Doc/Website/News.html

   1 <!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
   2 <HTML>
   3 <HEAD>
   4    <META http-equiv="Content-Type" content="text/html;charset=iso-8859-1">
   5    <TITLE>Gdcm News</TITLE>
   6 </HEAD>
   7
   8 <BODY>
   9
  10
  11 <!#######################################################################>
  12 <H1>Gdcm News</a></H1>
  13
  14 <!#######################################################################>
  15
  16 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
  17 <H2>
  18    <A CLASS="anchor" NAME="missing">
  19       <B>Missing features</B></A>
  20 </H2>
  21 We know the following are missing; don't loose time looking for them ...<br>
  22 We know they could be helpfull. We shall add them some day.<br>
  23 Any contribution is welcome.
  24 <UL>
  25 <LI> Decoders
  26    <UL>
  27       <LI> gdcm doesn't read yet JPEG-LS and JPEG2000 encoded files.
  28       <LI> gdcm doesn't read yet MPEG encoded files.
  29    </UL>
  30 <LI>Reader
  31    <UL>
  32       <LI> Allow user to tell <TT>gdcm::Document</TT> constructor he just wants
  33            to load a given list of <TT>DocEntries</TT>
  34            (to save CPU time and RAM space)
  35       <LI> Allow 'frame by frame' reading (should be helpfull for huge multiframe
  36 images)
  37       <LI> Expose Read/Decompression mechanisms to allow user getting
  38          information from <tt>DICOMDIR</TT> <br> -or from his own Data Base-
  39          and reading his images without parsing
  40          the header, one more time.
  41    </UL>
  42    <LI>Writer
  43    <UL>
  44       <LI> Allow user to tell the Writer he doesn't want to write down
  45            <TT>SeqEntry</TT> (if any)
  46       <LI> Allow user to tell the Writer he doesn't want to write down
  47            <TT>Shadow groups</TT> (if any)
  48       <LI> Allow user to tell the Writer which compression mode he wants<br>
  49            (Right now, no one is available)
  50       <LI> Allow user to tell the Writer he wants to split a
  51            <TT>Multiframe</TT> image into a serie of
  52            <TT>Single frame</TT> images.
  53       <LI> Allow user to tell the Writer he wants to agregate a
  54            Serie of <TT>Single frame</TT> images into a
  55            <TT>Multiframe</TT> image.
  56    </UL>
  57 <LI>Reader / Writer
  58    <UL>
  59       <LI> Full <TT>Icon Image</TT> management (Read and Write)
  60       <LI> Full <TT>Overlays</TT> management (Read and Write) <br>
  61            both for '<TT>ACR-NEMA</TT> style' (using groups <TT>0x6000</TT>
  62             and nexts) and '<TT>DICOM V3</TT> style' (using Sequences)
  63    </UL>
  64 <LI> <TT>DICOMDIR</TT>
  65     <UL>
  66       <LI> <TT>DICOMDIR</TT> full management (not limited to
  67            <TT> PATIENT</TT>/<TT>STUDY</TT>/<TT>SERIE</TT>/<TT>IMAGE</TT>)
  68       <LI> Allow user to add an entry (belonging to the file header Dicom
  69            entries)to the default entry list, before
  70            making a <TT>DICOMDIR</TT> from a root directory
  71       <LI> Allow user to add an entry of his owns (for instance an <TT>Icon</TT>
  72            to each image, or to each Serie.
  73       </UL>
  74 <LI> SerieHelper
  75    <UL>
  76
  77       <LI> An accurate <TT>SerieHelper</TT> <br>
  78            Right now <TT>SerieHelper</TT> only works on 'bona fide Series', and
  79            breaks on wrongly forged Series.<br>
  80            We are still looking for any heuristics...
  81       <LI> A <TT>SerieHelper</TT> that would use the <TT>DICOMDIR</TT> (if any)
  82         instead of parsing all the files within the Root Directory
  83    </UL>
  84 <LI> Other
  85    <UL>
  86       <LI> 16-bits-LUT full Management
  87       <LI> User friendly management of <TT>Rescale Slope</TT> and
  88            <TT>Rescale Intercept</TT>
  89       <LI> Allow parsing the <TT>Shadow groups</TT> against a user supplied
  90            private <TT>Dicom Dictionary</TT> (pfff!...)
  91    </UL>
  92 </UL>
  93 <!#######################################################################>
  94 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
  95 <H2>
  96    <A CLASS="anchor" NAME="NewsCurrentVersion">
  97    <B>Current Version</B></A>
  98       <B></B></A>
  99 </H2>
 100
 101 <UL>
 102    <LI>State of the art
 103    <UL>
 104       <LI>
 105          <a href="uml-gdcm.pdf">gdcm UML Class Diagram</a> current version.
 106       <LI>
 107    </UL>
 108
 109    <LI> New Features
 110    <UL>
 111       <LI>Both <TT>vtkgdcmViewer</TT> and <TT>vtkgdcmViewer2</TT>
 112           are available to allow easy displaying of single/multiframe
 113           GreyLevel/RGB/PaletteColor images
 114       <LI> <TT>DICOMDIR</TT> anonymiser (<TT>Load</TT> and <TT>Noload</TT> mode)
 115       <LI> User is now allowed to tell <TT>gdcm::Document</TT> constructor
 116             he doesn't want to deal with <TT>SeqEntry</TT>
 117             (every time it's possible) <br> and/or he doesn't
 118             want to deal with <TT>Shadow groups</TT> (every time it's
 119             possible)<br>
 120             use : <br><TT>
 121             gdcm::File *f = new gdcm::File();<br>
 122             f->SetLoadMode(NO_SEQ | NO_SHADOW);<br>
 123             f->Load(fileName);<br>
 124             </TT>
 125             instead of : <br>
 126             <TT>
 127             gdcm::File *f = new gdcm::File(fileName);</TT> <br>
 128             (old style still available)
 129
 130         <LI> User is now allowed to tell <TT>gdcm::DicomDir</TT> constructor
 131             he doesn't want to deal with <TT>SeqEntry</TT>
 132             (every time it's possible) <br> and/or he doesn't
 133             want to deal with <TT>Shadow groups</TT> (every time it's
 134             possible)<br>
 135             use : <br><TT>
 136             gdcm::DicomDir *dcmdir = new gdcm::DicomDir( );<br>
 137             dcmdir->SetParseDir(true);<br>
 138             dcmdir->SetLoadMode(NO_SEQ | NO_SHADOW);<br>
 139             dcmdir->Load(dirName);<br>
 140             </TT>
 141             instead of : <br>
 142             <TT>
 143             gdcm::DicomDir *dcmdir = new gdcm::DicomDir(dirName, true);</TT><br>
 144             (old style still available)
 145        <LI>
 146    </UL>
 147
 148    <LI> Bug fixes
 149    <UL>
 150       <LI> The difference between <TT>MONOCHROME1</TT> (low values = bright,
 151             high values = dark) and <TT>MONOCHROME2</TT> (low values = dark,
 152             high values = bright) is now taken into account.<br>
 153             It's no longer up to the user to change the pixels value
 154       <LI> Writing a 'True Dicom' image after reading an <TT>ACR-NEMA</TT> image
 155            does not request any longer from the user to build up
 156             'manually' the Meta Elements group (<TT>Ox0002</TT>)
 157       <LI> Old '24 Bits' <TT>ACR-NEMA</TT> are now correctly re-written
 158            in <TT>DICOM V3</TT> mode.
 159       <LI> Element <TT>0x0000</TT> of <TT>Shadow groups</TT> is always forced to be a
 160            <TT>ValEntry</TT> and its <TT>VR</TT> is forced to <TT>UL</TT>
 161       <LI>
 162    </UL>
 163
 164    <LI> A.P.I. breaking modifications (since previous version : <TT>1.0</TT>)
 165    <UL>
 166       <LI> NEVER more API breaking modifications !!!
 167
 168    </UL>
 169
 170    <LI> Known bugs
 171    <UL>
 172       <LI> Use of <TT>Implicit Value Representation</TT> writting mode may
 173            causes troubles, when there are some <TT>SQ</TT> belonging to a
 174            <TT>Shadow Group</TT>. <br>
 175            Better you use <TT>Explicit Value Representation</TT> writting mode ...
 176    </UL>
 177
 178    <LI> Sample Data
 179    <UL>
 180       Get a <a href="gdcmData.tar.gz">gzipped tarball</a> of sample data
 181        (warning : 185 Megabytes ...)
 182    </UL>
 183 </UL>
 184
 185
 186
 187 <!#######################################################################>
 188 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
 189 <H2>
 190    <A CLASS="anchor" NAME="NewsVersion1_0">
 191       <B>Version 1.0 (Feb 14 2005)</B></A>
 192 </H2>
 193 <UL>
 194    <LI>State of the art
 195    <UL>
 196       <LI>
 197          <a href="Doc1.0/uml-gdcmV1.0.pdf">gdcm 1.0 UML Class Diagram</a> version.
 198       <LI> <a href= "Doc1.0/html.user/index.html">User Documentation"</a>
 199       <LI> <a href= "Doc1.0/html.developper/index.html">Developper
 200          Documentation"</a>
 201       <LI> Final check of the jpeg sub-library: all 'classical' jpeg
 202         compressed Dicom files can be read<br>
 203       <LI>All the previously gdcm-breaker images are now readable<br>
 204       <LI> A huge number of memory leaks removed
 205       <LI> Improvement of write process
 206    </UL>
 207
 208
 209    <LI> A.P.I. breaking modifications (since previous version : <TT>0.6</TT>)
 210    <UL>
 211       <LI> Use of <TT> namespace</TT> : all the methods formerly named
 212           <TT>className::gdcmXxx()</TT> are now named <TT>className::Xxx()</TT>
 213           <br> End user will have to call them as <TT>gdcm::className::Xxx() </TT>
 214       <LI> a <TT>gdcm::Document</TT> is now specialized in :
 215       <UL>
 216          <LI> <TT>gdcm::DicomDir</TT>
 217          <LI> <TT>gdcm::File</TT>
 218       </UL>
 219       <LI> a <TT>gdcm::DicomElementSet</TT> is composed of a set of
 220             <TT>gdcm::DicomDocEntry</TT>
 221       <LI> a <TT>gdcm::DicomDocEntry</TT> can be :
 222       <UL>
 223          <LI> a <TT>gdcm::ContentEntry</TT>, specialized in :
 224          <UL>
 225             <LI> <TT>gdcm::ValEntry</TT>
 226             <LI> <TT>gdcm::BinEntry</TT> (no longer a specialization of
 227                  <TT>gdcm::ValEntry</TT>)
 228         </UL>
 229       <LI> a <TT>gdcm::SeqEntry</TT>
 230       </UL>
 231       <LI> Removal of useless accessors <TT>GetXxxByname</TT>, <TT>SetXxxByname</TT>
 232       <LI> Renaming of accessors <TT>GetXxxByNumber</TT>, <TT>SetXxxByNumber</TT>
 233            as follow :
 234       <UL>
 235          <LI> <TT>GetEntryByNumber
 236                   &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
 237                                           --> GetEntryValue</TT>
 238          <LI> <TT>GetEntryLengthByNumber  --> GetEntryLength</TT>
 239          <LI> <TT>GetEntryOffsetByNumber  --> GetEntryOffset</TT>
 240          <LI> <TT>GetEntryVRByNumber
 241                   &nbsp;&nbsp;&nbsp;      --> GetEntryVR</TT>
 242          <LI>
 243          <LI> <TT>GetDocEntryByNumber
 244                   &nbsp;&nbsp;            --> GetDocEntry</TT>
 245          <LI> <TT>GetValEntryByNumber
 246                   &nbsp;&nbsp;            --> GetValEntry</TT>
 247          <LI> <TT>GetBinEntryByNumber
 248                   &nbsp;&nbsp;            --> GetBinEntry</TT>
 249          <LI> <TT>GetSeqEntryByNumber
 250                   &nbsp;&nbsp;            --> GetSeqEntry</TT>
 251        </UL>
 252    </UL>
 253 </UL>
 254
 255 <!#######################################################################>
 256 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
 257 <H2>
 258    <A CLASS="anchor" NAME="NewsVersion0_6">
 259       <B>Version 0.6 (June 8 2004)</B></A>
 260 </H2>
 261 <UL>
 262    This version will be used by Insight Tool Kit
 263    (<a href="http://www.itk.org">ITK</a> 2.0) at the beginning of 2005.<br>
 264     It's not yet packaged ...<br><br>
 265    <LI> <a href= "Doc0.6/html.user/index.html">User Documentation"</a>
 266    <LI> <a href= "Doc0.6/html.developper/index.html">Developper Documentation"</a>
 267    <LI> The new <TT>gdcmDocument</TT> class is a parent class of
 268        <TT>gdcmHeader</TT> class and <TT>gdcmDicomDir</TT> class.
 269    <LI> Massive modifications in the Class Diagram :
 270    <UL>
 271       <LI> any dicom related file is a <TT>gdcmDocument</TT>
 272       <LI> a <TT>gdcmDocument</TT> can be :
 273       <UL>
 274          <LI> a <TT>gdcmHeader</TT>, if it contains pixel data
 275          <LI> a <TT>gdcmDicomDir</TT>, if it contains only informations
 276               on the files in a given directory
 277       </UL>
 278
 279    <LI> a <TT>gdcmDocument</TT> is_a <TT>gdcmElementSet</TT>,
 280         composed of a set of <TT>gdcmEntry</TT> separated into :
 281       <UL>
 282       <LI> <TT>gdcmValEntry</TT><br>
 283            a specialization of <TT>gdcmValEntry</TT>, for 'non
 284            <TT>std::string</TT> representable' values is
 285            <TT>gdcmBinEntry</TT>
 286        <LI> <TT>gdcmSeqEntry</TT> (VR = <TT>SQ</TT>, i.e Dicom Sequences)<br>
 287              they are dealt as tree-like structures :<br>
 288              - a <TT>gdcmSeqEntry</TT> is considered as a set
 289              of <TT>gdcmSQItem</TT>,<br>
 290              - a <TT>gdcmSQItem</TT> is_a <TT>gdcmElementSet</TT>, composed
 291              of <TT>gdcmDocEntries</TT>, recursively <br>
 292       </UL>
 293    </UL>
 294    <LI> Improvement of the jpeg sub-library: jpeg
 295            compressed Dicom files (lossless and lossy)
 296            might be read (check-it out)
 297 </UL>
 298
 299 <!#######################################################################>
 300 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
 301 <H2>
 302    <A CLASS="anchor" NAME="NewsVersion0_4">
 303       <B>Version 0.4 (February 6 2004)</B></A>
 304 </H2>
 305 <UL>
 306
 307    <LI> <a href="Doc0.4/uml-gdcmV0.4.pdf">gdcm 0.4 UML Class Diagram</a>.
 308    <LI> <a href= "Doc0.4/html.user/index.html">User Documentation"</a>
 309    <LI> <a href= "Doc0.4/html.developper/index.html">Developper Documentation </a>
 310
 311    <LI> Introduction of a jpeg sub-library: some very simple jpeg-lossy
 312         compressed Dicom files might be working (check-it out).
 313    <LI> And also, fewer memory leaks, cleaned-up stl usage (should work
 314         with gcc-3.x), python disutil installer (see file setup.py)
 315         supporting both Swig and vtk wrapping.
 316    <LI> Introduction of a RLE (Run-Time Encoding) library
 317    <LI> Color images (RGB or Palette Color) are dealt with
 318    <LI> Confusing names <TT>gdcmPatient</TT>, <TT>gdcmStudy</TT>,
 319         <TT>gdcmSerie</TT>, <TT>gdcmPatient</TT> changed to
 320         <TT>gdcmDicomDirPatient</TT>, <TT>gdcmDicomDirStudy</TT>,
 321         <TT>gdcmDicomDirSerie</TT>, <TT>gdcmDicomDirPatient</TT>
 322
 323 </UL>
 324
 325 <!#######################################################################>
 326 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
 327 <H2>
 328    <A CLASS="anchor" NAME="NewsVersion0_3">
 329       <B>Version 0.3 (July 8 2003)</B></A>
 330 </H2>
 331 <UL>
 332    <LI> <TT>gdcmFile</TT> class now enables acces to the data
 333        i.e. the image[s] content. Previously only parsing of the
 334        Dicom header was available through usage of <TT>gdcmHeader</TT>
 335        class.
 336    <LI> a <A HREF="http://public.kitware.com/VTK/">VTK</A> plugin
 337        of gdcm is now available through the <TT>vtkGdcmReader</TT>
 338        vtk class (see it as a vtk wrapper of gdcm), which enables
 339        <UL>
 340          <LI> Loading of a single image,
 341          <LI> Loading of a stack of images from multiple Dicom files,
 342          <LI> this class is wrapped for vtkPython (by using native vtk
 343               wrappers).
 344        </UL>
 345    <LI> Introduction of a jpeg sub-library: lossless-jpeg
 346         compressed Dicom files work.
 347 <LI> <TT>vtkgdcmViewer</TT> allows easy displaying of single/multiframe
 348      GreyLevel/RGB/PaletteColor images
 349 </UL>
 350
 351 <!#######################################################################>
 352 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
 353 <H2>
 354    <A CLASS="anchor" NAME="NewsVersion0_1">
 355       <B>Version 0.1 (April 1 2003)</B></A>
 356
 357 <!#######################################################################>
 358 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
 359 <H2>
 360    <A CLASS="anchor" name="NewsVersion0_1">
 361       <B>Version 0.0 (March 14 2003)</B></A>
 362
 363 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADRESS>
 364
 365 </BODY>
 366 </HTML>