Example/exImageLighten.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: exImageLighten.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2005/07/07 17:31:54 $
   7   Version:   $Revision: 1.3 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
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  17 =========================================================================*/
  18
  19 #include "gdcmFile.h"
  20 #include "gdcmFileHelper.h"
  21 #include "gdcmDocument.h"
  22 #include "gdcmValEntry.h"
  23 #include "gdcmBinEntry.h"
  24 #include "gdcmSeqEntry.h"
  25
  26 #include <stdlib.h> // for exit
  27
  28 int main(int argc, char *argv[])
  29 {
  30    std::cout << "-----------------------------------------------" << std::endl;
  31    std::cout << "Removes from a full gdcm-readable  Dicom image"  << std::endl;
  32    std::cout << " all the 'Shadow groups' and the 'Sequence' entries"
  33           << " Warning :  'Compressed images' are uncompressed"
  34           << std::endl
  35           << "         :  'YBR images' are converted into 'RGB images'"
  36           << std::endl
  37           << "         :  'RGB planes' are converted into 'RGB pixels'"
  38           << std::endl
  39           << "         :  'Palette Color images' are kept 'as is'"
  40           << std::endl;
  41    std::cout << "-----------------------------------------------" << std::endl;
  42
  43    if( argc < 3 )
  44     {
  45        std::cerr << "Usage " << argv[0]  << " Source image.dcm  "
  46                  << " Output image.dcm " << std::endl;
  47        return 1;
  48     }
  49
  50    std::string fileName       = argv[1];
  51    std::string output         = argv[2];
  52
  53 // ============================================================
  54 //   Read the input image.
  55 // ============================================================
  56
  57    std::cout << argv[1] << std::endl;
  58
  59    gdcm::File *f = new gdcm::File();
  60    f->SetLoadMode( 0x00000000);
  61    f->SetFileName( fileName );
  62    bool res = f->Load();
  63
  64    if (!res) {
  65        std::cerr << "Sorry, " << fileName <<"  not a gdcm-readable "
  66                  << "DICOM / ACR File"
  67                  <<std::endl;
  68        return 0;
  69    }
  70    std::cout << " ... is readable " << std::endl;
  71
  72 // ============================================================
  73 //   Read the Pixels
  74 //
  75 // ============================================================
  76
  77    // Pixel Reading must be done here, to be sure
  78    // to load the Palettes Color (if any)
  79
  80    // First, create a gdcm::FileHelper
  81    gdcm::FileHelper *fh = new gdcm::FileHelper(f);
  82
  83    // Load the pixels, DO NOT transform LUT (if any) into RGB Pixels
  84    uint8_t *imageDataRaw = fh->GetImageDataRaw();
  85    // Get the image data size
  86    size_t dataRawSize    = fh->GetImageDataRawSize();
  87
  88 // ============================================================
  89 //   Create a new gdcm::Filehelper, to hold new image.
  90 // ============================================================
  91
  92    gdcm::FileHelper *copy = new gdcm::FileHelper( output );
  93
  94 // ============================================================
  95 //   Selective copy of the entries (including Pixel Element).
  96 // ============================================================
  97
  98    gdcm::DocEntry *d = f->GetFirstEntry();
  99
 100    d = f->GetFirstEntry();
 101    while(d)
 102    {
 103       // We skip SeqEntries, since user cannot do much with them
 104       if ( !(dynamic_cast<gdcm::SeqEntry*>(d))
 105       // We skip Shadow Groups, since nobody knows what they mean
 106            && !( d->GetGroup()%2 ) )
 107       {
 108
 109          if ( gdcm::BinEntry *b = dynamic_cast<gdcm::BinEntry*>(d) )
 110          {
 111             copy->GetFile()->InsertBinEntry( b->GetBinArea(),b->GetLength(),
 112                                              b->GetGroup(),b->GetElement(),
 113                                              b->GetVR() );
 114          }
 115          else if ( gdcm::ValEntry *v = dynamic_cast<gdcm::ValEntry*>(d) )
 116          {
 117              copy->GetFile()->InsertValEntry( v->GetValue(),
 118                                               v->GetGroup(),v->GetElement(),
 119                                               v->GetVR() );
 120          }
 121          else
 122          {
 123           // We skip gdcm::SeqEntries
 124          }
 125       }
 126       d = f->GetNextEntry();
 127    }
 128
 129    // User wants to keep the Palette Color -if any-
 130    // and write the image as it was
 131    copy->SetImageData(imageDataRaw, dataRawSize);
 132    copy->SetWriteModeToRaw();
 133    copy->WriteDcmExplVR( output );
 134
 135    std::cout << std::endl
 136              << "------------------------------------------------------------"
 137              << std::endl;
 138    delete f;
 139    delete fh;
 140    delete copy;
 141
 142    exit (0);
 143 }
 144