Example/exColorToRGB.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: exColorToRGB.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2005/09/06 11:10:03 $
   7   Version:   $Revision: 1.7 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18
  19 #include "gdcmFile.h"
  20 #include "gdcmFileHelper.h"
  21 #include "gdcmDocument.h"
  22 #include "gdcmValEntry.h"
  23 #include "gdcmBinEntry.h"
  24 #include "gdcmSeqEntry.h"
  25
  26 #include <stdlib.h> // for exit
  27
  28 int main(int argc, char *argv[])
  29 {
  30
  31    std::cout << "------------------------------------------------" << std::endl;
  32    std::cout << "Tranforms a full gdcm-readable 'color' Dicom image "
  33           << " (e.g Palette Color, YBR, 3-Planes RGB) "
  34           << " into an 'RGB_Pixels' Dicom Image "
  35           << " "            << std::endl;
  36
  37    if (argc < 3)
  38    {
  39       std::cerr << "Usage :" << std::endl <<
  40       argv[0] << " input_dicom output_dicom" << std::endl;
  41       return 1;
  42    }
  43
  44    std::string fileName = argv[1];
  45    std::string output   = argv[2];
  46
  47
  48 // ============================================================
  49 //   Read the input image.
  50 // ============================================================
  51    // a gdcm::File contains all the Dicom Field but the Pixels Element
  52
  53    std::cout << argv[1] << std::endl;
  54
  55    gdcm::File *f = new gdcm::File();
  56    f->SetLoadMode( gdcm::LD_ALL);
  57    f->SetFileName( fileName );
  58    bool res = f->Load();
  59
  60    if (!res) {
  61        std::cerr << "Sorry, " << fileName <<"  not a gdcm-readable "
  62                  << "DICOM / ACR File"
  63                  <<std::endl;
  64        return 0;
  65    }
  66    std::cout << " ... is readable " << std::endl;
  67
  68 /*
  69    if (!f->IsMonochrome()) {
  70        std::cerr << "Sorry, " << fileName <<"  not a 'color' File "
  71                  << " "
  72                  <<std::endl;
  73        return 0;
  74    }
  75 */
  76
  77 // ============================================================
  78 //   Load the pixels in memory.
  79 // ============================================================
  80
  81    // We need a gdcm::FileHelper, since we want to load the pixels
  82    gdcm::FileHelper *fh = new gdcm::FileHelper(f);
  83
  84    // uint8_t DOESN'T mean it's mandatory for the image to be a 8 bits one !
  85    // It's just for prototyping.
  86    // Feel free to cast it.
  87
  88    uint8_t *imageData = fh->GetImageData();
  89
  90    if ( imageData == 0 )
  91    {
  92        std::cerr << "Sorry, Pixels of" << fileName <<"  are not "
  93                  << " gdcm-readable."       << std::endl;
  94        return 0;
  95    }
  96
  97
  98    // ------ User wants write a new image without shadow groups -------------
  99    // ------                              without Sequences     -------------
 100
 101
 102    gdcm::FileHelper *copy = new gdcm::FileHelper( );
 103    copy->SetFileName( output );
 104    copy->Load();
 105
 106    gdcm::DocEntry *d = f->GetFirstEntry();
 107    while(d)
 108    {
 109       // We skip SeqEntries, since user cannot do much with them
 110       if ( !(dynamic_cast<gdcm::SeqEntry*>(d))
 111       // We skip Shadow Groups, since nobody knows what they mean
 112            && !( d->GetGroup()%2 ) )
 113       {
 114
 115          if ( gdcm::BinEntry *b = dynamic_cast<gdcm::BinEntry*>(d) )
 116          {
 117             copy->GetFile()->InsertBinEntry( b->GetBinArea(),b->GetLength(),
 118                                              b->GetGroup(),b->GetElement(),
 119                                              b->GetVR() );
 120          }
 121          else if ( gdcm::ValEntry *v = dynamic_cast<gdcm::ValEntry*>(d) )
 122          {
 123              copy->GetFile()->InsertValEntry( v->GetValue(),
 124                                               v->GetGroup(),v->GetElement(),
 125                                               v->GetVR() );
 126          }
 127          else
 128          {
 129           // We skip gdcm::SeqEntries
 130          }
 131       }
 132       d = f->GetNextEntry();
 133    }
 134
 135    // User knows the image is a 'color' one -RGB, YBR, Palette Color-
 136    // and wants to write it as RGB
 137    copy->SetImageData(imageData, fh->GetImageDataSize());
 138    copy->SetWriteModeToRGB();
 139
 140    copy->WriteDcmExplVR( output );
 141
 142
 143    delete f;
 144    delete fh;
 145    delete copy;
 146
 147    exit (0);
 148 }
 149