Example/exImageLighten.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: exImageLighten.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2005/10/18 08:35:44 $
   7   Version:   $Revision: 1.8 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
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  17 =========================================================================*/
  18
  19 #include "gdcmFile.h"
  20 #include "gdcmFileHelper.h"
  21 #include "gdcmDocument.h"
  22 #include "gdcmDataEntry.h"
  23 #include "gdcmSeqEntry.h"
  24
  25 #include <stdlib.h> // for exit
  26
  27 int main(int argc, char *argv[])
  28 {
  29    std::cout << "-----------------------------------------------" << std::endl;
  30    std::cout << "Removes from a full gdcm-readable  Dicom image"  << std::endl;
  31    std::cout << " all the 'Shadow groups' and the 'Sequence' entries"
  32           << " Warning :  'Compressed images' are uncompressed"
  33           << std::endl
  34           << "         :  'YBR images' are converted into 'RGB images'"
  35           << std::endl
  36           << "         :  'RGB planes' are converted into 'RGB pixels'"
  37           << std::endl
  38           << "         :  'Palette Color images' are kept 'as is'"
  39           << std::endl;
  40    std::cout << "-----------------------------------------------" << std::endl;
  41
  42    if( argc < 3 )
  43     {
  44        std::cerr << "Usage " << argv[0]  << " Source image.dcm  "
  45                  << " Output image.dcm " << std::endl;
  46        return 1;
  47     }
  48
  49    std::string fileName       = argv[1];
  50    std::string output         = argv[2];
  51
  52 // ============================================================
  53 //   Read the input image.
  54 // ============================================================
  55
  56    std::cout << argv[1] << std::endl;
  57
  58    gdcm::File *f = new gdcm::File();
  59    f->SetLoadMode( gdcm::LD_ALL);
  60    f->SetFileName( fileName );
  61    bool res = f->Load();
  62
  63    if (!res) {
  64        std::cerr << "Sorry, " << fileName <<"  not a gdcm-readable "
  65                  << "DICOM / ACR File"
  66                  <<std::endl;
  67        return 0;
  68    }
  69    std::cout << " ... is readable " << std::endl;
  70
  71 // ============================================================
  72 //   Read the Pixels
  73 //
  74 // ============================================================
  75
  76    // Pixel Reading must be done here, to be sure
  77    // to load the Palettes Color (if any)
  78
  79    // First, create a gdcm::FileHelper
  80    gdcm::FileHelper *fh = new gdcm::FileHelper(f);
  81
  82    // Load the pixels, DO NOT transform LUT (if any) into RGB Pixels
  83    uint8_t *imageDataRaw = fh->GetImageDataRaw();
  84    // Get the image data size
  85    size_t dataRawSize    = fh->GetImageDataRawSize();
  86
  87 // ============================================================
  88 //   Create a new gdcm::Filehelper, to hold new image.
  89 // ============================================================
  90
  91    gdcm::FileHelper *copy = new gdcm::FileHelper( );
  92    copy->SetFileName( output );
  93    copy->Load();
  94
  95 // ============================================================
  96 //   Selective copy of the entries (including Pixel Element).
  97 // ============================================================
  98
  99    gdcm::DocEntry *d = f->GetFirstEntry();
 100    while(d)
 101    {
 102       // We skip SeqEntries, since user cannot do much with them
 103       if ( !(dynamic_cast<gdcm::SeqEntry*>(d))
 104       // We skip Shadow Groups, since nobody knows what they mean
 105            && !( d->GetGroup()%2 ) )
 106       {
 107
 108          if ( gdcm::DataEntry *de = dynamic_cast<gdcm::DataEntry *>(d) )
 109          {
 110             copy->GetFile()->InsertEntryBinArea( de->GetBinArea(),de->GetLength(),
 111                                                  de->GetGroup(),de->GetElement(),
 112                                                  de->GetVR() );
 113          }
 114          else
 115          {
 116           // We skip gdcm::SeqEntries
 117          }
 118       }
 119       d = f->GetNextEntry();
 120    }
 121
 122    // User wants to keep the Palette Color -if any-
 123    // and write the image as it was
 124    copy->SetImageData(imageDataRaw, dataRawSize);
 125    copy->SetWriteModeToRaw();
 126    copy->WriteDcmExplVR( output );
 127
 128    std::cout << std::endl
 129              << "------------------------------------------------------------"
 130              << std::endl;
 131    delete f;
 132    delete fh;
 133    delete copy;
 134
 135    exit (0);
 136 }
 137