Example/exSerieHelper.cxx

   1 /*=========================================================================
   2
   3   Program:   gdcm
   4   Module:    $RCSfile: exSerieHelper.cxx,v $
   5   Language:  C++
   6   Date:      $Date: 2007/06/22 11:01:57 $
   7   Version:   $Revision: 1.13 $
   8
   9   Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche et d'Applications en Traitement de
  10   l'Image). All rights reserved. See Doc/License.txt or
  11   http://www.creatis.insa-lyon.fr/Public/Gdcm/License.html for details.
  12
  13      This software is distributed WITHOUT ANY WARRANTY; without even
  14      the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR
  15      PURPOSE.  See the above copyright notices for more information.
  16
  17 =========================================================================*/
  18 #include "gdcmSerieHelper.h"
  19 #include "gdcmFile.h"
  20 #include "gdcmDirList.h" // for FileList
  21 #include "gdcmDebug.h"
  22 #include <iostream>
  23
  24 int main(int argc, char *argv[])
  25 {
  26    GDCM_NAME_SPACE::SerieHelper *s;
  27
  28    std::string dirName;
  29    if (argc > 1)
  30       dirName = argv[1];
  31    else
  32    {
  33       dirName = GDCM_DATA_ROOT;
  34    }
  35
  36    if (argc > 2)
  37       GDCM_NAME_SPACE::Debug::DebugOn();
  38
  39
  40    std::cout << "Dir Name :[" << dirName << "]" << std::endl;
  41    //
  42    // Something, using only SerieHelper is not enought !
  43    // See also exXcoherentFileSet
  44    //
  45
  46    s = GDCM_NAME_SPACE::SerieHelper::New();
  47    s->SetLoadMode(GDCM_NAME_SPACE::LD_ALL);     // Load everything for each File
  48    //GDCM_NAME_SPACE::TagKey t(0x0020,0x0013);
  49    //s->AddRestriction(t, "340", GDCM_NAME_SPACE::GDCM_LESS); // Keep only files where
  50                                               // restriction is true
  51    s->SetDirectory(dirName, true); // true : recursive exploration
  52
  53    std::cout << " ---------------------------------------- Finish parsing :["
  54              << dirName << "]" << std::endl;
  55
  56    s->Print();
  57    std::cout << " ---------------------------------------- Finish printing (1)"
  58              << std::endl;
  59
  60
  61    GDCM_NAME_SPACE::FileList::const_iterator it;
  62    GDCM_NAME_SPACE::FileList *l;
  63    std::cout << " ---------------------------------------- Recap"
  64              << std::endl;
  65    l = s->GetFirstSingleSerieUIDFileSet();
  66    while (l)
  67    {
  68       it = l->begin();
  69       std::cout << "SerieUID [" <<  (*it)->GetEntryString(0x0020,0x000e) <<"]   Serie Description ["
  70                 << (*it)->GetEntryString(0x0008,0x103e) << "] "
  71                 << " : " << l->size() << " files" << std::endl;
  72       l = s->GetNextSingleSerieUIDFileSet();
  73    }
  74     std::cout << " ----------------------------------------End Recap"
  75              << std::endl;
  76
  77    int nbFiles;
  78    double zspacing = 0.;
  79    // For all the Single SerieUID Files Sets of the GDCM_NAME_SPACE::Serie
  80    l = s->GetFirstSingleSerieUIDFileSet();
  81    while (l)
  82    {
  83       nbFiles = l->size() ;
  84       if ( l->size() > 5 ) // Why not ? Just an example, for testing
  85       {
  86          std::cout << "Sort list : " << nbFiles << " long" << std::endl;
  87
  88          //---------------------------------------------------------
  89          s->OrderFileList(l);  // sort the list (and compute ZSpacing !)
  90          //---------------------------------------------------------
  91
  92           zspacing = s->GetZSpacing();
  93          // Just to show : GetZSpacing from a GDCM_NAME_SPACE::SerieHelper is right
  94          std::cout << "GetZSpacing() of sorted SingleSerieUIDFileSet "
  95                    << "from GDCM_NAME_SPACE::SerieHelper: " << zspacing << std::endl;
  96          std::cout << " ('-1' means all the files have the same position)" << std::endl;
  97          for (std::vector<GDCM_NAME_SPACE::File* >::iterator it2 =  l->begin();
  98                                             it2 != l->end();
  99                                           ++it2)
 100          {
 101           // Just to show : GetZSpacing from a GDCM_NAME_SPACE::File may be different
 102              std::cout << (*it2)->GetFileName() << " -->  GetZSpacing() from GDCM_NAME_SPACE::File : "
 103                        << (*it2)->GetZSpacing() << std::endl;
 104          }
 105
 106          break; // we only deal with the first one ... Why not ?
 107       }
 108       l = s->GetNextSingleSerieUIDFileSet();
 109    }
 110    std::cout << " ------------------Prints all the Single SerieUID File Sets (sorted or not) -----"
 111              << std::endl;
 112    s->Print(); // Prints all the Single SerieUID File Sets (sorted or not)
 113    std::cout << " -------------------------------------------- Finish printing"
 114              << std::endl;
 115
 116    s->Delete();
 117
 118    return 0;
 119 }