Example/toBrainVisa.cxx

   1 #include "gdcmFile.h"
   2 #include "gdcmFileHelper.h"
   3 #include "gdcmDocument.h"
   4 #include "gdcmDataEntry.h"
   5 #include "gdcmArgMgr.h"
   6
   7    START_USAGE(usage)
   8    " \n toBrainVisa :\n                                                       ",
   9    "   Extracts user supplied tags (identified by group number-element number)",
  10    "   and writes their values in a text file.                                ",
  11    "   (file will be used as input by BrainVisa software )                    ",
  12    " usage :                                                                  ",
  13    " toBrainVisa      filein=inputFileName  (a DICOM file)                    ",
  14    "                  fileoutout=outputFileName                               ",
  15    "                  tags= list of tags to process                           ",
  16    "                  [verbose] [debug]                                       ",
  17    "                                                                          ",
  18    " e.g. : tags=0020-0052,0008-0021,0018-1030 (no space!)                    ",
  19    " dirout : will be created (as a text file) if doesn't exist               ",
  20    " verbose  : user wants to run the program in 'verbose mode'               ",
  21    " debug    : *developer*  wants to run the program in 'debug mode'         ",
  22    FINISH_USAGE
  23
  24 int main (int argc , char *argv[])
  25 {
  26    // ============== Initialize Arguments Manager =============================
  27
  28    GDCM_NAME_SPACE::ArgMgr *am = new GDCM_NAME_SPACE::ArgMgr(argc, argv);
  29
  30    if (argc == 1 || am->ArgMgrDefined("usage"))
  31    {
  32       am->ArgMgrUsage(usage); // Display 'usage'
  33       delete am;
  34       return 0;
  35    }
  36
  37    const char *filein;
  38    filein  = am->ArgMgrGetString("filein",".");
  39
  40    const char *fileout;
  41    fileout  = am->ArgMgrGetString("fileout",".");
  42
  43    int verbose  = am->ArgMgrDefined("verbose");
  44
  45    int nbTags;
  46    uint16_t *tags = am->ArgMgrGetXInt16Enum("tags", &nbTags);
  47
  48    // if unused Param we give up
  49    if ( am->ArgMgrPrintUnusedLabels() )
  50    {
  51       am->ArgMgrUsage(usage);
  52       delete am;
  53       return 0;
  54    }
  55    delete am;  // we don't need Argument Manager any longer
  56
  57    // ==================== Begin Processing =====================================
  58
  59    FILE *fp;
  60    fp=fopen(fileout, "w");
  61    if (fp == 0)
  62    {
  63       std::cout << "Failed to open [" << fileout << "] for writting" << std::endl;
  64       return 0;
  65    }
  66    GDCM_NAME_SPACE::File *f = GDCM_NAME_SPACE::File::New();
  67    f->SetLoadMode( GDCM_NAME_SPACE::LD_ALL);
  68    f->SetFileName( filein );
  69    bool res = f->Load();
  70
  71    if (!res)
  72    {
  73        std::cout << "Sorry, [" << filein << "]  not a gdcm-readable "
  74                  << "DICOM / ACR File"
  75                  <<std::endl;
  76        f->Delete();
  77        return 0;
  78    }
  79    if (verbose)
  80       std::cout << "[" << filein << "] is readable " << std::endl;
  81
  82    for(int i=0; i<nbTags; i++)
  83    {
  84       std::string toto = f->GetEntryString(tags[2*i], tags[2*i+1]);
  85       fprintf(fp, "%s\n", toto.c_str() );
  86       if (verbose)
  87          std::cout << "[" << toto << "]" << std::endl;
  88    }
  89
  90   f->Delete();
  91   fclose (fp);
  92
  93 }