Example/PrintDicomDir.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: PrintDicomDir.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2005/07/21 04:55:50 $
   7   Version:   $Revision: 1.28 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18 #include "gdcmDocument.h"
  19 #include "gdcmDicomDir.h"
  20 #include "gdcmValEntry.h"
  21 #include "gdcmDicomDirPatient.h"
  22 #include "gdcmDicomDirStudy.h"
  23 #include "gdcmDicomDirVisit.h"
  24 #include "gdcmDicomDirSerie.h"
  25 #include "gdcmDicomDirImage.h"
  26 #include "gdcmTS.h"
  27 #include "gdcmDebug.h"
  28
  29 #include "gdcmArgMgr.h"
  30
  31 #include <fstream>
  32 #include <iostream>
  33
  34 int main(int argc, char* argv[])
  35 {
  36    START_USAGE(usage)
  37    " \n PrintDicomDir :\n",
  38    " Display the tree-like structure of a DICOMDIR File",
  39    " usage: PrintDicomDir filein=fileName [level=n] [debug] ",
  40    "        detail = 1 : Patients, 2 : Studies, 3 : Series, 4 : Images ",
  41    "                 5 : Full Content ",
  42    "        level = 0,1,2 : depending on user (what he wants to see)",
  43    "        debug    : user wants to run the program in 'debug mode' ",
  44    FINISH_USAGE
  45
  46    // Initialize Arguments Manager
  47    gdcm::ArgMgr *am= new gdcm::ArgMgr(argc, argv);
  48
  49    if (argc == 1 || am->ArgMgrDefined("usage") )
  50    {
  51       am->ArgMgrUsage(usage); // Display 'usage'
  52       delete am;
  53       return 0;
  54    }
  55
  56    gdcm::DicomDir *f;
  57    gdcm::TSKey v;
  58
  59    gdcm::DicomDirPatient *pa;
  60    gdcm::DicomDirStudy *st;
  61    gdcm::DicomDirSerie *se;
  62    gdcm::DicomDirVisit *vs;
  63    gdcm::DicomDirImage *im;
  64
  65    char *fileName;
  66    fileName  = am->ArgMgrWantString("filein",usage);
  67
  68    int level  = am->ArgMgrGetInt("level", 2);
  69
  70    int detailLevel = am->ArgMgrGetInt("detail", 2);
  71
  72    if (am->ArgMgrDefined("debug"))
  73       gdcm::Debug::DebugOn();
  74
  75    /* if unused Param we give up */
  76    if ( am->ArgMgrPrintUnusedLabels() )
  77    {
  78       am->ArgMgrUsage(usage);
  79       delete am;
  80       return 0;
  81    }
  82
  83    // new gdcm2 style
  84
  85    f = new gdcm::DicomDir();
  86    f->SetFileName ( fileName );
  87    f->Load( );
  88
  89    // Test if the DicomDir is readable
  90    if( !f->IsReadable() )
  91    {
  92       std::cout<<"          DicomDir '"<<fileName
  93                <<"' is not readable"<<std::endl
  94                <<"          ...Failed"<<std::endl;
  95
  96       delete f;
  97       return 1;
  98    }
  99
 100    f->SetPrintLevel(level);
 101
 102    // Test if the DicomDir contains any Patient
 103    pa = f->GetFirstPatient();
 104    if ( pa == 0)
 105    {
 106       std::cout<<"          DicomDir '"<<fileName
 107                <<" has no patient"<<std::endl
 108                <<"          ...Failed"<<std::endl;
 109
 110       delete f;
 111       return 1;
 112    }
 113
 114 // Structure use Examples
 115
 116    switch (detailLevel)
 117   {
 118   case 1:
 119      std::cout << std::endl << std::endl
 120        << " =  PATIENT List =========================================="
 121        << std::endl<< std::endl;
 122
 123       pa = f->GetFirstPatient();
 124       while (pa)
 125       {
 126          std::cout << "Pat.Name:[" << pa->GetEntryValue(0x0010, 0x0010) <<"]"; // Patient's Name
 127          std::cout << " Pat.ID:[";
 128          std::cout << pa->GetEntryValue(0x0010, 0x0020) << "]" << std::endl; // Patient ID
 129          pa = f->GetNextPatient();
 130       }
 131       break;
 132
 133    case 2:
 134       std::cout << std::endl << std::endl
 135         << " = PATIENT/STUDY List ======================================="
 136         << std::endl<< std::endl;
 137
 138       pa = f->GetFirstPatient();
 139       while ( pa ) // on degouline les PATIENT de ce DICOMDIR
 140       {
 141          std::cout << "Pat.Name:[" << pa->GetEntryValue(0x0010, 0x0010) <<"]"; // Patient's Name
 142          std::cout << " Pat.ID:[";
 143          std::cout << pa->GetEntryValue(0x0010, 0x0020) << "]" << std::endl; // Patient ID
 144          st = pa->GetFirstStudy();
 145          while ( st ) { // on degouline les STUDY de ce patient
 146             std::cout << "--- Stud.descr:["    << st->GetEntryValue(0x0008, 0x1030) << "]"; // Study Description
 147             std::cout << " Stud.ID:["          << st->GetEntryValue(0x0020, 0x0010) << "]"; // Study ID
 148             std::cout << std::endl;
 149             st = pa->GetNextStudy();
 150          }
 151          pa = f->GetNextPatient();
 152       }
 153       break;
 154
 155    case 3:
 156       std::cout << std::endl << std::endl
 157         << " =  PATIENT/STUDY/SERIE List =================================="
 158         << std::endl<< std::endl;
 159
 160       pa = f->GetFirstPatient();
 161       while ( pa )   // on degouline les PATIENT de ce DICOMDIR
 162       {
 163        // Patient's Name, Patient ID
 164          std::cout << "Pat.Name:[" << pa->GetEntryValue(0x0010, 0x0010) <<"]"; // Patient's Name
 165          std::cout << " Pat.ID:[";
 166          std::cout << pa->GetEntryValue(0x0010, 0x0020) << "]" << std::endl; // Patient ID
 167
 168          st = pa->GetFirstStudy();
 169          while ( st ) { // on degouline les STUDY de ce patient
 170             std::cout << "--- Stud.descr:["    << st->GetEntryValue(0x0008, 0x1030) << "]"; // Study Description
 171             std::cout << " Stud.ID:["          << st->GetEntryValue(0x0020, 0x0010) << "]"; // Study ID
 172             std::cout << std::endl;
 173
 174             se = st->GetFirstSerie();
 175             while ( se ) { // on degouline les SERIES de cette study
 176                std::cout << "--- --- Ser.Descr:["<< se->GetEntryValue(0x0008, 0x103e)<< "]";  // Series Description
 177                std::cout << " Ser.nb:["          << se->GetEntryValue(0x0020, 0x0011);        // Series number
 178                std::cout << "] Mod.:["           << se->GetEntryValue(0x0008, 0x0060) << "]"; // Modality
 179                std::cout << std::endl;
 180                se = st->GetNextSerie();
 181             }
 182
 183             vs = st->GetFirstVisit();
 184             while ( vs ) { // on degouline les VISIT de cette study
 185                std::cout << "--- --- VISIT: ";
 186                std::cout << " Ref. File ID :[" << vs->GetEntryValue(0x0004, 0x1500) << "]"; // Referenced File ID
 187                std::cout << " Inst.Name:["    << vs->GetEntryValue(0x0008,0x0080)   << "]"; // Institution Name
 188                std::cout << " Adm.ID:["      << vs->GetEntryValue(0x0038, 0x0010)   << "]"; // Admission ID
 189                std::cout << " Adm. date:["   << vs->GetEntryValue(0x0038, 0x0020)   << "]"; // Admitting Date
 190                std::cout << std::endl;
 191                vs = st->GetNextVisit();
 192             }
 193
 194             st = pa->GetNextStudy();
 195          }
 196          pa = f->GetNextPatient();
 197       }
 198       break;
 199
 200    case 4:
 201       std::cout << std::endl << std::endl
 202            << " = PATIENT/STUDY/SERIE/IMAGE List ============================"
 203            << std::endl<< std::endl;
 204
 205       pa = f->GetFirstPatient();
 206       while ( pa ) {  // les PATIENT de ce DICOMDIR
 207        // Patient's Name, Patient ID
 208          std::cout << "Pat.Name:[" << pa->GetEntryValue(0x0010, 0x0010) <<"]"; // Patient's Name
 209          std::cout << " Pat.ID:[";
 210          std::cout << pa->GetEntryValue(0x0010, 0x0020) << "]" << std::endl; // Patient ID
 211
 212          st = pa->GetFirstStudy();
 213          while ( st ) { // on degouline les STUDY de ce patient
 214             std::cout << "--- Stud.descr:["    << st->GetEntryValue(0x0008, 0x1030) << "]"; // Study Description
 215             std::cout << " Stud.ID:["          << st->GetEntryValue(0x0020, 0x0010) << "]"; // Study ID
 216             std::cout << std::endl;
 217
 218             vs = st->GetFirstVisit();
 219             while ( vs ) { // on degouline les VISIT de cette study
 220                std::cout << "--- --- VISIT: ";
 221                std::cout << " Ref. File ID :[" << vs->GetEntryValue(0x0004, 0x1500) << "]"; // Referenced File ID
 222                std::cout << " Inst.Name:["    << vs->GetEntryValue(0x0008,0x0080)   << "]"; // Institution Name
 223                std::cout << " Adm.ID:["      << vs->GetEntryValue(0x0038, 0x0010)   << "]"; // Admission ID
 224                std::cout << " Adm. date:["   << vs->GetEntryValue(0x0038, 0x0020)   << "]"; // Admitting Date
 225                std::cout << std::endl;
 226                vs = st->GetNextVisit();
 227             }
 228
 229             se = st->GetFirstSerie();
 230             while ( se ) { // on degouline les SERIES de cette study
 231                std::cout << "--- --- Ser.Descr:["<< se->GetEntryValue(0x0008, 0x103e)<< "]";  // Series Description
 232                std::cout << " Ser.nb:["         <<  se->GetEntryValue(0x0020, 0x0011);        // Series number
 233                std::cout << "] Mod.:["          <<  se->GetEntryValue(0x0008, 0x0060) << "]"; // Modality
 234                std::cout << std::endl;
 235
 236                im = se->GetFirstImage();
 237                while ( im ) { // on degouline les Images de cette serie
 238                   std::cout << "--- --- --- "<< " IMAGE Ref. File ID :[" << im->GetEntryValue(0x0004, 0x1500)
 239                             << "]" << std::endl; // File name (Referenced File ID)
 240                   im = se->GetNextImage();
 241                }
 242                se = st->GetNextSerie();
 243            }
 244             st = pa->GetNextStudy();
 245         }
 246         pa = f->GetNextPatient();
 247       }
 248       break;
 249
 250    case 5:
 251       std::cout << std::endl << std::endl
 252            << " = DICOMDIR full content =========================================="
 253            << std::endl<< std::endl;
 254       f->Print();
 255       break;
 256
 257    }  // end switch
 258
 259
 260  /*
 261    // Previous code.
 262    // Kept as an example. Please don't remove
 263
 264    gdcm::ListDicomDirPatient::const_iterator  itPatient;
 265    gdcm::ListDicomDirStudy::const_iterator    itStudy;
 266    gdcm::ListDicomDirSerie::const_iterator    itSerie;
 267    gdcm::ListDicomDirImage::const_iterator    itImage;
 268    cout << std::endl << std::endl
 269         << " = Liste des PATIENT/STUDY/SERIE/IMAGE ==================================="
 270         << std::endl<< std::endl;
 271
 272    itPatient = f->GetDicomDirPatients().begin();
 273    while ( itPatient != f->GetDicomDirPatients().end() ) {  // on degouline les PATIENT de ce DICOMDIR
 274       std::cout << (*itPatient)->GetEntryValue(0x0010, 0x0010) << std::endl; // Patient's Name
 275       itStudy = ((*itPatient)->GetDicomDirStudies()).begin();
 276       while (itStudy != (*itPatient)->GetDicomDirStudies().end() ) { // on degouline les STUDY de ce patient
 277          std::cout << "--- "<< (*itStudy)->GetEntryValue(0x0008, 0x1030) << std::endl; // Study Description
 278          itSerie = ((*itStudy)->GetDicomDirSeries()).begin();
 279          while (itSerie != (*itStudy)->GetDicomDirSeries().end() ) { // on degouline les SERIES de cette study
 280             std::cout << "--- --- "<< (*itSerie)->GetEntryValue(0x0008, 0x103e) << std::endl; // Serie Description
 281             itImage = ((*itSerie)->GetDicomDirImages()).begin();
 282             while (itImage != (*itSerie)->GetDicomDirImages().end() ) { // on degouline les IMAGES de cette serie
 283                std::cout << "--- --- --- "<< (*itImage)->GetEntryValue(0x0004, 0x1500) << std::endl; // File name
 284                ++itImage;
 285             }
 286             ++itSerie;
 287          }
 288          ++itStudy;
 289       }
 290       itPatient ++;
 291    }
 292  */
 293
 294
 295    if(f->IsReadable())
 296       std::cout <<std::endl<<fileName<<" is Readable"<<std::endl;
 297    else
 298       std::cout <<std::endl<<fileName<<" is NOT Readable"<<std::endl;
 299    std::cout<<std::flush;
 300    delete f;
 301
 302    return(0);
 303 }