Example/exColorToRGB.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: exColorToRGB.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2005/02/09 14:39:48 $
   7   Version:   $Revision: 1.1 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18
  19 #include "gdcmFile.h"
  20 #include "gdcmFileHelper.h"
  21 #include "gdcmDocument.h"
  22 #include "gdcmValEntry.h"
  23 #include "gdcmBinEntry.h"
  24 #include "gdcmSeqEntry.h"
  25
  26
  27 int main(int argc, char *argv[])
  28 {
  29
  30    std::cout << "------------------------------------------------" << std::endl;
  31    std::cout << "Tranforms a full gdcm-readable 'color' Dicom image "
  32           << " (e.g Palette Color, YBR, 3-Planes RGB) "
  33           << " into an 'RGB_Pixels' Dicom Image "
  34           << " "            << std::endl;
  35
  36    if (argc < 3)
  37    {
  38       std::cerr << "Usage :" << std::endl <<
  39       argv[0] << " input_dicom output_dicom" << std::endl;
  40       return 1;
  41    }
  42
  43    std::string fileName = argv[1];
  44    std::string output   = argv[2];
  45
  46
  47 // ============================================================
  48 //   Read the input image.
  49 // ============================================================
  50    // a gdcm::File contains all the Dicom Field but the Pixels Element
  51
  52    gdcm::File *f1= new gdcm::File( fileName );
  53
  54
  55    std::cout << argv[1] << std::endl;
  56
  57    f1 = new gdcm::File( fileName );
  58    if (!f1->IsReadable()) {
  59        std::cerr << "Sorry, " << fileName <<"  not a gdcm-readable "
  60                  << "DICOM / ACR File"
  61                  <<std::endl;
  62        return 0;
  63    }
  64    std::cout << " ... is readable " << std::endl;
  65
  66 /*
  67    if (!f1->IsMonochrome()) {
  68        std::cerr << "Sorry, " << fileName <<"  not a 'color' File "
  69                  << " "
  70                  <<std::endl;
  71        return 0;
  72    }
  73 */
  74
  75 // ============================================================
  76 //   Load the pixels in memory.
  77 // ============================================================
  78
  79    // We need a gdcm::FileHelper, since we want to load the pixels
  80    gdcm::FileHelper *fh1 = new gdcm::FileHelper(f1);
  81
  82    // (unit8_t DOESN'T mean it's mandatory for the image to be a 8 bits one)
  83
  84    uint8_t *imageData = fh1->GetImageData();
  85
  86    if ( imageData == 0 )
  87    {
  88        std::cerr << "Sorry, Pixels of" << fileName <<"  are not "
  89                  << " gdcm-readable."       << std::endl;
  90        return 0;
  91    }
  92
  93
  94
  95
  96    // ------ User wants write a new image without shadow groups -------------
  97    // ------                              without Sequences     -------------
  98
  99
 100    gdcm::FileHelper *copy = new gdcm::FileHelper( output );
 101
 102    gdcm::DocEntry *d = f1->GetFirstEntry();
 103    while(d)
 104    {
 105       // We skip SeqEntries, since user cannot do much with them
 106       if ( !(dynamic_cast<gdcm::SeqEntry*>(d))
 107       // We skip Shadow Groups, since nobody knows what they mean
 108            && !( d->GetGroup()%2 ) )
 109       {
 110
 111          if ( gdcm::BinEntry *b = dynamic_cast<gdcm::BinEntry*>(d) )
 112          {
 113             copy->GetFile()->InsertBinEntry( b->GetBinArea(),b->GetLength(),
 114                                              b->GetGroup(),b->GetElement(),
 115                                              b->GetVR() );
 116          }
 117          else if ( gdcm::ValEntry *v = dynamic_cast<gdcm::ValEntry*>(d) )
 118          {
 119              copy->GetFile()->InsertValEntry( v->GetValue(),
 120                                               v->GetGroup(),v->GetElement(),
 121                                               v->GetVR() );
 122          }
 123          else
 124          {
 125           // We skip gdcm::SeqEntries
 126          }
 127       }
 128       d = f1->GetNextEntry();
 129    }
 130
 131    // User knows the image is a 'color' one -RGB, YBR, Palette Color-
 132    // and wants to write it as RGB
 133    copy->SetImageData(imageData, fh1->GetImageDataSize());
 134    copy->SetWriteModeToRGB();
 135
 136    copy->WriteDcmExplVR( output );
 137
 138
 139    delete f1;
 140    delete fh1;
 141    delete copy;
 142
 143    exit (0);
 144 }
 145