Example/exGrey2RGB.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: exGrey2RGB.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2005/07/19 15:19:25 $
   7   Version:   $Revision: 1.3 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18 #include "gdcmFile.h"
  19 #include "gdcmFileHelper.h"
  20 #include "gdcmDocument.h"
  21 #include "gdcmValEntry.h"
  22 #include "gdcmBinEntry.h"
  23 #include "gdcmDebug.h"
  24
  25 #ifndef _WIN32
  26 #include <unistd.h> //for access, unlink
  27 #else
  28 #include <io.h> //for _access
  29 #endif
  30
  31 // return true if the file exists
  32 bool FileExists(const char *filename)
  33 {
  34 #ifdef _MSC_VER
  35 # define access _access
  36 #endif
  37 #ifndef R_OK
  38 # define R_OK 04
  39 #endif
  40   if ( access(filename, R_OK) != 0 )
  41     {
  42     return false;
  43     }
  44   else
  45     {
  46     return true;
  47     }
  48 }
  49
  50 bool RemoveFile(const char *source)
  51 {
  52 #ifdef _MSC_VER
  53 #define _unlink unlink
  54 #endif
  55   return unlink(source) != 0 ? false : true;
  56 }
  57
  58 // Here we load a gdcmFile (8 or 16 Bits) and convert it into a 8 or 16 RGB file
  59
  60 int main(int argc, char *argv[])
  61 {
  62    if (argc < 3)
  63    {
  64       std::cerr << "Usage :" << std::endl <<
  65       argv[0] << " input_dicom output_dicom" << std::endl;
  66       return 1;
  67    }
  68
  69    //gdcm::Debug::DebugOn();
  70
  71    std::string filename = argv[1];
  72    std::string output   = argv[2];
  73
  74    if( FileExists( output.c_str() ) )
  75    {
  76       std::cerr << "Don't try to cheat, I am removing the file anyway" << std::endl;
  77       if( !RemoveFile( output.c_str() ) )
  78       {
  79          std::cerr << "Ouch, the file exist, but I cannot remove it" << std::endl;
  80          return 1;
  81       }
  82    }
  83
  84    gdcm::FileHelper *fh = new gdcm::FileHelper( );
  85    fh->SetFileName( filename );
  86    fh->Load();
  87
  88    size_t dataSize    = fh->GetImageDataSize();
  89    uint8_t *imageData = fh->GetImageData();
  90
  91    uint8_t *imageDataRGB = new uint8_t[dataSize*3];
  92
  93    if (fh->GetFile()->GetEntryValue(0x0028,0x0100) == "8" )
  94    {
  95       for (unsigned int i=0;i<dataSize;i++)
  96       {
  97          imageDataRGB[i*3]=imageDataRGB[i*3+1]
  98                           =imageDataRGB[i*3+2]
  99                           =imageData[i];
 100       }
 101    }
 102    else
 103    {
 104       for (unsigned int i=0;i<dataSize/2;i++)
 105       {
 106         //std::cout << i << std::endl;
 107          ((uint16_t *)imageDataRGB)[i*3]=((uint16_t *)imageDataRGB)[i*3+1]
 108                                         =((uint16_t *)imageDataRGB)[i*3+2]
 109                                         =((uint16_t *)imageData)[i];
 110       }
 111    }
 112    // Samples Per Pixel
 113    fh->GetFile()->InsertValEntry( "3 " ,0x0028,0x0002);
 114    // Photometric Interpretation
 115    fh->GetFile()->InsertValEntry( "RGB ",0x0028,0x0004 );
 116    // Planar Configuration
 117    fh->GetFile()->InsertValEntry( "1 ",0x0028,0x0006 );
 118
 119    // TODO  : free existing PixelData first !
 120
 121    fh->SetImageData(imageDataRGB, dataSize*3);
 122    fh->WriteDcmExplVR( output );
 123
 124    return 0;
 125 }
 126
 127