Example/TestCopyDicom.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: TestCopyDicom.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2005/10/18 08:35:43 $
   7   Version:   $Revision: 1.31 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18 #include "gdcmFile.h"
  19 #include "gdcmFileHelper.h"
  20 #include "gdcmDocument.h"
  21 #include "gdcmDataEntry.h"
  22
  23 #ifndef _WIN32
  24 #include <unistd.h> //for access, unlink
  25 #else
  26 #include <io.h> //for _access
  27 #endif
  28
  29 // return true if the file exists
  30 bool FileExists(const char *filename)
  31 {
  32 #ifdef _MSC_VER
  33 # define access _access
  34 #endif
  35 #ifndef R_OK
  36 # define R_OK 04
  37 #endif
  38   if ( access(filename, R_OK) != 0 )
  39     {
  40     return false;
  41     }
  42   else
  43     {
  44     return true;
  45     }
  46 }
  47
  48 bool RemoveFile(const char *source)
  49 {
  50 #ifdef _MSC_VER
  51 #define _unlink unlink
  52 #endif
  53   return unlink(source) != 0 ? false : true;
  54 }
  55
  56 // Here we load a gdcmFile and then try to create from scratch a copy of it,
  57 // copying field by field the dicom image
  58
  59 int main(int argc, char *argv[])
  60 {
  61    if (argc < 3)
  62    {
  63       std::cerr << "Usage :" << std::endl <<
  64       argv[0] << " input_dicom output_dicom" << std::endl;
  65       return 1;
  66    }
  67
  68 // don't modify identation in order to let this source xdiffable with ../Test
  69
  70       std::string filename = argv[1];
  71       std::string output = argv[2];
  72
  73       if( FileExists( output.c_str() ) )
  74       {
  75          std::cerr << "Don't try to cheat, I am removing the file anyway"
  76                    << std::endl;
  77          if( !RemoveFile( output.c_str() ) )
  78          {
  79             std::cerr << "Ouch, the file exist, but I cannot remove it"
  80                       << std::endl;
  81             return 1;
  82          }
  83       }
  84       gdcm::File *fileOr = new gdcm::File();
  85       fileOr->SetFileName( filename );
  86       fileOr->Load();
  87       gdcm::FileHelper *original = new gdcm::FileHelper( fileOr );
  88
  89       std::cout << "--- Original ----------------------" << std::endl;
  90       //original->GetFile()->Print();
  91
  92       gdcm::FileHelper *copy = new gdcm::FileHelper( );
  93       copy->SetFileName( output );
  94       copy->Load();
  95
  96       //size_t dataSize;
  97       uint8_t *imageData;
  98       //dataSize = original->GetImageDataSize();// just an accesor :useless here
  99
 100       imageData = original->GetImageData(); // VERY important :
 101                                       // brings pixels into memory !
 102       //(void)imageData; // not enough to avoid warning with icc compiler
 103       //(void)dataSize; //  not enough to avoid warning on 'Golgot'
 104
 105       std::cout << imageData << std::endl; // to avoid warning ?
 106
 107       //First of all copy the header field by field
 108
 109       gdcm::DocEntry *d = original->GetFile()->GetFirstEntry();
 110       while(d)
 111       {
 112          if ( gdcm::DataEntry *de = dynamic_cast<gdcm::DataEntry *>(d) )
 113          {
 114             copy->GetFile()->InsertEntryBinArea( de->GetBinArea(),de->GetLength(),
 115                                                  de->GetGroup(),de->GetElement(),
 116                                                  de->GetVR() );
 117          }
 118          else
 119          {
 120           // We skip pb of SQ recursive exploration
 121           std::cout << "Skipped Sequence "
 122                     << "------------- " << d->GetVR() << " "<< std::hex
 123                     << d->GetGroup() << "," << d->GetElement()
 124                     << std::endl;
 125          }
 126
 127          d=original->GetFile()->GetNextEntry();
 128       }
 129
 130       //copy->GetImageData();
 131       //copy->SetImageData(imageData, dataSize);
 132
 133       std::cout << "--- Copy ----------------------" << std::endl;
 134       std::cout <<std::endl << "DO NOT care about Offset"
 135                 <<std::endl << std::endl;;
 136       copy->GetFile()->Print();
 137       std::cout << "--- ---- ----------------------" << std::endl;
 138
 139       copy->WriteDcmExplVR( output );
 140
 141
 142       delete fileOr;   // File
 143       delete original; // FileHelper
 144       delete copy;     // FileHelper
 145       return 0;
 146 }
 147
 148
 149