Doc/Website/News.html

   1 <!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
   2 <HTML>
   3 <HEAD>
   4    <META http-equiv="Content-Type" content="text/html;charset=iso-8859-1">
   5    <TITLE>Gdcm News</TITLE>
   6 </HEAD>
   7
   8 <BODY>
   9
  10
  11 <!--#######################################################################-->
  12 <H1>Gdcm News</a></H1>
  13
  14 <!--#######################################################################-->
  15
  16 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
  17 <H2>
  18    <A CLASS="anchor" NAME="missing">
  19       <B>Missing features</B></A>
  20 </H2>
  21 We know the following are missing; don't loose time looking for them ...<br>
  22 We know they could be helpfull. We shall add them some day.<br>
  23 Any contribution is welcome.
  24 <UL>
  25 <LI> Decoders
  26    <UL>
  27       <LI> gdcm doesn't read yet <TT>JPEG-LS</TT> encoded files.
  28       <UL>
  29           We said '<TT>JPEG-LS</TT>', not Lossless Jpeg ...<br>
  30           [<TT>JPEG-LS</TT> is the basis for new lossless/near-lossless compression
  31           standard for continuous-tone images intended for <TT>JPEG2000</TT>.
  32           The standard is based on the LOCO-I algorithm
  33           (LOw COmplexity LOssless COmpression for Images)
  34           developed at Hewlett-Packard Laboratories]
  35      </UL>
  36      <LI> gdcm doesn't read yet all <TT>JPEG2000</TT> encoded files.
  37      <UL>
  38          But we are working on it (a lot of troubles with Jasper).
  39          Update: as of Oct 10 2005, we are currently investigating another library:
  40          openjpeg. The problem still exist for this library but one of the author
  41          is currently working on it:
  42             http://www.openjpeg.org/forum/viewtopic.php?t=18
  43       </UL>
  44       <LI> gdcm doesn't read yet <TT>MPEG2</TT> encoded files.
  45
  46    </UL>
  47    <LI>Reader
  48    <UL>
  49       <LI> Allow user to tell <TT>gdcm::Document</TT> constructor he just wants
  50            to load a given list of <TT>DocEntries</TT>
  51            (to save CPU time and RAM space)
  52       <LI> Allow 'frame by frame' reading (should be helpfull for huge
  53            multiframe images)
  54       <LI> Allow subvolume selection / frames selection before reading.
  55       <LI> Expose Read/Decompression mechanisms to allow user getting
  56          information from <tt>DICOMDIR</TT> <br> -or from his own Data Base-
  57          and reading his images without parsing
  58          the header, one more time.
  59    </UL>
  60    <LI>Writer
  61    <UL>
  62       <LI> Allow user to tell the Writer he doesn't want to write down
  63            <TT>SeqEntry</TT> (if any)
  64       <LI> Allow user to tell the Writer he doesn't want to write down
  65            <TT>Shadow groups</TT> (if any)
  66       <LI> Allow user to tell the Writer which compression mode he wants<br>
  67            (Right now, no one is available)
  68       <LI> Allow user to tell the Writer he wants to split a
  69            <TT>Multiframe</TT> image into a serie of
  70            <TT>Single frame</TT> images.
  71       <LI> Allow user to tell the Writer he wants to agregate a
  72            Serie of <TT>Single frame</TT> images into a
  73            <TT>Multiframe</TT> image.
  74    </UL>
  75 <LI>Reader / Writer
  76    <UL>
  77       <LI> Full <TT>Icon Image</TT> management (Read and Write)
  78       <LI> Full <TT>Overlays</TT> management (Read and Write) <br>
  79            both for '<TT>ACR-NEMA</TT> style' (using groups <TT>0x6000</TT>
  80             and next) and '<TT>DICOM V3</TT> style' (using Sequences)
  81    </UL>
  82 <LI> <TT>DICOMDIR</TT>
  83     <UL>
  84       <LI> <TT>DICOMDIR</TT> full management (not limited to
  85            <TT> PATIENT</TT>/<TT>STUDY</TT>/<TT>SERIE</TT>/<TT>IMAGE</TT>)
  86       <LI> Allow user to add an entry (belonging to the file header Dicom
  87            entries)to the default entry list, before
  88            making a <TT>DICOMDIR</TT> from a root directory
  89       <LI> Allow user to add an entry of his owns (for instance an <TT>Icon</TT>
  90            to each image, or to each Serie).
  91       </UL>
  92 <LI> SerieHelper
  93    <UL>
  94
  95       <LI> An accurate <TT>SerieHelper</TT> <br>
  96            Right now <TT>SerieHelper</TT> only works on 'bona fide Series', and
  97            breaks on wrongly forged Series.<br>
  98            We are still looking for any heuristics...
  99       <LI> A <TT>SerieHelper</TT> that would use the <TT>DICOMDIR</TT> (if any)
 100         instead of parsing all the files within the Root Directory
 101    </UL>
 102 <LI> Other
 103    <UL>
 104       <LI> 16-bits-LUT full Management
 105       <LI> User friendly management of <TT>Rescale Slope</TT> and
 106            <TT>Rescale Intercept</TT>.<br>
 107            (Well... Maybe it's up to the application to deal with it, not to
 108            gdcm ?)
 109       <LI> Allow manual adjunction / automatic recognition (pfff!...)
 110            of the private <TT>Dicom Dictionary</TT>
 111            to be used to parse <TT>Shadow groups</TT> against.
 112       <LI> User friendly way of anonymizing image when Patient's name is
 113            carved in the Pixels :-(
 114    </UL>
 115 </UL>
 116 <!#######################################################################>
 117 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
 118 <H2>
 119    <A CLASS="anchor" NAME="NewsCurrentVersion">
 120    <B>Current Version (CVS)</B></A>
 121       <B></B></A>
 122 </H2>
 123
 124 <UL>
 125    <LI> <A HREF="News.html#missing">Missing Features</a>
 126    <LI>State of the art
 127    <UL>
 128       <LI>
 129          <a href="uml-gdcm.pdf">gdcm UML Class Diagram</a> current version.
 130       <LI> <a href= "DocCVS/html.user/index.html">User Documentation</a>
 131       <LI> <a href= "DocCVS/html.developper/index.html">Developper
 132          Documentation</a>
 133    <LI> New Features
 134    <UL>
 135       <LI> To <i>try to</i> make gdcm images PACS usable, user is now allowed to
 136            gdcm what kind of image he wants to write, using :  <br>
 137    <TT>void FileHelper::SetContentType (ImageContentType c);</TT> <br>
 138    Four different types are identify (probabely more will be added) :
 139       <UL>
 140          <LI>
 141       1) user created ex nihilo his own image and wants to write it as a Dicom image.<br>
 142           c : <TT>USER_OWN_IMAGE</TT>
 143          <LI>
 144       2) user modified the pixels of an existing image, using mathematical operations.<br>
 145           c : <TT>FILTERED_IMAGE</TT>
 146          <LI>
 147       3) user created a new image, using existing images (eg MIP, MPR, cartography image)<br>
 148           c : <TT>CREATED_IMAGE</TT>
 149          wq<LI>
 150        4) user modified/added some tags *without processing* the pixels (anonymization, etc)<br>
 151          c : <TT>UNMODIFIED_PIXELS_IMAGE</TT>
 152       </UL>
 153       <LI> Stupid difference between <TT>gdcm::ValEntry</TT>
 154            and <TT>gdcm::BinEntry</TT> removed. <br>
 155            Only <TT>gdcm::DataEntry</TT> exist, now.
 156            Should have been considered as a 'Bug Fix'.<br>
 157            Actually, it's an API breaking modification ...
 158       <UL>
 159          <LI>
 160             <TT>std::string const &DataEntry::GetString() const</TT><br>
 161             returns as a string (when possible) the value of the DataEntry
 162          <LI>
 163             <TT>void DataEntry::SetString(std::string const &value)</TT><br>
 164              Sets the 'value' of a DataEntry, passed as a std::string
 165          <LI>
 166             <TT>void DataEntry::SetBinArea( uint8_t *area, bool self ) </TT><br>
 167              Sets the value (non string) of the current Dicom DataEntry
 168          <LI>
 169               <TT>void DataEntry::CopyBinArea( uint8_t *area, uint32_t length )</TT><br>
 170                Inserts the value (non string) into the current DataEntry
 171          <LI>
 172                <TT>void DataEntry::SetValue(const uint32_t &id, const double
 173  &val)</TT><br>
 174                Inserts the elementary (non string) value into the current
 175                (multivaluated) DataEntry, at the <TT>id></TT> position.
 176          <LI>
 177                <TT>double DataEntry::GetValue(const uint32_t &id) const </TT><br>
 178                returns, as a double one of the values (when entry is
 179                multivaluated), identified by its index <TT>id</TT>.
 180       </UL>
 181       <LI>
 182    <TT>DocEntrySet::GetEntryValue()</TT> replaced by
 183            <TT>DocEntrySet::GetEntryString()</TT> <br>
 184       <LI> SerieHelper : <br>
 185            Add some methods, to split a 'SingleSerieUID' Fileset into
 186            'Extra Coherent'  FileSets. <br>
 187            They return a std::map of 'Filesets' (actually : std::vector
 188            of gdcm::File*)<br>
 189            The key is the 'Orientation', the 'Position'
 190            or the value of a user choosen 'Tag' <br>
 191            -  <TT>XCoherentFileSetmap SplitOnOrientation(FileList *fileSet);
 192               </TT><br>
 193            -  <TT>XCoherentFileSetmap SplitOnPosition(FileList *fileSet);
 194               </TT> <br>
 195            -  <TT>XCoherentFileSetmap SplitOnTagValue(FileList *fileSet,
 196                                        uint16_t group, uint16_t element);
 197               </TT><br>
 198            These methods must be called by user, depending on what he wants
 199            to do, at application time.- *he* only  knows what his Series
 200            contain !-
 201       <LI> To avoid memory leaks and seg faults the user intended classes
 202            use now a Reference Counter.<br>
 203       <UL>
 204          <LI> <TT>new()</TT> and <TT>delete()</TT> are replaced by
 205               <TT>New()</TT> and <TT>Delete()</TT>
 206          <LI> <TT>Register()</TT> and <TT>Unregister()</TT> methods are
 207          available.
 208       </UL>
 209       <LI>
 210    </UL>
 211
 212    <LI> API breaking modifications (since previous version)
 213    <UL>
 214       <LI> Stupid difference between <TT>gdcm::ValEntry</TT>
 215            and <TT>gdcm::BinEntry</TT> removed. <br>
 216            Only <TT>gdcm::DataEntry</TT> exist, now. <br>
 217       <LI>
 218       <LI>
 219    </UL>
 220
 221    <LI> Bug fixes
 222    <UL>
 223       <LI> Implicit VR - Big Endian (G.E Private) Transfert Syntax 16 Bits
 224            images are now read correctly.
 225       <LI> File::GetZOrigin() returns accurate result in any case.
 226       <LI>
 227       <LI>
 228    </UL>
 229
 230    <LI> Known Bugs
 231    <UL>
 232       <LI> Use of <TT>Implicit Value Representation</TT> writting mode may
 233            causes troubles, when there are some <TT>SQ</TT> belonging to a
 234            <TT>Shadow Group</TT>. <br>
 235            Better you use <TT>Explicit Value Representation</TT> writting mode ...
 236       <LI> Troubles on 'Big endian' processors (i.e. Apple/Motorola, SunSparc
 237            ...) when writting 16 Bits images.
 238       <LI> Troubles on 64-bits processors.
 239       <LI>
 240       <LI>
 241    </UL>
 242
 243       <br><br>
 244  </UL>
 245
 246
 247
 248 <!#######################################################################>
 249 <A CLASS="anchor" NAME="NewsPreviousVersions">
 250 <!#######################################################################>
 251
 252 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
 253 <H2>
 254    <A CLASS="anchor" NAME="NewsVersion1_1">
 255       <B>Version 1.1 (September 14 2005)</B></A>
 256 </H2>
 257    <LI>State of the art
 258    <UL>
 259       <LI>
 260          <a href="Doc1.0/uml-gdcmV1.0.pdf">gdcm 1.1 UML Class Diagram</a> version.
 261       <LI> <a href= "Doc1.0/html.user/index.html">User Documentation</a>
 262       <LI> <a href= "Doc1.0/html.developper/index.html">Developper
 263          Documentation</a>
 264    <LI> New Features
 265    <UL>
 266       <LI> Add the methods
 267          <TT>gdcm::Dict:AddDict(std::string fullPathPrivateDictionaryFileName)</TT>
 268         <br>and<br>
 269         <TT>gdcm::Dict::RemoveDict(std::string fullPathPrivateDictionaryFileName)</TT>
 270         <br>
 271         to allow user to choose the 'Private Dictionary' he wants to work with.
 272         <br>
 273         One can dream about a better API;<br>
 274         This one allow right now anybody to see very easyly if the use
 275         of a given private dicom dictionary is of any help or not.
 276         <br><br>
 277       <LI>
 278       <TT>PrintFile</TT> has now a new command line argument manager option :<br>
 279           <TT>dict=fullPathNamePrivateDictionaryFile</TT><br>
 280           to allow user to see with no extra coding what differences
 281           makes the use or not of a private Dicom Dictionary.<br>
 282           e.g. : use it as follow <br>
 283           <TT>PrintFile filein=myGEdicomFile.dcm
 284           dict=/user/userName/gdcm/Dicts/GEMS-Advance.dic</TT>
 285           <br><br>
 286       <LI>
 287           (Not a great one ...)
 288           Stupid method names : <br><TT>DicomDir::WriteDicomDir()</TT>
 289           and <TT>DicomDir::AnonymizeDicomDir()</TT> <br>replaced by : <br>
 290           <TT>DicomDir::Write()</TT>
 291           and <TT>DicomDir::Anonymize()</TT>
 292           <br><br>
 293       <LI><TT>
 294           void Document::AddForceLoadElement(uint16_t group, uint16_t elem);
 295           </TT><br>
 296           allows user to tell <TT>gdcm::Document</TT> Loader he wants
 297           to force the loading of a given set of <TT>DocEntries</TT>,
 298           even if their length exceeds the current
 299           <TT>MAX_SIZE_LOAD_ELEMENT_VALUE</TT>.
 300           <br><br>
 301        <LI>
 302           Many users expect from <TT>vtkGdcmReader</TT> it 'orders' the images
 303           (that's the job of <TT>gdcm::SerieHelper</TT> ...)<br>
 304           When user <b>knows</b> the files with same Serie UID
 305           have same sizes, same 'pixel' type, same color convention, ...
 306           the right way to proceed is as follow :
 307     <pre>
 308         gdcm::SerieHelper *sh= new gdcm::SerieHelper();
 309    //      if user wants *not* to load some parts of the file headers
 310         sh->SetLoadMode(loadMode);
 311
 312    //      if user wants *not* to load some files
 313         sh->AddRestriction(group, element, value, operator);
 314         sh->AddRestriction( ...
 315         sh->SetDirectory(directoryWithImages);
 316
 317    //      if user *knows* how to order his files
 318         sh->SetUserLessThanFunction(userSuppliedComparisonFunction);
 319    //      or/and
 320    //      if user wants to sort reverse order
 321         sh->SetSortOrderToReverse();
 322
 323    //      here, we suppose only the first 'Single SerieUID' Fileset is of interest
 324    //      Just iterate using sh->NextSingleSerieUIDFileSet()
 325    //      if you want to get all of them
 326         gdcm::FileList *l = sh->GetFirstSingleSerieUIDFileSet();
 327
 328    //      if user is doesn't trust too much the files with same Serie UID
 329         if ( !sh->IsCoherent(l) )
 330            return; // not same sizes, or not same 'pixel type' -> stop
 331
 332         sh->OrderFileList(l);        // sort the list
 333
 334         vtkGdcmReader *reader = vtkGdcmReader::New();
 335    //      if user wants to modify pixel order (Mirror, TopDown, ...)
 336    //      he has to supply the function that does the job
 337    //      (a *very* simple example is given in vtkgdcmSerieViewer.cxx)
 338         reader->SetUserFunction (userSuppliedFunction);
 339
 340    //      to pass a 'Single SerieUID' Fileset as produced by gdcm::SerieHelper
 341         reader->SetCoherentFileList(l);
 342         reader->Update();
 343    </pre>
 344    You can see a full example in <TT>vtk/vtkgdcmSerieViewer.cxx</TT><br>
 345    e.g.<br>
 346
 347    <TT>vtkgdcmSerieViewer dirname=Dentist  mirror</TT><br>
 348    <TT>vtkgdcmSerieViewer dirname=Dentist  reverse</TT><br>
 349    <TT>vtkgdcmSerieViewer dirname=Dentist  reverse topdown</TT><br>
 350    </pre>
 351       <br>
 352
 353       <LI> <TT>vtkGdcmReader::SetUserFunction (userSuppliedFunction)</TT><br>
 354            with :<br>
 355            <TT>void userSuppliedFunction(uint8_t *imageData, File *f);</TT><br>
 356            allows user to reorganize the pixels of each image just after reading
 357            it (to mirror, or topdown the image, for instance)<br>
 358            Note : <TT>uint8_t *</TT> doesn't mean it works only on 8 Bits images.
 359            <br> It's for prototyping. Feel free to cast it.
 360            <br><br>
 361       <LI> <TT>
 362            SerieHelper::SetUserLessThanFunction(userSuppliedComparisonFunction)
 363            </TT><br> with : <br>
 364            <TT>bool userSuppliedComparisonFunction(File *, File *);</TT><br>
 365            allows user -when he knows more about his files than gdcm does-
 366            to give his own comparison function.
 367       <LI> <TT>SerieHelper::SetSortOrderToReverse</TT> allows user to ask
 368            to sort the Files reverse order.
 369       <LI> <TT>SerieHelper::AddRestriction</TT> has now a new constructor<br>
 370            <TT>AddRestriction(group, element, value, operator);</TT><br>
 371            allows user to exclude some files from the sorting, according to
 372            any comparison operator <br>
 373            (<TT>GDCM_EQUAL</TT>, <TT>GDCM_DIFFERENT</TT>,
 374            <TT>GDCM_GREATER</TT>, <TT>GDCM_GREATEROREQUAL</TT>,
 375            <TT>GDCM_LESS</TT>, <TT>GDCM_LESSOREQUAL</TT>), not only on the
 376            equality.
 377            <br><br>
 378       <LI> <TT>AnonymizeNoLoad</TT> used with <TT>dirin=inputDirectoryName</TT>
 379            anonymizes all the files within the given Directory.
 380            <br>
 381            User may also choose extra elements he wants to rub out: <br>
 382            <TT>rubout=listOfElementsToRubOut</TT><br>
 383            with <tt>listOfElementsToRubOut : group1-elem1,group2-elem2,
 384            ...</TT> (in hexa, no space within the list )
 385            <br><br>
 386       <LI> <TT>gdcm::SerieHelper()</TT> has a new method
 387            <TT>void AddGdcmFile(File *header)</TT>, that allows aware user to
 388            create a '<TT>FileList</TT>' (actually a
 389            <TT>std::vector< File* > </TT>).<br>
 390            The <TT>FileList</TT> created this way will be the
 391            'first one' in the <TT>gdcm::FileHelper()</TT> (retrieve it with
 392            <TT>FileList *GetFirstCoherentFileList()</TT> ).<br>
 393            It may be sorted using <TT>OrderFileList</TT>.<br>
 394            No 'coherence check' will be performed on this <TT>FileList</TT>
 395            before sorting.<br>
 396            It may be passed to a <TT>vtkGdcmReader</TT>
 397            (to avoid parsing twice the files)
 398            <br><br>
 399       <LI> <TT>vtkGdcmReader</TT> can now get the result of
 400            <TT>gdcm::SerieHelper</TT> (to avoid parsing twice the files)<br>
 401             Proceed as follow :<br>
 402            <pre>
 403            gdcmSerieHelper *sh = new gdcmSerieHelper();
 404            sh->SetDirectory(myImageDirectory, true);
 405            gdcmFileList *l = s->GetFirstCoherentFileList();
 406            s->OrderFileList(l);
 407
 408            vtkGdcmReader *gr = new vtkGdcmReader();
 409            gr->SetCoherentFileList(l);
 410            gr->Update();
 411            </pre>
 412            This works with a directory that contains only one '<TT>Serie</TT>'
 413            (same <TT>Serie UID</TT> for all the images).<br>
 414            If it contains more than one <TT>Serie</TT>, you'll have to loop
 415            on the Series, using <TT>GetNextCoherentFileList()</TT>;<br>
 416            It will be up to the user to delete the <TT>gdcm::File</TT>.
 417            <br><br>
 418            See <TT>vtkgdcmSerieViewer</TT> for an example.
 419            <br><br>
 420       <LI> Both <TT>vtkgdcmViewer</TT> and <TT>vtkgdcmViewer2</TT>
 421            are available to allow easy displaying of single/multiframe
 422            GreyLevel/RGB/PaletteColor images<br><br>
 423       <LI> <TT>DICOMDIR</TT> anonymiser (<TT>Load</TT> and <TT>Noload</TT> mode)
 424            <br><br>
 425       <LI> Because the <TT>gdcm::DicomDir::Load()</TT> method may be used
 426            either for loading an already made <TT>DICOMDIR</TT> file or for
 427            parsing all the dicom files with a given root directory we
 428            syntaxically separated the operations: <br>
 429            For loading an already made <TT>DICOMDIR</TT> file, use : <br>
 430            <pre>
 431            gdcm::DicomDir *d = new gdcm::DicomDir();
 432            d->SetFileName(fileName);
 433            d->Load( );
 434            </pre>
 435
 436            For parsing all the dicom files within a given root directory, use :<br>
 437            <pre>
 438            gdcm::DicomDir *d = new gdcm::DicomDir();
 439            d->SetDirectoryName(dirName);
 440            d->Load( )
 441            </pre>
 442
 443            <b>Don't</b> use any longer old deprecated style: <br>
 444            <TT>
 445            gdcm::DicomDir *d = new gdcm::DicomDir();<br>
 446            d->SetParseDir(true);   // </TT>or <TT>d->SetParseDir(false);<br>
 447            d->Load( fileName );<br>
 448            </TT>
 449            <br>
 450       <LI> User is now allowed to tell <TT>gdcm::Document</TT> constructor
 451            he doesn't want to deal with <TT>SeqEntry</TT>
 452            (every time it's possible, i.e for 'true length' Sequences) <br>
 453            and/or he doesn't want to deal with <TT>Shadow groups</TT>
 454            (every time it's possible i.e. when element <TT>0x0000</TT>
 455            exists for this Group) <br>
 456            or he doesn't want to deal with <TT>SeqEntry</TT> that belong to a
 457            <TT>Shadow group</TT>  (every time it's possible
 458            -'true length' Sequence-)<br>
 459            use : <br>
 460            <pre>
 461            gdcm::File *f = new gdcm::File();
 462                   f->SetLoadMode(NO_SEQ);            | depending on what
 463                   f->SetLoadMode(NO_SHADOW);         | you want *not*
 464                   f->SetLoadMode(NO_SEQ | NO_SHADOW);| to load from the
 465                   f->SetLoadMode(NO_SHADOWSEQ);      | target file
 466             f->SetFileName(fileName);
 467             f->Load( );
 468             </pre>
 469             <b>Don't</b> use any longer old deprecated style: <br>
 470             <TT>
 471             gdcm::File *f = new gdcm::File(fileName);</TT> <br>
 472             <br>
 473         <LI> User is now allowed to tell <TT>gdcm::DicomDir</TT> constructor
 474              he doesn't want to deal with <TT>SeqEntry</TT>
 475              (every time it's possible, i.e for 'true length' Sequences) <br>
 476              and/or he doesn't want to deal with <TT>Shadow groups</TT>
 477              (every time it's possible i.e. when element <TT>0x0000</TT>
 478              exists for this Group) <br>
 479              or he doesn't want to deal with <TT>SeqEntry</TT> that belong to a
 480              <TT>Shadow group</TT>  (every time it's possible
 481              -'true length' Sequence-)<br>
 482              when he parses all the Dicom files within a given directory.<br>
 483              use : <br>
 484              <pre>
 485              gdcm::DicomDir *f = new gdcm::DicomDir();
 486                   f->SetLoadMode(NO_SEQ);            | depending on what
 487                   f->SetLoadMode(NO_SHADOW);         | you want *not*
 488                   f->SetLoadMode(NO_SEQ | NO_SHADOW);| to load from the files
 489                   f->SetLoadMode(NO_SHADOWSEQ);      | within the root directory
 490              f->SetDirectoryName(rootDirectoryName);
 491              f->Load( );
 492             </pre>
 493             <b>Don't</b> use any longer old deprecated style: <br>
 494             <TT>
 495             gdcm::DicomDir *dcmdir = new gdcm::DicomDir(dirName, true);</TT><br>
 496             <br>
 497    </UL>
 498
 499    <LI> Bug fixes
 500    <UL>
 501       <LI> No more trouble when the 'endianess' switches within Sequences.
 502       <LI> No more trouble with 'no length Sequences' belonging to a
 503            <TT>Shadow Group</TT> when they are 'Implicit VR'.
 504       <LI> The difference between <TT>MONOCHROME1</TT> (low values = bright,
 505             high values = dark) and <TT>MONOCHROME2</TT> (low values = dark,
 506             high values = bright) is now taken into account.<br>
 507             It's no longer up to the user to change the pixels value
 508       <LI> Writing a 'True Dicom' image after reading an <TT>ACR-NEMA</TT> image
 509            does not request any longer from the user to build up
 510            'manually' the Meta Elements group (<TT>0x0002</TT>)
 511       <LI> Old '24 Bits' <TT>ACR-NEMA</TT> are now correctly re-written
 512            in <TT>DICOM V3</TT> mode.
 513       <LI> Element <TT>0x0000</TT> of <TT>Shadow groups</TT> is always forced to be a
 514            <TT>ValEntry</TT> and its <TT>VR</TT> is forced to <TT>UL</TT>
 515       <br><br>
 516    </UL>
 517
 518    <LI> A.P.I. breaking modifications (since previous version : <TT>1.0</TT>)
 519    <UL>
 520       <LI> NEVER more API breaking modifications !!!
 521       <br><br>
 522    </UL>
 523
 524    <LI> Known bugs
 525    <UL>
 526
 527    </UL>
 528
 529 </UL>
 530
 531
 532
 533 <!#######################################################################>
 534 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
 535 <H2>
 536    <A CLASS="anchor" NAME="NewsVersion1_0">
 537       <B>Version 1.0 (Feb 14 2005)</B></A>
 538 </H2>
 539 <UL>
 540    <LI>State of the art
 541    <UL>
 542       <LI>
 543          <a href="Doc1.0/uml-gdcmV1.0.pdf">gdcm 1.0 UML Class Diagram</a> version.
 544       <LI> <a href= "Doc1.0/html.user/index.html">User Documentation"</a>
 545       <LI> <a href= "Doc1.0/html.developper/index.html">Developper
 546          Documentation"</a>
 547       <LI> Final check of the jpeg sub-library: all 'classical' jpeg
 548         compressed Dicom files can be read<br>
 549       <LI>All the previously gdcm-breaker images are now readable<br>
 550       <LI> A huge number of memory leaks removed
 551       <LI> Improvement of write process
 552    </UL>
 553
 554
 555    <LI> A.P.I. breaking modifications (since previous version : <TT>0.6</TT>)
 556    <UL>
 557       <LI> Use of <TT> namespace</TT> : all the methods formerly named
 558           <TT>className::gdcmXxx()</TT> are now named <TT>className::Xxx()</TT>
 559           <br> End user will have to call them as <TT>gdcm::className::Xxx() </TT>
 560       <LI> a <TT>gdcm::Document</TT> is now specialized in :
 561       <UL>
 562          <LI> <TT>gdcm::DicomDir</TT>
 563          <LI> <TT>gdcm::File</TT>
 564       </UL>
 565       <LI> a <TT>gdcm::DicomElementSet</TT> is composed of a set of
 566             <TT>gdcm::DicomDocEntry</TT>
 567       <LI> a <TT>gdcm::DicomDocEntry</TT> can be :
 568       <UL>
 569          <LI> a <TT>gdcm::ContentEntry</TT>, specialized in :
 570          <UL>
 571             <LI> <TT>gdcm::ValEntry</TT>
 572             <LI> <TT>gdcm::BinEntry</TT> (no longer a specialization of
 573                  <TT>gdcm::ValEntry</TT>)
 574         </UL>
 575       <LI> a <TT>gdcm::SeqEntry</TT>
 576       </UL>
 577       <LI> Removal of useless accessors <TT>GetXxxByname</TT>, <TT>SetXxxByname</TT>
 578       <LI> Renaming of accessors <TT>GetXxxByNumber</TT>, <TT>SetXxxByNumber</TT>
 579            as follow :
 580       <UL>
 581          <LI> <TT>GetEntryByNumber
 582                   &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
 583                                           --> GetEntryValue</TT>
 584          <LI> <TT>GetEntryLengthByNumber  --> GetEntryLength</TT>
 585          <LI> <TT>GetEntryOffsetByNumber  --> GetEntryOffset</TT>
 586          <LI> <TT>GetEntryVRByNumber
 587                   &nbsp;&nbsp;&nbsp;      --> GetEntryVR</TT>
 588          <LI>
 589          <LI> <TT>GetDocEntryByNumber
 590                   &nbsp;&nbsp;            --> GetDocEntry</TT>
 591          <LI> <TT>GetValEntryByNumber
 592                   &nbsp;&nbsp;            --> GetValEntry</TT>
 593          <LI> <TT>GetBinEntryByNumber
 594                   &nbsp;&nbsp;            --> GetBinEntry</TT>
 595          <LI> <TT>GetSeqEntryByNumber
 596                   &nbsp;&nbsp;            --> GetSeqEntry</TT>
 597        </UL>
 598    </UL>
 599 </UL>
 600
 601 <!#######################################################################>
 602 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
 603 <H2>
 604    <A CLASS="anchor" NAME="NewsVersion0_6">
 605       <B>Version 0.6 (June 8 2004)</B></A>
 606 </H2>
 607 <UL>
 608    This version will be used by Insight Tool Kit
 609    (<a href="http://www.itk.org">ITK</a> 2.0) at the beginning of 2005.<br>
 610     It's not yet packaged ...<br><br>
 611    <LI> <a href= "Doc0.6/html.user/index.html">User Documentation"</a>
 612    <LI> <a href= "Doc0.6/html.developper/index.html">Developper Documentation"</a>
 613    <LI> The new <TT>gdcmDocument</TT> class is a parent class of
 614        <TT>gdcmHeader</TT> class and <TT>gdcmDicomDir</TT> class.
 615    <LI> Massive modifications in the Class Diagram :
 616    <UL>
 617       <LI> any dicom related file is a <TT>gdcmDocument</TT>
 618       <LI> a <TT>gdcmDocument</TT> can be :
 619       <UL>
 620          <LI> a <TT>gdcmHeader</TT>, if it contains pixel data
 621          <LI> a <TT>gdcmDicomDir</TT>, if it contains only informations
 622               on the files in a given directory
 623       </UL>
 624
 625    <LI> a <TT>gdcmDocument</TT> is_a <TT>gdcmElementSet</TT>,
 626         composed of a set of <TT>gdcmEntry</TT> separated into :
 627       <UL>
 628       <LI> <TT>gdcmValEntry</TT><br>
 629            a specialization of <TT>gdcmValEntry</TT>, for 'non
 630            <TT>std::string</TT> representable' values is
 631            <TT>gdcmBinEntry</TT>
 632        <LI> <TT>gdcmSeqEntry</TT> (VR = <TT>SQ</TT>, i.e Dicom Sequences)<br>
 633              they are dealt as tree-like structures :<br>
 634              - a <TT>gdcmSeqEntry</TT> is considered as a set
 635              of <TT>gdcmSQItem</TT>,<br>
 636              - a <TT>gdcmSQItem</TT> is_a <TT>gdcmElementSet</TT>, composed
 637              of <TT>gdcmDocEntries</TT>, recursively <br>
 638       </UL>
 639    </UL>
 640    <LI> Improvement of the jpeg sub-library: jpeg
 641            compressed Dicom files (lossless and lossy)
 642            might be read (check-it out)
 643 </UL>
 644
 645 <!#######################################################################>
 646 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
 647 <H2>
 648    <A CLASS="anchor" NAME="NewsVersion0_4">
 649       <B>Version 0.4 (February 6 2004)</B></A>
 650 </H2>
 651 <UL>
 652
 653    <LI> <a href="Doc0.4/uml-gdcmV0.4.pdf">gdcm 0.4 UML Class Diagram</a>.
 654    <LI> <a href= "Doc0.4/html.user/index.html">User Documentation"</a>
 655    <LI> <a href= "Doc0.4/html.developper/index.html">Developper Documentation </a>
 656
 657    <LI> Introduction of a jpeg sub-library: some very simple jpeg-lossy
 658         compressed Dicom files might be working (check-it out).
 659    <LI> And also, fewer memory leaks, cleaned-up stl usage (should work
 660         with gcc-3.x), python disutil installer (see file setup.py)
 661         supporting both Swig and vtk wrapping.
 662    <LI> Introduction of a RLE (Run-Time Encoding) library
 663    <LI> Color images (RGB or Palette Color) are dealt with
 664    <LI> Confusing names <TT>gdcmPatient</TT>, <TT>gdcmStudy</TT>,
 665         <TT>gdcmSerie</TT>, <TT>gdcmPatient</TT> changed to
 666         <TT>gdcmDicomDirPatient</TT>, <TT>gdcmDicomDirStudy</TT>,
 667         <TT>gdcmDicomDirSerie</TT>, <TT>gdcmDicomDirPatient</TT>
 668
 669 </UL>
 670
 671 <!#######################################################################>
 672 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
 673 <H2>
 674    <A CLASS="anchor" NAME="NewsVersion0_3">
 675       <B>Version 0.3 (July 8 2003)</B></A>
 676 </H2>
 677 <UL>
 678    <LI> <TT>gdcmFile</TT> class now enables acces to the data
 679        i.e. the image[s] content. Previously only parsing of the
 680        Dicom header was available through usage of <TT>gdcmHeader</TT>
 681        class.
 682    <LI> a <A HREF="http://public.kitware.com/VTK/">VTK</A> plugin
 683        of gdcm is now available through the <TT>vtkGdcmReader</TT>
 684        vtk class (see it as a vtk wrapper of gdcm), which enables
 685        <UL>
 686          <LI> Loading of a single image,
 687          <LI> Loading of a stack of images from multiple Dicom files,
 688          <LI> this class is wrapped for vtkPython (by using native vtk
 689               wrappers).
 690        </UL>
 691    <LI> Introduction of a jpeg sub-library: lossless-jpeg
 692         compressed Dicom files work.
 693 <LI> <TT>vtkgdcmViewer</TT> allows easy displaying of single/multiframe
 694      GreyLevel/RGB/PaletteColor images
 695 </UL>
 696
 697 <!#######################################################################>
 698 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
 699 <H2>
 700    <A CLASS="anchor" NAME="NewsVersion0_1">
 701       <B>Version 0.1 (April 1 2003)</B></A>
 702
 703 <!#######################################################################>
 704 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
 705 <H2>
 706    <A CLASS="anchor" name="NewsVersion0_1">
 707       <B>Version 0.0 (March 14 2003)</B></A>
 708
 709 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADRESS>
 710
 711 </BODY>
 712 </HTML>