Linux/scripts/ThirdParty-install-gdcm.sh

   1 # ---------------------------------------------------------------------
   2 #
   3 # Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image
   4 #                        pour la Santé)
   5 # Authors : Eduardo Davila, Frederic Cervenansky, Claire Mouton
   6 #
   7 #  This software is governed by the CeCILL-B license under French law and
   8 #  abiding by the rules of distribution of free software. You can  use,
   9 #  modify and/ or redistribute the software under the terms of the CeCILL-B
  10 #  license as circulated by CEA, CNRS and INRIA at the following URL
  11 #  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  12 #  or in the file LICENSE.txt.
  13 #
  14 #  As a counterpart to the access to the source code and  rights to copy,
  15 #  modify and redistribute granted by the license, users are provided only
  16 #  with a limited warranty  and the software's author,  the holder of the
  17 #  economic rights,  and the successive licensors  have only  limited
  18 #  liability.
  19 #
  20 #  The fact that you are presently reading this means that you have had
  21 #  knowledge of the CeCILL-B license and that you accept its terms.
  22 # ------------------------------------------------------------------------
  23
  24
  25 #!/bin/bash
  26
  27  if [ ! -f $PWD/scripts/CreaTools-configure.sh ]
  28  then
  29    echo
  30    echo "..ERROR.."
  31    echo "==================================================="
  32    echo "REMEMBER !"
  33    echo ""
  34    echo "YOU NEED TO RUN 'Configure' (0) First !"
  35    echo "==================================================="
  36    echo
  37    echo
  38    exit 0
  39 fi
  40
  41 source $PWD/scripts/CreaTools-configure.sh
  42
  43 #EED 2021-11-15
  44   source $PWD/scripts/LocalFunctions.sh
  45   if [ `getDistrib` == "CentOS" ] && [ `getKernelVersion` < "2.6.34" ]
  46   then
  47         stdCompiler=c++98
  48   fi
  49
  50
  51    echo "------"
  52    echo $PWD/scripts/CreaTools-configure.sh
  53    echo --generationdir--
  54    echo $generationdir
  55    echo --docgeneration--
  56    echo $docgeneration
  57    echo --installPrefix--
  58    echo $installPrefix
  59    echo --installPrefixThird--
  60    echo $installPrefixThird
  61    echo --buildType--
  62    echo $buildType
  63    echo --gdcmVersion--
  64    echo $gdcmVersion
  65 #   echo --sourcesFrom--
  66 #   echo $sourcesFrom
  67 #   echo --scriptDir--
  68 #   echo $scriptDir
  69 #   echo --start_point--
  70 #   echo $start_point
  71    echo "------"
  72
  73
  74 scriptDir=$PWD
  75 sourcesDir=$generationdir/thirdparty_sources
  76 binDir=$generationdir/thirdparty_bin
  77
  78 if [ ! -e $generationdir ]
  79 then
  80    mkdir -p $generationdir
  81    chown -R $loginUserName  $generationdir
  82    chgrp -R $loginGroupName $generationdir
  83
  84 fi
  85 if [ ! -e $sourcesDir ]
  86 then
  87    mkdir -p $sourcesDir
  88    #was : (pb on MacOS?)
  89    #chown -R $loginUserName:$loginGroupName $sourcesDir
  90    chown -R $loginUserName  $sourcesDir
  91    chgrp -R $loginGroupName $sourcesDir
  92 fi
  93
  94 if [ ! -e $binDir ]
  95 then
  96    mkdir -p $binDir
  97    chown -R $loginUserName  $binDir
  98    chgrp -R $loginGroupName $binDir
  99 fi
 100
 101   echo "we remove old stuff"
 102   rm -rf $sourcesDir/gdcm*
 103   rm -rf $binDir/gdcm*
 104
 105   cd $sourcesDir
 106
 107   echo "we download new stuff"
 108
 109 ##  if [ $OperatingSystem = "MacOS" ]
 110 ##  then
 111 ##   curl -O http://www.creatis.insa-lyon.fr/software/public/creatools/crea_ThirdParty_Libraries/source/gdcm_05_Mai_2011.tar.gz
 112 ##   # MacOS, clever enough to understand it *has* to uncompress, doesn't understand tar -z :-(
 113 ##   tar -xvf gdcm_05_Mai_2011.tar.gz
 114 ##  else
 115 ## ##19mai2015  wget http://www.creatis.insa-lyon.fr/software/public/creatools/crea_ThirdParty_Libraries/source/gdcm_05_Mai_2011.tar.gz
 116 ##
 117 ## ##VTK-5
 118 ## #    wget http://www.creatis.insa-lyon.fr/~davila/creatools_back_site/crea_ThirdParty_Libraries/source/gdcm_05_Mai_2011.tar.gz
 119 ## #    tar -xvzf gdcm_05_Mai_2011.tar.gz
 120 ##
 121 ## #    wget http://www.creatis.insa-lyon.fr/~davila/creatools_back_site/crea_ThirdParty_Libraries/source/gdcm_10_Mars_2017-vtk7.tar.gz
 122 ## #    tar -xvzf gdcm13_2018_05_28_vtk8.tar.gz
 123 ##  fi
 124
 125
 126 #cxxFlags='-std=c++11   '
 127 cxxFlags='  '
 128
 129 if [ $TDx == "ON" ]
 130 then
 131     cxxFlags=$cxxFlags'-F/Library/Frameworks -DVTK_USE_TDX '
 132 fi
 133
 134
 135 #    wget http://www.creatis.insa-lyon.fr/~davila/creatools_back_site/crea_ThirdParty_Libraries/source/gdcm13_2019_06_17_vtk8.zip
 136 #       unzip gdcm13_2019_06_17_vtk8.zip
 137
 138     wget http://www.creatis.insa-lyon.fr/~davila/creatools_back_site/crea_ThirdParty_Libraries/source/gdcm13_2022_07_21_vtk92.zip
 139         unzip gdcm13_2022_07_21_vtk92.zip
 140
 141 if [ $buildType = "Debug" ]
 142 then
 143    debug="ON"
 144 else
 145    debug="OFF"
 146 fi
 147
 148 # the following stupid test is used at debug time; Please don't remove!
 149 #if [ true = false ]
 150 if [ true = true ]
 151 then
 152   libname=gdcm13
 153   dirInstall=$binDir/$libname-Bin
 154   export GDCM_DIR=$installPrefixThird/lib/gdcm/
 155   mkdir -p $dirInstall
 156   cd $dirInstall
 157
 158   cmake -G"Unix Makefiles" -H$sourcesDir/$libname -B$dirInstall/
 159   ##cmake -G"CodeBlocks - Unix Makefiles" -H$sourcesDir/$libname -B$dirInstall/
 160   cmake -D CMAKE_CXX_FLAGS:STRING="$cxxFlags"                                 CMakeCache.txt
 161   cmake -D CMAKE_BUILD_TYPE:STRING=$buildType -D CMAKE_INSTALL_PREFIX:PATH=$installPrefixThird CMakeCache.txt
 162   cmake -D VTK_DIR:PATH=$VTK_DIR CMakeCache.txt
 163   cmake -D GDCM_VTK:BOOL=ON -D GDCM_NAME_SPACE:STRING=gdcm13 CMakeCache.txt
 164
 165   #EED 2017-03-24
 166   source $PWD/scripts/LocalFunctions.sh
 167   if [ `getDistrib` == "CentOS" ] && [ `getKernelVersion` < "2.6.34" ]
 168   then
 169         cmake -D CMAKE_CXX_FLAGS:STRING=-std=c++98 CMakeCache.txt
 170   fi
 171
 172   make -j $corenumber
 173   make -j $corenumber install
 174   cd ..
 175 fi
 176
 177 #if [ true = false ]
 178 if [ true = true ]
 179 then
 180   cd $sourcesDir
 181   cp tth $installPrefixThird/bin
 182 fi
 183
 184
 185 # deal with create creatools_third_party_libraries_config.sh
 186 # is now done in ThirdParty-install-Finalize.sh
 187