]> Creatis software - gdcm.git/blob - Example/PrintFile.cxx
comments
[gdcm.git] / Example / PrintFile.cxx
1 /*=========================================================================
2                                                                                 
3   Program:   gdcm
4   Module:    $RCSfile: PrintFile.cxx,v $
5   Language:  C++
6   Date:      $Date: 2010/09/01 14:41:48 $
7   Version:   $Revision: 1.94 $
8                                                                                 
9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
12                                                                                 
13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
16                                                                                 
17 =========================================================================*/
18 #include "gdcmFile.h"
19 #include "gdcmDocument.h"
20 #include "gdcmSeqEntry.h"
21 #include "gdcmSQItem.h"
22 #include "gdcmDataEntry.h"
23
24 #include "gdcmFileHelper.h"
25 #include "gdcmDebug.h"
26 #include "gdcmDirList.h"
27 #include "gdcmGlobal.h"
28 #include "gdcmDictSet.h"
29 #include "gdcmArgMgr.h"
30 #include "gdcmOrientation.h"
31 #include <iostream>
32
33 /// \todo : code factorization, for 'single file' an 'whole directory' processing
34
35 void ShowLutData(GDCM_NAME_SPACE::File *f);
36
37      // Nothing is written yet to get LUT Data user friendly
38      // The following is to be moved into a PixelReadConvert method
39      // Let here, waiting for a clever idea on the way to do it.
40
41 void ShowLutData(GDCM_NAME_SPACE::File *f)
42 {  
43    GDCM_NAME_SPACE::SeqEntry *modLutSeq = f->GetSeqEntry(0x0028,0x3000);
44    if ( modLutSeq !=0 )
45    {
46       GDCM_NAME_SPACE::SQItem *sqi= modLutSeq->GetFirstSQItem();
47       if ( sqi != 0 )
48       {
49          std::string lutDescriptor = sqi->GetEntryString(0x0028,0x3002);
50          if (   /*lutDescriptor   == GDCM_UNFOUND*/ 0 )
51          {
52             std::cout << "LUT Descriptor is missing" << std::endl;
53             return;
54          }
55          int length;   // LUT length in Bytes
56          int deb;      // Subscript of the first Lut Value
57          int nbits;    // Lut item size (in Bits)
58
59          int nbRead;    // nb of items in LUT descriptor (must be = 3)
60
61          nbRead = sscanf( lutDescriptor.c_str(),
62                            "%d\\%d\\%d",
63                               &length, &deb, &nbits );
64          std::cout << "length " << length 
65                   << " deb " << deb 
66                   << " nbits " << nbits
67                   << std::endl;
68          if ( nbRead != 3 )
69          {
70             std::cout << "Wrong LUT descriptor" << std::endl;
71          }
72          //LUT Data (CTX dependent)    
73          GDCM_NAME_SPACE::DataEntry *b = sqi->GetDataEntry(0x0028,0x3006); 
74          if ( b != 0 )
75          { 
76             int BitsAllocated = f->GetBitsAllocated();
77             if ( BitsAllocated <= 8 )
78             { 
79                int mult;
80                if ( ( nbits == 16 ) && ( BitsAllocated == 8 ) )
81                {
82                // when LUT item size is different than pixel size
83                   mult = 2; // high byte must be = low byte
84                }
85                else
86                {
87                // See PS 3.3-2003 C.11.1.1.2 p 619
88                   mult = 1;
89                }
90                uint8_t *lut = b->GetBinArea();
91                for( int i=0; i < length; ++i )
92                {
93                   std::cout << i+deb << " : \t"
94                               << (int) (lut[i*mult + 1]) << std::endl;
95                }
96             }
97             else
98             {
99                uint16_t *lut = (uint16_t *)(b->GetBinArea());  
100                for( int i=0; i < length; ++i )
101                {
102                   std::cout << i+deb << " : \t"
103                               << (int) (((uint16_t *)lut)[i])
104                               << std::endl;
105                }             
106             }
107          }  
108          else
109             std::cout << "No LUT Data DataEntry (0x0028,0x3006) found?!? " 
110                         << std::endl;
111       }
112       else
113          std::cout << "No First SQ Item within (0x0028,0x3000) ?!? " 
114                      << std::endl;      
115    }
116    else
117       std::cout << "No LUT Data SeqEntry (0x0028,0x3000) found " 
118                   << std::endl;
119 }
120
121 int main(int argc, char *argv[])
122 {
123
124    START_USAGE(usage)
125    " \n PrintFile : \n                                                        ",
126    " Display the header of a ACR-NEMA/PAPYRUS/DICOM File                      ",
127    " usage: PrintFile {filein=inputFileName|dirin=inputDirectoryName}[level=n]",
128    "                       [forceload=listOfElementsToForceLoad] [rec] [noex] ",
129    "                       [4DLoc= ][dict= privateDirectory]                  ",
130    "                       [ { [noshadowseq] | [noshadow][noseq] } ] [load]   ",
131    "                       [debug] [warning]                                  ",
132    "      level = 0,1,2 : depending on the amount of details user wants to see",
133    "      rec : user wants to parse recursively the directory                 ",
134    "      load : user wants to load the pixels, as well (to see warning info) ",
135    "      noex : user doesn't want extra 'user friendly' info                 ",   
136    "      4DLoc: group-elem(in hexa, no space) of the DataEntry holdind 4thDim",
137    "      listOfElementsToForceLoad : group-elem,g2-e2,... (in hexa, no space)",
138    "                                of Elements to load whatever their length ",
139    "      privateDirectory : source file full path name of Shadow Group elems ",
140    "      noshadowseq: user doesn't want to load Private Sequences            ",
141    "      noshadow   : user doesn't want to load Private groups (odd number)  ",
142    "      noseq      : user doesn't want to load Sequences                    ",
143    "      debug      : user wants to run the program in 'debug mode'          ",
144    "      warning    : user wants to be warned about any oddity in the File   ",
145    "      showlut :user wants to display the Palette Color (as an int array)  ",
146    FINISH_USAGE
147
148    // Initialize Arguments Manager   
149    GDCM_NAME_SPACE::ArgMgr *am= new GDCM_NAME_SPACE::ArgMgr(argc, argv);
150   
151    if (argc == 1 || am->ArgMgrDefined("usage") )
152    {
153       am->ArgMgrUsage(usage); // Display 'usage'
154       delete am;
155       return 1;
156    }
157
158    const char *fileName = am->ArgMgrGetString("filein");
159    const char *dirName  = am->ArgMgrGetString("dirin");
160
161    if ( (fileName == 0 && dirName == 0) ||
162         (fileName != 0 && dirName != 0) )
163    {
164       std::cerr << std::endl
165         << "Either 'filein=' or 'dirin=' must be present;" 
166         << std::endl << "Not both" << std::endl;
167       am->ArgMgrUsage(usage); // Display 'usage'  
168       delete am;
169       return 1;
170    }   
171       
172    bool noex = ( 0 != am->ArgMgrDefined("noex") );
173    bool rec  = ( 0 != am->ArgMgrDefined("rec") );   
174         
175    if (am->ArgMgrDefined("debug"))
176       GDCM_NAME_SPACE::Debug::DebugOn();
177
178    if (am->ArgMgrDefined("warning"))
179       GDCM_NAME_SPACE::Debug::WarningOn();
180        
181    int loadMode = GDCM_NAME_SPACE::LD_ALL;
182    if ( am->ArgMgrDefined("noshadowseq") )
183       loadMode |= GDCM_NAME_SPACE::LD_NOSHADOWSEQ;
184    else 
185    {
186       if ( am->ArgMgrDefined("noshadow") )
187          loadMode |= GDCM_NAME_SPACE::LD_NOSHADOW;
188       if ( am->ArgMgrDefined("noseq") )
189          loadMode |= GDCM_NAME_SPACE::LD_NOSEQ;
190    }
191
192    int level = am->ArgMgrGetInt("level", 1);
193
194    int forceLoadNb;
195    uint16_t *elemsToForceLoad 
196                            = am->ArgMgrGetXInt16Enum("forceload", &forceLoadNb);
197
198    int nbP =0;
199    uint16_t *FourthDimLoc;
200    if ( am->ArgMgrDefined("4DLoc") )
201    {
202       FourthDimLoc = am->ArgMgrGetXInt16Enum("4DLoc", &nbP);
203    
204       if (nbP != 1) 
205       {   
206          std::cout << "4DLoc must have 2 and only 2 components!" << std::endl;
207          delete am;
208          return 1;      
209       }
210    }
211
212    bool load = ( 0 != am->ArgMgrDefined("load") );
213    
214    bool showlut = ( 0 != am->ArgMgrDefined("SHOWLUT") );
215
216    bool ddict = am->ArgMgrDefined("dict") ? true : false;
217    const char *dict = 0;
218
219    if (ddict)
220    {
221      dict = am->ArgMgrGetString("dict",0);
222    }
223
224    /* if unused Param we give up */
225    if ( am->ArgMgrPrintUnusedLabels() )
226    {
227       am->ArgMgrUsage(usage);
228       delete am;
229       return 1;
230    } 
231
232    delete am;  // we don't need Argument Manager any longer
233
234    // ----------- End Arguments Manager ---------
235
236
237    if (ddict)
238    {
239       GDCM_NAME_SPACE::Global::GetDicts()->GetDefaultPubDict()->AddDict(dict);
240    }
241
242    if ( fileName != 0 ) // ====== Deal with a single file ======
243    {
244       GDCM_NAME_SPACE::File *f = GDCM_NAME_SPACE::File::New();
245       f->SetLoadMode(loadMode);
246       f->SetFileName( fileName );
247       f->SetMaxSizeLoadEntry(0xffff);
248
249       for (int ri=0; ri<forceLoadNb; ri++)
250       {
251          f->AddForceLoadElement((uint32_t)elemsToForceLoad[2*ri], 
252                                 (uint32_t)elemsToForceLoad[2*ri+1] );
253       }
254
255 // TODO : find why such a polution
256 // To avoid polluting the output with messages
257 // 'Last system error was : No such file or directory'
258
259 errno = 0; 
260
261
262       bool res = false;
263       try
264         {
265         res = f->Load();
266         }
267       catch(std::exception &ex)
268         {
269         std::cerr << "sorry an exception was thrown: " << ex.what() << std::endl;
270         }
271       // GDCM_NAME_SPACE::File::IsReadable() is no usable here, because we deal with
272       // any kind of gdcm-Parsable *document*
273       // not only GDCM_NAME_SPACE::File (as opposed to GDCM_NAME_SPACE::DicomDir)
274       if ( !res )
275       {
276          std::cout << "Cannot process file [" << fileName << "]" << std::endl;
277          std::cout << "Either it doesn't exist, or it's read protected "
278                    << std::endl;
279          std::cout << "or it's not a Dicom File, or its 'header' is bugged"
280                    << std::endl;
281          std::cout << "use 'PrintFile filein=... debug' to try to guess the pb"
282                    << std::endl;
283          f->Delete();
284          return 0;
285       }
286
287       if (nbP == 1)
288          f->SetFourthDimensionLocation(FourthDimLoc[0],FourthDimLoc[1]);
289
290
291       GDCM_NAME_SPACE::FileHelper *fh = GDCM_NAME_SPACE::FileHelper::New(f);
292       fh->SetPrintLevel( level );
293
294       fh->Print();
295
296       std::cout << "\n\n" << std::endl;
297
298       std::cout <<std::endl;
299       std::cout <<" dataSize    " << fh->GetImageDataSize()    << std::endl;
300       std::cout <<" dataSizeRaw " << fh->GetImageDataRawSize() << std::endl;
301 if (!noex)
302 {
303       int nX,nY,nZ,nT,sPP,planarConfig;
304       std::string pixelType;
305       nX=f->GetXSize();
306       nY=f->GetYSize();
307       nZ=f->GetZSize();
308       nT=f->GetTSize();
309       std::cout << " DIMX=" << nX << " DIMY=" << nY 
310                 << " DIMZ=" << nZ << " DIMT=" << nT
311                 << std::endl;
312
313       pixelType    = f->GetPixelType();
314       sPP          = f->GetSamplesPerPixel();
315       std::cout << " pixelType= ["            << pixelType 
316                 << "] SamplesPerPixel= ["     << sPP
317                 << "] ";
318
319       if (sPP == 3)
320       {
321          planarConfig = f->GetPlanarConfiguration();
322          std::cout << " PlanarConfiguration= [" << planarConfig 
323                 << "] "<< std::endl;
324       } 
325       std::cout << " PhotometricInterpretation= [" 
326                 << f->GetEntryString(0x0028,0x0004)
327                 << "] "<< std::endl;
328
329       int numberOfScalarComponents=f->GetNumberOfScalarComponents();
330       std::cout << " NumberOfScalarComponents = " << numberOfScalarComponents 
331                 <<std::endl
332                 << " LUT = " << (f->HasLUT() ? "TRUE" : "FALSE")
333                 << std::endl;
334
335       if ( f->GetDataEntry(0x0002,0x0010) )
336          if ( f->GetDataEntry(0x0002,0x0010)->IsNotLoaded() ) 
337          {
338             std::cout << "Transfer Syntax not loaded. " << std::endl
339                      << "Better you increase MAX_SIZE_LOAD_ELEMENT_VALUE"
340                   << std::endl;
341             f->Delete();
342             return 0;
343          }
344   
345       std::string transferSyntaxName = f->GetTransferSyntaxName();
346       std::cout << " TransferSyntaxName= [" << transferSyntaxName << "]" 
347                 << std::endl;
348       std::cout << " SwapCode= " << f->GetSwapCode() << std::endl;
349       std::cout << " ------" << std::endl;
350
351
352       std::cout << "\n\n" << std::endl; 
353       std::cout << "X spacing " << f->GetXSpacing() << std::endl;
354       std::cout << "Y spacing " << f->GetYSpacing() << std::endl;
355       std::cout << "Z spacing " << f->GetZSpacing() << std::endl;
356    
357 //------------------------------
358
359       // Let's get and print some usefull fields about 'Orientation'
360       // ------------------------------------------------------------
361
362       std::string strPatientPosition = 
363                                       f->GetEntryString(0x0018,0x5100);
364       if ( strPatientPosition != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND 
365         && strPatientPosition != "" )  
366             std::cout << "PatientPosition (0x0010,0x5100)= [" 
367                       << strPatientPosition << "]" << std::endl;
368  
369       std::string strViewPosition = 
370                                       f->GetEntryString(0x0018,0x5101);
371       if ( strViewPosition != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND 
372         && strViewPosition != "" )  
373             std::cout << "View Position (0x0018,0x5101)= [" 
374                       << strViewPosition << "]" << std::endl;
375       
376      std::string strPatientOrientation = 
377                                       f->GetEntryString(0x0020,0x0020);
378       if ( strPatientOrientation != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND
379         && strPatientOrientation != "")  
380          std::cout << "PatientOrientation (0x0020,0x0020)= [" 
381                    << strPatientOrientation << "]" << std::endl;
382
383       std::string strImageOrientationPatient = 
384                                       f->GetEntryString(0x0020,0x0037);  
385       if ( strImageOrientationPatient != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND
386         && strImageOrientationPatient != "" )  
387          std::cout << "ImageOrientationPatient (0x0020,0x0037)= [" 
388                    << strImageOrientationPatient << "]" << std::endl;
389
390       std::string strImageOrientationRET = 
391                                       f->GetEntryString(0x0020,0x0035);
392       if ( strImageOrientationRET != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND
393         && strImageOrientationRET != "" )  
394          std::cout << "ImageOrientationRET (0x0020,0x0035)= [" 
395                    << strImageOrientationRET << "]" << std::endl;
396
397       std::string strImagePositionPatient = 
398                                       f->GetEntryString(0x0020,0x0032);  
399       if ( strImagePositionPatient != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND
400         && strImagePositionPatient != "" )  
401          std::cout << "ImagePositionPatient (0x0020,0x0032)= [" 
402                    << strImagePositionPatient << "]" << std::endl;
403
404       std::string strImagePositionPatientRET = 
405                                       f->GetEntryString(0x0020,0x0030);
406       if ( strImagePositionPatientRET != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND
407         && strImagePositionPatientRET != "" )  
408          std::cout << "ImagePositionPatientRET (0x0020,0x0030)= [" 
409                    << strImagePositionPatientRET << "]" << std::endl;
410   
411      float iop[6];
412      //bool riop = 
413         f->GetImageOrientationPatient(iop);  
414      float ipp[3];
415      //bool ripp = 
416         f->GetImagePositionPatient(ipp);
417
418      std::cout << "Image Position (0x0020,0x0032|0x0030) : "
419                << ipp[0] << " , " << ipp[1] << " , "<< ipp[2]
420                << std::endl;
421      std::cout << "Image Orientation (0x0020,0x0037|0x0035) : "
422                << iop[0] << " , " << iop[1] << " , "<< iop[2] << " , "
423                << iop[3] << " , " << iop[4] << " , "<< iop[5]
424                << std::endl; 
425
426
427       // Let's compute 'user friendly' results about 'Orientation'
428       // ---------------------------------------------------------
429  
430       GDCM_NAME_SPACE::Orientation *o = GDCM_NAME_SPACE::Orientation::New();
431
432       if ( strImageOrientationPatient != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND ||
433            strImageOrientationRET     != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND )
434       {
435   
436          GDCM_NAME_SPACE::OrientationType orient = o->GetOrientationType( f );
437  
438          std::cout << "TypeOrientation = " << orient << " (-> " 
439                    << o->GetOrientationTypeString(orient) << " )" << std::endl;
440       }
441
442       std::string ori = o->GetOrientation ( f );
443       if (ori != "\\" )
444          std::cout << "Orientation [" << ori << "]" << std::endl;
445       o->Delete();
446       
447       
448 /*      
449 std::vector <double> valueVector; 
450 GDCM_NAME_SPACE::DataEntry *e_0018_5212 = f->GetDataEntry(0x0018, 0x5212);
451 bool resJP = e_0018_5212->GetDSValue(valueVector);
452 if (resJP) {
453    double test;
454    for ( int i=0; i < 3; i++ ) {
455        test = valueVector[i];
456        std::cout << " test " << test << std::endl;
457     }
458 }
459 //e_0018_5212->Delete();
460 */       
461
462
463 /* -----------------------------
464
465 // Try :
466 std::cout << std::endl << std::endl << "===========Try Get Numerical ======="
467           << std::endl;
468 GDCM_NAME_SPACE::DataEntry *e;
469 bool res;
470 std::vector<double> vd;
471
472 // Transfert Syntax
473 e=f->GetDataEntry(0x0002,0x0010);
474 if (e){
475   res=e->GetNumerical(vd);
476   if (!res){
477     std::cout << "0x0002,0x0010 not numerical, size =" << vd.size() << std::endl;  
478   }
479 }
480 // Columns
481 e=f->GetDataEntry(0x0028,0x0011);
482 if (e){
483   res=e->GetNumerical(vd);
484   if (!res){
485     std::cout << "0x0028,0x0011 not numerical, size =" << vd.size() << std::endl;  
486   } else {
487     std::cout << "0x0028,0x0011 numerical, size =" << vd.size() << std::endl;
488     std::cout << vd[0]<< std::endl;
489   }
490 }
491 // Im Orient (Pat)
492 e=f->GetDataEntry(0x0020,0x0032);
493 if (e){
494   res=e->GetNumerical(vd);
495   if (!res){
496     std::cout << "0x0020,0x0032 not numerical, size =" << vd.size() << std::endl;  
497   } else {
498     std::cout << "0x0020,0x0032 numerical, size =" << vd.size() << std::endl;
499     for(int l=0; l<vd.size(); l++)
500       std::cout << "vd[" << l << "]=" << vd[l]<< std::endl;
501   }
502 }
503
504 // Pixel Spacing
505
506 e=f->GetDataEntry(0x0028,0x0030);
507 if (e){
508   res=e->GetNumerical(vd);
509   if (!res){
510     std::cout << "0x0028,0x0030 not numerical, size =" << vd.size() << std::endl;  
511   } else {
512     std::cout << "0x0028,0x0030 numerical, size =" << vd.size() << std::endl;
513     for(int l=0; l<vd.size(); l++)
514       std::cout << "vd[" << l << "]=" << vd[l]<< std::endl;
515   }
516 }
517
518 ----------------------------------------------*/  
519     
520 }  
521 //------------------------------
522
523
524       // Display the LUT as an int array (for debugging purpose)
525       if ( f->HasLUT() && showlut )
526       {
527          uint8_t* lutrgba = fh->GetLutRGBA();
528          if ( lutrgba == 0 )
529          {
530             std::cout << "Lut RGBA (Palette Color) not built " << std::endl;
531  
532            // Nothing is written yet to get LUT Data user friendly
533            // The following is to be moved into a PixelRedaConvert method
534   
535             GDCM_NAME_SPACE::SeqEntry *modLutSeq = f->GetSeqEntry(0x0028,0x3000);
536             if ( modLutSeq !=0 )
537             {
538                GDCM_NAME_SPACE::SQItem *sqi= modLutSeq->GetFirstSQItem();
539                if ( !sqi )
540                {
541                   std::string lutDescriptor = sqi->GetEntryString(0x0028,0x3002);
542                   int length;   // LUT length in Bytes
543                   int deb;      // Subscript of the first Lut Value
544                   int nbits;    // Lut item size (in Bits)
545                   int nbRead;   // nb of items in LUT descriptor (must be = 3)
546
547                   nbRead = sscanf( lutDescriptor.c_str(),
548                                     "%d\\%d\\%d",
549                                      &length, &deb, &nbits );
550                   if ( nbRead != 3 )
551                   {
552                       std::cout << "Wrong LUT descriptor" << std::endl;
553                   }                                                  
554                   GDCM_NAME_SPACE::DataEntry *b = sqi->GetDataEntry(0x0028,0x3006);
555                   if ( b != 0 )
556                   {
557                      if ( b->GetLength() != 0 )
558                      {
559                         std::cout << "---------------------------------------"
560                                << " We should never reach this point      "
561                                << std::endl;
562                         //LoadEntryBinArea(b);    //LUT Data (CTX dependent)
563                      }   
564                  }
565               }      
566             }
567             else
568                std::cout << "No LUT Data (0x0028,0x3000) found " << std::endl;
569         }
570         /*
571          else
572          {
573             if ( fh->GetLutItemSize() == 8 )
574             {
575                for (int i=0;i<fh->GetLutItemNumber();i++)
576                   std::cout << i << " : \t"
577                          << (int)(lutrgba[i*4])   << " "
578                          << (int)(lutrgba[i*4+1]) << " "
579                          << (int)(lutrgba[i*4+2]) << std::endl;
580             }
581             else // LutItemSize assumed to be = 16
582             {
583                uint16_t* lutrgba16 = (uint16_t*)lutrgba;
584                for (int i=0;i<fh->GetLutItemNumber();i++)
585                   std::cout << i << " : \t"
586                          << (int)(lutrgba16[i*4])   << " "
587                          << (int)(lutrgba16[i*4+1]) << " "
588                          << (int)(lutrgba16[i*4+2]) << std::endl;
589             }
590          }
591          */
592       }
593       else if (showlut)
594       {
595          std::cout << "Try LUT Data "<< std::endl;
596          ShowLutData(f);
597       }
598
599       // Parsability of the GDCM_NAME_SPACE::Document already checked, after Load() !
600       
601       if ( f->IsReadable() )
602       {
603          std::cout <<std::endl<<fileName<<" is Readable"<<std::endl;
604       }
605       else if ( f->GetSeqEntry(0x0041,0x1010) )
606       {
607          std::cout <<std::endl<<fileName<<" looks like a 'PAPYRUS image' file"
608                    <<std::endl;
609       }
610       else if ( f->GetSeqEntry(0x0004,0x1220) )
611       {
612          std::cout <<std::endl<<fileName<<" looks like a 'DICOMDIR file'"
613                    <<std::endl;
614       }
615       else 
616       {
617          std::cout <<std::endl<<fileName<<" doesn't look like an image file "
618              <<std::endl; 
619       }
620  
621       std::cout<<std::flush;
622       f->Delete();
623       fh->Delete();
624    }
625          // ===========================================================================
626    else  // =============================== Deal with a Directory =====================
627    {     // ===========================================================================
628       std::cout << "dirName [" << dirName << "]" << std::endl;
629       
630       GDCM_NAME_SPACE::DirList dirList(dirName,rec); // gets recursively (or not) the file list
631       GDCM_NAME_SPACE::DirListType fileList = dirList.GetFilenames();
632       GDCM_NAME_SPACE::File *f;
633       bool res;
634
635       if (fileList.size() == 0)
636       {
637          std::cout << "No file found in : [" << dirName << "]" << std::endl;
638       }
639       
640       for( GDCM_NAME_SPACE::DirListType::iterator it  = fileList.begin();
641                                  it != fileList.end();
642                                  ++it )
643       {
644          std::cout << std::endl<<" Start processing :[" << it->c_str() << "]"
645                    << std::endl;
646          f = GDCM_NAME_SPACE::File::New();
647          f->SetLoadMode(loadMode);
648          f->SetFileName( it->c_str() );
649
650          for (int ri=0; ri<forceLoadNb; ri++)
651          {
652             printf("%04x,%04x\n",elemsToForceLoad[2*ri], 
653                                  elemsToForceLoad[2*ri+1]);
654             f->AddForceLoadElement((uint32_t)elemsToForceLoad[2*ri], 
655                                    (uint32_t)elemsToForceLoad[2*ri+1]); 
656          }
657          res = f->Load();
658
659          if ( !res )
660          {
661             std::cout << "Cannot process file [" << it->c_str() << "]" 
662                       << std::endl;
663             std::cout << "Either it doesn't exist, or it's read protected " 
664                       << std::endl;
665             std::cout << "or it's not a Dicom File, or its 'header' is bugged" 
666                       << std::endl;
667             std::cout << "use 'PrintFile filein=... debug' "
668                       << "to try to guess the pb"
669                       << std::endl;
670             f->Delete();
671             continue;
672          }
673
674          GDCM_NAME_SPACE::FileHelper *fh = GDCM_NAME_SPACE::FileHelper::New(f);
675          fh->SetPrintLevel( level );
676          fh->Print();
677
678 //------------------------------
679 if (!noex)
680 {
681          // Lets's get and print some usefull fields about 'Orientation'
682          // ------------------------------------------------------------
683
684          std::string strPatientPosition = 
685                                        f->GetEntryString(0x0018,0x5100);
686          if ( strPatientPosition != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND 
687          && strPatientPosition != "" )  
688                std::cout << "PatientPosition (0x0010,0x5100)= [" 
689                         << strPatientPosition << "]" << std::endl;
690     
691          std::string strViewPosition = 
692                                        f->GetEntryString(0x0018,0x5101);
693          if ( strViewPosition != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND 
694          && strViewPosition != "" )  
695                std::cout << "strViewPosition (0x0010,0x5101)= [" 
696                         << strViewPosition << "]" << std::endl;
697          
698          std::string strPatientOrientation = 
699                                        f->GetEntryString(0x0020,0x0020);
700          if ( strPatientOrientation != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND
701          && strPatientOrientation != "")  
702             std::cout << "PatientOrientation (0x0020,0x0020)= [" 
703                       << strPatientOrientation << "]" << std::endl;
704
705          std::string strImageOrientationPatient = 
706                                        f->GetEntryString(0x0020,0x0037);  
707          if ( strImageOrientationPatient != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND
708          && strImageOrientationPatient != "" )  
709             std::cout << "ImageOrientationPatient (0x0020,0x0037)= [" 
710                      << strImageOrientationPatient << "]" << std::endl;
711
712          std::string strImageOrientationRET = 
713                                        f->GetEntryString(0x0020,0x0035);
714          if ( strImageOrientationRET != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND
715          && strImageOrientationRET != "" )
716          {
717             std::cout << "ImageOrientationRET (0x0020,0x0035)= [" 
718                      << strImageOrientationRET << "]" << std::endl;
719          }
720
721          // Let's compute 'user friendly' results about 'Orientation'
722          // ---------------------------------------------------------
723     
724          GDCM_NAME_SPACE::Orientation *o = GDCM_NAME_SPACE::Orientation::New(); 
725
726
727          if ( strImageOrientationPatient != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND ||
728             strImageOrientationRET     != GDCM_NAME_SPACE::GDCM_UNFOUND )
729          {
730      
731             GDCM_NAME_SPACE::OrientationType orient = o->GetOrientationType( f );
732     
733             std::cout << "TypeOrientation = " << orient << " (-> " 
734                      << o->GetOrientationTypeString(orient) << " )" << std::endl;
735          }
736
737          std::string ori = o->GetOrientation ( f );
738          if (ori != "\\" )
739             std::cout << "Orientation [" << ori << "]" << std::endl;
740          o->Delete();
741 }
742 //------------------------------- 
743         
744          if (f->IsReadable())
745          {
746             if (load)  // just to see warning messages at load time !
747             {
748                uint8_t *pixels = fh->GetImageData();     (void)pixels;
749                uint32_t lgth   = fh->GetImageDataSize(); (void)lgth;
750             }         
751
752             std::cout <<std::endl<<it->c_str()<<" is Readable"<<std::endl;
753          }
754          else
755             std::cout <<std::endl<<it->c_str()<<" is NOT Readable"<<std::endl;
756          std::cout << "\n\n" << std::endl;
757          
758
759
760          f->Delete();
761          fh->Delete();
762       }
763       std::cout<<std::flush;
764    }
765    return 0;
766 }