Example/MakeDicomDir.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: MakeDicomDir.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2007/09/28 14:09:20 $
   7   Version:   $Revision: 1.25 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18 #include "gdcmDocEntry.h"
  19 #include "gdcmDicomDir.h"
  20 #include "gdcmDicomDirPatient.h"
  21 #include "gdcmDirList.h"
  22 #include "gdcmDebug.h"
  23 #include "gdcmArgMgr.h"
  24
  25 //#include <sys/times.h> // Linux Only
  26
  27 #include <iostream>
  28
  29 /**
  30   * \brief   Explores recursively the given directory
  31   *          orders the gdcm-readable found Files
  32   *          according their Patient/Study/Serie/Image characteristics
  33   *          makes the gdcmDicomDir
  34   *          and writes a file named DICOMDIR. (user may choose an other name)
  35   */
  36
  37 int main(int argc, char *argv[])
  38 {
  39    START_USAGE(usage)
  40    " \n MakeDicomDir :\n                                                      ",
  41    " Explores recursively the given directory, makes the relevant DICOMDIR    ",
  42    "          and writes it as 'DICOMDIR'                                     ",
  43    "                                                                          ",
  44    " usage: MakeDicomDir dirname=rootDirectoryName                            ",
  45    "                     name=DICOMDIR file name                              ",
  46    "        [noshadowseq][noshadow][noseq] [debug] [check]                    ",
  47    "                                                                          ",
  48    "        name : the default name for the generated dicomdir is 'DICOMDIR'  ",
  49    "        noshadowseq: user doesn't want to load Private Sequences          ",
  50    "        noshadow : user doesn't want to load Private groups (odd number)  ",
  51    "        noseq    : user doesn't want to load Sequences                    ",
  52    "        debug    : developper wants to run the program in 'debug mode'    ",
  53    "        check    : the dicomdir is checked as 'gdcm readable'             ",
  54    FINISH_USAGE
  55
  56    // ----- Initialize Arguments Manager ------
  57    GDCM_NAME_SPACE::ArgMgr *am = new GDCM_NAME_SPACE::ArgMgr(argc, argv);
  58
  59    if (argc == 1 || am->ArgMgrDefined("usage"))
  60    {
  61       am->ArgMgrUsage(usage); // Display 'usage'
  62       delete am;
  63       return 0;
  64    }
  65
  66    const char *dirName;
  67    dirName  = am->ArgMgrGetString("dirName",".");
  68
  69    const char *name;
  70    name  = am->ArgMgrGetString("name","DICOMDIR");
  71
  72    int loadMode = GDCM_NAME_SPACE::LD_ALL;
  73    if ( am->ArgMgrDefined("noshadowseq") )
  74       loadMode |= GDCM_NAME_SPACE::LD_NOSHADOWSEQ;
  75    else
  76    {
  77    if ( am->ArgMgrDefined("noshadow") )
  78          loadMode |= GDCM_NAME_SPACE::LD_NOSHADOW;
  79       if ( am->ArgMgrDefined("noseq") )
  80          loadMode |= GDCM_NAME_SPACE::LD_NOSEQ;
  81    }
  82
  83    if (am->ArgMgrDefined("debug"))
  84       GDCM_NAME_SPACE::Debug::DebugOn();
  85
  86    int check = am->ArgMgrDefined("check");
  87
  88    // if unused Param we give up
  89    if ( am->ArgMgrPrintUnusedLabels() )
  90    {
  91       am->ArgMgrUsage(usage);
  92       delete am;
  93       return 0;
  94    }
  95
  96    delete am;  // we don't need Argument Manager any longer
  97
  98    // ----- Begin Processing -----
  99
 100    GDCM_NAME_SPACE::DicomDir *dcmdir;
 101
 102    // we ask for Directory parsing
 103
 104    dcmdir = GDCM_NAME_SPACE::DicomDir::New( );
 105
 106    dcmdir->SetLoadMode(loadMode);
 107    dcmdir->SetDirectoryName(dirName);
 108    //dcmdir->SetParseDir(true);
 109
 110      // struct tms tms1, tms2; // Time measurements
 111      // times(&tms1);
 112
 113    dcmdir->Load(); // Reads all the files and creates the GDCM_NAME_SPACE::DicomDir
 114
 115       //times(&tms2);
 116       //std::cout
 117       //  << (long) ((tms2.tms_utime)  - (tms1.tms_utime))
 118       // << std::endl;
 119
 120    if ( GDCM_NAME_SPACE::Debug::GetDebugFlag() )
 121       std::cout << "======================= End Parsing Directory" << std::endl;
 122
 123     // ----- Check the result
 124
 125    if ( !dcmdir->GetFirstPatient() )
 126    {
 127       std::cout << "makeDicomDir: no patient found. Exiting."
 128                 << std::endl;
 129       dcmdir->Delete();
 130       return 1;
 131    }
 132
 133    // ----- Writes the corresponding DICOMDIR file (from the GDCM_NAME_SPACE::DicomDir)
 134
 135    dcmdir->Write(name);
 136    dcmdir->Delete();
 137
 138    if (check)
 139    {
 140       if ( GDCM_NAME_SPACE::Debug::GetDebugFlag() )
 141          std::cout << "======================= End Writting DICOMDIR"
 142                    << std::endl;
 143
 144      // Read from disc the just written DicomDir
 145
 146       GDCM_NAME_SPACE::DicomDir *newDicomDir = GDCM_NAME_SPACE::DicomDir::New();
 147       newDicomDir->SetFileName( name );
 148       newDicomDir->Load();
 149       if ( GDCM_NAME_SPACE::Debug::GetDebugFlag() )
 150          std::cout << "======================= End Parsing DICOMDIR"
 151                    << std::endl;
 152       if( !newDicomDir->IsReadable() )
 153       {
 154          std::cout<<"          Written DicomDir [" << name << "] "
 155                   <<" is not readable"<<std::endl
 156                   <<"          ...Failed"<<std::endl;
 157
 158          newDicomDir->Delete();
 159          return 1;
 160       }
 161
 162       if( !newDicomDir->GetFirstPatient() )
 163       {
 164          std::cout <<"          Written DicomDir [" << name << "] "
 165                    <<" has no patient"<<std::endl
 166                    <<"          ...Failed"<<std::endl;
 167
 168          newDicomDir->Delete();
 169          return(1);
 170       }
 171       std::cout<<std::flush;
 172       newDicomDir->Delete();
 173    }
 174    return 0;
 175 }