Example/Anonymize.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: Anonymize.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2006/03/01 09:51:56 $
   7   Version:   $Revision: 1.10 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
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  17 =========================================================================*/
  18 #include "gdcmFile.h"
  19 #include "gdcmFileHelper.h"
  20 #include "gdcmCommon.h"
  21 #include "gdcmDebug.h"
  22
  23 #include "gdcmArgMgr.h"
  24
  25 #include <iostream>
  26
  27 int main(int argc, char *argv[])
  28 {
  29    START_USAGE(usage)
  30    " \n Anonymize :\n                                                         ",
  31    " Anonymize a full gdcm-readable Dicom image                               ",
  32    "          Warning : probably segfaults if pixels are not gdcm readable.   ",
  33    "                    Use AnonymizeNoLoad instead.                        ",
  34    " usage: Anonymize filein=inputFileName fileout=anonymizedFileName[debug]  ",
  35    "        debug    : user wants to run the program in 'debug mode'          ",
  36    FINISH_USAGE
  37
  38    // ----- Initialize Arguments Manager ------
  39    gdcm::ArgMgr *am = new gdcm::ArgMgr(argc, argv);
  40
  41    if (argc == 1 || am->ArgMgrDefined("usage"))
  42    {
  43       am->ArgMgrUsage(usage); // Display 'usage'
  44       delete am;
  45       return 0;
  46    }
  47    char *fileName = am->ArgMgrWantString("filein",usage);
  48    if ( fileName == NULL )
  49    {
  50       delete am;
  51       return 0;
  52    }
  53
  54    char *outputFileName = am->ArgMgrWantString("fileout",usage);
  55    if ( outputFileName == NULL )
  56    {
  57       delete am;
  58       return 0;
  59    }
  60    if (am->ArgMgrDefined("debug"))
  61       gdcm::Debug::DebugOn();
  62
  63    // if unused Param we give up
  64    if ( am->ArgMgrPrintUnusedLabels() )
  65    {
  66       am->ArgMgrUsage(usage);
  67       delete am;
  68       return 0;
  69    }
  70
  71    delete am;  // we don't need Argument Manager any longer
  72
  73    // ============================================================
  74    //   Read the input file.
  75    // ============================================================
  76
  77    gdcm::File *f;
  78
  79    f = gdcm::File::New(  );
  80    f->SetLoadMode( gdcm::LD_ALL );
  81    f->SetFileName( fileName );
  82    int res = f->Load();
  83
  84    if ( !res )
  85    {
  86        std::cerr << "Sorry, " << fileName <<"  not a gdcm-readable "
  87                  << "DICOM / ACR File" <<std::endl;
  88        f->Delete();
  89        return 0;
  90    }
  91    std::cout << " ... is readable " << std::endl;
  92
  93    // ============================================================
  94    //   Load the pixels in memory.
  95    // ============================================================
  96
  97    // We need a gdcm::FileHelper, since we want to load the pixels
  98    gdcm::FileHelper *fh = gdcm::FileHelper::New(f);
  99
 100    // unit8_t DOESN'T mean it's mandatory for the image to be a 8 bits one !
 101    // Feel free to cast if you know it's not.
 102
 103    uint8_t *imageData = fh->GetImageData();
 104
 105    if ( imageData == 0 )
 106    {
 107        std::cerr << "Sorry, Pixels of" << fileName <<"  are not "
 108                  << " gdcm-readable."       << std::endl
 109                  << "Use exAnonymizeNoLoad" << std::endl;
 110        f->Delete();
 111        fh->Delete();
 112        return 0;
 113    }
 114
 115    // ============================================================
 116    //  Choose the fields to anonymize.
 117    // ============================================================
 118    // Institution name
 119    f->AddAnonymizeElement(0x0008, 0x0080, "Xanadoo");
 120    // Patient's name
 121    f->AddAnonymizeElement(0x0010, 0x0010, "Fantomas^X");
 122    // Patient's ID
 123    f->AddAnonymizeElement( 0x0010, 0x0020,"1515" );
 124    // Study Instance UID
 125    f->AddAnonymizeElement(0x0020, 0x000d, "9.99.999.9999" );
 126    // Telephone
 127    f->AddAnonymizeElement(0x0010, 0x2154, "3615" );
 128
 129    // Aware user will add here more fields to anonymize here
 130
 131    // The gdcm::File is modified in memory
 132
 133    f->AnonymizeFile();
 134
 135    // ============================================================
 136    //   Write a new file
 137    // ============================================================
 138
 139    // Since we just Anonymized the file, we know no modification
 140    // was performed on the pixels.
 141    // The written image will not appear as a 'Secondary Captured image'
 142    // nor as a DERIVED one
 143
 144    fh->SetContentType(gdcm::UNMODIFIED_PIXELS_IMAGE);
 145
 146    fh->WriteDcmExplVR(outputFileName);
 147    std::cout <<"End Anonymize" << std::cout;
 148
 149    // ============================================================
 150    //   Remove the Anonymize list
 151    // ============================================================
 152    f->ClearAnonymizeList();
 153
 154    f->Delete();
 155    fh->Delete();
 156    return 0;
 157 }
 158