    <UL>
 187       <LI>
 188          <a href="Doc1.0/uml-gdcmV1.0.pdf">gdcm 1.0 UML Class Diagram</a> version.
 189       <LI> <a href= "Doc1.0/html.user/index.html">User Documentation"</a>
 190       <LI> <a href= "Doc1.0/html.developper/index.html">Developper
 191          Documentation"</a>
 192       <LI> Final check of the jpeg sub-library: all 'classical' jpeg
 193         compressed Dicom files can be read<br>
 194       <LI>All the previously gdcm-breaker images are now readable<br>
 195       <LI> A huge number of memory leaks removed
 196       <LI> Improvement of write process
 197    </UL>
 198
 199
 200    <LI> A.P.I. breaking modifications (since previous version : <TT>0.6</TT>)
 201    <UL>
 202       <LI> Use of <TT> namespace</TT> : all the methods formerly named
 203           <TT>className::gdcmXxx()</TT> are now named <TT>className::Xxx()</TT>
 204           <br> End user will have to call them as <TT>gdcm::className::Xxx() </TT>
 205       <LI> a <TT>gdcm::Document</TT> is now specialized in :
 206       <UL>
 207          <LI> <TT>gdcm::DicomDir</TT>
 208          <LI> <TT>gdcm::File</TT>
 209       </UL>
 210       <LI> a <TT>gdcm::DicomElementSet</TT> is composed of a set of
 211             <TT>gdcm::DicomDocEntry</TT>
 212       <LI> a <TT>gdcm::DicomDocEntry</TT> can be :
 213       <UL>
 214          <LI> a <TT>gdcm::ContentEntry</TT>, specialized in :
 215          <UL>
 216             <LI> <TT>gdcm::ValEntry</TT>
 217             <LI> <TT>gdcm::BinEntry</TT> (no longer a specialization of
 218                  <TT>gdcm::ValEntry</TT>)
 219         </UL>
 220       <LI> a <TT>gdcm::SeqEntry</TT>
 221       </UL>
 222       <LI> Removal of useless accessors <TT>GetXxxByname</TT>, <TT>SetXxxByname</TT>
 223       <LI> Renaming of accessors <TT>GetXxxByNumber</TT>, <TT>SetXxxByNumber</TT>
 224            as follow :
 225       <UL>
 226          <LI> <TT>GetEntryByNumber
 227                   &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
 228                                           --> GetEntryValue</TT>
 229          <LI> <TT>GetEntryLengthByNumber  --> GetEntryLength</TT>
 230          <LI> <TT>GetEntryOffsetByNumber  --> GetEntryOffset</TT>
 231          <LI> <TT>GetEntryVRByNumber
 232                   &nbsp;&nbsp;&nbsp;      --> GetEntryVR</TT>
 233          <LI>
 234          <LI> <TT>GetDocEntryByNumber
 235                   &nbsp;&nbsp;            --> GetDocEntry</TT>
 236          <LI> <TT>GetValEntryByNumber
 237                   &nbsp;&nbsp;            --> GetValEntry</TT>
 238          <LI> <TT>GetBinEntryByNumber
 239                   &nbsp;&nbsp;            --> GetBinEntry</TT>
 240          <LI> <TT>GetSeqEntryByNumber
 241                   &nbsp;&nbsp;            --> GetSeqEntry</TT>
 242        </UL>
 243    </UL>
 244 </UL>
 245
 246 <!#######################################################################>
 247 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
 248 <H2>
 249    <A CLASS="anchor" NAME="NewsVersion0_6">
 250       <B>Version 0.6 (June 8 2004)</B></A>
 251 </H2>
 252 <UL>
 253    This version will be used by Insight Tool Kit
 254    (<a href="http://www.itk.org">ITK</a> 2.0) at the beginning of 2005.<br>
 255     It's not yet packaged ...<br><br>
 256    <LI> <a href= "Doc0.6/html.user/index.html">User Documentation"</a>
 257    <LI> <a href= "Doc0.6/html.developper/index.html">Developper Documentation"</a>
 258    <LI> The new <TT>gdcmDocument</TT> class is a parent class of
 259        <TT>gdcmHeader</TT> class and <TT>gdcmDicomDir</TT> class.
 260    <LI> Massive modifications in the Class Diagram :
 261    <UL>
 262       <LI> any dicom related file is a <TT>gdcmDocument</TT>
 263       <LI> a <TT>gdcmDocument</TT> can be :
 264       <UL>
 265          <LI> a <TT>gdcmHeader</TT>, if it contains pixel data
 266          <LI> a <TT>gdcmDicomDir</TT>, if it contains only informations
 267               on the files in a given directory
 268       </UL>
 269
 270    <LI> a <TT>gdcmDocument</TT> is_a <TT>gdcmElementSet</TT>,
 271         composed of a set of <TT>gdcmEntry</TT> separated into :
 272       <UL>
 273       <LI> <TT>gdcmValEntry</TT><br>
 274            a specialization of <TT>gdcmValEntry</TT>, for 'non
 275            <TT>std::string</TT> representable' values is
 276            <TT>gdcmBinEntry</TT>
 277        <LI> <TT>gdcmSeqEntry</TT> (VR = <TT>SQ</TT>, i.e Dicom Sequences)<br>
 278              they are dealt as tree-like structures :<br>
 279              - a <TT>gdcmSeqEntry</TT> is considered as a set
 280              of <TT>gdcmSQItem</TT>,<br>
 281              - a <TT>gdcmSQItem</TT> is_a <TT>gdcmElementSet</TT>, composed
 282              of <TT>gdcmDocEntries</TT>, recursively <br>
 283       </UL>
 284    </UL>
 285    <LI> Improvement of the jpeg sub-library: jpeg
 286            compressed Dicom files (lossless and lossy)
 287            might be read (check-it out)
 288 </UL>
 289
 290 <!#######################################################################>
 291 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
 292 <H2>
 293    <A CLASS="anchor" NAME="NewsVersion0_4">
 294       <B>Version 0.4 (February 6 2004)</B></A>
 295 </H2>
 296 <UL>
 297
 298    <LI> <a href="Doc0.4/uml-gdcmV0.4.pdf">gdcm 0.4 UML Class Diagram</a>.
 299    <LI> <a href= "Doc0.4/html.user/index.html">User Documentation"</a>
 300    <LI> <a href= "Doc0.4/html.developper/index.html">Developper Documentation </a>
 301
 302    <LI> Introduction of a jpeg sub-library: some very simple jpeg-lossy
 303         compressed Dicom files might be working (check-it out).
 304    <LI> And also, fewer memory leaks, cleaned-up stl usage (should work
 305         with gcc-3.x), python disutil installer (see file setup.py)
 306         supporting both Swig and vtk wrapping.
 307    <LI> Introduction of a RLE (Run-Time Encoding) library
 308    <LI> Color images (RGB or Palette Color) are dealt with
 309    <LI> Confusing names <TT>gdcmPatient</TT>, <TT>gdcmStudy</TT>,
 310         <TT>gdcmSerie</TT>, <TT>gdcmPatient</TT> changed to
 311         <TT>gdcmDicomDirPatient</TT>, <TT>gdcmDicomDirStudy</TT>,
 312         <TT>gdcmDicomDirSerie</TT>, <TT>gdcmDicomDirPatient</TT>
 313
 314 </UL>
 315
 316 <!#######################################################################>
 317 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
 318 <H2>
 319    <A CLASS="anchor" NAME="NewsVersion0_3">
 320       <B>Version 0.3 (July 8 2003)</B></A>
 321 </H2>
 322 <UL>
 323    <LI> <TT>gdcmFile</TT> class now enables acces to the data
 324        i.e. the image[s] content. Previously only parsing of the
 325        Dicom header was available through usage of <TT>gdcmHeader</TT>
 326        class.
 327    <LI> a <A HREF="http://public.kitware.com/VTK/">VTK</A> plugin
 328        of gdcm is now available through the <TT>vtkGdcmReader</TT>
 329        vtk class (see it as a vtk wrapper of gdcm), which enables
 330        <UL>
 331          <LI> Loading of a single image,
 332          <LI> Loading of a stack of images from multiple Dicom files,
 333          <LI> this class is wrapped for vtkPython (by using native vtk
 334               wrappers).
 335        </UL>
 336    <LI> Introduction of a jpeg sub-library: lossless-jpeg
 337         compressed Dicom files work.
 338 <LI> <TT>vtkgdcmViewer</TT> allows easy displaying of single/multiframe
 339      GreyLevel/RGB/PaletteColor images
 340 </UL>
 341
 342 <!#######################################################################>
 343 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
 344 <H2>
 345    <A CLASS="anchor" NAME="NewsVersion0_1">
 346       <B>Version 0.1 (April 1 2003)</B></A>
 347
 348 <!#######################################################################>
 349 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
 350 <H2>
 351    <A CLASS="anchor" name="NewsVersion0_1">
 352       <B>Version 0.0 (March 14 2003)</B></A>
 353
 354 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADRESS>
 355
 356 </BODY>
 357 </HTML>