]> Creatis software - gdcm.git/blob - Example/WriteDicomAsJPEG2000.cxx
First step to sync with v 1.2.2
[gdcm.git] / Example / WriteDicomAsJPEG2000.cxx
1 /*=========================================================================
2                                                                                 
3   Program:   gdcm
4   Module:    $RCSfile: WriteDicomAsJPEG2000.cxx,v $
5   Language:  C++
6   Date:      $Date: 2007/07/13 08:17:20 $
7   Version:   $Revision: 1.5 $
8                                                                                 
9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
12                                                                                 
13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
16                                                                                 
17 =========================================================================*/
18
19 #include "gdcmFile.h"
20 #include "gdcmFileHelper.h"
21 #include "gdcmUtil.h"
22
23 // Open a dicom file and compress it as JPEG 2000 stream
24 int main(int argc, char *argv[])
25 {
26   if( argc < 2)
27     {
28     std::cerr << argv[0] << " inputfilename.dcm\n";
29     return 1;
30     }
31
32    std::string filename = argv[1];
33    std::string outfilename = "/tmp/bla.dcm";
34    if( argc >= 3 )
35      outfilename = argv[2];
36    int quality = 100;
37    if( argc >= 4 )
38      quality = atoi(argv[3]);
39    std::cerr << "Using quality: " << quality << std::endl;
40
41 // Step 1 : Create the header of the image
42    GDCM_NAME_SPACE::File *f = GDCM_NAME_SPACE::File::New();
43    f->SetLoadMode ( GDCM_NAME_SPACE::LD_ALL ); // Load everything
44    f->SetFileName( filename );
45    f->Load();
46
47    GDCM_NAME_SPACE::FileHelper *tested = GDCM_NAME_SPACE::FileHelper::New( f );
48    std::string PixelType = tested->GetFile()->GetPixelType();
49    int xsize = f->GetXSize();
50    int ysize = f->GetYSize();
51    int zsize = f->GetZSize();
52    //tested->Print( std::cout );
53
54    int samplesPerPixel = f->GetSamplesPerPixel();
55    size_t testedDataSize    = tested->GetImageDataSize();
56    uint8_t *testedImageData = tested->GetImageData();
57
58 // Step 1 : Create the header of the image
59
60    GDCM_NAME_SPACE::File *fileToBuild = GDCM_NAME_SPACE::File::New();
61    std::ostringstream str;
62
63    // Set the image size
64    str.str("");
65    str << xsize;
66    fileToBuild->InsertEntryString(str.str(),0x0028,0x0011, "US"); // Columns
67    str.str("");
68    str << ysize;
69    fileToBuild->InsertEntryString(str.str(),0x0028,0x0010, "US"); // Rows
70
71    if(zsize>1)
72    {
73       str.str("");
74       str << zsize;
75       fileToBuild->InsertEntryString(str.str(),0x0028,0x0008, "IS"); // Number of Frames
76    }
77    int bitsallocated = f->GetBitsAllocated();
78    int bitsstored = f->GetBitsStored();
79    int highbit = f->GetHighBitPosition();
80    //std::string pixtype = f->GetPixelType();
81    int sign = f->IsSignedPixelData();
82
83    // Set the pixel type
84    str.str("");
85    str << bitsallocated;
86    fileToBuild->InsertEntryString(str.str(),0x0028,0x0100,"US"); // Bits Allocated
87
88    str.str("");
89    str << bitsstored;
90    fileToBuild->InsertEntryString(str.str(),0x0028,0x0101, "US"); // Bits Stored
91
92    str.str("");
93    str << highbit;
94    fileToBuild->InsertEntryString(str.str(),0x0028,0x0102, "US"); // High Bit
95
96    // Set the pixel representation
97    str.str("");
98    str << sign;
99    fileToBuild->InsertEntryString(str.str(),0x0028,0x0103, "US"); // Pixel Representation
100
101    // Set the samples per pixel
102    str.str("");
103    str << samplesPerPixel; //img.components;
104    fileToBuild->InsertEntryString(str.str(),0x0028,0x0002, "US"); // Samples per Pixel
105
106 // Step 2 : Create the output image
107    GDCM_NAME_SPACE::FileHelper *fileH = GDCM_NAME_SPACE::FileHelper::New(fileToBuild);
108    fileH->SetWriteTypeToJPEG2000(  );
109    fileH->SetImageData(testedImageData, testedDataSize);
110    if( !fileH->Write(outfilename) )
111      {
112      std::cerr << "write fails" << std::endl;
113      }
114
115    f->Delete();
116    tested->Delete();
117    fileToBuild->Delete();
118    fileH->Delete();
119
120    return 0;
121 }
122