Doc/Website/News.html

   1 <!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">
   2 <HTML>
   3 <HEAD>
   4    <META http-equiv="Content-Type" content="text/html;charset=iso-8859-1">
   5    <TITLE>Gdcm News</TITLE>
   6 </HEAD>
   7
   8 <BODY>
   9
  10
  11 <!--#######################################################################-->
  12 <H1>Gdcm News</a></H1>
  13
  14 <!--#######################################################################-->
  15
  16 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
  17 <H2>
  18    <A CLASS="anchor" NAME="missing">
  19       <B>Missing features</B></A>
  20 </H2>
  21 We know the following are missing; don't loose time looking for them ...<br>
  22 We know they could be helpfull. We shall add them some day.<br>
  23 Any contribution is welcome.
  24 <UL>
  25 <LI> Decoders
  26    <UL>
  27       <LI> gdcm doesn't read yet JPEG-LS encoded files.
  28       <UL>
  29           We said 'JPEG-LS', not Lossless Jpeg ...<br>
  30           [JPEG-LS is the basis for new lossless/near-lossless compression
  31           standard for continuous-tone images intended for JPEG2000.
  32           The standard is based on the LOCO-I algorithm
  33           (LOw COmplexity LOssless COmpression for Images)
  34           developed at Hewlett-Packard Laboratories]
  35      </UL>
  36      <LI> gdcm doesn't read yet JPEG2000 encoded files.
  37      <UL>
  38          But we are working on it.
  39       </UL>
  40       <LI> gdcm doesn't read yet MPEG2 encoded files.
  41       <UL>
  42           But we are working on it.
  43       </UL>
  44    </UL>
  45 <LI>Reader
  46    <UL>
  47       <LI> Allow user to tell <TT>gdcm::Document</TT> constructor he just wants
  48            to load a given list of <TT>DocEntries</TT>
  49            (to save CPU time and RAM space)
  50       <LI> Allow 'frame by frame' reading (should be helpfull for huge
  51            multiframe images)
  52       <LI> Allow subvolume selection / frames selection before reading.
  53       <LI> Expose Read/Decompression mechanisms to allow user getting
  54          information from <tt>DICOMDIR</TT> <br> -or from his own Data Base-
  55          and reading his images without parsing
  56          the header, one more time.
  57    </UL>
  58    <LI>Writer
  59    <UL>
  60       <LI> Allow user to tell the Writer he doesn't want to write down
  61            <TT>SeqEntry</TT> (if any)
  62       <LI> Allow user to tell the Writer he doesn't want to write down
  63            <TT>Shadow groups</TT> (if any)
  64       <LI> Allow user to tell the Writer which compression mode he wants<br>
  65            (Right now, no one is available)
  66       <LI> Allow user to tell the Writer he wants to split a
  67            <TT>Multiframe</TT> image into a serie of
  68            <TT>Single frame</TT> images.
  69       <LI> Allow user to tell the Writer he wants to agregate a
  70            Serie of <TT>Single frame</TT> images into a
  71            <TT>Multiframe</TT> image.
  72    </UL>
  73 <LI>Reader / Writer
  74    <UL>
  75       <LI> Full <TT>Icon Image</TT> management (Read and Write)
  76       <LI> Full <TT>Overlays</TT> management (Read and Write) <br>
  77            both for '<TT>ACR-NEMA</TT> style' (using groups <TT>0x6000</TT>
  78             and nexts) and '<TT>DICOM V3</TT> style' (using Sequences)
  79    </UL>
  80 <LI> <TT>DICOMDIR</TT>
  81     <UL>
  82       <LI> <TT>DICOMDIR</TT> full management (not limited to
  83            <TT> PATIENT</TT>/<TT>STUDY</TT>/<TT>SERIE</TT>/<TT>IMAGE</TT>)
  84       <LI> Allow user to add an entry (belonging to the file header Dicom
  85            entries)to the default entry list, before
  86            making a <TT>DICOMDIR</TT> from a root directory
  87       <LI> Allow user to add an entry of his owns (for instance an <TT>Icon</TT>
  88            to each image, or to each Serie).
  89       </UL>
  90 <LI> SerieHelper
  91    <UL>
  92
  93       <LI> An accurate <TT>SerieHelper</TT> <br>
  94            Right now <TT>SerieHelper</TT> only works on 'bona fide Series', and
  95            breaks on wrongly forged Series.<br>
  96            We are still looking for any heuristics...
  97       <LI> A <TT>SerieHelper</TT> that would use the <TT>DICOMDIR</TT> (if any)
  98         instead of parsing all the files within the Root Directory
  99    </UL>
 100 <LI> Other
 101    <UL>
 102       <LI> 16-bits-LUT full Management
 103       <LI> User friendly management of <TT>Rescale Slope</TT> and
 104            <TT>Rescale Intercept</TT>
 105       <LI> Allow parsing the <TT>Shadow groups</TT> against a user supplied
 106            private <TT>Dicom Dictionary</TT> (pfff!...)
 107    </UL>
 108 </UL>
 109 <!#######################################################################>
 110 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
 111 <H2>
 112    <A CLASS="anchor" NAME="NewsCurrentVersion">
 113    <B>Current Version</B></A>
 114       <B></B></A>
 115 </H2>
 116
 117 <UL>
 118    <LI>State of the art
 119    <UL>
 120       <LI>
 121          <a href="uml-gdcm.pdf">gdcm UML Class Diagram</a> current version.
 122       <LI>
 123    </UL>
 124
 125    <LI> New Features
 126    <UL>
 127       <LI>Both <TT>vtkgdcmViewer</TT> and <TT>vtkgdcmViewer2</TT>
 128           are available to allow easy displaying of single/multiframe
 129           GreyLevel/RGB/PaletteColor images
 130       <LI> <TT>DICOMDIR</TT> anonymiser (<TT>Load</TT> and <TT>Noload</TT> mode)
 131       <LI> User is now allowed to tell <TT>gdcm::Document</TT> constructor
 132             he doesn't want to deal with <TT>SeqEntry</TT>
 133             (every time it's possible) <br> and/or he doesn't
 134             want to deal with <TT>Shadow groups</TT> (every time it's
 135             possible)<br>
 136             use : <br><TT>
 137             gdcm::File *f = new gdcm::File();<br>
 138             f->SetLoadMode(NO_SEQ | NO_SHADOW);<br>
 139             f->Load(fileName);<br>
 140             </TT>
 141             instead of : <br>
 142             <TT>
 143             gdcm::File *f = new gdcm::File(fileName);</TT> <br>
 144             (old style still available)
 145
 146         <LI> User is now allowed to tell <TT>gdcm::DicomDir</TT> constructor
 147             he doesn't want to deal with <TT>SeqEntry</TT>
 148             (every time it's possible) <br> and/or he doesn't
 149             want to deal with <TT>Shadow groups</TT> (every time it's
 150             possible)<br>
 151             use : <br><TT>
 152             gdcm::DicomDir *dcmdir = new gdcm::DicomDir( );<br>
 153             dcmdir->SetParseDir(true);<br>
 154             dcmdir->SetLoadMode(NO_SEQ | NO_SHADOW);<br>
 155             dcmdir->Load(dirName);<br>
 156             </TT>
 157             instead of : <br>
 158             <TT>
 159             gdcm::DicomDir *dcmdir = new gdcm::DicomDir(dirName, true);</TT><br>
 160             (old style still available)
 161        <LI>
 162    </UL>
 163
 164    <LI> Bug fixes
 165    <UL>
 166       <LI> The difference between <TT>MONOCHROME1</TT> (low values = bright,
 167             high values = dark) and <TT>MONOCHROME2</TT> (low values = dark,
 168             high values = bright) is now taken into account.<br>
 169             It's no longer up to the user to change the pixels value
 170       <LI> Writing a 'True Dicom' image after reading an <TT>ACR-NEMA</TT> image
 171            does not request any longer from the user to build up
 172             'manually' the Meta Elements group (<TT>Ox0002</TT>)
 173       <LI> Old '24 Bits' <TT>ACR-NEMA</TT> are now correctly re-written
 174            in <TT>DICOM V3</TT> mode.
 175       <LI> Element <TT>0x0000</TT> of <TT>Shadow groups</TT> is always forced to be a
 176            <TT>ValEntry</TT> and its <TT>VR</TT> is forced to <TT>UL</TT>
 177       <LI>
 178    </UL>
 179
 180    <LI> A.P.I. breaking modifications (since previous version : <TT>1.0</TT>)
 181    <UL>
 182       <LI> NEVER more API breaking modifications !!!
 183
 184    </UL>
 185
 186    <LI> Known bugs
 187    <UL>
 188       <LI> Use of <TT>Implicit Value Representation</TT> writting mode may
 189            causes troubles, when there are some <TT>SQ</TT> belonging to a
 190            <TT>Shadow Group</TT>. <br>
 191            Better you use <TT>Explicit Value Representation</TT> writting mode ...
 192    </UL>
 193
 194 </UL>
 195
 196
 197
 198 <!#######################################################################>
 199 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
 200 <H2>
 201    <A CLASS="anchor" NAME="NewsVersion1_0">
 202       <B>Version 1.0 (Feb 14 2005)</B></A>
 203 </H2>
 204 <UL>
 205    <LI>State of the art
 206    <UL>
 207       <LI>
 208          <a href="Doc1.0/uml-gdcmV1.0.pdf">gdcm 1.0 UML Class Diagram</a> version.
 209       <LI> <a href= "Doc1.0/html.user/index.html">User Documentation"</a>
 210       <LI> <a href= "Doc1.0/html.developper/index.html">Developper
 211          Documentation"</a>
 212       <LI> Final check of the jpeg sub-library: all 'classical' jpeg
 213         compressed Dicom files can be read<br>
 214       <LI>All the previously gdcm-breaker images are now readable<br>
 215       <LI> A huge number of memory leaks removed
 216       <LI> Improvement of write process
 217    </UL>
 218
 219
 220    <LI> A.P.I. breaking modifications (since previous version : <TT>0.6</TT>)
 221    <UL>
 222       <LI> Use of <TT> namespace</TT> : all the methods formerly named
 223           <TT>className::gdcmXxx()</TT> are now named <TT>className::Xxx()</TT>
 224           <br> End user will have to call them as <TT>gdcm::className::Xxx() </TT>
 225       <LI> a <TT>gdcm::Document</TT> is now specialized in :
 226       <UL>
 227          <LI> <TT>gdcm::DicomDir</TT>
 228          <LI> <TT>gdcm::File</TT>
 229       </UL>
 230       <LI> a <TT>gdcm::DicomElementSet</TT> is composed of a set of
 231             <TT>gdcm::DicomDocEntry</TT>
 232       <LI> a <TT>gdcm::DicomDocEntry</TT> can be :
 233       <UL>
 234          <LI> a <TT>gdcm::ContentEntry</TT>, specialized in :
 235          <UL>
 236             <LI> <TT>gdcm::ValEntry</TT>
 237             <LI> <TT>gdcm::BinEntry</TT> (no longer a specialization of
 238                  <TT>gdcm::ValEntry</TT>)
 239         </UL>
 240       <LI> a <TT>gdcm::SeqEntry</TT>
 241       </UL>
 242       <LI> Removal of useless accessors <TT>GetXxxByname</TT>, <TT>SetXxxByname</TT>
 243       <LI> Renaming of accessors <TT>GetXxxByNumber</TT>, <TT>SetXxxByNumber</TT>
 244            as follow :
 245       <UL>
 246          <LI> <TT>GetEntryByNumber
 247                   &nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;
 248                                           --> GetEntryValue</TT>
 249          <LI> <TT>GetEntryLengthByNumber  --> GetEntryLength</TT>
 250          <LI> <TT>GetEntryOffsetByNumber  --> GetEntryOffset</TT>
 251          <LI> <TT>GetEntryVRByNumber
 252                   &nbsp;&nbsp;&nbsp;      --> GetEntryVR</TT>
 253          <LI>
 254          <LI> <TT>GetDocEntryByNumber
 255                   &nbsp;&nbsp;            --> GetDocEntry</TT>
 256          <LI> <TT>GetValEntryByNumber
 257                   &nbsp;&nbsp;            --> GetValEntry</TT>
 258          <LI> <TT>GetBinEntryByNumber
 259                   &nbsp;&nbsp;            --> GetBinEntry</TT>
 260          <LI> <TT>GetSeqEntryByNumber
 261                   &nbsp;&nbsp;            --> GetSeqEntry</TT>
 262        </UL>
 263    </UL>
 264 </UL>
 265
 266 <!#######################################################################>
 267 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
 268 <H2>
 269    <A CLASS="anchor" NAME="NewsVersion0_6">
 270       <B>Version 0.6 (June 8 2004)</B></A>
 271 </H2>
 272 <UL>
 273    This version will be used by Insight Tool Kit
 274    (<a href="http://www.itk.org">ITK</a> 2.0) at the beginning of 2005.<br>
 275     It's not yet packaged ...<br><br>
 276    <LI> <a href= "Doc0.6/html.user/index.html">User Documentation"</a>
 277    <LI> <a href= "Doc0.6/html.developper/index.html">Developper Documentation"</a>
 278    <LI> The new <TT>gdcmDocument</TT> class is a parent class of
 279        <TT>gdcmHeader</TT> class and <TT>gdcmDicomDir</TT> class.
 280    <LI> Massive modifications in the Class Diagram :
 281    <UL>
 282       <LI> any dicom related file is a <TT>gdcmDocument</TT>
 283       <LI> a <TT>gdcmDocument</TT> can be :
 284       <UL>
 285          <LI> a <TT>gdcmHeader</TT>, if it contains pixel data
 286          <LI> a <TT>gdcmDicomDir</TT>, if it contains only informations
 287               on the files in a given directory
 288       </UL>
 289
 290    <LI> a <TT>gdcmDocument</TT> is_a <TT>gdcmElementSet</TT>,
 291         composed of a set of <TT>gdcmEntry</TT> separated into :
 292       <UL>
 293       <LI> <TT>gdcmValEntry</TT><br>
 294            a specialization of <TT>gdcmValEntry</TT>, for 'non
 295            <TT>std::string</TT> representable' values is
 296            <TT>gdcmBinEntry</TT>
 297        <LI> <TT>gdcmSeqEntry</TT> (VR = <TT>SQ</TT>, i.e Dicom Sequences)<br>
 298              they are dealt as tree-like structures :<br>
 299              - a <TT>gdcmSeqEntry</TT> is considered as a set
 300              of <TT>gdcmSQItem</TT>,<br>
 301              - a <TT>gdcmSQItem</TT> is_a <TT>gdcmElementSet</TT>, composed
 302              of <TT>gdcmDocEntries</TT>, recursively <br>
 303       </UL>
 304    </UL>
 305    <LI> Improvement of the jpeg sub-library: jpeg
 306            compressed Dicom files (lossless and lossy)
 307            might be read (check-it out)
 308 </UL>
 309
 310 <!#######################################################################>
 311 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
 312 <H2>
 313    <A CLASS="anchor" NAME="NewsVersion0_4">
 314       <B>Version 0.4 (February 6 2004)</B></A>
 315 </H2>
 316 <UL>
 317
 318    <LI> <a href="Doc0.4/uml-gdcmV0.4.pdf">gdcm 0.4 UML Class Diagram</a>.
 319    <LI> <a href= "Doc0.4/html.user/index.html">User Documentation"</a>
 320    <LI> <a href= "Doc0.4/html.developper/index.html">Developper Documentation </a>
 321
 322    <LI> Introduction of a jpeg sub-library: some very simple jpeg-lossy
 323         compressed Dicom files might be working (check-it out).
 324    <LI> And also, fewer memory leaks, cleaned-up stl usage (should work
 325         with gcc-3.x), python disutil installer (see file setup.py)
 326         supporting both Swig and vtk wrapping.
 327    <LI> Introduction of a RLE (Run-Time Encoding) library
 328    <LI> Color images (RGB or Palette Color) are dealt with
 329    <LI> Confusing names <TT>gdcmPatient</TT>, <TT>gdcmStudy</TT>,
 330         <TT>gdcmSerie</TT>, <TT>gdcmPatient</TT> changed to
 331         <TT>gdcmDicomDirPatient</TT>, <TT>gdcmDicomDirStudy</TT>,
 332         <TT>gdcmDicomDirSerie</TT>, <TT>gdcmDicomDirPatient</TT>
 333
 334 </UL>
 335
 336 <!#######################################################################>
 337 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
 338 <H2>
 339    <A CLASS="anchor" NAME="NewsVersion0_3">
 340       <B>Version 0.3 (July 8 2003)</B></A>
 341 </H2>
 342 <UL>
 343    <LI> <TT>gdcmFile</TT> class now enables acces to the data
 344        i.e. the image[s] content. Previously only parsing of the
 345        Dicom header was available through usage of <TT>gdcmHeader</TT>
 346        class.
 347    <LI> a <A HREF="http://public.kitware.com/VTK/">VTK</A> plugin
 348        of gdcm is now available through the <TT>vtkGdcmReader</TT>
 349        vtk class (see it as a vtk wrapper of gdcm), which enables
 350        <UL>
 351          <LI> Loading of a single image,
 352          <LI> Loading of a stack of images from multiple Dicom files,
 353          <LI> this class is wrapped for vtkPython (by using native vtk
 354               wrappers).
 355        </UL>
 356    <LI> Introduction of a jpeg sub-library: lossless-jpeg
 357         compressed Dicom files work.
 358 <LI> <TT>vtkgdcmViewer</TT> allows easy displaying of single/multiframe
 359      GreyLevel/RGB/PaletteColor images
 360 </UL>
 361
 362 <!#######################################################################>
 363 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
 364 <H2>
 365    <A CLASS="anchor" NAME="NewsVersion0_1">
 366       <B>Version 0.1 (April 1 2003)</B></A>
 367
 368 <!#######################################################################>
 369 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADDRESS>
 370 <H2>
 371    <A CLASS="anchor" name="NewsVersion0_1">
 372       <B>Version 0.0 (March 14 2003)</B></A>
 373
 374 <HR size="1"><ADDRESS style="align: right;"></ADRESS>
 375
 376 </BODY>
 377 </HTML>