Example/TestCopyDicom.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: TestCopyDicom.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2005/10/17 10:41:59 $
   7   Version:   $Revision: 1.30 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18 #include "gdcmFile.h"
  19 #include "gdcmFileHelper.h"
  20 #include "gdcmDocument.h"
  21 #include "gdcmValEntry.h"
  22 #include "gdcmBinEntry.h"
  23
  24 #ifndef _WIN32
  25 #include <unistd.h> //for access, unlink
  26 #else
  27 #include <io.h> //for _access
  28 #endif
  29
  30 // return true if the file exists
  31 bool FileExists(const char *filename)
  32 {
  33 #ifdef _MSC_VER
  34 # define access _access
  35 #endif
  36 #ifndef R_OK
  37 # define R_OK 04
  38 #endif
  39   if ( access(filename, R_OK) != 0 )
  40     {
  41     return false;
  42     }
  43   else
  44     {
  45     return true;
  46     }
  47 }
  48
  49 bool RemoveFile(const char *source)
  50 {
  51 #ifdef _MSC_VER
  52 #define _unlink unlink
  53 #endif
  54   return unlink(source) != 0 ? false : true;
  55 }
  56
  57 // Here we load a gdcmFile and then try to create from scratch a copy of it,
  58 // copying field by field the dicom image
  59
  60 int main(int argc, char *argv[])
  61 {
  62    if (argc < 3)
  63    {
  64       std::cerr << "Usage :" << std::endl <<
  65       argv[0] << " input_dicom output_dicom" << std::endl;
  66       return 1;
  67    }
  68
  69 // don't modify identation in order to let this source xdiffable with ../Test
  70
  71       std::string filename = argv[1];
  72       std::string output = argv[2];
  73
  74       if( FileExists( output.c_str() ) )
  75       {
  76          std::cerr << "Don't try to cheat, I am removing the file anyway"
  77                    << std::endl;
  78          if( !RemoveFile( output.c_str() ) )
  79          {
  80             std::cerr << "Ouch, the file exist, but I cannot remove it"
  81                       << std::endl;
  82             return 1;
  83          }
  84       }
  85       gdcm::File *fileOr = new gdcm::File();
  86       fileOr->SetFileName( filename );
  87       fileOr->Load();
  88       gdcm::FileHelper *original = new gdcm::FileHelper( fileOr );
  89
  90       std::cout << "--- Original ----------------------" << std::endl;
  91       //original->GetFile()->Print();
  92
  93       gdcm::FileHelper *copy = new gdcm::FileHelper( );
  94       copy->SetFileName( output );
  95       copy->Load();
  96
  97       //size_t dataSize;
  98       uint8_t *imageData;
  99       //dataSize = original->GetImageDataSize();// just an accesor :useless here
 100
 101       imageData = original->GetImageData(); // VERY important :
 102                                       // brings pixels into memory !
 103       //(void)imageData; // not enough to avoid warning with icc compiler
 104       //(void)dataSize; //  not enough to avoid warning on 'Golgot'
 105
 106       std::cout << imageData << std::endl; // to avoid warning ?
 107
 108       //First of all copy the header field by field
 109
 110       gdcm::DocEntry *d = original->GetFile()->GetFirstEntry();
 111       while(d)
 112       {
 113          if ( gdcm::BinEntry *b = dynamic_cast<gdcm::BinEntry*>(d) )
 114          {
 115             copy->GetFile()->InsertBinEntry( b->GetBinArea(),b->GetLength(),
 116                                              b->GetGroup(),b->GetElement(),
 117                                              b->GetVR() );
 118          }
 119          else if ( gdcm::ValEntry *v = dynamic_cast<gdcm::ValEntry*>(d) )
 120          {
 121             copy->GetFile()->InsertValEntry( v->GetValue(),
 122                                              v->GetGroup(),v->GetElement(),
 123                                              v->GetVR() );
 124          }
 125          else
 126          {
 127           // We skip pb of SQ recursive exploration
 128           std::cout << "Skipped Sequence "
 129                     << "------------- " << d->GetVR() << " "<< std::hex
 130                     << d->GetGroup() << "," << d->GetElement()
 131                     << std::endl;
 132          }
 133
 134          d=original->GetFile()->GetNextEntry();
 135       }
 136
 137       //copy->GetImageData();
 138       //copy->SetImageData(imageData, dataSize);
 139
 140       std::cout << "--- Copy ----------------------" << std::endl;
 141       std::cout <<std::endl << "DO NOT care about Offset"
 142                 <<std::endl << std::endl;;
 143       copy->GetFile()->Print();
 144       std::cout << "--- ---- ----------------------" << std::endl;
 145
 146       copy->WriteDcmExplVR( output );
 147
 148
 149       delete fileOr;   // File
 150       delete original; // FileHelper
 151       delete copy;     // FileHelper
 152       return 0;
 153 }
 154
 155
 156