Linux/installscript

   1 # ---------------------------------------------------------------------
   2 #
   3 # Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image
   4 #                        pour la Santé)
   5 # Authors : Eduardo Davila, Frederic Cervenansky, Claire Mouton
   6 #
   7 #  This software is governed by the CeCILL-B license under French law and
   8 #  abiding by the rules of distribution of free software. You can  use,
   9 #  modify and/ or redistribute the software under the terms of the CeCILL-B
  10 #  license as circulated by CEA, CNRS and INRIA at the following URL
  11 #  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  12 #  or in the file LICENSE.txt.
  13 #
  14 #  As a counterpart to the access to the source code and  rights to copy,
  15 #  modify and redistribute granted by the license, users are provided only
  16 #  with a limited warranty  and the software's author,  the holder of the
  17 #  economic rights,  and the successive licensors  have only  limited
  18 #  liability.
  19 #
  20 #  The fact that you are presently reading this means that you have had
  21 #  knowledge of the CeCILL-B license and that you accept its terms.
  22 # ------------------------------------------------------------------------
  23
  24 #!/bin/bash -e
  25
  26 #   <<<<<<< HEAD
  27 #
  28 #   #This code is for Mac
  29 #   function EEDreadlink() {
  30 #     DIR="${1%/*}"
  31 #     (cd "$DIR" && echo "$(pwd -P)")
  32 #   }
  33 #
  34 #
  35 #   #EED 2120-08-25  This code is not working in MacOS so we use EEDreadlink()
  36 #   #EED scriptDirName=$(dirname $(Ereadlink -f $0) )
  37 #   scriptDirName=$(dirname $(Ereadlink  $0) )/Linux
  38 #   =======
  39 #   #EED 2018-08-26
  40 #
  41 #   #scriptDirName=$(dirname $(readlink -f $0) )
  42 #   scriptDirName=$(pwd)
  43 #   >>>>>>> origin/vtk8itk5wx3-mingw64
  44    scriptDirName=$(pwd)
  45
  46
  47 #########################################################################
  48 ############     Local Functions  #######################################
  49 #########################################################################
  50
  51
  52 echo scriptDirName $scriptDirName
  53
  54
  55
  56
  57 source scripts/LocalFunctions.sh
  58
  59 configureFile="scripts/CreaTools-configure.sh"
  60
  61
  62 # default configuration parameters
  63 OperatingSystem=`getDistrib`
  64 corenumber=`getncore`
  65 generationdir=$HOME/Creatis/C11
  66 installPrefixThird=
  67 installPrefix=
  68 docgeneration=OFF
  69 sourcesFrom=GIT
  70
  71
  72 loginUserName=$USER
  73 loginGroupName=`groups | awk '{print $1}'`
  74 buildType=Release
  75 gdcmVersion=GDCM1
  76 ITKVersion=ITK4
  77 export ETC_BASHRC=`getbashrc`
  78 TDx=OFF
  79
  80
  81 function usage {
  82     echo "installscript [options] command"
  83     echo "creatools configure/compile/install script"
  84     echo ""
  85     echo ""
  86     echo "OPTIONS ARE USE FOR CONFIGURATION ONLY: THEY WILL BE IGNORED IF <COMMAND> IS NOT \"CONFIG\" OR \"ALL\""
  87     echo ""
  88     echo ""
  89     echo "    command:"
  90     echo ""
  91     echo "    as a normal user:"
  92     echo "         config                    : set the configuration parameters only"
  93     echo "         "
  94     echo "    need root password:"
  95     echo "         3rd                       : Get, Compile, Install all 3rd party library "
  96     echo "         3rd-base                  : Install basic tools (cmake, doxygen...)"
  97     echo "         3rd-vtk                   : Get, Compile, Install vtk"
  98     echo "         3rd-itk                   : Get, Compile, Install itk"
  99     echo "         3rd-gdcm                  : Get, Compile, Install gdcm"
 100     echo "         3rd-wx                    : Get, Compile, Install wx widget (for Mac Users)"
 101     echo "         3rd-wt                    : Get, Compile, Install wt"
 102     echo "   "
 103     echo "    as a normal user:"
 104     echo "         creatools                 : Get Compile and Install the CreaTools"
 105     echo "         creatools-get             : Get the CreaTools"
 106     echo "         creatools-cmp             : Compile the CreaTools"
 107     echo "         creatools-install         : Install the CreaTools"
 108     echo "   "
 109     echo "         creatools-generateBinTGZ  : generation of CreaTools.tgz (binary version)"
 110     echo "   "
 111     echo "         uninstall                 : uninstall the creatools"
 112     echo "   "
 113     echo "         printconfig               : print the configuration"
 114     echo "         help                      : print help"
 115     echo "         env                       : print some environnement variables"
 116     echo ""
 117     echo "         all                       : configure / compile / install"
 118     echo "         "
 119     echo "   "
 120     echo "   "
 121     echo "   "
 122     echo "   "
 123     echo "    configure options: !!!!! IGNORED IF COMMAND IS NOT CONFIG OR ALL !!!!!!"
 124     echo "        -os <os>              : operating system distribution (default $OperatingSystem)"
 125     echo "        -ncore <n>            : number of core to use (default $corenumber)"
 126     echo "        -gdir <dir>           : generation directory (default $generationdir)"
 127     echo "        -instprefix <dir>     : creatools install prefix"
 128     echo "        -instprefix3 <dir>    : 3rd party library install prefix"
 129     echo "        -html                 : get creatools from HTML"
 130     echo "        -git                  : get creatools from git (CREATIS user only)"
 131     echo "        -git-read-only        : get creatools from git (anonymously, no write access)"
 132     echo "        -build                : build type Release, RelWithDebug or Debug (default RelWithDebug)"
 133     echo ""
 134     echo "     experimental configure options (use at your own risk!!):"
 135     echo "        -gdcm2         : use GDCM2 "
 136     echo "        -doc           : generate documentation"
 137     echo "        -itk4          : use ITK4"
 138     echo ""
 139     exit 1
 140 }
 141
 142 ##################################################
 143 # parse command line
 144 while [ $# -ge 1 ] ; do
 145     case $1 in
 146         -os)                OperatingSystem=$2;                        shift 2;;
 147         -ncore)             corenumber=$2;                             shift 2;;
 148         -gdir)              generationdir=$2;                          shift 2;;
 149         -instprefix)        installPrefix=$2;                          shift 2;;
 150         -instprefix3)       installPrefixThird=$2;                     shift 2;;
 151         -doc)               docgeneration=ON;                          shift 1;;
 152         -html)              sourcesFrom=HTML;                          shift 1;;
 153         -git)               sourcesFrom=GIT;                           shift 1;;
 154         -git-read-only)     sourcesFrom=GIT-READ-ONLY;
 155 shift 1;;
 156         -gdcm2)             gdcmVersion=GDCM2;                         shift 1;;
 157         -itk4)              ITKVersion=ITK4;                           shift 1;;
 158         -build)             buildType=$2;                              shift 2;;
 159         *) break;;
 160     esac
 161 done
 162
 163 if [ $# -le 0 ] ; then usage; fi
 164
 165 command=$1
 166
 167 # check that command is valid
 168 if [ `checkVal $command all config 3rd 3rd-base 3rd-vtk 3rd-itk 3rd-gdcm 3rd-wx 3rd-wt creatools creatools-get creatools-cmp creatools-install creatools-generateBinTGZ uninstall printconfig help env` == "false" ] ; then
 169     echo "Unrecognized command: $command"
 170     echo ""
 171     usage
 172 fi
 173
 174
 175 ############################## use existing configuration if command is not config or all
 176 if [ `checkVal $command config all` == false ] ; then
 177     if [ ! -f $configureFile ] ; then
 178         echo "scripts/CreaTools-configure.sh does not exists"
 179         echo "please run the scripts with command \"config\" or \"all\""
 180         exit
 181     fi
 182     source $configureFile
 183     if [ ! -f $installPrefixThird/share/creatools/creatools_third_party_library_config.sh ] ; then
 184         echo WARNING
 185         echo "the curently used Third Party libraries are NOT in $installPrefixThird but ... in :"
 186         grep "installPrefixThird=" $ETC_BASHRC
 187         echo "VTK_DIR  : " $VTK_DIR
 188         echo "ITK_DIR  : " $ITK_DIR
 189         echo "GDCM_DIR : " $GDCM_DIR
 190         echo "(Have a look at $ETC_BASHRC=, edit it or run again Install Third Party Libraries if you disagree)"
 191
 192 #        exit
 193     fi
 194
 195 fi
 196
 197 ##################################################################################
 198 ############################ check configuration parameters
 199 # check distribÒ
 200 checkDistrib $OperatingSystem
 201
 202 # complete default install prefix
 203 if [ -z "$installPrefix" ]      ; then installPrefix=$generationdir/ci; fi
 204 if [ -z "$installPrefixThird" ] ; then installPrefixThird=$generationdir/tpli; fi
 205
 206 # check build type
 207 if [ `checkVal $buildType Release Debug RelWithDebug` == "false" ] ; then
 208     echo "Unsupported build type: $buildType"
 209     echo "Please use one of: Release Debug RelWithDebug"
 210     exit 1
 211 fi
 212
 213
 214 ##################################################################################
 215 ############################  write configuration file
 216 if [ `checkVal $command config all` == true ] ; then
 217     echo "#!/bin/bash"                            >  $configureFile
 218     echo                                          >> $configureFile
 219     echo "#File generated by 'installscript'"           >> $configureFile
 220     echo "#DO NOT edit !"                         >> $configureFile
 221     echo "#(except if you *do* know what you do)" >> $configureFile
 222     echo                                          >> $configureFile
 223     echo "OperatingSystem=$OperatingSystem"       >> $configureFile
 224     echo "corenumber=$corenumber"                 >> $configureFile
 225     echo "generationdir=$generationdir"           >> $configureFile
 226     echo "installPrefix=$installPrefix"           >> $configureFile
 227     echo "installPrefixThird=$installPrefixThird" >> $configureFile
 228     echo "docgeneration=$docgeneration"           >> $configureFile
 229     echo "sourcesFrom=$sourcesFrom"               >> $configureFile
 230     echo "loginUserName=$loginUserName"           >> $configureFile
 231     echo "loginGroupName=$loginGroupName"         >> $configureFile
 232     echo "buildType=$buildType"                   >> $configureFile
 233     echo "gdcmVersion=$gdcmVersion"               >> $configureFile
 234     echo "ITKVersion=$ITKVersion"                 >> $configureFile
 235     echo "ETC_BASHRC=$ETC_BASHRC"                 >> $configureFile
 236     echo "TDx=$TDx"                               >> $configureFile
 237 fi
 238
 239
 240
 241 ################################### print current configuration
 242 printconfig
 243
 244
 245 ##################################################################################
 246 ##################################################################################
 247 ############   Process commands
 248 ##################################################################################
 249 ##################################################################################
 250
 251
 252 ################################################################################## config printconfig
 253 # config or printconfig : already done
 254 if [ `checkVal $command config printconfig` == true ] ; then
 255     exit
 256 fi
 257
 258 ################################################################################## creatools
 259 # download creatools
 260 if [ `checkVal $command all creatools creatools-get` == true ] ; then
 261     bigDisplay "DOWNLOAD CREATOOLS"
 262     bash scripts/CreaTools-load.sh
 263 fi
 264
 265 ################################################################################## 3rd library
 266 # install packaged dependencies as root
 267 if [ `checkVal $command all 3rd 3rd-base` == true ] ; then
 268     bigDisplay "INSTALL PACKAGES DEPENDENCIES"
 269     bash scripts/CreaTools-configure.sh
 270     cd scripts
 271     source ThirdParty-install-Base-Stuff.sh $OperatingSystem
 272     cd ..
 273     bash scripts/ThirdParty-install.sh
 274 fi
 275
 276 # vtk
 277 if [ `checkVal $command all 3rd 3rd-vtk` == true ] ; then
 278     bigDisplay "INSTALL VTK"
 279     bash scripts/ThirdParty-install-VTK.sh
 280     cd $scriptDirName
 281 fi
 282
 283 # gdcm
 284 if [ `checkVal $command all 3rd 3rd-gdcm` == true ] ; then
 285     bigDisplay "INSTALL $gdcmVersion"
 286     bash scripts/ThirdParty-install-gdcm.sh
 287     pwd
 288     echo $scriptDirName
 289     cd $scriptDirName
 290 fi
 291
 292 # itk
 293 if [ `checkVal $command all 3rd 3rd-itk` == true ] ; then
 294         bigDisplay "INSTALL $ITKVersion"
 295         bash scripts/ThirdParty-install-ITK.sh
 296     cd $scriptDirName
 297 fi
 298
 299 # wt
 300 if [ `checkVal $command all 3rd 3rd-wt` == true ] ; then
 301     bigDisplay "INSTALL WT"
 302     bash scripts/ThirdParty-install-WT.sh
 303     cd $scriptDirName
 304 fi
 305
 306 # Setup the user .bashrc correctly
 307 if [ `checkVal $command all 3rd 3rd-vtk 3rd-itk 3rd-gdcm 3rd-wx 3rd-wt ` == true ] ; then
 308     bigDisplay "FINALIZE 3RD PARTY LIBRARY INSTALLATION"
 309     bash scripts/ThirdParty-install-Finalize.sh
 310     if [ `checkVal $command 3rd 3rd-vtk 3rd-itk 3rd-gdcm 3rd-wx ` == true ] ; then
 311         bigDisplay "Third Party Install Done"
 312         bigDisplay "Please copy paste the following command or open a new terminal: source ~/.bashrc"
 313     fi
 314 fi
 315
 316 ################################################################################## creatools
 317 # compile creatools
 318 if [ `checkVal $command all creatools creatools-cmp` == true ] ; then
 319     bigDisplay "COMPILE CREATOOLS"
 320 echo "EED installscript compile creatools"
 321 echo $ETC_BASHRC
 322     source $ETC_BASHRC
 323     bash -x scripts/CreaTools-compile.sh
 324
 325     # To allow (*very* aware) user to patch code, later
 326     if [ ! -e $generationdir/creatools_source ] ; then
 327         echo "You probabely made a mistake : "
 328         echo "Directory $loginUserName $generationdir/creatools_source not found"
 329         echo "Make sure you know the mistake"
 330         echo "Hit any key to continue"
 331         echo "Fix the mistake!"
 332         read a
 333     else
 334         chown -R $loginUserName  $generationdir/creatools_source
 335         chgrp -R $loginGroupName $generationdir/creatools_source
 336     fi
 337 fi
 338
 339 #install creatools
 340 if [ `checkVal $command all creatools creatools-install` == true ] ; then
 341     bigDisplay "INSTALL CREATOOLS"
 342     source $ETC_BASHRC
 343     bash scripts/CreaTools-install.sh
 344     source $ETC_BASHRC
 345     echo " "
 346     echo " "
 347     echo " "
 348     echo " "
 349     echo "Open a new terminal to run creatools."
 350     echo "(Close this window and continue....) "
 351     echo " "
 352     echo " "
 353     ##EED read -p "Press [Enter] key to continue..."
 354 fi
 355
 356 #generate TGZ version of the bin (Creatools and ThirdParty)
 357 if [ `checkVal $command creatools-generateBinTGZ` == true ] ; then
 358     bash scripts/CreaTools-GenerateBinTGZ.sh
 359 fi
 360
 361 ################################################################################## uninstall
 362 if [ `checkVal $command uninstall` == true ] ; then
 363     bigDisplay "UNINSTALL CREATOOLS"
 364     bash scripts/CreaTools-uninstall.sh
 365 fi
 366
 367 ################################################################################## help
 368 if [ `checkVal $command help` == true ] ; then
 369     cat README.txt
 370 fi
 371
 372 ################################################################################## print env variables
 373 if [ `checkVal $command env` == true ] ; then
 374     if [ ! -f $installPrefixThird/share/creatools_third_party_library_config.sh ] ; then
 375         echo WARNING
 376         echo
 377         echo "the curently used Third Party libraries are NOT in $installPrefixThird but in :"
 378         grep "installPrefixThird=" $ETC_BASHRC
 379         echo "VTK_DIR  : " $VTK_DIR
 380         echo "ITK_DIR  : " $ITK_DIR
 381         echo "GDCM_DIR : " $GDCM_DIR
 382         echo
 383         echo "installPrefixThird ... " $installPrefixThird
 384     fi
 385
 386     if [ -f $installPrefixThird/share/creatools_third_party_library_config.sh ] ; then
 387         echo  "Third party config file : " $installPrefixThird/share/creatools_third_party_library_config.sh
 388         echo  ------
 389         cat $installPrefixThird/share/creatools_third_party_library_config.sh
 390         echo  ------
 391     fi
 392
 393     echo
 394
 395     if [ -f $installPrefix/share/creatools_base_library_config.sh ] ; then
 396        echo  "Creatools base library config file : " $installPrefix/share/creatools_base_library_config.sh
 397        echo  ------
 398        cat $installPrefix/share/creatools_base_library_config.sh
 399        echo  ------
 400        echo
 401        echo "installPrefix ... " $installPrefix
 402     fi
 403
 404     echo  ------
 405     echo "VTK_DIR  :                 " $VTK_DIR
 406     echo "ITK_DIR  :                 " $ITK_DIR
 407     echo "GDCM_DIR :                 " $GDCM_DIR
 408     echo
 409     echo "crea_DIR :                 " $crea_DIR
 410     echo "BBTK_DIR :                 " $BBTK_DIR
 411     echo "creaMaracasVisu_DIR :      " $creaMaracasVisu_DIR
 412     echo "creaEnvironment_DIR :      " $creaEnvironment_DIR
 413     echo "creaBruker_DIR :           " $creaBruker_DIR
 414     echo "creaImageIO_DIR :          " $creaImageIO_DIR
 415     echo "creaContours_DIR :         " $creaContours_DIR
 416     echo "creaRigidRegistration_DIR :" $creaRigidRegistration_DIR
 417     echo "bbtkGEditor_DIR :          " $bbtkGEditor_DIR
 418     echo "creaTools_DIR :            " $creaTools_DIR
 419     echo "creaMiniTools_DIR :        " $creaMiniTools_DIR
 420     echo "Ido_DIR :                  " $Ido_DIR
 421     echo "==================================="
 422     echo
 423
 424 fi
 425
 426
 427