Linux/scripts/ThirdParty-install-ITK.sh

   1 # ---------------------------------------------------------------------
   2 #
   3 # Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image
   4 #                        pour la Santé)
   5 # Authors : Eduardo Davila, Frederic Cervenansky, Claire Mouton
   6 #
   7 #  This software is governed by the CeCILL-B license under French law and
   8 #  abiding by the rules of distribution of free software. You can  use,
   9 #  modify and/ or redistribute the software under the terms of the CeCILL-B
  10 #  license as circulated by CEA, CNRS and INRIA at the following URL
  11 #  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  12 #  or in the file LICENSE.txt.
  13 #
  14 #  As a counterpart to the access to the source code and  rights to copy,
  15 #  modify and redistribute granted by the license, users are provided only
  16 #  with a limited warranty  and the software's author,  the holder of the
  17 #  economic rights,  and the successive licensors  have only  limited
  18 #  liability.
  19 #
  20 #  The fact that you are presently reading this means that you have had
  21 #  knowledge of the CeCILL-B license and that you accept its terms.
  22 # ------------------------------------------------------------------------
  23
  24
  25 #!/bin/bash
  26
  27  echo  "in ThirdParty-install-ITK.sh, source " $PWD/scripts/CreaTools-configure.sh
  28  if [ ! -f $PWD/scripts/CreaTools-configure.sh ]
  29  then
  30    echo
  31    echo "..ERROR.."
  32    echo "==================================================="
  33    echo "REMEMBER !"
  34    echo ""
  35    echo "YOU NEED TO RUN 'Configure' (0) First !"
  36    echo "==================================================="
  37    echo
  38    echo
  39    exit 0
  40 fi
  41
  42 source $PWD/scripts/CreaTools-configure.sh
  43
  44    echo "------"
  45    echo $PWD/scripts/CreaTools-configure.sh
  46    echo --generationdir--
  47    echo $generationdir
  48    echo --docgeneration--
  49    echo $docgeneration
  50    echo --installPrefix--
  51    echo $installPrefix
  52    echo --installPrefixThird--
  53    echo $installPrefixThird
  54    echo --buildType--
  55    echo $buildType
  56    echo --gdcmVersion--
  57    echo $gdcmVersion
  58    echo --ITKVersion--
  59    echo $ITKVersion
  60 #   echo --sourcesFrom--
  61 #   echo $sourcesFrom
  62 #   echo --scriptDir--
  63 #   echo $scriptDir
  64 #   echo --start_point--
  65 #   echo $start_point
  66    echo "------"
  67
  68
  69 #EED 2017-03-24
  70   source $PWD/scripts/LocalFunctions.sh
  71   if [ `getDistrib` == "CentOS" ] && [ `getKernelVersion` < "2.6.34" ]
  72   then
  73         stdCompiler=c++98
  74   else
  75         stdCompiler=c++11
  76   fi
  77
  78
  79
  80 scriptDir=$PWD
  81 sourcesDir=$generationdir/thirdparty_sources
  82 binDir=$generationdir/thirdparty_bin
  83 #EED itkfile=InsightToolkit-3.20.0.patchCreatis.tar.gz
  84
  85 if [ ! -e $generationdir ]
  86 then
  87    mkdir -p $generationdir
  88    chown -R $loginUserName  $generationdir
  89    chgrp -R $loginGroupName $generationdir
  90
  91 fi
  92 if [ ! -e $sourcesDir ]
  93 then
  94    mkdir -p $sourcesDir
  95    #was : (pb on MacOS?)
  96    #chown -R $loginUserName:$loginGroupName $sourcesDir
  97    chown -R $loginUserName  $sourcesDir
  98    chgrp -R $loginGroupName $sourcesDir
  99 fi
 100
 101 if [ ! -e $binDir ]
 102 then
 103    mkdir -p $binDir
 104    chown -R $loginUserName  $binDir
 105    chgrp -R $loginGroupName $binDir
 106 fi
 107
 108   echo "we remove old stuff"
 109   if [ $ITKVersion = ITK3 ]
 110   then
 111      rm -rf $sourcesDir/InsightToolkit*
 112      rm -rf $binDir/InsightToolkit*
 113   else
 114      rm -rf $sourcesDir/ITK*
 115      rm -rf $binDir/ITKt*
 116   fi
 117   cd $sourcesDir
 118
 119  echo "we download new stuff"
 120 #  if [ $ITKVersion = ITK3 ]
 121 #  then
 122 #     # deal with ITK3
 123 #     #EED itkfile=InsightToolkit-3.20.0.patchCreatis.tar.gz
 124 #     #EED libname=InsightToolkit-3.20.0
 125 #
 126 #     #EED itkfile=InsightToolkit-3.20.1.tar.gz
 127 #     #EED libname=InsightToolkit-3.20.1
 128 #
 129 #     itkfile=InsightToolkit-3.20.1-patchCreatis.tgz
 130 #     libname=InsightToolkit-3.20.1-patchCreatis
 131 #
 132 #  else
 133 #    # deal with ITK4
 134 #    itkfile=InsightToolkit-4.13.1.zip
 135 #    libname=InsightToolkit-4.13.1
 136 #  fi
 137
 138     itkfile=InsightToolkit-5.0.1.zip
 139     libname=InsightToolkit-5.0.1
 140
 141
 142 ##  if [ $OperatingSystem = "MacOS" ]
 143 ##    then
 144 ##      curl -O http://www.creatis.insa-lyon.fr/~davila/creatools_back_site/crea_ThirdParty_Libraries/source/$itkfile
 145 ##  else
 146 ## ##EED19mai2015      wget http://www.creatis.insa-lyon.fr/software/public/creatools/crea_ThirdParty_Libraries/source/$itkfile
 147 ##      wget http://www.creatis.insa-lyon.fr/~davila/creatools_back_site/crea_ThirdParty_Libraries/source/$itkfile
 148 ## ##  tar -xzvf $itkfile
 149 ##  fi
 150
 151   wget http://www.creatis.insa-lyon.fr/~davila/creatools_back_site/crea_ThirdParty_Libraries/source/$itkfile
 152   unzip  $itkfile
 153
 154
 155 #fi # JPR ------------1
 156
 157 #if [ $buildType = "Debug" ]
 158 #then
 159 #   debug="ON"
 160 #else
 161 #   debug="OFF"
 162 #fi
 163
 164 # the following stupid test is used at debug time; Please don't remove!
 165 #if [ true = false ]
 166 if [ true = true ]
 167 then
 168
 169   dirInstall=$binDir/$libname-Bin
 170   export ITK_DIR=$installPrefixThird/lib/InsightToolkit/
 171   mkdir -p $dirInstall
 172   cd $dirInstall
 173
 174   cmake -G"Unix Makefiles" -H$sourcesDir/$libname -B$dirInstall/
 175   ##cmake -G"CodeBlocks - Unix Makefiles" -H$sourcesDir/$libname -B$dirInstall/
 176   cmake -D CMAKE_BUILD_TYPE:STRING=$buildType -D CMAKE_INSTALL_PREFIX:PATH=$installPrefixThird CMakeCache.txt
 177   cmake -D BUILD_SHARED_LIBS:BOOL=ON -D BUILD_EXAMPLES:BOOL=OFF -D BUILD_TESTING:BOOL=OFF CMakeCache.txt
 178 #  if [ $ITKVersion = ITK3 ]
 179 #  then
 180 #    cmake -D ITK_USE_REVIEW:BOOL=ON CMakeCache.txt
 181 #  fi
 182 #  if [ $ITKVersion = ITK4 ]
 183 #  then
 184 ###EED ITK4.0
 185 ##     cmake -D ITKV3_COMPATIBILITY:BOOL=ON -D ITKGroup_Nonunit:BOOL=ON -D  ITKGroup_IO:BOOL=ON  -D Module_ITK-Deprecated:BOOL=ON -D Module_ITK-Review:BOOL=ON  CMakeCache.txt
 186 #
 187 ###EED ITK4.12
 188 ## -D ITK_USE_SYSTEM_GDCM=ON
 189 #     cmake -D ITKV3_COMPATIBILITY:BOOL=ON -D Module_ITKReview:BOOL=ON  CMakeCache.txt
 190 #  fi
 191
 192    cmake -D Module_ITKReview:BOOL=ON  CMakeCache.txt
 193    cmake -D CMAKE_CXX_FLAGS:STRING=-std=${stdCompiler} CMakeCache.txt
 194
 195   #uncomment following line if you want to use the bleeding edge of GDCM2!
 196   #cmake -D ITK_USE_SYSTEM_GDCM:BOOL=ON CMakeCache.txt
 197   cmake CMakeCache.txt
 198   make -j $corenumber
 199   make -j $corenumber install
 200   cd ..
 201 fi