Example/PrintFile.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: PrintFile.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2010/09/01 14:41:48 $
   7   Version:   $Revision: 1.94 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18 #include "gdcmFile.h"
  19 #include "gdcmDocument.h"
  20 #include "gdcmSeqEntry.h"
  21 #include "gdcmSQItem.h"
  22 #include "gdcmDataEntry.h"
  23
  24 #include "gdcmFileHelper.h"
  25 #include "gdcmDebug.h"
  26 #include "gdcmDirList.h"
  27 #include "gdcmGlobal.h"
  28 #include "gdcmDictSet.h"
  29 #include "gdcmArgMgr.h"
  30 #include "gdcmOrientation.h"
  31 #include <iostream>
  32
  33 /// \todo : code factorization, for 'single file' an 'whole directory' processing
  34
  35 void ShowLutData(GDCM_NAME_SPACE::File *f);
  36
  37      // Nothing is written yet to get LUT Data user friendly
  38      // The following is to be moved into a PixelReadConvert method
  39      // Let here, waiting for a clever idea on the way to do it.
  40
  41 void ShowLutData(GDCM_NAME_SPACE::File *f)
  42 {
  43    GDCM_NAME_SPACE::SeqEntry *modLutSeq = f->GetSeqEntry(0x0028,0x3000);
  44    if ( modLutSeq !=0 )
  45    {
  46       GDCM_NAME_SPACE::SQItem *sqi= modLutSeq->GetFirstSQItem();
  47       if ( sqi != 0 )
  48       {
  49          std::string lutDescriptor = sqi->GetEntryString(0x0028,0x3002);
  50          if (   /*lutDescriptor   == GDCM_UNFOUND*/ 0 )
  51          {
  52             std::cout << "LUT Descriptor is missing" << std::endl;
  53             return;
  54          }
  55          int length;   // LUT length in Bytes
  56          int deb;      // Subscript of the first Lut Value
  57          int nbits;    // Lut item size (in Bits)
  58
  59          int nbRead;    // nb of items in LUT descriptor (must be = 3)
  60
  61          nbRead = sscanf( lutDescriptor.c_str(),
  62                            "%d\\%d\\%d",
  63                               &length, &deb, &nbits );
  64          std::cout << "length " << length
  65                   << " deb " << deb
  66                   << " nbits " << nbits
  67                   << std::endl;
  68          if ( nbRead != 3 )
  69          {
  70             std::cout << "Wrong LUT descriptor" << std::endl;
  71          }
  72          //LUT Data (CTX dependent)
  73          GDCM_NAME_SPACE::DataEntry *b = sqi->GetDataEntry(0x0028,0x3006);
  74          if ( b != 0 )
  75          {
  76             int BitsAllocated = f->GetBitsAllocated();
  77             if ( BitsAllocated <= 8 )
  78             {
  79                int mult;
  80                if ( ( nbits == 16 ) && ( BitsAllocated == 8 ) )
  81                {
  82                // when LUT item size is different than pixel size
  83                   mult = 2; // high byte must be = low byte
  84                }
  85                else
  86                {
  87                // See PS 3.3-2003 C.11.1.1.2 p 619
  88                   mult = 1;
  89                }
  90                uint8_t *lut = b->GetBinArea();
  91                for( int i=0; i < length; ++i )
  92                {
  93                   std::cout << i+deb << " : \t"
  94                               << (int) (lut[i*mult + 1]) << std::endl;
  95                }
  96             }
  97             else
  98             {
  99                uint16_t *lut = (uint16_t *)(b->GetBinArea());
 100                for( int i=0; i < length; ++i )
 101                {
 102                   std::cout << i+deb << " : \t"
 103                               << (int) (((uint16_t *)lut)[i])
 104                               << std::endl;
 105                }
 106             }
 107          }
 108          else
 109             std::cout << "No LUT Data DataEntry (0x0028,0x3006) found?!? "
 110                         << std::endl;
 111       }
 112       else
 113          std::cout << "No First SQ Item within (0x0028,0x3000) ?!? "
 114                      << std::endl;
 115    }
 116    else
 117       std::cout << "No LUT Data SeqEntry (0x0028,0x3000) found "
 118                   << std::endl;
 119 }
 120
 121 int main(int argc, char *argv[])
 122 {
 123
 124    START_USAGE(usage)
 125    " \n PrintFile : \n                                                        ",
 126    " Display the header of a ACR-NEMA/PAPYRUS/DICOM File                      ",
 127    " usage: PrintFile {filein=inputFileName|dirin=inputDirectoryName}[level=n]",
 128    "                       [forceload=listOfElementsToForceLoad] [rec] [noex] ",
 129    "                       [4DLoc= ][dict= privateDirectory]                  ",
 130    "                       [ { [noshadowseq] | [noshadow][noseq] } ] [load]   ",
 131    "                       [debug] [warning]                                  ",
 132    "      level = 0,1,2 : depending on the amount of details user wants to see",
 133    "      rec : user wants to parse recursively the directory                 ",
 134    "      load : user wants to load the pixels, as well (to see warning info) ",
 135    "      noex : user doesn't want extra 'user friendly' info                 ",
 136    "      4DLoc: group-elem(in hexa, no space) of the DataEntry holdind 4thDim",
 137    "      listOfElementsToForceLoad : group-elem,g2-e2,... (in hexa, no space)",
 138    "                                of Elements to load whatever their length ",
 139    "      privateDirectory : source file full path name of Shadow Group elems ",
 140    "      noshadowseq: user doesn't want to load Private Sequences            ",
 141    "      noshadow   : user doesn't want to load Private groups (odd number)  ",
 142    "      noseq      : user doesn't want to load Sequences                    ",
 143    "      debug      : user wants to run the program in 'debug mode'          ",
 144    "      warning    : user wants to be warned about any oddity in the File   ",
 145    "      showlut :user wants to display the Palette Color (as an int array)  ",
 146    FINISH_USAGE
 147
 148    // Initialize Arguments Manager
 149    GDCM_NAME_SPACE::ArgMgr *am= new GDCM_NAME_SPACE::ArgMgr(argc, argv);
 150
 151    if (argc == 1 || am->ArgMgrDefined("usage") )
 152    {
 153       am->ArgMgrUsage(usage); // Display 'usage'
 154       delete am;
 155       return 1;
 156    }
 157
 158    const char *fileName = am->ArgMgrGetString("filein");
 159    const char *dirName  = am->ArgMgrGetString("dirin");
 160
 161    if ( (fileName == 0 && dirName == 0) ||
 162         (fileName != 0 && dirName != 0) )
 163    {
 164       std::cerr << std::endl
 165         << "Either 'filein=' or 'dirin=' must be present;"
 166         << std::endl << "Not both" << std::endl;
 167       am->ArgMgrUsage(usage); // Display 'usage'
 168       delete am;
 169       return 1;
 170    }
 171
 172    bool noex = ( 0 != am->ArgMgrDefined("noex") );
 173    bool rec  = ( 0 != am->ArgMgrDefined("rec") );
 174
 175    if (am->ArgMgrDefined("debug"))
 176       GDCM_NAME_SPACE::Debug::DebugOn();
 177
 178    if (am->ArgMgrDefined("warning"))
 179       GDCM_NAME_SPACE::Debug::WarningOn();
 180
 181    int loadMode = GDCM_NAME_SPACE::LD_ALL;
 182    if ( am->ArgMgrDefined("noshadowseq") )
 183       loadMode |= GDCM_NAME_SPACE::LD_NOSHADOWSEQ;
 184    else
 185    {
 186       if ( am->ArgMgrDefined("noshadow") )
 187          loadMode |= GDCM_NAME_SPACE::LD_NOSHADOW;
 188       if ( am->ArgMgrDefined("noseq") )
 189          loadMode |= GDCM_NAME_SPACE::LD_NOSEQ;
 190    }
 191
 192    int level = am->ArgMgrGetInt("level", 1);
 193
 194    int forceLoadNb;
 195    uint16_t *elemsToForceLoad
 196                            = am->ArgMgrGetXInt16Enum("forceload", &forceLoadNb);
 197
 198    int nbP =0;
 199    uint16_t *FourthDimLoc;
 200    if ( am->ArgMgrDefined("4DLoc") )
 201    {
 202       FourthDimLoc = am->ArgMgrGetXInt16Enum("4DLoc", &nbP);
 203
 204       if (nbP != 1)
 205       {
 206          std::cout << "4DLoc must have 2 and only 2 components!" << std::endl;
 207          delete am;
 208          return 1;
 209       }
 210    }
 211
 212    bool load = ( 0 != am->ArgMgrDefined("load") );
 213
 214    bool showlut = ( 0 != am->ArgMgrDefined("SHOWLUT") );
 215
 216    bool ddict = am->ArgMgrDefined("dict") ? true : false;
 217    const char *dict = 0;
 218
 219    if (ddict)
 220    {
 221      dict = am->ArgMgrGetString("dict",0);
 222    }
 223
 224    /* if unused Param we give up */
 225    if ( am->ArgMgrPrintUnusedLabels() )
 226    {
 227       am->ArgMgrUsage(usage);
 228       delete am;
 229       return 1;
 230    }
 231
 232    delete am;  // we don't need Argument Manager any longer
 233
 234    // ----------- End Arguments Manager ---------
 235
 236
 237    if (ddict)
 238    {
 239       GDCM_NAME_SPACE::Global::GetDicts()->GetDefaultPubDict()->AddDict(dict);
 240    }
 241
 242    if ( fileName != 0 ) // ====== Deal with a single file ======
 243    {
 244       GDCM_NAME_SPACE::File *f = GDCM_NAME_SPACE::File::New();
 245       f->SetLoadMode(loadMode);
 246       f->SetFileName( fileName );
 247       f->SetMaxSizeLoadEntry(0xffff);
 248
 249       for (int ri=0; ri<forceLoadNb; ri++)
 250       {
 251          f->AddForceLoadElement((uint32_t)elemsToForceLoad[2*ri],
 252                                 (uint32_t)elemsToForceLoad[2*ri+1] );
 253       }
 254
 255 // TODO : find why such a polution
 256 // To avoid polluting the output with messages
 257 // 'Last system error was : No such file or directory'
 258
 259 errno = 0;
 260
 261
 262       bool res = false;
 263       try
 264         {
 265         res = f->Load();
 266         }
 267       catch(std::exception &ex)
 268         {
 269         std::cerr << "sorry an exception was thrown: " << ex.what() << std::endl;
 270         }
 271       // GDCM_NAME_SPACE::File::IsReadable() is no usable here, because we deal with
 272       // any kind of gdcm-Parsable *document*
 273       // not only GDCM_NAME_SPACE::File (as opposed to GDCM_NAME_SPACE::DicomDir)
 274       if ( !res )
 275       {
 276          std::cout << "Cannot process file [" << fileName << "]" << std::endl;
 277          std::cout << "Either it doesn't exist, or it's read protected "
 278                    << std::endl;
 279          std::cout << "or it's not a Dicom File, or its 'header' is bugged"
 280                    << std::endl;
 281          std::cout << "use 'PrintFile filein=... debug' to try to guess the pb"
 282                    << std::endl;
 283          f->Delete();
 284          return 0;
 285       }
 286
 287       if (nbP == 1)
 288          f->SetFourthDimensionLocation(FourthDimLoc[0],FourthDimLoc[1]);
 289
 290
 291       GDCM_NAME_SPACE::FileHelper *fh = GDCM_NAME_SPACE::FileHelper::New(f);
 292       fh->SetPrintLevel( level );
 293
 294       fh->Print();
 295
 296       std::cout << "\n\n" << std::endl;
 297
 298       std::cout <<std::endl;
 299       std::cout <<" dataSize    " << fh->GetImageDataSize()    << std::endl;
 300       std::cout <<" dataSizeRaw " << fh->GetImageDataRawSize() << std::endl;
 301 if (!noex)
 302 {
 303       int nX,nY,nZ,nT,sPP,planarConfig;
 304       std::string pixelType;
 305       nX=f->GetXSize();
 306       nY=f->GetYSize();
 307       nZ=f->GetZSize();
 308       nT=f->GetTSize();
 309       std::cout << " DIMX=" << nX << " DIMY=" << nY
 310                 << " DIMZ=" << nZ << " DIMT=" << nT
 311                 << std::endl;
 312
 313       pixelType    = f->GetPixelType();
 314       sPP          = f->GetSamplesPerPixel();
 315       std::cout << " pixelType= ["            << pixelType
 316                 << "] SamplesPerPixel= ["     << sPP
 317                 << "] ";
 318
 319       if (sPP == 3)
 320       {
 321          planarConfig = f->GetPlanarConfiguration();
 322          std::cout << " PlanarConfiguration= [" << planarConfig
 323                 << "] "<< std::endl;
 324       }
 325       std::cout << " PhotometricInterpretation= ["
 326                 << f->GetEntryString(0x0028,0x0004)
 327                 << "] "<< std::endl;
 328
 329       int numberOfScalarComponents=f->GetNumberOfScalarComponents();
 330       std::cout << " NumberOfScalarComponents = " << numberOfScalarComponents
 331                 <<std::endl
 332                 << " LUT = " << (f->HasLUT() ? "TRUE" : "FALSE")
 333                 << std::endl;
 334
 335       if ( f->GetDataEntry(0x0002,0x0010) )
 336          if ( f->GetDataEntry(0x0002,0x0010)->IsNotLoaded() )
 337          {
 338             std::cout << "Transfer Syntax not loaded. " << std::endl
 339                      << "Better you increase MAX_SIZE_LOAD_ELEMENT_VALUE"
 340                   << std::endl;
 341             f->Delete();
 342             return 0;
 343          }
 344
 345       std::string transferSyntaxName = f->GetTransferSyntaxName();
 346       std::cout << " TransferSyntaxName= [" << transferSyntaxName << "]"
 347                 << std::endl;
 348       std::cout << " SwapCode= " << f->GetSwapCode() << std::endl;
 349       std::cout << " ------" << std::endl;
 350
 351
 352       std::cout << "\n\n" << std::endl;
 353       std::cout << "X spacing " << f->GetXSpacing() << std::endl;
 354       std::cout << "Y spacing " << f->GetYSpacing() << std::endl;
 355       std::cout << "Z spacing " << f->GetZSpacing() << std::endl;
 356
 357 //------------------------------
 358
 359       // Let's get and print some usefull fields about 'Orientation'
 360       // ------------------------------------------------------------
 361
 362       std::string strPatientPosition =
 363                                       f->GetEntryString(0x0018,0x5100);
 364       if ( strPatientPosition != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND
 365         && strPatientPosition != "" )
 366             std::cout << "PatientPosition (0x0010,0x5100)= ["
 367                       << strPatientPosition << "]" << std::endl;
 368
 369       std::string strViewPosition =
 370                                       f->GetEntryString(0x0018,0x5101);
 371       if ( strViewPosition != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND
 372         && strViewPosition != "" )
 373             std::cout << "View Position (0x0018,0x5101)= ["
 374                       << strViewPosition << "]" << std::endl;
 375
 376      std::string strPatientOrientation =
 377                                       f->GetEntryString(0x0020,0x0020);
 378       if ( strPatientOrientation != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND
 379         && strPatientOrientation != "")
 380          std::cout << "PatientOrientation (0x0020,0x0020)= ["
 381                    << strPatientOrientation << "]" << std::endl;
 382
 383       std::string strImageOrientationPatient =
 384                                       f->GetEntryString(0x0020,0x0037);
 385       if ( strImageOrientationPatient != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND
 386         && strImageOrientationPatient != "" )
 387          std::cout << "ImageOrientationPatient (0x0020,0x0037)= ["
 388                    << strImageOrientationPatient << "]" << std::endl;
 389
 390       std::string strImageOrientationRET =
 391                                       f->GetEntryString(0x0020,0x0035);
 392       if ( strImageOrientationRET != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND
 393         && strImageOrientationRET != "" )
 394          std::cout << "ImageOrientationRET (0x0020,0x0035)= ["
 395                    << strImageOrientationRET << "]" << std::endl;
 396
 397       std::string strImagePositionPatient =
 398                                       f->GetEntryString(0x0020,0x0032);
 399       if ( strImagePositionPatient != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND
 400         && strImagePositionPatient != "" )
 401          std::cout << "ImagePositionPatient (0x0020,0x0032)= ["
 402                    << strImagePositionPatient << "]" << std::endl;
 403
 404       std::string strImagePositionPatientRET =
 405                                       f->GetEntryString(0x0020,0x0030);
 406       if ( strImagePositionPatientRET != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND
 407         && strImagePositionPatientRET != "" )
 408          std::cout << "ImagePositionPatientRET (0x0020,0x0030)= ["
 409                    << strImagePositionPatientRET << "]" << std::endl;
 410
 411      float iop[6];
 412      //bool riop =
 413         f->GetImageOrientationPatient(iop);
 414      float ipp[3];
 415      //bool ripp =
 416         f->GetImagePositionPatient(ipp);
 417
 418      std::cout << "Image Position (0x0020,0x0032|0x0030) : "
 419                << ipp[0] << " , " << ipp[1] << " , "<< ipp[2]
 420                << std::endl;
 421      std::cout << "Image Orientation (0x0020,0x0037|0x0035) : "
 422                << iop[0] << " , " << iop[1] << " , "<< iop[2] << " , "
 423                << iop[3] << " , " << iop[4] << " , "<< iop[5]
 424                << std::endl;
 425
 426
 427       // Let's compute 'user friendly' results about 'Orientation'
 428       // ---------------------------------------------------------
 429
 430       GDCM_NAME_SPACE::Orientation *o = GDCM_NAME_SPACE::Orientation::New();
 431
 432       if ( strImageOrientationPatient != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND ||
 433            strImageOrientationRET     != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND )
 434       {
 435
 436          GDCM_NAME_SPACE::OrientationType orient = o->GetOrientationType( f );
 437
 438          std::cout << "TypeOrientation = " << orient << " (-> "
 439                    << o->GetOrientationTypeString(orient) << " )" << std::endl;
 440       }
 441
 442       std::string ori = o->GetOrientation ( f );
 443       if (ori != "\\" )
 444          std::cout << "Orientation [" << ori << "]" << std::endl;
 445       o->Delete();
 446
 447
 448 /*
 449 std::vector <double> valueVector;
 450 GDCM_NAME_SPACE::DataEntry *e_0018_5212 = f->GetDataEntry(0x0018, 0x5212);
 451 bool resJP = e_0018_5212->GetDSValue(valueVector);
 452 if (resJP) {
 453    double test;
 454    for ( int i=0; i < 3; i++ ) {
 455        test = valueVector[i];
 456        std::cout << " test " << test << std::endl;
 457     }
 458 }
 459 //e_0018_5212->Delete();
 460 */
 461
 462
 463 /* -----------------------------
 464
 465 // Try :
 466 std::cout << std::endl << std::endl << "===========Try Get Numerical ======="
 467           << std::endl;
 468 GDCM_NAME_SPACE::DataEntry *e;
 469 bool res;
 470 std::vector<double> vd;
 471
 472 // Transfert Syntax
 473 e=f->GetDataEntry(0x0002,0x0010);
 474 if (e){
 475   res=e->GetNumerical(vd);
 476   if (!res){
 477     std::cout << "0x0002,0x0010 not numerical, size =" << vd.size() << std::endl;
 478   }
 479 }
 480 // Columns
 481 e=f->GetDataEntry(0x0028,0x0011);
 482 if (e){
 483   res=e->GetNumerical(vd);
 484   if (!res){
 485     std::cout << "0x0028,0x0011 not numerical, size =" << vd.size() << std::endl;
 486   } else {
 487     std::cout << "0x0028,0x0011 numerical, size =" << vd.size() << std::endl;
 488     std::cout << vd[0]<< std::endl;
 489   }
 490 }
 491 // Im Orient (Pat)
 492 e=f->GetDataEntry(0x0020,0x0032);
 493 if (e){
 494   res=e->GetNumerical(vd);
 495   if (!res){
 496     std::cout << "0x0020,0x0032 not numerical, size =" << vd.size() << std::endl;
 497   } else {
 498     std::cout << "0x0020,0x0032 numerical, size =" << vd.size() << std::endl;
 499     for(int l=0; l<vd.size(); l++)
 500       std::cout << "vd[" << l << "]=" << vd[l]<< std::endl;
 501   }
 502 }
 503
 504 // Pixel Spacing
 505
 506 e=f->GetDataEntry(0x0028,0x0030);
 507 if (e){
 508   res=e->GetNumerical(vd);
 509   if (!res){
 510     std::cout << "0x0028,0x0030 not numerical, size =" << vd.size() << std::endl;
 511   } else {
 512     std::cout << "0x0028,0x0030 numerical, size =" << vd.size() << std::endl;
 513     for(int l=0; l<vd.size(); l++)
 514       std::cout << "vd[" << l << "]=" << vd[l]<< std::endl;
 515   }
 516 }
 517
 518 ----------------------------------------------*/
 519
 520 }
 521 //------------------------------
 522
 523
 524       // Display the LUT as an int array (for debugging purpose)
 525       if ( f->HasLUT() && showlut )
 526       {
 527          uint8_t* lutrgba = fh->GetLutRGBA();
 528          if ( lutrgba == 0 )
 529          {
 530             std::cout << "Lut RGBA (Palette Color) not built " << std::endl;
 531
 532            // Nothing is written yet to get LUT Data user friendly
 533            // The following is to be moved into a PixelRedaConvert method
 534
 535             GDCM_NAME_SPACE::SeqEntry *modLutSeq = f->GetSeqEntry(0x0028,0x3000);
 536             if ( modLutSeq !=0 )
 537             {
 538                GDCM_NAME_SPACE::SQItem *sqi= modLutSeq->GetFirstSQItem();
 539                if ( !sqi )
 540                {
 541                   std::string lutDescriptor = sqi->GetEntryString(0x0028,0x3002);
 542                   int length;   // LUT length in Bytes
 543                   int deb;      // Subscript of the first Lut Value
 544                   int nbits;    // Lut item size (in Bits)
 545                   int nbRead;   // nb of items in LUT descriptor (must be = 3)
 546
 547                   nbRead = sscanf( lutDescriptor.c_str(),
 548                                     "%d\\%d\\%d",
 549                                      &length, &deb, &nbits );
 550                   if ( nbRead != 3 )
 551                   {
 552                       std::cout << "Wrong LUT descriptor" << std::endl;
 553                   }
 554                   GDCM_NAME_SPACE::DataEntry *b = sqi->GetDataEntry(0x0028,0x3006);
 555                   if ( b != 0 )
 556                   {
 557                      if ( b->GetLength() != 0 )
 558                      {
 559                         std::cout << "---------------------------------------"
 560                                << " We should never reach this point      "
 561                                << std::endl;
 562                         //LoadEntryBinArea(b);    //LUT Data (CTX dependent)
 563                      }
 564                  }
 565               }
 566             }
 567             else
 568                std::cout << "No LUT Data (0x0028,0x3000) found " << std::endl;
 569         }
 570         /*
 571          else
 572          {
 573             if ( fh->GetLutItemSize() == 8 )
 574             {
 575                for (int i=0;i<fh->GetLutItemNumber();i++)
 576                   std::cout << i << " : \t"
 577                          << (int)(lutrgba[i*4])   << " "
 578                          << (int)(lutrgba[i*4+1]) << " "
 579                          << (int)(lutrgba[i*4+2]) << std::endl;
 580             }
 581             else // LutItemSize assumed to be = 16
 582             {
 583                uint16_t* lutrgba16 = (uint16_t*)lutrgba;
 584                for (int i=0;i<fh->GetLutItemNumber();i++)
 585                   std::cout << i << " : \t"
 586                          << (int)(lutrgba16[i*4])   << " "
 587                          << (int)(lutrgba16[i*4+1]) << " "
 588                          << (int)(lutrgba16[i*4+2]) << std::endl;
 589             }
 590          }
 591          */
 592       }
 593       else if (showlut)
 594       {
 595          std::cout << "Try LUT Data "<< std::endl;
 596          ShowLutData(f);
 597       }
 598
 599       // Parsability of the GDCM_NAME_SPACE::Document already checked, after Load() !
 600
 601       if ( f->IsReadable() )
 602       {
 603          std::cout <<std::endl<<fileName<<" is Readable"<<std::endl;
 604       }
 605       else if ( f->GetSeqEntry(0x0041,0x1010) )
 606       {
 607          std::cout <<std::endl<<fileName<<" looks like a 'PAPYRUS image' file"
 608                    <<std::endl;
 609       }
 610       else if ( f->GetSeqEntry(0x0004,0x1220) )
 611       {
 612          std::cout <<std::endl<<fileName<<" looks like a 'DICOMDIR file'"
 613                    <<std::endl;
 614       }
 615       else
 616       {
 617          std::cout <<std::endl<<fileName<<" doesn't look like an image file "
 618              <<std::endl;
 619       }
 620
 621       std::cout<<std::flush;
 622       f->Delete();
 623       fh->Delete();
 624    }
 625          // ===========================================================================
 626    else  // =============================== Deal with a Directory =====================
 627    {     // ===========================================================================
 628       std::cout << "dirName [" << dirName << "]" << std::endl;
 629
 630       GDCM_NAME_SPACE::DirList dirList(dirName,rec); // gets recursively (or not) the file list
 631       GDCM_NAME_SPACE::DirListType fileList = dirList.GetFilenames();
 632       GDCM_NAME_SPACE::File *f;
 633       bool res;
 634
 635       if (fileList.size() == 0)
 636       {
 637          std::cout << "No file found in : [" << dirName << "]" << std::endl;
 638       }
 639
 640       for( GDCM_NAME_SPACE::DirListType::iterator it  = fileList.begin();
 641                                  it != fileList.end();
 642                                  ++it )
 643       {
 644          std::cout << std::endl<<" Start processing :[" << it->c_str() << "]"
 645                    << std::endl;
 646          f = GDCM_NAME_SPACE::File::New();
 647          f->SetLoadMode(loadMode);
 648          f->SetFileName( it->c_str() );
 649
 650          for (int ri=0; ri<forceLoadNb; ri++)
 651          {
 652             printf("%04x,%04x\n",elemsToForceLoad[2*ri],
 653                                  elemsToForceLoad[2*ri+1]);
 654             f->AddForceLoadElement((uint32_t)elemsToForceLoad[2*ri],
 655                                    (uint32_t)elemsToForceLoad[2*ri+1]);
 656          }
 657          res = f->Load();
 658
 659          if ( !res )
 660          {
 661             std::cout << "Cannot process file [" << it->c_str() << "]"
 662                       << std::endl;
 663             std::cout << "Either it doesn't exist, or it's read protected "
 664                       << std::endl;
 665             std::cout << "or it's not a Dicom File, or its 'header' is bugged"
 666                       << std::endl;
 667             std::cout << "use 'PrintFile filein=... debug' "
 668                       << "to try to guess the pb"
 669                       << std::endl;
 670             f->Delete();
 671             continue;
 672          }
 673
 674          GDCM_NAME_SPACE::FileHelper *fh = GDCM_NAME_SPACE::FileHelper::New(f);
 675          fh->SetPrintLevel( level );
 676          fh->Print();
 677
 678 //------------------------------
 679 if (!noex)
 680 {
 681          // Lets's get and print some usefull fields about 'Orientation'
 682          // ------------------------------------------------------------
 683
 684          std::string strPatientPosition =
 685                                        f->GetEntryString(0x0018,0x5100);
 686          if ( strPatientPosition != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND
 687          && strPatientPosition != "" )
 688                std::cout << "PatientPosition (0x0010,0x5100)= ["
 689                         << strPatientPosition << "]" << std::endl;
 690
 691          std::string strViewPosition =
 692                                        f->GetEntryString(0x0018,0x5101);
 693          if ( strViewPosition != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND
 694          && strViewPosition != "" )
 695                std::cout << "strViewPosition (0x0010,0x5101)= ["
 696                         << strViewPosition << "]" << std::endl;
 697
 698          std::string strPatientOrientation =
 699                                        f->GetEntryString(0x0020,0x0020);
 700          if ( strPatientOrientation != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND
 701          && strPatientOrientation != "")
 702             std::cout << "PatientOrientation (0x0020,0x0020)= ["
 703                       << strPatientOrientation << "]" << std::endl;
 704
 705          std::string strImageOrientationPatient =
 706                                        f->GetEntryString(0x0020,0x0037);
 707          if ( strImageOrientationPatient != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND
 708          && strImageOrientationPatient != "" )
 709             std::cout << "ImageOrientationPatient (0x0020,0x0037)= ["
 710                      << strImageOrientationPatient << "]" << std::endl;
 711
 712          std::string strImageOrientationRET =
 713                                        f->GetEntryString(0x0020,0x0035);
 714          if ( strImageOrientationRET != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND
 715          && strImageOrientationRET != "" )
 716          {
 717             std::cout << "ImageOrientationRET (0x0020,0x0035)= ["
 718                      << strImageOrientationRET << "]" << std::endl;
 719          }
 720
 721          // Let's compute 'user friendly' results about 'Orientation'
 722          // ---------------------------------------------------------
 723
 724          GDCM_NAME_SPACE::Orientation *o = GDCM_NAME_SPACE::Orientation::New();
 725
 726
 727          if ( strImageOrientationPatient != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND ||
 728             strImageOrientationRET     != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND )
 729          {
 730
 731             GDCM_NAME_SPACE::OrientationType orient = o->GetOrientationType( f );
 732
 733             std::cout << "TypeOrientation = " << orient << " (-> "
 734                      << o->GetOrientationTypeString(orient) << " )" << std::endl;
 735          }
 736
 737          std::string ori = o->GetOrientation ( f );
 738          if (ori != "\\" )
 739             std::cout << "Orientation [" << ori << "]" << std::endl;
 740          o->Delete();
 741 }
 742 //-------------------------------
 743
 744          if (f->IsReadable())
 745          {
 746             if (load)  // just to see warning messages at load time !
 747             {
 748                uint8_t *pixels = fh->GetImageData();     (void)pixels;
 749                uint32_t lgth   = fh->GetImageDataSize(); (void)lgth;
 750             }
 751
 752             std::cout <<std::endl<<it->c_str()<<" is Readable"<<std::endl;
 753          }
 754          else
 755             std::cout <<std::endl<<it->c_str()<<" is NOT Readable"<<std::endl;
 756          std::cout << "\n\n" << std::endl;
 757
 758
 759
 760          f->Delete();
 761          fh->Delete();
 762       }
 763       std::cout<<std::flush;
 764    }
 765    return 0;
 766 }