Example/Anonymize.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: Anonymize.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2005/07/21 04:55:50 $
   7   Version:   $Revision: 1.3 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18 #include "gdcmFile.h"
  19 #include "gdcmFileHelper.h"
  20 #include "gdcmCommon.h"
  21 #include "gdcmDebug.h"
  22
  23 #include "gdcmArgMgr.h"
  24
  25 #include <iostream>
  26
  27 int main(int argc, char *argv[])
  28 {
  29    START_USAGE(usage)
  30    " \n Anonymize :\n                                                         ",
  31    " Anonymize a full gdcm-readable Dicom image                               ",
  32    "          Warning : probably segfaults if pixels are not gdcm readable.   ",
  33    "                    Use exAnonymizeNoLoad instead.                        ",
  34    " usage: Anonymize filein=inputFileName fileout=anonymizedFileName[debug]  ",
  35    "        debug    : user wants to run the program in 'debug mode'          ",
  36    FINISH_USAGE
  37
  38    // ----- Initialize Arguments Manager ------
  39    gdcm::ArgMgr *am = new gdcm::ArgMgr(argc, argv);
  40
  41    if (argc == 1 || am->ArgMgrDefined("usage"))
  42    {
  43       am->ArgMgrUsage(usage); // Display 'usage'
  44       delete am;
  45       return 0;
  46    }
  47    char *fileName = am->ArgMgrWantString("filein",usage);
  48    if ( fileName == NULL )
  49    {
  50       delete am;
  51       return 0;
  52    }
  53
  54    char *outputFileName = am->ArgMgrWantString("fileout",usage);
  55    if ( outputFileName == NULL )
  56    {
  57       delete am;
  58       return 0;
  59    }
  60    if (am->ArgMgrDefined("debug"))
  61       gdcm::Debug::DebugOn();
  62
  63    // if unused Param we give up
  64    if ( am->ArgMgrPrintUnusedLabels() )
  65    {
  66       am->ArgMgrUsage(usage);
  67       delete am;
  68       return 0;
  69    }
  70
  71    delete am;  // we don't need Argument Manager any longer
  72
  73    // ============================================================
  74    //   Read the input file.
  75    // ============================================================
  76
  77    gdcm::File *f;
  78
  79    f = new gdcm::File(  );
  80    f->SetLoadMode( 0x00000000 );
  81    f->SetFileName( fileName );
  82    int res = f->Load();
  83
  84    if ( !res )
  85    {
  86        std::cerr << "Sorry, " << fileName <<"  not a gdcm-readable "
  87                  << "DICOM / ACR File" <<std::endl;
  88        delete f;
  89        return 0;
  90    }
  91    std::cout << " ... is readable " << std::endl;
  92
  93    // ============================================================
  94    //   Load the pixels in memory.
  95    // ============================================================
  96
  97    // We need a gdcm::FileHelper, since we want to load the pixels
  98    gdcm::FileHelper *fh = new gdcm::FileHelper(f);
  99
 100    // (unit8_t DOESN'T mean it's mandatory for the image to be a 8 bits one)
 101
 102    uint8_t *imageData = fh->GetImageData();
 103
 104    if ( imageData == 0 )
 105    {
 106        std::cerr << "Sorry, Pixels of" << fileName <<"  are not "
 107            << " gdcm-readable."       << std::endl
 108                  << "Use exAnonymizeNoLoad" << std::endl;
 109        delete f;
 110        delete fh;
 111        return 0;
 112    }
 113
 114    // ============================================================
 115    //  Choose the fields to anonymize.
 116    // ============================================================
 117    // Institution name
 118    f->AddAnonymizeElement(0x0008, 0x0080, "Xanadoo");
 119    // Patient's name
 120    f->AddAnonymizeElement(0x0010, 0x0010, "Fantomas");
 121    // Patient's ID
 122    f->AddAnonymizeElement( 0x0010, 0x0020,"1515" );
 123    // Study Instance UID
 124    f->AddAnonymizeElement(0x0020, 0x000d, "9.99.999.9999" );
 125    // Telephone
 126    f->AddAnonymizeElement(0x0010, 0x2154, "3615" );
 127
 128    // Aware user will add more fields to anonymize here
 129
 130    // The gdcm::File is modified in memory
 131
 132    f->AnonymizeFile();
 133
 134    // ============================================================
 135    //   Write a new file
 136    // ============================================================
 137
 138    fh->WriteDcmExplVR(outputFileName);
 139    std::cout <<"End Anonymize" << std::cout;
 140
 141    // ============================================================
 142    //   Remove the Anonymize list
 143    // ============================================================
 144    f->ClearAnonymizeList();
 145
 146    delete f;
 147    delete fh;
 148    return 0;
 149 }
 150