Example/TestCopyDicom.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: TestCopyDicom.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2004/11/16 04:26:18 $
   7   Version:   $Revision: 1.12 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18 #include "gdcmHeader.h"
  19 #include "gdcmFile.h"
  20 #include "gdcmDocument.h"
  21 #include "gdcmValEntry.h"
  22 #include "gdcmBinEntry.h"
  23
  24 #ifndef _WIN32
  25 #include <unistd.h> //for access, unlink
  26 #else
  27 #include <io.h> //for _access
  28 #endif
  29
  30 // return true if the file exists
  31 bool FileExists(const char* filename)
  32 {
  33 #ifdef _MSC_VER
  34 # define access _access
  35 #endif
  36 #ifndef R_OK
  37 # define R_OK 04
  38 #endif
  39   if ( access(filename, R_OK) != 0 )
  40     {
  41     return false;
  42     }
  43   else
  44     {
  45     return true;
  46     }
  47 }
  48
  49 bool RemoveFile(const char* source)
  50 {
  51 #ifdef _MSC_VER
  52 #define _unlink unlink
  53 #endif
  54   return unlink(source) != 0 ? false : true;
  55 }
  56
  57 // Here we load a gdcmFile and then try to create from scratch a copy of it,
  58 // copying field by field the dicom image
  59
  60 int main(int argc, char* argv[])
  61 {
  62    if (argc < 3)
  63    {
  64       std::cerr << "Usage :" << std::endl <<
  65       argv[0] << " input_dicom output_dicom" << std::endl;
  66       return 1;
  67    }
  68
  69 // don't modify identation in order to let this source xdiffable with ../Test
  70
  71       std::string filename = argv[1];
  72       std::string output = argv[2];
  73
  74       if( FileExists( output.c_str() ) )
  75       {
  76          std::cerr << "Don't try to cheat, I am removing the file anyway" << std::endl;
  77          if( !RemoveFile( output.c_str() ) )
  78          {
  79             std::cerr << "Ouch, the file exist, but I cannot remove it" << std::endl;
  80             return 1;
  81          }
  82       }
  83       gdcm::File *original = new gdcm::File( filename );
  84
  85       std::cout << "--- Original ----------------------" << std::endl;
  86       //original->GetHeader()->Print();
  87
  88       gdcm::File *copy = new gdcm::File( output );
  89
  90       const gdcm::TagDocEntryHT & Ht = original->GetHeader()->GetTagHT();
  91
  92       size_t dataSize = original->GetImageDataSize();
  93       uint8_t* imageData = original->GetImageData();
  94
  95       //First of all copy the header field by field
  96
  97       // Warning :Accessor gdcmElementSet::GetEntry() should not exist
  98       // It was commented out by Mathieu, that was a *good* idea
  99       // (the user does NOT have to know the way we implemented the Header !)
 100       // Waiting for a 'clean' solution, I keep the method ...JPRx
 101
 102       gdcm::DocEntry* d;
 103
 104       for (gdcm::TagDocEntryHT::const_iterator tag = Ht.begin(); tag != Ht.end(); ++tag)
 105       {
 106          d = tag->second;
 107          d->Print(); std::cout << std::endl;
 108          if ( gdcm::BinEntry* b = dynamic_cast<gdcm::BinEntry*>(d) )
 109          {
 110             copy->GetHeader()->ReplaceOrCreateByNumber(
 111                                  b->GetBinArea(),
 112                                  b->GetLength(),
 113                                  b->GetGroup(),
 114                                  b->GetElement(),
 115                                  b->GetVR() );
 116          }
 117          else if ( gdcm::ValEntry* v = dynamic_cast<gdcm::ValEntry*>(d) )
 118          {
 119             copy->GetHeader()->ReplaceOrCreateByNumber(
 120                                  v->GetValue(),
 121                                  v->GetGroup(),
 122                                  v->GetElement(),
 123                                  v->GetVR() );
 124          }
 125          else
 126          {
 127           // We skip pb of SQ recursive exploration
 128           //std::cout << "Skipped Sequence "
 129           //          << "------------- " << d->GetVR() << " "<< std::hex
 130           //          << d->GetGroup() << " " << d->GetElement()
 131           //  << std::endl;
 132          }
 133       }
 134
 135
 136
 137
 138
 139       //copy->GetImageData();
 140       copy->SetImageData(imageData, dataSize);
 141
 142       std::cout << "--- Copy ----------------------" << std::endl;
 143       std::cout <<std::endl << "DO NOT care about Offset"  <<std::endl<<std::endl;;
 144       copy->GetHeader()->Print();
 145       std::cout << "--- ---- ----------------------" << std::endl;
 146
 147       copy->WriteDcmExplVR( output );
 148
 149       return 0;
 150 }
 151
 152
 153