Example/TestCopyDicom.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: TestCopyDicom.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2005/07/19 15:19:25 $
   7   Version:   $Revision: 1.26 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18 #include "gdcmFile.h"
  19 #include "gdcmFileHelper.h"
  20 #include "gdcmDocument.h"
  21 #include "gdcmValEntry.h"
  22 #include "gdcmBinEntry.h"
  23
  24 #ifndef _WIN32
  25 #include <unistd.h> //for access, unlink
  26 #else
  27 #include <io.h> //for _access
  28 #endif
  29
  30 // return true if the file exists
  31 bool FileExists(const char *filename)
  32 {
  33 #ifdef _MSC_VER
  34 # define access _access
  35 #endif
  36 #ifndef R_OK
  37 # define R_OK 04
  38 #endif
  39   if ( access(filename, R_OK) != 0 )
  40     {
  41     return false;
  42     }
  43   else
  44     {
  45     return true;
  46     }
  47 }
  48
  49 bool RemoveFile(const char *source)
  50 {
  51 #ifdef _MSC_VER
  52 #define _unlink unlink
  53 #endif
  54   return unlink(source) != 0 ? false : true;
  55 }
  56
  57 // Here we load a gdcmFile and then try to create from scratch a copy of it,
  58 // copying field by field the dicom image
  59
  60 int main(int argc, char *argv[])
  61 {
  62    if (argc < 3)
  63    {
  64       std::cerr << "Usage :" << std::endl <<
  65       argv[0] << " input_dicom output_dicom" << std::endl;
  66       return 1;
  67    }
  68
  69 // don't modify identation in order to let this source xdiffable with ../Test
  70
  71       std::string filename = argv[1];
  72       std::string output = argv[2];
  73
  74       if( FileExists( output.c_str() ) )
  75       {
  76          std::cerr << "Don't try to cheat, I am removing the file anyway" << std::endl;
  77          if( !RemoveFile( output.c_str() ) )
  78          {
  79             std::cerr << "Ouch, the file exist, but I cannot remove it" << std::endl;
  80             return 1;
  81          }
  82       }
  83       gdcm::File *fileOr = new gdcm::File();
  84       fileOr->SetFileName( filename );
  85       fileOr->Load();
  86       gdcm::FileHelper *original = new gdcm::FileHelper( fileOr );
  87
  88       std::cout << "--- Original ----------------------" << std::endl;
  89       //original->GetFile()->Print();
  90
  91       gdcm::FileHelper *copy = new gdcm::FileHelper( );
  92       copy->SetFileName( output );
  93       copy->Load();
  94
  95       size_t dataSize = original->GetImageDataSize();
  96       uint8_t *imageData = original->GetImageData();
  97       (void)imageData;
  98       (void)dataSize;
  99
 100       //First of all copy the header field by field
 101
 102       gdcm::DocEntry *d = original->GetFile()->GetFirstEntry();
 103       while(d)
 104       {
 105          if ( gdcm::BinEntry *b = dynamic_cast<gdcm::BinEntry*>(d) )
 106          {
 107             copy->GetFile()->InsertBinEntry( b->GetBinArea(),b->GetLength(),
 108                                              b->GetGroup(),b->GetElement(),
 109                                              b->GetVR() );
 110          }
 111          else if ( gdcm::ValEntry *v = dynamic_cast<gdcm::ValEntry*>(d) )
 112          {
 113             copy->GetFile()->InsertValEntry( v->GetValue(),
 114                                              v->GetGroup(),v->GetElement(),
 115                                              v->GetVR() );
 116          }
 117          else
 118          {
 119           // We skip pb of SQ recursive exploration
 120           std::cout << "Skipped Sequence "
 121                     << "------------- " << d->GetVR() << " "<< std::hex
 122                     << d->GetGroup() << "," << d->GetElement()
 123                     << std::endl;
 124          }
 125
 126          d=original->GetFile()->GetNextEntry();
 127       }
 128
 129       //copy->GetImageData();
 130       //copy->SetImageData(imageData, dataSize);
 131
 132       std::cout << "--- Copy ----------------------" << std::endl;
 133       std::cout <<std::endl << "DO NOT care about Offset"  <<std::endl<<std::endl;;
 134       copy->GetFile()->Print();
 135       std::cout << "--- ---- ----------------------" << std::endl;
 136
 137       copy->WriteDcmExplVR( output );
 138
 139       return 0;
 140 }
 141
 142
 143