Linux/installscript

   1 # ---------------------------------------------------------------------
   2 #
   3 # Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image
   4 #                        pour la Santé)
   5 # Authors : Eduardo Davila, Frederic Cervenansky, Claire Mouton
   6 #
   7 #  This software is governed by the CeCILL-B license under French law and
   8 #  abiding by the rules of distribution of free software. You can  use,
   9 #  modify and/ or redistribute the software under the terms of the CeCILL-B
  10 #  license as circulated by CEA, CNRS and INRIA at the following URL
  11 #  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  12 #  or in the file LICENSE.txt.
  13 #
  14 #  As a counterpart to the access to the source code and  rights to copy,
  15 #  modify and redistribute granted by the license, users are provided only
  16 #  with a limited warranty  and the software's author,  the holder of the
  17 #  economic rights,  and the successive licensors  have only  limited
  18 #  liability.
  19 #
  20 #  The fact that you are presently reading this means that you have had
  21 #  knowledge of the CeCILL-B license and that you accept its terms.
  22 # ------------------------------------------------------------------------
  23
  24 #!/bin/bash -e
  25
  26 #EED 2018-08-26
  27
  28 #scriptDirName=$(dirname $(readlink -f $0) )
  29 scriptDirName=$(pwd)
  30
  31 #########################################################################
  32 ############     Local Functions  #######################################
  33 #########################################################################
  34
  35
  36 source scripts/LocalFunctions.sh
  37
  38 configureFile="scripts/CreaTools-configure.sh"
  39
  40
  41 # default configuration parameters
  42 OperatingSystem=`getDistrib`
  43 corenumber=`getncore`
  44 echo "hola1"
  45 generationdir=$HOME/Creatis/creaTools
  46 installPrefixThird=
  47 installPrefix=
  48 docgeneration=OFF
  49 sourcesFrom=GIT
  50
  51
  52 loginUserName=$USER
  53 loginGroupName=`groups | awk '{print $1}'`
  54 buildType=Release
  55 gdcmVersion=GDCM1
  56 ITKVersion=ITK4
  57 export ETC_BASHRC=`getbashrc`
  58
  59
  60 function usage {
  61     echo "installscript [options] command"
  62     echo "creatools configure/compile/install script"
  63     echo ""
  64     echo ""
  65     echo "OPTIONS ARE USE FOR CONFIGURATION ONLY: THEY WILL BE IGNORED IF <COMMAND> IS NOT \"CONFIG\" OR \"ALL\""
  66     echo ""
  67     echo ""
  68     echo "    command:"
  69     echo ""
  70     echo "    as a normal user:"
  71     echo "         config                    : set the configuration parameters only"
  72     echo "         "
  73     echo "    need root password:"
  74     echo "         3rd                       : Get, Compile, Install all 3rd party library "
  75     echo "         3rd-base                  : Install basic tools (cmake, doxygen...)"
  76     echo "         3rd-vtk                   : Get, Compile, Install vtk"
  77     echo "         3rd-itk                   : Get, Compile, Install itk"
  78     echo "         3rd-gdcm                  : Get, Compile, Install gdcm"
  79     echo "         3rd-wx                    : Get, Compile, Install wx widget (for Mac Users)"
  80     echo "         3rd-wt                    : Get, Compile, Install wt"
  81     echo "   "
  82     echo "    as a normal user:"
  83     echo "         creatools                 : Get Compile and Install the CreaTools"
  84     echo "         creatools-get             : Get the CreaTools"
  85     echo "         creatools-cmp             : Compile the CreaTools"
  86     echo "         creatools-install         : Install the CreaTools"
  87     echo "   "
  88     echo "         creatools-generateBinTGZ  : generation of CreaTools.tgz (binary version)"
  89     echo "   "
  90     echo "         uninstall                 : uninstall the creatools"
  91     echo "   "
  92     echo "         printconfig               : print the configuration"
  93     echo "         help                      : print help"
  94     echo "         env                       : print some environnement variables"
  95     echo ""
  96     echo "         all                       : configure / compile / install"
  97     echo "         "
  98     echo "   "
  99     echo "   "
 100     echo "   "
 101     echo "   "
 102     echo "    configure options: !!!!! IGNORED IF COMMAND IS NOT CONFIG OR ALL !!!!!!"
 103     echo "        -os <os>              : operating system distribution (default $OperatingSystem)"
 104     echo "        -ncore <n>            : number of core to use (default $corenumber)"
 105     echo "        -gdir <dir>           : generation directory (default $generationdir)"
 106     echo "        -instprefix <dir>     : creatools install prefix"
 107     echo "        -instprefix3 <dir>    : 3rd party library install prefix"
 108     echo "        -html                 : get creatools from HTML"
 109     echo "        -git                  : get creatools from git (CREATIS user only)"
 110     echo "        -git-read-only        : get creatools from git (anonymously, no write access)"
 111     echo "        -build                : build type Release, RelWithDebug or Debug (default RelWithDebug)"
 112     echo ""
 113     echo "     experimental configure options (use at your own risk!!):"
 114     echo "        -gdcm2         : use GDCM2 "
 115     echo "        -doc           : generate documentation"
 116     echo "        -itk4          : use ITK4"
 117     echo ""
 118     exit 1
 119 }
 120
 121 ##################################################
 122 # parse command line
 123 while [ $# -ge 1 ] ; do
 124     case $1 in
 125         -os)                OperatingSystem=$2;                        shift 2;;
 126         -ncore)             corenumber=$2;                             shift 2;;
 127         -gdir)              generationdir=$2;                          shift 2;;
 128         -instprefix)        installPrefix=$2;                          shift 2;;
 129         -instprefix3)       installPrefixThird=$2;                     shift 2;;
 130         -doc)               docgeneration=ON;                          shift 1;;
 131         -html)              sourcesFrom=HTML;                          shift 1;;
 132         -git)               sourcesFrom=GIT;                           shift 1;;
 133         -git-read-only)     sourcesFrom=GIT-READ-ONLY;
 134 shift 1;;
 135         -gdcm2)             gdcmVersion=GDCM2;                         shift 1;;
 136         -itk4)              ITKVersion=ITK4;                           shift 1;;
 137         -build)             buildType=$2;                              shift 2;;
 138         *) break;;
 139     esac
 140 done
 141
 142 if [ $# -le 0 ] ; then usage; fi
 143
 144 command=$1
 145
 146 # check that command is valid
 147 if [ `checkVal $command all config 3rd 3rd-base 3rd-vtk 3rd-itk 3rd-gdcm 3rd-wx 3rd-wt creatools creatools-get creatools-cmp creatools-install creatools-generateBinTGZ uninstall printconfig help env` == "false" ] ; then
 148     echo "Unrecognized command: $command"
 149     echo ""
 150     usage
 151 fi
 152
 153
 154 ############################## use existing configuration if command is not config or all
 155 if [ `checkVal $command config all` == false ] ; then
 156     if [ ! -f $configureFile ] ; then
 157         echo "scripts/CreaTools-configure.sh does not exists"
 158         echo "please run the scripts with command \"config\" or \"all\""
 159         exit
 160     fi
 161     source $configureFile
 162     if [ ! -f $installPrefixThird/share/creatools/creatools_third_party_library_config.sh ] ; then
 163         echo WARNING
 164         echo "the curently used Third Party libraries are NOT in $installPrefixThird but ... in :"
 165         grep "installPrefixThird=" $ETC_BASHRC
 166         echo "VTK_DIR  : " $VTK_DIR
 167         echo "ITK_DIR  : " $ITK_DIR
 168         echo "GDCM_DIR : " $GDCM_DIR
 169         echo "(Have a look at $ETC_BASHRC=, edit it or run again Install Third Party Libraries if you disagree)"
 170
 171 #        exit
 172     fi
 173
 174 fi
 175
 176 ##################################################################################
 177 ############################ check configuration parameters
 178 # check distrib
 179 checkDistrib $OperatingSystem
 180
 181 # complete default install prefix
 182 if [ -z "$installPrefix" ]      ; then installPrefix=$generationdir/ci; fi
 183 if [ -z "$installPrefixThird" ] ; then installPrefixThird=$generationdir/tpli; fi
 184
 185 # check build type
 186 if [ `checkVal $buildType Release Debug RelWithDebug` == "false" ] ; then
 187     echo "Unsupported build type: $buildType"
 188     echo "Please use one of: Release Debug RelWithDebug"
 189     exit 1
 190 fi
 191
 192
 193 ##################################################################################
 194 ############################  write configuration file
 195 if [ `checkVal $command config all` == true ] ; then
 196     echo "#!/bin/bash"                            >  $configureFile
 197     echo                                          >> $configureFile
 198     echo "#File generated by 'installscript'"           >> $configureFile
 199     echo "#DO NOT edit !"                         >> $configureFile
 200     echo "#(except if you *do* know what you do)" >> $configureFile
 201     echo                                          >> $configureFile
 202     echo "OperatingSystem=$OperatingSystem"       >> $configureFile
 203     echo "corenumber=$corenumber"                 >> $configureFile
 204     echo "generationdir=$generationdir"           >> $configureFile
 205     echo "installPrefix=$installPrefix"           >> $configureFile
 206     echo "installPrefixThird=$installPrefixThird" >> $configureFile
 207     echo "docgeneration=$docgeneration"           >> $configureFile
 208     echo "sourcesFrom=$sourcesFrom"               >> $configureFile
 209     echo "loginUserName=$loginUserName"           >> $configureFile
 210     echo "loginGroupName=$loginGroupName"         >> $configureFile
 211     echo "buildType=$buildType"                   >> $configureFile
 212     echo "gdcmVersion=$gdcmVersion"               >> $configureFile
 213     echo "ITKVersion=$ITKVersion"                 >> $configureFile
 214     echo "ETC_BASHRC=$ETC_BASHRC"                 >> $configureFile
 215 fi
 216
 217
 218
 219 ################################### print current configuration
 220 printconfig
 221
 222
 223 ##################################################################################
 224 ##################################################################################
 225 ############   Process commands
 226 ##################################################################################
 227 ##################################################################################
 228
 229
 230 ################################################################################## config printconfig
 231 # config or printconfig : already done
 232 if [ `checkVal $command config printconfig` == true ] ; then
 233     exit
 234 fi
 235
 236 ################################################################################## creatools
 237 # download creatools
 238 if [ `checkVal $command all creatools creatools-get` == true ] ; then
 239     bigDisplay "DOWNLOAD CREATOOLS"
 240     bash scripts/CreaTools-load.sh
 241 fi
 242
 243 ################################################################################## 3rd library
 244 # install packaged dependencies as root
 245 if [ `checkVal $command all 3rd 3rd-base` == true ] ; then
 246     bigDisplay "INSTALL PACKAGES DEPENDENCIES"
 247     source scripts/CreaTools-configure.sh
 248     cd scripts
 249     source ThirdParty-install-Base-Stuff.sh $OperatingSystem
 250     cd ..
 251     bash scripts/ThirdParty-install.sh
 252 fi
 253
 254 # vtk
 255 if [ `checkVal $command all 3rd 3rd-vtk` == true ] ; then
 256             bigDisplay "INSTALL VTK"
 257                 source scripts/ThirdParty-install-VTK.sh
 258         cd $scriptDirName
 259 fi
 260
 261 # gdcm
 262 if [ `checkVal $command all 3rd 3rd-gdcm` == true ] ; then
 263     bigDisplay "INSTALL $gdcmVersion"
 264     source scripts/ThirdParty-install-gdcm.sh
 265     cd $scriptDirName
 266 fi
 267
 268 # itk
 269 if [ `checkVal $command all 3rd 3rd-itk` == true ] ; then
 270         bigDisplay "INSTALL $ITKVersion"
 271         bash scripts/ThirdParty-install-ITK.sh
 272     cd $scriptDirName
 273 fi
 274
 275 # wt
 276 if [ `checkVal $command all 3rd 3rd-wt` == true ] ; then
 277     bigDisplay "INSTALL WT"
 278     source scripts/ThirdParty-install-WT.sh
 279     cd $scriptDirName
 280 fi
 281
 282 # Setup the user .bashrc correctly
 283 if [ `checkVal $command all 3rd 3rd-vtk 3rd-itk 3rd-gdcm 3rd-wx 3rd-wt ` == true ] ; then
 284     bigDisplay "FINALIZE 3RD PARTY LIBRARY INSTALLATION"
 285     bash scripts/ThirdParty-install-Finalize.sh
 286     if [ `checkVal $command 3rd 3rd-vtk 3rd-itk 3rd-gdcm 3rd-wx ` == true ] ; then
 287         bigDisplay "Third Party Install Done"
 288         bigDisplay "Please copy paste the following command or open a new terminal: source ~/.bashrc"
 289     fi
 290 fi
 291
 292 ################################################################################## creatools
 293 # compile creatools
 294 if [ `checkVal $command all creatools creatools-cmp` == true ] ; then
 295     bigDisplay "COMPILE CREATOOLS"
 296 echo "EED installscript compile creatools"
 297 echo $ETC_BASHRC
 298     source $ETC_BASHRC
 299     bash -x scripts/CreaTools-compile.sh
 300
 301     # To allow (*very* aware) user to patch code, later
 302     if [ ! -e $generationdir/creatools_source ] ; then
 303         echo "You probabely made a mistake : "
 304         echo "Directory $loginUserName $generationdir/creatools_source not found"
 305         echo "Make sure you know the mistake"
 306         echo "Hit any key to continue"
 307         echo "Fix the mistake!"
 308         read a
 309     else
 310         chown -R $loginUserName  $generationdir/creatools_source
 311         chgrp -R $loginGroupName $generationdir/creatools_source
 312     fi
 313 fi
 314
 315 #install creatools
 316 if [ `checkVal $command all creatools creatools-install` == true ] ; then
 317     bigDisplay "INSTALL CREATOOLS"
 318     source $ETC_BASHRC
 319     bash scripts/CreaTools-install.sh
 320     source $ETC_BASHRC
 321     echo " "
 322     echo " "
 323     echo " "
 324     echo " "
 325     echo "Open a new terminal to run creatools."
 326     echo "(Close this window and continue....) "
 327     echo " "
 328     echo " "
 329     ##EED read -p "Press [Enter] key to continue..."
 330 fi
 331
 332 #generate TGZ version of the bin (Creatools and ThirdParty)
 333 if [ `checkVal $command creatools-generateBinTGZ` == true ] ; then
 334     bash scripts/CreaTools-GenerateBinTGZ.sh
 335 fi
 336
 337 ################################################################################## uninstall
 338 if [ `checkVal $command uninstall` == true ] ; then
 339     bigDisplay "UNINSTALL CREATOOLS"
 340     bash scripts/CreaTools-uninstall.sh
 341 fi
 342
 343 ################################################################################## help
 344 if [ `checkVal $command help` == true ] ; then
 345     cat README.txt
 346 fi
 347
 348 ################################################################################## print env variables
 349 if [ `checkVal $command env` == true ] ; then
 350     if [ ! -f $installPrefixThird/share/creatools_third_party_library_config.sh ] ; then
 351         echo WARNING
 352         echo
 353         echo "the curently used Third Party libraries are NOT in $installPrefixThird but in :"
 354         grep "installPrefixThird=" $ETC_BASHRC
 355         echo "VTK_DIR  : " $VTK_DIR
 356         echo "ITK_DIR  : " $ITK_DIR
 357         echo "GDCM_DIR : " $GDCM_DIR
 358         echo
 359         echo "installPrefixThird ... " $installPrefixThird
 360     fi
 361
 362     if [ -f $installPrefixThird/share/creatools_third_party_library_config.sh ] ; then
 363         echo  "Third party config file : " $installPrefixThird/share/creatools_third_party_library_config.sh
 364         echo  ------
 365         cat $installPrefixThird/share/creatools_third_party_library_config.sh
 366         echo  ------
 367     fi
 368
 369     echo
 370
 371     if [ -f $installPrefix/share/creatools_base_library_config.sh ] ; then
 372        echo  "Creatools base library config file : " $installPrefix/share/creatools_base_library_config.sh
 373        echo  ------
 374        cat $installPrefix/share/creatools_base_library_config.sh
 375        echo  ------
 376        echo
 377        echo "installPrefix ... " $installPrefix
 378     fi
 379
 380     echo  ------
 381     echo "VTK_DIR  :                 " $VTK_DIR
 382     echo "ITK_DIR  :                 " $ITK_DIR
 383     echo "GDCM_DIR :                 " $GDCM_DIR
 384     echo
 385     echo "crea_DIR :                 " $crea_DIR
 386     echo "BBTK_DIR :                 " $BBTK_DIR
 387     echo "creaMaracasVisu_DIR :      " $creaMaracasVisu_DIR
 388     echo "creaEnvironment_DIR :      " $creaEnvironment_DIR
 389     echo "creaBruker_DIR :           " $creaBruker_DIR
 390     echo "creaImageIO_DIR :          " $creaImageIO_DIR
 391     echo "creaContours_DIR :         " $creaContours_DIR
 392     echo "creaRigidRegistration_DIR :" $creaRigidRegistration_DIR
 393     echo "bbtkGEditor_DIR :          " $bbtkGEditor_DIR
 394     echo "creaTools_DIR :            " $creaTools_DIR
 395     echo "creaMiniTools_DIR :        " $creaMiniTools_DIR
 396     echo "Ido_DIR :                  " $Ido_DIR
 397     echo "==================================="
 398     echo
 399
 400 fi
 401
 402
 403