Example/Anonymize.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: Anonymize.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2005/06/07 11:12:10 $
   7   Version:   $Revision: 1.1 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
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  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18 #include "gdcmFile.h"
  19 #include "gdcmFileHelper.h"
  20 #include "gdcmCommon.h"
  21 #include "gdcmDebug.h"
  22
  23 #include "gdcmArgMgr.h"
  24
  25 #include <iostream>
  26
  27 int main(int argc, char *argv[])
  28 {
  29    START_USAGE(usage)
  30    " \n Anonymize :\n",
  31    " Anonymize a full gdcm-readable Dicom image",
  32    "          Warning : probably segfaults if pixels are not gdcm readable.",
  33    "                    Use exAnonymizeNoLoad instead.",
  34    " usage: Anonymize filein=inputFileName fileout=anonymizedFileName[debug] ",
  35    "        debug    : user wants to run the program in 'debug mode' ",
  36    FINISH_USAGE
  37
  38    // ----- Initialize Arguments Manager ------
  39    gdcm::ArgMgr *am = new gdcm::ArgMgr(argc, argv);
  40
  41    if (am->ArgMgrDefined("usage"))
  42    {
  43       am->ArgMgrUsage(usage); // Display 'usage'
  44       delete am;
  45       return 0;
  46    }
  47    char *fileName = am->ArgMgrWantString("filein",usage);
  48    if ( fileName == NULL )
  49    {
  50       delete am;
  51       return 0;
  52    }
  53
  54    char *outputFileName = am->ArgMgrWantString("fileout",usage);
  55    if ( outputFileName == NULL )
  56    {
  57       delete am;
  58       return 0;
  59    }
  60    if (am->ArgMgrDefined("debug"))
  61       gdcm::Debug::DebugOn();
  62
  63    // if unused Param we give up
  64    if ( am->ArgMgrPrintUnusedLabels() )
  65    {
  66       am->ArgMgrUsage(usage);
  67       delete am;
  68       return 0;
  69    }
  70
  71    delete am;  // we don't need Argument Manager any longer
  72
  73    // ============================================================
  74    //   Read the input file.
  75    // ============================================================
  76
  77    gdcm::File *f1;
  78
  79    f1 = new gdcm::File( fileName );
  80    if (!f1->IsReadable())
  81    {
  82        std::cerr << "Sorry, " << fileName <<"  not a gdcm-readable "
  83                  << "DICOM / ACR File" <<std::endl;
  84        delete f1;
  85        return 0;
  86    }
  87    std::cout << " ... is readable " << std::endl;
  88
  89    // ============================================================
  90    //   Load the pixels in memory.
  91    // ============================================================
  92
  93    // We need a gdcm::FileHelper, since we want to load the pixels
  94    gdcm::FileHelper *fh1 = new gdcm::FileHelper(f1);
  95
  96    // (unit8_t DOESN'T mean it's mandatory for the image to be a 8 bits one)
  97
  98    uint8_t *imageData = fh1->GetImageData();
  99
 100    if ( imageData == 0 )
 101    {
 102        std::cerr << "Sorry, Pixels of" << fileName <<"  are not "
 103            << " gdcm-readable."       << std::endl
 104                  << "Use exAnonymizeNoLoad" << std::endl;
 105        delete f1;
 106        delete fh1;
 107        return 0;
 108    }
 109
 110    // ============================================================
 111    //  Choose the fields to anonymize.
 112    // ============================================================
 113    // Institution name
 114    f1->AddAnonymizeElement(0x0008, 0x0080, "Xanadoo");
 115    // Patient's name
 116    f1->AddAnonymizeElement(0x0010, 0x0010, "Fantomas");
 117    // Patient's ID
 118    f1->AddAnonymizeElement( 0x0010, 0x0020,"1515" );
 119    // Study Instance UID
 120    f1->AddAnonymizeElement(0x0020, 0x000d, "9.99.999.9999" );
 121    // Telephone
 122    f1->AddAnonymizeElement(0x0010, 0x2154, "3615" );
 123
 124    // Aware user will add more fields to anonymize here
 125
 126    // The gdcm::File is modified in memory
 127
 128    f1->AnonymizeFile();
 129
 130    // ============================================================
 131    //   Write a new file
 132    // ============================================================
 133
 134    fh1->WriteDcmExplVR(outputFileName);
 135    std::cout <<"End Anonymize" << std::cout;
 136
 137    // ============================================================
 138    //   Remove the Anonymize list
 139    // ============================================================
 140    f1->ClearAnonymizeList();
 141
 142    delete f1;
 143    delete fh1;
 144    return 0;
 145 }
 146