Linux/installscript

   1 # ---------------------------------------------------------------------
   2 #
   3 # Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image
   4 #                        pour la Santé)
   5 # Authors : Eduardo Davila, Frederic Cervenansky, Claire Mouton
   6 #
   7 #  This software is governed by the CeCILL-B license under French law and
   8 #  abiding by the rules of distribution of free software. You can  use,
   9 #  modify and/ or redistribute the software under the terms of the CeCILL-B
  10 #  license as circulated by CEA, CNRS and INRIA at the following URL
  11 #  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  12 #  or in the file LICENSE.txt.
  13 #
  14 #  As a counterpart to the access to the source code and  rights to copy,
  15 #  modify and redistribute granted by the license, users are provided only
  16 #  with a limited warranty  and the software's author,  the holder of the
  17 #  economic rights,  and the successive licensors  have only  limited
  18 #  liability.
  19 #
  20 #  The fact that you are presently reading this means that you have had
  21 #  knowledge of the CeCILL-B license and that you accept its terms.
  22 # ------------------------------------------------------------------------
  23
  24 #!/bin/bash -e
  25
  26
  27 #This code is Mac
  28 function EEDreadlink() {
  29   DIR="${1%/*}"
  30   (cd "$DIR" && echo "$(pwd -P)")
  31 }
  32
  33
  34 #EED 2120-08-25  This code is not working in MacOS so we use EEDreadlink()
  35 #EED scriptDirName=$(dirname $(Ereadlink -f $0) )
  36 scriptDirName=$(dirname $(Ereadlink  $0) )/Linux
  37
  38 #########################################################################
  39 ############     Local Functions  #######################################
  40 #########################################################################
  41
  42
  43 source scripts/LocalFunctions.sh
  44
  45 configureFile="scripts/CreaTools-configure.sh"
  46
  47
  48 # default configuration parameters
  49 OperatingSystem=`getDistrib`
  50 corenumber=`getncore`
  51 generationdir=$HOME/Creatis/creaTools
  52 installPrefixThird=
  53 installPrefix=
  54 docgeneration=OFF
  55 sourcesFrom=GIT
  56
  57 loginUserName=$USER
  58 loginGroupName=`groups | awk '{print $1}'`
  59 buildType=Release
  60 gdcmVersion=GDCM1
  61 ITKVersion=ITK3
  62 export ETC_BASHRC=`getbashrc`
  63
  64
  65 function usage {
  66     echo "installscript [options] command"
  67     echo "creatools configure/compile/install script"
  68     echo ""
  69     echo ""
  70     echo "OPTIONS ARE USE FOR CONFIGURATION ONLY: THEY WILL BE IGNORED IF <COMMAND> IS NOT \"CONFIG\" OR \"ALL\""
  71     echo ""
  72     echo ""
  73     echo "    command:"
  74     echo ""
  75     echo "    as a normal user:"
  76     echo "         config                    : set the configuration parameters only"
  77     echo "         "
  78     echo "    need root password:"
  79     echo "         3rd                       : Get, Compile, Install all 3rd party library "
  80     echo "         3rd-base                  : Install basic tools (cmake, doxygen...)"
  81     echo "         3rd-vtk                   : Get, Compile, Install vtk"
  82     echo "         3rd-itk                   : Get, Compile, Install itk"
  83     echo "         3rd-gdcm                  : Get, Compile, Install gdcm"
  84     echo "         3rd-wx                    : Get, Compile, Install wx widget (for Mac Users)"
  85     echo "         3rd-wt                    : Get, Compile, Install wt"
  86     echo "   "
  87     echo "    as a normal user:"
  88     echo "         creatools                 : Get Compile and Install the CreaTools"
  89     echo "         creatools-get             : Get the CreaTools"
  90     echo "         creatools-cmp             : Compile the CreaTools"
  91     echo "         creatools-install         : Install the CreaTools"
  92     echo "   "
  93     echo "         creatools-generateBinTGZ  : generation of CreaTools.tgz (binary version)"
  94     echo "   "
  95     echo "         uninstall                 : uninstall the creatools"
  96     echo "   "
  97     echo "         printconfig               : print the configuration"
  98     echo "         help                      : print help"
  99     echo "         env                       : print some environnement variables"
 100     echo ""
 101     echo "         all                       : configure / compile / install"
 102     echo "         "
 103     echo "   "
 104     echo "   "
 105     echo "   "
 106     echo "   "
 107     echo "    configure options: !!!!! IGNORED IF COMMAND IS NOT CONFIG OR ALL !!!!!!"
 108     echo "        -os <os>              : operating system distribution (default $OperatingSystem)"
 109     echo "        -ncore <n>            : number of core to use (default $corenumber)"
 110     echo "        -gdir <dir>           : generation directory (default $generationdir)"
 111     echo "        -instprefix <dir>     : creatools install prefix"
 112     echo "        -instprefix3 <dir>    : 3rd party library install prefix"
 113     echo "        -html                 : get creatools from HTML"
 114     echo "        -git                  : get creatools from git (CREATIS user only)"
 115     echo "        -git-read-only        : get creatools from git (anonymously, no write access)"
 116     echo "        -build                : build type Release, RelWithDebug or Debug (default RelWithDebug)"
 117     echo ""
 118     echo "     experimental configure options (use at your own risk!!):"
 119     echo "        -gdcm2         : use GDCM2 "
 120     echo "        -doc           : generate documentation"
 121     echo "        -itk4          : use ITK4"
 122     echo ""
 123     exit 1
 124 }
 125
 126 ##################################################
 127 # parse command line
 128 while [ $# -ge 1 ] ; do
 129     case $1 in
 130         -os)                OperatingSystem=$2;                        shift 2;;
 131         -ncore)             corenumber=$2;                             shift 2;;
 132         -gdir)              generationdir=$2;                          shift 2;;
 133         -instprefix)        installPrefix=$2;                          shift 2;;
 134         -instprefix3)       installPrefixThird=$2;                     shift 2;;
 135         -doc)               docgeneration=ON;                          shift 1;;
 136         -html)              sourcesFrom=HTML;                          shift 1;;
 137         -git)               sourcesFrom=GIT;                           shift 1;;
 138         -git-read-only)     sourcesFrom=GIT-READ-ONLY;
 139 shift 1;;
 140         -gdcm2)             gdcmVersion=GDCM2;                         shift 1;;
 141         -itk4)              ITKVersion=ITK4;                           shift 1;;
 142         -build)             buildType=$2;                              shift 2;;
 143         *) break;;
 144     esac
 145 done
 146
 147 if [ $# -le 0 ] ; then usage; fi
 148
 149 command=$1
 150
 151 # check that command is valid
 152 if [ `checkVal $command all config 3rd 3rd-base 3rd-vtk 3rd-itk 3rd-gdcm 3rd-wx 3rd-wt creatools creatools-get creatools-cmp creatools-install creatools-generateBinTGZ uninstall printconfig help env` == "false" ] ; then
 153     echo "Unrecognized command: $command"
 154     echo ""
 155     usage
 156 fi
 157
 158
 159 ############################## use existing configuration if command is not config or all
 160 if [ `checkVal $command config all` == false ] ; then
 161     if [ ! -f $configureFile ] ; then
 162         echo "scripts/CreaTools-configure.sh does not exists"
 163         echo "please run the scripts with command \"config\" or \"all\""
 164         exit
 165     fi
 166     source $configureFile
 167     if [ ! -f $installPrefixThird/share/creatools/creatools_third_party_library_config.sh ] ; then
 168         echo WARNING
 169         echo "the curently used Third Party libraries are NOT in $installPrefixThird but ... in :"
 170         grep "installPrefixThird=" $ETC_BASHRC
 171         echo "VTK_DIR  : " $VTK_DIR
 172         echo "ITK_DIR  : " $ITK_DIR
 173         echo "GDCM_DIR : " $GDCM_DIR
 174         echo "(Have a look at $ETC_BASHRC=, edit it or run again Install Third Party Libraries if you disagree)"
 175
 176 #        exit
 177     fi
 178
 179 fi
 180
 181 ##################################################################################
 182 ############################ check configuration parameters
 183 # check distrib
 184 checkDistrib $OperatingSystem
 185
 186 # complete default install prefix
 187 if [ -z "$installPrefix" ]      ; then installPrefix=$generationdir/ci; fi
 188 if [ -z "$installPrefixThird" ] ; then installPrefixThird=$generationdir/tpli; fi
 189
 190 # check build type
 191 if [ `checkVal $buildType Release Debug RelWithDebug` == "false" ] ; then
 192     echo "Unsupported build type: $buildType"
 193     echo "Please use one of: Release Debug RelWithDebug"
 194     exit 1
 195 fi
 196
 197
 198 ##################################################################################
 199 ############################  write configuration file
 200 if [ `checkVal $command config all` == true ] ; then
 201     echo "#!/bin/bash"                            >  $configureFile
 202     echo                                          >> $configureFile
 203     echo "#File generated by 'installscript'"           >> $configureFile
 204     echo "#DO NOT edit !"                         >> $configureFile
 205     echo "#(except if you *do* know what you do)" >> $configureFile
 206     echo                                          >> $configureFile
 207     echo "OperatingSystem=$OperatingSystem"       >> $configureFile
 208     echo "corenumber=$corenumber"                 >> $configureFile
 209     echo "generationdir=$generationdir"           >> $configureFile
 210     echo "installPrefix=$installPrefix"           >> $configureFile
 211     echo "installPrefixThird=$installPrefixThird" >> $configureFile
 212     echo "docgeneration=$docgeneration"           >> $configureFile
 213     echo "sourcesFrom=$sourcesFrom"               >> $configureFile
 214     echo "loginUserName=$loginUserName"           >> $configureFile
 215     echo "loginGroupName=$loginGroupName"         >> $configureFile
 216     echo "buildType=$buildType"                   >> $configureFile
 217     echo "gdcmVersion=$gdcmVersion"               >> $configureFile
 218     echo "ITKVersion=$ITKVersion"                 >> $configureFile
 219     echo "ETC_BASHRC=$ETC_BASHRC"                 >> $configureFile
 220 fi
 221
 222
 223
 224 ################################### print current configuration
 225 printconfig
 226
 227
 228 ##################################################################################
 229 ##################################################################################
 230 ############   Process commands
 231 ##################################################################################
 232 ##################################################################################
 233
 234
 235 ################################################################################## config printconfig
 236 # config or printconfig : already done
 237 if [ `checkVal $command config printconfig` == true ] ; then
 238     exit
 239 fi
 240
 241 ################################################################################## creatools
 242 # download creatools
 243 if [ `checkVal $command all creatools creatools-get` == true ] ; then
 244     bigDisplay "DOWNLOAD CREATOOLS"
 245     bash scripts/CreaTools-load.sh
 246 fi
 247
 248 ################################################################################## 3rd library
 249 # install packaged dependencies as root
 250 if [ `checkVal $command all 3rd 3rd-base` == true ] ; then
 251     bigDisplay "INSTALL PACKAGES DEPENDENCIES"
 252     bash scripts/CreaTools-configure.sh
 253     cd scripts
 254     source ThirdParty-install-Base-Stuff.sh $OperatingSystem
 255     cd ..
 256     bash scripts/ThirdParty-install.sh
 257 fi
 258
 259 # vtk
 260 if [ `checkVal $command all 3rd 3rd-vtk` == true ] ; then
 261     bigDisplay "INSTALL VTK"
 262 ##EED    source scripts/ThirdParty-install-VTK.sh
 263     cd $scriptDirName
 264 fi
 265
 266 # gdcm
 267 if [ `checkVal $command all 3rd 3rd-gdcm` == true ] ; then
 268     bigDisplay "INSTALL $gdcmVersion"
 269     bash scripts/ThirdParty-install-gdcm.sh
 270     pwd
 271     echo $scriptDirName
 272     cd $scriptDirName
 273 fi
 274
 275 # itk
 276 if [ `checkVal $command all 3rd 3rd-itk` == true ] ; then
 277     bigDisplay "INSTALL $ITKVersion"
 278     bash scripts/ThirdParty-install-ITK.sh
 279     cd $scriptDirName
 280 fi
 281
 282 # wt
 283 if [ `checkVal $command all 3rd 3rd-wt` == true ] ; then
 284     bigDisplay "INSTALL WT"
 285     bash scripts/ThirdParty-install-WT.sh
 286     cd $scriptDirName
 287 fi
 288
 289 # Setup the user .bashrc correctly
 290 if [ `checkVal $command all 3rd 3rd-vtk 3rd-itk 3rd-gdcm 3rd-wx 3rd-wt ` == true ] ; then
 291     bigDisplay "FINALIZE 3RD PARTY LIBRARY INSTALLATION"
 292     bash scripts/ThirdParty-install-Finalize.sh
 293     if [ `checkVal $command 3rd 3rd-vtk 3rd-itk 3rd-gdcm 3rd-wx ` == true ] ; then
 294         bigDisplay "Third Party Install Done"
 295         bigDisplay "Please copy paste the following command or open a new terminal: source ~/.bashrc"
 296     fi
 297 fi
 298
 299 ################################################################################## creatools
 300 # compile creatools
 301 if [ `checkVal $command all creatools creatools-cmp` == true ] ; then
 302     bigDisplay "COMPILE CREATOOLS"
 303 echo "EED installscript compile creatools"
 304 echo $ETC_BASHRC
 305     source $ETC_BASHRC
 306     bash -x scripts/CreaTools-compile.sh
 307
 308     # To allow (*very* aware) user to patch code, later
 309     if [ ! -e $generationdir/creatools_source ] ; then
 310         echo "You probabely made a mistake : "
 311         echo "Directory $loginUserName $generationdir/creatools_source not found"
 312         echo "Make sure you know the mistake"
 313         echo "Hit any key to continue"
 314         echo "Fix the mistake!"
 315         read a
 316     else
 317         chown -R $loginUserName  $generationdir/creatools_source
 318         chgrp -R $loginGroupName $generationdir/creatools_source
 319     fi
 320 fi
 321
 322 #install creatools
 323 if [ `checkVal $command all creatools creatools-install` == true ] ; then
 324     bigDisplay "INSTALL CREATOOLS"
 325     source $ETC_BASHRC
 326     bash scripts/CreaTools-install.sh
 327     source $ETC_BASHRC
 328     echo " "
 329     echo " "
 330     echo " "
 331     echo " "
 332     echo "Open a new terminal to run creatools."
 333     echo "(Close this window and continue....) "
 334     echo " "
 335     echo " "
 336     ##EED read -p "Press [Enter] key to continue..."
 337 fi
 338
 339 #generate TGZ version of the bin (Creatools and ThirdParty)
 340 if [ `checkVal $command creatools-generateBinTGZ` == true ] ; then
 341     bash scripts/CreaTools-GenerateBinTGZ.sh
 342 fi
 343
 344 ################################################################################## uninstall
 345 if [ `checkVal $command uninstall` == true ] ; then
 346     bigDisplay "UNINSTALL CREATOOLS"
 347     bash scripts/CreaTools-uninstall.sh
 348 fi
 349
 350 ################################################################################## help
 351 if [ `checkVal $command help` == true ] ; then
 352     cat README.txt
 353 fi
 354
 355 ################################################################################## print env variables
 356 if [ `checkVal $command env` == true ] ; then
 357     if [ ! -f $installPrefixThird/share/creatools_third_party_library_config.sh ] ; then
 358         echo WARNING
 359         echo
 360         echo "the curently used Third Party libraries are NOT in $installPrefixThird but in :"
 361         grep "installPrefixThird=" $ETC_BASHRC
 362         echo "VTK_DIR  : " $VTK_DIR
 363         echo "ITK_DIR  : " $ITK_DIR
 364         echo "GDCM_DIR : " $GDCM_DIR
 365         echo
 366         echo "installPrefixThird ... " $installPrefixThird
 367     fi
 368
 369     if [ -f $installPrefixThird/share/creatools_third_party_library_config.sh ] ; then
 370         echo  "Third party config file : " $installPrefixThird/share/creatools_third_party_library_config.sh
 371         echo  ------
 372         cat $installPrefixThird/share/creatools_third_party_library_config.sh
 373         echo  ------
 374     fi
 375
 376     echo
 377
 378     if [ -f $installPrefix/share/creatools_base_library_config.sh ] ; then
 379        echo  "Creatools base library config file : " $installPrefix/share/creatools_base_library_config.sh
 380        echo  ------
 381        cat $installPrefix/share/creatools_base_library_config.sh
 382        echo  ------
 383        echo
 384        echo "installPrefix ... " $installPrefix
 385     fi
 386
 387     echo  ------
 388     echo "VTK_DIR  :                 " $VTK_DIR
 389     echo "ITK_DIR  :                 " $ITK_DIR
 390     echo "GDCM_DIR :                 " $GDCM_DIR
 391     echo
 392     echo "crea_DIR :                 " $crea_DIR
 393     echo "BBTK_DIR :                 " $BBTK_DIR
 394     echo "creaMaracasVisu_DIR :      " $creaMaracasVisu_DIR
 395     echo "creaEnvironment_DIR :      " $creaEnvironment_DIR
 396     echo "creaBruker_DIR :           " $creaBruker_DIR
 397     echo "creaImageIO_DIR :          " $creaImageIO_DIR
 398     echo "creaContours_DIR :         " $creaContours_DIR
 399     echo "creaRigidRegistration_DIR :" $creaRigidRegistration_DIR
 400     echo "bbtkGEditor_DIR :          " $bbtkGEditor_DIR
 401     echo "creaTools_DIR :            " $creaTools_DIR
 402     echo "creaMiniTools_DIR :        " $creaMiniTools_DIR
 403     echo "Ido_DIR :                  " $Ido_DIR
 404     echo "==================================="
 405     echo
 406
 407 fi
 408
 409
 410