Example/PrintDicomDir.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: PrintDicomDir.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2005/10/18 08:35:43 $
   7   Version:   $Revision: 1.29 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18 #include "gdcmDocument.h"
  19 #include "gdcmDicomDir.h"
  20 #include "gdcmDicomDirPatient.h"
  21 #include "gdcmDicomDirStudy.h"
  22 #include "gdcmDicomDirVisit.h"
  23 #include "gdcmDicomDirSerie.h"
  24 #include "gdcmDicomDirImage.h"
  25 #include "gdcmTS.h"
  26 #include "gdcmDebug.h"
  27
  28 #include "gdcmArgMgr.h"
  29
  30 #include <fstream>
  31 #include <iostream>
  32
  33 int main(int argc, char* argv[])
  34 {
  35    START_USAGE(usage)
  36    " \n PrintDicomDir :\n",
  37    " Display the tree-like structure of a DICOMDIR File",
  38    " usage: PrintDicomDir filein=fileName [level=n] [debug] ",
  39    "        detail = 1 : Patients, 2 : Studies, 3 : Series, 4 : Images ",
  40    "                 5 : Full Content ",
  41    "        level = 0,1,2 : depending on user (what he wants to see)",
  42    "        debug    : user wants to run the program in 'debug mode' ",
  43    FINISH_USAGE
  44
  45    // Initialize Arguments Manager
  46    gdcm::ArgMgr *am= new gdcm::ArgMgr(argc, argv);
  47
  48    if (argc == 1 || am->ArgMgrDefined("usage") )
  49    {
  50       am->ArgMgrUsage(usage); // Display 'usage'
  51       delete am;
  52       return 0;
  53    }
  54
  55    gdcm::DicomDir *f;
  56    gdcm::TSKey v;
  57
  58    gdcm::DicomDirPatient *pa;
  59    gdcm::DicomDirStudy *st;
  60    gdcm::DicomDirSerie *se;
  61    gdcm::DicomDirVisit *vs;
  62    gdcm::DicomDirImage *im;
  63
  64    char *fileName;
  65    fileName  = am->ArgMgrWantString("filein",usage);
  66
  67    int level  = am->ArgMgrGetInt("level", 2);
  68
  69    int detailLevel = am->ArgMgrGetInt("detail", 2);
  70
  71    if (am->ArgMgrDefined("debug"))
  72       gdcm::Debug::DebugOn();
  73
  74    /* if unused Param we give up */
  75    if ( am->ArgMgrPrintUnusedLabels() )
  76    {
  77       am->ArgMgrUsage(usage);
  78       delete am;
  79       return 0;
  80    }
  81
  82    // new gdcm2 style
  83
  84    f = new gdcm::DicomDir();
  85    f->SetFileName ( fileName );
  86    f->Load( );
  87
  88    // Test if the DicomDir is readable
  89    if( !f->IsReadable() )
  90    {
  91       std::cout<<"          DicomDir '"<<fileName
  92                <<"' is not readable"<<std::endl
  93                <<"          ...Failed"<<std::endl;
  94
  95       delete f;
  96       return 1;
  97    }
  98
  99    f->SetPrintLevel(level);
 100
 101    // Test if the DicomDir contains any Patient
 102    pa = f->GetFirstPatient();
 103    if ( pa == 0)
 104    {
 105       std::cout<<"          DicomDir '"<<fileName
 106                <<" has no patient"<<std::endl
 107                <<"          ...Failed"<<std::endl;
 108
 109       delete f;
 110       return 1;
 111    }
 112
 113 // Structure use Examples
 114
 115    switch (detailLevel)
 116   {
 117   case 1:
 118      std::cout << std::endl << std::endl
 119        << " =  PATIENT List =========================================="
 120        << std::endl<< std::endl;
 121
 122       pa = f->GetFirstPatient();
 123       while (pa)
 124       {
 125          std::cout << "Pat.Name:[" << pa->GetEntryString(0x0010, 0x0010) <<"]"; // Patient's Name
 126          std::cout << " Pat.ID:[";
 127          std::cout << pa->GetEntryString(0x0010, 0x0020) << "]" << std::endl; // Patient ID
 128          pa = f->GetNextPatient();
 129       }
 130       break;
 131
 132    case 2:
 133       std::cout << std::endl << std::endl
 134         << " = PATIENT/STUDY List ======================================="
 135         << std::endl<< std::endl;
 136
 137       pa = f->GetFirstPatient();
 138       while ( pa ) // on degouline les PATIENT de ce DICOMDIR
 139       {
 140          std::cout << "Pat.Name:[" << pa->GetEntryString(0x0010, 0x0010) <<"]"; // Patient's Name
 141          std::cout << " Pat.ID:[";
 142          std::cout << pa->GetEntryString(0x0010, 0x0020) << "]" << std::endl; // Patient ID
 143          st = pa->GetFirstStudy();
 144          while ( st ) { // on degouline les STUDY de ce patient
 145             std::cout << "--- Stud.descr:["    << st->GetEntryString(0x0008, 0x1030) << "]"; // Study Description
 146             std::cout << " Stud.ID:["          << st->GetEntryString(0x0020, 0x0010) << "]"; // Study ID
 147             std::cout << std::endl;
 148             st = pa->GetNextStudy();
 149          }
 150          pa = f->GetNextPatient();
 151       }
 152       break;
 153
 154    case 3:
 155       std::cout << std::endl << std::endl
 156         << " =  PATIENT/STUDY/SERIE List =================================="
 157         << std::endl<< std::endl;
 158
 159       pa = f->GetFirstPatient();
 160       while ( pa )   // on degouline les PATIENT de ce DICOMDIR
 161       {
 162        // Patient's Name, Patient ID
 163          std::cout << "Pat.Name:[" << pa->GetEntryString(0x0010, 0x0010) <<"]"; // Patient's Name
 164          std::cout << " Pat.ID:[";
 165          std::cout << pa->GetEntryString(0x0010, 0x0020) << "]" << std::endl; // Patient ID
 166
 167          st = pa->GetFirstStudy();
 168          while ( st ) { // on degouline les STUDY de ce patient
 169             std::cout << "--- Stud.descr:["    << st->GetEntryString(0x0008, 0x1030) << "]"; // Study Description
 170             std::cout << " Stud.ID:["          << st->GetEntryString(0x0020, 0x0010) << "]"; // Study ID
 171             std::cout << std::endl;
 172
 173             se = st->GetFirstSerie();
 174             while ( se ) { // on degouline les SERIES de cette study
 175                std::cout << "--- --- Ser.Descr:["<< se->GetEntryString(0x0008, 0x103e)<< "]";  // Series Description
 176                std::cout << " Ser.nb:["          << se->GetEntryString(0x0020, 0x0011);        // Series number
 177                std::cout << "] Mod.:["           << se->GetEntryString(0x0008, 0x0060) << "]"; // Modality
 178                std::cout << std::endl;
 179                se = st->GetNextSerie();
 180             }
 181
 182             vs = st->GetFirstVisit();
 183             while ( vs ) { // on degouline les VISIT de cette study
 184                std::cout << "--- --- VISIT: ";
 185                std::cout << " Ref. File ID :[" << vs->GetEntryString(0x0004, 0x1500) << "]"; // Referenced File ID
 186                std::cout << " Inst.Name:["    << vs->GetEntryString(0x0008,0x0080)   << "]"; // Institution Name
 187                std::cout << " Adm.ID:["      << vs->GetEntryString(0x0038, 0x0010)   << "]"; // Admission ID
 188                std::cout << " Adm. date:["   << vs->GetEntryString(0x0038, 0x0020)   << "]"; // Admitting Date
 189                std::cout << std::endl;
 190                vs = st->GetNextVisit();
 191             }
 192
 193             st = pa->GetNextStudy();
 194          }
 195          pa = f->GetNextPatient();
 196       }
 197       break;
 198
 199    case 4:
 200       std::cout << std::endl << std::endl
 201            << " = PATIENT/STUDY/SERIE/IMAGE List ============================"
 202            << std::endl<< std::endl;
 203
 204       pa = f->GetFirstPatient();
 205       while ( pa ) {  // les PATIENT de ce DICOMDIR
 206        // Patient's Name, Patient ID
 207          std::cout << "Pat.Name:[" << pa->GetEntryString(0x0010, 0x0010) <<"]"; // Patient's Name
 208          std::cout << " Pat.ID:[";
 209          std::cout << pa->GetEntryString(0x0010, 0x0020) << "]" << std::endl; // Patient ID
 210
 211          st = pa->GetFirstStudy();
 212          while ( st ) { // on degouline les STUDY de ce patient
 213             std::cout << "--- Stud.descr:["    << st->GetEntryString(0x0008, 0x1030) << "]"; // Study Description
 214             std::cout << " Stud.ID:["          << st->GetEntryString(0x0020, 0x0010) << "]"; // Study ID
 215             std::cout << std::endl;
 216
 217             vs = st->GetFirstVisit();
 218             while ( vs ) { // on degouline les VISIT de cette study
 219                std::cout << "--- --- VISIT: ";
 220                std::cout << " Ref. File ID :[" << vs->GetEntryString(0x0004, 0x1500) << "]"; // Referenced File ID
 221                std::cout << " Inst.Name:["    << vs->GetEntryString(0x0008,0x0080)   << "]"; // Institution Name
 222                std::cout << " Adm.ID:["      << vs->GetEntryString(0x0038, 0x0010)   << "]"; // Admission ID
 223                std::cout << " Adm. date:["   << vs->GetEntryString(0x0038, 0x0020)   << "]"; // Admitting Date
 224                std::cout << std::endl;
 225                vs = st->GetNextVisit();
 226             }
 227
 228             se = st->GetFirstSerie();
 229             while ( se ) { // on degouline les SERIES de cette study
 230                std::cout << "--- --- Ser.Descr:["<< se->GetEntryString(0x0008, 0x103e)<< "]";  // Series Description
 231                std::cout << " Ser.nb:["         <<  se->GetEntryString(0x0020, 0x0011);        // Series number
 232                std::cout << "] Mod.:["          <<  se->GetEntryString(0x0008, 0x0060) << "]"; // Modality
 233                std::cout << std::endl;
 234
 235                im = se->GetFirstImage();
 236                while ( im ) { // on degouline les Images de cette serie
 237                   std::cout << "--- --- --- "<< " IMAGE Ref. File ID :[" << im->GetEntryString(0x0004, 0x1500)
 238                             << "]" << std::endl; // File name (Referenced File ID)
 239                   im = se->GetNextImage();
 240                }
 241                se = st->GetNextSerie();
 242            }
 243             st = pa->GetNextStudy();
 244         }
 245         pa = f->GetNextPatient();
 246       }
 247       break;
 248
 249    case 5:
 250       std::cout << std::endl << std::endl
 251            << " = DICOMDIR full content =========================================="
 252            << std::endl<< std::endl;
 253       f->Print();
 254       break;
 255
 256    }  // end switch
 257
 258
 259  /*
 260    // Previous code.
 261    // Kept as an example. Please don't remove
 262
 263    gdcm::ListDicomDirPatient::const_iterator  itPatient;
 264    gdcm::ListDicomDirStudy::const_iterator    itStudy;
 265    gdcm::ListDicomDirSerie::const_iterator    itSerie;
 266    gdcm::ListDicomDirImage::const_iterator    itImage;
 267    cout << std::endl << std::endl
 268         << " = Liste des PATIENT/STUDY/SERIE/IMAGE ==================================="
 269         << std::endl<< std::endl;
 270
 271    itPatient = f->GetDicomDirPatients().begin();
 272    while ( itPatient != f->GetDicomDirPatients().end() ) {  // on degouline les PATIENT de ce DICOMDIR
 273       std::cout << (*itPatient)->GetEntryString(0x0010, 0x0010) << std::endl; // Patient's Name
 274       itStudy = ((*itPatient)->GetDicomDirStudies()).begin();
 275       while (itStudy != (*itPatient)->GetDicomDirStudies().end() ) { // on degouline les STUDY de ce patient
 276          std::cout << "--- "<< (*itStudy)->GetEntryString(0x0008, 0x1030) << std::endl; // Study Description
 277          itSerie = ((*itStudy)->GetDicomDirSeries()).begin();
 278          while (itSerie != (*itStudy)->GetDicomDirSeries().end() ) { // on degouline les SERIES de cette study
 279             std::cout << "--- --- "<< (*itSerie)->GetEntryString(0x0008, 0x103e) << std::endl; // Serie Description
 280             itImage = ((*itSerie)->GetDicomDirImages()).begin();
 281             while (itImage != (*itSerie)->GetDicomDirImages().end() ) { // on degouline les IMAGES de cette serie
 282                std::cout << "--- --- --- "<< (*itImage)->GetEntryString(0x0004, 0x1500) << std::endl; // File name
 283                ++itImage;
 284             }
 285             ++itSerie;
 286          }
 287          ++itStudy;
 288       }
 289       itPatient ++;
 290    }
 291  */
 292
 293
 294    if(f->IsReadable())
 295       std::cout <<std::endl<<fileName<<" is Readable"<<std::endl;
 296    else
 297       std::cout <<std::endl<<fileName<<" is NOT Readable"<<std::endl;
 298    std::cout<<std::flush;
 299    delete f;
 300
 301    return(0);
 302 }