]> Creatis software - gdcm.git/blob - Doc/Website/News.html
9b45d513f0a1ed4af27e49e086341bcc436f1d7f
[gdcm.git] / Doc / Website / News.html
1 <!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
2 <HTML>
3 <HEAD>
4    <META http-equiv="Content-Type" content="text/html;charset=iso-8859-1">
5    <TITLE>Gdcm News</TITLE>
6 </HEAD>
7
8 <BODY>
9
10
11 <!--#######################################################################-->
12 <H1>Gdcm News</a></H1>
13
14 <!--#######################################################################-->
15
16 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
17 <H2>
18    <A CLASS="anchor" NAME="missing">
19       <B>Missing features</B></A>
20 </H2>
21 We know the following are missing; don't loose time looking for them ...<br>
22 We know they could be helpfull. We shall add them some day.<br>
23 Any contribution is welcome.
24 <UL>
25 <LI> Decoders   
26    <UL>
27       <LI> gdcm doesn't read yet <TT>JPEG-LS</TT> encoded files.
28       <UL>
29           We said '<TT>JPEG-LS</TT>', not Lossless Jpeg ...<br>
30           [<TT>JPEG-LS</TT> is the basis for new lossless/near-lossless compression
31           standard for continuous-tone images intended for <TT>JPEG2000</TT>. 
32           The standard is based on the LOCO-I algorithm 
33           (LOw COmplexity LOssless COmpression for Images) 
34           developed at Hewlett-Packard Laboratories] 
35      </UL>
36      <LI> gdcm doesn't read yet all <TT>JPEG2000</TT> encoded files.
37      <UL>
38          But we are working on it (a lot of troubles with Jasper).
39          Update: as of Oct 10 2005, we are currently investigating another library:
40          openjpeg. The problem still exist for this library but one of the author
41          is currently working on it:
42             http://www.openjpeg.org/forum/viewtopic.php?t=18
43       </UL>
44       <LI> gdcm doesn't read yet <TT>MPEG2</TT> encoded files.
45
46    </UL>
47    <LI>Reader
48    <UL>
49       <LI> Allow user to tell <TT>gdcm::Document</TT> constructor he just wants 
50            to load a given list of <TT>DocEntries</TT> 
51            (to save CPU time and RAM space)
52       <LI> Allow 'frame by frame' reading (should be helpfull for huge 
53            multiframe images)
54       <LI> Allow subvolume selection / frames selection before reading.
55       <LI> Expose Read/Decompression mechanisms to allow user getting
56          information from <tt>DICOMDIR</TT> <br> -or from his own Data Base- 
57          and reading his images without parsing
58          the header, one more time.
59    </UL> 
60    <LI>Writer 
61    <UL> 
62       <LI> Allow user to tell the Writer he doesn't want to write down
63            <TT>SeqEntry</TT> (if any) 
64       <LI> Allow user to tell the Writer he doesn't want to write down
65            <TT>Shadow groups</TT> (if any)
66       <LI> Allow user to tell the Writer which compression mode he wants<br>
67            (Right now, no one is available)
68       <LI> Allow user to tell the Writer he wants to split a
69            <TT>Multiframe</TT> image into a serie of 
70            <TT>Single frame</TT> images.
71       <LI> Allow user to tell the Writer he wants to agregate a
72            Serie of <TT>Single frame</TT> images into a
73            <TT>Multiframe</TT> image.
74    </UL>
75 <LI>Reader / Writer 
76    <UL>  
77       <LI> Full <TT>Icon Image</TT> management (Read and Write) 
78       <LI> Full <TT>Overlays</TT> management (Read and Write) <br>
79            both for '<TT>ACR-NEMA</TT> style' (using groups <TT>0x6000</TT> 
80             and next) and '<TT>DICOM V3</TT> style' (using Sequences)
81    </UL>
82 <LI> <TT>DICOMDIR</TT> 
83     <UL>
84       <LI> <TT>DICOMDIR</TT> full management (not limited to
85            <TT> PATIENT</TT>/<TT>STUDY</TT>/<TT>SERIE</TT>/<TT>IMAGE</TT>)
86       <LI> Allow user to add an entry (belonging to the file header Dicom
87            entries)to the default entry list, before
88            making a <TT>DICOMDIR</TT> from a root directory
89       <LI> Allow user to add an entry of his owns (for instance an <TT>Icon</TT>
90            to each image, or to each Serie).  
91       </UL>
92 <LI> SerieHelper
93    <UL>
94
95       <LI> An accurate <TT>SerieHelper</TT> <br>
96            Right now <TT>SerieHelper</TT> only works on 'bona fide Series', and
97            breaks on wrongly forged Series.<br>
98            We are still looking for any heuristics...  
99       <LI> A <TT>SerieHelper</TT> that would use the <TT>DICOMDIR</TT> (if any)
100         instead of parsing all the files within the Root Directory
101    </UL>
102 <LI> Other
103    <UL>
104       <LI> 16-bits-LUT full Management
105       <LI> User friendly management of <TT>Rescale Slope</TT> and
106            <TT>Rescale Intercept</TT>.<br>
107            (Well... Maybe it's up to the application to deal with it, not to
108            gdcm ?)
109       <LI> Allow manual adjunction / automatic recognition (pfff!...)
110            of the private <TT>Dicom Dictionary</TT>
111            to be used to parse <TT>Shadow groups</TT> against.
112       <LI> User friendly way of anonymizing image when Patient's name is
113            carved in the Pixels :-(
114    </UL>
115 </UL>
116 <!#######################################################################>
117 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
118 <H2>
119    <A CLASS="anchor" NAME="NewsCurrentVersion">
120    <B>Current Version (CVS)</B></A>
121       <B></B></A>
122 </H2>
123
124 <UL>
125    <LI> <A HREF="News.html#missing">Missing Features</a>
126    <LI>State of the art
127    <UL>    
128       <LI>
129          <a href="uml-gdcmV1.2.pdf">gdcm UML Class Diagram</a> current version.
130       <LI> <a href= "DocCVS/html.user/index.html">User Documentation</a>
131       <LI> <a href= "DocCVS/html.developper/index.html">Developper
132          Documentation</a> 
133    <LI> New Features
134    <UL>
135       <LI> To <i>try to</i> make gdcm images PACS usable, user is now allowed to
136            gdcm what kind of image he wants to write, using :  <br>
137    <TT>void FileHelper::SetContentType (ImageContentType c);</TT> <br>
138    Four different types are identify (probabely more will be added) :
139       <UL> 
140          <LI>
141       1) user created ex nihilo his own image and wants to write it as a Dicom image.<br>
142           c : <TT>USER_OWN_IMAGE</TT>
143          <LI>
144       2) user modified the pixels of an existing image, using mathematical operations.<br>
145           c : <TT>FILTERED_IMAGE</TT>
146          <LI>
147       3) user created a new image, using existing images (eg MIP, MPR, cartography image)<br>
148           c : <TT>CREATED_IMAGE</TT>
149          <LI>
150        4) user modified/added some tags *without processing* the pixels (anonymization, etc)<br>
151          c : <TT>UNMODIFIED_PIXELS_IMAGE</TT> 
152       </UL>
153       <LI> Stupid difference between <TT>gdcm::ValEntry</TT> 
154            and <TT>gdcm::BinEntry</TT> removed. <br>
155            Only <TT>gdcm::DataEntry</TT> exist, now. 
156            Should have been considered as a 'Bug Fix'.<br>
157            Actually, it's an API breaking modification ...
158       <UL>
159          <LI>
160             <TT>std::string const &DataEntry::GetString() const</TT><br>
161             returns as a string (when possible) the value of the DataEntry
162          <LI>
163             <TT>void DataEntry::SetString(std::string const &value)</TT><br>
164              Sets the 'value' of a DataEntry, passed as a std::string 
165          <LI>
166             <TT>void DataEntry::SetBinArea( uint8_t *area, bool self ) </TT><br>
167              Sets the value (non string) of the current Dicom DataEntry
168          <LI>
169               <TT>void DataEntry::CopyBinArea( uint8_t *area, uint32_t length )</TT><br>
170                Inserts the value (non string) into the current DataEntry 
171          <LI>
172                <TT>void DataEntry::SetValue(const uint32_t &id, const double
173  &val)</TT><br>
174                Inserts the elementary (non string) value into the current
175                (multivaluated) DataEntry, at the <TT>id></TT> position.
176          <LI>
177                <TT>double DataEntry::GetValue(const uint32_t &id) const </TT><br>
178                returns, as a double one of the values (when entry is 
179                multivaluated), identified by its index <TT>id</TT>. 
180       </UL>
181       <LI> 
182    <TT>DocEntrySet::GetEntryValue()</TT> replaced by
183            <TT>DocEntrySet::GetEntryString()</TT> <br>
184       <LI> SerieHelper : <br>     
185            Add some methods, to split a 'SingleSerieUID' Fileset into 
186            'Extra Coherent'  FileSets. <br>
187            They return a std::map of 'Filesets' (actually : std::vector 
188            of gdcm::File*)<br>
189            The key is the 'Orientation', the 'Position' 
190            or the value of a user choosen 'Tag' <br>
191            -  <TT>XCoherentFileSetmap SplitOnOrientation(FileList *fileSet);
192               </TT><br>
193            -  <TT>XCoherentFileSetmap SplitOnPosition(FileList *fileSet);
194               </TT> <br>
195            -  <TT>XCoherentFileSetmap SplitOnTagValue(FileList *fileSet,
196                                        uint16_t group, uint16_t element);
197               </TT><br>
198            These methods must be called by user, depending on what he wants 
199            to do, at application time.- *he* only  knows what his Series 
200            contain !-
201       <LI> To avoid memory leaks and seg faults the user intended classes
202            use now a Reference Counter.<br>
203       <UL>
204          <LI> <TT>new()</TT> and <TT>delete()</TT> are replaced by
205               <TT>New()</TT> and <TT>Delete()</TT>
206          <LI> <TT>Register()</TT> and <TT>Unregister()</TT> methods are 
207          available.
208          <LI> --> Well ... People from ITK don't seem to agree too much with 
209              that feature.<br>
210           They demand to be allowed to allocate gdcm objects in the stack as
211           well, not only in the heap.
212       </UL>
213       <LI>
214    </UL>
215
216    <LI> API breaking modifications (since previous version)
217    <UL>
218       <LI> Stupid difference between <TT>gdcm::ValEntry</TT> 
219            and <TT>gdcm::BinEntry</TT> removed. <br>
220            Only <TT>gdcm::DataEntry</TT> exist, now. <br>  
221    <pre>
222    ValEntry(DictEntry *e);
223    BinEntry(DictEntry *e);
224 -->DataEntry *New(uint16_t group,uint16_t elem, VRKey const &vr);
225
226    std::string const &ValEntry::GetValue() const;
227    std::string const &BinEntry::GetValue() const;
228 -->std::string const &DataEntry::GetString() const;
229
230    uint8_t *BinEntry::GetBinArea();
231 -->uint8_t *DataEntry::GetBinArea();
232
233    void ValEntry::SetValue(std::string const &value);
234    void BinEntry::SetValue(std::string const &value);   
235 -->void DataEntry::SetString(std::string const &value);
236
237    void BinEntry::SetBinArea( uint8_t *area, bool self = true );
238 -->void DataEntry::SetBinArea( uint8_t *area, bool self = true );
239
240    void ValEntry::CopyValEntry(uint16_t gr, uint16_t el);
241 -->void DataEntry::CopyDataEntry(uint16_t gr, uint16_t el, VRKey const &vr);
242
243 New features :
244
245 For multivaluated numeric DataEntries
246 -->void DataEntry::SetValue(const uint32_t &id,const double &val);
247 -->double DataEntry::GetValue(const uint32_t &id) const;
248 -->uint32_t DataEntry::GetValueCount() const;
249
250 For converting 'Decimal String'
251 -->bool GetDSValue(std::vector &lt;double&gt; &valueVector);  
252       </pre>
253       <LI>
254    </UL> 
255       
256    <LI> Bug fixes
257    <UL>
258       <LI> Implicit VR - Big Endian (G.E Private) Transfert Syntax 16 Bits 
259            images are now read correctly.  
260       <LI> File::GetZOrigin() returns accurate result in any case.
261       <LI>
262       <LI>
263    </UL>
264    
265    <LI> Known Bugs
266    <UL>
267       <LI> Use of <TT>Implicit Value Representation</TT> writting mode may
268            causes troubles, when there are some <TT>SQ</TT> belonging to a 
269            <TT>Shadow Group</TT>. <br>
270            Better you use <TT>Explicit Value Representation</TT> writting mode ...
271       <LI> Troubles on 'Big endian' processors (i.e. Apple/Motorola, SunSparc
272            ...) when writting 16 Bits images.
273       <LI> Troubles on 64-bits processors.
274       <LI>
275       <LI>
276    </UL>
277  
278       <br><br>
279  </UL>
280
281
282   
283 <!#######################################################################>
284 <A CLASS="anchor" NAME="NewsPreviousVersions">
285 <!#######################################################################>
286
287 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
288 <H2>
289    <A CLASS="anchor" NAME="NewsVersion1_1">
290       <B>Version 1.1 (September 14 2005)</B></A>   
291 </H2> 
292    <LI>State of the art
293    <UL>
294       <LI>
295          <a href="Doc1.0/uml-gdcmV1.0.pdf">gdcm 1.1 UML Class Diagram</a> version.
296       <LI> <a href= "Doc1.0/html.user/index.html">User Documentation</a>
297       <LI> <a href= "Doc1.0/html.developper/index.html">Developper
298          Documentation</a> 
299    <LI> New Features
300    <UL>
301       <LI> Add the methods
302          <TT>gdcm::Dict:AddDict(std::string fullPathPrivateDictionaryFileName)</TT>
303         <br>and<br> 
304         <TT>gdcm::Dict::RemoveDict(std::string fullPathPrivateDictionaryFileName)</TT>
305         <br>
306         to allow user to choose the 'Private Dictionary' he wants to work with.
307         <br>
308         One can dream about a better API;<br>
309         This one allow right now anybody to see very easyly if the use 
310         of a given private dicom dictionary is of any help or not.
311         <br><br>
312       <LI>
313       <TT>PrintFile</TT> has now a new command line argument manager option :<br>
314           <TT>dict=fullPathNamePrivateDictionaryFile</TT><br>
315           to allow user to see with no extra coding what differences 
316           makes the use or not of a private Dicom Dictionary.<br>
317           e.g. : use it as follow <br>
318           <TT>PrintFile filein=myGEdicomFile.dcm 
319           dict=/user/userName/gdcm/Dicts/GEMS-Advance.dic</TT>
320           <br><br> 
321       <LI>
322           (Not a great one ...)  
323           Stupid method names : <br><TT>DicomDir::WriteDicomDir()</TT>
324           and <TT>DicomDir::AnonymizeDicomDir()</TT> <br>replaced by : <br>
325           <TT>DicomDir::Write()</TT>
326           and <TT>DicomDir::Anonymize()</TT>
327           <br><br> 
328       <LI><TT>
329           void Document::AddForceLoadElement(uint16_t group, uint16_t elem);
330           </TT><br>
331           allows user to tell <TT>gdcm::Document</TT> Loader he wants
332           to force the loading of a given set of <TT>DocEntries</TT>, 
333           even if their length exceeds the current 
334           <TT>MAX_SIZE_LOAD_ELEMENT_VALUE</TT>.
335           <br><br>
336        <LI>
337           Many users expect from <TT>vtkGdcmReader</TT> it 'orders' the images
338           (that's the job of <TT>gdcm::SerieHelper</TT> ...)<br>
339           When user <b>knows</b> the files with same Serie UID
340           have same sizes, same 'pixel' type, same color convention, ...
341           the right way to proceed is as follow :
342     <pre>
343         gdcm::SerieHelper *sh= new gdcm::SerieHelper();
344    //      if user wants *not* to load some parts of the file headers
345         sh->SetLoadMode(loadMode);
346
347    //      if user wants *not* to load some files
348         sh->AddRestriction(group, element, value, operator);
349         sh->AddRestriction( ...
350         sh->SetDirectory(directoryWithImages);
351
352    //      if user *knows* how to order his files
353         sh->SetUserLessThanFunction(userSuppliedComparisonFunction);
354    //      or/and
355    //      if user wants to sort reverse order
356         sh->SetSortOrderToReverse();
357    
358    //      here, we suppose only the first 'Single SerieUID' Fileset is of interest
359    //      Just iterate using sh->NextSingleSerieUIDFileSet()
360    //      if you want to get all of them
361         gdcm::FileList *l = sh->GetFirstSingleSerieUIDFileSet();
362
363    //      if user is doesn't trust too much the files with same Serie UID
364         if ( !sh->IsCoherent(l) )
365            return; // not same sizes, or not same 'pixel type' -> stop
366
367         sh->OrderFileList(l);        // sort the list
368
369         vtkGdcmReader *reader = vtkGdcmReader::New();
370    //      if user wants to modify pixel order (Mirror, TopDown, ...)
371    //      he has to supply the function that does the job
372    //      (a *very* simple example is given in vtkgdcmSerieViewer.cxx)
373         reader->SetUserFunction (userSuppliedFunction);
374
375    //      to pass a 'Single SerieUID' Fileset as produced by gdcm::SerieHelper
376         reader->SetCoherentFileList(l);
377         reader->Update();
378    </pre>
379    You can see a full example in <TT>vtk/vtkgdcmSerieViewer.cxx</TT><br>
380    e.g.<br>
381
382    <TT>vtkgdcmSerieViewer dirname=Dentist  mirror</TT><br>
383    <TT>vtkgdcmSerieViewer dirname=Dentist  reverse</TT><br>
384    <TT>vtkgdcmSerieViewer dirname=Dentist  reverse topdown</TT><br> 
385    </pre>
386       <br>
387
388       <LI> <TT>vtkGdcmReader::SetUserFunction (userSuppliedFunction)</TT><br>
389            with :<br>
390            <TT>void userSuppliedFunction(uint8_t *imageData, File *f);</TT><br>
391            allows user to reorganize the pixels of each image just after reading
392            it (to mirror, or topdown the image, for instance)<br>
393            Note : <TT>uint8_t *</TT> doesn't mean it works only on 8 Bits images.
394            <br> It's for prototyping. Feel free to cast it.
395            <br><br>  
396       <LI> <TT>
397            SerieHelper::SetUserLessThanFunction(userSuppliedComparisonFunction)
398            </TT><br> with : <br>
399            <TT>bool userSuppliedComparisonFunction(File *, File *);</TT><br>
400            allows user -when he knows more about his files than gdcm does-
401            to give his own comparison function. 
402       <LI> <TT>SerieHelper::SetSortOrderToReverse</TT> allows user to ask
403            to sort the Files reverse order.
404       <LI> <TT>SerieHelper::AddRestriction</TT> has now a new constructor<br>
405            <TT>AddRestriction(group, element, value, operator);</TT><br>
406            allows user to exclude some files from the sorting, according to
407            any comparison operator <br>
408            (<TT>GDCM_EQUAL</TT>, <TT>GDCM_DIFFERENT</TT>, 
409            <TT>GDCM_GREATER</TT>, <TT>GDCM_GREATEROREQUAL</TT>, 
410            <TT>GDCM_LESS</TT>, <TT>GDCM_LESSOREQUAL</TT>), not only on the
411            equality.
412            <br><br>
413       <LI> <TT>AnonymizeNoLoad</TT> used with <TT>dirin=inputDirectoryName</TT>
414            anonymizes all the files within the given Directory.
415            <br>
416            User may also choose extra elements he wants to rub out: <br>
417            <TT>rubout=listOfElementsToRubOut</TT><br>
418            with <tt>listOfElementsToRubOut : group1-elem1,group2-elem2,
419            ...</TT> (in hexa, no space within the list )
420            <br><br>
421       <LI> <TT>gdcm::SerieHelper()</TT> has a new method 
422            <TT>void AddGdcmFile(File *header)</TT>, that allows aware user to 
423            create a '<TT>FileList</TT>' (actually a 
424            <TT>std::vector< File* > </TT>).<br>
425            The <TT>FileList</TT> created this way will be the 
426            'first one' in the <TT>gdcm::FileHelper()</TT> (retrieve it with 
427            <TT>FileList *GetFirstCoherentFileList()</TT> ).<br>
428            It may be sorted using <TT>OrderFileList</TT>.<br>
429            No 'coherence check' will be performed on this <TT>FileList</TT>
430            before sorting.<br>
431            It may be passed to a <TT>vtkGdcmReader</TT> 
432            (to avoid parsing twice the files)
433            <br><br>
434       <LI> <TT>vtkGdcmReader</TT> can now get the result of
435            <TT>gdcm::SerieHelper</TT> (to avoid parsing twice the files)<br>
436             Proceed as follow :<br>
437            <pre>
438            gdcmSerieHelper *sh = new gdcmSerieHelper();
439            sh->SetDirectory(myImageDirectory, true);
440            gdcmFileList *l = s->GetFirstCoherentFileList();
441            s->OrderFileList(l);
442
443            vtkGdcmReader *gr = new vtkGdcmReader();
444            gr->SetCoherentFileList(l);
445            gr->Update();  
446            </pre>
447            This works with a directory that contains only one '<TT>Serie</TT>'
448            (same <TT>Serie UID</TT> for all the images).<br>
449            If it contains more than one <TT>Serie</TT>, you'll have to loop 
450            on the Series, using <TT>GetNextCoherentFileList()</TT>;<br>
451            It will be up to the user to delete the <TT>gdcm::File</TT>.
452            <br><br>
453            See <TT>vtkgdcmSerieViewer</TT> for an example.
454            <br><br>
455       <LI> Both <TT>vtkgdcmViewer</TT> and <TT>vtkgdcmViewer2</TT> 
456            are available to allow easy displaying of single/multiframe 
457            GreyLevel/RGB/PaletteColor images<br><br>
458       <LI> <TT>DICOMDIR</TT> anonymiser (<TT>Load</TT> and <TT>Noload</TT> mode)
459            <br><br>
460       <LI> Because the <TT>gdcm::DicomDir::Load()</TT> method may be used
461            either for loading an already made <TT>DICOMDIR</TT> file or for
462            parsing all the dicom files with a given root directory we
463            syntaxically separated the operations: <br>
464            For loading an already made <TT>DICOMDIR</TT> file, use : <br>
465            <pre>
466            gdcm::DicomDir *d = new gdcm::DicomDir();
467            d->SetFileName(fileName);
468            d->Load( );  
469            </pre>
470  
471            For parsing all the dicom files within a given root directory, use :<br>
472            <pre>
473            gdcm::DicomDir *d = new gdcm::DicomDir();
474            d->SetDirectoryName(dirName);
475            d->Load( )  
476            </pre>
477
478            <b>Don't</b> use any longer old deprecated style: <br>
479            <TT>
480            gdcm::DicomDir *d = new gdcm::DicomDir();<br>
481            d->SetParseDir(true);   // </TT>or <TT>d->SetParseDir(false);<br>
482            d->Load( fileName );<br>  
483            </TT>
484            <br> 
485       <LI> User is now allowed to tell <TT>gdcm::Document</TT> constructor 
486            he doesn't want to deal with <TT>SeqEntry</TT> 
487            (every time it's possible, i.e for 'true length' Sequences) <br>
488            and/or he doesn't want to deal with <TT>Shadow groups</TT> 
489            (every time it's possible i.e. when element <TT>0x0000</TT>
490            exists for this Group) <br> 
491            or he doesn't want to deal with <TT>SeqEntry</TT> that belong to a 
492            <TT>Shadow group</TT>  (every time it's possible 
493            -'true length' Sequence-)<br>
494            use : <br>
495            <pre>
496            gdcm::File *f = new gdcm::File();
497                   f->SetLoadMode(NO_SEQ);            | depending on what
498                   f->SetLoadMode(NO_SHADOW);         | you want *not* 
499                   f->SetLoadMode(NO_SEQ | NO_SHADOW);| to load from the
500                   f->SetLoadMode(NO_SHADOWSEQ);      | target file
501             f->SetFileName(fileName);
502             f->Load( );
503             </pre>
504             <b>Don't</b> use any longer old deprecated style: <br>
505             <TT>
506             gdcm::File *f = new gdcm::File(fileName);</TT> <br>
507             <br>
508         <LI> User is now allowed to tell <TT>gdcm::DicomDir</TT> constructor 
509              he doesn't want to deal with <TT>SeqEntry</TT> 
510              (every time it's possible, i.e for 'true length' Sequences) <br>
511              and/or he doesn't want to deal with <TT>Shadow groups</TT> 
512              (every time it's possible i.e. when element <TT>0x0000</TT>
513              exists for this Group) <br> 
514              or he doesn't want to deal with <TT>SeqEntry</TT> that belong to a 
515              <TT>Shadow group</TT>  (every time it's possible 
516              -'true length' Sequence-)<br>
517              when he parses all the Dicom files within a given directory.<br>
518              use : <br>
519              <pre>
520              gdcm::DicomDir *f = new gdcm::DicomDir();
521                   f->SetLoadMode(NO_SEQ);            | depending on what
522                   f->SetLoadMode(NO_SHADOW);         | you want *not* 
523                   f->SetLoadMode(NO_SEQ | NO_SHADOW);| to load from the files
524                   f->SetLoadMode(NO_SHADOWSEQ);      | within the root directory 
525              f->SetDirectoryName(rootDirectoryName);
526              f->Load( );
527             </pre>
528             <b>Don't</b> use any longer old deprecated style: <br>
529             <TT>
530             gdcm::DicomDir *dcmdir = new gdcm::DicomDir(dirName, true);</TT><br>
531             <br>         
532    </UL>
533
534    <LI> Bug fixes
535    <UL>
536       <LI> No more trouble when the 'endianess' switches within Sequences.
537       <LI> No more trouble with 'no length Sequences' belonging to a
538            <TT>Shadow Group</TT> when they are 'Implicit VR'.
539       <LI> The difference between <TT>MONOCHROME1</TT> (low values = bright,
540             high values = dark) and <TT>MONOCHROME2</TT> (low values = dark,
541             high values = bright) is now taken into account.<br> 
542             It's no longer up to the user to change the pixels value
543       <LI> Writing a 'True Dicom' image after reading an <TT>ACR-NEMA</TT> image 
544            does not request any longer from the user to build up 
545            'manually' the Meta Elements group (<TT>0x0002</TT>)
546       <LI> Old '24 Bits' <TT>ACR-NEMA</TT> are now correctly re-written
547            in <TT>DICOM V3</TT> mode.
548       <LI> Element <TT>0x0000</TT> of <TT>Shadow groups</TT> is always forced to be a
549            <TT>ValEntry</TT> and its <TT>VR</TT> is forced to <TT>UL</TT> 
550       <br><br>
551    </UL>
552
553    <LI> A.P.I. breaking modifications (since previous version : <TT>1.0</TT>)
554    <UL>    
555       <LI> NEVER more API breaking modifications !!!
556       <br><br>
557    </UL>
558
559    <LI> Known bugs
560    <UL>
561
562    </UL>
563
564 </UL>
565
566
567
568 <!#######################################################################>
569 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
570 <H2>
571    <A CLASS="anchor" NAME="NewsVersion1_0">
572       <B>Version 1.0 (Feb 14 2005)</B></A>
573 </H2>
574 <UL>
575    <LI>State of the art
576    <UL>
577       <LI>
578          <a href="Doc1.0/uml-gdcmV1.0.pdf">gdcm 1.0 UML Class Diagram</a> version.
579       <LI> <a href= "Doc1.0/html.user/index.html">User Documentation"</a>
580       <LI> <a href= "Doc1.0/html.developper/index.html">Developper
581          Documentation"</a>
582       <LI> Final check of the jpeg sub-library: all 'classical' jpeg
583         compressed Dicom files can be read<br>
584       <LI>All the previously gdcm-breaker images are now readable<br>
585       <LI> A huge number of memory leaks removed
586       <LI> Improvement of write process   
587    </UL>
588
589  
590    <LI> A.P.I. breaking modifications (since previous version : <TT>0.6</TT>)
591    <UL>
592       <LI> Use of <TT> namespace</TT> : all the methods formerly named
593           <TT>className::gdcmXxx()</TT> are now named <TT>className::Xxx()</TT>
594           <br> End user will have to call them as <TT>gdcm::className::Xxx() </TT>
595       <LI> a <TT>gdcm::Document</TT> is now specialized in : 
596       <UL>
597          <LI> <TT>gdcm::DicomDir</TT>
598          <LI> <TT>gdcm::File</TT>
599       </UL>
600       <LI> a <TT>gdcm::DicomElementSet</TT> is composed of a set of 
601             <TT>gdcm::DicomDocEntry</TT>
602       <LI> a <TT>gdcm::DicomDocEntry</TT> can be :
603       <UL>
604          <LI> a <TT>gdcm::ContentEntry</TT>, specialized in :
605          <UL>
606             <LI> <TT>gdcm::ValEntry</TT>
607             <LI> <TT>gdcm::BinEntry</TT> (no longer a specialization of
608                  <TT>gdcm::ValEntry</TT>) 
609         </UL>
610       <LI> a <TT>gdcm::SeqEntry</TT> 
611       </UL>
612       <LI> Removal of useless accessors <TT>GetXxxByname</TT>, <TT>SetXxxByname</TT> 
613       <LI> Renaming of accessors <TT>GetXxxByNumber</TT>, <TT>SetXxxByNumber</TT> 
614            as follow :
615       <UL>
616          <LI> <TT>GetEntryByNumber 
617                   &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
618                                           --> GetEntryValue</TT>
619          <LI> <TT>GetEntryLengthByNumber  --> GetEntryLength</TT>
620          <LI> <TT>GetEntryOffsetByNumber  --> GetEntryOffset</TT>
621          <LI> <TT>GetEntryVRByNumber 
622                   &nbsp;&nbsp;&nbsp;      --> GetEntryVR</TT>
623          <LI>
624          <LI> <TT>GetDocEntryByNumber     
625                   &nbsp;&nbsp;            --> GetDocEntry</TT>
626          <LI> <TT>GetValEntryByNumber     
627                   &nbsp;&nbsp;            --> GetValEntry</TT>
628          <LI> <TT>GetBinEntryByNumber     
629                   &nbsp;&nbsp;            --> GetBinEntry</TT>
630          <LI> <TT>GetSeqEntryByNumber     
631                   &nbsp;&nbsp;            --> GetSeqEntry</TT>
632        </UL>
633    </UL>
634 </UL>
635
636 <!#######################################################################>
637 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
638 <H2>
639    <A CLASS="anchor" NAME="NewsVersion0_6">
640       <B>Version 0.6 (June 8 2004)</B></A>
641 </H2>
642 <UL>
643    This version will be used by Insight Tool Kit 
644    (<a href="http://www.itk.org">ITK</a> 2.0) at the beginning of 2005.<br>
645     It's not yet packaged ...<br><br>
646    <LI> <a href= "Doc0.6/html.user/index.html">User Documentation"</a>
647    <LI> <a href= "Doc0.6/html.developper/index.html">Developper Documentation"</a>  
648    <LI> The new <TT>gdcmDocument</TT> class is a parent class of 
649        <TT>gdcmHeader</TT> class and <TT>gdcmDicomDir</TT> class.
650    <LI> Massive modifications in the Class Diagram :
651    <UL>
652       <LI> any dicom related file is a <TT>gdcmDocument</TT>
653       <LI> a <TT>gdcmDocument</TT> can be :
654       <UL>
655          <LI> a <TT>gdcmHeader</TT>, if it contains pixel data
656          <LI> a <TT>gdcmDicomDir</TT>, if it contains only informations 
657               on the files in a given directory  
658       </UL>
659
660    <LI> a <TT>gdcmDocument</TT> is_a <TT>gdcmElementSet</TT>,
661         composed of a set of <TT>gdcmEntry</TT> separated into :
662       <UL>
663       <LI> <TT>gdcmValEntry</TT><br>
664            a specialization of <TT>gdcmValEntry</TT>, for 'non
665            <TT>std::string</TT> representable' values is 
666            <TT>gdcmBinEntry</TT> 
667        <LI> <TT>gdcmSeqEntry</TT> (VR = <TT>SQ</TT>, i.e Dicom Sequences)<br>
668              they are dealt as tree-like structures :<br>
669              - a <TT>gdcmSeqEntry</TT> is considered as a set 
670              of <TT>gdcmSQItem</TT>,<br>
671              - a <TT>gdcmSQItem</TT> is_a <TT>gdcmElementSet</TT>, composed 
672              of <TT>gdcmDocEntries</TT>, recursively <br>
673       </UL>
674    </UL>
675    <LI> Improvement of the jpeg sub-library: jpeg
676            compressed Dicom files (lossless and lossy) 
677            might be read (check-it out)
678 </UL>
679
680 <!#######################################################################>
681 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
682 <H2>
683    <A CLASS="anchor" NAME="NewsVersion0_4">
684       <B>Version 0.4 (February 6 2004)</B></A>
685 </H2>
686 <UL>
687
688    <LI> <a href="Doc0.4/uml-gdcmV0.4.pdf">gdcm 0.4 UML Class Diagram</a>.
689    <LI> <a href= "Doc0.4/html.user/index.html">User Documentation"</a>
690    <LI> <a href= "Doc0.4/html.developper/index.html">Developper Documentation </a>
691
692    <LI> Introduction of a jpeg sub-library: some very simple jpeg-lossy
693         compressed Dicom files might be working (check-it out).
694    <LI> And also, fewer memory leaks, cleaned-up stl usage (should work
695         with gcc-3.x), python disutil installer (see file setup.py)
696         supporting both Swig and vtk wrapping.
697    <LI> Introduction of a RLE (Run-Time Encoding) library
698    <LI> Color images (RGB or Palette Color) are dealt with
699    <LI> Confusing names <TT>gdcmPatient</TT>, <TT>gdcmStudy</TT>,
700         <TT>gdcmSerie</TT>, <TT>gdcmPatient</TT> changed to 
701         <TT>gdcmDicomDirPatient</TT>, <TT>gdcmDicomDirStudy</TT>, 
702         <TT>gdcmDicomDirSerie</TT>, <TT>gdcmDicomDirPatient</TT>
703  
704 </UL>
705
706 <!#######################################################################>
707 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
708 <H2>
709    <A CLASS="anchor" NAME="NewsVersion0_3">
710       <B>Version 0.3 (July 8 2003)</B></A>
711 </H2>
712 <UL>
713    <LI> <TT>gdcmFile</TT> class now enables acces to the data
714        i.e. the image[s] content. Previously only parsing of the
715        Dicom header was available through usage of <TT>gdcmHeader</TT>
716        class.
717    <LI> a <A HREF="http://public.kitware.com/VTK/">VTK</A> plugin
718        of gdcm is now available through the <TT>vtkGdcmReader</TT>
719        vtk class (see it as a vtk wrapper of gdcm), which enables
720        <UL>
721          <LI> Loading of a single image,
722          <LI> Loading of a stack of images from multiple Dicom files,
723          <LI> this class is wrapped for vtkPython (by using native vtk
724               wrappers).
725        </UL>
726    <LI> Introduction of a jpeg sub-library: lossless-jpeg
727         compressed Dicom files work.
728 <LI> <TT>vtkgdcmViewer</TT> allows easy displaying of single/multiframe 
729      GreyLevel/RGB/PaletteColor images
730 </UL>
731
732 <!#######################################################################>
733 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
734 <H2>
735    <A CLASS="anchor" NAME="NewsVersion0_1">
736       <B>Version 0.1 (April 1 2003)</B></A>
737
738 <!#######################################################################>
739 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
740 <H2>
741    <A CLASS="anchor" name="NewsVersion0_1">
742       <B>Version 0.0 (March 14 2003)</B></A>
743
744 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADRESS>
745
746 </BODY>
747 </HTML>