Example/PrintDicomDir.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: PrintDicomDir.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2006/07/17 13:27:04 $
   7   Version:   $Revision: 1.33 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18 #include "gdcmDocument.h"
  19 #include "gdcmDicomDir.h"
  20 #include "gdcmDicomDirPatient.h"
  21 #include "gdcmDicomDirStudy.h"
  22 #include "gdcmDicomDirVisit.h"
  23 #include "gdcmDicomDirSerie.h"
  24 #include "gdcmDicomDirImage.h"
  25 #include "gdcmTS.h"
  26 #include "gdcmDebug.h"
  27
  28 #include "gdcmArgMgr.h"
  29
  30 #include <fstream>
  31 #include <iostream>
  32
  33 int main(int argc, char* argv[])
  34 {
  35    START_USAGE(usage)
  36    " \n PrintDicomDir :\n",
  37    " Display the tree-like structure of a DICOMDIR File",
  38    " usage: PrintDicomDir filein=fileName [level=n][detail=m][debug]   ",
  39    "        detail = 1 : Patients, 2 : Studies, 3 : Series, 4 : Images ",
  40    "                 5 : Full Content ",
  41    "        level = 0,1,2 : depending on user (what he wants to see)",
  42    "        debug    : user wants to run the program in 'debug mode' ",
  43    FINISH_USAGE
  44
  45    // Initialize Arguments Manager
  46    gdcm::ArgMgr *am= new gdcm::ArgMgr(argc, argv);
  47
  48    if (argc == 1 || am->ArgMgrDefined("usage") )
  49    {
  50       am->ArgMgrUsage(usage); // Display 'usage'
  51       delete am;
  52       return 0;
  53    }
  54
  55    gdcm::DicomDir *f;
  56    gdcm::TSKey v;
  57
  58    gdcm::DicomDirPatient *pa;
  59    gdcm::DicomDirStudy *st;
  60    gdcm::DicomDirSerie *se;
  61    gdcm::DicomDirVisit *vs;
  62    gdcm::DicomDirImage *im;
  63
  64    char *fileName;
  65    fileName  = am->ArgMgrWantString("filein",usage);
  66
  67    int level  = am->ArgMgrGetInt("level", 2);
  68
  69    int detailLevel = am->ArgMgrGetInt("detail", 2);
  70
  71    if (am->ArgMgrDefined("debug"))
  72       gdcm::Debug::DebugOn();
  73
  74    /* if unused Param we give up */
  75    if ( am->ArgMgrPrintUnusedLabels() )
  76    {
  77       am->ArgMgrUsage(usage);
  78       delete am;
  79       return 0;
  80    }
  81
  82    // new gdcm2 style
  83
  84    f = gdcm::DicomDir::New();
  85    f->SetFileName ( fileName );
  86    f->Load( );
  87
  88    // Test if the DicomDir is readable
  89    if( !f->IsReadable() )
  90    {
  91       std::cout<<"          DicomDir '"<<fileName
  92                <<"' is not readable"<<std::endl
  93                <<"          ...Failed"<<std::endl;
  94
  95       f->Delete();
  96       return 1;
  97    }
  98
  99    f->SetPrintLevel(level);
 100
 101    // Test if the DicomDir contains any Patient
 102    pa = f->GetFirstPatient();
 103    if ( pa == 0)
 104    {
 105       std::cout<<"          DicomDir '"<<fileName
 106                <<" has no patient"<<std::endl
 107                <<"          ...Failed"<<std::endl;
 108
 109       f->Delete();
 110       return 1;
 111    }
 112
 113 // Structure use Examples
 114
 115    switch (detailLevel)
 116    {
 117       case 1:
 118          std::cout << std::endl << std::endl
 119          << " =  PATIENT List =========================================="
 120          << std::endl<< std::endl;
 121
 122          pa = f->GetFirstPatient();
 123          while (pa)
 124          {
 125             std::cout << "Pat.Name:[" << pa->GetEntryString(0x0010, 0x0010) <<"]"; // Patient's Name
 126             std::cout << " Pat.ID:[";
 127             std::cout << pa->GetEntryString(0x0010, 0x0020) << "]" << std::endl; // Patient ID
 128             pa = f->GetNextPatient();
 129          }
 130          break;
 131
 132       case 2:
 133          std::cout << std::endl << std::endl
 134          << " = PATIENT/STUDY List ======================================="
 135          << std::endl<< std::endl;
 136
 137          pa = f->GetFirstPatient();
 138          while ( pa ) // on degouline les PATIENT de ce DICOMDIR
 139          {
 140             std::cout << "Pat.Name:[" << pa->GetEntryString(0x0010, 0x0010) <<"]"; // Patient's Name
 141             std::cout << " Pat.ID:[";
 142             std::cout << pa->GetEntryString(0x0010, 0x0020) << "]" << std::endl; // Patient ID
 143             st = pa->GetFirstStudy();
 144             while ( st )
 145             { // on degouline les STUDY de ce patient
 146                std::cout << "--- Stud.descr:["    << st->GetEntryString(0x0008, 0x1030) << "]"; // Study Description
 147                std::cout << " Stud.ID:["          << st->GetEntryString(0x0020, 0x0010) << "]"; // Study ID
 148                std::cout << " Stud.Inst.UID:["    << st->GetEntryString(0x0020, 0x000d) << "]"; // Study Instance UID
 149                std::cout << std::endl;
 150                st = pa->GetNextStudy();
 151             }
 152             pa = f->GetNextPatient();
 153          }
 154          break;
 155
 156       case 3:
 157          std::cout << std::endl << std::endl
 158          << " =  PATIENT/STUDY/SERIE List =================================="
 159          << std::endl<< std::endl;
 160
 161          pa = f->GetFirstPatient();
 162          while ( pa )   // on degouline les PATIENT de ce DICOMDIR
 163          {
 164             // Patient's Name, Patient ID
 165             std::cout << "Pat.Name:[" << pa->GetEntryString(0x0010, 0x0010) <<"]"; // Patient's Name
 166             std::cout << " Pat.ID:[";
 167             std::cout << pa->GetEntryString(0x0010, 0x0020) << "]" << std::endl; // Patient ID
 168
 169             st = pa->GetFirstStudy();
 170             while ( st )
 171             { // on degouline les STUDY de ce patient
 172                std::cout << "--- Stud.descr:["    << st->GetEntryString(0x0008, 0x1030) << "]"; // Study Description
 173                std::cout << " Stud.ID:["          << st->GetEntryString(0x0020, 0x0010) << "]"; // Study ID
 174                std::cout << " Stud.Inst.UID:["    << st->GetEntryString(0x0020, 0x000d) << "]"; // Study Instance UID
 175                std::cout << std::endl;
 176
 177                se = st->GetFirstSerie();
 178                while ( se )
 179                { // on degouline les SERIES de cette study
 180                   std::cout << "--- --- Ser.Descr:["<< se->GetEntryString(0x0008, 0x103e)<< "]";  // Series Description
 181                   std::cout << " Ser.nb:["          << se->GetEntryString(0x0020, 0x0011);        // Series number
 182                   std::cout << "] Mod.:["           << se->GetEntryString(0x0008, 0x0060) << "]"; // Modality
 183                   std::cout << " Serie Inst.UID.:[" <<  se->GetEntryString(0x0020, 0x000e) << "]";  // Series Instance UID
 184                   std::cout << std::endl;
 185                   se = st->GetNextSerie();
 186                }
 187
 188                vs = st->GetFirstVisit();
 189                while ( vs )
 190                { // on degouline les VISIT de cette study
 191                   std::cout << "--- --- VISIT: ";
 192                   std::cout << " Ref. File ID :[" << vs->GetEntryString(0x0004, 0x1500) << "]"; // Referenced File ID
 193                   std::cout << " Inst.Name:["    << vs->GetEntryString(0x0008,0x0080)   << "]"; // Institution Name
 194                   std::cout << " Adm.ID:["      << vs->GetEntryString(0x0038, 0x0010)   << "]"; // Admission ID
 195                   std::cout << " Adm. date:["   << vs->GetEntryString(0x0038, 0x0020)   << "]"; // Admitting Date
 196                   std::cout << std::endl;
 197                   vs = st->GetNextVisit();
 198                }
 199
 200                st = pa->GetNextStudy();
 201             }
 202             pa = f->GetNextPatient();
 203          }
 204          break;
 205
 206       case 4:
 207          std::cout << std::endl << std::endl
 208          << " = PATIENT/STUDY/SERIE/IMAGE List ============================"
 209          << std::endl<< std::endl;
 210
 211          pa = f->GetFirstPatient();
 212          while ( pa )
 213          {  // les PATIENT de ce DICOMDIR
 214             // Patient's Name, Patient ID
 215             std::cout << "Pat.Name:[" << pa->GetEntryString(0x0010, 0x0010) <<"]"; // Patient's Name
 216             std::cout << " Pat.ID:[";
 217             std::cout << pa->GetEntryString(0x0010, 0x0020) << "]" << std::endl; // Patient ID
 218
 219             st = pa->GetFirstStudy();
 220             while ( st )
 221             { // on degouline les STUDY de ce patient
 222                std::cout << "--- Stud.descr:["    << st->GetEntryString(0x0008, 0x1030) << "]"; // Study Description
 223                std::cout << " Stud.ID:["          << st->GetEntryString(0x0020, 0x0010) << "]"; // Study ID
 224                std::cout << " Stud.Inst.UID:["    << st->GetEntryString(0x0020, 0x000d) << "]"; // Study Instance UID
 225                std::cout << std::endl;
 226
 227                vs = st->GetFirstVisit();
 228                while ( vs )
 229                { // on degouline les VISIT de cette study
 230                   std::cout << "--- --- VISIT: ";
 231                   std::cout << " Ref. File ID :[" << vs->GetEntryString(0x0004, 0x1500) << "]"; // Referenced File ID
 232                   std::cout << " Inst.Name:["     << vs->GetEntryString(0x0008,0x0080)  << "]"; // Institution Name
 233                   std::cout << " Adm.ID:["        << vs->GetEntryString(0x0038, 0x0010) << "]"; // Admission ID
 234                   std::cout << " Adm. date:["     << vs->GetEntryString(0x0038, 0x0020) << "]"; // Admitting Date
 235                   std::cout << std::endl;
 236                   vs = st->GetNextVisit();
 237                }
 238
 239                se = st->GetFirstSerie();
 240                while ( se )
 241                { // on degouline les SERIES de cette study
 242                   std::cout << "--- --- Ser.Descr:["<< se->GetEntryString(0x0008, 0x103e) << "]";  // Series Description
 243                   std::cout << " Ser.nb:["          <<  se->GetEntryString(0x0020, 0x0011) << "]";  // Series number
 244                   std::cout << " Mod.:["            <<  se->GetEntryString(0x0008, 0x0060) << "]";  // Modality
 245                   std::cout << " Serie Inst.UID.:[" <<  se->GetEntryString(0x0020, 0x000e) << "]";  // Series Instance UID
 246                   std::cout << std::endl;
 247
 248                   im = se->GetFirstImage();
 249                   while ( im )
 250                   { // on degouline les Images de cette serie
 251                      std::cout << "--- --- --- "<< " IMAGE Ref. File ID :[" << im->GetEntryString(0x0004, 0x1500)
 252                                << "]" << std::endl; // File name (Referenced File ID)
 253                      im = se->GetNextImage();
 254                   }
 255                   se = st->GetNextSerie();
 256                }
 257                st = pa->GetNextStudy();
 258             }
 259             pa = f->GetNextPatient();
 260          }
 261          break;
 262
 263       case 5:
 264          std::cout << std::endl << std::endl
 265          << " = DICOMDIR full content =========================================="
 266          << std::endl<< std::endl;
 267          f->Print();
 268          break;
 269
 270    }  // end switch
 271
 272
 273  /*
 274    // Previous code.
 275    // Kept as an example. Please don't remove
 276
 277    gdcm::ListDicomDirPatient::const_iterator  itPatient;
 278    gdcm::ListDicomDirStudy::const_iterator    itStudy;
 279    gdcm::ListDicomDirSerie::const_iterator    itSerie;
 280    gdcm::ListDicomDirImage::const_iterator    itImage;
 281    cout << std::endl << std::endl
 282         << " = Liste des PATIENT/STUDY/SERIE/IMAGE ==================================="
 283         << std::endl<< std::endl;
 284
 285    itPatient = f->GetDicomDirPatients().begin();
 286    while ( itPatient != f->GetDicomDirPatients().end() ) {  // on degouline les PATIENT de ce DICOMDIR
 287       std::cout << (*itPatient)->GetEntryString(0x0010, 0x0010) << std::endl; // Patient's Name
 288       itStudy = ((*itPatient)->GetDicomDirStudies()).begin();
 289       while (itStudy != (*itPatient)->GetDicomDirStudies().end() ) { // on degouline les STUDY de ce patient
 290          std::cout << "--- "<< (*itStudy)->GetEntryString(0x0008, 0x1030) << std::endl; // Study Description
 291          itSerie = ((*itStudy)->GetDicomDirSeries()).begin();
 292          while (itSerie != (*itStudy)->GetDicomDirSeries().end() ) { // on degouline les SERIES de cette study
 293             std::cout << "--- --- "<< (*itSerie)->GetEntryString(0x0008, 0x103e) << std::endl; // Serie Description
 294             itImage = ((*itSerie)->GetDicomDirImages()).begin();
 295             while (itImage != (*itSerie)->GetDicomDirImages().end() ) { // on degouline les IMAGES de cette serie
 296                std::cout << "--- --- --- "<< (*itImage)->GetEntryString(0x0004, 0x1500) << std::endl; // File name
 297                ++itImage;
 298             }
 299             ++itSerie;
 300          }
 301          ++itStudy;
 302       }
 303       itPatient ++;
 304    }
 305  */
 306
 307
 308    if(f->IsReadable())
 309       std::cout <<std::endl<<fileName<<" is Readable"<<std::endl;
 310    else
 311       std::cout <<std::endl<<fileName<<" is NOT Readable"<<std::endl;
 312    std::cout<<std::flush;
 313    f->Delete();
 314
 315    return(0);
 316 }