Example/exColorToRGB.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: exColorToRGB.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2005/07/06 15:49:31 $
   7   Version:   $Revision: 1.2 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18
  19 #include "gdcmFile.h"
  20 #include "gdcmFileHelper.h"
  21 #include "gdcmDocument.h"
  22 #include "gdcmValEntry.h"
  23 #include "gdcmBinEntry.h"
  24 #include "gdcmSeqEntry.h"
  25
  26 #include <stdlib.h> // for exit
  27
  28 int main(int argc, char *argv[])
  29 {
  30
  31    std::cout << "------------------------------------------------" << std::endl;
  32    std::cout << "Tranforms a full gdcm-readable 'color' Dicom image "
  33           << " (e.g Palette Color, YBR, 3-Planes RGB) "
  34           << " into an 'RGB_Pixels' Dicom Image "
  35           << " "            << std::endl;
  36
  37    if (argc < 3)
  38    {
  39       std::cerr << "Usage :" << std::endl <<
  40       argv[0] << " input_dicom output_dicom" << std::endl;
  41       return 1;
  42    }
  43
  44    std::string fileName = argv[1];
  45    std::string output   = argv[2];
  46
  47
  48 // ============================================================
  49 //   Read the input image.
  50 // ============================================================
  51    // a gdcm::File contains all the Dicom Field but the Pixels Element
  52
  53    gdcm::File *f1= new gdcm::File( fileName );
  54
  55
  56    std::cout << argv[1] << std::endl;
  57
  58    f1 = new gdcm::File( fileName );
  59    if (!f1->IsReadable()) {
  60        std::cerr << "Sorry, " << fileName <<"  not a gdcm-readable "
  61                  << "DICOM / ACR File"
  62                  <<std::endl;
  63        return 0;
  64    }
  65    std::cout << " ... is readable " << std::endl;
  66
  67 /*
  68    if (!f1->IsMonochrome()) {
  69        std::cerr << "Sorry, " << fileName <<"  not a 'color' File "
  70                  << " "
  71                  <<std::endl;
  72        return 0;
  73    }
  74 */
  75
  76 // ============================================================
  77 //   Load the pixels in memory.
  78 // ============================================================
  79
  80    // We need a gdcm::FileHelper, since we want to load the pixels
  81    gdcm::FileHelper *fh1 = new gdcm::FileHelper(f1);
  82
  83    // (unit8_t DOESN'T mean it's mandatory for the image to be a 8 bits one)
  84
  85    uint8_t *imageData = fh1->GetImageData();
  86
  87    if ( imageData == 0 )
  88    {
  89        std::cerr << "Sorry, Pixels of" << fileName <<"  are not "
  90                  << " gdcm-readable."       << std::endl;
  91        return 0;
  92    }
  93
  94
  95
  96
  97    // ------ User wants write a new image without shadow groups -------------
  98    // ------                              without Sequences     -------------
  99
 100
 101    gdcm::FileHelper *copy = new gdcm::FileHelper( output );
 102
 103    gdcm::DocEntry *d = f1->GetFirstEntry();
 104    while(d)
 105    {
 106       // We skip SeqEntries, since user cannot do much with them
 107       if ( !(dynamic_cast<gdcm::SeqEntry*>(d))
 108       // We skip Shadow Groups, since nobody knows what they mean
 109            && !( d->GetGroup()%2 ) )
 110       {
 111
 112          if ( gdcm::BinEntry *b = dynamic_cast<gdcm::BinEntry*>(d) )
 113          {
 114             copy->GetFile()->InsertBinEntry( b->GetBinArea(),b->GetLength(),
 115                                              b->GetGroup(),b->GetElement(),
 116                                              b->GetVR() );
 117          }
 118          else if ( gdcm::ValEntry *v = dynamic_cast<gdcm::ValEntry*>(d) )
 119          {
 120              copy->GetFile()->InsertValEntry( v->GetValue(),
 121                                               v->GetGroup(),v->GetElement(),
 122                                               v->GetVR() );
 123          }
 124          else
 125          {
 126           // We skip gdcm::SeqEntries
 127          }
 128       }
 129       d = f1->GetNextEntry();
 130    }
 131
 132    // User knows the image is a 'color' one -RGB, YBR, Palette Color-
 133    // and wants to write it as RGB
 134    copy->SetImageData(imageData, fh1->GetImageDataSize());
 135    copy->SetWriteModeToRGB();
 136
 137    copy->WriteDcmExplVR( output );
 138
 139
 140    delete f1;
 141    delete fh1;
 142    delete copy;
 143
 144    exit (0);
 145 }
 146