Linux/installscript

   1 # ---------------------------------------------------------------------
   2 #
   3 # Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image
   4 #                        pour la Santé)
   5 # Authors : Eduardo Davila, Frederic Cervenansky, Claire Mouton
   6 #
   7 #  This software is governed by the CeCILL-B license under French law and
   8 #  abiding by the rules of distribution of free software. You can  use,
   9 #  modify and/ or redistribute the software under the terms of the CeCILL-B
  10 #  license as circulated by CEA, CNRS and INRIA at the following URL
  11 #  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  12 #  or in the file LICENSE.txt.
  13 #
  14 #  As a counterpart to the access to the source code and  rights to copy,
  15 #  modify and redistribute granted by the license, users are provided only
  16 #  with a limited warranty  and the software's author,  the holder of the
  17 #  economic rights,  and the successive licensors  have only  limited
  18 #  liability.
  19 #
  20 #  The fact that you are presently reading this means that you have had
  21 #  knowledge of the CeCILL-B license and that you accept its terms.
  22 # ------------------------------------------------------------------------
  23
  24 #!/bin/bash -e
  25
  26
  27 #This code is Mac
  28 function EEDreadlink() {
  29   DIR="${1%/*}"
  30   (cd "$DIR" && echo "$(pwd -P)")
  31 }
  32
  33
  34 #EED 2120-08-25  This code is not working in MacOS so we use EEDreadlink()
  35 #EED scriptDirName=$(dirname $(Ereadlink -f $0) )
  36 scriptDirName=$(dirname $(Ereadlink  $0) )/Linux
  37
  38 #########################################################################
  39 ############     Local Functions  #######################################
  40 #########################################################################
  41
  42
  43 source scripts/LocalFunctions.sh
  44
  45 configureFile="scripts/CreaTools-configure.sh"
  46
  47
  48 # default configuration parameters
  49 OperatingSystem=`getDistrib`
  50 corenumber=`getncore`
  51 generationdir=$HOME/Creatis/C11
  52 installPrefixThird=
  53 installPrefix=
  54 docgeneration=OFF
  55 sourcesFrom=GIT
  56
  57 loginUserName=$USER
  58 loginGroupName=`groups | awk '{print $1}'`
  59 buildType=Release
  60 gdcmVersion=GDCM1
  61 ITKVersion=ITK3
  62 export ETC_BASHRC=`getbashrc`
  63 TDx=ON
  64
  65
  66 function usage {
  67     echo "installscript [options] command"
  68     echo "creatools configure/compile/install script"
  69     echo ""
  70     echo ""
  71     echo "OPTIONS ARE USE FOR CONFIGURATION ONLY: THEY WILL BE IGNORED IF <COMMAND> IS NOT \"CONFIG\" OR \"ALL\""
  72     echo ""
  73     echo ""
  74     echo "    command:"
  75     echo ""
  76     echo "    as a normal user:"
  77     echo "         config                    : set the configuration parameters only"
  78     echo "         "
  79     echo "    need root password:"
  80     echo "         3rd                       : Get, Compile, Install all 3rd party library "
  81     echo "         3rd-base                  : Install basic tools (cmake, doxygen...)"
  82     echo "         3rd-vtk                   : Get, Compile, Install vtk"
  83     echo "         3rd-itk                   : Get, Compile, Install itk"
  84     echo "         3rd-gdcm                  : Get, Compile, Install gdcm"
  85     echo "         3rd-wx                    : Get, Compile, Install wx widget (for Mac Users)"
  86     echo "         3rd-wt                    : Get, Compile, Install wt"
  87     echo "   "
  88     echo "    as a normal user:"
  89     echo "         creatools                 : Get Compile and Install the CreaTools"
  90     echo "         creatools-get             : Get the CreaTools"
  91     echo "         creatools-cmp             : Compile the CreaTools"
  92     echo "         creatools-install         : Install the CreaTools"
  93     echo "   "
  94     echo "         creatools-generateBinTGZ  : generation of CreaTools.tgz (binary version)"
  95     echo "   "
  96     echo "         uninstall                 : uninstall the creatools"
  97     echo "   "
  98     echo "         printconfig               : print the configuration"
  99     echo "         help                      : print help"
 100     echo "         env                       : print some environnement variables"
 101     echo ""
 102     echo "         all                       : configure / compile / install"
 103     echo "         "
 104     echo "   "
 105     echo "   "
 106     echo "   "
 107     echo "   "
 108     echo "    configure options: !!!!! IGNORED IF COMMAND IS NOT CONFIG OR ALL !!!!!!"
 109     echo "        -os <os>              : operating system distribution (default $OperatingSystem)"
 110     echo "        -ncore <n>            : number of core to use (default $corenumber)"
 111     echo "        -gdir <dir>           : generation directory (default $generationdir)"
 112     echo "        -instprefix <dir>     : creatools install prefix"
 113     echo "        -instprefix3 <dir>    : 3rd party library install prefix"
 114     echo "        -html                 : get creatools from HTML"
 115     echo "        -git                  : get creatools from git (CREATIS user only)"
 116     echo "        -git-read-only        : get creatools from git (anonymously, no write access)"
 117     echo "        -build                : build type Release, RelWithDebug or Debug (default RelWithDebug)"
 118     echo ""
 119     echo "     experimental configure options (use at your own risk!!):"
 120     echo "        -gdcm2         : use GDCM2 "
 121     echo "        -doc           : generate documentation"
 122     echo "        -itk4          : use ITK4"
 123     echo ""
 124     exit 1
 125 }
 126
 127 ##################################################
 128 # parse command line
 129 while [ $# -ge 1 ] ; do
 130     case $1 in
 131         -os)                OperatingSystem=$2;                        shift 2;;
 132         -ncore)             corenumber=$2;                             shift 2;;
 133         -gdir)              generationdir=$2;                          shift 2;;
 134         -instprefix)        installPrefix=$2;                          shift 2;;
 135         -instprefix3)       installPrefixThird=$2;                     shift 2;;
 136         -doc)               docgeneration=ON;                          shift 1;;
 137         -html)              sourcesFrom=HTML;                          shift 1;;
 138         -git)               sourcesFrom=GIT;                           shift 1;;
 139         -git-read-only)     sourcesFrom=GIT-READ-ONLY;
 140 shift 1;;
 141         -gdcm2)             gdcmVersion=GDCM2;                         shift 1;;
 142         -itk4)              ITKVersion=ITK4;                           shift 1;;
 143         -build)             buildType=$2;                              shift 2;;
 144         *) break;;
 145     esac
 146 done
 147
 148 if [ $# -le 0 ] ; then usage; fi
 149
 150 command=$1
 151
 152 # check that command is valid
 153 if [ `checkVal $command all config 3rd 3rd-base 3rd-vtk 3rd-itk 3rd-gdcm 3rd-wx 3rd-wt creatools creatools-get creatools-cmp creatools-install creatools-generateBinTGZ uninstall printconfig help env` == "false" ] ; then
 154     echo "Unrecognized command: $command"
 155     echo ""
 156     usage
 157 fi
 158
 159
 160 ############################## use existing configuration if command is not config or all
 161 if [ `checkVal $command config all` == false ] ; then
 162     if [ ! -f $configureFile ] ; then
 163         echo "scripts/CreaTools-configure.sh does not exists"
 164         echo "please run the scripts with command \"config\" or \"all\""
 165         exit
 166     fi
 167     source $configureFile
 168     if [ ! -f $installPrefixThird/share/creatools/creatools_third_party_library_config.sh ] ; then
 169         echo WARNING
 170         echo "the curently used Third Party libraries are NOT in $installPrefixThird but ... in :"
 171         grep "installPrefixThird=" $ETC_BASHRC
 172         echo "VTK_DIR  : " $VTK_DIR
 173         echo "ITK_DIR  : " $ITK_DIR
 174         echo "GDCM_DIR : " $GDCM_DIR
 175         echo "(Have a look at $ETC_BASHRC=, edit it or run again Install Third Party Libraries if you disagree)"
 176
 177 #        exit
 178     fi
 179
 180 fi
 181
 182 ##################################################################################
 183 ############################ check configuration parameters
 184 # check distribÒ
 185 checkDistrib $OperatingSystem
 186
 187 # complete default install prefix
 188 if [ -z "$installPrefix" ]      ; then installPrefix=$generationdir/ci; fi
 189 if [ -z "$installPrefixThird" ] ; then installPrefixThird=$generationdir/tpli; fi
 190
 191 # check build type
 192 if [ `checkVal $buildType Release Debug RelWithDebug` == "false" ] ; then
 193     echo "Unsupported build type: $buildType"
 194     echo "Please use one of: Release Debug RelWithDebug"
 195     exit 1
 196 fi
 197
 198
 199 ##################################################################################
 200 ############################  write configuration file
 201 if [ `checkVal $command config all` == true ] ; then
 202     echo "#!/bin/bash"                            >  $configureFile
 203     echo                                          >> $configureFile
 204     echo "#File generated by 'installscript'"           >> $configureFile
 205     echo "#DO NOT edit !"                         >> $configureFile
 206     echo "#(except if you *do* know what you do)" >> $configureFile
 207     echo                                          >> $configureFile
 208     echo "OperatingSystem=$OperatingSystem"       >> $configureFile
 209     echo "corenumber=$corenumber"                 >> $configureFile
 210     echo "generationdir=$generationdir"           >> $configureFile
 211     echo "installPrefix=$installPrefix"           >> $configureFile
 212     echo "installPrefixThird=$installPrefixThird" >> $configureFile
 213     echo "docgeneration=$docgeneration"           >> $configureFile
 214     echo "sourcesFrom=$sourcesFrom"               >> $configureFile
 215     echo "loginUserName=$loginUserName"           >> $configureFile
 216     echo "loginGroupName=$loginGroupName"         >> $configureFile
 217     echo "buildType=$buildType"                   >> $configureFile
 218     echo "gdcmVersion=$gdcmVersion"               >> $configureFile
 219     echo "ITKVersion=$ITKVersion"                 >> $configureFile
 220     echo "ETC_BASHRC=$ETC_BASHRC"                 >> $configureFile
 221     echo "TDx=$TDx"                               >> $configureFile
 222 fi
 223
 224
 225
 226 ################################### print current configuration
 227 printconfig
 228
 229
 230 ##################################################################################
 231 ##################################################################################
 232 ############   Process commands
 233 ##################################################################################
 234 ##################################################################################
 235
 236
 237 ################################################################################## config printconfig
 238 # config or printconfig : already done
 239 if [ `checkVal $command config printconfig` == true ] ; then
 240     exit
 241 fi
 242
 243 ################################################################################## creatools
 244 # download creatools
 245 if [ `checkVal $command all creatools creatools-get` == true ] ; then
 246     bigDisplay "DOWNLOAD CREATOOLS"
 247     bash scripts/CreaTools-load.sh
 248 fi
 249
 250 ################################################################################## 3rd library
 251 # install packaged dependencies as root
 252 if [ `checkVal $command all 3rd 3rd-base` == true ] ; then
 253     bigDisplay "INSTALL PACKAGES DEPENDENCIES"
 254     bash scripts/CreaTools-configure.sh
 255     cd scripts
 256     source ThirdParty-install-Base-Stuff.sh $OperatingSystem
 257     cd ..
 258     bash scripts/ThirdParty-install.sh
 259 fi
 260
 261 # vtk
 262 if [ `checkVal $command all 3rd 3rd-vtk` == true ] ; then
 263     bigDisplay "INSTALL VTK"
 264     bash scripts/ThirdParty-install-VTK.sh
 265     cd $scriptDirName
 266 fi
 267
 268 # gdcm
 269 if [ `checkVal $command all 3rd 3rd-gdcm` == true ] ; then
 270     bigDisplay "INSTALL $gdcmVersion"
 271     bash scripts/ThirdParty-install-gdcm.sh
 272     pwd
 273     echo $scriptDirName
 274     cd $scriptDirName
 275 fi
 276
 277 # itk
 278 if [ `checkVal $command all 3rd 3rd-itk` == true ] ; then
 279     bigDisplay "INSTALL $ITKVersion"
 280     bash scripts/ThirdParty-install-ITK.sh
 281     cd $scriptDirName
 282 fi
 283
 284 # wt
 285 if [ `checkVal $command all 3rd 3rd-wt` == true ] ; then
 286     bigDisplay "INSTALL WT"
 287     bash scripts/ThirdParty-install-WT.sh
 288     cd $scriptDirName
 289 fi
 290
 291 # Setup the user .bashrc correctly
 292 if [ `checkVal $command all 3rd 3rd-vtk 3rd-itk 3rd-gdcm 3rd-wx 3rd-wt ` == true ] ; then
 293     bigDisplay "FINALIZE 3RD PARTY LIBRARY INSTALLATION"
 294     bash scripts/ThirdParty-install-Finalize.sh
 295     if [ `checkVal $command 3rd 3rd-vtk 3rd-itk 3rd-gdcm 3rd-wx ` == true ] ; then
 296         bigDisplay "Third Party Install Done"
 297         bigDisplay "Please copy paste the following command or open a new terminal: source ~/.bashrc"
 298     fi
 299 fi
 300
 301 ################################################################################## creatools
 302 # compile creatools
 303 if [ `checkVal $command all creatools creatools-cmp` == true ] ; then
 304     bigDisplay "COMPILE CREATOOLS"
 305 echo "EED installscript compile creatools"
 306 echo $ETC_BASHRC
 307     source $ETC_BASHRC
 308     bash -x scripts/CreaTools-compile.sh
 309
 310     # To allow (*very* aware) user to patch code, later
 311     if [ ! -e $generationdir/creatools_source ] ; then
 312         echo "You probabely made a mistake : "
 313         echo "Directory $loginUserName $generationdir/creatools_source not found"
 314         echo "Make sure you know the mistake"
 315         echo "Hit any key to continue"
 316         echo "Fix the mistake!"
 317         read a
 318     else
 319         chown -R $loginUserName  $generationdir/creatools_source
 320         chgrp -R $loginGroupName $generationdir/creatools_source
 321     fi
 322 fi
 323
 324 #install creatools
 325 if [ `checkVal $command all creatools creatools-install` == true ] ; then
 326     bigDisplay "INSTALL CREATOOLS"
 327     source $ETC_BASHRC
 328     bash scripts/CreaTools-install.sh
 329     source $ETC_BASHRC
 330     echo " "
 331     echo " "
 332     echo " "
 333     echo " "
 334     echo "Open a new terminal to run creatools."
 335     echo "(Close this window and continue....) "
 336     echo " "
 337     echo " "
 338     ##EED read -p "Press [Enter] key to continue..."
 339 fi
 340
 341 #generate TGZ version of the bin (Creatools and ThirdParty)
 342 if [ `checkVal $command creatools-generateBinTGZ` == true ] ; then
 343     bash scripts/CreaTools-GenerateBinTGZ.sh
 344 fi
 345
 346 ################################################################################## uninstall
 347 if [ `checkVal $command uninstall` == true ] ; then
 348     bigDisplay "UNINSTALL CREATOOLS"
 349     bash scripts/CreaTools-uninstall.sh
 350 fi
 351
 352 ################################################################################## help
 353 if [ `checkVal $command help` == true ] ; then
 354     cat README.txt
 355 fi
 356
 357 ################################################################################## print env variables
 358 if [ `checkVal $command env` == true ] ; then
 359     if [ ! -f $installPrefixThird/share/creatools_third_party_library_config.sh ] ; then
 360         echo WARNING
 361         echo
 362         echo "the curently used Third Party libraries are NOT in $installPrefixThird but in :"
 363         grep "installPrefixThird=" $ETC_BASHRC
 364         echo "VTK_DIR  : " $VTK_DIR
 365         echo "ITK_DIR  : " $ITK_DIR
 366         echo "GDCM_DIR : " $GDCM_DIR
 367         echo
 368         echo "installPrefixThird ... " $installPrefixThird
 369     fi
 370
 371     if [ -f $installPrefixThird/share/creatools_third_party_library_config.sh ] ; then
 372         echo  "Third party config file : " $installPrefixThird/share/creatools_third_party_library_config.sh
 373         echo  ------
 374         cat $installPrefixThird/share/creatools_third_party_library_config.sh
 375         echo  ------
 376     fi
 377
 378     echo
 379
 380     if [ -f $installPrefix/share/creatools_base_library_config.sh ] ; then
 381        echo  "Creatools base library config file : " $installPrefix/share/creatools_base_library_config.sh
 382        echo  ------
 383        cat $installPrefix/share/creatools_base_library_config.sh
 384        echo  ------
 385        echo
 386        echo "installPrefix ... " $installPrefix
 387     fi
 388
 389     echo  ------
 390     echo "VTK_DIR  :                 " $VTK_DIR
 391     echo "ITK_DIR  :                 " $ITK_DIR
 392     echo "GDCM_DIR :                 " $GDCM_DIR
 393     echo
 394     echo "crea_DIR :                 " $crea_DIR
 395     echo "BBTK_DIR :                 " $BBTK_DIR
 396     echo "creaMaracasVisu_DIR :      " $creaMaracasVisu_DIR
 397     echo "creaEnvironment_DIR :      " $creaEnvironment_DIR
 398     echo "creaBruker_DIR :           " $creaBruker_DIR
 399     echo "creaImageIO_DIR :          " $creaImageIO_DIR
 400     echo "creaContours_DIR :         " $creaContours_DIR
 401     echo "creaRigidRegistration_DIR :" $creaRigidRegistration_DIR
 402     echo "bbtkGEditor_DIR :          " $bbtkGEditor_DIR
 403     echo "creaTools_DIR :            " $creaTools_DIR
 404     echo "creaMiniTools_DIR :        " $creaMiniTools_DIR
 405     echo "Ido_DIR :                  " $Ido_DIR
 406     echo "==================================="
 407     echo
 408
 409 fi
 410
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