PackRecalage/src/bbPackRecalageReSlicerBox.cxx

   1 /*
   2 # ---------------------------------------------------------------------
   3 #
   4 # Copyright (c) CREATIS (Centre de Recherche en Acquisition et Traitement de l'Image
   5 #                        pour la Santé)
   6 # Authors : Eduardo Davila, Frederic Cervenansky, Claire Mouton
   7 #
   8 #  This software is governed by the CeCILL-B license under French law and
   9 #  abiding by the rules of distribution of free software. You can  use,
  10 #  modify and/ or redistribute the software under the terms of the CeCILL-B
  11 #  license as circulated by CEA, CNRS and INRIA at the following URL
  12 #  http://www.cecill.info/licences/Licence_CeCILL-B_V1-en.html
  13 #  or in the file LICENSE.txt.
  14 #
  15 #  As a counterpart to the access to the source code and  rights to copy,
  16 #  modify and redistribute granted by the license, users are provided only
  17 #  with a limited warranty  and the software's author,  the holder of the
  18 #  economic rights,  and the successive licensors  have only  limited
  19 #  liability.
  20 #
  21 #  The fact that you are presently reading this means that you have had
  22 #  knowledge of the CeCILL-B license and that you accept its terms.
  23 # ------------------------------------------------------------------------
  24 */
  25
  26
  27 #include "bbPackRecalageReSlicerBox.h"
  28 #include "bbPackRecalagePackage.h"
  29
  30 namespace bbPackRecalage
  31 {
  32
  33 BBTK_ADD_BLACK_BOX_TO_PACKAGE(PackRecalage,ReSlicerBox)
  34 BBTK_BLACK_BOX_IMPLEMENTATION(ReSlicerBox,bbtk::AtomicBlackBox);
  35 void ReSlicerBox::Process()
  36 {
  37         if(!bbGetInputOrigin().empty()  && bbGetInputTransform() != NULL)
  38         {
  39                 //image = vtkImageChangeInformation::New();
  40                 image->SetInput( bbGetInputIn() );
  41                 image->SetOutputSpacing( 1,1,1 );
  42
  43                 if(bbGetInputCentered())
  44                 {
  45                         image->CenterImageOn();
  46                 }
  47
  48                 //slicer =vtkImageReslice::New();
  49                 slicer->SetInput( image->GetOutput() );
  50                 slicer->SetInformationInput( image->GetOutput() );
  51                 slicer->SetResliceTransform(bbGetInputTransform());
  52                 slicer->SetOutputOrigin( -(bbGetInputOrigin()[0]) , -(bbGetInputOrigin()[1]) , -(bbGetInputOrigin()[2]) );
  53                 if(bbGetInputInterpolate())
  54                 {
  55                         slicer->InterpolateOn();
  56                 }
  57                 slicer->Update();
  58
  59                 //imageResult = vtkImageChangeInformation::New();
  60                 imageResult->SetInput( slicer->GetOutput() );
  61                 double spc[3];
  62                 bbGetInputIn()->GetSpacing(spc);
  63                 imageResult->SetOutputSpacing( spc );
  64                 imageResult->SetOutputOrigin( 0,0,0 );
  65
  66                 bbSetOutputOut( imageResult->GetOutput() );
  67         }
  68         else
  69         {
  70                 bbSetOutputOut( NULL );
  71         }
  72 }
  73 void ReSlicerBox::bbUserSetDefaultValues()
  74 {
  75         std::vector<int> empty;
  76         bbSetInputOrigin(empty);
  77     bbSetInputIn(NULL);
  78     bbSetInputTransform(NULL);
  79     bbSetOutputOut(NULL);
  80         bbSetInputCentered(false);
  81         bbSetInputInterpolate(false);
  82
  83 }
  84 void ReSlicerBox::bbUserInitializeProcessing()
  85 {
  86
  87 //  THE INITIALIZATION METHOD BODY :
  88 //    Here does nothing
  89 //    but this is where you should allocate the internal/output pointers
  90 //    if any
  91         image = vtkImageChangeInformation::New();
  92     slicer =vtkImageReslice::New();
  93         imageResult = vtkImageChangeInformation::New();
  94 }
  95 void ReSlicerBox::bbUserFinalizeProcessing()
  96 {
  97         image->Delete();
  98         slicer->Delete();
  99     imageResult->Delete();
 100 }
 101 }
 102 // EO namespace bbPackRecalage