Example/exColorToRGB.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: exColorToRGB.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2005/10/18 08:35:43 $
   7   Version:   $Revision: 1.8 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18
  19 #include "gdcmFile.h"
  20 #include "gdcmFileHelper.h"
  21 #include "gdcmDocument.h"
  22 #include "gdcmDataEntry.h"
  23 #include "gdcmSeqEntry.h"
  24
  25 #include <stdlib.h> // for exit
  26
  27 int main(int argc, char *argv[])
  28 {
  29
  30    std::cout << "------------------------------------------------" << std::endl;
  31    std::cout << "Tranforms a full gdcm-readable 'color' Dicom image "
  32           << " (e.g Palette Color, YBR, 3-Planes RGB) "
  33           << " into an 'RGB_Pixels' Dicom Image "
  34           << " "            << std::endl;
  35
  36    if (argc < 3)
  37    {
  38       std::cerr << "Usage :" << std::endl <<
  39       argv[0] << " input_dicom output_dicom" << std::endl;
  40       return 1;
  41    }
  42
  43    std::string fileName = argv[1];
  44    std::string output   = argv[2];
  45
  46
  47 // ============================================================
  48 //   Read the input image.
  49 // ============================================================
  50    // a gdcm::File contains all the Dicom Field but the Pixels Element
  51
  52    std::cout << argv[1] << std::endl;
  53
  54    gdcm::File *f = new gdcm::File();
  55    f->SetLoadMode( gdcm::LD_ALL);
  56    f->SetFileName( fileName );
  57    bool res = f->Load();
  58
  59    if (!res) {
  60        std::cerr << "Sorry, " << fileName <<"  not a gdcm-readable "
  61                  << "DICOM / ACR File"
  62                  <<std::endl;
  63        return 0;
  64    }
  65    std::cout << " ... is readable " << std::endl;
  66
  67 /*
  68    if (!f->IsMonochrome()) {
  69        std::cerr << "Sorry, " << fileName <<"  not a 'color' File "
  70                  << " "
  71                  <<std::endl;
  72        return 0;
  73    }
  74 */
  75
  76 // ============================================================
  77 //   Load the pixels in memory.
  78 // ============================================================
  79
  80    // We need a gdcm::FileHelper, since we want to load the pixels
  81    gdcm::FileHelper *fh = new gdcm::FileHelper(f);
  82
  83    // uint8_t DOESN'T mean it's mandatory for the image to be a 8 bits one !
  84    // It's just for prototyping.
  85    // Feel free to cast it.
  86
  87    uint8_t *imageData = fh->GetImageData();
  88
  89    if ( imageData == 0 )
  90    {
  91        std::cerr << "Sorry, Pixels of" << fileName <<"  are not "
  92                  << " gdcm-readable."       << std::endl;
  93        return 0;
  94    }
  95
  96
  97    // ------ User wants write a new image without shadow groups -------------
  98    // ------                              without Sequences     -------------
  99
 100
 101    gdcm::FileHelper *copy = new gdcm::FileHelper( );
 102    copy->SetFileName( output );
 103    copy->Load();
 104
 105    gdcm::DocEntry *d = f->GetFirstEntry();
 106    while(d)
 107    {
 108       // We skip SeqEntries, since user cannot do much with them
 109       if ( !(dynamic_cast<gdcm::SeqEntry*>(d))
 110       // We skip Shadow Groups, since nobody knows what they mean
 111            && !( d->GetGroup()%2 ) )
 112       {
 113
 114          if ( gdcm::DataEntry *de = dynamic_cast<gdcm::DataEntry *>(d) )
 115          {
 116             copy->GetFile()->InsertEntryBinArea( de->GetBinArea(),de->GetLength(),
 117                                                  de->GetGroup(),de->GetElement(),
 118                                                  de->GetVR() );
 119          }
 120          else
 121          {
 122           // We skip gdcm::SeqEntries
 123          }
 124       }
 125       d = f->GetNextEntry();
 126    }
 127
 128    // User knows the image is a 'color' one -RGB, YBR, Palette Color-
 129    // and wants to write it as RGB
 130    copy->SetImageData(imageData, fh->GetImageDataSize());
 131    copy->SetWriteModeToRGB();
 132
 133    copy->WriteDcmExplVR( output );
 134
 135
 136    delete f;
 137    delete fh;
 138    delete copy;
 139
 140    exit (0);
 141 }
 142